Translate this page to:
Italian
In JoVE (1)
Other Publications (2)
Automatic Translation
This translation into Italian was automatically generated.
English Version | Other Languages
Articles by Joel R. Meyerson in JoVE
JoVE Immunology and Infection
Determinazione di strutture molecolari di glicoproteine dell'HIV Busta con Cryo-Electron Positron e automatizzato Sub-tomogramma Averaging
1Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, 2The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, 3National Library of Medicine, National Institutes of Health, 4Massachusetts Institute of Technology, 5William Fremd High School, 6University of Virginia, 7Duke University, 8Yale University, 9University of Notre Dame, 10Washington University in St. Louis, 11Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, 12Thomas Jefferson High School for Science and Technology
Il protocollo descrive un approccio high-throughput per determinare le strutture di proteine di membrana con crio-elettroni tomografia ed elaborazione delle immagini 3D. Esso copre i dettagli della preparazione dei campioni, raccolta, elaborazione e interpretazione dei dati, e si conclude con la produzione di un bersaglio rappresentante per l'approccio, l'HIV-1 glicoproteina Busta. Queste procedure di calcolo sono stati progettati in un modo che consente ai ricercatori e agli studenti di lavorare in remoto e contribuire alla elaborazione dei dati e l'analisi strutturale.
Other articles by Joel R. Meyerson on PubMed
Effetti Globali Della Replicazione Del DNA E La DNA Replica Origine Attività Sull'espressione Genica Negli Eucarioti
Questo rapporto fornisce una visione globale di come espressione del gene è influenzato dalla replicazione del DNA. Abbiamo analizzato sincronizzati colture di Saccharomyces cerevisiae in condizioni che impediscono l'avvio di replicazione del DNA senza ritardare la progressione del ciclo cellulare. Usiamo una decomposizione a valori singolari di ordine superiore per integrare l'espressione del mRNA globale misurata nei corsi più tempo, individuare e rimuovere gli artefatti sperimentali e identificare le combinazioni significative di variabilità di espressione attraverso i geni, punti temporali e condizioni. Troviamo che, in primo luogo, circa l'88% dell'espressione di mRNA globale è indipendente della replicazione del DNA. In secondo luogo, il requisito della replica del DNA per l'espressione del gene dell'istone efficiente è indipendente da condizioni che suscitano risposte di checkpoint danni del DNA. In terzo luogo, origine licenze diminuisce l'espressione di geni con origini vicino a loro 3' estremità, rivelando che origini a valle possono regolare l'espressione dei geni a monte. Questo conferma le previsioni precedenti di modellazione matematica di un coordinamento globale causale tra attività di origine replica del DNA e l'espressione del mRNA e mostra che mathematical modeling di DNA microarray dati possono essere utilizzati per predire correttamente modalità biologiche precedentemente sconosciuti del regolamento.
Architetture Molecolari Di Glicoproteine Busta Trimeric SIV E HIV-1 Su Virus Intatto: Ceppo-dipendente Dalla Variazione Nella Struttura Quaternaria
Il passo iniziale per infezione delle cellule bersaglio da umani e il virus dell'immunodeficienza delle scimmie strettamente correlate (HIV e SIV, rispettivamente) si verifica con l'associazione di glicoproteine busta trimeric (Env), composto da eterodimeri della glicoproteina transmembrana virale (gp41) e superficie glicoproteina (gp120) a bersaglio le cellule T. Conoscenza della struttura molecolare di Env trimeric su virus intatto è importante per comprendere i meccanismi molecolari sottostanti le interazioni virus-cellula e per la progettazione di vaccini basati su immunogen efficaci combattere l'HIV/AIDS. Analisi precedenti di virioni di HIV-1 BaL intatte già hanno portato a strutture di Env trimeric in unliganded e CD4-liganded afferma a risoluzione Å ~ 20. Qui, ci mostra che le architetture molecolari di Env trimeric da SIVmneE11S, SIVmac239 e l'HIV-1 R3A ceppi sono strettamente paragonabili a quella determinata in precedenza per BaL di HIV-1, con la V1 e V2 cicli variabile si trovano all'apice del picco, vicino alla zona di contatto tra virus e cellula. La posizione delle anse V1/V2 in Env trimeric fu definitivamente confermata dall'analisi strutturale dei virioni di HIV-1 R3A ingegnerizzato di Env espressa con eliminazione di questi cicli. Sorprendentemente, in SIV CP-MAC, un ceppo di CD4-indipendente, Env trimeric è in una conformazione costitutivamente "aperta" con gp120 trimeri strombate in una conformazione simile a quello visto per Env di HIV-1 BaL quando è complessato con sCD4 e il CD4i anticorpo 17b. I nostri risultati suggeriscono una spiegazione strutturale per il meccanismo molecolare di entrata virale CD4-indipendente e ulteriormente stabilire che tomografia del cryo-elettrone può essere utilizzata per scoprire distinte, funzionalmente rilevanti strutture quaternarie di Env visualizzati su virus intatto.
