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Articles by Angela L. Elwell in JoVE
JoVE General
Single Read und Paired End mRNA-Seq Illumina Bibliotheken von 10 Nanogramm Gesamt-RNA
1Regenerative Biology, Morgridge Institute for Research, 2Department of Cell & Regenerative Biology, University of Wisconsin, 3Department of Molecular, Cellular, & Regenerative Biology, University of California
Hier beschreiben wir ein Verfahren zur Herstellung der beiden einzigen gelesen und gepaart Ende Illumina mRNA-Seq-Sequenzierung Bibliotheken zur Genexpressionsanalyse auf T7 lineare RNA-Amplifikation basieren. Dieses Protokoll erfordert nur 10 Nanogramm ab Gesamt-RNA und erzeugt sehr konsistent Bibliotheken für ganze Transkripte.
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Trennen Die Elterliche Umfeld Von Saatgut-Größe-Auswirkungen Auf Die Nächste Generation Wachstum Und Entwicklung in Arabidopsis
Pflanzenwachstum und Entwicklung ist zutiefst beeinflusst durch Umweltbedingungen, die Labor-Experimente in der Regel zu kontrollieren versucht. Wachstumsbedingungen sind jedoch nicht einheitlich zwischen oder sogar in Labors und die inwieweit diese Unterschiede beeinflussen Pflanzenwachstum und Entwicklung ist unbekannt. Experimente mit Wildtyp Arabidopsis Thaliana wurden entwickelt, um die Einflüsse der elterlichen Umgebung und Saatgut Größe auf Wachstum und Entwicklung in der nächsten Generation zu quantifizieren. Einzelne viel Saatgut wurde in sechs Kammern der Umwelt gepflanzt und zur Reife gewachsen. Das Saatgut produziert wurde mechanisch in kleinen und großen Größenklassen dann in einer gemeinsamen Umgebung angebaut und eine Reihe von Proben, die über den gesamten Lebenszyklus ausgesetzt gesiebt. Varianzanalyse zeigte, dass Saatgut Größe Effekte besonders signifikant, früh in der Entwicklung, die primäre Wurzelwachstum und Gravitropism, sondern auch Blütezeit war. Elterliche Umfeld beeinflusst Nachkommenschaft Keimung Zeit, Blüte und Gewicht einheimische der Nachkommenschaft Erzeugung. In einigen Fällen das elterliche Umfeld beeinflusst das Ausmaß der (interagierte mit) die beobachteten Saatgut-Größe-Effekte. Diese Daten zeigen, dass die Umstände der Lebensgeschichte der elterlichen Generation beeinflussen können, Wachstum und Entwicklung während des gesamten Lebenszyklus der nächsten Generation in einem Ausmaß, die bei der Durchführung von genetischer Studies berücksichtigt werden sollten.
