Translate this page to:
German
In JoVE (1)
Other Publications (2)
Automatic Translation
This translation into German was automatically generated.
English Version | Other Languages
Articles by Joel R. Meyerson in JoVE
JoVE Immunology and Infection
Bestimmung von Molekülstrukturen von HIV Hüllglycoproteine mit Cryo-Elektronen-Tomographie und automatisierte Sub-Tomogramm Averaging
1Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, 2The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, 3National Library of Medicine, National Institutes of Health, 4Massachusetts Institute of Technology, 5William Fremd High School, 6University of Virginia, 7Duke University, 8Yale University, 9University of Notre Dame, 10Washington University in St. Louis, 11Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, 12Thomas Jefferson High School for Science and Technology
Das Protokoll beschreibt eine High-Throughput-Ansatz zur Bestimmung Strukturen von Membranproteinen mittels Kryo-Elektronen-Tomographie und 3D-Bildverarbeitung. Es deckt die Einzelheiten der Probenvorbereitung, Datenerfassung, Datenverarbeitung und-interpretation, und schließt mit der Produktion von einer repräsentativen Ziel für den Ansatz, die HIV-1 Envelope Glykoproteins. Diese Berechnungsverfahren sind in einer Weise, Forscher und Studenten ermöglicht, remote arbeiten und einen Beitrag zur Datenverarbeitung und Statik ausgelegt.
Other articles by Joel R. Meyerson on PubMed
Globale Auswirkungen Der DNA-Replikation Und DNA-Replikation-Ursprung-Aktivität Auf Eukaryotischen Genexpression
Dieser Bericht enthält eine globale Ansicht wie Genexpression durch DNA-Replikation beeinflusst wird. Wir analysierten synchronisierte Kulturen von Saccharomyces Cerevisiae unter Bedingungen, die DNA-Replikation-Einleitung zu verhindern, ohne die Zellzyklusprogression zu verzögern. Wir verwenden eine Singulärwertzerlegung höherer Ordnung zum Integrieren des globale mRNA Ausdrucks in mehreren Kursen Zeit gemessen, erkennen und experimentelle Artefakte zu entfernen und signifikante Kombinationen von Mustern der Ausdrucks-Variation über die Gene, die Zeitpunkte und die Bedingungen zu identifizieren. Wir finden, dass das zunächst etwa 88 % des globalen mRNA Ausdrucks ist unabhängig von der DNA-Replikation. Zweitens ist das Erfordernis der DNA-Replikation für effiziente Histon-Genexpression unabhängig von Bedingungen, die DNA Beschädigung Prüfpunkt Antworten zu entlocken. Drittens sinkt die Herkunft Lizenzierung die Expression von Genen mit Ursprung in der Nähe von ihren 3' enden, offenbart, dass nachgeschaltete Ursprünge den Ausdruck der upstream Gene regulieren können. Dies bestätigt frühere Vorhersagen aus mathematische Modellierung einer globalen kausale Koordinierung zwischen DNA-Replikation-Ursprung-Aktivität und mRNA Ausdruck und zeigt, dass die mathematische Modellierung von DNA Microarray Daten verwendet werden können bisher unbekannte biologische Modi Verordnung vorherzusagen.
Molekulare Architekturen Der Trimere SIV Und HIV-1 Umschlag-Glykoproteine Auf Intakte Viren: Stamm-abhängigen Schwankungen Der Quartären Struktur
Der erste Schritt in deiner Zelle Infektion von Menschen und die eng verwandten Simianes Immundefizienz-Viren (HIV und SIV, beziehungsweise) tritt bei der Bindung von Trimere Umschlag Glykoproteinen (Env), bestehend aus Heterodimere der viralen Transmembran-Glykoprotein (gp41) und Oberflächen-Glykoprotein (gp120) in T-Zellen als Ziel. Wissen über die molekulare Struktur der Trimere Env auf intakte Viren ist wichtig für das Verständnis der molekularen Mechanismen Virus-Zell-Interaktionen sowohl für die Gestaltung der wirksame Immunogen-basierte Impfstoffe zur Bekämpfung von HIV/AIDS. Frühere Analysen der intakten HIV-1 BaL Virionen führten bereits Strukturen der Trimere Env in Unliganded und CD4-liganded Zustände bei ~ 20 Å Auflösung. Hier zeigen wir, dass die molekularen Architekturen der Trimere Env aus SIVmneE11S, SIVmac239 und HIV-1-R3A-Stämme sind eng vergleichbar, die zuvor für HIV-1 BaL, mit der V1 und V2, die Variable Schleifen auf dem Höhepunkt der Spike, nahe an der Kontaktzone zwischen Virus und Zelle gelegen. Die Lage der V1/V2 Schleifen in Trimere Env bestätigte endgültig Strukturanalyse von HIV-1-R3A Virionen konstruiert, ausdrückliche Env mit löschen diese Schleifen. Auffällig ist, ist in der CP-MAC, einem CD4-unabhängigen Stamm SIV, Trimere Env in eine konstitutiv "offen" Konformation mit gp120 Trimere gespreizten heraus in eine Konformation wie man für HIV-1 BaL Env, wenn es mit sCD4 und der CD4i-Antikörper 17b komplexiert ist. Unsere Ergebnisse eine strukturelle Erklärung für die molekularen Mechanismen der CD4-unabhängigen Viren Eintrag vorschlagen und, dass Cryo-Elektron-Tomographie verwendet werden kann, um getrennte, funktionell relevante Quaternäre Strukturen der Env angezeigt auf intakte Viren zu entdecken weiter aufzubauen.
