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Articles by Judy E. Kim in JoVE
Termodinamica di Folding delle proteine di membrana Misurato in spettroscopia di fluorescenza
Diana E. Schlamadinger, Judy E. Kim
Chemistry and Biochemistry, University of California San Diego - UCSD
Questo articolo dettagli video la procedura sperimentale per ottenere l'energia libera di Gibbs di ripiegamento delle proteine della membrana da triptofano fluorescenza.
Other articles by Judy E. Kim on PubMed
Caratteristiche Cliniche Della Corioretinopatia Sierosa Centrale Nelle Donne
Ophthalmology. Feb, 2002 | Pubmed ID: 11825806
Per descrivere le caratteristiche cliniche di Corioretinopatia sierosa centrale (CSC) in donne e identificare i fattori predittivi di recupero completo, perdita visiva moderata e prolungata durata.
Time-resolved Risonanza Raman Analisi Dei Cambiamenti Strutturali Cromoforo Nella Formazione E Deperimento Dell'intermedio Di BSI Di Rodopsina
Journal of the American Chemical Society. May, 2002 | Pubmed ID: 11971736
Time-resolved risonanza Raman microchip flusso sono esperimenti per ottenere lo spettro vibrazionale del cromoforo in intermedio BSI di rodopsina e sonda cambiamenti strutturali in bathorhodopsin-a-BSI e transizioni BSI-a-lumirhodopsin. Gli spettri Raman cinetici da 250 ns a 3 micros identificare le principali caratteristiche vibrazionali della BSI. BSI esibisce relativamente intensa modalità HOOP a 886 e 945 cm(-1) che sono assegnate a C (14) H e C (11) (12) H = C H A(u) wags, rispettivamente. Questo risultato suggerisce che nella transizione bathorhodopsin-BSI il cromoforo altamente sforzato all-trans ha rilassato nella regione C(10)-C(11)=C(12)-C(13), ma è ancora distorte vicino C(14). La bassa frequenza della modalità A(u) HOOP 11,12 in BSI confrontato con quello di lumirhodopsin e semplice indica più debole accoppiamento tra la H 11 e H 12 wags a causa della distorsione residua del cromoforo BSI vicino C(11)=C(12). La modalità C=NH(+) stretching in BSI a 1653 cm(-1) esibisce una normale deuteriation indotta da scalata di cm(-1) 23, implicando che non non c'è nessun significativo riarrangiamento strutturale della regione Schiff counterion base di transizione di bathorhodopsin di BSI. Tuttavia, un drastico cambiamento di ambiente di base di Schiff si verifica nella transizione BSI-a-lumirhodopsin, perché la modalità di stretching C=NH(+) 1638 cm(-1) in lumirhodopsin è insolitamente bassa e si sposta solo 7 cm(-1) in D (2) O, suggerendo che non ha essenzialmente accettore di H-bonding. Con questi dati possiamo per la prima volta confrontare e discutere la risonanza di temperatura ambiente struttura vibrazionale Raman di tutti i prodotti intermedi chiavi in eccitazione visiva.
Risultati Angiografici Fluoresceina in Un Inarcamento Scleral Infetto
Ophthalmic Surgery and Lasers. Sep-Oct, 2002 | Pubmed ID: 12358300
Questa relazione presenta fluoresceina angiografica risultati (FA) in un paziente con infezione inarcamento scleral. Dieci giorni dopo chirurgia sclerale instabilità, FA dimostrato dilated vasi della coroide sopra la fibbia con fuoriuscita di fluorescina nello spazio al. Irregolare ispessimento sclerale diffuso è stato osservato sulla tomografia computerizzata (CT). Le scoperte di Coroidite focale con vasi dilatati leaky coroidale visti su FA, o diffuso ispessimento sclerale dimostrato da un CT possono essere di aiuto nello stabilire la diagnosi di infezione da inarcamento scleral.
Rilassamento Vibrazionale in Beta-carotene Probed by Picosecondo Stokes E Spettroscopia Raman Di Risonanza Anti-Stokes
The Journal of Physical Chemistry. A. Jun, 2002 | Pubmed ID: 17235377
Picosecondo time-resolved Stokes e risonanza anti-Stokes spettri Raman di tutto-trans-beta-carotene sono ottenuti e analizzati per rivelare le dinamiche dello stato eccitato (S(1)) popolazione e decadimento, così come Rilassamento vibrazionale dello stato fondamentale. Time-resolved spectra Stokes mostra che lo stato di terra recupera con una costante di tempo 12,6 ps, d'intesa con il deperimento osservato delle bande S(1) Stokes uniche. Gli spettri di anti-Stokes non esibiscono picchi imputabile allo stato S(1) (2A(g) (-)), che indica che il rilassamento vibrazionale in S(1) deve essere quasi completa entro 2 ps. Dopo fotoeccitazione c'è un forte aumento della dispersione anti-Stokes da modalità di terra-stato che sono vibrazionalmente eccitato attraverso conversione interna. Anti-Stokes dati sono idonei a uno Schema cinetico in cui la modalità C = C si rilassa in ps 0,7, la modalità C-C si rilassa in 5,4 ps e la modalità C-CH(3) si rilassa in 12,1 ps. Questi risultati sono coerenti con un modello per conversione interna S(1)-S(0) in cui la modalità C = C è l'accettore primario, la modalità C-C è un accettore minori, e la modalità C-CH(3) è eccitata tramite ridistribuzione di energia vibrazionale intramolecolare.
Raman Anti-Stokes Lo Studio Della Dinamica Vibrazionale Raffreddamento Nella Fotochimica Primaria Della Rodopsina
The Journal of Physical Chemistry. A. Sep, 2002 | Pubmed ID: 16552447
Picosecondo Stokes e anti-Stokes Raman spectra è utilizzati per sondare la dinamica strutturale ed energia reattiva flusso nella reazione di isomerizzazione cis-trans primario della rodopsina. L'aspetto della caratteristiche etilenico, idrogeno fuori piano (HOOP), basso-wavenumber photoproduct bande e negli spettri Raman è strumento-risposta-limited, coerente con un tempo di aspetto del prodotto subpicosecond. Picchi di intenso anti-Stokes di alta e bassa frequenza dimostrano che l'all-trans photoproduct è prodotto vibrazionalmente caldo sulla superficie del suolo-stato. In particolare, le modalità di bassa frequenza a 282, 350 e 477 cm(-1) sono altamente vibrazionalmente eccitate (T > 2000 K) immediatamente successiva isomerizzazione, rivelando che questi movimenti di bassa frequenza partecipano direttamente il processo reattivo curva-incrocio. Le modalità di anti-Stokes sono caratterizzate da un decadimento temporale circa 2,5 di ps che coincide con la conversione di photorhodopsin a bathorhodopsin. Questa corrispondenza dimostra che la transizione foto-batho è un processo di raffreddamento dello stato fondamentale e quello stoccaggio di energia nella photoproduct visiva primaria è completa della scala di tempo di picosecondi. Infine, le vibrazioni Stokes uniche a 290, 992, 1254, 1290 e 1569 cm(-1) derivanti dallo stato eccitato della rodopsina sono osservati solo a ritardo 0 ps.
Analisi Della Distribuzione Di Energia Dello Stato Eccitato Modalità Specifiche E Rendimento Quantico Fotoreazione Dipendente Dalla Lunghezza D'onda Di Rodopsina
Biophysical Journal. Apr, 2003 | Pubmed ID: 12668457
Il rendimento quantico fotoreazione della rodopsina è dipendente dalla lunghezza d'onda: phi(lambda) è ridotto fino al 5% a lunghezze d'onda per il rosso di 500 nm, ma è invariante (phi = 0.65 + /-0,01) fra 450 e 500 nm (Kim et al., 2001). Per comprendere questo processo di conversione interna prevengono, questi risultati sono confrontati con le previsioni di un modello di Landau-Zener per la traversata della curva dinamica. La distribuzione iniziale di energia dei fotoni in eccesso nei 28 Franck-Condon attivi modi vibrazionali della rodopsina è definita da un calcolo di vibronico somma-over-stati pienamente termalizzato. Questo calcolo rivela che assorbimento da modalità metalloide aspetto metallico ad alta frequenza (ad esempio, si estende per C [doppio legame] C) aumenta con la lunghezza d'onda di eccitazione è spostata da 570 a 450 nm mentre relativamente meno energia è depositato in modalità reattiva di bassa frequenza. Questo risultato qualitativamente spiega la dipendenza dalla lunghezza d'onda osservata sperimentalmente di phi(lambda) per la rodopsina e rivela l'importanza delle modalità delocalizzati, torsionale nella via del reattiva.
Distacco Di Retina in Occhi Sottoposti a Pars Plana Vitrectomia Per La Rimozione Dei Frammenti Conservati Lente
Ophthalmology. Apr, 2003 | Pubmed ID: 12689890
Per studiare l'incidenza ed esiti di distacco di retina (RD) associato mantenne frammenti lente rimossi da vitrectomia di pars plana (PPV).
Della Coroide Metastasi Da Un Cystadenocarcinoma Mucinoso Ovarico Primario
Retina (Philadelphia, Pa.). Apr, 2003 | Pubmed ID: 12707607
Dinamiche Di Picosecondo Di G-protein Coupled Receptor Attivazione in Rodopsina Da Time-resolved Risonanza UV Spettroscopia Raman
Biochemistry. May, 2003 | Pubmed ID: 12731857
La risposta di proteina per isomerizzazione cromoforo retinale nella rodopsina pigmento visivo è studiata mediante risonanza UV picosecondo time-resolved spettroscopia Raman. Gli spettri Raman di segnale-rumore alti sono ottenuti utilizzando un apparato di laser Ti:Sapphire 1 kHz che fornisce < 3 ps visibile (466 nm) pompa e UV (233 nm) sonda impulsi. Quando non non c'è nessun ritardo di tempo tra la pompa e sonda eventi, modalità di triptofano W16 W18 e W3 esibiscono diminuita intensità di scattering Raman. A più lungo tempo di pompa-sonda ritardi di + 5 e + 20 ps, entrambi triptofano (W18, W16, W3 e W1) e tirosina (Y1 + 2xY16a, Y7a, Y8a) picco di intensità goccia fino al 3%. Questi cambiamenti di intensità sono attribuiti a idrofobicità diminuito nel microambiente vicino almeno un triptofano e un residuo di tirosina che probabilmente derivano da indebolito l'interazione con l'anello beta-ionone del cromoforo seguito isomerizzazione cis-trans. Esame della struttura cristallina suggerisce che W265 e Y268 sono responsabili per questi segnali. Questi cambiamenti spettrali UV Raman sono quasi identici a quelli osservati per la rodopsina-a-Meta che la transizione, implicando che impulsivamente guidato moto di proteina dal cromoforo isomerizing durante il fs 200 transizione principale unità principali modifiche strutturali che portano all'attivazione della proteina.
Voriconazolo Trattamento Di Ascesso Sclerite Ed Epibulbar Fungina Derivanti Da Inarcamento Scleral Infezione
Archives of Ophthalmology. May, 2003 | Pubmed ID: 12742860
Determinazione Del Vitreo, Acquoso E La Concentrazione Plasmatica Di Voriconazolo Somministrato Oralmente Negli Esseri Umani
Archives of Ophthalmology. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14718293
Per indagare la penetrazione di voriconazolo, un agente antimicotico triazolo di nuova generazione, nel vitreo e umore acqueo dopo somministrazione orale.
Nocardiosi Oculari Endogene
Journal of AAPOS : the Official Publication of the American Association for Pediatric Ophthalmology and Strabismus / American Association for Pediatric Ophthalmology and Strabismus. Apr, 2004 | Pubmed ID: 15088059
Subcongiuntivali Antibiotici Per Endoftalmite Acuta Postcataract Estrazione - è Necessario?
American Journal of Ophthalmology. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15183800
Per valutare l'efficacia dell'iniezione antibiotica subcongiuntivali adiuvante nel trattamento dell'Endoftalmite acuta estrazione postcataract.
Zinco-porfirina Solvatazione Negli Stati Piegati E Dispiegati Di Zn-citocromo C
Inorganic Chemistry. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15578829
Dopo una breve rassegna dell'uso di trigger fotochimici e sostituzione metallo eme per sondare le dinamiche pieghevole del citocromo c, vi presentiamo i nuovi risultati sulla fotofisica e fotochimica degli stati piegati e spiegati della proteina sostituito con zinco (Zn-cyt c). Le nostre misurazioni della cinetica di decadimento di Zn-cyt c terzina stato rivelano un effetto dell'isotopo sistematica sulla vite: il decadimento della proteina ripiegata (tau(H)2(O) circa 10 ms) è solo modestamente influenzato da buffer isotopicamente sostituito (k(H)2(O)/k(D)2(O) = 1.2), considerando che una terzina ridotta durata (circa 1,3 ms) e maggiore effetto isotopico (1.4) sono stati trovati per chimicamente denaturato, completamente spiegata della proteina. La più breve durata (0,1-0,4 ms) e più grande effetto isotopico (1.5) sono stati trovati per un modello completamente esposto composto, zinco-sostituita N-acetil-microperoxidase-8 (ZnAcMP8), che implica che la proteina unfolded fornisce qualche protezione al gruppo Zn-porfirina anche sotto denaturare completamente le condizioni. Ulteriore prova per struttura parziale in dispiegata Zn-cyt c proviene da bimolecolare tempra esperimenti utilizzando Ru(NH(3))(6)(3+) come un quencher di stato di tripletto Zn-porfirina esterni. In presenza di quencher, parzialmente spiegata della proteina al cloruro di guanidinium punto medio (GdmCl) e cinetica di decadimento urea concentrazioni esposizioni bifasico terzina, una componente rapida corrispondente a uno stato esteso, esposte al solvente (6,6 x 10, paragrafo 8 M(-1) s(-1) in GdmCl, 6,3 x 10, paragrafo 8 M(-1) s(-1) nell'urea) e una componente lenta imputabile ad uno stato compatto e relativamente solvente-inaccessibile, (5,9 x 10 M(-1) s(-1) in GdmCl8,6 x 10 M(-1) s(-1) nell'urea). La variazione di solvatazione Zn-porfirina per gli Stati compatti i due denaturanti rivela che il cofattore della proteina parzialmente spiegata meglio è protetto in soluzioni di urea.
Neurofibromatosi Di Tipo 2 in Un Neonato Che Presenta Con Minorazione Visiva Confermata Con L'analisi Di Mutazione Genetica
Retina (Philadelphia, Pa.). Oct-Nov, 2005 | Pubmed ID: 16205576
David Pit Ottica Senza Schisi Retinica Interna Cavità
Retina (Philadelphia, Pa.). Jan, 2006 | Pubmed ID: 16395153
Thermotherapy Termoterapia Con Enhancement Colorante Verde Indocianina Per Il Trattamento Della Neovascolarizzazione Coroidale Subfoveal Occulto Nella Degenerazione Maculare Legata All'età
Ophthalmic Surgery, Lasers & Imaging : the Official Journal of the International Society for Imaging in the Eye. Jul-Aug, 2006 | Pubmed ID: 16898386
Thermotherapy termoterapia (TTT) con verde indocianina (ICG) valorizzazione di colorante (TTT +) e TTT da solo sono stati confrontati per la sicurezza e l'efficacia come trattamento della neovascolarizzazione coroidale subfoveal occulto nella degenerazione maculare legata all'età.
Sondaggio Piegato E Si Svolse Gli Stati Della Proteina Della Membrana Esterna Una Con Fluorescenza Steady-state E Time-resolved Triptofano
The Journal of Physical Chemistry. B. Sep, 2006 | Pubmed ID: 16942111
Le misure di fluorescenza steady-state e time-resolved su ciascuno dei cinque residui di triptofano nativa in full-length e troncati varianti di e. coli della proteina di membrana esterna in che una (OmpA) è state fatte piegata e denaturato Stati. Durata stato eccitato del triptofano singoletto è multiexponential e varia tra i residui. Inoltre, aumenti sostanziali nella vita dello stato eccitato accompagnano OmpA pieghevole, con durata più lunga nelle micelle più nel bilayer fosfolipidico. Questa scoperta suggerisce che gli ambienti Trp della OmpA piegato in micelle e bilayer fosfolipidico sono diversi. Misurazioni della cinetica di decadimento Trp fluorescenza con full-length OmpA piegato in lipidi ritardanti vescicole rivelano che W102 è il fluoroforo più distante dal nucleo dell'idrocarburo, mentre W7 è il più vicino. Stazionario e time-resolved fluorescenza polarizzata misurazioni indicano ridotta mobilità Trp quando OmpA è piegato in una micella e ancora più bassa mobilità quando la proteina è piegata in un doppio strato. Le proprietà di fluorescenza di OmpA troncato, in cui viene rimosso il dominio periplasmico solubile, solo modestamente differiscono da quelli del modulo full-length, suggerendo strutture simili piegate per le due forme in queste condizioni.
Intravitreal Triamcinolone Acetonide Per Il Trattamento Dell'edema Maculare Cistoide Associato Con Retinite Pigmentosa
Retina (Philadelphia, Pa.). Nov-Dec, 2006 | Pubmed ID: 17151506
Inserimento Del Peptide, Posizionamento E Stabilizzazione in Una Membrana: Insight Da Una Simulazione Di Dinamica Molecolare All-atom
Biopolymers. Apr 5-15, 2007 | Pubmed ID: 17274025
Peptide inserimento, posizionamento e stabilizzazione in una membrana modello sono state esaminate tramite una simulazione di dinamica molecolare (MD) di all-atom. In ogni foglio di una membrana di dimyristoylglycero-3-fosfato (DMPC) solvatato viene simulato un peptide (WL5). Entro i primi 5 ns, i peptidi inserire spontaneamente la membrana e poi stabilizzarsi durante il restante 70 ns di tempo di simulazione. In entrambi i volantini, i peptidi localizzare all'interfaccia membrana, e questa localizzazione è attribuita alla formazione di legami idrogeno del peptide-lipidico. Dimostriamo che il residuo di triptofano singolo in ogni peptide contribuisce significativamente a questi legami idrogeno; in particolare, l'eteroatomo azoto dell'anello indolo gioca un ruolo fondamentale. Gli angoli di inclinazione degli anelli indolo rispetto la membrana normale in volantini superiore e inferiore sono circa 26 e 54 gradi, rispettivamente. L'angolo d'inclinazione della catena del peptide intero è 62 e 74 gradi. La membrana induce conformazioni del peptide che sono caratteristici di beta-fogli, e il peptide migliora i lipidi ordinazione nella membrana. Infine, il tasso di diffusione dei peptidi nel piano della membrana è calcolato (basata su concentrazioni sperimentali del peptide) da circa 6 A (2) / ns, suggerendo così un 500 ns tempo scala per interazioni intermolecolari.
Riproducibilità Di Spessore Macula E Volume Mediante Tomografia a Coerenza Ottica Zeiss in Pazienti Con Edema Maculare Diabetico
Ophthalmology. Aug, 2007 | Pubmed ID: 17353052
Per valutare la riproducibilità di optical coherence tomography (OCT) in pazienti con edema macula diabetico (DME).
Perfluorocarbone Al Rimozione: Perfluorocarbone Volume Stima E Cannula Scelta
Retina (Philadelphia, Pa.). Jan, 2008 | Pubmed ID: 18185156
ISIS-DME: Prospettico, Randomizzato, Studio Di Dose-escalation Intravitreal Iniezione Di Steroidi Per Edema Macula Diabetico Refrattario
Retina (Philadelphia, Pa.). May, 2008 | Pubmed ID: 18463518
: Per determinare la sicurezza e l'efficacia di intravitreal triamcinolone acetonide (IVTA) per refrattario clinicamente significativo edema maculare diabetico (DME).
Ultravioletto Risonanza Spettroscopia Raman Degli Stati Piegati E Spiegati Una Proteina Integrale Di Membrana
The Journal of Physical Chemistry. B. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18588328
La struttura vibrazionale del nativo ancoraggio triptofano (Trp) e residui di tirosina in una proteina integrale di membrana, proteine di membrana esterna batterica un (OmpA), sono state indagate mediante spettroscopia di UV risonanza Raman (UVRR) per la prima volta. Spettri della OmpA nativo, un mutante di singolo-Trp e un mutante Trp-di meno sono stati registrati negli stati piegati e spiegati e rivelano cambiamenti significativi nella struttura di triptofano e ambiente locale. Salienti alterazioni su pieghevole comprendono perdita di idrogeno-bonding carattere di indolo N1H, evidenziato da un cambiamento nella frequenza W17 da 874 878 cm(-1) e crescita in idrofobicità dell'ambiente locale triptofano, supportata dall'aumento del rapporto I1361/I1340. Oltre a questi cambiamenti site-specifici in un residuo di triptofano singolo, modificazione della struttura vibrazionale delle resto nativo triptofano e tirosina amminoacidi è anche evidente. Infine, i dati UVRR qui presentati indicano che le strutture della OmpA piegata in vescicola e piegato in detersivo possono differiscono e fornire importanti basi per gli studi in corso di ripiegamento proteico di membrana.
Le Cellule Staminali Embrionali Con Una 2A Self-cleaving Peptide Di Marcatura: Un NKX2-5 Smeraldo Reporter GFP BAC
PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18596956
Reporter fluorescente sono utili per analizzare l'espressione genica in cellule viventi e per identificare e isolare le popolazioni di cellule puro da culture eterogenee, comprese le cellule staminali embrionali (ES). Esistono molteplici fluorofori e marcatori di selezione genetica; Tuttavia, un sistema per la creazione di costrutti reporter che preservano le sequenze regolatrici nei pressi del sito di inizio ATG nativo di un gene non è ampiamente disponibile.
Fattori Di Rischio Per La Rimozione Di Inarcamento Scleral: Uno Studio Caso-controllo Abbinato
American Journal of Ophthalmology. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18614132
Per identificare preoperatoria, perioperatoria e postoperatoria rischio fattori per inarcamento scleral rimozione (SB).
Termodinamica Di Inserimento Del Peptide E Di Aggregazione in Un Doppio Strato Lipidico
The Journal of Physical Chemistry. B. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18681475
Una varietà di biomolecole mediare i processi fisiologici inserendo e riorganizzazione nelle membrane cellulari, e le forze termodinamiche responsabile per loro partizionamento sono di grande interesse. Recenti esperimenti fornito preziosi dati sui cambiamenti di energia libera associati con il trasferimento di singoli amminoacidi dall'acqua a membrana. Tuttavia, un quadro completo delle vie e i cambiamenti associati in energia di inserimento del peptide in una membrana resta sfuggente. A tal fine, tecniche computazionali integrano i dati sperimentali con dettagli a livello atomico e gettare luce sulla energetica di inserimento. Qui, abbiamo impiegato la tecnica di campionamento di ombrello in un totale di 850 ns di simulazioni di dinamica molecolare all-atom per studiare il profilo di energia libera e il percorso di inserimento di un modello esapeptide composto un triptofano e cinque leucines (WL5). Il profilo di energia libera calcolata del peptide che viaggiano dal solvente di massa attraverso il nucleo di membrana esibisce due minimi: un minimo locale presso l'interfaccia acqua-membrana o la regione di capigruppo e un minimo globale all'interfaccia idrofobico e idrofilico nei pressi della regione di glicerolo di lipidi. Una barriera piuttosto piccola di circa 1 kcal mol-(1) esiste il nucleo di membrana, che si spiega con la maggiore flessibilità del peptide profondamente inserita. Combinando i nostri risultati con quelli in letteratura, vi presentiamo un modello termodinamico per inserimento del peptide e aggregazione che coinvolge l'aggregazione del peptide a contatto con la membrana all'interfaccia solvente lipidico capigruppo.
A Randomized Trial Confrontando Intravitreal Triamcinolone E Focale/griglia Fotocoagulazione Per Edema Maculare Diabetico: Caratteristiche Di Base
Retina (Philadelphia, Pa.). Jul-Aug, 2008 | Pubmed ID: 18698292
Per confrontare le caratteristiche demografiche, sistemici e oculari previsione all'interno di età e sottogruppi razziali tra i partecipanti a questa sperimentazione clinica diabetica retinopatia Clinical Research Network e confrontare questa coorte con altre coorti si iscrive in fase 3 studi clinici per la retinopatia diabetica.
A Breve Termine Della Pressione Intraoculare Cambia Immediatamente Dopo L'iniezione Intravitreal Di Fattore Di Crescita Endoteliale Anti-vascular Agenti
American Journal of Ophthalmology. Dec, 2008 | Pubmed ID: 18775528
Per valutare le tendenze a breve termine e la necessità di monitor intraoculare (IOP) pressione cambia immediatamente dopo intravitreal iniezioni di ranibizumab, bevacizumab, pegaptanib e triamcinolone acetonide.
Gli Effetti Del Microambiente Triptofano, Dominio Solubile E Vescicola Dimensioni Sulla Termodinamica Del Ripiegamento Proteico Di Membrana: Lezioni Dalla Proteina Transmembrana OmpA
Biochemistry. Dec, 2008 | Pubmed ID: 18991402
Curve Refolding della proteina integrale di membrana proteina membrana esterna una (OmpA) sono state misurate per determinare lo stabilità di questo sistema di modello per membrane protein folding conformazionali. Wild-type OmpA esposizioni un'energia libera di svolgersi (DeltaG gradi H2O) di 10,5 mutanti kcal/mol, contenente un residuo di triptofano singolo nativo nelle posizioni 7, 15, 57, 102 o 143, sono meno stabili OmpA wild-type, con gradi di DeltaG H2O valori di 6,7, 4.7 e 4.8, 2.4 2,8 kcal/mol, rispettivamente. La tendenza osservata qui è discusso in termini di interazioni non covalenti, comprese le interazioni aromatiche e legame idrogeno. L'effetto della coda solubile sulla stabilità conformazionale del dominio transmembrana della OmpA è stato studiato anche tramite tronco singolo-Trp mutanti; DeltaG gradi H2O valori per quattro dei cinque troncati mutanti sono maggiori di > 2,7 kcal/mol rispetto alle versioni full-length, suggerendo che l'assenza del dominio solubile possa destabilizzare il dominio transmembrana dispiegato. Infine, sono stati eseguiti esperimenti di diffusione dinamica della luce per misurare gli effetti di urea e proteine sulla dimensione della vescicola e la stabilità. Concentrazioni di urea superiori a 1 M causano un aumento di dimensioni della vescicola, e questi diametri sono inalterati in presenza di proteine. Questi risultati di diffusione dinamica della luce completano gli studi di fluorescenza e illustrano gli effetti importanti della dimensione della vescicola sulla stabilità conformazionale della proteina.
Fattori Di Rischio Per La Rimozione Di Inarcamento Scleral: Uno Studio Caso-controllo Abbinato
Transactions of the American Ophthalmological Society. 2008 | Pubmed ID: 19277232
Per identificare preoperatoria, perioperatoria e postoperatoria rischio fattori per inarcamento scleral rimozione (SB).
Trasferimento Di Energia Per Risonanza E Stabilità Conformazionale Delle Proteine: Un Avanzato Modulo Biofisico Per Gli Studenti Di Chimica Fisica
Journal of Chemical Education. Sep, 2008 | Pubmed ID: 19756254
Il protein folding è un'area che esplodono di ricerca in biofisica e chimica fisica. Qui, descriviamo l'integrazione di diverse tecniche, tra cui Förster risonanza energy transfer (FRET) misurazioni, per sondare temi importanti in ripiegamento proteico, spettroscopia di fluorescenza e spettroscopia di assorbimento. Il citocromo c è usato come una proteina di modello; confronto di stabilità conformazionale (ΔGH2O∘) misurata tramite due chimici denaturanti, urea e guanidinio idrocloruro, illustrare concetti importanti in interazioni intermolecolari e pieghevole della proteina. Inoltre, la determinazione delle distanze intraprotein basato sulla coppia FRET Trp-59 e il gruppo eme per stati svelati del citocromo c mette in evidenza l'evoluzione della struttura della proteina in condizioni di svolgimento. Analisi e discussione di questi risultati forniscono opportunità di acquisire una conoscenza approfondita dei modelli per il protein folding e ne rafforza le competenze degli studenti con tecniche ottiche. Collettivamente, la combinazione della spettroscopia ottica, analisi quantitativa rigorosa e un focus sulla biofisica illustra l'importanza della ricerca fondamentale all'incrocio crescente di chimica, biologia e fisica.
Fenotipiche Eterogeneità E Lesione Dimensione Misurazioni Nella Distrofia Macula Di Stargardt
Ophthalmic Surgery, Lasers & Imaging : the Official Journal of the International Society for Imaging in the Eye. Sep-Oct, 2009 | Pubmed ID: 19772279
Autofluorescenza del fondo è stato utilizzato nella distrofia macula di Stargardt e fundus flavimaculatus per meglio comprendere la progressione e lo stato di malattia. Immagini di fundus autofluorescence delineano aree atrofiche con grande chiarezza e contrasto elevato. Gli autori hanno indagato se fundus autofluorescence immagini rivelato più atrofia di fotografie a colori del fundus studiando una famiglia di tre fratelli con lunga malattia che ha dimostrato un aspetto eterogeneo fundus. Conclusioni su autofluorescenza del fondo sono stati confrontati con fluoresceina immagini e fotografie a colori del fundus. Immagini di tomografia di coerenza ottica sono stati anche analizzati. Aree di lesioni atrofiche erano misurati e confrontati su fotografie di fundus autofluorescence e colore del fondo. Immagini di autofluorescenza delineati atrofiche regioni più chiaramente di fotografie del fondo di colore. Tuttavia, le aree di atrofia misurate erano solo modestamente più grandi nelle immagini di autofluorescenza del fondo più in fotografie a colori del fundus. Le immagini di tomografia di coerenza ottica ha mostrato grave atrofia della retina esterna e la perdita del contorno fovea.
Legame Idrogeno E Indicatori Di Polarità Solvibile in Risonanza Uv Spettro Raman Di Triptofano: Applicazione Di Proteine Di Membrana
The Journal of Physical Chemistry. B. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19817473
Spettri Raman (UVRR) ultravioletta risonanza dei residui di triptofano in vari solventi e un peptide modello vengono presentati e rivelano cambiamenti sistematici che riflettono la polarità solvibile, la forza di legame idrogeno e interazione catione-pi. Il marcatore di spettrale UVRR comunemente utilizzato per la polarità di ambiente che è stata basata sui dati di fuori risonanza Raman, il rapporto di doppietto di triptofano Fermi I1360/I1340, esibisce valori diversi in su e fuori-risonanza gli spettri Raman per quanto riguarda i derivati del triptofano differenti. In particolare, il rapporto del farsetto UVRR Fermi per indolo varia da 0,3 in solventi polari a 0,8 in solventi non polari, mentre i rispettivi valori riportati qui e in precedenza per fuori risonanza gli spettri Raman sono 0,5-1,3. UVRR Fermi doppietto rapporti per la molecola più biologicamente rilevante, estere etilico di N-acetil triptofano (Sandro), sono in una più piccola gamma di 1.1 (solvente polare) a 1.7 (solventi non polari) e correlano per il solvente polarità/polarizzazione parametri pi ed ETN. Come è stato segnalato in precedenza, diversi modi di UVRR sono anche sensibili alla forza di legame a idrogeno del gruppo N-H di indolo. Qui, segnaliamo un nuovo marcatore inequivocabile per H-bonding: il rapporto dell'intensità W10 (circa 1237 cm-1) a quello della modalità W9 (1254 circa cm-1) (RW10). Questo rapporto è 0,7 per Sandro in assenza di accettori di legame idrogeno e aumenta a 3.1 in presenza di forte legame idrogeno ricettori, con un valore di 2.3 in acqua. La modalità W8 e W17 shift + più di 10 e circa - 5 cm-1 all'aumento della forza di legame idrogeno; Questa gamma di W17 è inferiore rispetto a quello segnalato in precedenza e riflette una gamma più realistica per le proteine e peptidi in soluzione. Infine, i nostri dati forniscono la prova per cambiamento dell'intensità relativa W18 e W16 in presenza di interazioni catione-π. Questi marcatori UVRR vengono utilizzati per interpretare gli spettri di ottile triptofano membrana-limiti sistemi di modello e il melittin tossina peptide. Questi spettri rivelano l'importanza di intra - e idrogeno intermolecolari bonding e catione-pi interazioni che probabilmente influenzano il partizionamento di biomolecole membrana associata a lipidici o oligomeri self-associated solubili. L'analisi UVRR presentato qui modifica e potenzia le relazioni precedenti e fornisce un set di inequivocabile dei creatori spettrale che può essere applicato per delucidare il microambiente molecolare e la struttura di una vasta gamma di sistemi complessi, compresi residui di triptofano nelle proteine di membrana e peptidi di ancoraggio.
Risonanza Di Fluorescenza E UV Studio Raman Di Interazioni Peptide-vescicola Di Human Cathelicidin LL-37 E Suoi Mutanti Di F6W E F17W
Biochemistry. Dec, 2009 | Pubmed ID: 19894716
LL-37 è un peptide di antimicrobici umano ad ampio spettro della famiglia cathelicidin. Dosaggi di potenza sotto forma di minima perdita di concentrazione e vescicola inibitorio indicano che i mutanti di singolo-triptofano, F6W e F17W, sono efficaci a uccidere i batteri e disgregare le membrane come il peptide LL-37 nativo, privo di triptofano. Fluorescenza steady-state e risonanza UV spettroscopia Raman di F6W e F17W rivelare dettagli molecolari di questi residui di triptofano. La polarità dell'ambiente locale, forza di legame idrogeno del gruppo N-H indolo e diminuzione libertà rotazionale sia per F6W e F17W in presenza di ioni di carbonato relativo alla pura acqua distillata; questi risultati sono coerenti con la sepoltura della regione idrofoba di alfa-elicoidale LL-37 nei nuclei oligomerici indotta in presenza di ioni di carbonato. Le differenze nelle proprietà spettroscopiche delle forme alfa-elicoidale indotta dal carbonato di F6W e F17W riflettono la presenza di un residuo di lisina locale vicino F6W che rende il microambiente del F6W più polare rispetto a quella di F17W. In presenza di vescicole di lipidi, i mutanti sono sottoposti ad ulteriore perdita di polarità di ambiente, la forza di legame idrogeno e libertà rotazionale. Tempra esperimenti utilizzando ritardanti lipidi rivelano che i residui di triptofano in entrambi mutanti sono essenzialmente equidistanti dal centro doppio strato e che bromines più vicino al centro del doppio strato, in posizioni 9,10, placare la fluorescenza in modo più efficiente rispetto a quelli più vicini alla headgroups (6,7 posizioni). Questi risultati supportano moquette o toroidale poro meccanismi di rottura della membrana di LL-37 e dimostrano che la combinazione di strumenti spettroscopici sensibili e triptofano mutanti possa fornire importanti indizi molecolari sull'azione antimicrobica.
Valutazione Del Medico Di Modificare Le Dimensioni Della Lesione Delle Membrane Neovascular Coroidale Classica Prevalentemente Nella Degenerazione Maculare Legata All'età
Ophthalmic Surgery, Lasers & Imaging : the Official Journal of the International Society for Imaging in the Eye. Nov-Dec, 2009 | Pubmed ID: 19928720
Per quantificare l'interpretazione di forniti di fluorescina di evoluzione prevalentemente classico neovascolarizzazione coroidale nella degenerazione maculare legata all'età.
Spettro Microbiologico Degli Organismi Isolati Da Fibbie Sclerale Espiantate
Ophthalmic Surgery, Lasers & Imaging : the Official Journal of the International Society for Imaging in the Eye. Mar-Apr, 2009 | Pubmed ID: 19320315
Rimozione di inarcamento Scleral è una rara procedura eseguita per vari motivi. Informazioni microbiologiche su fibbie sclerale espiantate rimangano limitate. Gli autori hanno identificato 37 casi di rimozione di inarcamento scleral durante un periodo di 18 anni. Colture batteriche isolato un organismo in 4 dei 9 pazienti (44%) con infezione clinica. Gli organismi identificati includevano Staphylococcus aureus meticillino-resistente, Pseudomonas aeruginosa, Mycobacterium abscessus e specie Staphylococcus coagulasi-negativi. Colture batteriche isolato un organismo in 3 delle 11 pazienti (27%) senza infezione clinica. Gli organismi identificati includono specie di Nocardia, Alcaligenes xylosoxidans e Mycobacterium chelonae. Fibbie sclerale che appaiono clinicamente infetti possono essere associate più virulenti organismi e una maggiore possibilità di identificazione di un organismo. Le colture batteriche possono essere di valore per fibbie sclerale dopo l'espianto.
Gli Studi Di Raman Di Risonanza Della (sua) Cluster 2Fe-2S (Cys) 3 Di MitoNEET: Confronto Con Il Mutante (Cys) 4 E Le Implicazioni Degli Effetti Del PH Sul Centro Metallo Labile
Biochemistry. Jun, 2009 | Pubmed ID: 19388667
MitoNEET è una proteina di membrana mitocondriale esterna 2Fe-2S che inizialmente è stata identificata come un bersaglio per farmaci anti-diabetici. Esibisce una piegatura della proteina romanzo, e in contrasto con altre proteine 2Fe-2S come proteine Rieske e ferredoxins, i cluster metallici nell'omodimero mitoNEET sono ciascuna coordinati da un residuo di istidina e tre residui di cisteina. L'interazione del residuo His87 legatura con il moiety 2Fe-2S è particolarmente significativo perché studi precedenti hanno mostrato che sostituzione con Cys in mutante H87C stabilizza il cluster contro rilascio. Riportiamo la risonanza spettri Raman di questa proteina natura Fe(2)S(2)(His)(Cys)(3) per valutare i cambiamenti strutturali locali associati con labilità di cluster. Confronto di mitoNEET al suo mutante H87C ferredossina-come indica che i picchi di Raman nei circa 250-300 cm(-1) regione di mitoNEET sono influenzati da moiety il Fe-His87. PH-dipendente sistematico risonanza Raman sono stati osservati cambiamenti spettrali in questa regione spettrale per mitoNEET nativo ma non il mutante H87C. I circa 250-300 cm(-1) regione mitoNEET nativo è anche sensibile al tampone fosfato. Così, le condizioni che influenzano il rilascio di cluster sono mostrate qui a colpiscono simultaneamente la risonanza dello spettro Raman della regione con Fe, il suo contributo. Questi risultati supportano l'ipotesi che l'interazione Fe-N(His87) è modulata all'interno della gamma di pH fisiologico, e tale modulazione può essere fondamentale per la funzione di mitoNEET.
Valutazione Genetica E Clinica Di Retinoschisi Giovanile
Journal of AAPOS : the Official Publication of the American Association for Pediatric Ophthalmology and Strabismus / American Association for Pediatric Ophthalmology and Strabismus. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19393523
Retinoschisi giovanile sono una rara distrofia retinica causata da mutazioni del gene RS1.(1) Gli esami clinici e l'analisi molecolare definitivamente diagnosticato Retinoschisi giovanile in 2 neonati maschi, uno dei quali ha avuto una mutazione romanzo non precedentemente segnalata negli Stati Uniti. Test genetico può essere il modo più semplice per confermare questa diagnosi nei neonati.
Vitrectomia Di Transconjunctival 20-gauge Pars Plana Usando Una Singola Voce Cannulati Sutureless Sistema
Retina (Philadelphia, Pa.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19696700
Pars plana vitrectomia con un calibro 20 transconjunctival cannulati sutureless (TCS) sistema ha la possibilità di combinare i vantaggi dei sistemi di vitrectomia calibro più piccolo con il vantaggio economico di non dover acquistare eventuali ulteriori strumenti portatili. Tuttavia, la dimensione del sclerotomy è molto più grande, e sclerotomies auto-sigillante può essere più difficile da costruire. Quindi, abbiamo valutato la necessità di sclerotomy di sutura dopo l'esecuzione di vitrectomia TCS 20-gauge.
Caratterizzazione Raman Di Risonanza Di Un Radicale in Un Mutante Azurina Di Triptofano Stabile
The Journal of Physical Chemistry. B. Jan, 2009 | Pubmed ID: 19072535
I radicali triptofano giocano un ruolo importante nel trasferimento di elettroni biologici e processi catalitici di mediazione. Qui, ci avvaliamo di visibile e UV risonanza spettroscopia Raman, EPR e assorbimento insieme a pH/isotopo studi e calcoli per sondare un neutro chiuso-shell triptofano e la sua controparte radicale ossidato in una proteina modificata azurina. Confronto della risonanza gli spettri Raman delle specie radicali e guscio chiuso combinati con analisi vibrazionale rivela importanti differenze strutturali tra queste due specie di triptofano. Osserviamo sperimentalmente una riduzione significativa in ordine di legame dell'anello pirrolo del radicale, come evidenziato da una scalata 208 cm(-1) della modalità W3 (principalmente C(2)-C(3) tratto). Analisi degli spettri acquisiti a pH acido e nel buffer deuterato evidenzia quei modi vibrazionali del radicale che sono sensibili all'ambiente di idrogeno-bonding. Il cambiamento più significativo causato da buffer deuterato è una scalata di 45 cm(-1) di una modalità di spostamento di azoto di indolo (W17). Il nostro spettro di fornisce la prova che la specie radicale è un accettore di forte legame a idrogeno, particolarmente in un ambiente acido. Inoltre, il pK(a) per questo triptofano radicale deve essere inferiore a 4.0, che scende di sotto di valori precedentemente riportati per l-triptofano in soluzione acquosa. Le assegnazioni di modalità normale di radicale il triptofano aiutano caratterizzano l'ambiente locale, conformazione, legami idrogeno e stato dello protonazione all'interno di una proteina.
Tre Anni Di Follow-up Di Uno Studio Randomizzato Confrontando Triamcinolone Fotocoagulazione E Intravitreal Di Focale/griglia Per Edema Maculare Diabetico
Archives of Ophthalmology. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19273785
A riferire i risultati di 3 anni dei pazienti che hanno partecipato a uno studio randomizzato valutazione dosi di 1 mg e 4 mg di triamcinolone conservanti intravitreal confrontato con fotocoagulazione focale/griglia per il trattamento dell'edema maculare diabetico.
Azione Antimicrobica Selettiva è Fornito Da Modulins Fenolo-solubile Derivata Da Staphylococcus Epidermidis, Un Residente Della Pelle Normale
The Journal of Investigative Dermatology. Jan, 2010 | Pubmed ID: 19710683
Peptidi antimicrobici servono come prima linea di difesa immunitaria innata contro l'invasione di organismi come batteri e virus. In questo studio, abbiamo ipotizzato che peptidi prodotto da un residente microbico normale della pelle umana, Staphylococcus epidermidis, potrebbe anche agire come uno scudo di antimicrobici e contribuire alla difesa normale all'interfaccia epidermica. Mostriamo circolare spettroscopia di dicroismo e triptofano che modulins fenolo-solubile (PSMs) gamma e delta, prodotto da S. epidermidis hanno un carattere alfa-elicoidale e un'interazione di membrana lipidica forti simile a mammiferi AMPs come LL-37. Entrambi PSMs direttamente indotto perdite vescicola lipidici ed esercitata azione antimicrobica selettiva contro gli agenti patogeni della pelle quali Staphylococcus aureus. PSMs funzionalmente ha cooperato con gli altri e LL-37 per rafforzare l'azione antimicrobica. Inoltre, PSMs ridotto gruppo A streptococco (GAS) ma non la sopravvivenza di S. epidermidis sulla pelle del mouse. Così, questi dati suggeriscono che la produzione di PSMgamma e PSMdelta da S. epidermidis può beneficiare difesa immunitaria cutanea inibendo selettivamente la sopravvivenza di agenti patogeni della pelle, mantenendo la pelle normale microbioma.
Staphylococcus Epidermidis Antimicrobica Delta-tossina (fenolo-solubile Modulin-gamma) Collabora Con Peptidi Antimicrobici Host Per Uccidere Il Gruppo A Streptococco
PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20052280
Peptidi antimicrobici giocano un ruolo importante nella difesa ospite contro agenti patogeni. Recentemente, sono stati mostrati modulins fenolo-solubile (PSMs) da Staphylococcus epidermidis (S. epidermidis) per interagire con le membrane lipidiche, formano complessi ed esercitare attività antimicrobica. Basato sull'abbondanza e l'innocuità della cutanea residente S. epidermidis, abbiamo ipotizzato che loro PSMs contribuiscono alla difesa ospite. Qui vi mostriamo che S. epidermidis delta-tossina (PSMgamma) è normalmente presente nell'epidermide e scarsamente nel derma della pelle umana mediante immunoistochimica. Delta-tossina sintetica interagito con trappole extracellulari del neutrofilo (reti) e colocalized con cathelicidin mentre anche indurre formazione netto nei neutrofili umani. Dosaggi antimicrobica contro il gruppo A streptococco (GAS), delta-tossina ha cooperato con CRAMPI, hBD2 e hBD3. Nel sangue intero, aggiunta di delta-tossina esercitato un effetto batteriostatico su GAS e nelle reti, delta-tossina aumentato la loro capacità di uccisione contro questo agente patogeno. Spettroscopia di coimmunoprecipitation e triptofano ha dimostrato il binding diretto di delta-tossina di peptidi antimicrobici host LL-37, CRAMPO, hBD2 e hBD3. Infine, in un modello murino della ferita, sopravvivenza di GAS è stato ridotto (insieme a Mip-2 livelli di citochine) quando le ferite sono state pretrattate con delta-tossina. Così, questi dati suggeriscono che S. epidermidis derivati delta-tossina collabora con i peptidi antimicrobici derivati da host nel sistema immunitario innato per ridurre la sopravvivenza di un importante patogeno batterico umano.
Vicino-peer Laboratori Per Le Abilità Di Esame Fisico Pre-tirocinio
Medical Education. May, 2010 | Pubmed ID: 20374469
Confronto Spettroscopica Dei Radicali Triptofano Fotogenerati in Azurina: Effetti Dell'ambiente Locale E La Struttura
Journal of the American Chemical Society. Jul, 2010 | Pubmed ID: 20536238
Radicali di triptofano giocano un ruolo importante nel trasferimento di elettroni biologica di mediazione. Riportiamo il photogeneration di un radicale di triptofano longevo, neutro (Az48W *) il residuo nativo triptofano-48 nel nucleo idrofobo di azurina. L'assorbimento ottico, risonanza paramagnetica elettronica e risonanza Raman spectra sostenere fortemente la formazione di un radicale neutro, e i dati sono coerenti con trasferimento di elettroni diretto tra triptofano e il centro di rame (II). Spettri di specie longeva Az48W * sono paragonati a quelli di un radicale precedentemente studiato, esposte al solvente alla posizione 108 per identificare le firme dei radicali di triptofano che sono sensibili all'ambiente locale. I massimi di assorbimento di Az48W visualizzare uno spostamento di hypsochromic circa 23 nm nell'ambiente non polare. La maggior parte della risonanza frequenze Raman sono downshifted da circa 7 cm(-1) rispetto i cambiamenti radicali e grandi esposte al solvente in intensità è osservata per alcuni modi. La risonanza di eccitazione Raman profili per Az48W * esposizione maxima distinti all'interno della busta di assorbimento. Spettroscopia di risonanza paramagnetica elettronica produce spettri con linee parzialmente risolti causati dall'accoppiamento iperfine; le differenze tra le costanti di accoppiamento per il radicale sepolto e solvente-esposti sono principalmente causate da variazioni nella struttura. Le intuizioni acquisite dalla spettroscopia di risonanza magnetica, elettronico e vibrazionale migliorano la nostra comprensione degli effetti dell'ambiente della proteina sul radicale proprietà fondamentali. Sono proposte ipotesi per il percorso di trasferimento del protone all'interno di azurina e un tasso di deprotonazione di circa 5 x 10 s(-1).
Cambiamenti Demografici E La Risposta Al Trattamento Nella Retinopatia Soglia Della Prematurità Laser: 10 Anni Di Esperienza
Journal of Pediatric Ophthalmology and Strabismus. Jul-Aug, 2010 | Pubmed ID: 19791711
Per valutare l'esito della indiretta trattamento laser a diodo per retinopatia soglia della prematurità (ROP) e per segnalare le modifiche demografiche osservate oltre 10 anni.
Standard Care Vs Corticosteroide Per Occlusione Venosa Retinica (SCORE) Studiare Il Sistema Per La Valutazione Di Fotografie a Colori Stereoscopiche Del Fundus E Forniti Di Fluoresceina: SCORE Report Studio 9
Archives of Ophthalmology. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20837797
Per descrivere le procedure e la riproducibilità di classificazione colore stereoscopico fundus fotografie e forniti di fluorescina dei partecipanti allo studio SCORE.
Interazioni Di Triptofano-lipido in Membrane Protein Folding Sondati Dai Raggi Ultravioletto Risonanza Raman E Spettroscopia Di Fluorescenza
Biophysical Journal. May, 2011 | Pubmed ID: 21539779
Amminoacidi aromatici delle proteine di membrana sono arricchiti all'interfaccia acqua-lipidi. Il ruolo del triptofano sulla piegatura e la stabilità di una proteina integrale di membrana è indagati con raggi ultravioletto risonanza Raman e spettroscopia di fluorescenza. Indaghiamo un modello del sistema, la proteina di membrana esterna del β-barilotto un (OmpA) e concentrarsi sui residui di triptofano interfacciale orientati verso il doppio strato lipidico (trp-7, trp-170 o trp-15) o all'interno del poro β-barrel (trp-102). OmpA mutanti con un residuo di triptofano unico in una posizione non nativo 170 (Trp-170) o una posizione nativa 7 (Trp-7) mostrano la massima stabilità, con Gibbs libera le energie di dispiegarsi in assenza di denaturante di 9,4 e 6,7 kcal/mol, rispettivamente. Questi mutanti sono più stabili di triptofano libero OmpA mutante, che esibisce un'energia libera di spiegamento di 2,6 risonanza kcal/mol di Ultraviolet spettri Raman di Trp-170 e Trp-7 rivelano l'evoluzione di un legame a idrogeno in un ambiente non polare durante la reazione pieghevole, evidenziata da spostamenti sistematici nei marcatori idrofobicità e legame idrogeno. Queste osservazioni suggeriscono che il ricettore del legame dell'idrogeno è il gruppo carbonile lipidi acil, e questa interazione contribuisce significativamente alla stabilizzazione di proteine di membrana. Altri cambiamenti spettrali sono osservati per un residuo di triptofano in posizione 15, e tali modifiche vengono attribuite allo sviluppo di un'interazione catione-π triptofano-lipidi che è più stabilizzante rispetto a un legame a idrogeno intraprotein di ∼2 kcal/mol. Come previsto, non ci sono prove per interazioni lipido-proteina per il residuo di triptofano orientato verso l'interno del poro β-barrel. Questi risultati evidenziano l'importanza delle interazioni della proteina-lipidi e indicano che il doppio strato fornisce più di un ambiente idrofobico per membrane protein folding. Invece, deve essere adottato un paradigma di membrana lipidica-assistita protein folding e stabilizzazione.
Con Carica Di Controllare Le Proprietà Funzionali Di Nanopori Auto-assemblati Nelle Membrane
Small (Weinheim an Der Bergstrasse, Germany). Jul, 2011 | Pubmed ID: 21626687
Legame Idrogeno, Dei Radicali Di Triptofano Rivelato Da EPR a 700 GHz
Journal of the American Chemical Society. Nov, 2011 | Pubmed ID: 22007694
Tryptophans redox-attiva sono importanti in biochimica di trasferimento e redox biologici elettrone. Le proteine possono sintonizzare l'elettrone trasferimento cinetica e redox potenziali del triptofano attraverso il controllo dello stato protonazione e la forza di legame a idrogeno. Esaminiamo l'ambiente locale dei due radicali neutro triptofano (Trp108 sulla superficie esposta a solvente) e Trp48 seppellito nel nucleo idrofobo in due varianti di azurina. Spettroscopia EPR ultraelevata-campo 700 GHz e 25 T ha permesso la completa risoluzione di tutti i componenti principali dei tensori g dei due radicali e ha rivelato differenze significative fra le anisotropie di tensore g. Gli spettri insieme (2) gli spettri H ENDOR e calcoli DFT supporto mostrano che l'anisotropia di tensore g è direttamente diagnostico della presenza o assenza, così come la forza di un legame a idrogeno all'azoto dell'indolo. L'approccio è una potente per identificare e caratterizzare i legami idrogeno che sono fondamentali per la regolazione del trasferimento di elettroni triptofano-assistita e chimica redox triptofano-mediata in proteine.
Terapia Fotodinamica Per Corioretinopatia Sierosa Centrale Associata Steroide
The British Journal of Ophthalmology. Apr, 2011 | Pubmed ID: 20679080
Per valutare l'efficacia a breve termine della terapia fotodinamica (PDT) per steroidi associati cronica o ricorrente centrale sierosa Corioretinopatia (CSC).
Förster Resonance Energy Transfer Come Una Sonda Di Ripiegamento Proteico Di Membrana
Biochimica Et Biophysica Acta. Feb, 2012 | Pubmed ID: 21925139
La reazione di ripiegamento di una proteina di membrana di β-barrel, proteina di membrana esterna una (OmpA), è sondata con esperimenti di Förster resonance energy transfer (FRET). Quattro mutanti della OmpA sono stati generati in cui il fluoroforo donatore, triptofano e molecola accettore, un derivato del naftalene, sono collocati in diverse posizioni sulla proteina per segnalare l'evoluzione delle distanze attraverso il doppio strato ed attraverso il poro proteina durante un evento pieghevole. Analisi dei rendimenti FRET rivelano tre scadenze per le modifiche di struttura terziaria associati con inserimento e pieghevole in un doppio strato sintetico. Forma un poro strette durante la fase iniziale dell'inserimento, seguita da attraversamento di doppio strato. Infine, un componente da lungo tempo è attribuita ad equilibrio e rilassamento e può comportare cambiamenti globali come estensione di espansione e strand poro. Questi risultati aumentano i modelli esistenti che descrivono eventi pieghevoli e inserimento concordata ed evidenziano la capacità di fornire i complessi meccanismi di ripiegamento proteico di membrana FRET. Questo articolo fa parte di un numero speciale intitolato: struttura della proteina di membrana e funzione.
