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Articles by Kimberly L. Mowry in JoVE
머릿속 RNA 현지화에서 Xenopus Oocytes
James A. Gagnon, Kimberly L. Mowry
Department of Molecular Biology, Cell Biology, and Biochemistry, Brown University
의 시각화
Other articles by Kimberly L. Mowry on PubMed
두 번째 분열 하기 전에 발생 하는 프로세스 Xenopus에서 세 번째 분열 방향 결정
Experimental Cell Research. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11855862
마찬가지로 많은 생물 Xenopus laevis 계란 양식 잘 설명된 상호 직교 형상에서의 처음 세 개의 분열 비행기. 이 간단한 패턴을 지시 하는 요소는 명확 하 게 확인 하지 못했습니다. 여기, 우리는 새로운 접근 방식으로 정적 자기장을 사용 하 여 이러한 요소에 대 한 새로운 통찰력을 제공 하는 정상적인 분열 형상을 교란 실험, 설명. 우리는 분열 및 셀 모양을 변경 하지 않고 그들의 명목상 오리 엔 테이 션에 거의 수직으로 정렬 세 번째 분열 비행기에서 자기장 적용 중 하나 또는 둘 다 처음 두 셀 사이클 3 세포 주기 mitotic 기구 (MA)을 일으킬 수 보여줍니다. 이 결과 처음 두 셀 사이클 중에 주로 발생 하는 프로세스 지시 세 번째 분열 평면과 mitotic 기구 방향을 나타냅니다. 우리가 논의 어떻게 형성은 후 엄마를 정렬할 수 있는 메커니즘이이 시스템에서 분열 형상을 결정 하는 데 보조 중요성의 될 가능성이 있습니다.
Xenopus Oocytes 식물성 피 질에 세균 층 Determinants 지휘 합의 RNA 신호
Developmental Biology. Aug, 2002 | Pubmed ID: 12142022
RNA 지역화는 초기 배아에서 세포질 다양 성과 극성을 생성 하기 위한 중요 한 메커니즘입니다. Xenopus, T 기본 녹음 방송 요인 VegT 인코딩 하는 RNA의 올바른 지역화 올바른 공간 조직과 endoderm mesoderm의 정체성에 대 한 필수적입니다. 비록 많은 지역화 된 Rnas에 대 한 지역화 신호는 3' UTR을 확인 한 RNA 지역화 신호를 구성 하는 것에 대 한 통찰력 애매 남아 있습니다. 신호 사이의 가능한 공통 기능 같은 subcellular 영역에 직접 다른 Rnas는 조사, 새롭거나 VegT RNA 지역화 신호의 상세한 분석을 실시 하 고 이야기도 Vg1 지역화 신호에 비해. Oogenesis의 같은 기간 동안 식물성 피 질 두 RNAs 지역화. 우리의 결과 클러스터 중복 단백질 바인딩 모티프와 트랜스 행동 요인의 수준에서 일반적인 RNA 지역화 신호를 권해 드립니다. 우리는 어떤 RNA 지역화 신호 특징 일반적 아닌지 뉴클레오티드 시퀀스 또는 이차 구조 라기보다는, 중요 한 특정 중복 단백질 바인딩 모티프의 클러스터링 하지만 제안 합니다.
명백한 미토 콘 드 리아 비대칭 Xenopus 계란입니다
Developmental Dynamics : an Official Publication of the American Association of Anatomists. Apr, 2003 | Pubmed ID: 12666203
셀 극성 Xenopus laevis 개구리의 알에 동물/식물성 축 명단입니다. 이 축을 따라 모성 세포질 구성 요소 비대칭적으로 분산 하 고 뚜렷한 세포 운명 사양 기반이 되 고 생각 된다. 분자 같은 세포질 구성 요소 id를 확인, 특히 식물성 반구 Xenopus 계란의 얼룩 단일 클론 항 체 사용. 항 원 단백질 Vp67 (67 Kda의 식물성 단백질)은 정화를 통해 확인 된 미토 콘 드리 아 단백질 dihydrolipoamide acetyltransferase, 복잡 한 pyruvate 효소의 구성 요소의 Xenopus 체로 복제 합니다. 미토 콘 드리 아 단백질으로 vp67의 id는 미토 콘 드리 아의 인구는 Xenopus 계란 배포 비대칭적으로 나타낼 수 있습니다.
단백질 키 니 아 제를 인 산화 변조 Polypyrimidine로 바인딩 단백질의 수송
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12851456
이종 핵 ribonucleoprotein 입자 (hnRNP) 단백질 Mrna에 중요 한 역할을 재생할 진핵생물에서 처리 하지만 약간 셀룰러 신호 경로 의해 규제 되는 방법에 대 한 알려져 있다. Polypyrimidine로 바인딩 단백질 (PTB, 또는 hnRNP 나) 대체 이전 mRNA 접합, 바이러스 성 RNA 번역 및 mRNA 지역화의 중요 한 레 귤 레이 터는 이다. 여기 우리가 PTB의 nucleo 세포질 전송 합니다 3', 5'-캠프-종속 단백질 키 니 아 제 (PKA)에 의해 규제 됩니다 보여줍니다. PKA 직접 PTB 보존 Ser-16, phosphorylates 및 PC12 세포에서 PKA 활성화 Ser-16 인 산화를 유도. PTB 알라닌 돌연변이를 Ser 16 들고 핵에서 정상적으로 축적. 그러나,이 돌연변이 단백질 핵에서의 수출 heterokaryon 였죠 분석 실험에에서 크게 줄어듭니다. 반대로, PKA의 촉매 소 단위와 coexpression에 의해 PTB의 hyperphosphorylation 세포질에서 PTB의 축적에 발생합니다. 이 축적은 다시 구체적으로 S16A 돌연변이 의해 차단 됩니다. 마찬가지로 Xenopus oocytes에서 인-Ser-16-PTB는 세포질, 제한 된 반면 비-Ser-16-phosphorylated PTB는 핵. 따라서, Ser-16에서 PTB의 직접 PKA 인 산화 PTB의 nucleo 세포질 분포 변조. 이 인 산화 가능성이 PTB의 세포질 기능에 역할을 한다.
보존 및 클러스터 된 RNA 인식 시퀀스 Xenopus Oocytes에서 RNA 지역화를 지시 하는 신호의 중요 한 기능입니다
Mechanisms of Development. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14706704
그것은 그 자신의 3' untranslated 영역 (UTR) 내 경우 cis-요소의 인식에 의존 subcellular 목적지로 RNA 분자를 대상으로 것은 널리, 비록 상대적으로 작은 기능 기반이 되는 이러한 cis 시퀀스의 특정 기능에 대 한 알려져 있다. 내는 3' UTR 특정 반복된 모티프와 RNA 의무적인 단백질 간의 상호 작용 Xenopus oocytes 식물성 극 Vg1 RNA의 지역화의 중요 한 단계로 제안 되었습니다. 반복 된 지역화 요소 (LE) 시퀀스의 상대적 기여를 이해 하 두 개구리 종, Xenopus laevis Xenopus 리스에서 Vg1 레 비교 분석 기능을 사용 했습니다. 우리는 반복 된 v m 1과 e 2는 모티프의 클러스터는 효율적인 지역화에 필요한 보여줍니다. 그러나, 그룹 혼자 어느 한 사이트의 지역화를 위한 충분 하지 않습니다. 또한, 우리 X. 리스 Vg1 르 X. laevis Vg1 르 같은 집합이 RNA 의무적인 단백질에 의해 인식 되 고 엑스 laevis 생산적인 상호 작용의 수 X. laevis oocytes에서 식물성 지역화를 직접 충분 한로 기계를 수송 하는 증거를 제시. 이 결과 르 내의 cis 연기 사이트의 클러스터링된 세트 직접 지역화 기계와의 특정 상호 작용을 통해 식물성 전송 것이 좋습니다.
핵 RNP 복잡 한 어셈블리 세포질 RNA 지역화를 시작합니다
The Journal of Cell Biology. Apr, 2004 | Pubmed ID: 15096527
Mrnas의 세포질 지역화 셀 극성을 생성 하는 광범위 한 메커니즘은와 배아 개발 패턴화 하기 위한 기초를 제공할 수 있습니다. 눈에 띄는 예로 Xenopus oocytes 모성 Mrnas의 지역화, 지역화 기계류의 단백질 구성 요소 시퀀스를 필수적인 RNA의 인정을 요구 하는 프로세스. 그러나, 그것은 아직 명확한 방법 및 시기 등의 단백질 요소 지역화 RNAs RNA 전송 수행 하 연관 하지입니다. RNA 지역화를 중재 하는 RNA-단백질 상호 작용을 추적 하는 우리는 핵과 세포질에서 RNP 단지를 분석 했다. 우리는 지역화 통로의 초기 단계는 핵에서 특정 RNA 의무적인 단백질에 의해 지역화 Rnas의 인식 찾으십시오. 세포질에 전송 후 RNP 복잡 한 개조 및 추가 전송 요소 모집. 이 결과 세포질 RNA 지역화 핵에서 시작 하 고 핵에서 특정 RNA 의무적인 단백질 바인딩 대상 RNAs 세포질에서 적절 한 대상으로 행동 수 있습니다 것이 좋습니다.
Xenopus 벨기에 Ribonucleoprotein Vg1 RNA와 Kinesin이 포함 된 복잡 한 구성 요소입니다
Development (Cambridge, England). Jul, 2004 | Pubmed ID: 15163628
RNA 지역화는 생물의 다양 한 셀 및 발달 극성을 생성 하기 위한 주요 메커니즘입니다. 우리는 이중 가닥 RNA 의무적인 단백질 벨기에를 oogenesis 동안 RNA 지역화에서 Xenopus 체의 역할을 조사 하는 연구를 수행 했습니다. 우리 Xenopus 벨기에 (XStau) 복잡 한, ribonucleoprotein에 존재 하 고 모두는 kinesin 모터 및 vegetally 지역화 RNAs Vg1 단백질과 VegT 연결 발견 했습니다. Xstau에 대 한 기능적 역할 Vg1 RNA vivo에서 지역화를 차단 하는 지배적인 부정적인 버전의 식을 통해 밝혀졌다. 우리의 결과 Xenopus oocytes에서 RNA 지역화에 Xstau에 대 한 중심 역할을 제안 하 고 벨기에 특정 Mrnas와 RNA 지역화 기계 사이의 보존된 링크입니다 증거를 제공.
함정 및 연관 Endoplasmic 그물을 통해 Xenopus Oocytes에서 미토 콘 드리 아 구름 Rnas의 지역화
Molecular Biology of the Cell. Oct, 2004 | Pubmed ID: 15292452
Xenopus 세균 세포 계보의 유래는 별개 "미토 콘 드리 아 구름" 내에서 세균 혈장 상속 지정 (MC) previtellogenic oocytes에서. 세균 혈장 Xcat2 및 Xdazl을 포함 한 생식 세포 개발에 연루 지역화 RNAs 포함 되어 있습니다. 라이브 confocal 영상 적용 우리는 Rnas는 엠씨 지역화 초기 통로의 메커니즘을 이해, photobleaching 분석 oocytes 형광 xcat2와 microinjected 및 Xdazl RNA 생성. 이러한 RNAs 보급을 통해 세포질에 걸쳐 균등 하 게 분산 하 고 점차적으로 움직이지 되었다 고 MC에 MC. 함정에 형성된 된 집계 microtubule 혼란에 의해 방해 하지는 새싹과 립에 지역화 요구 하지 않았다. 움직이지 RNA 구조 codistributed 및 Dil16(3) 라벨 및 면역 형광 분석으로 밝혀는 MC에 집중 되어 밀도가 포장된 endoplasmic 그물 (응급실)로 조율 된 움직임을 보였다. Vg1RBP/베라 단백질, 식물성 ER에 늦은 통로 RNAs 연결에 연루 되어있다, 특히 모두 야생-타입 Xcat2 3' 맞이 지역 및 지역화 결함 구조 표시 했다. 생 Vg1RBP/베라와 Vg1RBP/베라-녹색 형광 단백질 주로 MC에서 제외 하지만 이후에 식물성 피 질에 ER xcat2와 codistribute를 찾았습니다. 우리는 그 세균 선 RNAs 엠씨로 응급실 Vg1RBP/베라-독립 협회와 관련 된 확산/함정 메커니즘을 통해 지역화 결론.
적절 한 시기에 적절 한 장소에 RNAs 퍼 팅: 개구리 Oocyte RNA 지역화
Biology of the Cell / Under the Auspices of the European Cell Biology Organization. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15601255
지역화 많은 개발 생물 모성 Mrnas의 oogenesis 및 embryogenesis 중 패턴화 하는 동안 초기 극성 모두에 대 한 기초를 제공합니다. 이 현상의 저명한 예 Xenopus laevis, 지역화 된 모성 mRNAs 동물/식물성 축 따라 발달 극성을 생성 하는 어디에서 찾을 수 있습니다. 특정 subcellular 지역에 mRNA 분자의 유전자 발현의 공간 규정에 대 한 근본적인 메커니즘 이며 내부 분자 경로 정의에 상당한 진전이 이루어졌습니다.
Ribonucleoprotein RNA 지역화 하는 동안 리 모델링입니다
Differentiation; Research in Biological Diversity. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17381548
세포질 RNA 지역화 이산 subcellular 위치로 단백질 식이 제한 하 여 극성을 만드는 수단 이다. RNA 지역화는 특정 거래 요인에 의해 RNA 내에서 cis 연기 시퀀스의 인식으로 시작 하는 다단계 프로세스 및 RNAs RNA와 수많은 단백질 구성 요소를 모두 포함 하는 ribonucleoprotein (RNP) 단지에 지역화 됩니다. 지역화 기계의 구성 요소는 RNP 복잡 하 고, 뚜렷한 subcellular 영역에 translationally 억압 된 상태에서 일반적으로 공간적으로 제한 된 유전자 발현의 결과 전송 합니다. 최근 노력을 두는 cis-와 트랜스-요소 식별 RNA 지역화에 필요한 지역화 하는 동안 개조 하는 RNA-단백질 상호 작용 해명 했습니다.
PTB/hnRNP 나는 RNP Xenopus Oocytes에서 RNA 지역화 하는 동안 리 모델링에 대 한 필요 합니다
Molecular and Cellular Biology. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18039852
세포 세포질 내에서 정의 된 영역을 특정 Mrnas의 전송 셀 및 발달 극성을 규제 하는 근본적인 메커니즘입니다. Xenopus oocyte Vg1 RNA 인코딩된 단백질의 지역화 식은 배아 극성에 대 한 중요 한 식물성 세포질에 수송 된다. Vg1 지역화 통로 Vg1 RNA 내에서 주요 모티프와 그 RNA 시퀀스 인식 단백질 요소 간의 상호 작용에 의해 지시 된다. 우리는 지역화 통로의 서로 다른 단계를 실행 하 고 발견 Vg1 RNP 세포질 RNA 전송 하는 동안 개조를 RNA-단백질 상호 작용 수 변조 하는 방법을 조사 했습니다. 우리의 결과 연루 두 개의 RNA 바인딩 단백질 Vg1 RNA 지역화, PTB/Hnrnp에서에서 핵심 역할을 내가 하 고,이 과정에서 Vg1RBP/베라. 우리는 보여 PTB/hnRNP Vg1RBP/베라 Vg1 RNA 사이의 상호 작용의 개장에 필요한입니다. 비판적으로,이 리 모델링 이벤트를 차단 하는 돌연변이 또한 RNP 개장 지역화를 위해 필요 하다는 것을 제안 하는 RNA의 식물성 지역화를 제거 하 고.
여러 Kinesin 모터 조정 Xenopus Oocytes에서 Microtubules Subpopulation에 세포질 RNA 전송
Developmental Cell. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18771961
RNA 지역화 셀룰러 비대칭을 생성 하기 위한 널리 보존된 메커니즘입니다. Xenopus oocytes에서 식물성 피 질 Rnas의 microtubule 종속 전송 세균 레이어 패턴화 기초가 되. 비록 kinesin 모터스가이 과정에 연루 되어 microtubule cytoskeleton의 명백한 극성은 대신 빼기 엔드 감독 모터에 대 한 역할을 지적 했다. 이 문제를 해결 하려면 우리 식물성 RNA 전송 kinesin 모터 참가 분석 하 고 식별 Xenopus kinesin-1에 대 한 직접 역할. 또한, vivo에서 간섭 및 생화학 실험 여러 자동차, 특히 kinesin 1과 kinesin 2 키 기능을 공개 하 고 전송 하는 동안 이러한 모터 작용 될 수 있습니다 것이 좋습니다. 비판적으로, 우리와 microtubules 플러스 식물성 피 질에서 끝나는 subpopulation 식물성 RNA 전송에서 이러한 kinesin 모터에 대 한 역할을 지 원하는 발견 했습니다. 이러한 결과 이해를 위한 새로운 기계 기초 감독 세포질 내 RNA 전송 제공.
미 숙 Xenopus Laevis Oocytes에서 높은 활성 셀 무료 번역 시스템의 준비
Methods (San Diego, Calif.). May, 2010 | Pubmed ID: 20123127
최근 몇 년 동안에서 많은 감시를 받고 온 유전자 발현의 post-transcriptional 컨트롤의 메커니즘을 이해. 이 분야에서 중요 한 질문은 특정 Mrnas의 번역 활성화 또는 지정 된 셀에 공간적으로 그리고 일시적으로 억압 어떻게. 개구리 Xenopus laevis의 oocytes에서 다양 한 mRNAs 일찍 oogenesis 및 이후 나중 단계에서 번역. 우리 번역 연구 및 exogenous와 내 생 Mrnas의 변환 제어에 적용 되는 oogenesis의 초기 단계에 oocytes에서 높은 활성 셀 무료 번역 시스템을 개발 했습니다.
Xenopus Oocytes에서 MRNA 지역화의 시각화입니다
Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21431735
Vivo에서 mRNA 지역화의 시각화 전송 메커니즘의 이해 단계를 위한 도구를 제공합니다. 여기 우리가 놓여있는지 mRNA 성적 증명서 표기 및 Xenopus laevis oocytes 이미징 confocal 현미경 검사 법에 의해 뒤에 microinjecting의 방법을 자세히 설명 합니다. 이 기술은 고해상도 mRNA 지역화 시각화의 신속한 방법을 제공 하면서 개구리 oocyte에서 RNA를 이미징의 중요 한 장애물을 극복 했다.
분자 모터: RNA 지역화 하는 동안 트래픽을 지시 합니다
Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. Jun, 2011 | Pubmed ID: 21476929
RNA 지역화, subcellular 특정 영역의 RNA의 농축은 다양 한 시스템 설립 및 셀룰러 극성의 유지 보수에 대 한 메커니즘입니다. 궁극적으로, 공간적으로 제한 하는 유전자 발현에 대 한 보편적인 방법을 발생 합니다. RNA 지역화의 결과 단순, 편광된 전송 수행 하는 메커니즘의 많은 애매 남아 있다. 여러 최근 연구는 분자 모터 단백질 RNA 지역화 하는 과정에서 재생할 역할 조명 있다. 이러한 연구는 복잡 한 메커니즘 하나 이상의 모터 단백질의 조율 된 행동 RNAs 그들의 최종 목적지에 직접 지역화 프로세스의 다른 부분에서 작동할 수 있습니다 밝혀 있다. 이 리뷰에서 우리 통로 RNA의 감독된 움직임을 제어 하는 메커니즘을 명확히 하기 위해에서 여러 다른 시스템에서 최근 연구 결과 대해.
