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Articles by Derek Cummings in JoVE
JoVE General
골수 엽 성의 전구 물질에서 골수양 돌기 세포의 문화
1Medical Sciences Program, McMaster University, 2Centre for Gene Therapeutics, McMaster University, 3Department of Chemical Engineering, University of Waterloo
이 동영상은 마우스 골수에서 골수양 돌기 세포를 차별에 대한 절차를 설명합니다. 마우스 경골과 대퇴골, 그리고 골수 처리의 분리가 증명하고 있습니다. 세포 표현형 및 CPG를 사용하여 IL - 12 생산 다음과 성숙을 묘사한 분화 전후의 세포 형태를 보여주는 사진, 그림이 표시됩니다.
Other articles by Derek Cummings on PubMed
Cre 레벨 Cre/loxP 도우미 종속 Adenoviral 벡터 시스템에서 포장 신호 절단 효율을 제한합니다
도우미 종속 (HD) 아 데 노 바이러스 벡터 코딩 시퀀스 모든 바이러스 성 없는 복제 대용량 있고 무시할 수 독성, 유전자 치료에 대 한 매력적인 벡터를 만들고 장기적인 transgene 식 vivo에서 제공 합니다. 현재, HD 벡터를 생산 하는 가장 효율적인 수단 293 셀 HD 벡터와 베어링 loxP 사이트에 의해 형벌 포장 신호 도우미 바이러스 Cre 표현 coinfecting 해야 합니다. Cre 중재 포장 신호 절단에 도우미 바이러스 게놈을 렌더링 unpackageable 하지만 여전히 복제할 수 HD 벡터 전파에 대 한 도우미 함수를 제공 합니다. 일반적으로 도우미 바이러스 오염은 < = 1% 사전 또는 및 < 또는 CsCl 밴딩 하 여 0.1 %postpurification =. 이러한 오염 수준 낮은 반면 추가 감소는 바람직하다. 그러나, Cre/loxP 시스템을 처음으로 개발한 이후이 목표 실현 되지 않았습니다. 진행이이 부족, 적어도 부분적으로, 오염 도우미 바이러스 유래의 이해, 따라서 달성 하기 어려운 그것의 감소 또는 제거 렌더링의 우리의 부족 때문 이다. 이 연구는 오염 도우미 바이러스 HD 벡터 증폭 하는 동안 지속 가능한 소스를 조사 하도록 설계 되었습니다. 결과 발표 Cre 도우미에 제한 바이러스 감염 Cre를 표현 함으로써 신호 절단 포장을 탈출 하 여 전파 도우미 바이러스 허용 293 셀. 이 연구 결과 더 줄이거나 가능성이 오염 도우미 바이러스를 제거 하는 합리적인 전략을 개발 하기 위한 기초를 제공 해야 합니다.
수술을 닫을 때 GP에 문의: 위치 및 액세스의 문제
이 종이 북 서 잉글랜드에 두 보건 당국에서 일반 연습을 통해 시간 관리에서의 배달의 공간 변화를 검사합니다. 영역의 다른 부분에 있는 환자에 게 제공 하는 보험의 종류에 상당한 변화를 보여 줍니다. 이러한 차이 주로 지역의 지리적 또는 사회 경제적 특성 때문. 오히려, 유형의 시간 배달 관리 따라 구조 및 서비스 제공의 구성에 훨씬 더 많은 변화 중. 각 지역에 있는 서비스 개발의 역사와 개별 일반 진료 서비스를 구축 하는 수단이 기 풍 이러한 요인을 차례로 크게 반영 합니다.
태국 Haemorrhagic 뎅기열 발생에 파도 여행
뎅기열은 모기 매개 바이러스 감염 50-100 백만명 매년입니다. 이러한 감염의 200000-500, 000 병, 뎅기열 haemorrhagic (DHF) 심각한, 생명을 위협 형태로 발생합니다. 큰, 예기치 못한 DHF 전염병 종종 건강 시스템을 압도. DHF 발병 률의 시간적 공간적 패턴의 이해 이러한 전염병에 대처 하기 위해 리소스 할당을 지원 합니다. 여기에 우리가 850000 감염 1983-1997 기간 72 태국의 지역에서 발생을 설명 하는 데이터 집합에서 DHF 발병 률의 시간적 공간적 역학 조사. 우리는 DHF 발생률에 시간적 공간 여행 파의 존재를 보여 경험적 모드 분해 방법을 사용 합니다. 우리는 호스트 병원 체 인구 역학 관계를 반영 하기 위해 생각 하는 차이의 3 년 주기 구성 요소에서이 파도 관찰. 파도 방콕, 광선으로 한달에 148 km의 속도로 이동 하는 태국에서 가장 큰 도시에서에서 emanates. 이 찾는 검색 및 특성화 DHF 태국에서의 시간적 공간적 역동성에 기여 하는 핵심 프로세스에 대 한 중요 한 출발점을 제공 합니다.
포함 하는 소스에서 유행 성 독감
높게 병원 성 새 유행 성 감기 A (h 5 n 1 subtype) 잠재적으로 엄청난 비율의 인간의 유행 성 독감을 일으킬 위협 하고있다. 타겟된 항 바이러스 예방, 격리 및 포함 하는 소스에서 신흥 유행 성 감기 긴장에서 pre-vaccination의 효과 조사 하기 위해 농촌 동남 아시아에 대 한 확률적 인플루엔자 시뮬레이션 모델을 사용 했습니다. 기본적인 생식 번호 (R0) 1.60 아래 있었다면 우리의 시뮬레이션 대상된 antivirals와 준비 된 응답 확률이 높은 질병을 포함 하는 것으로 나타났다. 이 경우, 치료 및 예방을 위한 100, 000 ~ 1만 코스 순서 항 바이러스 대리인 비축 충분 한 것입니다. Pre-vaccination 발생 한 포함 하는 R0 높은 2.1와 긴장에 대 한 효과적인 타겟된 항 바이러스 예방 수. 있습니다 타겟된 항 바이러스 예방, pre-vaccination, 및 격리 조합 높은 2.4는 R(0)와 함께 긴장을 포함할 수 있습니다.
신흥 동남아에서 유행 성 인플루엔자를 포함 하기 위한 전략
고도의 병원 성 H5N1 인플루엔자 A 바이러스는 이제 동남 아시아에서 조류 인구에서 발병 하 고 인간의 경우 계속 누적. 비록 현재 지속적인된 인간 대 인간의 전송의 불능, h 5 n 1 돌연변이 나 바이러스를 생성 하는 증가 된 transmissibility와 reassortment의 위험 때문에 심각한 유행 성 위협을 나타냅니다. 초기 단계에서 유행 성 독감을 중단 수 있습니다 공중 보건 개입을 확인 하는 것은 따라서 우선입니다. 여기 독감 전송 동남 아시아에서의 시뮬레이션 모델을 사용 하 여 봉쇄 전략으로 항 바이러스 약물의 타겟된 대량 예방 사용의 잠재적 효과를 평가 합니다. 다른 개입 인구 연락처 요금을 줄이기 위한 것도 바이러스 기반 제약 정책에 지원군으로 검사 합니다. 우리는 새로운 바이러스의 기본적인 재생 수 1.8 미만인 경우 및 사회적 배제 하는 조치, 지리적 타겟된 예방의 조합을 사용 하 여 가능한 초기 유행 성 독감의 제거 수 있습니다 보여줍니다. 우리가 예측 비축 항 바이러스 약품의 3 백만 과정의 제거를 위한 충분 해야 한다. 정책 효과 따라 비판적으로 얼마나 빨리 임상 사례에 진단 되 고 속도는 항 바이러스 약물을 배포할 수 있습니다.
바이러스의 피트 니스에 항 체 의존 증진의 동적 효과
항 체 의존 향상 (ADE), 바이러스 성 복제 증가 현상이 면역 세라 감소 보다는 오히려 관찰 되었습니다 많은 공중 위생 중요성, flaviviruses, coronaviruses, retroviruses 등의 바이러스에 대 한 생체 외에서. 인 간에 있는 ADE의 가장 눈에 띄는 vivo에서 예 출혈 성 뎅기열는 에이드 뎅기열 바이러스 감염의 임상 발현의 심각도 증가 증가 바이러스 복제에 의해 생각가 질환입니다. 우리는 보급에 에이드의 역학적 영향과 바이러스 serotypes의 지 속성을 검사. 우리 에이드 하지 않는 사람에 비해 증진을 받아야 그 serotypes에 경쟁 우위를 제공할 수 있습니다 그리고이 이점을 cocirculating serotypes 수가 증가 함께 증가 찾을 뎅기열 serotypes cocirculating n의 동적 시스템 모델을 사용 하 여. 역설적으로, 에이드, 수준의 증가 의해 제공 하는 향상 높은 수준의 향상 및 nonenhanced serotypes 지 속성 위협 모든 뎅기열 바이러스 감염의 발생률에 큰 진폭 진동 유발 하기 때문에 선택적인 이점에 한계가 있다. 여기에 제시 된 모델은 뎅기열을 위해 설계 된, 하지만 우리의 결과 부분 내성 병원 체 복제 속도 증가 모든 역학 시스템에 적용 됩니다. 우리의 결과 향상은 설정에서 가장 유리한 여러 serotypes 순환 및 큰 호스트 인구를 바이러스 복제의 큰 진폭 에이드 유도 진동의 깊은 골짜기 중 지 속성 병원 체를 지 원하는 데 사용할 수 있는 것이 좋습니다.
Multistrain 질병의 혼란 Desynchronization입니다
Multistrain 질병 여러 변종, 또는 serotypes 이루어져 질병이 있습니다. Serotypes 항 체 의존 향상 (ADE) 단일 serotype에 감염 되어 무 증상, 하지만 두 번째 serotype 감염 큰 infectivity 동반 하는 심각한 질병에 이르게 하 여 상호 작용할 수 있습니다. 출혈 성 뎅기열 발생 4 serotypes의 비동기적으로 발생 하는의 serotype 데이터에서 관찰 되었다. 자율적이 고 계절에 따라 구동 발생 에이드를 포함 하는 모델에서 공부 했다. 충분히 작은 에이드의 단계에서 발생 하는 발생 하 각 serotype infectives 수 동기화 합니다. ADE는 과거의 임계값 증가, 시스템 무질서, 되 고 각 serotype infectives desynchronize. 그러나, 1 차 및 2 차 infectives의 특정 그룹화 혼란 정권 에서도 동기화 된 상태로 유지 합니다.
인플루엔자 유행 성 완화를 위한 전략입니다
새로운 인플루엔자 유행 병의 심각도 줄이기 위한 전략의 개발은 지금 최고 글로벌 공중 보건 우선 순위. 인플루엔자 예방 및 억제 전략 바이러스, 백신 및 아닌-제약 (케이스 격리, 가정용 격리, 학교 또는 직장 폐쇄, 여행에 대 한 제한)의 광범위 한 범주로 간주 될 수 있습니다 측정. 수학적 모델 개입 전략의이 복잡 한 풍경을 탐험 하 고 잠재적인 비용과 혜택을 다양 한 옵션의 측정을 위한 강력한 도구입니다. 여기 큰 전염병 시뮬레이션 사용 하 여 검사할 개입 옵션 신형 인플루엔자 발생의 초기 봉쇄 실패, 영국과 미국에서는 예제로 사용 하 여. 우리가 찾을 테두리 제한 및/또는 내부 여행 제한 99%의 효과가 이상 하지 않는 이상 2 ~ 3 주에 의해 전파 지연 가능성이 있습니다. 유행 성 독감의 절정 동안 학교 폐쇄 피크 공격 속도 40%까지 줄일 수 있습니다 하지만 가능한 경우 케이스 격리 또는 가정용 격리 상당한 영향을 미칠 수 있는 반면 전체 공격 속도에 거의 영향을 미치지 있다. 임상 사례의 치료 증상 시작 하루만에 antivirals 준다면 전송만을 줄일 수 있습니다. 인구의 50%에 대 한 충분 한 마약을 감안할 때, 가정에 기초를 둔 예방 반응성 학교 폐쇄와 결합 하 여 40-50% 임상 공격 속도 줄일 수 있습니다. 더 광범위 한 예방 더욱 물류 도전 하지만 75% 이상에 의해 공격을 줄일 수 있습니다. 전염병을 사전 비축 백신 공격을 크게 줄일 수 있는 속도 낮은 효능의 경우에도. 정책 효과의 추정 미래 유행 성 긴장의 특성 그 과거 전염병에서 본 실질적으로 다른 경우 변경 됩니다.
카메룬에서 향상 된 홍 역 감시 발병 률의 두 가지 주요 동적 패턴을 보여준다
카메룬의 홍 역 발생률이 성 관련 패턴의 특성 및 2000 년 1 월 ~ 6 월 기간 동안 홍 역 발병 률에서 증가 하는 경우를 확인 하려면 2001는 다른 inter-epidemic 기간은 여러 영역에서 일치 전염병 일치 합니다.
개인 기반 천연두 전염병 제어 전략의 전산 모델링
가능한 바이오에 대 한 우려에 대응, 저자 천연두 전염병 전송 및 제어의 개인 기반 (또는 "에이전트 기반") 전산 모델을 개발 했다. 모델 명시적으로 개별 인간의 "인공 사회"를, 각각 고유한 개체 또는 데이터 구조는 컴퓨터 프로그램으로 구현 됩니다. 이러한 에이전트 로컬로 가정, 직장, 학교 및 병원 등의 사회 단위 코드 표현에서 서로 상호 작용 합니다. 많은 반복이 microinteractions 공간 및 시간에 전염병의 과정 등 기본적인 관심의 대규모 거시적인 현상을 생성합니다. (부 화 기간, 임상 질환 식, contagiousness, 그리고 물리적 이동성) 모델 변수 할당 된 천연두에 대 한 전문가의 자문 그룹에 의해 합의 현실적인 값 다음. 8 개의 응답 시나리오 두 전염병 비늘 하나 6000 인 마을과 다른 50000 사람 마에 500 천연두 사례의 소개로 10 천연두 사례의 소개 되 고 평가 했다. 모델링 운동을 보여 연락처를 추적 하 고 가정, 직장, 병원 근로자의 신속한 사후 예방 접종 및 절연 진단된 된 경우의 학교 연락처의 예방 접종 검사 두 전염병 스케일에서 천연두 포함 될 수 있습니다.
바이러스 입자 항목에 IFN 독립적인 응답 TLRs Retinoic 산을 유도할 수 있는 유전자를 독립적 항 바이러스 방어의 첫 번째 줄 제공 나
타고 난 면역 체계는 다양 한 병원 체 관련 된 분자 패턴 인식에 따라 일반적인 면역 반응을 도출 하 여 병원 체 감염에 응답 합니다. Tlrs와 RNA helicases retinoic 산을 유도할 수 있는 유전자 나 (장비-나) 흑색 종 분화 관련 유전자 5 각각 endosomal 및 세포질 구획 내에서 외국 핵 산을 인식, 나는 필 사를 통해 IFN IFN 규제 요소 (IRF) 3와 NF kappaB 요인 포함 형식의 유도 신호 모두를 시작 합니다. 그러나, 최근 패러다임은 세균성 DNA 및 더블-좌초 B 형태의 DNA 트리거 유형 I IFN 생산 새롭거나 TLR 및 유 정 난-독립적인 경로 통해 나왔다. 우리가 이전에 그 안에서 다양 한 RNA 및 DNA 둘러싸 바이러스 입자의 항목은 IFN 자극 유전자의 하위 집합을 유발 하기에 충분 한 기본 게재에 응답과 IRF3 종속 IFN 독립적인 방식으로 완전 한 항 바이러스 응답을 설명 했다. 이 연구에서 우리는 바이러스 입자 입장에 선 천 적 면역 반응을 TLR 및 장비는 표시-난 IRF3 활성화 귀착되는 소설 타고 난 면역 메커니즘의 존재를 확인 하는 통로. 또한, 우리는 타고 난 항 바이러스 면역 바이러스의 숫자를 증가 하는 노출 입자 끌어올리고 cytokines의 하나의 관련 된 분 비 및 면역 세포에 침투의 활성화를 세포내, IFN 독립적인 응답에서 세포 반응의 복잡성의 모델을 제안 합니다.
항 체에 종속적인 기능 추가 Multiserotype 질병 모델에 불안 합니다
이 종이 multiserotype 질병 모델에서 항 체 의존 향상 (ADE)에 의해 유도 된 복잡 한 역학 조사. ADE는 여러 serotype의 이전 감염에의 한 면책의 존재 바이러스 성 성장 율에 있는 증가. 증가 바이러스 성 성장 속도 증가 2 차 전염 성 클래스 infectivity 생각 된다. 우리의 모델 에이드 하지 않고 외부 진동의 발병을 유도합니다. 전염 성 클래스에서 진동 질병의 발생을 나타냅니다. 이 논문에서 우리는 진동 유발 하 고 진동의 유형을 구분 관련된 bifurcations를 분석 하는 데 필요한 에이드 매개 변수 근사 파생. 우리는 다음 stochastic 물결 모델에 추가 하 여 이러한 역학의 안정성을 조사 합니다. 우리는 또한 모델에서 단일 serotype 예방 접종의 효과의 예비 분석을 제시.
Transmissibility 포트 딕스에 돼지 독감 1976
포트 딕스에 A/New 저지/76 인플루엔자 1976 발발 광범위 하 게 확산 하는 데 실패 하는 문서화 된 인간에 인간 전송 인플루엔자 바이러스의 드문 예입니다. 광범위 한 역학 조사에도 불구 하 고 시도이 바이러스의 transmissibility 척도를 만들어왔다. 세계 보건 기구와 미국 정부 포함 되 유행 성 독감 퇴치를 중심으로 유행 성 감기 긴장 신흥 볼. 전산 모델 예측 바이러스 transmissibility 낮은 경우 응급 유행 성 인플루엔자를 포함 수 있을 수 있습니다. 미국 육군 교육 센터에서 포트 딕스, 뉴저지 1976 년 1 월에 A/New 저지/76 발발 13 입원, 1 죽음 및 예상된 230 경우 발생합니다. 이 전염병 바이러스 전송 특성, 우리는 기본적인 생식 번호와 결정적 전염병 모델 및 확률적 시뮬레이션을 사용 하 여 직렬 간격 추정 했다. 우리 예상 1.2 (지원 되는 간격 1.1-1.4), 직렬 간격은 1.9 일 (지원 되는 구간 1.6-3.8 일), 그리고 바이러스가 적어도 6 개 직렬 인간에 인간 전송 했다 것이 발생에 대 한 기본적인 생식 수 있습니다. 이 컨트롤에 대 한 임계값 이하로 독감 변종 순환의 하단에 A/New 저지/76 바이러스 transmissibility 배치.
모델링 대상으로 미국에서 유행 성 인플루엔자의 제약 계층
독감의 유행 성 스트레인의 확산에 대 한 응답을 계획 하는 것은 높은 공중 보건 우선 순위입니다. 다른 개인 기반, 확률적 시뮬레이션 모델을 사용 하 여 3 개의 연구 그룹 미국 공중 보건 근로자와 협의 하 여 선정 개입 전략의 결과를 살펴보았다. 첫 번째 목적은 잠재적으로 실현 가능한 개입 전략의 집합의 효과 시뮬레이션 합니다. 조합 대상 이라는 계층 독감 항 바이러스 치료와 예방 치료와 격리의 nonpharmaceutical 중재의 제약 (TLC), 격리, 학교 폐쇄, 커뮤니티의 사회적 배제 하 고 직장을 사회적 배제 간주 됩니다. 두 번째 목적은 모델 가정 결과의 견고성을 확인입니다. 인구는 약 8.6 백만명 시카고, 비슷한 유행 성 발발에 초점을 비교 합니다. 시뮬레이션은 유행 성 변형 예상된 transmissibility에서 대상된 가정 항 바이러스 예방 및 사회적 배제 조치 조합 적시 구현의 실질적으로 낮출 수 질병 공격 속도 효능이 높은 백신을 사용할 수 있게 수 전에 것이 좋습니다. 측정값 및 학교 폐쇄의 적시 개시 중요 한 역할을 합니다. 같은 모델의 기반이 되는 데이터의 현재 부족, 추가 필드 연구는 전송 원본과 인플루엔자 전송을 줄이는 사회적 배제 조치의 효과 대 한 자세한 내용은 것이 좋습니다.
두려움과 질병의 감염 역학 결합: 수학 및 전산 탐험
고전 수학 역학 개인 중에 전염병 동안 접촉 행태가 적응 하지 않습니다. 그들은 관여 하지 않습니다 endogenously, 예를 들어, 두려움에 기반을 사회적 거리에. 그러나, 적응 행동은 진정한 전염병에 잘 문서화. 우리는 전염병 역학 모델에서 그러한 행동을 포함 하는 효과 찾아보기.
급성 호흡기 바이러스 성 감염의 부 화 기간: 체계적인 검토
잠복기의 기술 조사 및 전염 성 질병을 관리에 필수적입니다 하지만 잠복기의 문에 종종 잘못 참조 된, 일관성이 없거나 제한 된 데이터에 따라. 공공의 건강 중요성의 9 개의 호흡기 바이러스 감염에 문학의 체계적인 검토, 잠복기의 진술과 436 기사와 38 풀링된 분석용 데이터로 파악. 우리는 풀링된 데이터 로그 정규 분포를 장착 하 고 발견 될 5.6 일 (95% CI 4.8-6.3) 아 데 노 바이러스, 3.2 일 (95% CI 2.8-3.7) 인간의 코로나 바이러스에 대 한 일 (95% CI 3.6 4.4) 중증 급성 호흡기 증후군 코로나 바이러스에 대 한 일 (95% CI 1.3-1.5) 인플루엔자, 인플루엔자 B, 홍 역에 대 한 일 (95% CI 11.8 13.3) 0.6 일 (95% CI 0.5-0.6)에 대 한 평균 잠복기2.6 일 (95% CI 2.1-3.1) rhinovirus에 1.9 일 (95% CI 1.4-2.4)에 대 한 호흡 syncytial 바이러스, 파라 인플루엔자, 4.4 일 (95% CI 3.9-4.9). 부 화 기간을 사용 하는 경우 그것은 전체 분포를 고려 하는 것이 중요: 격리 정책, 가능성이 시간과 감염의 소스에 대 한 중앙 지역 및 유행 성 계획에 사용 된 모델에 대 한 전체 메일 오른쪽 꼬리. 우리의 예상 결합 게시 된 데이터를 이러한 및 다른 응용 프로그램에 필요한 정보를 제공 합니다.
인큐베이션 기간 거친 데이터 분포 추정
잠복기, 감염 및 질병 발병 사이의 시간 감시 및 감염 성 질환 제어 중요 하지만 덜 자주 관찰 됩니다. 굵고 데이터 감염, 시간 질병 발병 또는 둘 모두의 시간 정확 하 게 알려져 있지 않습니다 때문에 발생 합니다. 부 화 기간 분포의 정확한 추정은 실시간 발발 조사 및 모델링 공중 보건 개입에 유용 합니다. 우리 같은 분포를 추정 하는 두 가지 방법을 비교 합니다. 첫 번째 방법은 이중 간격 검열로 데이터를 나타냅니다. 두 번째 계산을 더 온순한 게 데이터 감소 기술을 소개 합니다. 시뮬레이션 연구에서 중간, 추정 방법 비슷하게 수행 하지만 첫 번째 방법은 수익률 분포 꼬리의 안정적 예측. 모델 가정 위반 하는 두 가지 방법의 민감도 분석을 실시 하 고 우리가 이러한 인플루엔자 A에 대 한 역사적 인큐베이션 기간 데이터를 메서드 및 호흡 syncytial 바이러스 적용. 줄어든된 데이터 분석은 덜 요하는 광범위 한 조건 아래에서 중간값을 추정 하는 데 잘 수행 하 고 있습니다. 그러나 추정 분포의 꼬리, 이중 간격 검열 분석 권장 되는 절차입니다.
태국에서 뎅기열에 인구 통계 학적 변화에 미치는 영향: 인 사이트 통계 분석 및 수학적 모델링에서
태국에서 뎅기열 출혈 (DHF) 경우의 평균 연령 증가 보고 되었습니다. 이 증가의 원인은 알려져 있지 않습니다. 가능한 설명을 전송 때문에 모기 인구, 인간과 모기, 및 보고의 변화 사이의 접촉을 감소 감소 감소를 포함. 우리는 낮은 출생과 죽음의 속도으로 인구 변화는 뎅기열 전송을 감소 하 고 길어 큰 전염병 사이의 간격을 제안 합니다.
Multiyear 기후 변화 및 뎅기열-엘 니 뇨 남방 진동, 날씨, 그리고 푸에 르 토 리코, 멕시코, 그리고 태국에서 뎅기열 발병 률: 경도 데이터 분석
뎅기열 모기 매개 바이러스는 세계의 열 대 및 아열대 지역에 걸쳐 중요 한 공중 위생 문제. 온도 강수량의 변화 전송 주기 잘 정의 된 역할 있고 따라서 발병 률 수준 변경에 역할을 할 수 있습니다. El Niño 남쪽 진동 (ENSO) 로컬 온도 강 수 전세계의 multiyear 기후 드라이버입니다. 이전 연구 ENSO와 뎅기열 발병 률 사이의 연관의 정도의 보고가 있었습니다.
발발 2009 유행 성 인플루엔자 A (H1N1)는 뉴욕시 학교에서
2009 년 4 월 소설 돼지 기원 인플루엔자 (2009 H1N1 인플루엔자) 확산 뉴욕 퀸 즈 고등학교에서 발생 했습니다. 우리 발발에 설명 하 고이 소설은 바이러스의 임상 역학적 측면의 특성.
출혈 성 뎅기열의 위험에서 Serotype 차이점: 데이터의 분석 2006 1994 년에서 방콕, 태국에서 수집
뎅기열 serotypes 심각한 질병의 원인이 자신의 성향에 다 하는 여부는 분명 하지 않다. 우리는 방콕, 태국에서 의료 조치를 제시 하는 아이 들에 있는 serotype 특정 질병 심각도의 차이 분석.
VACTERL 협회를 가진 환자에서 상속에 대 한 증거입니다
VACTERL/VATER 협회는 일반적으로 산발적 인 장애. 우리 VACTERL 협회와 78 판단은 상속에 데이터를 표시 하 고 판단은의 9%는 하나 이상의 구성 요소 기능을 VACTERL 협회의 기본 상대 보여줍니다. 구성 요소 기능 1 급 친척에의 보급 수 etiologies에 영향을 받는 가족의 상담 및 연구에 대 한 의미를가지고 일반 인구에서 예상 보다 크게 높다.
VACTERL 협회 진단 79 환자에서 구성 요소 연구 결과의 분석
VACTERL 협회는 원인을 제대로 이해 남아 있지만 상대적으로 일반적인 상태 이다. 우리는 VACTERL 협회 진단 79 환자 데이터를 표시 하 고 최소한 3 개의 구성 요소 기능을 갖춘 60 환자의 선택 된 부분 집합에 통계 분석을 수행 하 고, 검토 후, 기준을 충족 하지 않은 가능성이 대체 진단에 대 한. 두 구성 요소의 기능이 없습니다 크게 관련 된 개별적으로 간주 하지만 여러 다변량 통계 기법 구성 요소 기능의 起의 새로운 패턴 제안 하 고 숨겨진 클래스 클러스터 분석 보여 환자 들의 5 개의 주요 하위 그룹의 존재. 이러한 발견 VACTERL 협회의 모두 우리의 이해에 대 한 및이 조건에 관련 된 연구에 대 한 접근에 대 한 암시를 가진다.
사전 및 중화 항 체 Titers 감염 바탕으로 뎅기열 바이러스 감염 연관 Serotype 유추
현재, serotype 뎅기열 바이러스 (DENV) 감염과 관련 된 결정의 유일한 테스트 급성 니 기간 동안 샘플링을 필요로 합니다. 테스트 정확히 과거 DENV 감염 연관 serotype를 감지 수 있습니다. 이 테스트의 성능을 평가 하 고 있지만 DENV에 대하여 serotype 특정 항 체의 결정에 대 한 표준 분석 결과 플 라크 감소 중화 시험 (PRNT) 이다.
미주에 있는 H1N1pdm
2009 년 4 월 말 2009 유행 성 인플루엔자 (H1N1pdm) 바이러스의 출현은 인간의 감지 되었습니다. 2009 년 7 월 18 일를 통해 자사의 검색에서 미주에서 h1n1pdm의 사례를 확인된 주기적으로 하는 팬 미국 보건 기구 (PAHO) 회원국에 의해 알려졌다. 미주에 걸쳐 많은 세계의 위도, 때문에이 데이터 H1N1pdm 전송 계절의 변화를 검사 하는 좋은 기회를 제공 합니다. 2009 년 4 월 26 일 2009 년 7 월 18 일을 통해 PAHO 회원국에서 보고서를 사용 하 여 우리 미주에 H1N1 유행 성 독감의 초기 확산 특징. 회원국의 지리적으로 대표적인 샘플에 대 한 우리 보고 기간 동안 H1N1pdm 생식 수 (R)를 예측 합니다. 이러한 추정과 위도, 온도, 습도 및 인구 연령 구조 사이 협회 추정 되었다. H1N1pdm (칠레)에 대 한 2.1 (에 대 한 파나마, 콜롬비아) 1.3에서 ranged 생식 최대 수의 견적. 우리 생식 번호 견적 변량 및 복수 변수 분석에 위도와 가장 관련 된 발견. 위도 기후와 동작,이 협회에 계절의 변화에 대 한 프록시 수 H1N1pdm 전송에 강한 계절 구성 요소를 제안 합니다. 그러나,이 계절에 대 한 이유가 불분명 남아 있습니다.
인간의 Holoprosencephaly에 Zic2의 변이: 소설 ZIC2 특정 Phenotype과 157 개인의 포괄적인 분석의 설명
Holoprosencephaly (HPE), 인간의 개의 가장 일반적인 기형 비 syndromic HPE 연관 유전자에 변이 원인일 수 있습니다. 염색체 13q32에 있는 zic2의 변이 아닌 syndromic, 비 염색체 HPE의 일반적인 원인입니다.
베이지안 관점에서 경쟁 전염 성 병원 체 모델링: 불완전 한 실험실 결과 인플루엔자 연구에 응용
계절 인플루엔자 전염병 호흡 syncytial 바이러스 (RSV) 등 병원 균 자주 독감으로 co-circulate 하 고 인간의 호스트에서 인플루엔자와 같은 질병 (ILI) 발생. 그러나 불가능 자주 각 잠재적인 병원 체에 대 한 테스트 또는 인플루엔자 전송에 대 한 유추를 어렵게 만드는 각 관찰된 ILI 에피소드에 대 한 표본을 수집 합니다. 전염 성 질병의 설정에서 누락 된 결과 개인 간의 의존도 때문에 특정 과제 부과. 우리는 병원 체의 생물학적 확인에서 missingness은 ignorable 가정 transmissibility 및 개입 신진대사에 유추에 대 한 여러 co-circulating 병원 체에 대 한 베이지안 경쟁 위험 모델을 제안 합니다. 시뮬레이션 연구 잠재적인 병원 균 수 misspecified 하는 경우에 제안 된 모델의 합리적인 성능을 나타냅니다. 그들은 또한 실험실 테스트 결과 누락의 적당 한 금액은 가까운 연락처 그룹 설정에서 키 매개 변수에 대 한 유추에만 작은 영향을 보여줍니다. 제안 된 모델을 사용 하 여, 우리는 발견 비 제약 개입 소폭 인플루엔자 A 초등학교에서 실시 한 연구에서의 전송에 대 한 보호.
태국에서 뎅기열 백신의 경제적 가치입니다
여러 후보 뎅기열 백신 개발, 이것은 중요 한 이해 관계자 (예를 들어, 정책 입안자, 과학자, 임상, 및 제조 업체)을 돕는 시간을 더 나은 백신 특성과 전략 쉽게 변경 될 수 있습니다 하는 동안에 특히 뎅기열 백신의 잠재적인 경제적 가치 (비용) 이해. 우리는 잠재적인 건강 및 사회적 관점에서 개인 (≤ 1 년 나이의) 태국에서에 뎅기열 백신 관리의 경제적 가치 평가 의사 결정 분석 마르코프 시뮬레이션 모델 개발. 감도 분석 평가 이르기까지 다양 한 백신 (예: 비용, 효능, 부작용), 역학의 효과 (뎅기열 위험), 질병 (치료를 추구 행동) 특성. ≥ 50% 효능이 백신은 매우 비용 효율적인 [< 1 × 1 인당 총 국내 생산 (GDP) ($4,289)]는 총 접종 $60의 비용 및 비용 효율적인 [< 3 × 1 인당 GDP ($12,868)] 전체 예방 접종 비용 최대 $200의 최대. 총 백신 시리즈는 $1.50 때 많은 시나리오 저장 비용을 했다.
임상 증거를 떠 올 리: 부 화 기간 호흡기 바이러스 감염에 대 한 인용 네트워크
반복 하면 작은 경험적 증거 들을 지 원하는 경우에 의료 사실 진실으로 안치 될 수 있습니다. 우리는 시간에 따라 특정 과학적 사실의 인용 역사를 추적 하기 위한 직관적이 고 명확한 시각 디자인 제시. 우리 9 호흡기 바이러스 성 감염의 잠복기에 이전에 게시 된 문서 검토에서 데이터를이 방법을 적용 합니다. 결과 인용 네트워크가이 질병의 잠복기에 대 한 전통적인 지혜가 기록도 경험적 증거에의 한 경우에서 및 사용 가능한 데이터의 작은 분수를 기반으로 공개. 전반적으로, 모든 부 화 기간 문 50% 제공 하지 않은 소스 그들의 견적 및 65%의 원본 소스에 대 한 잠복기 이후 발행물에 데이터 통합 되지 않았습니다에 대 한. 의학적 증거의 이러한 역사를 시각화를 위한 더 표준화 되 고 광범위 하 게 사용할 수 있는 방법은 경험적으로 지원 되는 기술에서 전통적인 지혜가 너무 멀리 이탈 수 없습니다 보장 하기 위해 필요 합니다.
학교에 손 소독 제와 기침 위생의 사용과 관련 된 인플루엔자 A만 아닌 인플루엔자 B의 발생률에서 감소: 무작위 통제 재판
독감의 확산을 줄이기 위해 알코올 기반의 손 소독약 호흡기 위생 등 nonpharmaceutical 개입 (NPIs)의 효능에 관한 실험실 기반 증거 부족.
뎅기열 백신의 영향의 모델: 현재 연구 잠재력 접근의 검토
예방 접종 개별 감염을 방지 하 여 직접 및 간접적으로, 감염 된 개인 및 취약 것 들 사이의 접촉의 가능성을 줄임으로써 전송 병원 체의 감소. 전송의 수학적 모델을 사용 하 여 미래의 뎅기열 백신의 잠재적인 결합된 효과 예상할 수 있는. 그러나, 뎅기열 전송 역학을 정확 하 게 나타내는 모델의 구조에 상당한 불확실이 있다. 여기, 우리 미래의 뎅기열 예방 접종 프로그램의 영향을 평가 하기 위해 사용 될 수 있는 모델을 검토 합니다. 또한 유효성을 검사 하 고 모델을 매개 변수화 하는 방법을 검토 합니다. 모든 방법의 주요 매개 변수는 기본 복제 번호, 전송 제거 하는 중요 한 예방 접종 분수를 결정 하는 R(0). 이 수량을 추정 하는 여러 가지 방법을 검토 합니다. 마지막으로, 우리는 정확 하 게 뎅기열 바이러스 전송에 대 한 잠재적인 영향을 평가 하기 위해 추정 해야 뎅기열 백신의 특성 설명.
인플루엔자 1918 유행 성 동안 가정에 전송입니다
기록 데이터의 분석 강하게 유행 성 독감의 역학에 대 한 우리의 이해를 형성 했다 고 현재와 미래의 전염병의 분석을 알려 줍니다. 여기, 작가 분석된 이전에 게시 되지 않은 문서 "스페인어" H1N1 인플루엔자 유행 성, 큰 가계 조사에서 1918 년를 첫 번째 시간 측정 인플루엔자 transmissibility 사람 수준에서 그 동안에 대 한 가장 치명적인 전염병의 실시. 저자 계절 독감에서 비교 견적을 기준으로 개별 전송의 낮은 확률을 추정 하 고 다른 직접 2009 H1N1 독감의 최근 견적 비슷합니다 하지만 감염을 전송. 저자가 유행이 성, 비정상적으로 악성 바이러스와 일치에 대 한 이전에 알려지지 않은 매개 변수가 무 증상 감염의 가능성이 매우 낮은 추정. 저자 1918 봄에 크게 보고 되지 않은 인플루엔자 전염병 (또는 아마도 cross-reactive 면역) 특성을 사용 하는 이전 면역의 높은 주파수 추정. 이 발견에서 extrapolating 저자 가설 이전 면역 부분적으로 유행 최악의에서 일부 인구를 보호 하 고 인구 사이 공격 속도의 차이 설명 하는 도움이 됩니다. 함께, 이러한 분석 1918 인플루엔자 바이러스 이지만 매우 악성만 적절 하 게 전송 가능 했다 고 따라서 현대적인 맥락에서 간주 됩니다 제어할 수 있는 방법을 보여 줍니다.
부패와 방콕에서 유아 중 모성 뎅기열 항 체의 지 속성
개요입니다. 모성 뎅기열 항 체 뎅기열 예방 접종의 최적 연령 결정 하는 데 중요 하지만 아무 연구 항 체 부패와 유아의 지 속성의 이종 계량 했다. 방콕에서 139 유아에서 serotype 특정 중화 항 체의 부패 및 지 속성 시간 측정 경도 회귀 방법 및 생존 분석을 사용 했습니다. 나아졌다 감퇴 패턴 하프 라이프 타임 24-29 일 사이 출산 하 고 3 개월 후 3 개월과 44-150 일 발견 됐다. 흔하지 않은 부패 속도 뎅기열 바이러스-1과-4에 대 한 유아의 17%에서 발견 됐다. 플 라크 감소 중립화의 중간 지 속성 시간 테스트 > 10 9 개월에 6에서 배열 했다. 출생 시 항 체 값에 따라 개인에 대 한 지 속성 시간을 예측할 수 없습니다. 생 후 12 개월 플 라크 감소 중립화에 모성 항 체 80 아래 수준을 테스트 하는 경우 효과가 있을 것 전에 뎅기열 예방 접종 백신 통풍 관을 방해 합니다. 유아에서 뎅기열 병 인에 대 한 연구에서 평균 항 체 지 속성 값을 기반으로 출생 시의 계획을 피해 야 한다.
최근 뿌 변종 독감 중국 남부에서 노출 위치 관련 패턴
위치 사이 인플루엔자 발병 률의 변화는 일반적으로 큰 공간 비늘에 관찰 됩니다. 이러한 변화 인구 인구 통계에서 heterogeneities 또는 인구 구조와 연결에 더 미묘한 차이의 결과 인지 작은 공간 스케일에 발생 하는지 명확 하지 않다. 여기 우리는 중국에 있는 공동체 가운데 인플루엔자 A 바이러스에 면역에 큰 차이가 인구 인구 통계의 차이 의해 설명 하지는 보여줍니다. 우리는 무작위로 중국 광저우는 설문에 응답와 serological 최근에 독감 바이러스 순환 5에 대 한 테스트를 위한 혈액 샘플을 제공 근처에 5 개의 무작위로 선택 된 위치에서 가구를 선택. 우리 나이, 나이가 나이 그룹에서 레벨 링 증가 감지 중화 titers 주파수에서 상당한 감소를 찾으십시오. 나이, 고용 상태, 예방 접종 기록, 가정용 크기와 조건 주택 위치 사이 큰 차이가 있습니다. 그러나, 조정 후, 상당한 변화 감지 중화 titers 주파수에 위치에서 유지 됩니다. 이 결과 거기에 개인 및 가정 수준 위험 요소 외에도 인플루엔자 전송 역학 드라이브 사회의 특성 등의 요소는 긴장의 독립적인 효과 좋습니다.
검색 쿼리 감시를 사용 하 여 뎅기열 발병의 예측입니다
인터넷 검색 데이터 사용 인플루엔자 발병 률 예측에 효과가 증명 되었습니다. 이 이렇게 연간 발생률 및 임상 더 독특한 프레 젠 테이 션 및 전송 모드에 큰 변화는 뎅기열에 대 한 더 많은 성공적인 수 있습니다.
횡단면 설문 조사를 사용 하 여 예방 접종 프로그램의 성능을 측정: 가능성 프레임 워크 및 회고전 분석
루틴 및 추가 면역 활동의 성능을 관리 방법에 의해 보통 측정: 대상 모집단의 크기에 의해 배포 수를 나누어. 이 방법은 인구 통계 및 건강 조사 (국토 안보 부)에서 예방 접종은 때로는 불가능 한 (예: 예방접종 대상 모집단의 102%), 그리고 일반적으로 비율을 일치 하지 않는 있는 보험 견적으로 이어집니다. 우리가 예방 접종 활동에 액세스할 수 있는 인구 비율을 추정 하는 방법을 설명 하는 내-캠페인 비효율성, 예방 접종 범위의 일관성 있는 견적 제공.
Hyperendemicity에 다시 등장에서: 브라질에서 뎅기열 유행 병의 자연 역사
뎅기열 바이러스 (DENV)는 1986 년에 브라질에 다시 추가 하 고 1995 년 그것은 전국적으 확산 했다. 2007 년에서 뎅기열 출혈 (DHF) 경우의 수를 두 배 이상 고 연령 분포에 변화가 보고 되었다. 이전에 대부분의 DHF 경우 성인 중 발생, 2007 년에서의 경우 53% 발생 15 세 미만의 어린이에. 이 변화에 대 한 이유로 결정 되지 않은.
민감도 특이성 설정 지역 사회에서 어린이의 빠른 독감 테스트
신속 하 게 독감 시험 (RFT) 인플루엔자의 신속한 케어 포인트 진단에 대 한 수 있습니다. Quidel QuickVue 인플루엔자 A + B 테스트 (QuickVue)는 보고 된 제조업체의 민감도 특이성 73%와 96%, 각각, 비 강 면봉으로. 그러나, 수 사관 감도 커뮤니티 설정에서 77%에서 22%까지 나타났습니다.
전염병 감시 데이터에서 절대 및 상대 사건 사망자 비율 추정
인구는 신흥 감염 증에서 심한 결과 대 한 위험이 가장 요약 알면 발발 응답 하는 동안 자원의 최적 배분 결정에 결정적 이다. 사건 사망자 비율 (CFR)는 질병 계약 후 사례의 비율입니다. 상대 CFR는 한 그룹의 경우 사망자는 크거나 작은 두 번째 그룹에 있는 요소입니다. 복구도 하 고, 감염 된 개인의 숫자의 불완전 한 보고 CFR의 편향된 추정 될 수 있습니다. 우리는 CFR 및 상대 CFR는 식별 하는 조건을 정의 합니다. 또한, 우리는 보고 속도 시간 변화에 대 한 제어 상대 CFR에 대 한 한 견적을 제안 합니다. 우리 일반화 감염과 죽음 사이의 경과 시간에 대 한 계정이 우리의 방법. 새로운 방법론을 설명 하기 우리가 메릴랜드에서 군 사이의 상대 Cfr 추정 1918 인플루엔자 유행에서 데이터를 사용 합니다. 발발 시나리오에 방법의 성능을 평가 하는 시뮬레이션 연구. R 소프트웨어 패키지 메서드 및 여기에 표시 되는 데이터 자유롭게 사용할 수 있게 합니다. 우리의 일 한계와 도전 연습에 절대 및 상대 Cfr 추정과 관련 된 강조 표시 됩니다. 그러나, 특정 상황에서 여기에 제시 된 방법을 식별할 수 있습니다 초기 유행 성 인플루엔자 등 신흥 병원 체의 감염에에서 취약 한 부분.
연속 시간 모델을 사용 하 여 어린 시절 전염 성 질병의 전송 매개 변수 추정에 대 한 비선형 프로그래밍 접근
수학적 모델 어린 시절 감염 병 역학에 대 한 우리의 이해를 향상 시킬 수 있지만이 모델은 종종 알려진 질병 사례 데이터에서 추정 해야 합니다 적절 한 매개 변수 값에 따라 달라 집니다. 이 신문에 우리 계절 전송 매개 변수가 포함 된 모델 및 측정 잡음 연속 미분 방정식을 사용 하 여 어린 시절 전염병 모델의 효율적 평가 위한 프레임 워크 개발. 문제는 대규모 대수적 비선형 프로그래밍 문제를 주고 비선형 불안 한 듀얼 인테리어 포인트 찾기를 사용 하 여 해결 하는 동시 접근 모든 상태 변수 분할 되 고 분할 된 미분 방정식을 제약 조건으로 사용 하 여 책정 됩니다. 기술은 다른 학교 휴일 일정 하는 데 세 가지 다른 위치에서 홍 역 사례 데이터를 사용 하 여 보여 줍니다 및 학교에 전송 매개 변수 표시 강한 상관의 계절의 견적을 우리의 휴일 기간. 우리의 접근 방식을 다른 게시 된 방법에 비해 솔루션 시간에서 40 400 배 감소를 보여주는 극적인 효율 향상을 제공 합니다. 우리의 접근 방식은 전체 알 수 없는 상태로 공간을 통합 하는 기술을 통해 바이어스를 증가 자화 율 동안 자세한 시뮬레이션 연구 바이어스의 증거를 보여줍니다. 또한, 우리의 접근 방법의 계산 효율 더 요하는 방법에 비해 큰 모델 공간의 조사에 대 한 수 있습니다.
