Determinación de estructuras moleculares de glicoproteínas de la envoltura del VIH con Cryo-tomografía electrónica y automatizada promedio Sub-tomografía

JoVE 2770 12/01/2011

Joel R. Meyerson^1,2, Tommi A. White¹, Donald Bliss³, Amy Moran³, Alberto Bartesaghi¹, Mario J. Borgnia¹, M. Jason V. de la Cruz¹, David Schauder¹, Lisa M. Hartnell¹, Rachna Nandwani^1,4, Moez Dawood⁵, Brianna Kim⁶, Jun Hong Kim⁷, John Sununu⁸, Lisa Yang⁹, Siddhant Bhatia¹⁰, Carolyn Subramaniam¹, Darrell E. Hurt¹¹, Laurent Gaudreault¹², Sriram Subramaniam¹

¹Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, ²The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, ³National Library of Medicine, National Institutes of Health, ⁴Massachusetts Institute of Technology, ⁵William Fremd High School, ⁶University of Virginia, ⁷Duke University, ⁸Yale University, ⁹University of Notre Dame, ¹⁰Washington University in St. Louis, ¹¹Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, ¹²Thomas Jefferson High School for Science and Technology

El protocolo describe un método de alto rendimiento para la determinación de estructuras de proteínas de membrana con la crio-tomografía electrónica y procesamiento de imágenes 3D. Que cubre los detalles de la preparación de muestras, la recopilación de datos, procesamiento e interpretación de datos, y concluye con la producción de un objetivo representante para la aproximación, la pandemia del VIH-1 glicoproteína de la envoltura. Estos procedimientos de cálculo han sido diseñados de una manera que permite a los investigadores y estudiantes para trabajar a distancia y contribuir al tratamiento de los datos y el análisis estructural.