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Articles by Frances Trail in JoVE
의 성적 개발 및 Ascospore 방전 Fusarium graminearum
Brad Cavinder1, Usha Sikhakolli2, Kayla M. Fellows3, Frances Trail2,4
1Genetics Program, Michigan State University, 2Department of Plant Biology, Michigan State University, 3Human Biology Program, Michigan State University, 4Department of Plant Pathology, Michigan State University
성 십자가와 재조합 자손의 고립은 사상균에 대한 중요한 연구 도구입니다
Other articles by Frances Trail on PubMed
염색체 위치 누 Parasiticus에서 Aflatoxin 유전자 발현의 조절에 역할을 한다
Applied and Environmental Microbiology. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11772640
Filamentous 곰 팡이 Aspergillus parasiticus에도-1 유전자 aflatoxin 생 합성에 관련 된 ketoreductase를 인코딩합니다. 도 1 식에 대 한 환경 영향 연구, 우리는 1 발기인-베타-glucuronidase (거 스) (Uida에 의해 인코딩된)를 포함 하는 플라스 미드 pAPGUSNNB 생성 선택 가능한 표식으로 niaD (인코딩합니다 질산염 reductase)와 기자 퓨전. A. parasiticus 긴장의 niaD transformants NR-1 (niaD) Papgusnnb도 1 또는 niaD 로커 스에서 주로 통합 실시. 네이티브도 1 및도 1::GUS 기자의 식 transformants 북부와 서 부 분석 하 고 질적, 양적 GUS 활동 분석 실험 여 aflatoxin 유도 조건 하에서 성장에 비교 되었다. 타이밍 및 Papgusnnb도 1에서 통합으로 1 발기인 기능의 수준을 네이티브도 1 유전자에 대 한 관찰 비슷 했다. 반면, 통합 Niad에서 발생 하는 경우 pAPGUSNNB 및 두 번째도 1::GUS 기자 구문, pBNG3.0도 아니다 1 발기인 활동 감지 되지 않았습니다. NiaD 종속 규정 Niad에 식의 부재에 대 한 계정 수 있습니다, 때문에 세 번째 염색체 위치 선택 마커로 포함도 1::GUS pAPGUSNP 플러스 pyrG (인코딩합니다 OMP decarboxylase)를 사용 하 여 분석 했다. 거 스 식 되었고 감지만 때 Papgusnp도 1 통합에 pyrG, pyrG 식 필요한 성장 상태 에서도 감지 되었다. aflatoxin 유전자 클러스터 내에서 동종 사이트에 통합 되어 있지만 aflatoxin 유전자 클러스터 외부의 두 위치에서 네이티브도 1 레벨에서 표현 하지도 1::GUS 네이티브도 1 유전자를 유사 하 게 규제 됩니다. 우리는 거 스 기자 시스템도 1 발기인 활동을 측정을 효과적으로 사용할 수 없으며-1은 A. parasiticus 염색체에 위치 종속 규정이 적용 결론.
정화와 마 니 톨 효소의 특성 및 머리 마 름 병 균 류, Gibberella Zeae (Fusarium Graminearum)에서 해당 Cdna의 식별
Phytochemistry. Dec, 2002 | Pubmed ID: 12453571
마 니 톨-2-효소 (MtDH) Gibberella zeae에서 정화는 고 해당 cDNA 식별 합니다. Mtdh의 정화 황산 분류, 조합 하 여 달성 되었다 음이온 교환 및 염료 ligand 착 색 인쇄기. 최종 정화 네이티브 젤에서 electroelution에 따라 달성 했다. SDS 페이지를 기반으로 하는 분자 질량 결정 변성된 단백질 29 Kda는 표시. 천연 단백질 질량 110 kDa 젤 투과 크로마토그래피를 사용 하 여, tetrameric 형태를 나타내는 것으로 확인 되었습니다. 과 당 산화 환 원 효소 활동 마 니 톨 산도 옵 티 마는 각각 9.0, 및 7.0. 기판으로 sorbitol과 활동 마 니 톨과 활동의 21% 이었다. 키네틱 매개 변수는 기질 농도 대 효소 활동의 직접 선형 음모에 의해 결정 했다. 600Mm 이상의 농도 당 0.3 이상의 NADPH 농도 mM 기판 저해를 인 한. 여러 가지 곰 팡이 Mtdhs의 예측 된 아미노산 시퀀스의 비교는 phyla 내 높은 보존 표시. 강제적인 ascospore 방전에 turgor 압력의 세대에서 MtDH 위한 가능한 역할을 설명 합니다.
Gibberella Zeae (anamorph Fusarium Graminearum)의 방전 방지 Ascospore의 생리 적, 환경적 측면
Mycologia. Mar-Apr, 2002 | Pubmed ID: 21156487
우리는 perithecial 균 Gibberella zeae에서에서 ascospore 방전 조사. 일정 비 고 낮과 밤 길이 변화를 시뮬레이션 하는 바람 터널 연구에서 ascospore 출시의 비율은 약 8-30% 광원 보다 완전 한 어둠 속에서 더 큰 했다. 지속적인 빛 아래 ascospore 방전 92% 보다 높은 상대 습도 레벨에서 최대 속도에서 발생 했습니다. 높은 외부 osmolarity의 조건 하에서 perithecia 했다 놓으면 ascospore 방전 크게 감소 했다. Ascospores는 ascus 내에서 액체, epiplasm, 한 방울 함께 asci에서 퇴원 했다. GC-질량 분석에 의해 방전된 epiplasmic 액체의 분석을 마 니 톨 유체의 주요 간단한 설탕 구성 요소는 밝혔다. 마 니 톨과 당 변환할 catalyzes, 마 니 톨 효소의 활동 식물 조직에서 추출 물에 보다 성숙 perithecia에서 단백질 추출 물에서 더 높았다. K(+)와 Ca(++) 이온 채널의 여러 억제제 ascospore 방전 turgor 압력 이온 플럭스와 마 니 톨 축적에 의해 생성 된 축적에서 결과 제안 ascospore 방전 억제.
Gibberella Zeae (anamorph Fusarium Graminearum)에서 태그를 표현된 시퀀스의 분석
Fungal Genetics and Biology : FG & B. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12620255
Gibberella zeae 밀과 보 리를 포함 한 많은 작물 식물을 감염 하 고 전 세계에 걸쳐 머리 마 름 병 및 부패 병 발생 하는 광범위 한 호스트 범위 병원 체 이다. 곰 팡이 개발 및 pathogenicity 더 나은 이해를 우리 세 cDNA 라이브러리에서 7996 ESTs 생성. 두 라이브러리는 carbon-(c-)에서 생성 된 질소 (N-) 굶주린 사체와 하나의 라이브러리 perithecia (P)을 성숙의 문화에서 생성 된. 다른 곰 팡이 병원 균 감염 관련 유전자 발현을 유도 하는 신호 역할을 기아 상태 표시 되었습니다. Cdnas를 putative 함수를 할당 하려면 시퀀스 Stackpack를 사용 하 여 처음 조립 했다. 3 개의 EST 데이터베이스에서 확인 된 유전자의 예상된 총 수는 2110: 1088 contigs 및 1022 단일 시퀀스. 이러한 2110 시퀀스 효 모 단백질 시퀀스 참조 집합 및 BLASTX를 사용 하 여 은행 비중복 데이터베이스 비교 했다. 이 프로세스에 의해 식별 된 추정 유전자 기능을 바탕으로, 우리 두 굶 어 문화 했다 발견 비슷하지만 동일 하지는 않습니다 유전자 발현의 패턴 반면 발달 문화 식의 그들의 패턴에서 별개 했다. 세 가지 라이브러리의 perithecium 라이브러리 "분류" 카테고리에 빠지지 ESTS의 가장 큰 비율 (46%)를 했다. 일부 알려진된 곰 팡이 독성 또는 pathogenicity 요인의 homologues 주로에서 N-와 C-라이브러리를 발견 했다. 비교도 관련된 균 류 Neurospora crassa 및 Magnaporthe grisea 명. crassa 게놈 시퀀스에서 Ests와 만들어진 했다.
Cis-행동의 역할 Transcriptional 정품 인증도 1 누 Parasiticus NorL, TATA 상자 및 AflR1 사이트
Applied and Environmental Microbiology. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15746358
AflR 전사 인자는 aflatoxin filamentous 곰 팡이 Aspergillus에서 생 합성에 관련 된 특정 통로 유전자의 업 레 귤 레이 션에 대 한 필요 합니다. 도 1 인코딩합니다 초기 aflatoxin 통로 효소를; 그것의 발기인 합의 AflR 바인딩 사이트를 (AflR1)에 포함 되어 있습니다. 누 parasiticus 셀 추출 물과 Aflr이이 사이트는 필요 없고 1 식 또는 다른 전사 인자 유전자 조절에 기여 하는 경우 불분명 했다 그래서 병원 성 대장균이 A. parasiticus AflR1 체 외에 바인딩할 할 표현에 단백질. 이 연구에서 A. parasiticus에도 1 식에 Aflr1의 역할을 정의 하 고 cis 행동 사이트를 추가로 최대도 1 transcriptional 활성화에 필요한 식별. 삭제 및 대체 AflR1 A. parasiticus 이나 1::GUS 기자 변종에도 1 발기인에이 사이트는 필요 없고 1 transcriptional 활성화 vivo에서 나타났다. 상 타 타 상자도 1 발기인에의 대체 nondetectable 베타-glucuronidase (거 스) 활동,이 타 타 상자는 vivo 기능을 보여주는 귀착되 었 다. 우리는 또한 NorL, 잔류물-210 및-238 A. parasiticus 액체 매체와 단단한 매체에 성장에 최대도 1 transcriptional 활성화를 위해 필요한 사이 지정 소설 cis 연기 사이트 발견. 전기 이동 기동성 교대 분석 실험을 사용 하 여 최대 바인딩 용량 기능 Aflr에 직접 또는 간접적으로 의존 하는 특정 NorL 종속 DNA-단백질 복잡 한 식별. NorL 사이트 aflatoxin 유전자 클러스터에서 한 번만 나타나므로 연관도 1 발기인 aflatoxin 통로 대 한 전반적인 규제 제도 대 한 중요 한 암시를 할 수 있습니다.
방출 역학 및 Gibberella Zeae (anamorph Fuarium Graminearum)의 Ascospores의 궤적
Fungal Genetics and Biology : FG & B. Jun, 2005 | Pubmed ID: 15878295
이후 바람 속도 방울 표면, 강제 배출 0으로 포자의 분산 촉진 한다. 하지만 표면 영역을 기준으로 낮은 질량 작은 포자에 대 한 높은 방출 속도 수익률만 그래서 유독한 단거리 궤적은 그들의 드래그 합니다. 따라서, 높은 속도 달성 막대 한 가속 필요 합니다. Ascomycete Gibberella zeae에서 우리 발사 속도 perithecia, 그리고 소스와 출시 운전 압력의 크기에서 총 ascospores의 운동 에너지는 결정. 우리는 발사 속도 에너지에 대 한 계정에는 ascus 내부의 압력 충분 여부를 물었다. 발사 속도 34.5 ms 1, 압력을 필요로 1.54 MPa 870,000 g-가속의 최고 가속 생물 학적 시스템에 보고 합니다. 이 분석 마 니 톨, 방전, 운전에 중요 한 역할을 가진 것으로 하는 epiplasmic 액체의 주요 설탕 구성 요소를 할인 해준다 고 메커니즘에 칼륨 이온 플럭스의 역할을 지원 합니다.
Filamentous 곰 팡이 Gibberella Zeae (anamorph Fusarium Graminearum)에 Polyketide Synthase 유전자의 기능 분석
Eukaryotic Cell. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16278459
Polyketides은 광대 한 다양 한 형태와 기능을 전시 하는 2 차 대사 산물의 클래스. 곰 팡이, 이러한 화합물 polyketide synthases (PKSs) 타입으로 분류는 크고, 다중 도메인 효소에 의해 생성 됩니다. 이 연구에서 우리가 식별 하 고 기능적으로 filamentous 곰 팡이 Gibberella zeae의 게놈에서 15 PKS 유전자를 방해. 이 유전자의 다섯 mycotoxins zearalenone, aurofusarin, 및 fusarin C와 블랙 perithecial 안료 생산에 대 한 책임이 있습니다. 15 유전자의 포괄적인 식 분석 곡물 식민지, 식물 식민지, 성적인 개발과 사체 성장 중 다양 한 식 패턴을 공개 했다. PKS 유전자의 식 18 조건 테스트에서 검색 되지 않았습니다. 이것은 하나의 유기 체에서 PK 유전자의 완전 한 세트의 유전자 특성을 첫 번째 연구 이다.
개발 및 Gibberella Zeae의 차별화 (anamorph: Fusarium Graminearum) 밀의 식민지 기간 동안
Mycologia. Jan-Feb, 2005 | Pubmed ID: 16389974
머리 마 름 병 균, Gibberella zeae 전세계, 작은 알갱이의 가장 치명적인 병원 균 중 하나입니다. Ascospore 라덴 perithecia이이 균의 성숙한 시리얼 작물을 개발 하 고 파편 자르기 및 질병의 기본 inoculum을 제공. 우리 밀 조직 perithecium 생산 리드의 식민 과정 특징. 줄기를 체계적이 고 광범위 하 게 다음 밀 머리의 접종 식민지 화 했다. Haploid 사체 혈관 시스템과 속 아래로 이동 하 고 광선 줄기 조직 식민지 화. 두 가지 별도 단계에서 개발 된 dikaryotic 균: 방사형 hyphal 성장 지원 xylem 그리고 chloremchyma perithecium 개발 지원. Perithecium 형성 stomatesand 실리 카 셀과 협회에서 시작 되었다. 혈관 occlusions 25% 접종된 식물의 줄기를 식민지에서 사체를 수 없습니다. 이러한 결과의 의미는 저항 cultivars 개발 하 고 질병의 화학 제어 개선에 대 한 설명 합니다.
Gibberella Zeae에서 Zearalenone 생 합성에 관련 된 두 개의 Polyketide Synthase 유전자의 특성 분석
Applied and Environmental Microbiology. Mar, 2006 | Pubmed ID: 16517624
Zearalenone, 여러 Fusarium 종 제작한 mycotoxin 주로 저장된 곡물에 오염 물질 발견 및 포유류에 만성 estrogenic 효과가 있다. Zearalenone polyketide polyketide synthase (PKS) 하 여 여러 명의 아세트산 단위 순차 결로에서 파생 된 하지만 그 생 합성의 유전학을 이해 하지 않습니다. 우리는 두 개의 유전자, ZEA1 및 ZEA2, polyketide synthases Gibberella zeae (anamorph Fusarium graminearum)에 의해 zearalenone의 생 합성에 참여 하는 인코딩 지정 복제. 어느 유전자 장애 zearalenone 생산 유도 하는 조건에서의 손실 귀착되 었 다. ZEA1 및 ZEA2 divergently 공통 프로모터 영역에서 복사할 수 있습니다. PKS 유전자와 6의 정량적 PCR 분석 측면 유전자 지원 2 polyketide synthases zearalenone 생 합성에 대 한 코어 생 합성 단위를 구성 하는 보기. Zearalenone 생 합성 유전자의 감사 zearalenone 곡물의 오염 발생 필드 조건에서 합성은 어떻게 이해 필요 합니다.
Fusarium Graminearum Affymetrix GeneChip Planta 및 생체 외에서 곰 팡이 유전자 발현 프로 파일링의 개발
Fungal Genetics and Biology : FG & B. May, 2006 | Pubmed ID: 16531083
최근 여러 filamentous 곰 팡이의 게놈 시퀀스 제공 게놈 넓은 식 분석을 포함 한 대규모 기능 분석에 대 한 기회를 제공 하 되. 우리 보고 디자인과 filamentous 곰 팡이, ascomycetous 식물 병원 체 Fusarium graminearum의 전체 게놈에 따라 첫 번째 Affymetrix GeneChip microarray의 유효성을 검사 합니다. 배열에 모든 상 유전자 (약 14, 000)를 대표 하는 가능성을 최대화 하기 위해 두 가지 집합이 자동으로 예측된 유전자 호출 사용 되었고 온라인 F. graminearum 게놈 데이터베이스에 통합. 이러한 유전자 집합에서 호출의 일부를 수동으로 주석이 추가 EST에 함께 한 모든 호출의 비중복 추출 시퀀스 및 컨트롤 GeneChip 디자인에 대 한 제출 했다. 실험 F. graminearum GeneChip 성능 테스트를 실시 했다. 게놈 DNA를 사용 하 여 교 잡 실험 시연 F. graminearum와 실험에 대 한 배열의 유용성 및 적어도 4 개의 추가 병원 성 Fusarium 종. 차동 사본 축적 GeneChip 치료와 3 개의 영양 정권 문화에서 성장 균 류에서와 감염 된 보 리에 곰 팡이 성장에 비해 파생 F. graminearum를 사용 하 여 발견 되었습니다. Planta에서 곰 팡이 유전자를 검색할 수는 곰 팡이 녹취 록에 대 한 풍부 하 게 하는 노력 없이 의외로 민감한. 공장 식 데이터베이스 (PLEXdb, http://www.plexdb.org) F. graminearum Genechip에서에서 원시 및 정규화 된 식 데이터에 대 한 공용 리포지토리로 사용 됩니다. F. graminearum GeneChip 공장에서 균 류와 질병 응답에서 pathogenicity 유전자 간의 상호 작용을 포함 될 수 있습니다 호스트 병원 체 통로의 탐사가 속하는 데 도움이 됩니다.
질병 개발의 초기 단계 동안 Fusarium Graminearum과 밀 사이의 호스트 병원 체 상호의 게놈 분석
Microbiology (Reading, England). Jun, 2006 | Pubmed ID: 16735750
Fusarium graminearum 변종 식물 질병 Fusarium 머리 황폐를 일으키는 원인이 되기를 위해 책임 mycotoxins에 밀을 생산 하 고 질병의 원인이 자신의 능력에서 크게 다릅니다. 곰 팡이 유전자 발현 pathogenicity 관련 이해의 목표와 함께 세 cDNA 라이브러리 억제 감법 교 잡 밀 머리를 사용 하 여 매우 공격적 긴장을 물 이나이 병원 체의 덜 공격적 긴장으로 주사 하 여 만들어졌습니다. 80-4 곰 팡이 유전자 표현 초기 질병 개발 하는 동안 발견 되었습니다. 가능성이 49이이 유전자의 기능 bioinformatic 분석에 의해 유추 될 수 있습니다. 35 ESTs 현재 데이터베이스에 없습니다 알려진된 homologues가 졌고 ab 론 적 유전자 예측 방법으로 식별 하지 했다. 감염 된 밀 머리에서 이러한 Ests는 아마 이전에 주석 했다 F. graminearum 유전자를 나타냅니다. 이러한 라이브러리 중 하나에 표현 하는 4 개의 유전자는 타겟된 유전자 대체, 이어지는 2-구성 요소 응답 레 귤 레이 터 homologue pathogenicity의 곰 팡이에 관련 된 특성에 대 한 선정 됐다. 이 유전자에 돌연변이 감소 포자 형성 보여 주며 밀에서 Fusarium 머리 마 름 병의 확산을 지연.
Microarray 분석 성적표 축적 Filamentous 곰 팡이 Gibberella Zeae (anamorph Fusarium Graminearum)에 Perithecium 개발 하는 동안
Molecular Genetics and Genomics : MGG. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16741730
Gibberella zeae (anamorph Fusarium graminearum)는 밀과 보 리는 미국에서의 마 름 Fusarium 머리 병 (FHB)의 인과 에이전트입니다. Ascospores perithecia, 성숙한 fruiting 몸에서 강제로 퇴원 FHB 전염병에 대 한 기본 inoculum 역할. Perithecium 개발 및 기능에 대 한 중요 한 유전자를 식별 하려면 G. zeae 게놈의 11%를 적용 하는 cDNA microarray 건립 되었다. 3 개의 연속 된 perithecium 개발 단계 동안 표현 하는 유전자의 전사 수준에서 변화를 측정 하 여 microarray 사용 되었다. 식물 사체에 비해, 651 (31%) cDNA 클론 대 본 수준에서 변화를 보였다 하 여 세 발달 단계 중 하나. Perithecium 개발 하는 동안 263 (13%) cDNA 클론 대 본 프로필의 시간적 변화를 보였다. Perithecia 성숙의 수준에 가장 큰 변화를 보여준 성적표 유전자 세포 구조, 신진 대사, 세포 타입 분화, 에너지, 그리고 셀룰러 전송의 FunCat 주요 기능 범주에 속 했다. 셀룰러 전송 관련 유전자에 대 한 성적 증명서는 성숙 perithecia 최고 수준을 보여준 반면 신진 대사 및 세포 타입 분화 관련 유전자에 대 한 성적 미 숙 perithecia에서 최고 수준을 보였다. 이 연구는 perithecium 개발 하는 동안 대 본 수준에 공간 및 시간적 변화의 첫 번째 대규모 조사를 나타냅니다. 곰 팡이에 성적 개발 과정이 복잡 하 고, multigenic 및이 농업 중요 한 곰 팡이의 성적인 개발에 관련 된 유전자를 식별 한 분명 한 증거를 제공 합니다.
유전자 발현 Perithecium 개발 환경 Gibberella Zeae (anamorph Fusarium Graminearum) 이온 전송 단백질에 특히 중점을 이동합니다
Fungal Genetics and Biology : FG & B. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17555994
Gibberella zeae Fusarium 머리 황폐의 인과 에이전트 작은 알갱이 전세계의 치명적인 병원 체 이다. 성적 사이클은 머리의 중요 한 구성 요소 기본 inoculum으로 역할을 강제로 방전된 ascospores 역학, 황폐. G. zeae의 모든 예측된 유전자의 probesets 대표를 포함 하는 Affymetrix Genechip의 최근 개발 성적 개발 중 차동 유전자 발현의 연구의 문을 열었습니다. Genechips를 사용 하 여 개발 시간 코스 문화 성숙 multiseptate ascospores와 함께 perithecia 식물 균에서 수행 했습니다. 시간-포인트 구성 된 성숙한 perithecium 주요 세포 유형의 개발을 나타냅니다. 17,830 G. zeae probesets, 78%의 대부분은 적어도 하나의 발달 단계; 중 표현 했다 이들 중 12%는 성적 개발에 나타납니다. 162 예측된 이온 운송업 자 유전자의 분석은 perithecium 함수와 함께 그들의 협회 때문에 자세하게에서 보도 했다. 염화 채널 미 라 형 siderophores의 식 패턴 P 형 ATPases, 칼륨 전송기 발달 단계에 관한 몇 가지 전문 표시. 이 차동 사본 축적 filamentous 곰 팡이에 성적 개발 하는 동안 첫 번째 전체 게놈 분석 이다.
곰 팡이 대포: 폭발성 포자 방전은 Ascomycota에 있습니다
FEMS Microbiology Letters. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17784861
Ascomycetous 곰 팡이 포자 성과 관계가 없는 및 성적 재생산을 통해 막대 한 양의 생성합니다. 그들의 성적 포자 (ascospores) 역할을 작은 물 대포와 포자를 공기 중으로 추방 하는 asci 라는 관 모 낭 내에서 개발. 강제 방전 하 여 포자의 분산 및 많은 마저 곰 팡이의 분산에 대 한 많은 식물 곰 팡이 질병의 보급에 대 한 중요 하다. 메커니즘 확장 ascus; 내 turgor 압력에 의해 구동 되어야 하 긴 줄 알았는데 그러나, 상대적으로 작은 유전자 및 생리 적 작업 메커니즘에 실시 되었습니다. 최근 연구는 ascus 내의 압력 측정 있고 ascus epiplasmic 액체의 삼 투 잠재력에 기여 하는 구성 요소를 계량 합니다. 몇 종 자세히 살펴보았다 하지만 결과 ascus 크기, fruiting 체형 및 특정 종족의 틈새 반영 ascus 함수에 다양성을 나타냅니다.
Fusarium Graminearum 게놈 지역화 된 다형성 및 병원 체 전문화 사이의 링크를 보여준다
Science (New York, N.Y.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17823352
시퀀싱 하 고 filamentous 곰 팡이 Fusarium graminearum, 곡물 재배의 주요 병원 체의 게놈 주석. 거의 반복적인 시퀀스 검색 된 및 광범위 한 변이 따라 중복된 시퀀스는 반복을 이용한 포인트 돌연변이 과정 부분적으로 감소 반복 콘텐츠 및 명백한 낮은 수가 paralogous (ancestrally 중복된) 유전자에 대 한 계정 수 있습니다. F. graminearum의 두 번째 변형 포함 10000 단일 뉴클레오티드 polymorphisms 자주 telomeres 근처와 다른 개별 염색체 세그먼트 내에 위치 했다. 유전자의 많은 포함 한 고도로 다형 영역 세트 식물 곰 팡이 상호 작용에 연루와 재결합의 높은 속도와 비정상적으로 분기 했다. 게놈 혁신의이 지역에서의 식물의 호스트와 F. graminearum의 상호 작용으로 인해 선택 발생할 수 있습니다.
L 타입 칼슘 이온 채널 Cch1 Ascospore 방전 Filamentous 곰 팡이 Gibberella Zeae (anamorph Fusarium Graminearum)에서 바로 성장에 영향을 미칩니다
Eukaryotic Cell. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18083828
Cch1, 상 전압 개폐 칼슘 이온 채널은 Gibberella zeae에서 ascus 개발에서의 역할에 대 한 조사. Cch1의 유전자 교체 돌연변이 생성 되었고 형태학 ascus ascospore 개발 asci의 대부분에서 정상 등장 강제로 포자를 배출 하지 않았다 asci 발견. 또한, 사체 성장 상당히 느린 했다 하 고 성적인 개발 돌연변이;에서 약간 지연 되었다 돌연변이 균 사체 특유 무성 한 형태학 보여 주며 아무 cirrhi 생산 되었다. 밀 Deltacch1 개발 돌연변이 증상에 감염 된 야생 타입; 밀 대 등으로 감염 그러나, 돌연변이 saprobic 곰 팡이 의해 식민지 로부터 감염 된 줄기를 보호 하기 위해 감소 능력을 보였다. 유전자 발현에 중요 한, 두 가지 또는 더 큰, Affymetrix Fusarium microarray 보였다 2,449 유전자를 사용 하 여 돌연변이의 transcriptional 분석 발달 시리즈에 걸쳐 사본 풍부 하 게에서 변경 합니다. 이 작품 G. zeae에서 강제 포자 방전에 cch1의 역할을 확장 하 고이 채널은 성장과 개발에 미묘한 영향을 제안 합니다.
Triacylglyceride 대사 Fusarium Graminearum에 의해 식민과 밀에 성적인 개발 하는 동안
Molecular Plant-microbe Interactions : MPMI. Dec, 2009 | Pubmed ID: 19888815
Fusarium graminearum, 작은 알갱이의 치명적인 병원 체 작물 잔류물에 overwinters를 임시 perithecia를 생성 합니다. Overwintering 균에 지질 축적 overwinter 생존과 perithecium 개발에 대 한 매장 량을 제공할 것 이다. Perithecium 개발 하는 동안 문화의 지방산 조성 단계에 걸쳐 개발 하지만 지방산 구성에 약간의 변화 하는 동안 중성 지질 수준 감소를 나타냅니다. 성적 개발 초기에 문화의 현미경 검사 밝혀 지질 시체와 함께 부풀어 오른 hyphal 셀. 비교, 식물 균 몇 지질 시체를 포함. Microarray 분석 밀 줄기에 perithecium 개발을 통해 식민지의 단계에서 수행 되었습니다. Perithecium 개발 모두 planta 및 체 외 (이전에 게시 된) 지원 단계 동안 진 식 분석 보기 지질 생 합성 성적 발달을 지도 하는 밀 식민의 초기 단계 동안 발생 하 고 그 지질 산화 발생 perithecia로 개발 하는. 밀 줄기 식민지의 단계에서 유전자 발현의 분석에는 이러한 단계에 고유한 유전자의 세트를 공개 했다. 이 결과 지질 균 밀 줄기 식민지에 축적 하 고 이후에 perithecium 형성 줄기 조직에 사용 되는 보기를 지원 합니다. 이 결과 나타내고 식물 조직 전에 수확의 광범위 한 식민지 작물 잔류물에 후속 포자 형성을 위해 필수적 이다, 따라서, inoculum 감소에 대 한 중요 한 의미를 갖는다.
Atrazine 성장 호르몬 방출 호르몬 수용 체에 바인딩하고 성장 호르몬 유전자 발현에 영향을 줍니다
Environmental Health Perspectives. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20529762
Atrazine (ATR), 미국에서는 일반적으로 사용 되는 제 초 제 생태계 및 환경에서 지 속성을 통해 자사의 이동성 때문에 물과 토양에 광범위 하 게 배포 됩니다. ATR 동물, 성적인 개발에 연결 되었습니다 하지만 포유류 시스템에 대 한 연구 명확 하 게 식별 셀룰러 대상 실패 했습니다.
임의의 플라스 미드 통합으로 인 한 일부 염색체 삭제 Fusarium Graminearum에 감소 독성 형 귀착되 었 다
Molecular Plant-microbe Interactions : MPMI. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20615118
Fusarium graminearum (teleomorph: Gibberella zeae) 감염 agriculturally 중요 작물, 밀, 보 리, 옥수수 등의 범위는 Ascomycete 곰 팡이 식물 병원 체 이다. 임의의 플라스 미드 삽입 mutagenesis 접근 pathogenicity 전체 게놈 정보를 사용할 수 있는 PH 1 스트레인의 분석에 사용 되었다. 곰 팡이 transformants 처음 밀 귀 감염을 그들의 능력에 대 한 상영 했다. 총 상영 1170 transformants에서에서 8 pathogenicity 밀 귀 및 뿌리에에서 매우 줄어들 것 확인 되었다. 이러한 질병 감쇠 F. graminearum (daf) 돌연변이 지정 했다. 체 외 성장 속도 각 daf 돌연변이의 모양을 해당 부모의 긴장 되었다. Deoxynivalenol (돈) 당한 곡물 귀 daf10 돌연변이와 주사에서 발견 한에서 검색 되지 않았습니다. 플라스 미드 구조 및 돌연변이 daf10의 순서 염색체 1의 한쪽 끝에서 약 350 kb 삭제를 공개 했다. 이 염색체 세그먼트 146 유전자 포함 될 전망 이다. Microarray 분석 돈 유도 조건에서 성장 하는 동안 daf10 유전자 발현의 큰 삭제 확인. 삭제 하는 유전자의 정체성과 돈 생산, 병, 및 기타 생활 프로세스에 있는 그들의 잠재적인 역할을 설명 합니다.
ROA, 새로운 유전자는 정상적인 Morphogenesis 및 Ascospores Gibberella Zeae에서의 방전에 대 한 필요 합니다
Eukaryotic Cell. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20802018
머리 마 름 병, Gibberella zeae로 인 한 밀, 보 리, mycotoxins와 곡 식의 오염으로 인해 쌀 등 곡물 작물 가운데 중요 한 질병 이다. G. zeae ascospores 작물 잔류물 형성 성적 fruiting 시체에서 강제로 퇴원 하 여 전염 됩니다. 이 연구에서 우리는 정상적인 성적 발전에 필요한 새로운 유전자, ROA, 특징. ROA (Δroa)의 삭제 있지만 비정상적인 크기와 모양 asci 및 ascospores의 결과 식물 성장에 영향을 미치지 않았다. Δroa 돌연변이 포자 한계 후 라운드 ascospores 및 부족 한 세포 분열을 유발. Δroa 변형 asci는 perithecia에서 적은 ascospores 퇴원 하지만 야생-타입 스트레인의 것 보다 더 큰 분산 거리를 달성. Asci 내의 turgor 압력 osmolytes epiplasmic 액체에서의 분석을 통해 계산 되었다. 삭제 ROA 유전자의 돌연변이 asci에 turgor 압력을 증가 것으로 보인다. Δroa 돌연변이 asci 및 돌연변이 포자 모양 높은 turgor 압력 더 긴 거리 분산에 기여 했다. Δroa 돌연변이 스트레인 MAT1 2 유전자 대신 녹색 형광 단백질 (GFP) 표식 포함 된 Δmat1 2 돌연변이와 outcrossed는 비정상적인 phenotypic 분리 발생 했습니다. GFP 분리에 GFP의 비는 1:1; 그러나, 모두 8 개의 포자 같은 모양을 했다. 함께 촬영이 연구의 결과 ROA G. zeae의 적절 한 형태와 ascospores의 방전을 유지 하는 다양 한 역할을 재생 것이 좋습니다.
Mid1, Mechanosensitive 칼슘 이온 채널, 성장, 발달과 Filamentous 곰 팡이 Gibberella Zeae에서 Ascospore 방전에 영향을 줍니다
Eukaryotic Cell. Jun, 2011 | Pubmed ID: 21357477
Mid1, 칼슘 ascospore 개발과 asci에서 강제 방전에 의해 침투 되 고 수 있는 스트레치 활성 이온 채널의 역할은 병원 성 균 Gibberella zeae (anamorph Fusarium graminearum)에서 조사 되었다. Δmid1 돌연변이 전시는 > ascospore 12-fold 감소 활동 및 생산된 주로 비정상적인 두 세포 ascospores 죄이 고 하 고 연약한 septae와 방전. 돌연변이의 식물 성장 율은 야생 형 율 ∼50 %와 macroconidia의 생산 > 야생 타입에 비해 10 배 낮은. 칼슘 플럭스의 역할을 더 잘 이해 하기 Δmid1 Δcch1 이중 돌연변이 했다 검사 또한 Cch1, L 타입 칼슘 이온 채널은 Saccharomyces cerevisiae에 mid1와 연결 합니다. Δmid1 Δcch1 이중 돌연변이의 표현 형에는 비슷하지만 모든 범주에 대 한 Δmid1 돌연변이의 표현 형 보다 더 심한. 잠재력과 전류 전압 측정은 Δmid1 및 Δcch1 돌연변이 야생 타입의 식물 균에서 찍은 및 모든 세 가지 변종에 대 한 측정은 비슷해도 단백질 플라즈마 멤브레인의 전체적인 전기적 특성에 크게 기여를 나타내는. 호스트 (밀)에 Δmid1 및 Δmid1Δcch1 돌연변이 체 pathogenicity는 돌연변이 의해 영향을 받지 않습니다. Exogenous 칼슘 보충제는 부분적으로 모든 뮤턴트에 대 한 ascospore 방전 및 식물 성장 결함을 복원 하지만 비정상적인 ascospores 여전히 생산 되었다. 이 결과 ascospore 개발 및 강제 방전 mid1의 알려진된 역할을 확장합니다. 그러나 Neurospora crassa Δmid1 돌연변이 검사도 했다 고 결함 ascospore 개발 또는 ascospore 방전을 발생 하지 않았다. 다른 ascomycetes의 이온 채널에 비해 Mid1 틈새 특정 적응에 관해서는 특히 역할의 놀라운 적응력을 보여줍니다.
Fusarium Graminearum에 의해 밀 커널 식민지 중 Deoxynivalenol 생 합성 관련 유전자 발현
Phytopathology. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21521001
Deoxynivalenol (돈)는 강력한 mycotoxin 독성 요소 Fusarium graminearum에 의해 제작. 우리 밀 머리 감염 감염 및 내성 cultivars 및 취약 cultivars strobilurin 균 (예를 들어, azoxystrobin)로 치료 시 돈 생 합성 유전자 Tri5 코어의 식을 조사 했다. 돈 독 소 누적 식 상관 관계를 계량 했다. 하우스키핑 유전자를 기준으로 가장 높은 Tri5 식 감염 앞에서 발생 했습니다. 감염 된 초기 커널을 보였다 저하 감염 진행으로 상대 Tri5 식 하지만 Tri5 식 적 관찰 21 일 동안 끊었다. Azoxystrobin 치료 상대 Tri5 식 또는 돈 수량에 큰 영향 없이 보였다. 'Alsen' 보여 최소한의 저항 품종 하루 21에 의해 감지 아니 균 류와 곰 팡이의 확산. 돈 샘플링 나중 단계에서 Alsen에 상당한 수량에서 검색 되지 않았습니다. Wheaten, 돈 레벨 이후 샘플링 시간 포인트에서 감지할 수 돈과 8 일 postinoculation (dpi)에 무시할 수 있었다. Tri5 완전히 senesced 커널에도 검색 된 21 dpi. 우리의 데이터 이전에 설명 보다 훨씬 더 긴 기간 동안 취약 품종에 Tri5 녹취 록의 존재를 보여 줍니다. 이 곰 팡이의 능력을 빠르게 다시 시작 독 소 생 합성 말린된 감염 된 곡물에 도움이 되는 환경 조건 표시 있어야 제안 하 고 무 증상 곡 식의 수준 높은 돈에 대 한 가능한 메커니즘을 제공 합니다.
기능 분석 실험 식 분석에서 Fusarium Graminearum입니다
Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21590414
Fusarium graminearum, 밀, 헤드 황폐의 인과 에이전트는 완성 된 게놈 시퀀스를 세 번째 filamentous 곰 팡이. 2003 년에서 게놈 시퀀스의 릴리스 이후 F. graminearum 유전체학 및 transcriptomics, mycotoxins, 곰 팡이 집단 유전학, 유전자 기능 및 성적 개발의 연구에 대 한 모델 되고있다. 여기서 우리는 우리가 우리의 실험실에 F. graminearum의 라이프 사이클 단계에 식 분석을 수행 하려면 사용 하는 기술과 기능으로 잠재적으로 식별 하는 그 유전자의 특성을 기술 제시 흥미로운.
