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Articles by David M. Francis in JoVE
JoVE General
番茄分析器：一个有用的软件应用，收集准确和详细的二维物体的形态和色度数据
Department of Horticulture and Crop Science, The Ohio State University
番茄仪（TA）在重复性好，准确地量化的二维形状和颜色的属性。一步一步的过程是一个获得高质量的数字化图像的番茄果实，形态和色彩分析这些图像，然后使用几个应用程序，通过该软件生成的数据。
Other articles by David M. Francis on PubMed
慢性特发性荨麻疹和与疾病严重程度的相关性的抗 FcepsilonRI 和抗 IgE 抗体的分类。
循环 FcepsilonRI 抗体，IgE，或两者都发生在约有三分之一的患者慢性特发性荨麻疹 (调查组)，但不是所有的自身抗体发起组胺释放。
QTL 控制干形态和番茄 EsculentumxLycopersicon 棉 (茄科) 十字架的血管发育位于 2 号染色体上。
高等植物维管组织组织成一个连续的统一系统，经历两个极具特色的结构、 根与茎之间的过渡。这种过渡了番茄调查番茄和 L.棉 LA407 之间的形态变异的遗传基础的研究。我们的分析集中于形态的截面，和我们干自交回交人口拥有 L.番茄作为经常性的父项和作为捐助父 LA407 检测到遗传遗传差异。交回交线 (IBL) 2353年载从 2 号染色体的捐助部分和保留的功能的 LA407 干血管形态。标记性状分析血管结构在 IBL 2353 和 L.番茄显著 (0.0001 ≤ P ≤ 0.0375) 之间的跨中的 2 号染色体上的标记和主血管束的大小、 形状的血管系统和辅助血管组织的厚度之间的关联。家庭与 LA407 DNA 的 2 号染色体上的标记了较大的主血管束、 较发达的中等的血管组织和血管三角形状。这些结果表明，在 LA407 中的 2 号染色体的远端部分包含轨迹或影响血管形态和发展轨迹。
积极防御反应与拟南芥 Oomycete 马铃薯晚疫病病菌非宿主抗性相关联。
摘要的分子基础非主机抵抗或物种特异性的抗，仍然是一个微生物-植物相互作用的研究中，主要的未知数。在本文中，我们描述涉及模式植物拟南芥和经济上重要的和具有破坏性的 oomycete 马铃薯晚疫病病原非主机 pathosystem 的表征。细胞学的早期阶段的这种互动调查发芽的马铃薯晚疫病病菌囊肿对拟南芥叶片、 直接穿透表皮细胞，形成感染水泡和偶尔的二级菌丝，其次是典型的过敏反应。马铃薯晚疫病病菌生物过程的拟南芥感染动态监测动力学 pcr、 生物量增加期间第一次 24 小时暴露后接种，随后在后期减少。转基因记者行和 RNA 污点分析被用来描绘的防御反应诱导以下马铃薯晚疫病病菌感染。PDF1.2 的重大感应有人在 48 h 后接种，而 PR 基因表达水平升高检测到接种后的三天。要进一步描述这种防卫反应，DNA 芯片分析进行感染后确定为 11 000 c.拟南芥菜花 16 h 表达谱。这些分析发现拟南芥非宿主反应和其他与国防有关的治疗，文献所述之间有显著的重叠。尤其是，非主机响应马铃薯晚疫病病菌是茉莉通路的激活与明确关联。所述的拟南芥体育晚疫病 pathosystem 提供了极好的前景，为提高我们对非宿主抗性的了解。
蛋白质组学分析的两个基因控制的番茄细菌性溃疡病的抗性 Rcm 2.0 和 Rcm 5.1 介导耐药。
番茄棉，Rcm 2.0 和 Rcm 5.1，从两个数量性状基因控制马铃薯环腐病菌亚种病菌，因果代理的番茄细菌性溃疡病的抗性。包含 Rcm 2.0 和 Rcm 5.1 和容易控制线行在 72 和 144 h postinoculation，使用 2 维凝胶电泳来标识规定 C.病菌亚种病菌感染反应的蛋白质进行了比较。总共有 47 蛋白质遭到串联质谱法。由此产生的光谱与数据库查询发现番茄基因 26 蛋白质。其余 21 蛋白质也确定了其他物种或拥有没有已知蛋白的同源性。光谱被解释为推断出肽氨基酸序列，然后被用来查询公开提供数据。这种方法确定番茄基因或表达序列标签为 44 的蛋白质进行分析。三种超氧化物歧化酶 (SOD) 酶差异基因型，规管和过氧化氢积累模式基因型-和组织特异性，表明氧化应激反应 C.病菌亚种病菌的作用。超氧化物歧化酶、 硫氧还蛋白 M 型、 S adenosylhomocysteine 水解和病程相关蛋白的稳态 mRNA 和蛋白水平的差别调控相似。包含 Rcm 2.0 和 Rcm 5.1 行积累不同蛋白质和稳态 mRNAs 在接种，这表明两个基因位点可通过不同机制耐药性的响应。
在番茄种内跨越到 T1 枯株白菜型油菜抗 Pv。vesicatoria 引起细菌性斑点病番茄。
抽象我们用分子标记来标识数量性状基因 (QTL) 的耐药性对疮痂病领域光伏。vesicatoria 种族 T1、 细菌性斑点病番茄的因果代理。F(2) 人口来自夏威夷 7998 (H 7998） 之间的交叉和精英育种线，俄亥俄州 88119，用于初步认定的分子标记和抵抗细菌菌群的个别植物温室大棚来衡量之间的关联。在此抵抗番茄番茄捐助与精英 L.番茄父之间的跨多态性是有限的。一套核心的 148 聚合酶链反应基于标记被认定为多态在 L.番茄 x L.番茄杂交导致了为感兴趣的跨多态的 37 标记的鉴定有针对性地的使用。以前的研究使用 x L.pennellii 宽 H 7998 交叉牵连三个基因位点、 Rx1、 Rx2，rx3 型，T1 株的过敏反应。我们确定的标记被链接到 Rx1 和 rx3 型基因位点，但在 Rx2 所在的 1 号染色体区域确定了没有标记。单个标记性状分析建议，5 号染色体，附近的 rx3 型轨迹，减少细菌菌群的行执行从 H 7998 轨迹作出了贡献。5 号染色体上的轨迹解释发展中国家在受感染的植物的细菌种群表型变异的 25%。高的世代和随后自交回交线作为经常性的父项使用俄亥俄 88119 开发了用于确认 QTL 协会 F(2) 人口中检测到。5 号染色体上的标记解释复制田间抗性的表型变异的 41%。相比之下，1 号染色体上的 Rx1 轨迹没发挥作用在抵抗十、 白菜型油菜光伏。vesicatoria 种族 T1 株细菌菌群的温室或在该字段中的症状来衡量。从 H 7998 第 4 号染色体的轨迹是与疾病易感性的关联，并解释说总表型变异的 11%。附加电阻变化的解释是植物成熟 （6%），由表示显示多个电阻的不确定植物的抵抗与植物的习惯 （6%），较低级别的早期成熟家庭。链接到 rx3 型的标记将有助于抵抗 x 精英十字架精英的选择。
支架相关儿科移植肾输尿管的梗阻。
输尿管梗阻和使用外部引流膀胱输尿管皮肤 （外部） 支架的并发症率 （组 1： n = 39） 和内部输尿管膀胱 (双 J） 支架的使用 （组 2： n = 16)，55 64 连续儿科肾移植受者，在执行我们机构 1996 年 1 月至 2003 年 12 月，已经比较。血清肌酐水平 pre 和手术和 pre 和血管内支架拆除录。输尿管梗阻的诊断基于增加血清肌酐的 > 或 = 20%，结合超声证据的积水或指示，凡肾功能不全的其他原因被排除在外。输尿管梗阻发生在 13 39 例 (33.3%) 在组 1 中，相比只有一例输尿管梗阻患者 16 (6.25%) 在组 2 中的 （或 = 7.5，95 %ci = 0.8-70，P = 0.038）。没有任何证据的尿路感染的人数分别 (9/39 组 1 中、 6/16 在组 2，或 = 0.5，95 %ci = 0.14 到 1.8，P = 0.275） 或医院留的平均长度 （在第 1 组，在组 2 中，95 %ci =-2.3 至 4 天，P 10.1 天 10.9 天 = 0.565） 两个组之间。肾小球滤过率 (肾小球过滤率) 在一周后支架拆除在组 2 中，改善，但在组 1 中恶化 （P = 0.07)。这种非随机对照比较的支架类型支持在儿科肾移植-减少输尿管并发症和改善肾功能血管内支架拆除支架置入双 J 预防性使用。
两级 Brachiobasilic 动静脉瘘的慢性血液透析访问。
许多血液透析病人不能具有或保持上肢远端动静脉 (AV) 瘘因不足静脉或动脉，因此需要更近端访问。我们已与塑造的手臂两级 brachiobasilic AV 血液透析瘘检讨我们的经验。
从热诱导独联体异构体富番茄汁番茄红素是从所有跨富番茄酱在人类受试者比更多生物。
番茄红素是目前主要作为独联体异构体人类血清和组织中，而所有跨-番茄红素在番茄制品中占主导都地位表明，所有-跨-番茄红素 isomerised 在正文中，或被少生物。本研究的目的是制定工艺条件的西红柿获得产品具有不同的独联体跨-番茄红素异构体分布，并评估其生物利用度。健康成人受试者 (n 12) 受聘为此随机交叉试验。每次发言之前按水毁 2 周期间。两个番茄汁，一个富含全-跨-番茄 （32.5 毫克番茄红素/100 g 总酱 ； 5%独联体异构体），其他高在独联体-番茄红素 （26.4 毫克番茄红素/100 g 总酱 ； 45%独联体异构体），制作了由不同的加热处理技术。每个酱 (150 克) 在后隔夜禁食 08.00 小时已送达标准化的膳食中。血浆标记富脂蛋白组分超过 9.5 h 后测试餐消费作为一项措施吸收番茄红素的获得和表示为基线更正区域诉时间曲线 (AUC) 浓度下使用高效液相色谱电化学检测。所有跨-番茄红素的反应是明显高于从独联体异构体富酱，相比全跨富酱，被诉 4.74 （sem 1.08) nmol 7.30 （sem 1.45） 和 AUC 值调整量消耗的番茄红素为表明的总数，共计独联体-x h/l (P = 0.002），3.80 （sem 0.76） 诉 1.98 （sem 0.37） nmol x h/l (P = 0.0005) 3.50 （sem 0.76） 诉 2.76 （sem 0.76） nmol x h/l (P = 0.01）分别。本研究从独联体富番茄红素番茄汁演示大番茄红素生物利用度，突出考虑同分异构体分布的番茄红素生物利用度的重要性。此外，可以控制工艺参数改变的番茄制品的同分异构体模式和影响番茄红素生物利用度。
血型不相容肾移植： 一定的时间来重新审视 ！
我们与抗体清除前和移植后，报告成功肾移植 (A1 捐助者 O 收件人），和 pre-transplant 抗 CD20 单克隆抗体 (利妥昔单抗)、 静脉注射丙种球蛋白和常规移植免疫抑制的管理。移植手术，执行无脾切除术，是第一次在澳大利亚这种移植。在 20 个月，患者的肌酐水平是 110-130 摩尔/升，没有证据表明拒绝与无并发症。Abo 血型不合的移植应该增加"活体"肾移植，减少等候时间，并改善病人预后。
应激和促肾上腺皮质激素释放因子诱导复职，并积极与压力有关的行为反应被增强后长时间访问可卡因自治的大鼠。
压力事件期间戒毒可能有助于可卡因依赖个人在复发。服用过量可卡因可能增加通过改建的应激诱发复吸易感性脑促肾上腺皮质激素释放因子 (CRF) 响应能力。
优化采样的番茄果实类胡萝卜素含量与评估的成熟障碍影响到应用程序。
颜色定义为番茄和番茄制品质量的一个方面。类胡萝卜素色素负责的红色和橙色的番茄果实颜色，因此颜色也膳食感兴趣。这项研究的目的是 (1) 对确定的相对重要性的现场取样和分析复制时对番茄红素和番茄汁及组织中的胡萝卜素含量测定番茄红素、 胡萝卜素番茄果实中和 (2) 对确定黄色肩障碍 (顺达) 的影响。我们的研究结果显示增加生物复制是一个有效的策略，为减少实验误差的番茄红素、 胡萝卜素的测量与关联。分析复制没有不极大地促进观察到的变化，并因此将通过减少而增加字段复制分析复制获得实验效率。我们发现顺达大大减少了受影响的组织中，并由受影响水果制成的汁中的番茄红素。相比之下，胡萝卜素浓度只减少了受影响的组织中，但汁中并未明显降低。随着 biofortified 作物的兴趣，调制番茄中的类胡萝卜素的配置文件，通过最小化顺达症状表示改善目前由种植合同结构和处理器职系支持的番茄果实品质的策略。
外科手术与昼夜皮质酮替代减慢升级并防止大鼠自治下长准入条件的可卡因可卡因诱导复职的扩充。
控制可卡因使用和定义人类可卡因成瘾的药物复发持续加剧易感性的损失是药源性神经可塑性的后果和可以在大鼠自治可卡因作为升级的药物摄入和高度的敏感性复职模式的日常长访问 (LgA) 的条件下学习。这项研究对这些行为的毒瘾有关的神经可塑性指数调查作出贡献的潜力提升糖皮质激素在 LgA 可卡因自治 (SA) 的时间。大鼠提供 14 天的可卡因 6 h 访问 (LgA) 表明了逐步升级的 SA 和可卡因诱导复职 (10 mg/kg，腹腔) 条件下短期访问 (长沙 ； 2 h) 自治的大鼠相比更容易。外科的肾上腺和皮质酮更换 (ADX/C) 养生，同时保持分泌的昼夜模式消除 SA 诱导下的增加皮质酮 (科特) 未能改变 SA 或长沙大鼠恢复但放缓升级和减毒 LgA 大鼠应用之前但不是后慢性 LgA SA 测试时以后恢复。虽然不能排除其他肾上腺激素的贡献，这些数据表明高架糖皮质激素在可卡因曝光时间可能需要对可卡因摄入和后来复职 LgA SA 的影响。日常科特管理之前每天长沙 SA，期间 LgA SA，模仿的 LgA SA 影响转载反应的剂量不能表明期间 SA 高架糖皮质激素可能有助于成瘾的可卡因诱导神经可塑性中发挥纵容的作用。
高敏抗性细菌现货 T3 (白叶枯病 Perforans) 从番茄加入 PI 128216 的表征。
细菌性斑点病番茄是由四个物种的白叶枯病引起的。PI 128216 (白毛 pimpinellifolium） 加入显示 (HR) 比赛 T3 株 (predominantely 白叶枯病 perforans） 的过敏反应。我们开发了自交回交 (IBC) 人口 (BC(2)S(5)，178 家庭） 来自 PI 128216 和 OH88119 (S.lycopersicum) 作为易复发父项同时渗入和 HR 反应的遗传分析。这些中型散货箱家庭进行了评估，为人力资源部门竞赛 T3 应变 Xcv761 温室。中型散货箱人口是泌尿系统，找出可以赋予抵抗的候选基因位点分配到整个基因组的分子标记。我们中型散货箱人口视为一假说成型代指导中随后十字架的验证。非参数分析确定 HR 和聚集在 11 号染色体上的标记之间的关联 (P < 0.0001 0.05) 和 6 号染色体 (0.04 > P > 0.002）。中型散货箱人口进一步分析建议标记染色体 6 和 11 上的未能协调独立，称为四分孢子阶段不平衡现象。因此，若要验证标记性状的联系，耐中型散货箱植物都越过了与 OH88119 和 BC(3)F(2) 后代在温室中的 HR 评价了。这些后来的人口，HR 的反应是与 11 号染色体标记相关联 (P < 0.0002)，但不是与 6 号染色体上的标记 (P > 0.25)。独立 F(2) 家庭制定了 OH8245、 OH88119，和 OH7530 的交叉耐药中型散货箱行。这些人口有泌尿系统，组织到类基于染色体 11 标记和计算领域中的阻力。取决于基因用量和遗传背景的抵抗 PI 128216 提供的轨迹在 11 号染色体上。这些结果定义单个轨迹、 Rx-4，从 PI 128216，其中提供了抗细菌性斑点种族 T3、 添加剂基因操作，和位于 11 号染色体上。
栽培番茄 (白毛 Lycopersicum L.） 多态性寡核苷酸阵列发现揭示了单核苷酸多态性变异与育种相关模式。
栽培的番茄 (白毛 lycopersicum L.） 已很难确定之间优异种质基因多态性的窄遗传多样性。我们作为标记发展栽培番茄高吞吐量方法探讨基于阵列的单一功能多态性 (SFP) 发现。
外科的决策。
决策是外科实践的一个组成部分，一是同等重要的运作能力的技能。健全决策是获得 '外科智慧'，通过学习、 体验和思考的结果。本文回顾了进程的外科决策选择正确的程序和决定何时能运作，恕我直言，如何执行部分的决定，以及因素，影响我们手术的决定。
矮牵牛授粉诱导卡罗拉衰老的蛋白质组学分析。
衰老表示其间大分子和细胞器的退化和营养素是向发展中国家组织再生的花瓣发展的最后阶段。为了更好地了解调节花瓣衰老，蛋白质组学方法被用来分析蛋白质的转录变化效果更改 Petuniaxhybrida '米切尔二倍体' 衰老过程中花冠。总可溶性蛋白提取从授粉矮牵牛花冠在 0、 24、 48、 72 h 花开放后和在 24、 48、 72 h 授粉后。双向凝胶电泳技术 (2-DE) 用于标识表达非衰老 (unpollinated) 和衰老 （授粉) 花冠的蛋白质和图像分析被用来确定哪些蛋白质 2.1-fold 是通过实验确定停产的向上或向下调节为 P < 0.05。三十三个差异表达的蛋白点选定了测序。高效液相色谱串联质谱法 (LC-MS/MS) 用来确定这些蛋白质的身份。搜索翻译的 EST 数据库和 NCBI 非冗余蛋白质数据库，得以将假定识别分配给大于 90%的这些蛋白质。许多衰老上调蛋白质被认定参与国防和应激反应或高分子分解代谢。确定了一些蛋白质，以前没有花衰老过程的特点，包括 orthologue 的成熟蛋白 4 (ASR4) 的番茄脱落酸应力。基因表达模式并不总是相关蛋白表达，确认蛋白质组学和基因组学将需要详细了解的花瓣衰老的规管。
使用番茄和拟南芥基因组信息的栽培番茄内含子多态性的发现。
较低的遗传变异具有有限表征栽培番茄重要性状的分子标记的应用程序。(COS)，表示序列中番茄守恒 ortholog 集检测多态性标记 （无害环境技术) 搜查对番茄和拟南芥基因组的序列，以定义内含子的位置。内含子被放大从 12 不同加入番茄的聚合酶链反应和核苷酸序列由测序。结果表明有 71%的可能性来放大内含子从番茄基因组 DNA，通过这种办法。总共有 201 内含子从 86 COS unigenes 被测序。内含子的立场和数字保守之间番茄和拟南芥，但平均内含子的长度是在拟南芥中比番茄长三倍。总共有 307 单核苷酸多态性 (SNPs) 和 75 indels 57 COS unigenes 12 番茄品系的内含子中检测到。内栽培番茄种质 172 单核苷酸多态性和 47 indels 33 COS unigenes 内含子中检测到。此外，在用的 27 COS unigenes 确定了 41 单核苷酸多态性。单核苷酸多态性的频率是用在具有内含子和 exonic 基因多态性的 22 COS unigenes 比内含子高 2.4 倍。这些结果表明内含子区域可能包含足够的变异中栽培番茄全基因组分析的足够标记资源开发。
番茄细菌性斑点竞赛 T4 抗性相关基因定位的标识。
细菌性斑点病番茄 (白毛 lycopersicum L.)，引起几个白叶枯病 sp.），是通过化学方法控制严重但困难的疾病。出现竞赛毒番茄、 定量的抵抗，继承和幼苗测定及在该字段中的电阻低相关性阻碍了发展的阻力。S.lycopersicum 变种 cerasiformae 加入 PI 114490 叙述了多个种族，包括种族 T4、 抗性。我们用分子标记来标识数量性状位点 (QTL) 的关联中来自哦 9242、 PI 114490 和佛罗里达 7600，与番茄加入夏威夷 7998 (H7998) 在其系谱选育行精英自交回交 (IBC) 人口。与这些行跨越种族 T4 还在 — — 佛罗里达 8233、 佛罗里达 8517 和佛罗里达 8326 和选择性基因分型的方法用来标识 introgressions 关联中分离所得的后代抵抗的先进的育种行中说明了抵抗。在 IBC 人口中，11 和 3 号染色体上的基因位点分别解释高达 29.4 和 4.8%的电阻变化。这两个这些座位也证实了选择性基因分型： PI 114490 和 H7998 等位基因染色体 11 每个提供抗。PI 114490 3 号染色体上的等位基因被证实在美国佛罗里达州 8517 人口中，和等位基因的待定后裔证实在此 — — 佛罗里达 8326 人口中的轨迹。染色体 12 等位基因有关联 — — 佛罗里达 8517 人群易感性的关系。造成轻微影响的额外座位也牵涉到在中型散货箱人口或选择性基因分型。选型主要 QTL 标记指示震撼的办法应大大提高效率的细菌现货种族 T4 抗性育种，虽然尚未被发现的 QTL 将需要进行严格的标记辅助选择。
番茄红素番茄汁遭受储存稳定性相结合压力热处理。
储存稳定性的热中断番茄汁准备从两个不同品种和处理的各种压力热组合中的番茄红素的特点进行了研究。样品受到压力辅助的热加工 (PATP ； 600 MPa，100 摄氏度，10 分钟)、 高压处理 (小贩认可区 ； 700 MPa、 45 度 C，10 分钟) 和热加工 (TP ； 0.1 MPa，100 摄氏度，35 分钟)。已处理的样品被存放在 4、 25 和为引进高达 37 摄氏度 52 周。小贩认可区和 PATP 处理大大改进番茄红素的工美 TP 和控制。全反式番茄红素被发现在处理期间的异构化和独联体异构体含量的控制相当稳定，加工的果汁没有明显差别。番茄红素降解在存放期间，作为函数的品种、 加工方法、 贮藏温度和时间各不相同。这项研究显示联合的压力温度处理可能是热杀菌保存番茄汁质量很好的替代品。
从西红柿与红外光谱法测量不同颜料配置文件所作的番茄汁的生产与储存过程中类胡萝卜素稳定性。
类胡萝卜素和脂类化学变化在生产和使用 ATR 红外光谱法和高效液相色谱法的罐装的番茄汁的存储过程进行了研究。从具有不同的配置文件的类胡萝卜素的西红柿 10 组样品分析了新鲜后热中断和筛选、 后装罐，并在五个不同的时间点在 1 年的存储。类胡萝卜素明显增加指出由于改进的提取效率热休息后。这种增加被伴随某种程度的脂质氧化和异构化类胡萝卜素。建宁产生最激烈变化，脂质分解甘油三酯 (约 1743 cm(-1))、 脂肪酸 （约 1712 cm(-1))，和退化和异构化跨-类胡萝卜素 (约 960 和约 3006 cm(-1)) 的形成与配置文件中.异构化反应证实了相应的类胡萝卜素独联体异构体的高效液相色谱法领域相对增加。建宁分别减少跨-番茄红素、 跨-三角洲-胡萝卜素、 反式-β-胡萝卜素，跨叶黄素的 30、 34、 43 和 67%。高效液相色谱法的数据表明罐头导致 tetra-独联体-番茄红素的急剧减少，并促进其异构化到其他几何的形式，包括所有跨-番茄红素。番茄汁脂质组分的红外光谱 (SECV < 11 天，r 值 > 0.99），存储的天数与相关血脂游行示威持续恶化。结果表明个别类胡萝卜素和其异构形式的行为以不同的方式在生产和罐装的番茄汁的存储过程。红外光谱法收集到的资料很好补充的高效液相色谱法，提供标记带进一步了解化学的变化发生在加工和储存的番茄汁。
基于番茄的食品前列腺癌预防： 我们学到了？
证据来自于大量的实验室研究和流行病学调查有牵连饵料丰富的水果和蔬菜的降低某些癌症的风险。但是，这些方法不能证明的因果关系，有的随机、 对照试验因困难而缺乏涉及与执行食品和行为变化的研究。而不是追求所必需明确干预审判，以水果和蔬菜中的生物活性成分的确认，其中单个代理使用药理方法后来的发展为重点的简化论的办法推动了近几十年来研究的重点。此时，没有化学预防策略都是标准的护理在医疗实践中所产生的这种做法。这项检讨介绍另一种方法以番茄为基础的食品产品针对癌症预防的人体临床试验，作为辅助治疗手段的发展为重点。西红柿是生物活性植物化学物质的来源和广泛使用。可以操纵的番茄制品植物化工模式优化通过遗传学、 园艺技术和食品加工的抗癌活性。发展丰富的临床试验针对特定癌症，尤其是前列腺癌、 抗癌植物化学物质的高度一致的基于番茄的食品产品的机会，就必须园艺、 食品技师、 癌症生物学家和临床转化调查人员互动的跨学科研究的工作。
与水有关的形态和生理适应在地中海加入的茄果类 Lycopersicum 中使用效率。
背后的 Tomàtiga de Ramellet (TR) 品种明显抗旱生理性状，人口的地中海番茄品种与延迟的水果恶化 (DFD) 表型和通常种植下非灌溉条件，进行评估。八个不同番茄加入已选定，并列入国家的六个 TR 加入一个地中海国家非 TR 加入 （NTR(M)) 和加工品种 (NTR(O))。TR 加入两叶形态类型，选择正常分裂的叶片和叶、 马铃薯。植物被栽下黄水 (WW) 强调水 （WS） 治疗和，30 和 10%的土壤水容量，分别。加入分别按叶类型和 TR 型下 WW 和 WS，聚簇。不同水分处理下参数相关性建议这种潜力改善内部用水效率 (A(N)/g(s)) 是对收益率的负面影响不可能的。WS TR 下加入显示较高 A (N) /g(s)，这并不是因为差异与光合作用有关参数，但与叶片叶肉细胞与气孔 conductances （g(m)/g(s)) 比例相关.结果证实对地中海加入的番茄，干旱胁迫的反应鉴别性状的存在，表明 g (m) /g(s) 比率的增加使改进 A (N) /g(s) 在园艺作物中。
全基因组的单核苷酸多态性检测中的多态性的集合映射和连锁不平衡分析种植番茄。
历史的番茄 (白毛 lycopersicum L.） 改进包括遗传瓶颈、 野生物种 introgressions 和成不同市场类分歧。这段历史使番茄一个优秀的模型来调查选择对基因组变异的影响。两个 F(2) 种群遗传图谱和物理映射与新出现的数据用于定位 434 基于聚合酶链反应的指标，包括单核苷酸多态性。 三---140 个标记的基因组序列的组合被用于代表野生物种、 品种、 复古的品种和当代 (新鲜市场和加工) 品种的基因型 102 番茄行。主成分分析证实的栽培番茄市场类之间的遗传差异 （P < 0.0001)。全基因组的调查表明，连锁不平衡 （LD） 衰减超过 6-8 厘米，当所有栽培西红柿，包括经典和当代的是一起审议。当代加工品种内 LD 腐朽超过 6-14 厘米，和衰变是超过 3-16 厘米内新鲜市场品种。重大的 inter-chromosomal （四分孢子阶段） LD 检测到新鲜市场和加工品种之间染色体 2 和 3，2 和 4，而是为每个市场类不同染色体位置。额外 LD 染色体 3、 4、 3 和 11，4 和 6 鲜肉市场品种和染色体 3 和 12 中加工品种之间检测到。这些结果表明市场专业化的番茄育种实践导致遗传差异新鲜市场和加工类型之间。
从番茄过敏抵抗分子图谱夏威夷 7981' 白叶枯病 Perforans 竞赛 T3。
细菌性斑点病番茄 (白毛 lycopersicum) 是由四个物种的白叶枯病引起的。疾病导致重大的产量损失和减少果实品质。与对应的白叶枯病 perforans 菌株的种族番茄 3 (T3) 说明了生理小种。育种一行夏威夷 7981 (以下简称 H7981） 显示过敏反应 (HR) 竞赛 T3 株受制于宿主抵抗轨迹 Xv3 与细菌的相互作用效应 avrXv3。Xv3 基因是必需的 H7981 派生的抵抗，可有效字段条件下，虽然其表达式是受遗传背景。来自跨越到加工番茄父母 OH88119 和 OH7870 的 H7981 F(2) 人群中分离的 HR 331 后代进行了研究，拥有两个独立的跨越提供验证。我们甄别 453 简单序列重复、 插入/删除和单核苷酸多态性标记，并确定 44 多态性标记每个 OH88119 和 OH7870 人口面积 84.6 73.3%的基因组，分别为和，20 centimorgans （厘米） 内。使用所有的多态性标记的标记性状分析表明 Xv3 介导的抗性映射到两个独立十字形 11 号染色体。携带 Xv3 从 H7981 派生的行之间的杂交进行等位性测试、 Rx 4 源自植物引种 (PI) 128216 和从 PI 126932 派生的抵抗。这些等位性测试建议空调 HR 种族 T3 株的基因位点 0.1 厘米内链接、 是等位基因，或有相同的基因。
精细定位及候选基因在番茄中分析的加入 PI128216 赋予过敏抵抗细菌现货竞赛 T3。
白叶枯病 euvesicatoria、 十、 vesicatoria、 十、 perforans 和十、 gardneri 引起的细菌性斑点是西红柿 (白毛 lycopersicum L.） 生长在热带和亚热带地区的最具破坏性的疾病之一。探索从不同种质资源的抗性基因，并将其纳入栽培品种是控制这种疾病的关键。S.pimpinellifolium 加入 PI128216 据报进行的 Rx4 基因染色体 11 赋予过敏及田间抗性竞赛 T3。为了便于在育种中的分子标记辅助选择使用和基于地图的基因的克隆，源自易感品种 OH88119 和 PI128216 的耐加入一种介于 F(2) 人口成立为 Rx4 基因的精细定位。我们使用 18 标记通过各种办法制定，映射基因到 45.1 kb 之间两个标记 pcc17 和 pcc14 在 11 号染色体上的区域。国家统计局令类耐药基因被确定为基于注释结果从国际番茄批注组的 Rx4 基因的候选人。Rx4 在 PI128216 和 OH88119 的等位基因的基因组序列的比较显示 6 bp 插入/删除 （InDel） 和八个单核苷酸多态性。InDel 标记被成功地用于区分抵抗和敏感性的番茄生产线 12 条。这些结果将便利 Rx4 基因的克隆和分子标记辅助选择的这种基因在番茄育种程序提供一个有用的工具。
