Escherichia Coli FPG Glycosylase Est Nonrendundant Et Nécessaires Pour La Réparation Rapide Mondiale De La Purine Oxydé Et Dommages Pyrimidine in Vivo

Journal of Molecular Biology. Jul, 2011  |  Pubmed ID: 21601577

Endonucléase (Endo) III et formamidopyrimidine-N-glycosylase (FPG) sont deux des ADN glycosylases prédominants dans Escherichia coli qui éliminent les dégâts de base oxydatif. Dans des extraits cellulaires et sous forme purifiée, Endo III est généralement plus actif vers pyrimidines oxydées, alors que Fpg est plus active à l'égard des purines oxydées. Toutefois, les spécificités de substrat de ces enzymes se chevauchent partiellement in vitro. On en sait moins sur la contribution relative de ces enzymes dans la restauration de la matrice génomique à la suite des dommages oxydatifs. Dans cette étude, nous avons examiné comment efficacement Endo III et Fpg réparer leurs substrats oxydatifs dans le traitement in vivo après avec du peroxyde d'hydrogène. Nous avons constaté que Fpg était redondant et nécessaire pour éliminer rapidement ses lésions substrat sur le chromosome. En outre, GPJ a aussi réparé une partie importante des lésions reconnues par Endo III, ce qui suggère qu'elle joue un rôle important dans la réparation des dommages mondiale purine et les lésions pyrimidine in vivo. Par comparaison, Endo III n'a pas d'incidence sur le taux de réparation des substrats glycémie à jeun et était seul responsable de la réparation d'un sous-ensemble de ses lésions propres substrat in vivo. L'absence de Endo VIII ou de la réparation par excision de nucléotides n'a pas affecté significativement la réparation globale de l'une des Fpg ou Endo III substrats in vivo. Étonnamment, la réplication récupéré après des dommages oxydatifs à l'ADN dans tous les mutants examinés, même lorsque les lésions ont persisté dans l'ADN, suggérant la présence d'un mécanisme efficace pour traiter ou de surmonter les dommages oxydatifs rencontrés lors de la réplication.