Translate this page to:
Spanish
In JoVE (1)
Other Publications (9)
- Nature Reviews. Molecular Cell Biology
- The Journal of Comparative Neurology
- The Journal of Comparative Neurology
- PloS One
- The Journal of Comparative Neurology
- BMC Developmental Biology
- Development (Cambridge, England)
- Developmental Dynamics : an Official Publication of the American Association of Anatomists
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
Automatic Translation
This translation into Spanish was automatically generated.
English Version | Other Languages
Articles by Jeffrey M. Trimarchi in JoVE
JoVE Neuroscience
Una sola célula de perfiles de neuronas de la retina en desarrollo y maduro
Department of Genetics, Development and Cell Biology, Neuroscience Program, Iowa State University
Un método para el aislamiento de células de la retina individuales y la amplificación posterior de sus ADNc se describe. Una sola célula de la transcriptómica revela el grado de heterogeneidad presente celular en un pañuelo de papel y descubre nuevos genes marcadores de poblaciones celulares raras. El protocolo de acompañamiento se puede ajustar para adaptarse a diferentes tipos de células.
Other articles by Jeffrey M. Trimarchi on PubMed
Rivalidad Entre Hermanos En La Familia E2F
La familia del factor de transcripción E2F determina si es o no una célula se divide por el control de la expresión de los principales reguladores del ciclo celular. Los E2Fs individuales se puede dividir en subgrupos distintos que actúan en oposición directa entre sí para promover la proliferación celular o bien al ciclo celular y la diferenciación terminal de salida. ¿Cuál es la base molecular subyacente de este "push-pull-me-lo-regulación, y cuáles son sus consecuencias biológicas?
La Heterogeneidad Molecular De Desarrollo De Las Células Ganglionares Retinales Y Amacrinas Revelado a Través De Perfiles De Expresión Génica De Células Individuales
Durante el desarrollo del sistema nervioso central (SNC), ciclismo comprometidos células progenitoras dan lugar a una variedad de distintos tipos de células neuronales y gliales. A medida que estos diferentes tipos de células que nacen progresar a partir de células nuevas especificaciones para las neuronas y glía totalmente diferenciados. Con el fin de definir los procesos de desarrollo de los tipos de células individuales, perfilado sola expresión de células se llevó a cabo en el desarrollo de ganglio y las células amacrinas de la retina murino. Las células individuales de varias etapas de desarrollo se aislaron y se perfila en las matrices de oligonucleótidos de Affymetrix. Dos colores hibridación in situ fluorescente en la retina disociadas se utilizó para verificar y ampliar los resultados de microarrays, permitiendo mediciones cuantitativas de un gran número de células coexpressing dos genes. En conjunto, estos experimentos han dado una vista ampliada de los procesos en curso en el desarrollo de ganglio retinal y las células amacrinas, así como varios cientos de genes marcadores de nuevas versiones de estos tipos de células. Además, este estudio ha permitido la definición de algunas de la heterogeneidad molecular entre ambos ganglio desarrollo y las células amacrinas y entre las subclases de cada tipo de células.
Identificación De Marcadores Moleculares De Las Células Bipolares En La Retina Murina
La retina las neuronas bipolares servir como interneuronas de relé que conectan la barra y las células fotorreceptoras de cono amacrinas y células ganglionares. Presentan diversas morfologías esenciales para el enrutamiento adecuado de las señales de las células fotorreceptoras de amacrinas específica postsináptica y las células ganglionares. El desarrollo y la fisiología de estas interneuronas no han sido completamente definidos molecularmente. A pesar de identificación previa de los genes expresados en varios subtipos de células bipolares, moléculas que marcan cada tipo de célula bipolar todavía por descubrir. En este informe, los nuevos marcadores genéticos de las células bipolares murinos se encontraron. Los candidatos fueron generadas inicialmente por el uso de análisis de microarrays de células bipolares individuales y la minería del análisis de la retina de serie de la expresión génica (SAGE) de datos. Estos candidatos se ensayaron posteriormente para la expresión en células bipolares por ARN en hibridación in situ. Diez nuevos marcadores moleculares fueron identificados, cinco de los cuales son altamente enriquecido en su expresión en las células bipolares en la retina adulta. Etiquetado doble experimentos con sondas para subconjuntos previamente caracterizadas de las células bipolares se llevaron a cabo para identificar los subtipos de células bipolares que expresan los nuevos marcadores. Además, la expresión de genes de células bipolares se analizó en Bhlhb4 retinas knockout, en la que bastones, las células bipolares degenerado postnatalmente, para delimitar aún más la identidad de las células bipolares en los que se encuentran nuevos marcadores. A partir del análisis de Bhlhb4 retinas mutantes, cono célula bipolar expresión de genes parece ser relativamente no afectado por la degeneración de los bastones, células bipolares. Identificación de marcadores moleculares para los distintos subtipos de células bipolares conducirá a un mayor conocimiento en el desarrollo y la función de estas interneuronas diversas.
Las Células Progenitoras De La Retina Individuales Muestran Una Heterogeneidad Amplia De La Expresión Génica
El desarrollo de tejidos complejos requiere que las células mitóticas progenitoras integrar la información del ambiente. Los resultados muy variados de los procesos de integración, sin duda, estos dependen, al menos en parte, de las variaciones entre los programas de expresión génica de las células progenitoras individuales. Hasta la fecha, no ha habido un examen completo de estas diferencias entre las células progenitoras de un tejido particular. Aquí, utilizamos perfiles de expresión genética global para definir las diferencias entre las células progenitoras individuales de la retina de los vertebrados. Las células retinianas progenitoras (RPC) se ha demostrado por análisis de linaje para ser multipotentes en todo el desarrollo y producir distintos tipos de células hijas, en un orden temporal, conservada. Un total de 42 RPC solo se perfila en arrays de Affymetrix. En hibridaciones in situ realizadas en las dos secciones de retina y células de la retina disociadas se utilizaron para validar los resultados de los microarrays. Una gran cantidad de heterogeneidad en la expresión génica entre RPC, incluso entre las células aisladas desde el punto mismo tiempo de desarrollo, se observó. Mientras que muchas clases de genes muestran heterogeneidad de la expresión génica, la expresión de factores de transcripción constituía una cantidad significativa de la heterogeneidad observada. En contraste con los resultados anteriores, RPC individuales se encontraron para expresar múltiples factores de transcripción bHLH, lo que sugiere modelos alternativos a los desarrollados anteriormente con respecto a cómo estos factores pueden ser coordinados. Además, la expresión de las transcripciones relacionadas con el ciclo celular mostró diferencias entre los asociados a la fase G2 y M, en comparación con G1 y S, lo que sugiere diferentes niveles de regulación de estos genes. Estos datos proporcionan una visión de los tipos de procesos y de los genes que son fundamentales para elegir el destino celular, la proliferación de las decisiones, y, para las células del sistema nervioso central, las bases de la formación de un circuito complejo.
El Transcriptoma De La Retina Las Células Gliales De Müller
Müller células gliales son el principal tipo de células gliales en la retina de mamíferos. Para identificar el mecanismo molecular que define la identidad de Müller células gliales y la función, solo gen celular de perfiles de expresión se realizó en microarrays de Affymetrix. La identificación de un grupo de genes que se expresan en altos niveles sugiere un núcleo de las células de Müller transcriptoma, que es la base que probablemente muchas de las funciones de las células de Müller. Expresión de los componentes de la maquinaria del ciclo celular y la vía de Notch, así como de factores de crecimiento, quimiocinas y lipoproteínas podría permitir la comunicación entre las células de Müller gliales y las neuronas que apoyo, incluyendo la modulación de la actividad neuronal. Este enfoque revela un conjunto de transcripciones que no fueron caracterizados anteriormente en (Müller) glía; validación de la expresión de algunos de estos genes se realizó mediante hibridación in situ. Los genes expresados exclusivamente por las células de Müller fueron identificados como nuevos marcadores. Además, un nuevo BAC ratón transgénico que expresa Cre en las células células de Müller se ha generado. La huella molecular de las células de Müller proporciona una base para nuevos estudios de desarrollo de las células de Müller y la función en los estados normales y enfermos.
Componentes De La Hormona Tiroidea Se Expresan En Tres Olas Secuencial Durante El Desarrollo De La Retina De Pollo
La hormona tiroidea (TH) es un importante regulador del desarrollo en muchos tejidos, incluyendo la retina. TH se activa a nivel local a través de deiodinase 2 (DIØ2), y es destruido por deiodinase 3 (DIØ3). Los receptores de TH, TRA y TRB, mediar en la actividad de TH través de la unión de hormonas y ADN, y las interacciones con los reguladores de la transcripción.
Requisito Temporal De La Sfrs1 Factor De Empalme Alternativo Para La Supervivencia De Las Neuronas Retinianas
Splicing alternativo es el principal mecanismo por el cual un número limitado de genes que codifican proteínas puede generar la diversidad del proteoma. Hemos investigado el papel del factor de empalme alternativo Sfrs1, una arginina / serina-rica (SR) miembro de la familia de proteínas, durante el desarrollo del ratón retina. La pérdida de la función Sfrs1 durante el desarrollo embrionario retina tuvo un efecto profundo, dando lugar a una retina pequeños al nacer. Además, la retina se sometieron a una mayor degeneración en el periodo postnatal. La pérdida de la función Sfrs1 resultó en la muerte de neuronas de la retina que nacieron durante la primera mitad de desarrollo embrionario. Las células ganglionares, los fotorreceptores de los conos, células horizontales y células amacrinas se produjeron y se inició la diferenciación. Sin embargo, estas neuronas se le practicó la muerte celular por apoptosis. Por el contrario, Sfrs1 no era necesario para la supervivencia de las neuronas generadas más tarde, como más tarde nacen las células amacrinas, los fotorreceptores de los bastones, células bipolares y células de Müller. Nuestros resultados ponen de manifiesto la exigencia de splicing alternativo Sfrs1 mediada por la supervivencia de neuronas de la retina, con una sensibilidad definida por la ventana de tiempo en el que se generó la neurona.
La Identificación De Genes Que Se Expresan Preferentemente En El Margen De Desarrollo Periférico De La Copa óptica
Especificación de la copa óptica periférica mediante la señalización de Wnt es esencial para la formación del cuerpo ciliar / iris. La identificación de los genes marcadores de esta región durante el desarrollo de un punto de partida para el análisis funcional. En el perfil transcripcional de las células individuales de los ojos en desarrollo, dos células se identificaron los genes expresados que no se encuentran en la mayoría de los otros perfiles de una sola célula. En hibridaciones in situ demostrado que muchos de estos genes se expresan en la copa óptica periférica en ambos ratón y desarrollo temprano de pollo, y en el cuerpo ciliar / iris en las subsiguientes etapas de desarrollo. Estos análisis indican que las dos células probablemente se originó en el desarrollo del cuerpo ciliar / iris. Los cambios en la expresión de estos genes se analizaron en las retinas de embriones de pollo, cuando la señalización de Wnt canónica se activó ectópica por CA-beta-catenina. Doce cuerpo ciliar / iris genes fueron identificados como después de la inducción upregulated, lo que sugiere que son excelentes candidatos para los efectores de señalización Wnt en la copa óptica.
Desarrollo Y Diversificación De La Retina Interneuronas Amacrinas En La Resolución De Los Organismos Unicelulares
La retina de los vertebrados utiliza diversos tipos de células neuronales dispuestas en complejos circuitos neuronales para extraer, procesar y transmitir información de la escena visual a los centros de procesamiento de orden superior del cerebro. Células amacrinas, una clase de interneuronas, se cree que median la mayor parte del procesamiento de la señal visual que se produce dentro de la retina. Aunque las células amacrinas mostrar la diversidad morfológica extensa, la naturaleza molecular de esta diversidad es en gran parte desconocido. Además, no se sabe cómo esta diversidad surge durante el desarrollo. En este sentido, se han combinado en el etiquetado vivo genética, célula única en todo el genoma de perfiles de expresión, y birthdating clásica a (i) identificar los tipos específicos moleculares de las células amacrinas, (ii) demostrar la diversidad molecular de la clase de células amacrinas, y (iii) muestran que la diversidad de células amacrinas surge al menos en parte a través de patrones temporales.
