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Articles by Liyun Zhang in JoVE
JoVE General
ゼブラフィッシュ胚眼の組織の顕微解剖
Department of Biological Sciences, Purdue University
この記事では、1〜3日postfertilizationの胚から、接続されている網膜色素上皮がある場合とない場合のゼブラフィッシュ網膜を顕微解剖するアプローチを説明します。
Other articles by Liyun Zhang on PubMed
エコ環境進化、制御、および排除 Aibi 株だ湖流域の調整。
排除 aibi 株だ湖北新疆の乾燥地が独特の湿地乾燥地生態系の典型的な湖です。乾燥機と人間活動の妨害になって気候のため、排除 aibi 株だ湖流域のエコ環境が悪化していています。それあった植生カバー、植物種と、流域における土壌の理化学的性質の時空変化我々 の研究でわかった。沖積河川平野の上部のセクションでは、砂漠の草原マッテオーニ、ヨモギ属のいくつかの 50 ％ の植生カバーで開発されています。Haloxylon ammodendron 砂漠植生カバー付け下のセクションのいくつかの 60 ％ を占めています。集中的な人間の妨害とこれらの地域で植生年次植物錯体の草本植生に低下しました。沖積河川のファン、湖畔や川口参加湖、異なる azonal 植生ヨシ ヨシ湿原周辺の地域の余白で、ヨシ ヨシ草原とタマリクス低木がいくつかの 80 ％ の植生カバーを開発しました。重い、salinized の土地に Halocnemum strobilaceum によって支配したジューシーな塩生植物の砂漠の植生は 10-15% の小数のキャノピー カバーで形成しています。Haloxylon 形態、Aristida pennata、他の種と植生カバー 30 〜 50 ％ の湖の周辺に砂の砂漠地帯で育ちます。1950 年代のとは対照的に、植生カバー、よどんだ周りと川のデルタでは幾分増加している;ただし、植生カバー、湖の周囲が減少しており、植物種がまだ劣化しています。土地は湖の風下側に微粒子を蓄積してきたに対し、植生保護を失っている表面の土壌の風上領域及び乾燥軟弱地盤が粗いとなっています。1980 年代とは異なり、土壌有機物は著しく減少しています。精河県・ ボレ市最後の 20 年間で増加ほこりを漂流の日数を示す気象データの解析。調査では、集中的に開発された土地、裸軟弱地盤、耕作放棄地大量のほこりを漂流のための材料を提供することを発見しました。結論としては、不適切な人間の活動から生じるエコ環境劣化を考慮し、土地利用調整と粉塵制御のための勧告を出した。
コンフォメーションと Acutolysin D アメリカマムシ属ヒャッポダ毒からの活性に対する金属イオンの影響
Acutolysin D、アメリカマムシ属ヒャッポダ毒から分離された著しい出血と蛋白分解の活動を持っています。分子の重量と吸収係数 (は、(1%)(280)) acutolyisn D は、それぞれ ± 8 amu 47,850 と質量分析計および紫外線スペクトルによって 9.3 であると判断されています。コンホメーションに対する金属イオンの効果と活動 acutolysin D の次の蛍光, 円二色性および生物活性測定により調べた。Acutolysin D には、2 つの Ca(2+) 結合部位と原子吸光分光光度計により決定される 2 つの Zn(2+) 結合部位が含まれています。Zn(2+) は acutolysin D の酵素活性のために不可欠ですしかし、1 mM Zn(2+) の存在はその caseinolytic の活性が大幅に減少、組み込みの蛍光強度は pH 9.0 Zn(OH)(2) による沈殿形成。カルシウムは acutolysin D の構造の整合性のために重要であり、1 mM カルシウムの存在は caseinolytic、その活動を著しく高めます。興味深いことに、Cu(2+)、Co(2+)、Mn(2+) または Tb(3+) によって部分的に抑制され、Cd(2+) によって完全に阻害した caseinolytic 活動 Mg(2+) によって強化です。Cu(2+)、Co(2+)、Cd(2+) または Mn(2+) が、どちらもカルシウム、Mg(2+)、また Tb(3+) の存在下で蛋白質の蛍光強度が減少します。Zn(2+), カルシウム, Mg(2+), Cu(2+), Mn(2+), Co (2++) と Tb(3+) その二次構造内容の若干の効果があります。さらに、Cd(2+) は、逆平行 β シートの内容を顕著に増加 45.5% から 60.2% にします。
ANP T2238C、C 664 G 遺伝子多型と冠状動脈性心臓疾病の中国の人口。
心房性ナトリウム利尿ペプチド (ANP) ポリモーフィズムと冠状動脈性心臓病 (CHD) の間の中国の人口を検討しました。ANP T2238C と ANP C 664 G の遺伝子型はポリメラーゼの連鎖反応と制限断片長ポリモーフィズム (PCR-RFLP) メソッド 158 連続した冠動脈疾患患者と 165 コントロールによって検出されました。冠動脈疾患のグループでの A2A2 遺伝子型の分布が対照群より有意に高かっただったことが見つかりませんでした (P < 0.05). 段階的なロジスティック回帰分析を明らかにした男性、禁煙、歴史性高血圧症、糖尿病の歴史、高血圧、血清コレステロールおよび ANP T2238C ポリモーフィズムの高レベルの家族歴冠動脈疾患患者の可能性のリスク要因いたこと （P < 0.05). ただし、冠動脈疾患患者と ANP C 664 G ポリモーフィズムの分布の対照群と有意差があった (P 目 0.05)。A2A2 T2238C 遺伝子型冠動脈疾患の危険因子のあることが示唆された (P < 0.05、または: 1.80、95 %ci: 1.03 の 3.15)。
カルシウム イオンによる安定化と蛍光分光によるアメリカマムシ属ヒャッポダ毒から Agkisacutacin のリフォールディングします。
アメリカマムシ属ヒャッポダ毒から分離された Agkisacutacin は血液凝固因子 IX/凝固因子 X 結合タンパク質と抗凝固と血小板変調活動マークです。カルシウム イオンによる安定化と Agkisacutacin のリフォールディング蛍光測定を次で研究されてきた。カルシウム イオンだけでなく GdnHCl 変性に対する agkisacutacin の構造安定性を高めるが、またそのリフォールディングを誘発します。GdnHCl 誘起 apo agkisacutacin と精製 agkisacutacin のアンフォールディングはシングル ステップ プロセスがない検出中間状態です。カルシウム イオン agkisacutacin の構造の安定化が重要な役割を再生します。Ca(2+) 安定化 agkisacutacin GdnHCl 変性 apo agkisacutacin より高い耐性を示します。単 1 mM カルシウム イオン、変性剤の濃度を変更することがなく追加して展開の apo agkisacutacin のリフォールディングを誘発することが可能です。Ca(2+) 誘起リフォールディングのキネティックの結果 agkisacutacin 少なくとも 2 つのリフォールディング フェーズから成りますと Ca(2+) 誘起リフォールディングの最初のフェーズは、コンパクトな Ca(2+) バインディング サイト地域の形成を含むべきであるし、その後、タンパク質をさらにネイティブ構造を形成する構造再編成受ける証拠を提供します。
1 つの注入の応答では、後続の改善としてのインフリキシマブと 3 つのパルスを注入強直性脊椎炎の再発率を予測しています。
本研究の目的は、患者の第 10 週で大幅な改善を導出するかどうかを予測する、インフリキシマブの 3 つの標準的な注入と治療を受けた患者として初期の臨床パラメーターの場合、または注入中止後長い臨床応答があるかどうかを評価するためにだった。60 3 としての患者は、0、2、および 6 週で 3 輸液 5 mg/kg のインフリキシマブを与えられ、順次各注入前に、とも 10 週で評価。彼らの病気の活動になるまでその後、患者による電話インタビュー フォロー アップされた目 60% の基準値。その時点で、病気は再発するいると考えられました。週 2 でだけでなく、ベースライン時の臨床パラメーター解析を週 10、時の改善を予測する可能性がありますまたは遅延の再発を予測する要因を識別に使用されました。プレディクタ 0.75 曲線 （AUC） レシーバー演算子計算 (ROC) を分析したときの下の領域を超えた場合に役に立つと考えられています。ベースライン時のパラメーターは、十分な予測値があります。しかし、ASAS20 （強直性脊椎炎国際ワーキング グループの基準で評価） で週 2 週 10 と、インフリキシマブ 6 週で中止後の臨床応答期間で改善を予測します。インフリキシマブのパルスを 1 つの応答は、後続の応答のベスト予測だけでなく、インフリキシマブ中止後の再発率です。
金属イオンと PH - Acutolysin A アメリカマムシ属ヒャッポダ毒からのコンフォメーション変化を蛍光分光による誘起。
Acutolysin A ヒャッポダと 22 kDa のタンパク質出血と分解酵素の活動をマークですアメリカマムシ属の毒から分離されました。Acutolysin A の構造変化の金属イオンと pH 誘起蛍光と活性測定を次で検討されている.ここでは、ネイティブのホロ acutolysin A 2 つの微妙に異なる立体構造を採用すること事実ネイティブ状態 (Na) 安定 6.0 から 7.0 に低活動とネイティブ状態 b (Nb) 弱アルカリ性 pH 範囲で安定して 7.5 から 9.0 で高活性に弱い酸性 pH の範囲での証拠を提供します。ホロ acutolysin A、最適 pH 8.5 caseinolytic 活動のための最大の蛍光は pH 8.5 で最も安定した構造蛋白質を採用します。Ca 2 +、zn 2 + イオンは pH が誘起変性転移曲線および pH 依存性活性曲線に大きな効果があります。1 MM ca 2 + 酸誘起変性転移曲線とエンドゾーン酸誘起による不活化の曲線の下の pH 値に向かってホロ acutolysin A シフトとアルカリ誘起変性転移曲線とエンドゾーン アルカリ誘起による不活化のより高い pH 値に向かって曲線のシフトの追加。1 MM zn 2 + の添加がまたアルカリ誘起変性転移曲線とエンドゾーン アルカリ誘起不活化曲線より高い pH 値へのシフトし pH 値を下げるため、酸誘起変性遷移曲線をシフト、酸誘発不活性化にはほとんど影響。Ca 2 +、zn 2 + の除去、タンパク質からその ph の感度を高め、酸誘起変性中にその全体的な安定性を大幅に削減します。それはまた、現在から明白であることを仕事無料 zn 2 +-8.0 から 9.0 の pH 範囲における誘導の不活性化は蛋白質の Zn (OH) 2 の析出の影響に起因する必要があります。
ウシ血清アルブミンの蛍光はヒステリシス効果につながる染織 Fe (iii) とウシ血清アルブミンと Fe (iii) の相互作用の酸素依存性酸化。
血清アルブミンは血漿中の最も豊富な蛋白質、鉄は多くの細胞プロセスに不可欠です。ただし、Fe(3+) とヘム無料血清アルブミンとの相互作用は不明であります。ここで無料のヘム BSA 1 つの特定の Fe(3+) 結合部位を持っているという事実の証拠を提供します。Fe(3+) に BSA のバインディングは重要な BSA の Trp 蛍光消光で結果します。平均 Fe(3+) と BSA の相互作用の見かけの解離定数値は、3.46 の x 10(-8) ± 3 × 10(-10) M 37 ℃ で、3.30 の x 10(-8) 5 x 10(-10) M 25 ℃ ± それぞれ、蛍光滴定によって決定しました。50 MicroM Fe(2+) に 1 microM BSA の添加は BSA の蛍光の顕著な履歴効果の結果します。Fe(2+) によって BSA の時間依存性蛍光消光 BSA の Fe(2+) 誘起コンホメーション変化ですが Fe(3+) に Fe(2+) の酸素依存性酸化によって引き起こされるありません。Fe(2+) は Fe(3+) に酸素依存性酸化 BSA Fe(3+) との相互作用によって加速され、広く嫌気条件下で抑制した好気条件下を受けます。BSA - トランスフェリン バインドされた鉄の転送に参加することが示唆されました。
サイトカインの強直性脊椎炎に対するインフリキシマブの監視に役立つと急性相反応物質の同定
最も強直性脊椎炎患者インフリキシマブ治療への明らかな臨床反応を示しているが、かなり個人差があります。現在の臨床評価は大きく主観の患者自己評価を依存するため、高い感度と特異性のマーカーが多く必要です。ここでは、47 強直インフリキシマブの 3 つの標準的なパルスを受けた強直性脊椎炎患者における潜在的なバイオ マーカーを評価しました。各注入前に、と週 10 時に、次に測定した: 22 異なるサイトカイン血清マトリックスメタロプロテイナーゼ-3 (MMP-3） の血小板数 C 反応性蛋白 (CRP) 赤血球沈降速度 (ESR)。初回投与後 2 週間は、非レスポンダーからレスポンダー ESR, CRP, と血小板数の組み合わせ 81.3% の感度と 72.7% の特異性とを区別することを発見しました。各急性相反応物質を単独で使用した場合、区別の力をはるかに少ないでした。22 のサイトカインの間では、血清 IL 1 α の 53.8 ％ で 6 週、感度 84.9 ％ と特異性をもつ非レスポンダーからレスポンダーを区別することができた。滑液レベルとして対応する血清よりもはるかに高い血清 IL 1 α はおそらく共同のコンパートメントから生成されました。インフリキシマブ輸液の血清 MMP 3 レベルの急激かつ大幅なの抑制につながったが、血清 MMP 3 非レスポンダーからレスポンダーを区別しました。潜在的なバイオ マーカーを識別する以外にも、我々 の結果は、また感度と特異度を使用して潜在的なバイオ マーカーの有用性を評価するための有用性を示します。
識別は珍しいことで (D) アメリカマムシ属ヒャッポダ毒由来の多機能の NAD Glycohydrolase パセ様活性。
NAD-分子生物学 (NADases) は NAD glycohydrolase を持っているユビキタスの酵素 ADPR シクラーゼまたはこのモデル加水分解酵素の活動。これらの活動はすべて C N グリコシルトレハ ロース ボンドの NADase 触媒開裂に起因しています。アメリカマムシ属ヒャッポダ毒から精製した AA NADase は既知の NADases から異なる二硫化リンク 2 鎖で構成されています-bond(s) し、1 つの Cu(2+) イオンが含まれています。ここでは、AA NADase を ADPR とニコチン酸アミド、生成する NAD の C N グリコシルトレハ ロース ボンド切断することができるだけでなくまた劈開は ATP、ADP や AMP PNP の phosphoanhydride リンケージ収量アンプにすることができるを示します。AA NADase 選択的 ATP, ADP や AMP PNP の P O P ボンドなし NAD の P O P ボンドの開裂を引き裂いています。NAD, ATP および AA-NADase による触媒による ADP の加水分解反応は相互に競争しています。ATP AA NADase のための優秀な基板で、最高の特異性定数 k(cat)/K(m) 7mM(-1)s(-1) +/-293 のです。AA NADase 中間 ADP とアンプを生産する ATP の加水分解を触媒します。AA NADase アンプで高い親和性等温滴定型熱量計 (ITC) の決定にバインドします。アンプは、NAD に対して効率的な阻害剤です。AA NADase これまでのところ NADase とで (D) のパセのような活動を最初のユニークな multicatalytic 酵素として識別されています。
抗凝固療法における金属イオン置換の影響因子 I 3 活性凝固因子 X 結合と構造安定性の毒から。
凝固因子 I （ACF 私） アメリカマムシ属の毒から分離されたヒャッポダです、活性凝固因子 X （貴社）-結合で Ca(2+) 依存的に結合するタンパク質抗凝固活性をマークします。熱力学の結合のアルカリ土類金属イオン ACF にし、効果のアルカリ土類金属イオン グアニジン塩酸塩 （GdnHCl） に- し、ACF は貴社に調べた等温滴定型熱量計、蛍光、円二色性と表面プラズモン共鳴によるそれぞれのバインディング ACF のアンフォールディングを誘発。ACF の Ca(2+) 結合部位を占める陽イオンのイオン半径は決定的結合親和性影響ことが示唆された ACF 私のアルカリ土類金属イオンとして ACF の構造安定性としても私は GdnHCl 変性に対して。Sr(2+) と Ba(2+) イオン半径のカルシウム, イオン半径よりも大きいとバインドできます Ca(2+) 無料 ACF に私は （apo ACF は)、Mg(2+) ながら、イオン半径のカルシウムより少ないショー大幅に apo ACF 結合親和性低私は。すべてのバインド中のカルシウム、Sr(2+)、および Ba(2+) イオン ACF 私は主にエンタルピー駆動の 2 つのサイトと、エントロピーの彼らのために有利ではありません。GdnHCl 変性 Ca(2+) ACF よりわずかに低い抵抗を展示 Sr(2+) 安定化 ACF, Ba(2+) 安定化 ACF ながら私はくらい GdnHCl 変性 Ca(2+) ACF I. Mg(2+) より低い耐性を示すと Sr(2+) イオン半径のカルシウムに近いと貴社にバインドでき、したがっても ACF のバインディングを誘発する私は貴社に、Ba(2+)、カルシウム、よりはるかに大きいイオン半径を持つ ACF のバインディングをサポートすることはできませんに対し貴社が私は。我々 の観測は、提案するバインディング ACF の構造安定性を高める 2 つのサイトの ACF におけるカルシウム、Sr(2+)、および Ba(2+) イオンのけどこれらバインディングは ACF のバインディングのために不可欠ではない貴社と私は、Mg(2+)、カルシウム、および Sr(2+) イオン貴社へのバインディングが貴社と ACF と認識のため不可欠である可能性があります私は。
金属イオン RecA Inteins に結核菌からバインドします。
亜鉛 inteins の結晶構造で発見されており、亜鉛イオン in vitro および in vivo のスプライシング インテインを阻害することができます。3 つの最小化された recA inteins と金属イオンとの相互作用は、この作品で検討されている.等温滴定型熱量計 (ITC) 結果亜鉛の結合親和性 3 つの inteins に DeltaI-SM 順ですショー目 DeltaDeltaI （hh）-SM 約 DeltaDeltaI （hh）-CM、しかし、EDTA をよりはるかに弱いです。これらのデータのみの DeltaI-SM recA インテインの結晶構造における亜鉛の存在と可逆的阻害について説明します。異なる金属イオンの滴定により結合定数と抑制効率と正の相関を認めた.DeltaDeltaI (hh) を除く、すべての相互作用検出された単一サイト バインディング モード-2 つの亜鉛サイト CM。亜鉛 DeltaDeltaI (hh) の結合サイト-CM の NMR 分光法及び化学修飾と inteins に ITC 滴定法による分析を行いました。Cys1 と His73 DeltaDeltaI （hh） で 2 番目の亜鉛結合部位であることが示唆-cm CD 研究を示す金属バンカボート タンパク質立体構造のごくわずか影響があります。この作業では、キーの残留金属配位からの移動制限にインテイン スプライシング金属阻止の主な原因がある可能性が高く示唆しています。
一般的な銅触媒のカップリングのアゾール ビニル ブロマイド付き。
ビニル ブロマイド アゾールとのカップリングの銅触媒の方法論を開発しました。このプロトコル ヨ ウ化銅の 10 mol % の組み合わせと 20 mol % のエチレンジアミンの触媒として使用します。ビニル ブロマイドとアゾールの様々 な反応が進むし、二重結合ジオメトリ ビニル ブロマイドの反応条件下で保持されます。
アメリカマムシ属ヒャッポダ毒由来抗凝固因子 II の一酸化依存型降圧効果の Id。
抗凝固因子 II (ACF II) 3 の毒から分離された血液凝固因子 IX/凝固因子 X 結合タンパク質 (IX/X-bp) 家族のメンバーです。ACF II は 1:1 錯体の活性凝固因子 X Ca(2+) に依存するファッションの形成し、それによって血液凝固カスケードの増幅をブロックします。本研究は, ACF II 平均動脈血圧 (MABP) に及ぼす影響を調べたし、心拍数 (HR) のラットを麻酔しました。ACF II ラット増加し MABP、しかしない明らかに影響時間 ACF II 誘発低血圧は大幅に、一酸化窒素 （NO） 合成酵素阻害剤 N-オメガ-L-アルギニン メチルエステルによる (L 名) ブロックされているかより長続きするわずかな減少が続いて MABP の短い高速ドロップで用量依存的応答を誘導することが示唆されました。ACF II ラット大動脈リングと内皮機能の濃度依存性緩和を生成します。ACF II による血管拡張による内皮細胞の除去を完全に阻害した、L 名前前処理によって有意に抑制しました。これらの観察は ACF II 低血圧強く内皮細胞からの NO のリリースによって媒介される、内皮依存性血管拡張反応を誘導することを示しています。ACF II 活性化部分トロンボプラスチン時間測定に基づく高抗凝固活性 in vivo で展示しています。したがって、ACF II は、これまでのところ異なる経路を介してラットの血液の抗凝固薬および血圧降下効果がある IX/X-bp の家族の中で最初のユニークな二官能性蛋白質として識別されます。
高圧 CO2 とリンゴ ジュースで自然の微生物処理穏やかな熱の効果。
アップル ジュース高圧炭酸ガス (HPCD) 4.5 5.3 ％ と穏やかな熱 (MH) 大気圧二酸化炭素濃度で 20 mpa で殺菌されました。微生物の不活性化と自然の微生物のリンゴ ジュースの安定性を調べた。37, 42, 47, 52, 57 と 62 度 C の温度のあった、治療時間は 30 分あった、ストレージ温度殺菌リンゴ ジュースの 2 と 28 ℃ はあった好気性細菌 (AB) MH 62 ℃ で、HPCD で扱われる目または = 52 ℃ だったほぼ完全に活性化、微生物のカウントされた < 10CFU/mL の酵母と鋳型 (Y & M) 扱わ。 mh で目または 57 ℃ = と HPCD で目または = 42 ℃ だった完全に活性化。HPCD これらの自然の微生物の温度に対する感受性を増加し、その微生物の不活性化を強化します。リンゴ ジュースの AB の治療で HPCD によって目または 52 度 C と M を HPCD で治療、Y & = 目または 57 ℃、AB と M を mh 62 ℃ 貯蔵 2 と 28 ℃ 時の安定性の向上を示したがで HPCD によって扱われるアップル ジュースで扱われる、Y & = < または = 47 度 C は AB の高の生菌数と特徴付けられた目または 2.75 x 10 (3) = CFU/ml。C. どうやら apple の HPCD 治療の適切な温度ジュース 20 mpa でと 2 で保存が実行可能な非培養 (VBNC) 状態 Y & HPCD 42、47、52 度 C で 28 ℃ で貯蔵中に観察された MH 57 ℃ でとによってによって扱われる M の 28 度 C に 52 ℃ 以上、中に適切な温度の増加この研究の 62 度 c MH 処理用。
Mg (II)-因子 IX-結合タンパク質アメリカマムシ属クズルウルマク パラスの毒からファクター Xa とのバインディングを誘発。
因子 IX-結合タンパク質 (AHP IX bp)、ca 2 +- および zn 2 +-結合タンパク質アメリカマムシ属クズルウルマク パラスの毒からの zn 2 + 第 IX 因子と特異的にバインドする報告された-に依存する方法。ここで我々 はクロマトグラフィーのプロシージャの単純な 2 段階によって AHP IX bp を精製いると AHP IX bp も結合することが見つかりました Xa （貴社） で mg 2 + の高いバインディングを親和性因子-に依存する方法。Apo-AHP IX-bp 等温滴定型熱量計によって決定されるため大幅に低結合親和性 mg 2 + イオンがあるが、彼らは貴社の ca 2 + ネイティブ ページと表面プラズモン共鳴によって決定として不在でさえ apo-AHP IX-bp のバインディングを引き起こすことができます。Mg 2 + イオンはその認識 AHP IX bp のための FX Gla ドメインの in vivo での機能を維持する必要があります。Ca 2 +、zn 2 + イオン apo AHP IX bp と貴社の間のバインドを誘導しません。血液における豊富な mg 2 + イオンが重要な役割 AHP IX bp の抗凝固療法で再生します。
バインディングは、結核菌由来 RecA Inteins に銅イオンの抑制。
蛋白質スプライシングでインテインを自体のシーケンスに並ぶ併用の結紮を前駆体から切り取る独自の翻訳後修飾のプロセスです。インテインを亜鉛の結合を阻害する可逆的にスプライシングの蛋白質と阻害 EDTA を取り除きます。銅蛋白質スプライシング トランスを阻害することがわかった。ただし、インテイン スプライシングの回復は EDTA および銅亜鉛と比較して異なる抑制メカニズムを示唆して TCEP 必要。この作業では、バインド プロパティと結核菌由来 RecA インテイン銅イオンの抑制効果を検討しました。異なる結合部位同定されたが Cu(+) と Cu(2+) inteins に高い結合親和性を展示しました。Cys1 タンパク質スプライシング、メカニズムに関与するキーの残渣に Cu(2+) 座標では、Cu(+) はただし、システインに調整されません。In vitro 阻害アッセイは、一価 Cu(+) 蛋白質スプライシングへの可逆的阻害を示します抑制効率 Zn(2+) に対等であることを示した。Cu(2+) と inteins システインの酸化還元反応が観察された、速度定数を求めた。デュアル ロール用 Cu(2+) インテイン スプライシングの抑制に示唆された： Cu(2+) （Cys1 を含む） の主残余のインテインと Cys1、N タンパク質スプライシング S アシル シフト ステップ--> 必要な残渣の後続の酸化に強い調整。酸化還元反応は抑制後の段階で追加の役割をプレイできるに対しキネティック研究調整が当初、Cu(2+) の阻害効果の主要な原因なる可能性を示唆しました。
人間のマンナン結合レクチン (MBL) モチーフをバインド MBL 関連セリンプロテアーゼの場所です。
レクチン経路は抗体の独立したルートの補体活性化を提供します。マンナン結合レクチン (MBL) を通じてコラーゲンのような地域 (CLR) 補体結合反応を開始する MBL 関連のセリーンのプロテアーゼ (MASPs) 化合物を形成できます。本研究では設計し、ブロック MBL MASP 相互作用する人間の MBL のセリーンのプロテアーゼ結合モチーフを見つけるために仮定されたペプチドのひと MBL CLR の順序に従って範囲を合成しました。MASPs が Gly-X と Y の繰り返しパターンのコラーゲンのようなドメインの中断によって形成されたヒンジ領域の C 末端側のバインドが示されました。加えて、Arg32Cys、Gly35Asp、Gly37Glu の突然変異体蛋白質と同様のセリン プロテアーゼ バインディング特性が野生型 MBL がタンパク質構造変異 MBL と MASPs 間のバインドは野生型 MBL タンパク質と MASPs の間よりはるかに弱いです。
金属イオンの NAD-glycohydrolase にアメリカマムシ属ヒャッポダ毒からバインド: Multicatalytic 活性の調節。
単3-NADase アメリカマムシ属ヒャッポダ毒から、一意の multicatalytic 酵素と NADase とで (D) パセ活動です。すべての識別された NADases 間でにはのみ AA NADase にはその multicatalytic の活動では欠かせない Cu(2+) イオンが含まれます。本研究は, 相互作用 2価金属イオンと AA NADase とその構造と活性に及ぼす金属イオンの平衡透析、等温滴定型熱量計、蛍光、二色、動的光散乱と高速液体クロマトグラフィーによって検討しました。単3 形 NADase Cu(2+) 結合サイト、1 つのアクティベーター サイト高い親和性と約六つの阻害剤サイト低親和性と 2 つのクラスがあることが示唆されました。Cu(2+) イオンは、NADase、その活動のためのスイッチとして機能します。また、AA NADase Mn(2+) バインディングの 1 つのサイト、1 つの Zn(2+) 結合部位、強いと 2 つの弱い Co(2+) バインディング サイトと 2 強いと六つの弱い Ni(2+) 結合部位があります。金属イオン結合親和性に従う傾向 Cu(2+) 目 Ni(2+) 目 Mn(2+) 目 Co(2+) 目 Zn(2+) は、1 つの Cu(2+) で精製の AA NADase の存在のアカウントします。AA NADase の NADase、更に活動 Cu(2+) の絶対的な要件を持っていないとすべてのテストされた金属イオンをアクティブにする、NADase と更にアクティビティと傾向 Zn(2+) 活性化能を次目 Mn(2+) 目 Cu(2+) ~Co(2+) 目 Ni(2+)。金属イオンは、レギュレータの multicatalytic 活動として役立ちます。すべてのテストされた金属イオンに AA NADase のグローバル構造の明らかな効果があるないが、Cu(2+) と Zn(2+) 誘起コンホメーション変化いくつか Trp 残基の周りを観察されています。興味深いことに、各テストの金属イオンは 2 つの異なるアクティビティはおそらく、同じサイトで発生することを示唆して、両方の NADase と更にの活動の非常によく似て活性化しています。
ドミノ N-H/C-H 結合活性化: 銅触媒合成アゾールと 1, 4-dihalo-1, 3-ジエンを用いた窒素ブリッジヘッド複素環化合物の。
1, 4-Dihalo-1, 3-ジエン アゾール N H ボンドとその隣接 C-H 結合活性化を経由での銅触媒を用いたタンデム カップリングが記載されています。1, 4-Dihalo-1, 3-ジエン系の非対称を用いるときは反応良い位置選択を展示しています。このメソッドは、新規のルート窒素ブリッジヘッド azolopyridine 誘導体の合成を提供しました。
動脈の堅さと無症候性頭蓋内大動脈狭窄症と高血圧における石灰化中国語。
頭蓋内大動脈疾患 （ICLAD）、狭窄や石灰化など中国脳卒中患者では一般的です。しかし、ほとんど ICLAD と高血圧患者における大規模な動脈硬化の関連について知られていません。
マンナン結合レクチン Lps 投与によって誘導される樹状細胞の成熟とサイトカインの生産を調節します。
マンナン結合レクチン (MBL) パターン認識分子生得の免疫防御における補体活性化と opsonophagocytosis を促進関与している血清の存在であります。樹状細胞 (Dc) は、専門の抗原提示細胞 （Apc） は適応免疫の開始のために重要なです。リポポリサッカライド (LPS) 炎症反応と免疫調節の強力な活性化に示されています。我々 はまず MBL LPS 誘導性細胞の応答を変調し、その阻害作用の可能なメカニズムを検討したかどうか調べた。
マンナン結合レクチンは直接 Toll 様受容体 4 と対話し、thp-1 細胞からのリポ多糖誘発炎症性サイトカイン分泌を抑制します。
マンナン結合レクチン (MBL) におけるレクチン経路補体活性化の重要な役割を果たしているし、サイトカインの発現に影響を与えることができます。Toll 様受容体 4 （TLR4） 広く表されリポポリサッカライド (LPS) に関与することが実証されて-シグナリングを誘導。最初 MBL 露出 LPS 誘発炎症性サイトカイン分泌と核因子-κB (NF-) 活動そのセルライン THP 1 を使用してモジュレートできるかどうかを決定するために求めた。我々 は、任意観測規制効果のメカニズムを調べた。ELISA と逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応 (RT-PCR) 分析を使用して、我々 はタンパク質及び mRNA レベルで LPS 誘発腫瘍壊死因子 (TNF) MBL と治療を抑制することを発見-α と thp-1 細胞で IL 12 生産。電気泳動の移動性シフト試金および西部のしみの分析 MBL 治療 LPS 誘導される NF-DNA 結合と転流 thp-1 細胞に抑制することを明らかにしました。MBL のバインディング thp-1 細胞に生理的カルシウム濃度で明らかになったが、このバインディングは最適に応答して生理学的カルシウム濃度が発生しました。このバインディングは、組換え TLR4 細胞外ドメインのいずれか可溶性状による治療または反 TLR4 モノクローナル抗体 (HTA125) によって部分的抑制ことができます。LPS 処理 THP 1 細胞の活性化の増加の MBL バインディングで結果。我々 はまた、MBL は、用量依存的に TLR4 の細胞外ドメインに直接バインドできませんし、この相互作用を細胞表面への LPS のバインド減衰が観察。一緒に取られて、これらのデータ MBL 変調の LPS-/TLR シグナル伝達を介してサイトカイン発現に影響することをお勧め経路。MBL 免疫調節およびサイトカイン ネットワークに関与するシグナル伝達経路において重要な役割を再生可能性がありますが示唆されました。
ゼブラフィッシュ網膜におけるSmarca4の細胞発現（BRG1）調節遺伝子
最近のゲノム研究では、Leungら。ミクロ解剖ゼブラフィッシュの網膜でSmarca4（BRG1）調節遺伝子を同定するために階乗マイクロアレイ解析を使用していました。二百59の遺伝子が最も具体的な網膜の変化を運ん三方ANOVAモデルに分類されています。マイクロアレイ結果を検証し、さらに特性評価のための重要な遺伝子の細胞の発現パターンを解明するために、32が知られている遺伝子は、ランダムにこのグループから選ばれた。これらの遺伝子のin situハイブリダイゼーションマイクロアレイと同じステージ（36および52時間後に受精（HPF））でのサンプルと同じタイプ（野生型（WT）とsmarca4a50/a50（YNG）変異体）上で行った研究。
環状ジペプチド ラジカル カチオンの放射光真空紫外 （VUV） 光誘起断片化。
その化学的性質と様々 な生理活性のための環状ジペプチド メディシナルケミストリーを非常に魅力的であります。Cyclo(Gly-Gly)、cyclo(Ala-Ala)、cyclo(Gly-Val) の相を含む 3 つの簡単な環状ジペプチドの僻放射光真空紫外 （VUV） 光イオン化質量分析法 (VUV PIMS） と理論計算で決定されます。Cyclo(Gly-Gly) と cyclo(Ala-Ala) と同様の断片化経路を示しています。Cyclo(Gly-Gly) および cyclo(Ala-Ala) ラジカル カチオンのプライマリ分解反応は HNCO 損失と CO 除去と認められます。フラグメント イオンの外観エネルギー (AEs) [CH(2)NHCOCH(2)](+•) と [CH(3)CHNHCOCHCH(3)](+•) を測定する 10.21 と 9.66 ± 0.05 eV、それぞれ cyclo(Gly-Gly) および cyclo(Ala-Ala) ラジカル カチオン HNCO 除去とから形成されます。イソプロピル側グループと cyclo(Gly-Val) のラジカル カチオンの安定により支配的なフラグメント イオン m/z として割り当て 114 [C(4)H(6)N(2)O(2)](+•) γ H 移行と私によって生成される開裂プロピレンを失う。3 つの環状ジペプチドのイオン化エネルギー （IEs） 減少の順序 cyclo(Gly-Gly) (9.33 ± 0.05 eV) 目 cyclo(Ala-Ala) （9.21 ± 0.05 eV) 目 cyclo(Gly-Val) (9.09 ± 0.05 eV) 光イオン化効率スペクトル測定から。それは IEs 環状ジペプチドの置換基グループおよび分子構造の対称的な評価によって影響を受けることを意味します。これらの観察 (M(+•)) 2, 5 ジケトピペラジンの気相分子の反応性の理解と型ジケトピペラジン基づく薬物設計を導くために重要かもしれない。 環状ジペプチド ラジカル ・ イオンの化学特性の
低酸素誘導因子 （HIF）-1 による転写アップ制御 RhoE の上皮間葉転換胃癌細胞の低酸素吸入時に推進しています。
上皮間葉転換 （EMT） 癌浸潤をドライブ重要なプロセスです。最近では、低酸素細胞骨格を改造を伴う EMT を誘発する報告されています。RhoE 細胞骨格形成の重要な調節であるように、我々 と仮定 RhoE は低酸素誘導 EMT で役割を果たす可能性があります。初めて、胃癌細胞の低酸素条件下での RhoE タンパク質レベル向上を報告します。厳密な分析が明らかに RhoE アップ規制が転写レベルでで、低酸素誘導因子 （HIF） が必要です-1 α の誘導とその HIF-1 α RhoE プロモーターの低酸素応答性の高い要素 (HRE) をバインドします。さらに、低酸素または RhoE の過剰発現時の脳内でビメンチンの間葉系のマーカーは、アップを調節する、上皮性マーカー E-カドヘリンを下降調節および in vitro 細胞浸潤が著しく増加ことを発見しました。HIF-1 α や RhoE のによって特定 siRNAs サイレンシングこれらの低酸素誘導効果を救出しました。RhoE の異所性発現はまた MMP2/MMP-9 胃癌細胞のアップレギュレーションを誘導しました。この研究の RhoE は HIF-1 胃癌細胞の直接ターゲットとしてを識別します。さらに、RhoE 性調節細胞の適応応答ピボタル胃癌細胞 EMT で意味を持つ低酸素と侵略を表します。RhoE 標的療法高侵襲的潜在性胃癌細胞の低酸素領域を抑制するかもしれないことを提案します。
シスプラチン スプライシング、inteins での抗酸菌治療ターゲットとして示唆タンパク質を阻害します。
結核菌は重要な遺伝子とタンパク質製品の inteins と呼ばれるタンパク質スプライシング要素が 3 つを隠し持っています。翻訳後修飾の除去、inteins の autocatalytically が発生し、それぞれ M. 結核蛋白質の機能に必要です。Inteins は、そのため抗マイコ バクテリア剤の潜在的なターゲットです。この作業では、我々 インテイン結核の RecA recombinase の存在のスプライシングの活性による抗がん剤シスプラチン (cis-diamminedichloro-platinum(II))。 強力抑制していることを報告します。これ以前シスプラチンの活動、ic50 値 （50 ∼2 μ M とインテイン大腸菌のスプライス用遺伝レポーターをもたらしたアッセイ スプライシング両方 in vitro インテインを使用して設立された認識されていません。テスト関連の platinum(II) 錯体活性の阻害は高度の構造に依存した最高抑制効果を呈するシスプラチンが指定されました。最後に、我々 シスプラチンと ∼40 μ M の最小発育阻止濃度は, 結核に向かって有毒関連結核菌 bovis 細菌カルメット Guérrin （BCG） ひずみを実施、遺伝子実験で私達はシスプラチン毒性インテイン overexpression によって軽減できますを示すという報告します。スプライシング用が必要です少なくとも 1 つの保存されたシステイン残基を変更することによってそのシスプラチン インテイン活性を阻害する提案します。一緒にこれらの結果は、アクティブ サイトの新規阻害剤 inteins の識別し、抗酸菌の小分子阻害の有望なターゲットとして inteins を検証します。
Cu (ii) および二硫化物社債による安定化グアニジン塩酸塩と熱誘起変性 NAD Glycohydrolase の毒から中 3 の。
アメリカマムシ属ヒャッポダ毒から NAD glycohydrolase （AA-NADase) は、一意の multicatalytic 酵素と NADase とで (D) パセのような活動です。すべての識別された NADases の間で唯一の単3 形 NADase ジスルフィド ダイマー、Cu(2+) を含んでいます。Cu(2+) および二硫化物結束はその multicatalytic の活動で不可欠です。この研究は、グアニジン塩酸塩 （GdnHCl） Cu(2+) と二硫化物結束の影響で- と熱誘起 AA-NADase のアンフォールディング行った蛍光, 円二色性 (CD) と走査熱量 (DSC) による。Cu(2+) と二硫化債が自由エネルギー GdnHCl 誘起展開中に蛍光によって定められるように変更、また全体的なエンタルピー変化と遷移温度熱誘起展開時に CD と DSC によって決定として増加増加だけでなく。中点で GdnHCl 誘起変性曲線の傾きと熱容量の熱誘起変性はわずか Cu(2+) によって影響を受けるが、3 つのジスルフィドの削減後が大幅に低下します。この作業は、二硫化物結束をたたんだ状態アンフォールディングと疎水性残基のパッキングの安定化のエンタルピーを増やすことによって安定化一方、アンフォールディングのエンタルピーを増やすことによって Cu(2+) が折り畳まれた状態を安定させることが示唆されました。したがって Cu(2+) および二硫化物結束構造の役割その multicatalytic の活動で再生します。
