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Articles by Judy Yen in JoVE
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牛痘病毒感染及病毒基因表达的时空分析：第1部分
Whitehead Institute for Biomedical Research, MIT - Massachusetts Institute of Technology
协议牛痘感染的HeLa细胞和宿主和病毒基因的表达分析。
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牛痘病毒感染及病毒基因表达的时空分析：第2部分
Whitehead Institute for Biomedical Research, MIT - Massachusetts Institute of Technology
协议牛痘感染的HeLa细胞和宿主和病毒基因的表达分析。
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牛痘病毒感染及病毒基因表达的时空分析：第3部分
Whitehead Institute for Biomedical Research, MIT - Massachusetts Institute of Technology
协议牛痘感染的HeLa细胞和宿主和病毒基因的表达分析。第3部分介绍了从主机和染料的氨基烯丙基耦合病毒样本的荧光标记扩增的RNA的过程。
Other articles by Judy Yen on PubMed
可行的人类巨细胞病毒重组病毒 IE2 86 基因内部缺失会影响后期的病毒复制。
使用细菌人工染色体 (BAC) 技术，我们有构造和特点主要立即早期区域 2 （IE2） 特定的外显子的突变与人类巨细胞病毒重组病毒基因产物。由此产生的 IE2 86 kDa 蛋白 (IE2 86) 氨基酸 136 至 290 内部删除，对增强型绿色荧光蛋白 (EGFP) 的羧基总站保险丝烧断。删除操作还会删除 p40 p60 形式的蛋白质，IE2 和启动器蛋氨酸的窗体的启动子和启动器蛋氨酸，因此，不生产这些迟到的基因产品。这种突变病毒 IE2 86 三角洲 SX 与绿色荧光蛋白是可行的但展品改变相比全长野生型 (wt) IE2 86-绿色荧光蛋白病毒或乃是病毒的组织培养中生长特性。当细胞感染突变病毒在感染 (MOI) 低多重性时，传染性病毒的生产有明显的延迟。这是与较慢的细胞病毒扩散的关联。通过免疫荧光和印迹分析，我们表明这种突变病毒的复制过程中的早期步骤媲美 wt。虽然大大少 IE2 蛋白突变感染的细胞中，初始积累 IE1 72 与病毒的早期蛋白中有只温和的滞后和病毒 DNA 复制过程正常进行。这种突变也只是很小的影响，对病毒主要衣壳蛋白的合成。突变病毒感染最显著分子的缺陷是，pp65 稳态水平 (UL83) 和 pp28 (UL99) 基质蛋白将大大减少。UL83，但不是 UL99，也是基因突变病毒感染的细胞中存在相应减少。
人类巨细胞病毒感染的细胞在 S 期期间感染导致的封锁的蛋白酶体的抑制作用是可以克服的立即早期基因表达。
单元格之后开始 DNA 复制人类巨细胞病毒 (HCMV) 感染不启动病毒立即早期 (IE) 基因表达并逮捕前划分。要确定这种封锁的性质，我们审查了被感染 24 小时后释放的 G(0) 使用免疫荧光、 激光扫描流式细胞仪、 荧光激活细胞分选 (FACS) 分析的单元格。大约 40 到 50%的单元格了 2N DNA 含量、 成为第一 12 h，IE(+) 和逮捕。大多数但不是所有的单元格与 > 2N DNA 含量并没有表示 IE 抗原直到后有丝分裂。来定义小人口的逐渐积累的 S 和 G (2) 内的 IE(+) 细胞 /M 车厢，单元格是脉冲与溴脱氧尿甙 (BrdU) 前夕 S 阶段感染并在 IE 基因表达、 BrdU 阳性和细胞周期的位置与 12 h 受进行分析。BrdU(+) 细胞的大多数是 IE(-)，并到 G (2) /M 或回 G(1) 取得了进展。IE(+) 的大多数细胞在 S 和 G (2) /M 是 BrdU(-)。只有几个细胞是 IE(+) BrdU(+)，他们居住在 G 2/M.多点 BrdU 脉冲标记表明，相比于积极合成 DNA 在感染开始的单元格，更大的单元格开始 DNA 复制 4 h 以后的百分比可以表示 IE 抗原和 S.同步带 aphidicolin 的单元格的进入还指出了封锁对 IE 基因表达的激活成立于细胞 DNA 复制启动后不久。看来短暂蛋白在 S 期细胞中的可能需要的 IE 基因表达，因为它部分恢复，以 MG132 蛋白酶体抑制剂治疗。
在早期时间准确处理和积累的人类巨细胞病毒 UL122 123 和 UL37 立即早期成绩单和在稍后时间病毒生产需要细胞周期蛋白依赖性激酶活性。
人巨细胞病毒 (HCMV) 感染导致的多个细胞周期调节蛋白时异常。在此研究中，我们审查了对病毒复制的细胞周期蛋白依赖性激酶 （cdk） 活性抑制作用的影响。与药物系列，一种特定的抑制剂细胞周期蛋白依赖性激酶 1、 2、 5、 7 和 9，我们已经表明期间感染第一 6 h，细胞周期蛋白依赖性激酶依赖的事件发生，其中包括受规管的加工和立即早期 (IE) UL122-123 成绩单和 UL36 37 成绩单的积累。改变 UL122 123 导致 IE1 72 和 IE2 86 增加损失的处理。比例拼接到 unspliced UL37 成绩单也发生了变化。这些效果的蛋白酶体不需要 de novo 蛋白质合成或蛋白质降解。增加了感染的开头系列也是表达式的关联选病毒的早期基因产品、 病毒性 DNA 复制和晚期的病毒基因表达的抑制作用。当系列感染的第一次 6 h 后添加的时不再发现 IE 基因表达影响和病毒复制开始通过后期阶段，但减少了病毒滴度。在病毒滴度减少有人甚至系列第一次添加时在 48 h 受指示细胞周期蛋白依赖性激酶活性必需在 IE 和时代晚期。Flavopiridol，另一种特异性抑制剂的细胞周期蛋白依赖性激酶了类似 IE 和早期基因表达的影响。这些结果强调准确的 RNA 加工的重要性，并重申人巨细胞病毒感染的细胞周期调节因子的显著作用。
埃博拉出血热的治疗： 全基因组转录分析成功疾病缓解。
埃博拉病毒 （EBOV） 发病机制都只是部分了解，但正常宿主免疫反应 （包括杀伤性的淋巴细胞，增加循环细胞因子水平及凝血功能异常的发展） 失调思想方面发挥主要作用。越来越多的证据表明很多观察病理不是病毒所致的结构性损伤的直接结果，而是由于从 EBOV 感染细胞释放可溶性免疫调解员。因此，至关重要的是要了解如何治疗的候选人可能阻断疾病的过程或针对病原体。若要标识是保护相关的基因签名，我们用于 DNA 芯片方法比较 EBOV 感染非人灵长类动物 (NHPs) 回应候选药物治疗学的主机全基因组的反应。我们注意到虽然整体循环免疫反应的存在和缺乏凝血抑制物相似，尚存 NHPs 聚集在一起。凝血功能相关基因的明显差异似乎与生存，这是揭示的明显差异表达基因，包括趋化因子配体 8 （CCL8/MCP-2），可为早期诊断或未来治疗学提供可能的目标子集关联。这些分析将帮助我们在理解 EBOV 感染的发病机制和确定改进的治疗策略。
