Articles by David Schauder in JoVE

Détermination des structures moléculaires des glycoprotéines d'enveloppe du VIH en utilisant microscopie cryo-électronique et automatisée Sous-tomogramme moyenne

JoVE 2770 12/01/2011

Joel R. Meyerson^1,2, Tommi A. White¹, Donald Bliss³, Amy Moran³, Alberto Bartesaghi¹, Mario J. Borgnia¹, M. Jason V. de la Cruz¹, David Schauder¹, Lisa M. Hartnell¹, Rachna Nandwani^1,4, Moez Dawood⁵, Brianna Kim⁶, Jun Hong Kim⁷, John Sununu⁸, Lisa Yang⁹, Siddhant Bhatia¹⁰, Carolyn Subramaniam¹, Darrell E. Hurt¹¹, Laurent Gaudreault¹², Sriram Subramaniam¹

¹Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, ²The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, ³National Library of Medicine, National Institutes of Health, ⁴Massachusetts Institute of Technology, ⁵William Fremd High School, ⁶University of Virginia, ⁷Duke University, ⁸Yale University, ⁹University of Notre Dame, ¹⁰Washington University in St. Louis, ¹¹Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, ¹²Thomas Jefferson High School for Science and Technology

Le protocole décrit une approche à haut débit pour déterminer les structures des protéines membranaires par cryo-tomographie électronique et traitement d'images 3D. Il couvre les détails de la préparation des échantillons, collecte, traitement et interprétation des données, et se termine par la production d'une cible représentant de l'approche, le VIH-1 glycoprotéine d'enveloppe. Ces procédures de calcul sont conçues d'une façon qui permet aux chercheurs et aux étudiants de travailler à distance et de contribuer au traitement des données et l'analyse structurale.