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Articles by Ancha Baranova in JoVE
JoVE General
Do-It-Yourself dispositif de récupération d'échantillons cryoconservés tombé accidentellement dans les réservoirs de stockage cryogéniques
1Molecular and Microbiology Department and Center for the Study of Genomics in Liver Diseases, George Mason University, 2Translational Research Institute, Inova Health System, 3Research Center for Medical Genetics RAMS
Ici, nous présentons un faible coût, durable dispositif cryotolerant pour la récupération d'échantillon à partir de réservoirs de Dewar remplis avec de l'azote liquide. La facilité de la construction et la conception modulaire de l'appareil rend le processus de récupération de l'échantillon à partir de réservoirs cryogéniques sûr et facile.
Other articles by Ancha Baranova on PubMed
Basées Sur La PCR Detection De Transposons Pol III-transcrits Et Son Application Au Modèle Rongeur De Réponse Ultraviolet
Les concentrations cellulaires d'ARN contenant des éléments transposables augmentent en réponse à divers stress. Polymérase III (Pol III)-transcriptions dépendants de transposons sont différentes de RNAs générés par la fonction Pol II-dépendants de transcription contenant du transposon. Jusqu'à présent, les transcriptions Pol III ont été détectées par extension d'amorce suivie par électrophorèse sur gel de temps. Dans cet article, nous décrivons une méthode plus sensible basées sur la PCR pour la détection sélective de RNA Pol III-transcrits. La méthode est basée sur la différence dans les séquences à l'extrémité 5' de la transcription de Pol II et Pol III-dépendante. Nous avons employé cette méthode pour quantifier les transcriptions Pol III du transposon B1 dans les cellules de rongeurs et a révélé que leurs niveaux sont affectés par l'irradiation UV. Par conséquent, nous concluons que l'abondance de la fraction Pol III-transcription de l'ARN cellulaire peut servir de marqueur de réponse au stress et peut être facilement quantifié par la méthode décrite.
Des Profils D'expression Génique Précoce Des Personnes Atteintes De L'hépatite C Chronique Traitement Avec De L'interféron-alpha Pégylé Et La Ribavirine
Réactivité pour le traitement de l'hépatite C (VHC) dépend virale and host factors. Notre objectif était d'évaluer la réponse virologique soutenue (RVS)-associé à expression de gène précoce chez les patients recevant pégylé interféron-alpha2a (PEG-IFN-alpha2a) ou PEG-IFN-alpha2b et la ribavirine avec la durée issue des génotypes HCV. Des échantillons de sang ont été prélevés dans des tubes de PAXgene avant le traitement ainsi que 1, 7, 28 et 56 jours après le traitement. Depuis les cellules du sang périphérique, l'ARN total a été extrait, quantifié et utilisée pour une étape reverse transcription polymerase chain reaction à profil 154 des ARN messagers. Niveaux d'expression des ARN messagers ont été normalisées avec six gènes de « ménager » et un ARN de référence. Régression multiple et la sélection par étapes ont été effectuées afin d'évaluer les différences dans l'expression des gènes à des moments différents, et la performance prédictive a été évaluée pour chaque modèle. Un total de 68 patients ont été recrutés pour l'étude et traités avec la thérapie combinée. Les résultats de l'expression génique ont montré que SVR pouvait être prédite par l'expression de gène de signal transducteur et activateur de transcription-6 (6-STAT) et suppresseur de cytokine de signalisation-1 dans les échantillons de prétraitement. Après 24 heures, SVR a été prédite par l'expression des gènes dépendants de l'interféron, et cette dépendance a continué à être bien visible tout au long du traitement. Conclusion : Expression des gènes précoces au cours du traitement anti-VHC peut élucider les voies moléculaires importantes qui peuvent influer sur la probabilité d'atteindre la réponse virologique.
