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Articles by Judy E. Kim in JoVE
JoVE Bioengineering
荧光光谱法测定膜蛋白质折叠的热力学
Chemistry and Biochemistry, University of California San Diego - UCSD
此视频文章详细介绍了实验过程中色氨酸荧光膜蛋白质折叠吉布斯自由能获得。
Other articles by Judy E. Kim on PubMed
时间分辨共振拉曼分析的发色团形成的结构变化和腐烂的视紫红质的 BSI 中间。
时间分辨共振拉曼微芯片流实验执行获得振动谱的视紫红质的 BSI 中间发色团，并探讨了 bathorhodopsin BSI 的结构变化和 BSI 向 lumirhodopsin 的过渡。动力学的拉曼光谱，从 250 到 3 micro ns 标识 BSI 振动的主要特征。BSI 展品在 886 和 945 cm(-1) 分配给 C (14) H 和 C (11) (12) H = C H A(u) 摇动，分别的比较紧张的箍模式。这一结果表明 bathorhodopsin 到 BSI 转型高度紧张的全反式发色团在 C(10)-C(11)=C(12)-C(13) 地区，放松了，但仍扭曲的 C(14) 附近。11,12 A(u) 箍模式相比，lumirhodopsin 和 metarhodopsin 我指示 11 H 和 12 H 的弱耦合的 BSI 的低频摇由于 BSI C(11)=C(12) 附近的发色团的残余变形。1653 Cm(-1) 上的 C=NH(+) 在 BSI 拉伸模式展品 23 cm(-1)，暗示有席夫基反离子区域转型到 BSI bathorhodopsin 中没有重大结构性重组诱导正常 deuteriation 放缓。但是，席夫碱基地环境发生了巨大变化发生的 BSI 向 lumirhodopsin 的过渡期，因为 1638 cm(-1) C=NH(+) 在 lumirhodopsin 中的拉伸模式是异常低并转移 D (2) O，这表明它已基本上没有 H 粘接承兑人中的只有 7 cm(-1)。有了这些数据我们可以第一次比较和讨论室温共振拉曼振动结构的所有关键的中间体，在视觉励磁。
在受感染的巩膜扣眼底荧光造影的结果。
本报告介绍了眼底荧光造影 (FA) 结果患者巩膜扣带术感染。十天后巩膜，表现出 FA 扩张脉络膜血管对与荧光素渗漏扣到视网膜下的空间。不规则弥漫性巩膜增稠指出关于计算机断层扫描 (CT)。焦性扩张漏脉络膜血管 FA 或弥漫性巩膜增厚的 CT 表现上看到的结果可能会帮助建立巩膜扣带术感染的诊断。
胡萝卜素 Probed 皮秒斯托克斯和反斯托克斯共振拉曼光谱中的振动松弛。
皮秒时间分辨斯托克斯和反斯托克斯共振拉曼光谱研究所有跨胡萝卜素获取并分析揭示动态的激发态 （S(1)) 人口和衰变，以及基态振动弛豫。时间分辨斯托克斯光谱显示地面状态复苏 12.6 ps 时间常数，与观察到的独特的 S(1) 斯托克斯乐队腐烂。反斯托克斯光谱表现出没有归因到 S(1) (2A(g) (-)） 的状态，该值指示在 S(1) 中的振动弛豫必须接近完成内 2 ps 的高峰。Photoexcitation 是 anti-Stokes 散射振动而兴奋通过内部转换的地面状态模式的大量增加。反斯托克斯数据适合运动的方案，其中 C = C 模式放松了 0.7 ps 中，C C 模式放松了在 5.4 ps 和 C-CH(3) 模式放松了 12.1 ps 中。这些结果都符合 S(1)-S(0) 内部转换，其中 C = C 模式是主受体模型、 C C 模式是次要的承兑人和 C-CH(3) 模式兴奋通过分子内的振动能量的再分配。
反斯托克斯拉曼的振动冷却动力学中的视紫红质的主光化学研究。
斯托克斯皮秒和 anti-Stokes 拉曼光谱用来探测结构动力学和无功电能流动在主独联体反式异构化反应中的视紫红质。外观特征 ethylenic，氢出的平面 (卡箍) 和低波数 photoproduct 波段拉曼光谱中的是仪器反应有限，与亚皮秒产品外观的时间相一致。激烈的高、 低频率反斯托克斯山峰证明全反式 photoproduct 基态表面热振动产生。具体地说，在 282、 350 和 477 cm(-1) 低频模式都高度振动 (T > 2000 K) 紧随其后异构化，揭示这些低频运动直接参与反应曲线交叉进程。反斯托克斯模式的特点是正值到 bathorhodopsin 的 photorhodopsin 转换的约 2.5 ps 时间衰变。这种对应关系显示照片向 batho 的过渡是一个地面状态冷却过程和能量存储在主视觉 photoproduct 是皮秒时间刻度上完成。最后，独特的斯托克斯振动在 290、 992、 1254年、 1290、 1569年观察到所产生的视紫红质的兴奋状态的 cm(-1) 只能在 0 ps 延迟。
分析的特定模式的激发态能量分布和波长依赖单键量子产量的视紫红质。
单键量子产量的视紫红质是波长依赖： phi(lambda) 波长达 5%减至 500 的红 nm 但是不变的 (phi = 0.65 + /-0.01) 之间 450 和 500 nm (Kim et al，2001年)。若要了解此叙述内部转换过程，这些结果被相比动态曲线过境蓝兔稳压模型的预测。完全 thermalized 总和超过态振动计算的定义是过剩光子能量的视紫红质 28 Franck Condon 积极振动模式中的初始的分发。这种计算表明，吸收的高频率不活跃的惰性模式 （例如，C [双键] C 拉伸) 随着激发波长转向从 570 450 nm 而相对较少的能源存入无功低频率模式。这一结果从质的方面解释 phi(lambda) 的视紫红质的实验观测的波长依赖，并揭示了异地、 扭模式无功途径中的重要性。
皮秒时间分辨紫外共振拉曼光谱的视紫红质耦合的 G-蛋白受体活化的动态变化。
对视网膜的发色团异构化的视色素视紫红质蛋白反应是使用皮秒时间分辨紫外共振拉曼光谱研究的。高信号到噪声拉曼光谱获得使用提供 1 kHz 钛宝石激光仪 < 可见 3 ps (466 nm） 泵和 UV (233 nm） 探测脉冲。当泵和探针事件之间有没有时间延迟时，色氨酸模式 W18、 W16 和 W3 表现出下降的拉曼散射强度。次长泵探头 + 5 和 + 20 ps，色氨酸 （W1、 W16、 W3、 W18) 和酪氨酸 (Y1 + 2xY16a，Y7a，Y8a) 延迟峰值强度下降达 3%。这些强度变化归因于在附近至少一个色氨酸微环境中减少疏水性和可能产生的一个酪氨酸残留削弱后独联体反式异构化的发色团的 β-紫罗兰酮环与互动。晶体结构的研究表明 W265 和 Y268 负责这些信号。这些紫外拉曼光谱变化，这些观察到的视紫红质-到-元转型，这意味着小学过渡冲动驱动蛋白议案由 isomerizing 发色团期间 200 fs 驱动器关键的结构性改变，导致蛋白激活几乎相同。
在折叠和展开状态的锌-细胞色素 C 的锌卟啉溶剂。
后使用光化学触发器和血红素金属替代来探测细胞色素 c 的折叠动力学简要回顾，我们提出了新光物理与光化学折叠和展开国家取代锌蛋白 (锌市长运通 c) 的结果。我们的锌市长运通 c 三线态状态衰减动力学的测量揭示生存期的系统同位素效应： 折叠蛋白 (tau(H)2(O) 约 10 ms) 衰变只温和受惰性取代缓冲区 (k(H)2(O)/k(D)2(O) = 1.2），而减少三线态寿命 (约 1.3 ms) 及更大的同位素效应 (1.4) 被发现为化学变性充分展现蛋白。最短生存期 (0.1-0.4 ms) 和最大的同位素效应 （1.5） 被发现为充分暴露模型复合、 锌-取代 N-乙酰-微过氧化物酶-8 （ZnAcMP8），这意味着未折叠的蛋白锌卟啉组即使在完全变性的条件下提供了一些保护。展开锌市长运通 c 局部结构的进一步证据来自于双分子淬火实验使用 Ru(NH(3))(6)(3+) 作为外部的锌卟啉三线态状态淬火。淬火、 部分未折叠的蛋白在中点胍盐氯化 (GdmCl) 和尿素浓度展品双相三线态衰减动力学、 快速组件对应扩展、 溶剂暴露状态 (6.6 x 10(8) M(-1) s(-1) GdmCl 中的，在尿素 6.3 x 10(8) M(-1) s(-1)) 和慢部分归因于紧凑，相对访问溶剂，状态 (x 10(7) M(-1) s(-1) GdmCl 在 5.9 面前尿素中的 10(6) M(-1) s(-1) x 8.6）。契约国家在两个变性剂锌卟啉溶剂的变化揭示了部分未折叠蛋白辅酶尿素溶液中更好的保护。
吲哚菁绿染料增强隐匿新增年龄相关性黄斑变性脉络膜新生血管治疗经瞳孔温热疗法。
吲哚菁绿 (ICG) 染料增强 (TTT +) 经瞳孔温热疗法 (TTT) TTT 仅作了比较安全和作为隐匿新增年龄相关性黄斑变性脉络膜新生血管治疗的有效性。
探测折叠和展开国家外膜蛋白的稳定状态和时间分辨色氨酸荧光。
稳定状态和时间分辨荧光测量每五个本机色氨酸残留在全长和截断变种大肠杆菌外膜蛋白 (OmpA) 已在折叠和变性的国家。色氨酸单线态激发态寿命是 multiexponential 和残留物也会有所不同。此外，激发态寿命大幅增加陪 OmpA 折叠，具有较长的生存期比在磷脂双层胶束中。这一发现表明 OmpA 的跨国激进党环境折叠胶束中和磷脂双层都不同。跨国激进党荧光衰减动力学与全长 OmpA 测量折叠在溴化脂囊泡揭示 W102 是烃类核心，从最远的荧光，而 W7 是最接近。稳定状态和时间分辨偏振的荧光测量表明减少跨国激进党流动时当蛋白质折叠的双层 OmpA 折叠胶束，和更低的流动性。荧光性能的截断 OmpA，从中删除可溶性周质域，只是小幅有所不同的全长形式，表明在这些条件下的两种形式类似折叠式的结构。
多肽插入、 定位和膜稳定： 从所有原子分子动力学模拟的洞察力。
肽插入、 定位和模型膜的稳定，通过所有原子分子动力学 (MD) 模拟探测。在每个单张的溶解 dimyristoylglycero-3-磷酸 （DMPC） 膜模拟一个肽 (WL5)。内第一次的 5 ns，肽自发地插入膜，然后稳定期间剩余 70 ns 仿真时间。在该两份单张，至膜界面，本地化的多肽和此本地化归因于肽脂质氢键的形成。我们显示在每个肽单色氨酸残留大大有助于这些氢键 ；具体而言，氮杂原子的吲哚环发挥着关键的作用。相对于正常的上限和下限单张膜的吲哚环的倾斜角度分别是大约 26 度和 54 度。整个肽链的倾斜角度是 62 度和 74 度。膜诱导肽的构象所特有的 β-表和肽增强脂质膜中的排序。最后，在膜平面肽的扩散率计算 （基于实验肽浓度） 是大约 6 A 2/ns，从而表明 500 ns 分子间相互作用的时间刻度。
ISIS-二甲醚： 前瞻性、 随机、 剂量升级玻璃体腔内注射类固醇治疗难治性糖尿病黄斑水肿的研究。
： 为确定难治性临床意义糖尿病黄斑水肿 (DME) 玻璃体腔注射曲安奈德 (IVTA) 的安全性和有效性。
紫外共振拉曼光谱研究积分膜蛋白折叠和展开的国家。
振动结构的本机锚固色氨酸 （Trp） 和酪氨酸残留的一体式膜蛋白、 细菌外膜蛋白 (OmpA)，有第一次使用紫外共振拉曼 (UVRR) 进行调查。本机 OmpA、 单 Trp 突变体和跨国激进党少突变谱录在折叠和展开的国家，和揭示色氨酸结构和当地环境的重大变化。突出改建后折叠包括氢键结合特性的吲哚 N1H，明证 shift W17 频率从 874 和 878 cm(-1)，以及增长在疏水性地方色氨酸环境，支持 I1361/I1340 的比率增加的损失。是一个单一的色氨酸残留物这些特定于站点的变化，其余的本机色氨酸和酪氨酸氨基酸的振动结构改造也是明显。最后，这里介绍的 UVRR 数据表明 OmpA 囊泡中折叠和洗涤剂中折叠的结构可能不同，并为正在进行的膜蛋白质折叠的研究提供重要的基础。
标志着胚胎干细胞与 2A Self-cleaving 肽： NKX2-5 翡翠的绿色荧光蛋白 BAC 记者。
荧光记者都可用于测定在活细胞中的基因表达和标识和隔离纯的细胞群体从异质文化，包括 (ES) 胚胎干细胞。存在多个荧光和遗传选择标记 ；但是，创建维护基因本机 ATG 起始站点附近的调控序列的记者构造的系统尚未广泛可用。
热力学的肽插入和聚集的脂质双层。
生物分子的各种调解生理过程的插入和细胞膜，在重组和热力学的部队负责其分区很感兴趣。最近的实验与个别氨基酸从水膜与转让相关的免费能源变化提供了宝贵数据。但是，完整的路径和能量的一种膜肽插入相关的变化图仍然是可望而不可及。为此目的，计算技术补充实验数据与原子级别的详细信息，并阐明 balls 插入。在这里，我们采用了该项技术总 850 伞采样的 ns 的所有原子分子动力学模拟研究的自由能源配置文件和色氨酸和五个 leucines (WL5) 组成的模型 hexapeptide 插入的途径。肽的计算的自由能源配置文件传送时从批量溶剂通过膜核心展品两个极小值： 在水膜界面或头区域和全球最低疏水亲水界面该脂甘油区域局部最小。在膜核心的、 增强的灵活性肽深深插入时的解释是存在相当小的屏障的大约 1 千卡 mol (-1)。我们与那些在文献中结合我们的研究结果，目前肽插入和聚合涉及肽聚合膜的溶剂脂头基接口接触的热力学模型。
一项随机临床试验比较玻璃体腔曲安奈德和焦/网格凝治疗糖尿病性黄斑水肿： 基准特征。
内年龄和种族子群这糖尿病视网膜病变临床研究网络临床试验的参与者之间比较基准人口、 系统性，和眼的特征，并比较此队列与其他同党入学阶段 3 临床试验治疗糖尿病视网膜病变。
色氨酸微环境、 可溶性域和囊泡的影响大小的膜蛋白质折叠的热力学： 跨膜蛋白 OmpA 的经验教训。
复性曲线积分膜蛋白外膜蛋白 (OmpA) 被测量，以确定此模型系统的膜蛋白质折叠的构象稳定性。野生型 OmpA 展品展开 （DeltaG 度 H2O） 10.5 千卡/mol.突变，含 7、 15、 57、 102、 或 143，本机阵地的单一色氨酸残基的自由能源分别比野生型 OmpA，DeltaG 度 H2O 值 6.7、 4.8、 2.4、 4.7、 和 2.8 千卡/摩尔，与不稳定。这里观察到的趋势被讨论非共价相互作用，包括芳香的交互与氢键。可溶性尾影响的跨膜域 OmpA 的构象稳定性通过截的单 Trp 突变体 ； 还进行调查四个五个截断突变体 DeltaG H2O 度值是由更大 > 2.7 千卡/摩尔与全长版本，这表明可溶性域的缺席可能会破坏稳定展开跨膜域。最后，进行了动态光散射试验来衡量对囊泡大小与稳定尿素和蛋白质的影响。尿素浓度大于 1 米导致囊泡大小的增加，这些直径下蛋白不变。这些动态光散射结果补充荧光研究和阐释囊泡大小对蛋白质构象稳定性的重要作用。
Förster 共振能量转移和蛋白质构象稳定性： 先进的生物物理模块的物理化学学生。
蛋白质折叠是研究的爆炸的生物物理和物理化学领域。在这里，我们将介绍几种技术，包括吸收分光光度法、 荧光光谱和 Förster 共振能量转移 （音品） 测量，来探测中蛋白质折叠的重要主题的一体化。细胞色素 c 用作一种模型的蛋白质 ；构象稳定性 (ΔGH2O∘) 比较两个化学变性剂、 尿素、 胍盐盐酸，通过测量说明中蛋白质折叠和分子间相互作用的重要概念。此外，根据音品对跨国激进党-59 intraprotein 距离的确定和展开国家的细胞色素 c 的血红素组突出显示展开条件下的蛋白质结构的演变。这些结果的分析与探讨提供模型的蛋白质折叠同时提高学生的技能与光学技术的深入了解的机会。集体，结合光学光谱技术、 严格的量化分析和生物物理重点说明了越来越多路口、 化学、 生物学和物理学的基本研究的意义。
表型异质性和病变大小测量 Stargardt 黄斑营养不良。
Stargardt 黄斑营养不良已用于眼底荧光和眼底 flavimaculatus 更好地了解疾病现状及进展。眼底荧光图像描绘伟大的清晰度和高对比度的萎缩性区域。作者调查是否眼底荧光图像揭示比彩色眼底照片更多萎缩的研究表明一种异构眼底的外观的长期病的三个兄弟姐妹的家庭。关于眼底荧光的研究结果被相比彩色眼底照片和荧光图像。此外分析了光学相干断层扫描图像。被测量和眼底荧光和彩色眼底照片上相比领域萎缩性病变。自体荧光图像颜色眼底照片更清晰地划定萎缩性区域。但是，测量的领域只是萎缩的稍大一点的彩色眼底照片比眼底荧光图像中的。光学相干断层扫描图像显示严重外视网膜萎缩和凹轮廓的损失。
氢键和溶剂极性标记中的紫外共振拉曼光谱的色氨酸： 膜蛋白中的应用。
色氨酸中各种溶剂和模型多肽化合物的紫外共振拉曼 (UVRR) 光谱被提交并揭示反映溶剂极性、 氢键强度和阳离子 pi 相互作用的系统更改。通常利用的 UVRR 光谱一直基于非共振拉曼数据，色氨酸费米双重比率 I1360/I1340 的环境极性标记表现出不同的值在上-和非共振拉曼光谱以及不同色氨酸衍生物。具体而言，吲哚的 UVRR 费米双重比率范围从在极性溶剂中 0.3 到 0.8 在非极性溶剂，而各自的值在这里报告和以前的非共振拉曼光谱是 0.5-1.3。更多生物相关分子、 N-乙酰色氨酸乙酯 (NATEE) 的 UVRR 费米双重比率较小范围内的 1.1 （极性溶剂） 到 1.7 (非极性溶剂） 和溶剂极性/极化参数 pi * 和 ETN 相关的。如以前报告几个 UVRR 模式也是敏感的氢键强度的吲哚 N-H 结构的。在这里，我们报告新的明确标记为 H 粘接： 微粉 W10 (约 1237年厘米-1) 强度的 W9 （约 1254年厘米-1) 模式 (RW10) 的比率。这一比率是缺席的氢键受众为 NATEE 0.7 和增加到 3.1 强氢键受众，值为 2.3 中水的存在。W8 和 W17 模式转移超过 + 10 和约-5 厘米-1 后增加的氢键强度 ；W17 此范围较以前报告，反映了蛋白质和肽的解决方案更切合实际的范围。最后，我们的数据中存在阳离子 pi 相互作用下 W18 和 W16 相对强度提供变化的证据。UVRR 这些标记被用来解释光谱的模型膜绑定系统色氨酸辛酯和肽毒素蜂。这些谱揭示内部和可能影响分区关联膜脂双层或缔可溶性低聚物生物分子的分子间氢粘接和阳离子 pi 相互作用的重要性。这里介绍的 UVRR 分析修改和补充了以前的报告，并提供可以适用于阐明分子微环境的光谱决策者明确套和各种各样的复杂系统，包括锚定色氨酸残留在细胞膜蛋白与多肽的结构。
荧光和紫外共振拉曼光谱研究人类 Ll-37 和其 F6W 和 F17W 突变体肽囊泡相互作用。
LL 37 是广谱的人类抗菌肽 cathelicidin 家庭中。形式的最小抑制浓度和囊泡泄漏效价测定表明单-色氨酸突变，F6W 和 F17W，那样可以有效地杀死细菌和扰乱膜作为本机、 无色氨酸的 LL 37 肽。稳态荧光和紫外共振拉曼光谱研究 F6W 和 F17W 揭示这些色氨酸残留分子机制的细节。当地环境极性，氢键强度的吲哚 N-H 和旋转自由下降 F6W 和 F17W 相对于碳酸离子存在下的纯蒸馏水 ；这些结果都符合疏水区域的阿尔法螺旋 LL 37 碳酸离子存在下诱导的寡聚核中埋葬。F6W 和 F17W 的碳酸盐诱导 α 螺旋形式的光谱性能差异反映一个地方赖氨酸 F6W 使 F6W 的微环境比 F17W 更极地附近残留物的存在。下脂囊泡突变体经过环境极性、 氢键强度和旋转自由的额外损失。利用溴化的血脂的淬火实验显示这两个突变体中的色氨酸残留量基本上圆心等距的双层溴元素更接近到双层中心，在 9,10 的立场，比这些更接近于 headgroups (6,7 职位) 更有效地抑制荧光。这些结果支持细胞膜破坏由 LL 37 carpeting 或环形孔机制，并证明色氨酸突变体和敏感的光谱工具的组合可提供线索抗菌行动的重要分子。
微生物谱的分离 Explanted 巩膜扣的有机体。
巩膜扣带术去除是出于各种原因执行常见程序。Explanted 巩膜扣上微生物的信息仍然有限。文章作者发现巩膜扣带术去除 18 年期间的 37 例。细菌培养分离 4 9 例 (44%) 临床感染的生物。确定的生物体包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、 铜绿假单胞菌、 脓肿分枝杆菌、 凝固酶阴性葡萄球菌物种。细菌培养分离生物 3 无临床感染 11 例 (27%)。确定的生物体包括物种红色诺卡氏菌、 产碱 xylosoxidans 和非结核性分支杆菌。巩膜扣出现临床感染可能更为恶毒的有机体和查明机体更多的机会与相关联。细菌培养可能取消后巩膜扣的值。
（他的） 的共振拉曼研究的 MitoNEET （Cys） 3 2Fe-2S 群集： 比较 （Cys） 4 突变和所涉问题的不耐热金属中心对 Ph 值的影响。
MitoNEET 是一种 2Fe-2S 线粒体外膜蛋白，最初发现为靶点的抗糖尿病药物。它展示新型蛋白质的折叠，并与其他 2Fe-2S Rieske 蛋白质和铁氧还蛋白等蛋白质，在 mitoNEET homodimer 的金属簇合物每协调由一组氨酸残留和三个半胱氨酸残留。2Fe-2S 结构与相互作用的结扎 His87 残留是特别重要的意义，因为先前的研究显示更换与胱抑素 H87C 突变体稳定释放对群集。在这里，我们报告的共振拉曼光谱研究此自然发生的 Fe(2)S(2)(His)(Cys)(3) 蛋白以评估当地的结构变化与群集不相关联。其铁氧还蛋白样 H87C 突变体 mitoNEET 的比较表明拉曼峰在大约 250-300 cm(-1) mitoNEET 的区域受到 Fe His87 结构。系统 pH 依赖型共振拉曼光谱区域内的本机 mitoNEET 但不是 H87C 突变体在观察到的光谱变化。大约 250-300 cm(-1) 区域的本机 mitoNEET 也是敏感的磷酸盐缓冲。因此，影响群集释放的条件所示同时影响的共振拉曼光谱地区与 Fe--他的贡献。这些结果支持 Fe-N(His87) 的相互作用在生理 ph 值范围内，调制和此调制可能是至关重要的 mitoNEET 函数的假说。
遗传和临床评价的少年劈裂。
少年劈是罕见的视网膜色素变性，如果将 RS1 基因突变引起的。(1) 临床考试及分子检测明确诊断 2 男婴儿，其中一人有一种新的突变，以前未报告在美国少年劈裂。基因检测可能的最简单的方法，以确认此婴儿的诊断。
结膜 20 轨玻璃体使用单个条目空心无缝线系统。
玻璃体切除 20 轨结膜空心无缝线 (TCS) 系统具有较小仪玻璃体切割系统的优势与经济优势，因为不需要购买任何额外的手持仪器相结合的潜力。然而，sclerotomy 大小是大得多，自封 sclerotomies 可能会更难构造。因此，我们计算需要 sclerotomy 执行 20 轨 TCS 玻璃体切割术后缝合。
激进阿苏林突变体稳定色氨酸的共振拉曼表征。
色氨酸基调解生物电子转移和催化过程中的重要作用。在这里，我们聘请可见和紫外共振拉曼、 EPR 和吸收谱以及 ph 值/同位素研究和计算来探测中立的闭壳色氨酸和改性阿苏林蛋白氧化的对口激进。比较激进和闭壳物种的拉曼光谱与振动分析相结合的共振揭示了两个色氨酸物种之间的重要结构差异。我们通过实验观察吡咯环的基债券订单大幅度减少 208 cm(-1) 挡的 W3 模式 （主要是 C(2)-C(3) 拉伸） 可见一斑。后天在酸性 ph 值和氘化缓冲区中的谱分析突出了基的那些敏感的氢键结合环境的振动模式。45 Cm(-1) 挡的吲哚氮位移模式 (W17) 造成的氘化的缓冲区的最大的变化。我们谱提供证据的激进的物种是强氢键承兑人，特别是在酸性环境中。此外，为根治此色氨酸 pK(a) 必须小于 4.0，其中低于先前报告值的 l-色氨酸水溶液中。激进的色氨酸的正常模式分配帮助其当地的环境、 构象、 氢键结合和蛋白质内的质子化状态的特点。
三年的随机对照研究焦/网格凝和玻璃体腔注射曲安奈德治疗糖尿病性黄斑水肿的后续行动。
报告参与评价焦/网格光凝治疗糖尿病性黄斑水肿的治疗相比无防腐剂的玻璃体腔曲安奈德 1 毫克、 4 毫克剂量对照病人 3 年成果。
由来自普通居民的皮肤表皮葡萄球菌酚可溶性 Modulins 提供选择性的抗菌作用。
抗菌肽作为第一线的先天免疫防御入侵生物，如细菌和病毒。在此研究中，我们假设多肽生产人体皮肤，葡萄球菌正常微生物驻地的表皮、 可能还充当抗菌屏蔽和表皮界面正常防御作出贡献。我们通过显示圆二色性和色氨酸谱这酚可溶性 modulins （接入） 伽马和三角洲由 S.表皮有 α 螺旋的字符和类似于哺乳动物安培等 LL 37 强脂质膜相互作用。这两种接入直接诱导脂囊泡泄漏和施加侵害皮肤的病原体如金黄色葡萄球菌的选择性抗菌作用。接入功能同对方和 LL-37 以加强抗菌的行动。此外，通信异常减少组 A 链球菌 (气) 但 S.鼠标皮肤表皮的生存不是。因此，这些数据表明生产 PSMgamma 和 PSMdelta S.表皮的可以通过选择性地抑制皮肤病原体的同时保持正常皮肤微生物的生存受益皮肤免疫防御。
葡萄球菌葡萄球菌抗菌三角-毒素 (酚可溶性 Modulin-伽马) 与主机抗菌肽要杀组 A 链球菌进行合作。
抗菌肽对病原体在宿主防御中发挥了重要作用。最近，酚可溶性 modulins （接入） 从表皮葡萄球菌 (S.表皮) 是表明与脂质膜进行交互、 形成配合物，并发挥抗菌活性。丰度和无毒皮肤驻地 S.表皮的基础，我们假设其接入贡献主机防御。在这里我们展示 S.表皮三角洲-毒素 (PSMgamma) 是通常会出现在表皮和人烟使用免疫组化的人类皮肤的真皮层。合成三角洲毒素交互中性粒细胞胞外陷阱 (网)，同时也诱导净形成的中性粒细胞与 cathelicidin colocalized。抗菌检测对组 A 链球菌 （气），在三角洲毒素合作与抽筋、 hBD2、 hBD3。全血加法的三角洲毒素施加对天然气、 抑菌效果和渔网，三角洲毒素增加他们对这种病菌的杀伤能力。Coimmunoprecipitation 和色氨酸光谱表明直接绑定的三角洲毒素对主机抗菌肽 LL 37、 抽筋、 hBD2、 hBD3。最后，在伤口的小鼠模型中，气生存减少 （以及按揭保险计划 2 细胞因子水平） 时伤了预处理三角洲毒素。因此，这些数据表明 S.源性表皮三角洲毒素同主机派生抗菌肽在先天的免疫系统，以减少重要的人类细菌病原体的生存。
阿苏林域色氨酸基光谱比较： 当地的环境和结构的影响。
色氨酸基在调解生物电子转移的重要作用。我们报告王正激进的长寿、 中立的色氨酸 (Az48W *) 从本机残留色氨酸-48 中的阿苏林疏水核心。光吸收、 电子顺磁共振和共振拉曼光谱强烈支持的中性基形成和数据均符合色氨酸和碱式中心之间的直接电子转移。光谱的长寿命的 Az48W * 物种与那些以前学过、 溶剂暴露基 108 位置来标识对当地环境敏感的色氨酸基的签名进行比较。Az48W * 吸收极非极性环境中显示大约 23 nm hypsochromic shift 键。大多数的共振拉曼频率由大约 7 cm(-1) 溶剂暴露的激进，和大变化小段中强度得到遵守的几种模式。共振拉曼励磁的配置文件以及 Az48W * 展览不同 maxima 吸收信封内。电子顺磁共振波谱分析产量造成的超精细耦合 ； 部分解析线谱埋地和溶剂暴露基耦合常数之间的差异主要是由结构的变化引起的。电子、 振动，和磁共振波谱的见解基本加深我们的蛋白质环境对自由基性能的影响。阿苏林和大约 5 x 10(6) s(-1)，去质子化率范围内的质子传递途径的假说被提出。
标准护理 Vs 糖皮质激素的视网膜静脉阻塞 (得分) 立体彩色眼底照片和眼底荧光造影评价体系的研究： 成绩研究报告 9。
若要描述的程序和可重复性的分级立体彩色眼底照片和眼底荧光造影的评分研究的参与者。
膜蛋白折叠中的色氨酸脂质相互作用的紫外共振拉曼和荧光光谱探测。
芳香族氨基酸的膜蛋白丰富脂质水界面。色氨酸对折叠的作用和稳定性的一种不可或缺的膜蛋白与紫外共振拉曼和荧光光谱进行调查。我们调查模型系统，β 桶外膜蛋白 (OmpA)，并侧重于界面色氨酸残留面向脂质双层 （跨国激进党-7、 跨国激进党-170 或跨国激进党-15） 或内部的 β 桶孔 （跨国激进党-102)。OmpA 突变体 (跨国激进党-170) 外来位置 170 单个色氨酸残留或本机位置 7 （跨国激进党-7) 表现出最大的稳定性，吉布斯自由能的展现在变性的 9.4 和 6.7 千卡/摩尔，没有分别。这些突变体是比无色氨酸的 OmpA 突变，其中展品逐渐显露的 2.6 千卡/mol.紫外共振拉曼光谱的跨国激进党-170 和跨国激进党-7 折叠反应，证明由氢键和疏水性标记系统转变过程揭示的氢键在非极性环境中演变的自由能源更加稳定。这些意见表明氢键承兑是脂质酰基羰基组，这种相互作用大大有助于膜蛋白稳定。其他的光谱变化，会遵守位置 15，色氨酸残留和这些修改都归于是 intraprotein 氢键比更多稳定的色氨酸脂质阳离子-π 相互作用的发展由 ∼2 千卡/摩尔。如所料，没有任何证据为面向内部的 β 桶孔隙的色氨酸残留的脂蛋白相互作用。这些结果突出显示脂蛋白相互作用的意义，并指示双层提供了更多比一个膜蛋白质折叠的疏水性环境。相反，必须通过辅助脂质膜蛋白质折叠和稳定的一个范例。
色氨酸基揭示的 EPR 700 Ghz 的氢键结合。
氧化还原活性 tryptophans 是重要的生物电子转移及氧化还原生物化学。蛋白质可以调整色氨酸通过质子化状态和氢键强度的控制电子转移反应动力学和氧化还原电位。我们研究两个中立的色氨酸基 (溶剂暴露表面上的 Trp108 和 Trp48 埋在疏水核心） 阿苏林两种变体的本地环境。超高层字段 EPR 谱在 700 GHz 和 25 T 允许彻底解决所有 g 张量两种自由基的主要组件和揭示了 g 张量各向异性的重大差异。(2) H 珥光谱和辅助 DFT 计算的光谱显示 g 张量各向异性是直接诊断的存在或缺乏，以及对吲哚氮氢键的强度。方法是一个十分有力的标识和描述是非常重要的色氨酸辅助电子转移的规管和蛋白质中的色氨酸介导氧化还原化学的氢键。
Förster 共振能量转移探针的膜蛋白质折叠。
Förster 共振能量转移 （音品） 实验探测的 β 桶膜蛋白外, 膜蛋白 (OmpA)，折叠式反应。OmpA 的四个突变是处于对蛋白质折叠事件期间跨双层和蛋白孔隙报告的距离演变的各个地点的捐助荧光、 色氨酸与受体分子，一种萘衍生物，生成的。音品效率的分析揭示出三级结构更改关联插入和折叠成合成双层三个的尺度。在初始阶段的插入，其次是双层遍历窄孔形式。最后，长期的组件归因于平衡和放松，并可能涉及全球变化例如毛孔扩张和钢绞线延长。这些结果增加现有模型描述一致的插入和折叠事件，并突出显示的烦恼能力提供洞察的膜蛋白质折叠的复杂机制。这篇文章是一个特别的问题，题为的一部分： 膜蛋白质结构和功能。
