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Articles by Dylan M. Morris in JoVE
세균성 세포의 전자 Cryotomography
Songye Chen1, Alasdair McDowall1,2, Megan J. Dobro1, Ariane Briegel1,2, Mark Ladinsky1,2, Jian Shi2, Elitza I. Tocheva1, Morgan Beeby1,2, Martin Pilhofer1,2, H. Jane Ding1, Zhuo Li1,2, Lu Gan1, Dylan M. Morris1, Grant J. Jensen1,2
1Division of Biology, California Institute of Technology - Caltech, 2Howard Hughes Medical Institute, California Institute of Technology - Caltech
가까운 원시 상태에서 세균 세포의 ultrastructure 연구를 전자 cryotomography (요법)를 사용하는 방법을 우리는 "macromolecular"(~ 4 NM) 해상도, 여기를 보여줍니다.
Other articles by Dylan M. Morris on PubMed
격리 된 Synechococcus 구조 밝혀 전자 Cryotomography WH8102 Carboxysomes 변형
Journal of Molecular Biology. Sep, 2007 | Pubmed ID: 17669419
Carboxysomes 트는 같은 polyhedral 시체 남조류와 탄소 고정을 용이 하 게 하는 것으로 생각 되는 많은 chemoautotrophic 박테리아에서 발견 됩니다. Carboxysomes proteinaceous 외피에 의해 제한 되며 ribulose 1, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCO) CO(2) 고정 경로의 첫 번째 효소 가득 하지만 정확히 그들은 어떻게 탄소 고정을 강화 하는 것은 분명 합니다. 여기 우리는 전자 cryotomography 밝혀 순화 carboxysomes Synechococcus 종 변형 wh8102에서에서의 3 차원 구조를 보고 합니다. 우리 개별 carboxysomes의 크기는 동안 114에서 다양이 유기 체에서 발견 137 nm nm, 놀랍게도, 모두 약 icosahedral 했다. Carboxysome, 3 ~ 4 동심 레이어로 구성 당 약 250 RuBisCOs 평균 했다. 일부 모델 carboxysome 함수의 개별 Rubiscos와 쉘, 특정 연락처에 의존 하지만 이러한 연락처의 증거는 발견: 밀도 또는 셸 상대로 RuBisCO 위치에 연결의 아무 체계적인 패턴의 6 각형 격자를 분별 수 있습니다, 그리고 시뮬레이션 포장 혼자 힘 보여준 Rubiscos의 계층화 된 조직에 대 한 계정 수 있습니다 추정 된다.
향해 전체 세균 세포의 Biomechanical 이해
Annual Review of Biochemistry. 2008 | Pubmed ID: 18355161
수십 년간 유전학 및 생화학 연구, 따라 박테리아의 기본 신진 대사 지금 잘 이해 된다. 그러나 코어 신진 대사 뿐만 아니라, 세균성 세포 또한 수행 자신의 환경 내에서 이동 특징적인 형태를 유지 하는 등 기계적 작업의 번호 그들의 게놈을 분리 하 고 분리 합니다. 주요 발전 기술을 포함 한 형광 가벼운 현미경 검사 법 (fLM) 및 전자 cryotomography (ECT) 이미징에 세균 ultrastructures 이러한 작업을 수행 하는 새로운 통찰력을 제공 했다. 그것은 이제 분명, 예를 들어, 그 박테리아는 매우, cytoskeletons, 소지 특별히 유전자, 내부 구획 배열 조직과 고분자 기계를 신중 하 게 배치 합니다. 이러한 구조와 기능이 일반화 된 세균 세포의 완전 한 biomechanical 이해를 향해 진행 상황 보고서의 형태로 여기 검토 됩니다. 결국 전체 셀의 공간적 명시적, 기계적으로 예측 모델에 유전적, 생화학, 이미징, 및 생물 리 데이터를 통합의 목표는 강조 표시 됩니다.
조직, 구조, 및 알파 Carboxysomes 그대로 셀의 전자 Cryotomography에 의해 결정의 조립
Journal of Molecular Biology. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19925807
Carboxysomes는 polyhedral 포함 시체 많은 박테리아에 autotrophic 신진 대사에 중요 한 역할을 합니다. 전자 cryotomography를 사용 하 여, 우리 carboxysomes를 3 chemolithoautotrophic 박테리아의 그대로 세포 내에서 그들의 네이티브 국가에서 조사 했다. Carboxysomes polyphosphate과 립, 바로 근처에서 종종 세포질 내에서 별개의 그룹으로 일반적으로 클러스터 및 밀도의 정기적 격자 자주 근처 carboxysomes과 립 연결를 찾았습니다. 작은 세부적인 시체 또한 carboxysomes 내에서 볼 수 있었다. 이러한 관측 carboxysomes 및 polyphosphate과 립 간의 기능적 관계를 것이 좋습니다. Carboxysomes 전시 큰 크기, 모양, 및 정화 준비에 보다 셀 작곡 분포도. 마지막으로, 우리는 우리 misassembled 쉘 단백질 특성 filamentous 구조 어셈블리의 다양 한 단계에서 carboxysomes을 관찰 했다. 놀랍게도, 두 개 이상의 부분 carboxysome 셀당 적 관찰 되었다. 이러한 관찰을 바탕으로, 우리는 껍질과 내부 RuBisCO (ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase) 격자 형태로 동시에, 가능성이 유도 셸 단백질과 RuBisCOs 사이 특정 상호 작용에 의해 carboxysome 어셈블리에 대 한 모델을 제안 합니다.
Peptidoglycan 개장 및 포자 형성 하는 동안 외부 멤브레인으로 내부 멤브레인의 변환
Cell. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21884938
Bacilli 및 Clostridia 클래스를 포함 하는 Firmicute 문의 두 가지 특징은 자신의 능력을 양식 endospores 고 그들의 "그람 양성" 단일 membraned, 두꺼운 세포 벽 봉투 구조. Acetonema longum endospores는 하지만 의외로 "그램 네거티브," 소지 안쪽과 바깥쪽 막과 얇은 세포 벽 형성 Clostridia의 덜 알려진 가족 (Veillonellaceae)의 일부입니다. 여기, 고분자 해상도, 3D 전자 cryotomographic 이미지의 식물, sporulating, 그리고 보여주는 그 포자 형성 과정에서 어머니 셀의 내부 막이 반전 될 germinating 세포의 외부 세포 막을 변형 A. longum 셀 germinating 선물이. Peptidoglycan 전역, 프로세스에서의 역할에 대 한 수정 된 경우, "연속" 모델을 선도 유지 합니다. 게놈 분석으로 결합해,이 결과 포자 형성 가리킨 의해 메커니즘으로는 외부 세균 막 발현 될 수 있습니다 및 잠재적인 단일 및 이중 membraned 박테리아 사이 "누락 된 링크"로 대답 longum.
