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Hi-C: Un método para estudiar la arquitectura tridimensional de los genomas.


JoVE 1869 5/06/2010

1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology

El método de Hi-C permite la identificación imparcial de todo el genoma de las interacciones entre la cromatina (1). Hi-C parejas ligadura de proximidad y de secuenciación masiva en paralelo. Los datos resultantes se pueden utilizar para estudiar arquitectura genómica a diferentes escalas, los resultados iniciales identificaron características tales como los territorios de cromosomas, la segregación de la cromatina abierta y cerrada, y la estructura de la cromatina en la escala de megabase.

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Anexina XI Co-localises Con Calcyclin En Células Proliferantes Del Testículo Embrionario Del Ratón

Determinación del sexo mamífero se basa en la expresión de SRY, que desencadena una cascada bien regulada de la expresión génica conduce a la diferenciación masculina. Muchos elementos de esta vía permanecen para ser identificados. Aquí, nos caracterizan Anexina XI (Anxa11), un gen cuya principales de expresión embrionaria estuvo dentro del testículo no diferenciado y diferenciador. Expresión de nivel inferior también se observó en ambos sexos en el tumor y conductos de Wolff, el dermamyotome somitic y la zona intermedia dorsal del tubo neural. Anxa11 transcripciones fueron detectadas en la gónada indiferente de 10,5 días post coitum (dpc), convirtiéndose en el hombre específicos como desarrollo procedió. Expresión estaba dentro de las cuerdas del testículo, inicialmente en las células germinales y luego en Sertoli y células germinales. Anexina proteína XI fue considerada en las cuerdas de testículo de 12.5 dpc, localizando el citoplasma de las células de Sertoli. También se observó la expresión de calcyclin (S100a6), que se mostraron anteriormente para interactuar con Anexina XI in vitro, en células proliferantes del testículo embrionario, apoyar una posible interacción in vivo.

Dividendos Clínicos De Diagnóstico Genético Molecular De Craneosinostosis

Una docena de años transcurridos desde la primera lesión genética fue identificada en una familia con craneosinostosis, la fusión prematura de las suturas craneales. Posteriormente, las mutaciones en los genes FGFR2, FGFR3, TWIST1 y EFNB1 han demostrado representan aproximadamente el 25% de craneosinostosis, mientras que varios genes adicionales hacen contribuciones menores. Utilizando ejemplos concretos, mostramos cómo estos descubrimientos permitieron refinamiento de información sobre el diagnóstico, el riesgo de recurrencia, el pronóstico para el desarrollo mental y planificación quirúrgica. Sin embargo, la variabilidad fenotípica puede presentar un reto importante para la interpretación clínica de los estudios genéticos moleculares. En particular, la dificultad de analizar la compleja interacción de la genética y el medio ambiente prenatal para determinar las características clínicas, limita el valor de identificar las mutaciones de baja penetrancia.

Análisis Genéticos Y Epigenéticos De CHEK2 En Esporádico Mama, Colon Y Ovario

Variantes de la línea germinal en CHEK2 se han asociado con el aumento de mama, tiroides, próstata, riñón y riesgo de cáncer colorrectal; sin embargo, la prevalencia de inactivación somática de CHEK2 en tipos comunes de cáncer es menos clara. El objetivo de este estudio fue determinar si mutación somática y/o modificación epigenética desempeñan un papel en el desarrollo de mama esporádico, colon o cáncer de ovario.

Dividendos Clínicos De Diagnóstico Genético Molecular De Craneosinostosis

Una docena de años transcurridos desde la primera lesión genética fue identificada en una familia con craneosinostosis, la fusión prematura de las suturas craneales. Posteriormente, las mutaciones en los genes FGFR2, FGFR3, TWIST1 y EFNB1 han demostrado representan aproximadamente el 25% de craneosinostosis, mientras que varios genes adicionales hacen contribuciones menores. Utilizando ejemplos concretos, mostramos cómo estos descubrimientos permitieron refinamiento de información sobre el diagnóstico, el riesgo de recurrencia, el pronóstico para el desarrollo mental y planificación quirúrgica. Sin embargo, la variabilidad fenotípica puede presentar un reto importante para la interpretación clínica de los estudios genéticos moleculares. En particular, la dificultad de analizar la compleja interacción de la genética y el medio ambiente prenatal para determinar las características clínicas, limita el valor de identificar las mutaciones de baja penetrancia.

Viabilidad Y Los Resultados a Corto Plazo De Un Tratamiento Chamánico Para Trastornos De La Articulación Temporomandibulares

Trastornos de la articulación temporomandibulares (TTM) son condiciones de dolor crónico, recurrente, no progresiva que afecta a la mandíbula y la cara. Pacientes menos probabilidades de responder al tratamiento alopático son aquellos con la capacidad de respuesta biológica más marcada a estresores externos y concomitantes dificultades emocionales y psicosociales. Estas características describen a quienes son "descorazonados" y pueden beneficiarse de la curación chamánica, una forma antigua de sanación espiritual.

Análisis Genético Y Epigenético Del Gen TIMP-3 En El Cáncer De Ovario

Cromosoma 22q demuestra una alta frecuencia de la pérdida de heterocigosidad (LOH) en el ovario, sugiriendo la existencia de uno o más genes supresores del tumor importante (ETG). El inhibidor de tejido de la metaloproteinasa-3 (TIMP-3) es un candidato plausible de TSG, puesto que a menudo se engloba dentro de estas regiones de LOH. TIMP-3 no ha sido investigado previamente para las mutaciones somáticas o hipermetilación del promotor en cáncer de ovario. Se analizaron 65 ovario somáticas mutaciones genéticas tanto hipermetilación del promotor de TIMP-3. Proyección de los exones codificación de TIMP-3 no reveló que ninguna mutaciones genéticas somáticas y sólo 1/65 demostraron TIMP-3 metilación. Nuestros datos indican que la inactivación de TIMP-3 por mutación somática o promotor hipermetilación es rara en cáncer de ovario.

Análisis De Mutación Y La Metilación De La Cromodominio-helicase-DNA Binding 5 Gen En Cáncer De Ovario

Cromodominio, helicasa, ADN atando 5 (CHD5) es un miembro de una subclase de la cromatina remodelación proteínas Swi/Snf y recientemente se ha propuesto como un supresor tumoral en una amplia gama de cánceres humanos. Analizamos todos los 41 codificación exones de CHD5 para el análisis del derretimiento de las mutaciones somáticas en 123 casos de cáncer ováricos primarios así como 60 cánceres de mama primario con alta resolución. También examinamos la metilación del promotor CHD5 en 48 muestras de cáncer de ovario por polimorfismo de la conformación de monocatenario de metilación específica y la secuencia de bisulfito. A diferencia de estudios anteriores, se identificaron ningunas mutaciones en los cánceres de mama, pero se identificaron mutaciones sin sentido heterozigóticas somáticas en 3 de 123 cánceres ováricos. Identificamos metilación del promotor en 3 de 45 muestras con CHD5 normal y en 2 de 3 muestras con CHD5 mutación, lo que sugiere estos tumores puede tener biallelic inactivación de CHD5. Hemizygous copia número pérdida en CHD5 ocurrido en 6 de 85 muestras según lo determinado por la matriz de polimorfismo de nucleótido simple. Tumores con mutación CHD5 o metilación eran más propensos a tener KRAS o BRAF (P =.04. La frecuencia total de haploinsufficiency de CHD5 o inactivación es 16,2% en cáncer de ovario. Así, los CHD5 pueden desempeñar un papel como un gen supresor de tumor en cáncer de ovario; sin embargo, es probable que exista otro objetivo de la pérdida neutro número frecuente copia de heterocigosidad observada en 1 p 36.

¿Hay Cualquier Tumor Ovárico Más Genes Supresores? Una Nueva Perspectiva Con Número De Ultra Alta Resolución Copia Y Pérdida De Análisis Del Heterocigoto

Cáncer de ovario se caracteriza por alteraciones genéticas complejas, incluyendo la copia número pérdida y copia número neutro pérdida de heterocigosidad (LOH). Estas alteraciones se supone que representan el "segundo golpe" del subyacente gen supresor tumoral (TSG), sin embargo, con respecto al número de hotspots LOH informó, se han identificado algunos ETG ovárico. Se realizó un análisis LOH alta resolución con matrices SNP (500 K y SNP6.0) de 106 tumores ováricos primarios de varios subtipos histológicos junto con coincidencia de ADN normal. LOH fue detectado en al menos el 35% de las muestras en los cromosomas 17, 19p 22q, Xp, 13q, 8P, 6q, 4q, 5q, 1 p, 16q y 9q con una región mínima promedio de superposición de sólo 300 kb. Se observaron diferencias de subtipo específico en frecuencia LOH, especialmente en los casos mucinoso. También identificamos 192 delecciones homocigóticas somáticos (HDs). HDs recurrentes dirigido ETG conocido como CDKN2A (ocho muestras), RB1 (cinco muestras) y PTEN (tres muestras). HDs recurrentes adicionales dirigido 16 candidato ETG cerca de regiones mínimo de LOH en los cromosomas 17, 13, 8P, 5q y X. Dada la importancia de HDs en la inactivación de genes conocidos, estos candidatos están altamente probables que ETG ovárico. Nuestros datos sugieren que el pobre éxito de estudios previos de LOH fue debido a la inhabilidad de la tecnología anterior para resolver complejas alteraciones genómicas y distinguir LOH cierto desequilibrio alélico. Este estudio muestra que las regiones recurrentes de LOH y HD con frecuencia alinean con ETG conocido sugiriendo que análisis LOH sigue siendo un enfoque válido para descubrir nuevos candidatos.

ALLPATHS 2: Pequeños Genomas Montada Con Precisión Y Alta Continuidad Corto Lee Emparejados

Demostramos que genoma calidad acabado que puede generarse a partir de secuencias cortas lecturas emparejadas. Usando 36 base (fragmento) y base de 26 (saltar) lee de cinco genomas microbianos de variada composición de GC y tamaños de hasta 40 Mb, ALLPATHS2 genera ensamblados con largos y precisos contigs y andamios. Terciopelo y EULER-SR eran menos precisos. Por ejemplo, Escherichia coli, la fracción de tramos de 10 kb que eran perfectos fue 99.8% (ALLPATHS2), 68.7% (terciopelo) y 42.1% (EULER-SR).

Elaboración De Mapas Detallados De Las Interacciones De Largo Alcance Revela Principios De Plegado Del Genoma Humano

Se describe Hi-C, un método que las sondas de la arquitectura tridimensional de todo el genoma mediante el acoplamiento basado en la proximidad con la ligadura de secuenciación masiva en paralelo. Hemos construido los mapas espaciales de proximidad del genoma humano con Hi-C, a una resolución de 1 megabase. Estos mapas confirmar la presencia de los territorios cromosómicos y la proximidad espacial de pequeñas gen ricos en cromosomas. Se identificaron un nivel adicional de organización del genoma que se caracteriza por la segregación espacial de la cromatina abierta y cerrada para formar dos compartimentos en todo el genoma. En la escala megabase, la conformación de la cromatina es consistente con un glóbulo fractal, un nudo-libre, conformación polímero que permite el envasado máximamente densa preservando al mismo tiempo la capacidad de plegar y desplegar fácilmente cualquier locus genómico. El glóbulo fractal es distinto del modelo de equilibrio más comúnmente utilizado globular. Nuestros resultados demuestran el poder de Hi-C para mapear las conformaciones dinámicas de genomas completos.

Identificación De Genes En Cáncer De Ovario a Través Del Análisis De Número Y Expresión Copia Integral Del Crecimiento Candidato

Cáncer de ovario es una enfermedad caracterizada por cambios genómicos complejos, pero la mayoría de los genes que son el objetivo de estas alteraciones no es identificada. Catalogación estos objetivo genes proporcionarán información útil sobre la etiología de la enfermedad y pueden proporcionar una oportunidad para desarrollar nuevas intervenciones diagnósticas y terapéuticas. Número de gran copia de genoma de alta resolución y emparejar datos de expresión de 68 carcinomas ováricos epiteliales primarios de varios histotypes se integró para identificar genes en regiones de amplificación más frecuente con la correlación más fuerte con expresión y número de copia. Regiones en los cromosomas 3, 7, 8 y 20 más frecuentemente aumentaron en número de copias (> 40% de las muestras). Dentro de estas regiones, 703/1370 (51%) expresión de gen único probesets fueron diferencialmente expresados cuando muestras con ganancia se compararon muestras sin ganancia. 30% de ellos expresados diferencialmente probesets también mostraron una fuerte correlación positiva (r > = 0.6) entre la expresión y el número de copias. También se identificaron 21 regiones de ganancia número copia de gran amplitud, en el que 32 genes de codificación de proteínas conocidas mostraron una fuerte correlación positiva entre la expresión y el número de copias. En general, nuestros datos validación genes de cáncer de ovario previamente conocidas, como ERBB2 y también conductores potenciales novela identificadas como MYNN, PUF60 y TPX2.

Contribución De La Temperatura Central Del Cuerpo, Hora Para Despertar Previo Y Al Rendimiento Cognitivo Durante Las Etapas Del Sueño Forzado Desynchrony

Turnos a menudo son obligados a dormir en fases inadecuadas de su sistema de cronometraje circadiano, con implicaciones para la dinámica de las etapas del sueño ultradianos. Los efectos independientes de estos cambios en el rendimiento cognitivo no son bien entendidos. Esto es debido a los efectos del sueño sobre el rendimiento generalmente se confunden con los factores que no pueden ser controladas bajo condiciones normales de día/noche. El objetivo de este estudio fue evaluar la contribución de la raíz anterior, la temperatura central del cuerpo, y forzada de las etapas del sueño al rendimiento cognitivo en condiciones de desynchrony (FD). Un total de 11 varones adultos jóvenes sanos residió en un laboratorio del sueño en el que fueron eliminados zeitgebers de día/noche y fueron controlados los niveles de iluminación, la temperatura ambiente y el comportamiento. El protocolo incluye 2 días de entrenamiento, un día de línea de base y períodos de 7 x 28-h FD. Cada período de FD consistió en un período de despertar de 18,7-h seguido por un período de descanso de 9.3-h. Sueño se evaluó mediante polisomnografía estándar. Temperatura corporal y la actividad física fueron evaluados continuamente en épocas de 1-min. Rendimiento cognitivo se midió por una adición de serial-5min y tarea de resta (SAS) y una tarea de sustitución (DSS) símbolo de 90-s dígitos. Éstos fueron administrados en sesiones de prueba previsto cada 2,5 h a través de los períodos de la raíz de cada período de FD. En promedio, los períodos de reposo tenían una duración media (+-desviación estándar) de 8.5 (+/-1.2) h en que los participantes obtuvieron 7.6 (+/-1.4) h tiempo total de sueño. Esto incluyó 4.2 (+/-1.2) h de la etapa 1 y etapa 2 sueño (sueño de S1-S2), 1.6 (+/-0.6) h de sueño profundo (SWS) y 1.8 (+/-0.6) h de sueño de movimientos oculares rápidos (MOR). Un análisis de modelo mezclado con cinco covariables indicó efectos fijos significativos en el rendimiento cognitivo para la fase circadiana, Estela antes de tiempo y cantidad de sueño REM. No se encontraron efectos significativos para el sueño de S1-S2 y SWS. Los resultados demuestran que las variaciones en la temperatura central del cuerpo, tiempo despierto y cantidad de sueño REM se asocian con cambios en el rendimiento cognitivo. La ausencia de efecto significativo sobre la SWS puede atribuirse a la gama truncada de duración período de sueño muestreadas en este estudio. Sin embargo, debido a la media y varianza para SWS eran similares al sueño REM, estos resultados sugieren que rendimiento cognitivo puede ser más sensible a las variaciones en el sueño REM que SWS.

Expresión in Vitro De NGN3 Identifica RAB3B Como El Miembro De Familia De 3 De Proteína De Unión a GTP Asociada a Ras Predominante En Islotes Humanos

Neurogenin 3 (NGN3) se compromete a progenitores pancreáticos a una suerte de células del islote. Hemos inducido NGN3 expresión e identificado upregulation del gen que codifica la proteína asociada a Ras pequeña masa molecular Unión a GTP, RAB3B. RAB3B localizado al citoplasma de β-células humanas, tanto durante el período fetal y post natally. Genes que codifican proteínas de RAB3 alternativas y RAB27A fueron inalterados por NGN3 expresión y en islotes adultos humanos que sus transcripciones fueron que muchas veces menos frecuentes que los de RAB3B. La regulación de la exocitosis de insulina en las células β-roedores y receptividad a incretinas dependen de miembros de la familia del Rab, en particular, Rab3a y Rab27a, pero no Rab3b. Nuestros resultados apoyan una importante diferencia entre las especies en la regulación de la exocitosis de insulina donde RAB3B es la isoforma más expresada en islotes humanos.

Análisis De Número De Copia Identifican Nuevas Interacciones Entre Loci Genómicas En Cáncer De Ovario

Cáncer de ovario es una enfermedad heterogénea mostrando alteraciones genómicas complejos, y por lo tanto, ha sido difícil determinar las más relevantes alteraciones de números de copia con la escala de estudios hasta la fecha. Obtuvimos datos de alteración (CNA) del número de copia del genoma de cuatro plataformas diferentes de matriz SNP, con un conjunto de datos final de 398 tumores ováricos, en su mayoría del subtipo histológico seroso. Aberraciones frecuentes de CNA habían dirigido muchos miles de genes. Sin embargo, amplicones de alto nivel y delecciones homocigóticas permitieron filtrar esta lista a las más relevantes. El gran conjunto de datos habilitada refinamiento de regiones mínimo e identificación de amplicones rara como en 1 p 34 y 20q11. Realizó un análisis de co-ocurrencia de novela para evaluar la cooperación y la exclusividad de CNAs y analiza su relación con los resultados de los pacientes. Asociaciones positivas fueron identificadas entre ganancias en 19 y 20q, ganancia de 20q y pérdida de X y entre varias regiones de pérdida, particularmente 17q. Se encontraron correlaciones débiles del CNA en locus genómicos como 19q12 con resultado clínico. También evaluaron medidas de inestabilidad genómica y encontró una correlación del número de mayores ganancias de amplitud con supervivencia más pobre. Montando la mayor colección de datos del número de copia ovárica hasta la fecha, hemos sido capaces de identificar las aberraciones más frecuentes y sus interacciones.

Viaje Hacia La Curación: La Experiencia Transformadora De Curación Chamánica En Mujeres Con Trastornos De La Articulación Temporomandibulares

Para evaluar las percepciones de los participantes de la enfermedad, proceso curativo y la experiencia de efectos del tratamiento chamánico según la información de entrevistas en profundidad. MARCO teórico: Coherente con su conjunto sistemas modelo de investigación, se utilizaron métodos cualitativos para evaluar los resultados y experiencias de los participantes en ensayos clínicos. En otros lugares se divulgan resultados cuantitativos.

De Alta Calidad Asambleas Proyecto De Los Genomas De Mamíferos a Partir De Datos De Secuencia Masivamente Paralelos

Masivamente paralelos tecnologías de secuenciación de ADN están revolucionando la genómica por lo que es posible generar miles de millones de relativamente corto (~ 100-base) secuencia se lee a muy bajo costo. Mientras que estos datos pueden ser fácilmente utilizada para una amplia gama de aplicaciones biomédicas, se ha demostrado que es difícil de usar para generar alta calidad De las asambleas del genoma de novo de los genomas de vertebrados grandes y ricos de repetición. Hasta la fecha, las asambleas del genoma generados a partir de estos datos están muy por debajo de los obtenidos con la antigua (pero mucho más caro) capilar enfoque basado en la secuenciación. Aquí, se presenta el desarrollo de un algoritmo para el genoma de montaje, ALLPATHS LG-, y su aplicación en paralelo de forma masiva los datos de la secuencia del ADN de los genomas humano y del ratón, generadas en la plataforma Illumina. Los conjuntos de los proyectos resultantes del genoma tiene una buena precisión, la contigüidad de corto alcance, conectividad de largo alcance, y la cobertura del genoma. En particular, la precisión de base es alta (≥ 99,95%) y el tamaño de andamio (N50 tamaño = 11.5 Mb para Mb humanos y 7,2 para ratón) enfoque los obtenidos con capilar basada en la secuencia. La combinación de la tecnología de secuenciación mejorada y la mejora de los métodos de cálculo ahora debe hacer posible que aumenten sustancialmente la secuenciación de novo de grandes genomas. El programa ALLPATHS-LG está disponible en http://www.broadinstitute.org/science/programs/genome-biology/crd.

Una Mutación En Synaptojanin 2 Causa Pérdida De Oído Progresiva En La Cepa De Ratón ENU-mutagenised Mozart

Discapacidad auditiva es la debilitación sensorial más común en los seres humanos, que afectan a la 1: 1,000 nacimientos. Hemos identificado a un mutante de ratón ENU generado, Mozart, con pérdida de oído progresiva no sindrómica, hereditario y recesivo causada por una mutación en el synaptojanin 2 (Synj2), una enzima regulador central en la cascada de señalización fosfatidilinositol.

Duplicación Del Gen EFNB1 En Hipertelorismo Familiar: Desequilibrio En La Expresión De Efrina-B1 Y Fenotipos Anormales En Humanos Y Ratones

Hipertelorismo familiar, caracterizado por ojos muy espaciados, clásico muestra herencia autosómica dominante (tipo de Tibi), pero algunos pedigrees son compatibles con el X-acoplamiento. Ningún mecanismo se ha descrito anteriormente, pero la semejanza clínica se ha observado a síndrome craneofrontonasal (CFNS), que es causado por mutaciones en el gen EFNB1 X-ligado. Aquí divulgamos a una familia en la que las hembras en tres generaciones presentaron con hipertelorismo, pero carecían de craneosinostosis o una extremidad nasal acanalada, excluyendo CFNS. Secuencia de la DNA de EFNB1 era normal, pero el análisis posterior reveló una duplicación de 937 kb, incluyendo EFNB1 y genes que flanquean dos: PJA1 y STARD8. Encontramos que el cromosoma X, teniendo la duplicación produce ∼1.6-doble transcripción de EFNB1 más que el cromosoma X normal y proponer que, en el contexto de la x-inactivación, esta diferencia en el nivel de expresión de EFNB1 da lugar a clasificar hacia hipertelorismo anormal de células. Para apoyar esta hipótesis, Proporcionamos evidencia de un modelo de ratón llevando un cDNA humano específico de EFNB1, que la separación celular anormal ocurre en la región craneal. Por lo tanto, proponemos que casos ligadas al cromosoma X que se asemejan a Tibi hipertelorismo pueden tener un mecanismo similar a CFNS y eso mosaicismo celular para diferentes niveles de efrina-B1 (así como simple presencia/ausencia) conduce a anormalidades craneofaciales.

Una Mutación Inducida Por ENU De Cdh23 Causa Pérdida Auditiva Congénita, Pero Ninguna Disfunción Vestibular, En Ratones

Mutaciones en el humano cadherin 23 (CDH23) gene causa sordera, la neurosensorial, autosómico recesivo 12 (DFNB12) nonsyndromic hipoacusia o el síndrome de Usher, tipo 1D (caracterizada por el deterioro de oído, disfunción vestibular y la discapacidad visual). Cepas de ratón caballitos divulgado cada uno albergan una mutación Cdh23 nulo y presentan pérdida auditiva y la disfunción vestibular. Dos Cdh23 adicionales ratón mutantes, salsa y erlong, cada uno llevan una mutación sin sentido homocigótica de Cdh23 y tienen pérdida de oído progresiva. Divulgamos la identificación de una cepa de ratón novela, jera, con heredado hipoacusia causada por una mutación de c.7079T>A N-ethyl-N-nitrosourea-inducida en el gene de Cdh23. La mutación produce un cambio sin sentido, p.V2360E, Cdh23. ratones afectados tienen sordera sensorineural profunda, con ninguna disfunción vestibular. La mutación de p.V2360E es semidominant porque los ratones heterocigotos tienen pérdida auditiva más suave y más progresistas en edad avanzada. La mutación afecta a un motivo de Unión Ca(2+) altamente conservado en el dominio extracelular 22, cree que es importante para la dimerización y Cdh23 estructura. Modelado molecular sugiere que la mutación Cdh23(V2360E/V2360E) altera la conformación estructural de la proteína y afecta las propiedades de enlace de Ca(2+). Similar a los ratones de la salsa, pero en contraste con los ratones de caballitos, desarrollo del paquete de cabello es normal en jera y pérdida de la audición parece ser debido a la pérdida de enlaces de la punta. Así, jera es un modelo de ratón novela para DFNB12.

Comparación De Un Medicamento De Fórmula Libre De BAK Conservada Con Polyquaternium-1 Con Travoprost BAK-preservado En Hipertensión Ocular O Glaucoma De ángulo Abierto

Para demostrar que la presión intraocular (PIO)-reducir el efecto de travoprost 0.004% preservado con polyquaternium-1 (cloruro de benzalconio travoprost [BAK]-libre) se conserva no es inferior a la de travoprost 0.004% con cloruro de benzalconio (travoprost BAK) en pacientes con hipertensión ocular o glaucoma de ángulo abierto.

Identificación De Cepas De Ratón De Pérdida De Audición Novela Tres Con Mutaciones En El Gen Tmc1

Divulgamos la identificación de tres nuevos modelos de ratón, baringo, agradable y la puntada, con sordera sensorineural hereditaria y recesivo debido a mutaciones en el gene de canal-como transmembrana 1 (Tmc1). Estas cepas fueron generadas por la N-ethyl-N-nitrosourea mutagénesis. Análisis de la secuencia de ADN reveló cambios en c.545A>G, c.1345T>C y c.1661G>T, que causa p.Y182C, p.Y449H y p.W554L del aminoácido sustituciones en baringo, agradable y coser mutantes, respectivamente. Las mutaciones afectan los residuos del aminoácido que evolutivamente se conservan entre especies. Similar a la mutante de Beethoven Tmc1 previamente divulgado, tanto p.Y182C como p.W554L se encuentran fuera de un dominio transmembrana previsto, mientras que la mutación de p.Y449H reside en el dominio transmembrana previsto 4. Ratones de puntada-mutante homocigóticos tienen hipoacusia severa en la edad de 4 semanas y son sordos por la edad de 8 semanas, mientras que tanto baringo y agradables mutantes son totalmente sordas a la edad de 4 semanas. Ninguna de las cepas muestra signos de disfunción vestibular. Microscopía electrónica de barrido reveló la degeneración de las células de pelo externas en la región basal de baringo, agradable y mutantes de la puntada. Inmunolocalización estudios revelaron la expresión de la proteína TMC1 en las células ciliadas, las neuronas del ganglio espiral, apoyar a las células y los ligamentos de la estría en el oído interno. Reducción en los niveles de proteína fueron observados en el ligamento espiral de mutantes en comparación con animales de tipo salvaje de TMC1. Estos tres mutantes alélicos proporcionan modelos valiosos para estudiar nonsyndromic recesivo hipoacusia neurosensorial (DFNB7/11) tanto en los seres humanos.

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