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Articles by M. Jason V. de la Cruz in JoVE
JoVE Immunology and Infection
使用低温电子断层扫描和自动子断层扫描平均HIV包膜糖蛋白分子结构的测定
1Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, 2The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, 3National Library of Medicine, National Institutes of Health, 4Massachusetts Institute of Technology, 5William Fremd High School, 6University of Virginia, 7Duke University, 8Yale University, 9University of Notre Dame, 10Washington University in St. Louis, 11Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, 12Thomas Jefferson High School for Science and Technology
协议描述了高通量的方法，以确定使用低温电子断层扫描和三维图像处理的膜蛋白的结构。它涵盖了样品制备的详细信息，数据采集，数据处理和解释，最后一个有代表性的目标的方法，HIV - 1包膜糖蛋白的生产。这些计算程序设计的方式，使研究人员和学生远程工作和作出贡献的数据处理和结构分析。
Other articles by M. Jason V. de la Cruz on PubMed
三联 SIV 和艾滋病毒 1 包膜糖蛋白对完整病毒的分子体系结构： 在第四纪的结构依赖于应变的变化。
目标单元格和感染的人，密切相关的猴免疫缺陷病毒的第一步 （艾滋病毒和 SIV，分别） 与 heterodimers 的病毒跨膜糖蛋白 (gp41） 和到目标 T 细胞表面的糖蛋白 (gp120) 组成的三联包膜糖蛋白 (Env) 绑定时发生。三联 Env 分子完整的病毒知识是结构的理解基本病毒细胞相互作用的分子机制和有效的基于免疫原的疫苗的设计，以防治艾滋病毒/艾滋病的重要。三联 Env 在 unliganded 结构中已经导致以前的完整艾滋病毒 1 BaL virions 的分析和 CD4 liganded ~ 20 ① 分辨率。在这里，我们表明的三联 Env SIVmneE11S，从体系结构的分子 SIVmac239 和艾滋病毒 1 R3A 株是密切相媲美，先前确定的艾滋病毒 1 BaL，V1 和 V2 变量循环位于图文场中，接近病毒与单元格之间的接触区域的顶点。在三联 Env V1/V2 循环的位置明确证实了艾滋病毒 1 R3A virions 删除这些循环与快递 Env 基因修饰的结构分析。引人注目的是，在 CD4 独立应变，SIV CP MAC 三联 Env 处于一"开放"的构象有 gp120 眼珠类似于见 Hiv-1 BaL 与 sCD4 和 CD4i 抗体 17b 络合时构象中的三聚体。我们的研究结果表明 CD4 独立病毒性条目的分子机制结构解释和进一步建立该低温电子断层扫描可以用于发现独特、 功能上相关的第四纪结构的 Env 显示完整的病毒。
可溶性 CD4 绑定国家的使用低温电子断层扫描确定的三联猴免疫缺陷病毒包膜糖蛋白的三维结构。
显示在三联的信封糖蛋白 (Env) 峰值猴免疫缺陷病毒 (SIV) 和人类免疫缺陷病毒类型的曲面上 1 （艾滋病毒-1） virions 由组成三个 heterodimers 的病毒糖蛋白 gp120 和 gp41。虽然 gp120 绑定以细胞表面的 CD4 和趋化因子受体已知征求 gp120 和 gp41 的构象变化，只是最近才阐明第四纪的三聚体结构的变化。因为艾滋病毒 1 BaL 隔离，CD4 附件结果惊人重排反应从"封闭"到"开放"构象三聚体。然而，对 SIV，三聚体的 CD4 影响不被描述。使用低温电子断层扫描，我们现在已经确定的可溶性 CD4 分子体系结构 (sCD4)-绑定的 SIV Env 三聚体为三个不同品系 （SIVmneE11S，SIVmac239 和 SIV CP MAC） 的国家。与艾滋病毒 1 博联公司形成了鲜明的对比，SIVmneE11S 和 SIVmac239 Env 表明只有轻微的构象变化后 sCD4 绑定。在 SIV CP-MAC，三联 Env 一"开放"构象类似于见 Hiv-1 BaL sCD4 络合状态的显示位置，我们显示的 sCD4 或 7 3 绑定后构象有没有发生重大的进一步变化抗体。密度图还显示 7 3 和 17b 抗体针对抗原表位在 gp120 对立双方的 hiv 感染抑制绑定站点上。这些结果提供新的见解的 SIV Env 结构的多样性，并显示有绑定到三联 SIV Env sCD4 的方向依赖应变的变化。
