Определение молекулярной структуры гликопротеинов ВИЧ Конверт использованием крио-электронной томографии и автоматизированных Sub-томограмма усреднения

JoVE 2770 12/01/2011

Joel R. Meyerson^1,2, Tommi A. White¹, Donald Bliss³, Amy Moran³, Alberto Bartesaghi¹, Mario J. Borgnia¹, M. Jason V. de la Cruz¹, David Schauder¹, Lisa M. Hartnell¹, Rachna Nandwani^1,4, Moez Dawood⁵, Brianna Kim⁶, Jun Hong Kim⁷, John Sununu⁸, Lisa Yang⁹, Siddhant Bhatia¹⁰, Carolyn Subramaniam¹, Darrell E. Hurt¹¹, Laurent Gaudreault¹², Sriram Subramaniam¹

¹Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, ²The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, ³National Library of Medicine, National Institutes of Health, ⁴Massachusetts Institute of Technology, ⁵William Fremd High School, ⁶University of Virginia, ⁷Duke University, ⁸Yale University, ⁹University of Notre Dame, ¹⁰Washington University in St. Louis, ¹¹Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, ¹²Thomas Jefferson High School for Science and Technology

Протокол описывает высокой пропускной подход к определению структуры мембранных белков использованием крио-электронной томографии и 3D обработки изображений. Он содержит подробную информацию об образце подготовки, сбора данных, обработки и интерпретации данных, и заключает с производством представитель мишенью для подходом, ВИЧ-1 Конверт гликопротеин. Эти процедуры расчетов разработаны таким образом, что позволяет исследователям и студентам работать удаленно и вносить вклад в обработку данных и структурного анализа.