LET-Verteilungen an Der Anlage Mit Dem CERF RRMD-III Gemessen

Journal of Radiation Research. Dec, 2002  |  Pubmed ID: 12793735

Eine Einzigartige Unnatürliche Basenpaar Zwischen Einem Analogen C, Pseudoisocytosin Und Einem A-Analogon, 6-methoxypurine, Bei Der Replikation

Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. May, 2002  |  Pubmed ID: 11992784

Lösung Strukturaufklärung Der Beiden DNA-bindenden Domänen in Der Schizosaccharomyces Pombe Abp1 Protein Durch Eine Kombination Von Dipolaren Kopplung Und Diffusions-Anisotropie Beschränkungen

Journal of Biomolecular NMR. Apr, 2002  |  Pubmed ID: 12018481

[High-Throughput-NMR-Strukturbestimmung: Die Gegenwart Und Die Zukunft]

Tanpakushitsu Kakusan Koso. Protein, Nucleic Acid, Enzyme. Jun, 2002  |  Pubmed ID: 12099020

Lösung Struktur Des DFF-C-Domäne Von DFF45/ICAD. Eine Strukturelle Grundlage Für Die Regulierung Von Apoptotischen DNA-Fragmentierung

Journal of Molecular Biology. Aug, 2002  |  Pubmed ID: 12144788

Dosisäquivalente Inneren Der Raumstation MIR Durch Die Kombination Von CR-39 Platten Und TLDs Und Deren Vergleich Mit Denen Auf Space Shuttle STS-79, -84 Und -91 Missionen Gemessen

Radiation Measurements. Oct, 2002  |  Pubmed ID: 12442747

Parkin Bindet Die Rpn10-Untereinheit Des 26S Proteasoms Durch Die Ubiquitin-ähnliche Domäne

EMBO Reports. Mar, 2003  |  Pubmed ID: 12634850

Spektroskopische Und Mutationsanalyse Des Blaulicht-Photorezeptor AppA: A Novel Photozyklus Mit Flavin-Stapeln Mit Einer Aromatischen Aminosäure

Biochemistry. Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12779327

Markierung Mit Stabilen Isotopen Von Arabidopsis Thaliana Für Eine NMR-basierte Metabolomik-Ansatz

Plant & Cell Physiology. Aug, 2004  |  Pubmed ID: 15356336

Einfluss Der Dielektrischen Eigenschaften Von Lösungsmitteln Auf Die Qualität Faktor Für Eine über 900-MHz-Sonde Kryo-Modell

Journal of Magnetic Resonance (San Diego, Calif. : 1997). May, 2005  |  Pubmed ID: 15809170

Untersuchung über Die Kristallstruktur Und Die Strukturellen Und Magnetischen Eigenschaften Des SrCu2 (PO4) 2

Inorganic Chemistry. Sep, 2005  |  Pubmed ID: 16156620

SrCu2 (PO4) 2 wurde vorbereitet von der Solid-State-Methode bei 1153 K. Seine Struktur wurde gelöst durch direkten Methoden in der Raumgruppe Pccn (Nr. 56) mit Z = 8 aus Synchrotron Röntgen Pulver Beugung Daten gemessen bei Raumtemperatur. Strukturparameter wurden dann verfeinert, indem die Rietveld Methode die Gitterparametern erhalten eine = 7.94217(8) A, b = 15.36918(14) A und c = 10.37036(10) A. SrCu2 (PO4) 2 präsentiert eine neue Art von Struktur und ist von Sr2O16 und Cu1Cu2O8-Einheiten mit Cu1 aufgebaut...Cu2 = 3.256 A. Die magnetischen Eigenschaften von SrCu2 (PO4) 2 durch Magnetische Suszeptibilität, Magnetisierung bis 65 T Cu Nuklear Quadrupol Resonanz (NQR), Elektronenspin Resonanz und spezifische Wärme Messungen untersucht wurden. Mit Drehbeschleunigung-Dimer Analyse zeigte es sich, dass die zwei stärksten Spin-Austausch-Interaktionen zwischen Cu Websites das Ergebnis der Cu1-O...O-Cu2 und Cu2-O...O-Cu2-Super-Superexchange-Pfade mit Cu1...Cu2 = 5.861 A und Cu2...Cu2 5.251 = A, und die Superexchange Zusammenhang mit der strukturellen Dimer Cu1Cu2O8 vernachlässigbar. Die Magnetische Suszeptibilität Daten wurden analysiert im Hinblick auf eine lineare vier-Spin-Cluster-Modell, Cu1-Cu2-Cu2-Cu1 mit - 2J (1) /kB = 82,4 K für Cu1 Cu2 und-2J(2)/k(B) = 59 K für Cu2-Cu2. Eine Drehbeschleunigung-Lücke, die von diesem Modell abgeleitet (Delta/kB = 63 K) wird im Einvernehmen mit, die aus der Cu NQR-Daten gewonnen (Delta/kB = 65 K). Eine Hälfte Magnetisierung Plateau wurde beobachtet, zwischen ca. 50 und 63 T bei 1,3 K. spezifische Wärme zeigen, dass SrCu2 (PO4) 2 nicht unterziehen eine weiträumige magnetische Sortierung bis 0,45 K. SrCu2 (PO4) 2 schmilzt incongruently bei 1189 K. Wir berichten auch seine Schwingungs Eigenschaften studierte bei Raman-Spektroskopie.

Strukturelle Und Funktionelle Charakterisierung Von Einer Mutante Des Pseudocerastes Persicus Natriuretisches Peptid

Protein and Peptide Letters. 2006  |  Pubmed ID: 16515458

Hiermit berichten wir auf einer teilhabende Analyse eine neuartige natriuretisches Peptid (PNP), der kürzlich von uns aus der iranischen Schlangengift isoliert. Die PNP-Variante (MutPNP) mit vier Ersetzungen (G16T, K18S, R21S, G23R) und ein Disulfid verklebt Ring um 3 Rückstände verkürzt. MutPNP Peptid wurde in pET32 ausgedrückt und durch Affinität Trennung auf Nickel-Harz, gefolgt von RP-HPLC Chromatographie gereinigt. Lösung war die Gestaltung des MutPNP von 1 H KERNRESONANZSPEKTROSKOPIE, geprägt wo es gefunden wurde, dass der Ring 14-Rückstand Disulfid gebunden wie die 17-Rückstand-Ring in PNP, ein hohes Maß an Konformationsänderungen Flexibilität behält. Die Gestaltung des MutPNP an NPR-C-Rezeptor gebunden wurde von Homologie-Protein-Struktur-Modellierung vorhergesagt. Wenn intravenös in Ratten injiziert, hatte MutPNP, im Gegensatz zu PNP keine physiologischen Auswirkungen auf den Blutdruck oder Diurese. Der Verlust der physiologischen Aktivität wird in Bezug auf die modellierten gebundenen Konformation und das Ensemble der Lösung Konformationen mit Hilfe der NMR-Einschränkungs erläutert.

Praktische Aspekte Der Einheitlichen Stabiles Isotop Kennzeichnung Von Höheren Pflanzen Für Heteronukleare NMR-basierte Metabolomics

Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2007  |  Pubmed ID: 17035691

Analysemethoden zur Sondierung pflanzlichen Stoffwechsel nehmen neue Bedeutung in der Ära der funktionellen Genomik, Metabolomics und Systeme Biologie. Kernspinresonanz (NMR) ist eine Schlüsseltechnologie im Werk Metabolomics immer. Stabiles Isotop Kennzeichnung von kultivierten Zellen und höheren Organismen ist besonders vielversprechend gewesen, die es, die Verwendung von erweiterten heteronukleare NMR Methoden durch eine Kombination von in-vivo und in vitro Messungen ermöglicht. Dieser neue Ansatz liefert eine viel bessere Auflösung der Metabolit Mischung Signale in den multidimensionalen NMR-Spektren als die konventionelle eindimensionale 1 H-NMR-früher im Werk Metabolomics tut. In diesem Kapitel beschreiben wir die praktischen Aspekte der zwei NMR-Schlüsseltechnologien: einheitliche stabile Beschriften von Pflanzen und in-vitro-heteronukleare NMR.

Oben Phenomics Von Arabidopsis Thaliana: Metabolic Profiling Von Ein- Und Zweidimensionale Kernspinresonanz-Spektroskopie Und Transkriptom-Analyse Der Albino-Mutanten

The Journal of Biological Chemistry. Jun, 2007  |  Pubmed ID: 17468106

Elucidating die Funktion von jedem Gen eines Genoms ist wichtig für das Verständnis des gesamten Organismus. Zuvor konstruierten wir 4000 Disruptant-Mutanten von Arabidopsis durch Einfügung von Ds Transposonen. Hier beschreiben wir einen Top-Down Phenomics Ansatz basierend auf metabolic profiling, verwendet eindimensionale 1 H und zweidimensionalen 1 H, 13 C-NMR-Analysen und Transkriptom-Analyse der mutant Albino-Linien der Arabidopsis. Eindimensionale 1H NMR metabolischer Fingerabdruck offenbart globale metabolische Veränderungen in die Albino-Mutanten, insbesondere eine Abnahme der aromatischen Metaboliten und Änderungen in aliphatische Metaboliten. NMR-Messungen von Pflanzen mit 13C 6-Glukose gefüttert haben gezeigt, dass die Albino-Linien drastisch unterschiedliche 13C-beschriften Muster hatte und verschiedene Aminosäuren, vor allem höhere Asn und Gln. Microarray Analyse eines der Albino-Linien ergab ein eindeutiger Ausdruck-Profil und zeigte, dass Änderungen in der Expression von Genen Codierung metabolische Enzyme nicht mit Änderungen bei der Höhe der Metaboliten entsprach. Diese Ergebnisse zufolge gemeinsam Albino Mutanten das normalen Kohlenstoff/Stickstoff-Gleichgewicht, vermutlich hauptsächlich durch Photosynthese verlieren. Unsere Studie bietet eine Vorstellung davon, wie viel das Stoffwechselprodukt-Netzwerk wird beeinflusst von Chloroplast Funktion in Pflanzen und zeigt die Effektivität des NMR-basierte metabolische Analyse für die Profilerstellung Metabolit. Auf der Grundlage dieser Ergebnisse schlagen wir vor, dass künftige Untersuchungen für Pflanzenbiologie Systeme Transcriptomic, metabolische und phenomic Analysen von Gen Disruptant Linien verbinden.

In Richtung Dynamische Metabolische Netzmessungen Von Multidimensionalen NMR-basierte Fluxomics

Phytochemistry. Aug-Sep, 2007  |  Pubmed ID: 17532017

Neue Technologien zur Messung biologischer Systeme und Methoden zur Visualisierung von Daten führten zu einer Revolution in den Biowissenschaften. Kernspinresonanz (NMR) Techniken können über Metabolit Struktur und metabolische Dynamik auf atomarer Ebene informieren. Wir entwickeln eine neue Methode zur Messung des dynamischen metabolischen Netzwerks grobe Extrakte, das kombiniert [(13)C(6)] Glukose Stabiles Isotop Kennzeichnung von Arabidopsis Thaliana und multidimensionale heteronukleare NMR-Analyse, hingegen die meisten konventionelle metabolische Flussmittel Analysen proteinogene Aminosäuren, die speziell mit teilweise gekennzeichneten Substraten wie [2-(13)C(1)] Glucose oder Glukose 10 % [(13)C(6)] beschriftet sind. Der Gültigkeit unserer Methode zeigen wir untersucht, so erhalten Sie Informationen über die biochemischen Reaktionen, C-C Bindung Bildung, und die Spaltung der wichtigsten Metaboliten, wie Freie Aminosäuren, in grobe Extrakte anhand der Analyse der (13) C-(13) C-Kupplung-Musters in 2D-NMR-Spektren. Die Kombination von verschiedenen Extraktionslösungsmittel ermöglicht beispielsweise eine komplizierte (13) unterscheiden C-(13) C feinen Kupplungen an der C2-Position von Aminosäuren. Als ein weiterer Ansatz hilft f1-f3 Projektion des HCACO Spektrums auch die Analyse der (13) C-(13) C-Konnektivitäten. Mit diesen neuen Methoden präsentieren wir ein Beispiel, bei der Überwachung des Aufnahme Profils [(13)C(6)] Glukose in A. Thaliana und seine metabolischen Dynamik, die sich in einer zeitabhängigen Weise mit atmosphärischen (12)CO(2) Assimilation ändern.

Primitive Neuroektodermale Tumor Der Brust: Immunhistochemie Und Fluoreszenz in Situ Hybridisierung

Pathology International. Aug, 2007  |  Pubmed ID: 17610475

Ein Fall von primitive Neuroektodermale Tumor (PNET), die wie ein Klumpen Brust in eine 47 Jahre alte japanische Frau berichtet entwickelt. Nach fein-Nadel-Aspiration (FNA) Zytologie wurde eine Mastektomie durchgeführt. Die chirurgische Probe war ein zirkumskripten Tumor, 21 x 18 x 18 mm, in der Brust lokalisiert. Die Tumorzellen waren klein und rund mit wenig Zytoplasma und gewucherten in Blättern oder festen Nester. Keine intraduktales Karzinom Komponente war anwesend. Die Tumorzellen waren bestätigt positive für neuronales Zelladhäsionsmolekül (CD56), Neuron-spezifische Enolase und Synaptophysin, und sie zeigten membranöse Immunoreactivity für das MIC2-Protein (CD99). Fluoreszenz in Situ Hybridisierung (FISH) angegeben, eine Neuordnung der EWS-Region auf Chromosom 22, die ist sehr spezifisch für Ewing Sarkom und PNET, die als das Ewing-Sarkom-Familie von Tumoren (EFT) bezeichnet werden. Keine andere Läsionen an den primären Standort dieser Tumor, wie Knochen, weiches Gewebe oder andere Organe wurden entdeckt. Der Patient wurde Krankheit kostenlos 6 Monate nach der Operation, gefolgt von Chemoradiation Therapie. Fisch ist äußerst nützlich für die genaue Diagnose der EFT, insbesondere in Fällen von ungewöhnlichen Orten.

Vergleichende Genomanalyse Lactobacillus Reuteri Und Lactobacillus Fermentum Offenbaren Eine Genomische Insel Für Reuterin Und Cobalamin-Produktion

DNA Research : an International Journal for Rapid Publication of Reports on Genes and Genomes. Jun, 2008  |  Pubmed ID: 18487258

Lactobacillus Reuteri ist ein heterofermentativen Milchsäure-Bakterium, die natürlich den Darm von Menschen und anderen Tieren bewohnt. Die probiotische Wirkung von L. Reuteri sind vorgeschlagen worden, die Produktion von der Breitspektrum antimikrobielle zusammengesetzte Reuterin während anaeroben Stoffwechsel des Glyzerins weitgehend zugeordnet werden. Wir entschlossen die vollständige Genom-Sequenz von Reuterin erzeugenden L. Reuteri JCM 1112(T) und seine eng verwandten Arten Lactobacillus Fermentum IFO 3956. Beide sind in der gleichen phylogenetische Gruppe innerhalb der Gattung Lactobacillus. Vergleichende Genomanalyse offenbart, dass L. Reuteri JCM 1112(T) hat einen einzigartigen Cluster 58 Gene für die Biosynthese von Reuterin und Cobalamin (Vitamin B(12)). Der 58-gen-Cluster hat einen niedrigeren GC-Gehalt und anscheinend eingefügt in die konservierte Region darauf hindeutet, dass der Cluster eine genomische Insel erwarb einen anomalen Ursprung darstellt. Zweidimensionale Kernspinresonanz (2D-NMR) mit (13) C 3-Glycerin gezeigt, dass L. Reuteri JCM 1112(T) konnte Glycerin in konvertiert Reuterin in vivo untermauerte das Potenzial von L. Reuteri JCM 1112(T) Reuterin im Darm produzieren. Da Glycerin angezeigt wird, natürlich im Kot vorhanden sein muss, ist die erworbene Fähigkeit, Reuterin und Cobalamin eine evolutionäre Reaktion, die wahrscheinlich auf die probiotischen Eigenschaften des L. Reuteri beiträgt.

Quantum Phasenübergang in Die Ambulante Antiferromagnet (V0.9Ti0.1) 2O3

Physical Review Letters. Aug, 2008  |  Pubmed ID: 18851633

Quanten-kritische Verhalten von den wandernden Elektronen Antiferromagnet (V0.9Ti0.1) 2O3 wurde von Einzel-Kristall Neutronenstreuung untersucht. Indem Sie direkt beobachten ANTIFERROMAGNETISCHE Drehfeld Schwankungen in der paramagnetischen Phase, haben wir gezeigt, dass die charakteristische Energie hängt von der Temperatur als c1 + c2T3/2, wo c1 und c2 sind Konstanten. Diese Abhängigkeit T3/2 zeigt, dass die vorliegende stark korrelierte d-Elektronen Antiferromagnet deutlich die Gefährlichkeit der Drehbeschleunigung-Dichte-Wave-Phase Quantensprung in drei Dimensionen des Raumes zeigt.

Systematischer NMR-Analyse Des Stabilen Isotops Beschriftet Metabolit Mischungen in Pflanzlichen Und Tierischen Systemen: Grob Genarbt Ansichten Von Stoffwechselwegen

PloS One. 2008  |  Pubmed ID: 19030231

Metabolische pathologies ist eine wichtige 'bird's-Eye-View'-Technologie geworden, die auf höhere Organismen, wie Modellpflanze und Tier-Systeme in der Ära Post-Genomik und Proteomik angewendet werden können. Obwohl Genotypisierung-Technologie in den letzten zehn Jahren stark erweitert hat, dahin da es Probleme mit der 'Top-Down' chemische Analysen metabolische pathologies. Hier beschreiben wir eine systematische NMR-Methodik zur stabilen Isotop-Kennzeichnung und Analyse der Metabolit Mischungen in Pflanze und Tier-Systeme.

PRIMe: Eine Website, Die Tools Für Metabolomik Und Transcriptomics Montiert

In Silico Biology. 2008  |  Pubmed ID: 19032166

PRIMe (http://prime.psc.riken.jp/), die Plattform für RIKEN Metabolomics, ist eine Website, die ist konzipiert und implementiert, um Forschung und Analyse-Workflows, die Transkriptom-Analyse von Metabolom bis zu unterstützen. Die Website bietet Zugriff auf eine wachsende Sammlung von standardisierten Messungen von Metaboliten, die mithilfe von Tools für NMR, GC-MS, LC-MS, und CE-MS und Metabolomics, die ähnliche Analysen (SpinAssign für die Identifizierung der Metaboliten mittels NMR, Ranzen für Suchvorgänge innerhalb Metabolit Datenbanken) zu unterstützen. Die Transcriptomics-Tools bieten darüber hinaus korreliert gen Suche und Cluster-Schneiden für die Analyse von mRNA Ausdruck. Verwendung der Tools und Datenbank kann dazu beitragen, die Analyse von biologischen Ereignissen auf den Ebenen der Metaboliten und Genexpression und wir beschreiben ein Beispiel für eine solche Analyse für Arabidopsis Thaliana mit Hilfe der Batch-Learning selbstorganisierenden Karte (BL-SOM), die über die Website bereitgestellt wird.

Dual Biosynthetischen Bahnen, Phytosterine Via Cycloartenol Und Lanosterin in Arabidopsis

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2009  |  Pubmed ID: 19139393

Die Unterschiede zwischen der Biosynthese der Sterine in höheren Pflanzen und Hefe/Säugetiere sind vermutlich stammen bei Cyclisierung der Oxidosqualene, die ist Cyclized Cycloartenol in höheren Pflanzen und Lanosterin in Hefe/Säugetiere. Vor kurzem wurden Lanosterin-Synthase Gene identifiziert, aus Magnoliophyta Pflanzenarten einschließlich Arabidopsis, was darauf hindeutet, dass höhere Pflanzen duale biosynthetischen Bahnen an Phytosterinen über Lanosterin und durch Cycloartenol besitzen. Biosynthetischen Pfad zum Phytosterine über Lanosterin zu identifizieren und zu die Beiträgen zur Phytosterine Biosynthese über jede Cycloartenol und Lanosterin offenbaren, wir füttern Experimente mithilfe von [6-(13)C(2)H(3)] Mevalonat mit Arabidopsis Sämlinge ausgeführt. Anwenden (13) C-{(1) H} {(2) H} Kernspinresonanz (NMR) Techniken, die Aufklärung von Deuterium auf C-19-Verhalten der Phytosterine Beweise vorgelegt, dass kleine Mengen von Phytosterin biosynthetisiert über Lanosterin waren. Die Phytosterine zugenommen auf eine Überexpression von LAS1 und Phytosterolen von Lanosterin abgeleitet wurden nicht beobachtet, in einer LAS1-k.o.-Anlage. Dies ist die direkte Beweise an, dass die biosynthetischen Bahn für Phytosterine über Lanosterin in Pflanzenzellen vorhanden ist. Wir bezeichnen die biosynthetischen Pathway, Phytosterine über Lanosterin "die Lanosterin-Pathway." LAS1 Ausdruck wird durch die Anwendung der Jasmonate induziert werden gemeldet und wird gedacht, um von einer angestammten Cycloartenol Synthase zu einem Triterpenoid-Synthase, z. B. Beta-Amyrin-Synthase und Lupeol Synthase entwickelt haben. In Anbetracht dieser Hintergrund kann der Lanosterin-Stoffwechselweg für die Biosynthese von nicht nur Phytosterine, sondern auch Steroide als Sekundärmetaboliten beitragen.

Nebenschilddrüse Karzinom Mit Anaplastisches Feature: Verband Der P53-Genmutation Mit Anaplastisches Transformation

Pathology International. Feb, 2009  |  Pubmed ID: 19154265

Nebenschilddrüse Karzinom ist eine seltene Neubildungen, die nur 1-3 % der Fälle von primärer Hyperparathyreoidismus ausmacht. Nebenschilddrüse-Karzinom ist ein Liposarkom Tumor, der manchmal schwer zu histopathologically von gutartigen Gegenstück, Nebenschilddrüse Adenom zu unterscheiden ist. Der molekulare Mechanismus der Nebenschilddrüse Karzinogenese ist unbekannt, und Ermittler haben berichtet, dass Anomalien im p53-Gen nicht in anderen menschlichen Krebserkrankungen eine wichtige Rolle in der Nebenschilddrüse Karzinogenese, im Gegensatz zu spielen. Der vorliegende Bericht beschreibt Nebenschilddrüse Karzinom mit anaplastisches Umwandlung von differenzierten Nebenschilddrüse Karzinom bei einem Patienten mit primärer Hyperparathyreoidismus. Nukleare Akkumulation von p53-Protein in anaplastisches Karzinom-Zellen gefunden, aber nicht in differenzierte Karzinom-Zellen. Polymerase-Kettenreaktion-Single-Strand-Konformation Polymorphismus gefolgt von direkter Sequenzierung ergab, dass anaplastisches Karzinom-Zellen eine Missense-Mutation im Codon 248 (CGG zu CAG) des Gens p53, trug während die verbleibenden Karzinom-Zellen differenzierten hatte das Wildtyp p53-Gen. Diese Forschungsergebnisse legen nahe, dass die p53-Gen-Mutation anaplastisches Transformation der Nebenschilddrüse Karzinom zugeordnet ist.

Bewertung Und Charakterisierung Von Bakteriellen Stoffwechsel Dynamik Mit Einem Roman Profilerstellung Technik, Echtzeit-Metabolotyping

PloS One. 2009  |  Pubmed ID: 19287504

Ökologische Prozesse in Ökosystemen sind durch mehrere metabolische Reaktionen in Mikroorganismen, einschließlich intrazelluläre Sensorik und Pumpen, Kampf für das Überleben, und Lieferung von oder Konkurrenz um Nährstoffe dynamisch geändert. Vor allem Darmbakterien pflegen homöostatischen Gleichgewicht bei Säugetieren über mehrere dynamische biochemischen Reaktionen, mehrere Metaboliten aus der unverdaute Nahrung zu produzieren, und diese Metaboliten üben verschiedene Effekte auf Säugetier-Zellen in gewissem Sinne zeitabhängige. Wir haben eine Methode zur Analyse der bakteriellen Stoffwechsel Dynamik in Echtzeit und benutzte es in Kombination mit statistischen NMR-Verfahren.

Korrelation Exploration Der Metabolischen Und Genomische Vielfalt Reis

BMC Genomics. 2009  |  Pubmed ID: 19948071

Es ist wichtig, die Beziehung zwischen metabolische und genomische Vielfalt zu verstehen, die genetischen regulatorischen Netzwerken verbunden mit dem wandelnden Metabolo-Phänotyp unter natürliche Variation bzw. Populationen zu erhellen. Aktuelle Innovationen in Metabolomics-Technologien ermöglichen es uns, die umfassenden Funktionen von das Metabolom zu erfassen. Metabolit quantitative Trait-Analyse ist ein wichtiger Ansatz zur Identifizierung der genetischen Loci Metabolit Variation mit getrennte Populationen beteiligt. Obwohl mehrere Versuche unternommen wurden, Korrelative Beziehungen zwischen genetische und metabolische Vielfalt unter den natürlichen Populationen in verschiedenen Organismen zu finden, ist noch unklar, ob es möglich ist, solche Korrelationen zwischen einzelnen Metaboliten und der Polymorphismen gefunden an jeder chromosomalen Position zu entdecken ist. Um die Korrelative Beziehung zwischen der Vielfalt des metabolischen und genomische gefunden in Reis Beitritte zu beurteilen, verglichen wir die Distanz-Matrizen für diese zwei "Omics"-Muster in die Reis-Beitritte.

Elektiven Stecker Reparatur Von Einem Inhaftierten Obturator Hernie Durch Den Oberschenkel-Ansatz Nach Nichtinvasive Manuelle Reduktion: Bericht über Zwei Fälle

Surgery Today. 2010  |  Pubmed ID: 20107962

Ein Musculus Obturator Hernie ist eine seltene Art von Becken-Hernien, die Darmverschluss verursachen können. Trotz verbesserter bildgebender Verfahren, die uns zu einer präoperativen Diagnostik machen können, wird oft noch Notfall Laparotomie durchgeführt. Wir reparieren diese Hernie wahlweise in zwei älteren Frauen durch die Einfügung von eines Stecker in den Musculus Obturator-Kanal über die Oberschenkel, nach nichtinvasive manuelle Reduktion. Beide Patienten wurden nach der plötzlich auftretende, starke Schmerzen im Oberschenkel oder Leistengegend unsere Notaufnahme gebracht. Die Diagnose wurde bestätigt durch Computertomographie und manuelle Reduktion erfolgte unmittelbar danach. Da beide Patienten Leistengegend Hernie Operation der identische Seite vor durchgemacht hatte, weniger invasive inguinale oder extraperitoneal Ansätze wurden als unmöglich, aber Laparotomie schien auch invasive. Trotz einer unbekannten Feld für allgemeine Chirurgen, gibt der Oberschenkel-Ansatz sehr gut und einfach Zugang zu den Musculus Obturator-Kanal. Die Technik, die wir beschreiben eignet sich besonders für Patienten, die frühere Leistengegend Hernie Operationen unterzogen haben. Wir erwarten, dass diese Methode eine Standardtechnik für Musculus Obturator Hernien ohne abwürgen wird.

Profilerstellung Polar- Und Semipolar Pflanze Metaboliten Im Gesamten Extraktion Verarbeitet Mit Einer Kombinierten Lösung-State Und Hochauflösende Magic-Angle Spinnerei NMR-Ansatz

Analytical Chemistry. Mar, 2010  |  Pubmed ID: 20121204

In metabolische Analysen sollten achten, welche Metaboliten extrahiert werden, aus der Probe und die in der Rückstand bleiben; die verbleibenden Metaboliten werden in der Regel verworfen nach Extraktion. In dieser Studie Kernspinresonanz (NMR)-basierte Metabolomics wurde verwendet, um die Pflanze Metabolitenprofil im gesamten wiederholte Extraktion Prozessen zu visualisieren. Metaboliten in der Extraktion Rückstände (13) C-beschrifteten Arabidopsis Thaliana wurden durch wiederholte Extraktion mit methanol-d(4) und Deuteriumoxid erholt. Die lösliche Extrakte und verbleibende Pellets aus jeden Schritt der Extraktionsprozess wurden durch Lösung-State und hochauflösende Magic-Angle spinning NMR analysiert. Metabolic profiling basierend auf chemischen Verschiebungen in der zweidimensionalen (1) H-(13) C heteronukleare Einzel-Quantum Kohärenz Spektren erlaubt die Aufklärung der sowohl strukturelle als auch chemische Eigenschaften. Neben der Metabolitenprofil scheint es eine Beziehung zwischen Metabolit Struktur und das Verhalten während des gesamten Extraktionsprozesses wiederholte. Diese Ansätze vorschlagen, dass die Metaboliten nicht immer in einem einzigen Schritt extrahiert werden und dass die Verteilung der Metaboliten in einem Szenario mit Extraktion allein aufgrund der Löslichkeit oder Polarität nicht vorhergesagt werden kann. Die Zusammensetzung der alle Metaboliten in den Zellen beeinflusst die Löslichkeit der einzelnen Stoffwechselprodukt; besonderer Aufmerksamkeit sollte so bezahlt werden, da Veränderungen nur ein Teil der Metaboliten die gesamte Metabolitenprofil in einem Lösungsmittel-Extrakt beeinflussen könnte.

Statistischen Indizes Für Gleichzeitige Groß Angelegte Metabolit Erkennungen Für Ein Einzelnes NMR-Spektrum

Analytical Chemistry. Mar, 2010  |  Pubmed ID: 20128615

NMR-basierte Metabolomik ist eine praktische und analytische Methodik zur Entdeckung neuartiger Gene, Biomarker, metabolische Phänotypen und dynamische Zelle Verhalten in Organismen geworden. Jüngste Entwicklungen im NMR-basierte Metabolomics, haben jedoch nicht auf Verbesserungen der Vollständigkeit in Bezug auf die gleichzeitige groß angelegte Metabolit Erkennungen konzentriert. Um dieses Problem zu beheben, haben wir entwickelt und implementiert einen statistischen Index, der SpinAssign p-Wert, in NMR-basierte Metabolomics für groß angelegte Metabolit Anmerkung und veröffentlicht diese Informationen. Es ermöglicht die gleichzeitige Annotation von mehr als 200 Kandidaten-Metaboliten aus dem einzigen (13) C-HSQC (heteronukleare einzelnen Quanten-Kohärenz) NMR-Spektrum einer einzigen Stichprobe von Zelle-Extrakt.

Überwachung Neuansatz Für Metabolische Dynamics in Mikrobiellen Ökosysteme Mit Stall-Isotop-beschriften-Technologien

Journal of Bioscience and Bioengineering. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 20541122

Wir haben einen neuen Ansatz für die Überwachung der metabolischen Dynamik in mikrobiellen Ökosysteme mit einer Kombination von DNA-fingerprinting und Metabolom-Analyse basierend auf testing-Isotop-beschriften-Technologien entwickelt. Testing-Isotop Sondierung der DNA (DNA-SIP) wurde zuvor für die Bewertung der Kreuz-Fütterung in mikrobielle Gemeinschaften eingesetzt. Für die Entwicklung und Validierung unserer Überwachung Ansatzes fäkale Microbiota wurden analysiert mit Stall-Isotop-beschrifteten Glucose als einziger Kohlenstoffquelle verwendet. Um die metabolische Informationen und die mikrobielle Variabilität zu verbinden, führten wir metabolische mikrobielle Korrelationsanalyse basierend auf Kernspinresonanz (NMR) Profile und Denaturierung gradient Gel-Elektrophorese (DGGE)-Fingerabdrücke, die erfolgreich die Verwendung von Glukose-Bakterien und deren verwandten extrazellulären Metaboliten identifiziert. Darüber hinaus unser Ansatz offenbart Informationen bezüglich der CO2-Flux, denn von die "erste" Welle der extrazellulären Metaboliten ausgeschieden die Verwendung von Glukose-Bakterien wurden in der "sekundäre" Fraktion der Substrat-Nutzung Bakterien aufgenommen, und, dass diese "sekundären" Gruppe weiter ihre eigenen Sekundär produziert metabolisiert Substrate. Daher dieser Ansatz ist ein leistungsfähiges Werkzeug für die Überwachung der metabolischen Dynamik in mikrobiellen Ökosysteme und die Verfolgung von der Kohlenstoff-Flux innerhalb einer mikrobiellen Gemeinschaft ermöglicht.

Ein Fall Von IgA-bezogene Enteropathie Kompliziert Mit Magen-Darm-Blutungen Und Progressive IgA-Nephropathie: Eine Mögliche Variante Henoch-Schönlein Purpura?

Internal Medicine (Tokyo, Japan). 2010  |  Pubmed ID: 20720354

Hier berichten wir einen erwachsenen Patienten mit IgA-bezogene Enteropathie kompliziert mit massiven intestinale Blutungen und akutes Nierenversagen, aber ohne Hautläsionen. Chirurgische Resektion des Dünndarms und Steroid-Puls-Therapie durchgeführt wurde. Histopathologie ergab bedeutende Ablagerungen von IgA und C3 in den kleinen Blutgefäßen der Darm und die Niere Mesangium. Obwohl Haut Purpura abwesend war, schlug der Histopathologie und klinische Manifestationen die Pathophysiologie Henoch-Schönlein Purpura (HSP), was bedeutet IgA-bezogene Enteropathie als eine Unterklasse von HSP ähnlich war. Retrospektive Analyse zeigt, dass terminal Ileum Läsionen ein schlechter prognostischer Indikator sein können.

Auswirkungen Der Verschiedenen Elastomer-Formulierungen Auf Feuchtigkeit Permeation Durch Stopper Verwendet Für Lyophilisierte Produkte Unter Feuchten Bedingungen Gelagert

PDA Journal of Pharmaceutical Science and Technology / PDA. Jan-Feb, 2010  |  Pubmed ID: 21502005

Der Zweck dieser Studie war es, die Wirkung der Feuchtigkeitsdurchlässigkeit von verschiedenen Elastomer Formulierung stopfen, die unterschiedliche Feuchtigkeit Absorption Fähigkeiten hatte, auf die Erhöhung der Feuchtigkeitsgehalt innerhalb lyophilisierte Vials während der langfristigen Lagerung unter feuchten Bedingungen zu bewerten. Zwei verschiedene Elastomer Formulierung Stopper (hoher Feuchtigkeit und niedrig-Feuchtigkeit Aufnahme Stopper) wurden verglichen. Die erhöhte Menge an Feuchtigkeit-Inhalt innen lyophilisierte Fläschchen mit hoher Feuchtigkeit Stoppern ausgestattet war höher als diejenigen mit geringer Feuchtigkeit Stopper während der frühen Phase der Speicher ausgestattet. Allerdings kehrte sich dieser Trend in der späteren Phase des Speicher. Unsere Daten zeigen, dass die Erhöhung der Feuchtigkeit im Inneren die lyophilisierten Fläschchen im frühen Stadium wurde verursacht durch Feuchtigkeit-Übertragung aus der Stopper, während die spätere Feuchtigkeit zu erhöhen wurde von äußerer Feuchtigkeit Permeation durch den Pfropfen verursacht. Ergebnisse zeigen, dass der Unterschied im Profil Aufnahme Feuchtigkeit im Inneren die lyophilisierten Fläschchen auf jeden Zeitraum der Speicherung von Feuchtigkeit-Aufnahme-Fähigkeit und Feuchtigkeit Permeation Fähigkeit von die zwei Elastomer-Formulierung-Stopper verursacht wurde. Im Hinblick auf die langfristige Lagerstabilität unter feuchten Bedingungen zeigen unsere Daten, dass äußerer Feuchtigkeit durchdringt durch den Stopfen in die lyophilisierte Fläschchen während der späten Phase der wichtiger Faktor war. Darüber hinaus wurde der Anstieg der Feuchtigkeitsgehalt im frühen Stadium von stopfen Trocknungszeit kontrolliert. Darüber hinaus stopfen Trocknungszeit nicht auf Feuchtigkeit Permeation im späten Stadium auswirken. Feuchtigkeit Permeation während der Lagerzeit wird der verschiedenen Elastomer Formulierungen der Stopper abhängig zu sein. Die Feuchtigkeit-Permeation von verschiedenen Elastomer-Stopper war ein wichtiger Faktor im Hinblick auf die erhöhte Feuchtigkeit-Inhalt in die lyophilisierten Fläschchen während der späten Phase der langfristigen Lagerung unter feuchten Bedingungen. Für lyophilisierte Produkte bei Zimmertemperatur gelagert ist die Feuchtigkeit Permeation Fähigkeit der Stopper einer der wichtigsten Faktoren für langfristige Lagerstabilität.

Redox-abhängige Domäne Neuordnung Der Protein-Disulfid-Isomerase Gekoppelt Mit Der Exposition Der Substrat-Bindung Hydrophoben Oberfläche

Journal of Molecular Biology. Feb, 2010  |  Pubmed ID: 19944705

Protein-Disulfid-Isomerase (PDI) ist ein wichtiger Protein in der Endoplasmatisches Reticulum, als eine wesentliche Faltreifen Katalysator und Molekulare Chaperone für Disulfid-haltige Proteine durch katalysieren die Bildung, Umlagerung und Bruch von ihrer Disulfidbrücken. Dieses Enzym hat eine modulare Struktur mit vier Thioredoxin-ähnlichen Domänen, a, b, b', und ein ', zusammen mit einem C-Terminal-Erweiterung. Die Homologen a und a' Domänen enthalten ein Cystein-paar in ihrer aktiven Site unmittelbar mit Thiol-Disulfid Austausch Reaktionen, während die b' Domäne vermeintlich stellt einen primären Bindungsstelle für unstrukturierte Regionen von der Substrat-Polypeptiden. Wir berichten hier, ein Redox-abhängige intramolekulare Umlagerung des b' und einem ' Domänen von PDI aus Humicola Insolens, thermophilen Pilze, verdeutlicht durch kombinierte Verwendung der Kernspinresonanz (NMR) und Small-Angle x-ray Streuung (SAXS) Methoden. Unsere NMR-Daten zeigten, dass die Substrate gebunden an eine hydrophobe Oberfläche auf diese beiden Bereiche, die mehr das Lösungsmittel bei der Oxidation von der aktiven-Site der ausgesetzt wurde die eine ' Domäne. Die Wasserstoff-Deuterium-Austausch und Entspannung-Daten angezeigt, die den Redox-Zustand des die eine ' Domäne beeinflusst die dynamischen Eigenschaften des b' Domäne. Darüber hinaus ergab die SAXS-profile die Oxidation von der eine ' aktive Website führt dazu, dass Rassentrennung zwischen den beiden Domänen. Auf der Grundlage dieser Daten schlagen wir eine mechanistische Modell PDI Handelns; die eine ' Domäne überträgt seine eigene Disulfidbindung in das entfaltet Protein in der hydrophoben Oberfläche der Region Substrat-Bindung, die folglich ändert sich in eine "geschlossene" Form, die Freigabe des oxidierten Substrats untergebracht.

Dynamische Omics Ansatz Identifiziert Ernährung-vermittelte Mikrobielle Interaktionen

Journal of Proteome Research. Feb, 2011  |  Pubmed ID: 21058740

"Omics" Studien bisher gemeldet haben entweder gründlich zeichnen sich einzelnen Arten behandelt oder schlecht erforscht Meta-mikrobielle Gemeinschaften. Diese Techniken sind jedoch sehr informative Daten für die Analyse der Wechselwirkungen zwischen zwei Organismen produziert. Wir die bakterielle Wechselwirkung zwischen Escherichia coli O157: H7 (O157) und Bifidobacterium Longum (BL) als pathogener Kommensale bakterielle Modell erstellen eines minimalen mikrobiellen Ökosystems im Darm mit dynamischen Omics Ansätzen, bestehend aus verbesserte Zeitraffer 2D-nukleare magnetische Resonanz (NMR) metabolische Profilerstellung, Transcriptomic und Proteomic Analysen geprüft. Unsere Studie ergab, dass das minimale Ökosystem durch bakterielle Anpassung an die Veränderungen der extrazellulären Umwelt, hauptsächlich von O157 wurde, aber nicht durch BL. Darüber hinaus die Beziehung zwischen BL und O157 teilweise werden zwischen Produzent und Verbraucher von Nährstoffen, bzw. insbesondere Serin und Aspartat-Stoffwechsel angesehen könnte. Zusammengenommen bieten unsere Profilsystem neue Einblicke in die primäre metabolische Dynamik in mikrobiellen Ökosysteme.

Die Circadiane Clock Moduliert Wasser Dynamik Und Aquaporin Ausdruck in Arabidopsis Wurzeln

Plant & Cell Physiology. Feb, 2011  |  Pubmed ID: 21186174

Wir haben eine Pflanze Wachstum System Wasser-Dynamik in die Wurzeln von einer kleinen Modellpflanze Arabidopsis Thaliana, Kernspinresonanz (NMR) mikroskopische Bildgebung analysieren entwickelt. Mit die zweidimensionalen Slice-Technik, erhielten wir eine Reihe von Bildern mit hohen Signal-Rausch-Verhältnis angibt, die Wasserverteilung im Stamm. Um leichte Regulierung der Wassertransport im Stamm und Einbeziehung der Aquaporin-Genexpression zu demonstrieren, wir visualisiert die Verteilung des Wassers in Arabidopsis Wurzeln unter verschiedenen Lichtverhältnissen und verglichen die Daten mit den Ausdruck-Profilen der beiden Aquaporin-Gene. (1)H-NMR-Bildgebung ergab, dass Wassergehalt in Arabidopsis Wurzeln in das Licht als in der Dunkelheit tiefer liegt. Diese tagaktiven Variation im Wassergehalt wurde eindeutig in der basalen Zone des Stamms beobachtet. Darüber hinaus wurde ein autonomer Rhythmus Wasser Dynamik unter Dauerlicht (LL) und Finsternis (DD) beobachtet. Jedoch war die circadiane Schwankung in Wasser Dynamik in den frühblühenden 3 (elf3) Mutanten unter LL verdeckt. Der Ausdruck der beiden Aquaporin Gene, AtPIP1; 2 und AtPIP2; 1, hin-und hergerissen mit dem zirkadianen Rhythmus unter LL Bedingungen in Wildtyp Sämlinge, aber nicht in den elf3-Mutanten. Diese Ergebnisse zeigen die Vorteile unserer Technik zur Überwachung von Wasser Dynamik in Wurzeln von Arabidopsis Sämlinge Leben, und schlagen vor, daß die circadiane Uhr Wasser-Dynamik und Aquaporin-Ausdruck moduliert.

Bewertung Eines Semipolar Solvent Systems Als Einen Schritt in Richtung Heteronukleare Mehrdimensionale NMR-basierte Metabolomics Für 13C-beschrifteten Bakterien, Pflanzen Und Tiere

Analytical Chemistry. Feb, 2011  |  Pubmed ID: 21208007

Kernspinresonanz (NMR) hat zu einer Schlüsseltechnologie in Metabolomics, mit der Verwendung von stabilen Isotop beschriften und erweiterte heteronukleare mehrdimensionale NMR-Techniken. In diesem Papier konzentrieren wir uns auf die Bewertung der Extraktionslösungsmittel, NMR-basierte Methoden zur Metabolomics zu verbessern. Ausweitung der Linie ist ein ernstes Hindernis für die Erkennung von Signalen und die Anmerkung von Metaboliten mit mehrdimensionale NMR. Wir evaluieren einer Reihe von NMR-Lösemittel für einfache und vielseitige Einzelschritt Extraktion mit Hilfe der (13) C-beschrifteten photosynthetische Bakterium Rhodobacter Sphaeroides, die zeigt ausgeprägte Erweiterung der NMR-Signale. Die Leistung der einzelnen Extraktionslösung gerichtet wurde, mit 2D (1) H-(13) C heteronukleare single Quanten-Kohärenz (HSQC)-Spektren, unter Berücksichtigung der drei Kriterien: (1) Verteilung von die Linienstärke in halber Höhe (2) die Anzahl der Signale zu beobachten, und (3) die insgesamt beobachtet Signalintensität. In Anbetracht der Rang Gesamtwerte für die drei Metriken wählten wir methanol-d(4) (MeOD) als ein semipolar Extraktionslösung, die kann die Linienbreite ausreichend schärfen und bietet bessere NMR-Spektren. Wir evaluieren auch die Reihe der Extraktionslösungsmittel mittels induktiv gekoppeltem Plasma optische Emission-Spektroskopie (ICP-OES) basierte Ionomics Ansatz. Auch wurde darauf hingewiesen, dass MeOD nützlich für das Ausschließen von paramagnetischen Ionen sowie Makromoleküle in eine einfache Einzelschritt-Extraktion. MeOD Extraktion schien auch effektiv für andere bakteriellen und tierischen Proben. Ein weiterer Vorteil dieses semipolar Lösungsmittel ist, dass es das wässrige (polar) Puffersystem berichtet von vielen Gruppen ergänzt. Die flexible und angemessene Anwendung der Polar- und semipolar Extraktion sollte die groß angelegte Analyse von Metaboliten beitragen.

Bifidobakterien Kann Vor Enteropathogener Infektion Durch Produktion Von Acetat Schützen

Nature. Jan, 2011  |  Pubmed ID: 21270894

Der menschliche Darm ist mit einer Vielzahl von Mikroorganismen, einschließlich Arten, wie die der bakteriellen Gattung Bifidobacterium, die positive Wirkung auf die menschliche Physiologie und Pathologie haben kolonisiert. Zählen Sie die markantesten Vorteile der Bifidobakterien Modulation der Host Verteidigung Antworten und Schutz vor Infektionskrankheiten. Dennoch haben die molekularen Mechanismen dieser Effekte kaum geklärt. Um diese Mechanismen zu untersuchen, haben wir die Mäuse, die bestimmte Bifidobacterial-Stämme und ein vereinfachtes Modell der tödliche Infektion mit enterohämorrhagischen Escherichia coli O157: H7, zusammen mit einem integrierten 'Omics'-Ansatz zugeordnet verwendet. Hier zeigen wir, dass Gene eine ATP-Bindung-Kassettengeräte Kohlenhydrat-Transporter in bestimmte Bifidobakterien vorhanden einen Beitrag zum Schutz der Mäuse gegen den Tod von E. Coli O157: H7 induziert. Wir fanden, dass dieser Effekt zurückgeführt werden kann, mindestens im Teil, zu erhöhte Produktion von Acetat und die Umsiedlung der E. Coli O157: H7 Shiga Toxin aus dem Darm-Lumen zum Blut gehemmt wurde. Wir vorschlagen, Acetat, produziert von schützenden Bifidobakterien verbessert die intestinale Verteidigung von Epithelzellen vermittelt und damit den Host gegen tödliche Infektion schützt.

Präparation Der Genotyp-Phänotyp-Verbände in Reiskörner Metabolom Quantitative Trait Loci Analyse

The Plant Journal : for Cell and Molecular Biology. Jan, 2012  |  Pubmed ID: 22229385

Eine umfassende und großflächige Metabolom quantitative Trait Loci (mQTL) Analyse wurde durchgeführt, um die genetische Hintergründe zugeordnete metabolische Phänotypen in Reiskörner zu untersuchen. Das Metabolom-Dataset bestand aus 759 Metabolit Signale aus die Körner von 85 Linien von Reis (Oryza Sativa, Sasanishiki × Habataki Rücken gekreuzt Inzuchtlinien) gewonnen. Metabolom Analyse erfolgte mit vier Massenspektrometrie Rohrleitungen zur Erkennung verschiedener Klassen von Metaboliten zu verbessern. Diese mQTL-Analyse einer Vielzahl von Metaboliten markiert eine ungleichmäßige Verteilung der 802 mQTLs auf das Reis-Genom sowie verschiedene Formen der metabolischen Merkmal (m-Zug) Kontrolle unter verschiedenen Arten von Metaboliten. Das Niveau der meisten Metaboliten innerhalb Reiskörner waren sehr empfindlich auf Umwelteinflüsse, aber nur schwach mQTLs zugeordnet. Koordinierte Steuerung wurde für mehrere Gruppen von Metaboliten, beobachtet, wie z. B. Aminosäuren verknüpft mit der mQTL-Hotspot auf Chromosom 3. Für Flavonoide wurde m-Merkmal-Variante unter den experimentellen Linien eng regiert durch genetische Faktoren, die die Glykosylierung der Flavone ändern. Viele Loci, die Auswirkungen auf die Ebenen der Metaboliten von QTL-Analyse erkannt wurden und plausible gen Kandidaten wurden durch in Silico Analyse ausgewertet. Mehrere mQTLs beeinflusst zutiefst Metabolit Ebenen, die Einblick in die Kontrolle der Reis-Stoffwechsel. Genomische Region und Gene möglicherweise verantwortlich für die Biosynthese von Apigenin-6,8-di-C-α-l-arabinoside als Beispiel für eine kritische mQTL der Analyse festgestellten präsentiert werden.

WIRTSCHAFTWISSENSCHAFT: Ein Web-basiertes Toolkit Für Die Untersuchung Des Biomolekularen Webs in Ökosystemen Mit Einem Trans-Omics-Ansatz

PloS One. 2012  |  Pubmed ID: 22319563

Ökosysteme können konzeptionell als Umwelt- und metabolische Verbundnetzen betrachtet werden in denen kleinen Moleküle zu Makro-Moleküle durch vielfältige Netzwerke interagieren. Zustand-of-the-Art Technologien in der postgenomischen Wissenschaft bieten Möglichkeiten zum inspizieren und analysieren diese Biomolekulare Web mit Omics-basierten Ansätzen. Erkunden nützliche Gene und Enzyme sowie Biomasse-Ressourcen verantwortlich für Anabolismus und Katabolismus innerhalb Ökosysteme trägt zu einem besseren Verständnis der ökologischen Funktionen und deren Anwendung auf Biotechnologie. Hier präsentieren wir WIRTSCHAFTWISSENSCHAFT, eine Suite von Web-basierten Tools für Ökosystem Trans-OMICS Untersuchung für durchgeführte metagenomische, Metatranscriptomic und Meta-metabolische Systeme, einschließlich Biomacromolecular-Mischungen, die aus Biomasse abgeleitet. WIRTSCHAFTWISSENSCHAFT besteht aus vier integrierten Webtools. E-Klasse ermöglicht die Sequenz-basierte taxonomische Klassifikation der eukaryotischen und prokaryotischen ribosomal Daten und funktionale Klassifizierung der ausgewählten Enzyme. FT2B ermöglicht die digitale Verarbeitung von NMR-Spektren für nachgeschaltete metabolischen oder chemische pathologies. BM-Char ermöglicht statistische Zuordnung von bestimmten Verbindungen fanden in Lignocellulose-basierte Biomasse und HetMap ist ein Data-Matrix-Generator und Korrelation Rechner, die Trans-Omics Datasets angewendet werden kann, wie durch diese und andere Web-Tools analysiert. Diese Web-Suite ist einzigartig, sie erlaubt die Überwachung der Biomasse Stoffwechsel in einer bestimmten Umgebung, d.h. aus Makromolekulare komplexe (FT2DB und Bm-Char) mikrobiellen Zusammensetzung und Abbau (E-Klasse) und ermöglicht das Verständnis der Beziehungen zwischen Molekulare und mikrobielle Elementen (HetMap). Diese Website ist bei der öffentlichen Domäne verfügbar: https://database.riken.jp/ecomics/.