Translate this page to:
Italian
In JoVE (3)
- Inserire grande Ambientale Genomic Produzione Biblioteca
- Espressione di proteine ricombinanti nel lievito Methylotrophic Pichia pastoris
- Una schermata di High Throughput per Biomining attività Cellulase da librerie metagenomiche
Other Publications (5)
Automatic Translation
This translation into Italian was automatically generated.
English Version | Other Languages
Articles by Marcus Taupp in JoVE
JoVE General
Inserire grande Ambientale Genomic Produzione Biblioteca
Department of Microbiology and Immunology, University of British Columbia - UBC
Costruzione di una biblioteca con fosmid ambientale DNA genomico isolato dal continuum profondità verticale di un fiordo stagionalmente ipossia è descritto. La biblioteca clone risultante è raccolto in 384 pozzetti e archiviati per il sequenziamento a valle e screening funzionale con l'applicazione di un sistema automatizzato di raccolta colonia.
JoVE General
Espressione di proteine ricombinanti nel lievito Methylotrophic Pichia pastoris
Department of Microbiology and Immunology, University of British Columbia - UBC
Il protocollo descrive l'espressione della proteina usando il lievito methylotrophic
JoVE General
Una schermata di High Throughput per Biomining attività Cellulase da librerie metagenomiche
Microbiology and Immunology, University of British Columbia - UBC
Questo protocollo descrive uno schermo ad alta velocità per l'attività cellulosolitici da una libreria metagenomica espressa in Escherichia coli. Lo schermo è soluzione basata e altamente automatizzata, ed utilizza una pentola chimica nel 384 micropiastre bene con la lettura finale come una misura di assorbanza.
Other articles by Marcus Taupp on PubMed
Crescita, Virulenza E Immunogenicità Di Mutanti Aro Di Listeria Monocytogenes
Mutanti di Listeria monocytogenes con delezioni di geni del ramo comune del percorso della biosintesi che porta a composti aromatici furono costruiti come ceppi possibile vettore attenuata virulenza per gli antigeni della proteina o vaccino DNA. aroA, Luca, e in particolare aroE mutanti hanno mostrato tassi di crescita fortemente ridotta nelle cellule epiteliali e persino nella ricca cultura media. Il metabolismo dei mutanti aro in queste condizioni è stato prevalentemente anaerobico. Metabolismo aerobico e un tasso di crescita del selvaggio-tipo erano, tuttavia, ha riguadagnati dopo l'aggiunta di vitamina K2, suggerendo che i mutanti di aro sono carenti di respirazione ossidativa a causa della mancanza di menachinone. Replica dei mutanti aro nel citosol della cellula ospite e la diffusione di cellula-cellula sono stati drasticamente rallentato, e aro tutti i mutanti ha mostrato virulenza elevata attenuazione nei topi, cioè, il 50% dose letale in topi BALB/c è stata aumentata ad almeno 4-fold per i mutanti aroA, Luca e aroA/B e > 5-fold per il mutante aroE rispetto al ceppo principale. Tuttavia, topi preimmunized con aro batteri mutanti ha suscitati buona risposta delle cellule T e una protezione completa contro una sfida successiva con il ceppo virulento di wild-type. Un totale di 5 x 10 aroA, Luca e aroA/B batteri mutanti sono stati sufficienti per ottenere una risposta protettiva delle cellule T, mentre 5 x 10, paragrafo 8 aroE o aroA/E mutanti sono state necessarie per raggiungere numeri paragonabili di cellule T antigene-specifiche. Questi numeri sono stati ben tollerati senza causare sintomi di malattia, che indica che i ceppi di Listeria con delezioni nei geni del ramo base del percorso dell'amminoacido aromatico potrebbero essere vettori vaccino utile per indurre immunità delle cellule T.
Fronte Enantioselectivities Di Due Simili Fenotipicamente E Genotipicamente Ceppi Di Pseudomonas Frederiksbergensis in Sulfoxidation Di Tutta La Cellula Batterica
Campioni di suolo sono stati proiettati per selezionare microrganismi con la capacità di ossidare i solfuri organici nei corrispondenti solfossidi con differenziale enantioselectivities. Diversi ceppi batterici che preferenzialmente prodotta l'enantiomero S-configurato solfossido sono stati isolati. Sorprendentemente, un ceppo batterico, genotipicamente e fenotipicamente caratterizzato come Pseudomonas frederiksbergensis, dato in modo selettivo l'enantiomero R. La constatazione che due organismi apparentemente identici visualizzati di fronte enantioselectivities è romanzo per organismi non geneticamente modificati.
Produzione Di Antranilato Di Metile Naturale Da Microbica N-demetilazione Del N-metil Antranilato Di Metile Dal Terriccio-isolato Batterio Bacillus Megaterium
Bacillus megaterium, isolato in un processo di screening da terriccio, è stato utilizzato per N-demetilazione del naturale antranilato di metile N-metilico per produrre antranilato di metile naturale. Produttività massima di 70 mg/L/giorno è stato ottenuto in condizioni di laboratorio senza ulteriore ottimizzazione. No sottoprodotti sono stati osservati. Così, la produzione di antranilato di metile "naturale" utilizzando megaterium b. è un miglioramento significativo sopra analoghe procedure già esistenti.
Cattura Diretta Di Formaldeide Formata Tramite N-demetilazione Ossidativa Di N, N-dialkylarylamines Da Bacillus Megaterium Mediante Derivatizzazione Cisteammina
N-demetilazione ossidativa è stata misurata mediante esperimenti di incubazione utilizzando Bacillus megaterium isolato da terriccio come un biocatalizzatore per la N-demetilazione del N, N-dialkylarylamines N, N-dimetilanilina e N-etil-N-metilanilina. Formato formaldeide, normalmente difficili da analizzare in sistemi biologici a causa di ulteriore metabolizzazione, è stato con successo intrappolato e convertito in thiazolidine tramite l'aggiunta di cisteammina in media di incubazione. Studia con N, N-di-(trideutero-methyl)-anilina e N-etil - N-(trideuteromethyl) - anilina così come N, N - di-[metil-(13) C] - anilina e N-ethyl-N-[methyl-(13)C]-aniline sono stati eseguiti per confermare che la N-demetilazione procede via formaldeide.
L'arte E Il Design Degli Schermi Metagenomica Funzionale
Questo articolo riassume i principi di progettazione generali per metagenomica funzionale. Il focus è su Escherichia coli come un host di espressione, anche se sistemi alternativi ospite-vettore sono discusse in relazione al recupero del gene in schermi basati su attività di ottimizzazione. Esempi di approcci di isolamento e di arricchimento del DNA, costruzione della libreria e read-out fenotipiche sono descritti con particolare enfasi sull'uso delle tecnologie high throughput per rapido isolamento dei cloni ambientali codifica tratti fenotipici di interesse.
