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Articles by Daniel R. Barreda in JoVE
Geändert Annexin V / Propidiumiodid Apoptose Assay für eine genaue Beurteilung des Zelltods
Aja M. Rieger1, Kimberly L. Nelson1, Jeffrey D. Konowalchuk1, Daniel R. Barreda1,2
1Department of Biological Sciences, University of Alberta, 2Department of Agriculture, Food and Nutrition Sciences, University of Alberta
Eine genaue Methode für die Beurteilung der Zelltod beschrieben. Das Protokoll verbessert die auf konventionellen Annexin V / Propidiumiodid (PI)-Protokolle, die up-Display zu 40% falsch-positive Ereignisse in Zelllinien und Primärzellen aus einer breiten Palette von Tiermodellen.
Other articles by Daniel R. Barreda on PubMed
Differentiell Exprimierte Gene, Die Potenzielle Marker Von Goldfischen Makrophagen Entwicklung in Vitro Zu Kodieren
Developmental and Comparative Immunology. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15043942
Verordnung Von Myeloischen Entwicklung Und Funktion Von Kolonie-stimulierenden Faktoren
Developmental and Comparative Immunology. May, 2004 | Pubmed ID: 15062647
Eine Neuartige Lösliche Form Des CSF-1-Rezeptor Hemmt Die Proliferation Von Selbst Erneuernden Makrophagen Von Goldfisch (Carassius Auratus L.)
Developmental and Comparative Immunology. 2005 | Pubmed ID: 15978283
Eine Neuartige Hämatopoetischen Hülle Induziert Vermehrung Der Goldfische (Carassius Auratus L.) Makrophagen
The Journal of Biological Chemistry. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16473876
Granulins sind eine Gruppe von stark konservierten Wachstumsfaktoren, die aus einer Vielzahl von Organismen, die über die Metazoa beschrieben wurden. In dieser Studie Goldfisch Hülle war einer der am häufigsten festgestellte Transkripte in das differenzielle Kreuz-Screening von Makrophagen cDNA-Bibliotheken und wurde bevorzugt in proliferierenden Makrophagen ausgedrückt. Im Gegensatz zu Säugetieren Granulins, die welche 7,5 Wiederholungen einer charakteristischen Signatur 12 Cystein-Rückstände zu besitzen, codiert die Goldfisch-Hülle ein mutmaßliches Peptid besitzen nur 1,5 Cystein-Wiederholungen. Nordfleck und Echtzeit-PCR-Analysen angegeben, dass Goldfische-Hülle wurde nur in den hämatopoetischen Geweben von Goldfisch, insbesondere der Niere und Milz, ausgedrückt und in aktiviert peripheren mononukleären Blutzellen. Wir Hülle mit einer prokaryotischen Expressionssystem ausgedrückt und produziert eine Affinität gereinigt Kaninchen anti-goldfish Hülle IgG. Rekombinante Goldfisch Hülle induziert eine dosisabhängige proliferative Antwort der Goldfisch Makrophagen, die umgekehrt auf die Bühne myeloische Differenzierung der Zellen studiert verwandt war. Die höchste proliferative Reaktion wurde in Vorläuferzellen von Makrophagen und Monozyten beobachtet. Diese proliferative Reaktion der Makrophagen wurde durch die Zugabe von IgG Anti-Hülle aufgehoben. Diese Ergebnisse zeigen, dass die Goldfisch-Hülle einen Wachstumsfaktor ist, der Zellproliferation an unterschiedlichen Stellen der Differenzierung von Makrophagen positiv moduliert.
Differenzielle Kinase Anforderungen in Mensch Und Maus Fc-Gamma-Rezeptor Phagozytose Und Endozytose
Journal of Leukocyte Biology. Dec, 2006 | Pubmed ID: 16921024
FC-Gamma-Rezeptoren (FcgammaRs) tragen zur Internalisierung von großen und kleinen Immunkomplexe durch Phagozytose und Endozytose, beziehungsweise. Die molekularen Prozessen zugrunde liegen, diese Internalisierung Mechanismen unterscheiden sich dramatisch und haben unterschiedliche Ergebnisse im Immunsystem Freiraum und Modulation der Zellfunktion. Aber es ist unklar, wie die gleichen Rezeptoren (FcgammaR) Bindung an identische Liganden (IgG) kann solche unterschiedlichen Reaktionen hervorrufen. Wir und andere haben diese Kinase Syk Src-bezogene Tyrosinkinasen (SRTKs) und Phosphatidyl-Inositol-3-Kinasen (PI3K) eine wichtige Rolle in FcgammaR Phagozytose spielen gezeigt. Hier zeigen wir, dass diese Kinasen nicht für FcgammaR Endozytose erforderlich sind. Endozytose von Hitze aggregierte IgG (HA-IgG) von COS-1 Zellen die stabil mit FcgammaRIIA transfected oder Chimären FcgammaRI-Gamma-Gamma (EG-TM-CYT) wurde durch PP2, Piceatannol oder Wortmannin nicht wesentlich verändert. Im Gegensatz dazu opsonized Phagozytose von großen Partikeln (IgG sensibilisiert Schaf-Erythrozyten, EA) wurde durch diese Inhibitoren deutlich reduziert. Diese Ergebnisse wurden primäre Maustaste Knochenmark abgeleiteten Makrophagen und frisch isolierten menschlichen Monozyten bestätigt. Ebenen der Rezeptor Phosphorylierung ähnelten sich, wenn FcgammaRIIA mit HA-IgG oder EA vernetzt war. Allerdings verhinderten die Hemmung der FcgammaR Phosphorylierung nur FcgammaR Phagozytose. Schließlich biochemische Analysen der PI3K (p85)-Syk Bindung angegeben, dass direkte Interaktionen zwischen systemeigenen Syk und PI3K Proteine differentiell während FcgammaR Phagozytose und Endozytose reguliert werden. Insgesamt zeigen unsere Ergebnisse, dass FcgammaR Endozytose und Phagozytose drastisch in ihrer Anforderung für Syk, SRTKs und PI3K, auf markante Unterschiede in der Signal-Transduktion-Mechanismen unterscheiden. Wir bieten ein wettbewerbsfähiges Hemmung basierende Modell in der PI3K und c-Cbl spielen gegensätzlichen Rollen in die Induktion von Phagozytose oder Endozytose Signalisierung Kaskaden.
B-Lymphozyten Aus Frühen Wirbeltieren Haben Starke Phagozytische Und Mikrobizide Fähigkeiten
Nature Immunology. Oct, 2006 | Pubmed ID: 16980980
Das gegenwärtige Paradigma diktiert, dass die Phagozytose hauptsächlich durch "professionelle" Fresszellen (z. B. Makrophagen und Monozyten), vollendet wird, während die B-Zellen phagozytische Funktionen fehlen. Hier zeigen wir, dass B-Zellen von teleost Fische potente in vitro und in vivo phagozytische Tätigkeit haben. Partikel Aufnahme durch B-Zellen induziert Aktivierung von 'downstream' Degradations Übertragungswege bei 'Phagolysosome' Bildung und intrazelluläre Tötung von aufgenommenen Mikroben. Diese Ergebnisse zeigen eine bisher unbekannte Funktion für B-Zellen in der angeborenen Immunität dieser primitive Tiere. Ein erheblicher Anteil der Xenopus Laevis B-Zellen waren auch phagozytische. Unsere Erkenntnisse unterstützen die Idee, dass B-Zellen entwickelte sich aus einer uralten phagozytische Zelle geben und einen evolutionären Rahmen zum Verständnis der engen Beziehung zwischen Säugetier-B-Lymphozyten und Makrophagen bilden.
Entwicklung Von Goldfischen Makrophagen in Vitro
Fish & Shellfish Immunology. Feb, 2006 | Pubmed ID: 15936214
Klonierung Und Expression Analyse Der Goldfisch (Carassius Auratus L.) Prominin
Fish & Shellfish Immunology. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17123832
Das integrale Membranprotein, bekannt als Prominin wurde zunächst auf die apikale Oberfläche der Maus neuronale Epithelzellen sowie auf der Oberfläche des menschlichen hämatopoetische Vorläuferzellen identifiziert. Dieser Bericht beschreibt eine Prominin-ähnlichen Sequenz und Ausdruck-Analyse der Prominin in der Goldfisch. Der vorhergesagten Aminosäuresequenz für Goldfische Prominin teilt alle strukturellen Merkmale der Familie Prominin, Markenzeichen, aber der Verwandtschaft, die anhand der prozentualen Aminosäure-Identität ließen erkennen, dass diese Goldfische Prominin in die aktuelle Säugetier-Dichotomie des Typs 1 oder 2 platziert werden kann nicht. Die Real-Time-PCR-Analysen erkennen, dass diese Prominin weitgehend in verschiedenen Geweben mit einem besonders hohen beobachtet in der Niere und Gill die Goldfish ausgedrückt wurde. Ferner ergab die Goldfisch Prominin differentiell werden in Subpopulationen von in Vitro-abgeleitete Goldfisch Makrophagen, mit dem höchsten Ausdruck beobachtet in Vorläuferzellen ausgedrückt.
Entwicklung Von Makrophagen Friedfischrevieren Fische
Developmental and Comparative Immunology. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19063916
Der angeborenen Immunantwort des frühen Wirbeltiere, wie z. B. Knochenfische, spielen eine zentrale Rolle in der Host-Abwehr gegen Infektionskrankheiten und eine der wichtigsten Effektorzellen der angeborenen Immunität sind Makrophagen. In Reihenfolge für Makrophagen Host Verteidigung erwiesen, dass sie alle Zeiten in den Geweben ihres Wirtes und allem anwesend sein müssen muss der Host rasant Makrophagen Zahlen in Zeiten der Not können. Blutbildung ist ein Prozess der Bildung und Entwicklung von reifer Blutzellen, einschließlich Makrophagen. Blutbildung wird gesteuert durch lösliche Faktoren, sogenannte Zytokine, die Veränderungen der Transkriptionsfaktoren in den Zielzellen, die Zelle Schicksal Änderungen und die endgültige Entwicklung der spezifischen Effektorzellen beeinflussen. Prozesse in Makrophagen Entwicklung haben weitgehend von Säugetier-Modellorganismen abgeleitet wurde. Jedoch wurden neue Zuführungen zum Verständnis der Entwicklung der Makrophagen in Knochenfische, eine Gruppe von Organismen vorgenommen, die stark auf ihre angeborene Immunabwehr. Unser Verständnis von den Wachstumsfaktoren beteiligt teleost Makrophage-Entwicklung, als auch die Rezeptoren und regulatorische Mechanismen zu kontrollieren hat beträchtlich zugenommen. Darüber hinaus entstanden Modellorganismen wie dem Zebrafisch als wichtige Instrumente zur Förderung unser Verständnis der transkriptionelle Kontrolle der Zelle Entwicklung bei Fischen ebenso wie bei Säugetieren. Diesen Bericht unterstreicht die neuen Zuführungen in unserem Verständnis der teleost Makrophage-Entwicklung. Konzentrierten wir uns auf den Wachstumsfaktoren identifiziert, um bei der Regulierung der Makrophagen Entwicklung aus einer Zelle Vorläuferzellen in einer funktionalen Makrophagen wichtig sein und diskutieren die wichtige Transkriptionsfaktoren, die festgestellt wurden Funktion in teleost Blutbildung. Wir beschreiben auch die Ergebnisse der in-vivo-Untersuchungen, die Beobachtungen, die in-vitro verstärkt haben und haben wesentlich verbessert, die Relevanz und die Bedeutung der Verwendung von teleost Fische als Modellorganismen für Entwicklungsprozesse zu studieren.
Microarray Analyse Differentiell Exprimierten Genen Von Peyer Die Patches Von Vieh Mündlich Mit Der Bovinen Spongiformen Enzephalopathie in Frage Gestellt
Journal of Toxicology and Environmental Health. Part A. 2009 | Pubmed ID: 19697233
Der wahrscheinlichste Weg des Eintrags der Infektion nach oraler Exposition gegenüber transmissiblen spongiformen Enzephalopathien (TSE) ist über die immunologisch aktive Peyer Flecken (PP). Diese sekundären lymphatischen Organe scheinen die mögliche Route für Prion-Neuroinvasion. Die molekularen Mechanismen, die die Aufnahme von der infektiösen Prionen-Agent und Fortschreiten der Krankheit beteiligt bleiben jedoch noch unklar. Dieser Untersuchung untersucht die Veränderungen in der Genexpression in PP nach oraler Exposition von Rindern bovine spongiforme Enzephalopathie (BSE) Arbeitsstoffe. Die Genausdruck Muster in PP von Kühen 12 Mo nach BSE-Challenge wurden mit Steuerelementen mithilfe einer Microarray-Plattform mit 24.000 Oligonukleotide, 16.846 einzigartige gen-Loci und 5943 äußerte Sequenz Tag (EST) aus Rindern Genom verglichen. Zwischen der Tiere Verkleidungswettbewerb und, 90 Gene und 16 EST wurden identifiziert, wie signifikant differentiell ausgedrückt (> 2.0-fold Änderung): 36 waren herraufreguliert und 70 Downregulated. Dieser Gene fanden fünf Immunfunktion abstammte. Major Histocompatibility complex (MHC)-Klasse II MHC Klasse II-DQ Alpha, L-RAP und zwei hypothetische Proteine. Differentiell exprimierten Gene im Zusammenhang mit Mobilfunk und metabolische Prozesse, einschließlich der Entwicklung und Reifung von Zellen in der PP wurden auch identifiziert. In diesem Zusammenhang werden die möglichen Auswirkungen dieser Gen-Ausdruck-Änderungen in PP auf BSE Entwicklung diskutiert.
Konventionelle Apoptose-Assays, Die Mit Propidium Jodid Generieren Eine Erhebliche Anzahl Der Fehlalarme, Die Genaue Bewertung Des Zelle Todes Zu Verhindern
Journal of Immunological Methods. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20381494
Das Aufkommen der Flow Cytometry-basierten Anwendungen hat das Studium der zellulären Apoptose erheblich beeinflusst. Propidium Jodid (PI) ist eine häufig verwendete Lebensfähigkeit Fleck in diesen Studien. Leider finden wir, dass konventionelle Annexin V/PI-Protokolle zu eine beträchtliche Anzahl von falsch positiven Ereignisse führen (bis zu 40 %), die PI Beflecken RNS innerhalb des zytoplasmatischen Fachs zugeordnet sind. Primärzellen und Zelllinien betroffen sind, mit großen Zellen (nukleare: zytoplasmatische Verhältnisse < 0,5) zeigen das höchste vorkommen. Diese Distribution umfasst eine Vielzahl von Tiermodellen, darunter Mäuse, Schweinepest, Vogelgrippe, und teleost Fische und potenziell betrifft bis zu 1016 aus 1019 Peer-Review-Papiere, die in diesem Bereich seit 1995 veröffentlicht. Wir zeigen, dass die primären Konsequenzen aus diesen Erkenntnissen Zellen erleben RNA Content-Änderungen betreffen. Viral infizierte Zellen, sind beispielsweise qualifiziert als Apoptose in Reaktion auf eine Infektion, die auf der Grundlage konventioneller Färbung Protokolle unterzogen; Diese Zellen sind in der Tat lebendig und aktiv produzierenden viraler RNA, die dienen kann, um zusätzliche ansteckende virale Partikel zu produzieren. Aufgrund unserer Beobachtungen, dass schlagen wir eine geänderte Protokoll, zeigen Sie, dass es frühere Nachteile dieser Technik überwindet und es für eine genauere Beurteilung des Zelle Todes über verschiedene Plattformen hinweg ermöglicht.
Erratum Zu "Klonen Und Ausdruck Analyse Der Goldfische (Carasius Auratus L.) Prominin" [Fische Schalentiere Immunol. 22 (2007) 308-317]
Fish & Shellfish Immunology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20547224
Makrophagen Aktivierung Moduliert Differentiell Partikel Binden, Phagozytose Und Nachgeschaltete Antimikrobielle Mechanismen
Developmental and Comparative Immunology. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20600280
Phagozytose stellt einen kritischen ersten Linie der Verteidigung gegen eindringende Krankheitserreger. Engagement von Partikeln durch Rezeptor-vermittelte Bindung vorausgeht Internalisierung und Induktion der zellulären antimikrobielle Antworten. Fresszellen haben die Fähigkeit zur Bindung und Internalisierung Prozesse durch Änderungen in ihrem Rezeptor-Profil und Modulation der nachgeschalteten Ereignisse differentiell zu regulieren. Dies ist notwendig für die komplizierte Kontrolle der phagozytische antimikrobielle Antworten. Für die Bewertung der Phagozytose stehen mehrere Methoden zur Auswahl. Leider zulassen nichts für genaue quantitative Bestimmung der Bindung und Internalisierung Veranstaltungen. Diese Einschränkungen zu überwinden, haben wir eine neuartige Phagozytose-Assay basiert auf einer multispektralen bildgebenden fließen Cytometry-Plattform entwickelt. Diese Probe zwischen verinnerlichten und Oberfläche gebundene Teilchen in einer statistisch zuverlässige Weise diskriminiert und Multiparameter-Analyse der Phagozytose und nachgeschaltete Anti-mikrobiellen Reaktionen ermöglicht. Wir entwickelten auch einen neuen Ansatz zur Untersuchung von Phagolysosome Fusion, bietet eine verbesserte Kapazität für quantitative Beurteilung der Phagolysosome Fusion in gemischten Populationen von intakten Zellen. Wichtig ist, dürften unsere Ansätze geneigt sein, eine breite Palette von vergleichenden Modellsysteme basiert auf unsere Prüfung des murinen RAW 264.7 Zellen und Makrophagen (PKM) Modellsystem Goldfisch primären Nieren. Letzteres konnten wir die evolutionäre Erhaltung der phagozytische antimikrobielle Antworten in einem niedrigeren Vertebraten Modell zu untersuchen. Während zuvor berichtet wurde, dass gemischte Bevölkerung dieser Makrophagen-Kulturen phagozytische sind, blieb unklar, ob Subpopulationen innerhalb dieser differentiell zu dieser Tätigkeit beigetragen. Entsprechend höhere vertebrate Modelle fanden wir, dass eine erhöhte Fähigkeit zur Phagozytose in Goldfisch PKM Differenzierung entlang der Makrophage-Weg führt. Interessanterweise reguliert zelluläre Aktivierung differentiell Partikel Internalisierung in PKM Monozyte und Reifen Makrophagen Teilmengen. Wir fanden auch differenzielle Verordnung von Phagolysosome Fusion und nachgelagerte Produktion von reaktiven Sauerstoff Zwischenprodukte (ROI). Die zeitliche Aktivierung von bestimmten phagozytische antimikrobielle Antworten auf unterschiedlichen Stufen der PKM Differenzierung schlägt Spezialisierung innerhalb der Makrophagen-Fach früh in der Evolution, an bestimmten Host Immunität Anforderungen in speziellen Nischen ausgerichtet.
Antimikrobielle Mechanismen Der Fisch Leukozyten
Developmental and Comparative Immunology. Dec, 2011 | Pubmed ID: 21414350
Frühe Aktivierung und Koordinierung der angeborenen Abwehr sind wichtig für wirksame Maßnahmen gegen Krankheitserreger zu infiltrieren. Schnelle Engagement von Immunzellen bietet einen kritischen ersten Linie der Verteidigung bald nach Erreger eindringen. Aktivierung führt ein instrumentiertes Satz von Ereignissen, der die Induktion sieht und Regulierung der intrazellulären und extrazellulären antimikrobielle Abwehr. Ein Array von regulatorischen Mediatoren, hochgiftige lösliche Moleküle, Degradations Enzyme und antimikrobielle Peptide bietet maximalen Schutz gegen ein breites Spektrum von Erregern während den endogenen Schaden auf Host-Gewebe. In diesem Bericht wir markieren die jüngsten Fortschritte im Verständnis der angeborenen zelluläre antimikrobielle Antworten teleost Fische und ihre Implikationen für Zelle überleben, Immunmodulation und Tod zu diskutieren. Die evolutionäre Erhaltung dieser Antworten ist ein Beweis für ihre Wirksamkeit gegen Erreger eindringen und ihr Engagement für eine effektive Wartung der Host-Homöostase. Wichtig ist, haben jüngste Entwicklungen in teleost Fische Systeme Roman Host Verteidigungsstrategien identifiziert, die möglicherweise für diese niedrigeren Vertebraten Gruppe eindeutig oder verweist möglicherweise auf bisher unbekannte angeborene Mechanismen, die auch eine bedeutende Rolle in höheren Wirbeltieren Host Immunität zu spielen.
Zentrale Vorverkauf: Bauchhöhle B-1 B-Zellen Haben Phagozytische Und Mikrobizide Kapazitäten Und Gegenwärtigen Phagozytiertes Antigen Auf CD4 + T-Zellen
Journal of Leukocyte Biology. Nov, 2011 | Pubmed ID: 22058420
Brechen das lang gehegte Paradigma, dass primäre B-Zellen nicht phagozytische sind, mehrere Studien kürzlich, B-Zellen von Fischen, Amphibien bewiesen haben und Reptilien eine bedeutende phagozytische Kapazität haben. Ob dieser Kapazität in gewissen Säugetier-B-Zell-Teilmengen konservierten geblieben ist derzeit ein Rätsel. Hier berichten wir über eine zuvor unbekannte Fähigkeit der PerC B-1a und 1 B-b-Lymphozyten, Latex Perlen und Bakterien phagocytose. Im Gegensatz dazu hatte B-2-Lymphozyten eine fast vernachlässigbare Fähigkeit, diese Partikel zu verinnerlichen. Bei der Phagozytose B-1a und 1 B-b-Zellen konnten ihre Phagosomen in Phagolysosomes ältere und angezeigt, die Fähigkeit, verinnerlichte Bakterien zu töten. B-1a und 1 B-b-Zellen präsentieren vor allem effektiv Antigen aus phagozytiertes Teilchen auf CD4(+) T-Zellen wiederhergestellt. Diese Zellen zeigte allerdings eine viel geringere Kompetenz, lösliche Antigen oder Antigen aus großen, noninternalized Partikel zu präsentieren. B-1 B Zellen präsentiert Partikel und lösliche Antigen zu CD4(+) T-Zellen effizienter als Makrophagen, während DCs die potentesten APCs waren. Der Roman phagozytische und Mikrobizide Fähigkeiten im B-1 B-Lymphozyten identifiziert stärken die angeborene Natur, die lange auf diese Zellen zugeschrieben hat. Im Rahmen der adaptiven Immunität zeigen wir, dass diese angeborene immun Prozesse relevant, wie sie zu vorhanden phagocytosable Partikel Antigen B-1 B-Zellen aktivieren. Diese Kapazitäten positionieren diese Zellen an der Kreuzung, die angeborenen mit adaptiven Immunsystems Prozesse verknüpfen. In einem breiteren Kontext unterstützen diese neu identifizierten Kapazitäten von B-1 B-Zellen weiter die zuvor erkannten funktionellen, Entwicklungsstörungen und evolutionären Beziehungen zwischen diesen Zellen und Makrophagen.
