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Articles by Mark A. Borchardt in JoVE
JoVE Immunology and Infection
Filtres laine de verre pour concentration des virus d'origine hydrique et agricole des agents pathogènes zoonotiques
1Wisconsin Water Science Center, United States Geological Survey, 2University of Wisconsin – Madison, 3Agricultural Research Service, United States Department of Agriculture, 4Alaska Science Center, United States Geological Survey
Filtres de laine de verre ont été utilisés pour concentrer les virus d'origine hydrique par un certain nombre de groupes de recherche à travers le monde. Ici, nous montrons une approche simple pour la construction de filtres de laine de verre et de démontrer les filtres sont également efficaces dans la concentration d'origine hydrique, les bactéries pathogènes viraux et protozoaires.
Other articles by Mark A. Borchardt on PubMed
Incidence De Virus Entériques Dans Les Eaux Souterraines Des Puits Domestiques Dans Le Wisconsin
Des études récentes sur la contamination des eaux souterraines par des virus entériques humains ont mis l'accent sur les systèmes d'eau publics, alors que peu est connu sur la présence de virus dans les puits domestiques privés. L'objectif de la présente étude était d'estimer l'incidence des virus dans les puits domestiques situés à proximité des sites Wisconsin boues épandue sur des terres ou dans les subdivisions rurales desservies par des fosses septiques. Cinquante puits dans sept districts hydrogéologiques ont été échantillonnés quatre fois plus d'un an, une fois par saison. RT-PCR (RT-PCR), suivie par hybridation de Southern, a été utilisé pour détecter les entérovirus, rotavirus, l'hépatite A (VHA) et de type Norwalk virus (VDN). En outre, la culture cellulaire a été utilisé pour détecter les entérovirus cultivables. Des échantillons d'eau de compagnie ont été recueillies pour les coliformes totaux, Escherichia coli, entérocoques fécaux, F-spécifiques coliphages à ARN, les nitrates, et les analyses de chlorure. Parmi les 50 puits, quatre (8%) étaient positifs pour le virus par RT-PCR. Trois puits ont été positifs pour le VHA, et le quatrième était bien positif pour les deux rotavirus et NLV dans un échantillon et un entérovirus dans un autre échantillon. La contamination a été transitoire, étant donné qu'aucun des puits était positif pour le virus de deux échantillons successifs. Entérovirus cultivables n'ont pas été détectés dans l'un des puits. Indicateurs de la qualité de l'eau n'ont pas été statistiquement associée à la survenue du virus, bien que certains de concordance a été noté pour le chlorure. La présente étude est la première aux États-Unis pour surveiller systématiquement les puits domestiques privés pour contamination par le virus et, combinées avec des données pour les puits publics, prévoit en outre un aperçu de l'étendue de la contamination des eaux souterraines avec des virus entériques humains.
Aeromonas Isolats De Selles Diarrhéiques De L'homme Et Des Eaux Souterraines Comparés Par électrophorèse En Champ Pulsé
Infections gastro-intestinales des espèces Aeromonas sont généralement considérés comme d'origine hydrique; pour cette raison, Aeromonas hydrophila a été mis sur le United States Environmental Protection Agency Liste Candidate Contaminant des agents pathogènes émergents dans l'eau potable. Dans cette étude, nous avons comparé en champ pulsé motifs d'électrophorèse sur gel d'Aeromonas isole les échantillons de selles de patients atteints de la diarrhée avec des isolats d'Aeromonas de l'eau potable des patients. Parmi les échantillons de selles diarrhéiques 2565 soumis à un laboratoire du Wisconsin clinique de référence, 17 (0,66%) ont été testés positifs pour Aeromonas. Isolats d'Aeromonas des eaux souterraines ont été obtenus à partir de puits privés tout au long du Wisconsin et de l'eau potable d'Aeromonas patients positifs. L'analyse a montré que les isolats de l'eau potable et de selles ont été génétiquement non apparentées, ce qui suggère que dans cette population Aeromonas infections gastro-intestinales ne sont pas liés à l'exposition des eaux souterraines.
Densité Fosse Septique Et De La Diarrhée Infectieuse Dans Une Population Définie De L'enfance
Un quart des ménages américains utilisent une fosse septique pour l'élimination des eaux usées. Dans cette étude nous avons examiné si la densité de la fosse septique a été associée à la maladie diarrhéique endémique chez les enfants. Cas - enfants de 1 à <19 ans en quête de soins médicaux en cas de diarrhée aiguë - et des commandes résidé dans la zone de Marshfield étude épidémiologique, une cohorte basée sur la population dans le centre du Wisconsin. L'inscription était de Février 1997 à Septembre 1998. Participants à l'étude à une entrevue structurée, et la densité de la fosse septique a été déterminée à partir des permis sanitaires de comté. Puits domestiques ont été échantillonnées pour les bactéries pathogènes et des indicateurs de qualité de l'eau sanitaire. Les facteurs de risque ont été évalués pour les cas groupés par l'étiologie des diarrhées. Dans les analyses multivariées, la diarrhée virale a été associée avec le nombre de la tenue des systèmes de fosses septiques dans la section de 640 acres entourant la résidence cas [odds ratio ajusté (AOR), 1,08, intervalle de confiance 95% (IC), 01.02 à 01.15, p = 0,008 diarrhée], et bactérienne a été associée avec le nombre de bassins de rétention par 40-quart d'acre-quart de section (AOR, 1,22, IC 95%, de 1.02 à 1.46, p = 0,026). La diarrhée d'étiologie inconnue a été indépendamment associée à la consommation d'un ménage ainsi contaminés par des matières fécales entérocoques (AOR, 6,18, IC 95%, de 1,22 à 31,46, p = 0,028). Densités de fosses septiques ont été associés à la maladie diarrhéique endémique dans le centre du Wisconsin. L'association devrait être étudiée dans d'autres régions, et des normes pour les installations septiques doivent être évalués afin de s'assurer que la santé publique est protégée.
La Transmission De Salmonella Enterica Sérotype Typhimurium DT104 Pour Les Nourrissons Par Le Lait Maternel Des Mères
Cette étude documente la première transmission rapporté de Salmonella enterica sérotype Typhimurium type de définitif 104 (DT104) pour prématurés jumeaux fraternels par le lait maternel de leur mère. Lorsque jumeaux nouveau-nés prématurés mis au point une entérite sévère dans l'unité néonatale de soins intensifs (UNSI), des échantillons de selles et le lait maternel de la mère ont été cultivées pendant la présence de Salmonella. Les profils de sensibilité antibactériens ont été déterminés. Semi-quantitatives des données d'abondance organisme ont été rétrospectivement recueillies sur 54 échantillons de lait maternel stockées recueillies sur 34 jours différents en utilisant une méthode rapide, en temps réel la réaction en chaîne par polymérase (PCR) méthode (LightCycler PCR). Des échantillons de fèces de nourrissons d'autres à l'USIN à l'époque ont également été testés. Électrophorèse en champ pulsé (PFGE) a été utilisé pour évaluer la composition génétique des organismes isolés. Tabourets Les jumeaux nouveau-nés et des cultures le lait maternel du sein a révélé un profil de résistance (R-Type) à l'ampicilline, le chloramphénicol, la streptomycine, sulfamides et la tétracycline. LightCycler PCR analyse des échantillons de lait maternel séquentielles confirmé l'existence d'être la source probable de transmission. Dans l'enquête épidémiologique ultérieure, aucun des échantillons de surveillance UNSI fécaux se sont révélés positifs pour cet organisme. La composition génétique des organismes isolés du lait maternel ne se distinguait pas de celles isolées à partir d'échantillons néonatals tels que déterminés par électrophorèse en champ pulsé. Des tests de sensibilité aux antibiotiques associés à des profils électrophorétiques suggèrent que ces isolats de Salmonella ont été DT104. Parce que la prévalence de l'infection DT104 est en hausse aux Etats-Unis, néonatologistes doivent être conscients du lait maternel comme un mode de transmission potentielle.
La Vulnérabilité Des Puits D'eau Potable à La Crosse, Wisconsin, Aux Gastro-virus Contamination Par Des Contributions D'eau De Surface
Les virus entériques humains peuvent contaminer municipaux puits d'eau potable, mais peu d'études ont examiné les voies par lesquelles les virus pénètrent dans ces puits. Dans la présente étude, l'objectif était de surveiller les puits municipaux de La Crosse, Wisconsin, pour des virus entériques et de déterminer si le montant de la rivière Mississippi eau qui s'infiltre dans les puits a été liée à la fréquence de détection de virus. De Mars 2001 to Février 2002, un seul site l'eau de rivière et de quatre puits prédite par la modélisation hydrogéologique d'avoir des degrés variables de contributions d'eau de surface ont été échantillonnés mensuellement pour les virus entériques, les indicateurs microbiens de qualité sanitaire et les isotopes d'oxygène et d'hydrogène. (18) O / (16) O et (2) H / (1) les ratios H ont été utilisées pour déterminer le niveau des contributions des eaux de surface. Tous les échantillons ont été prélevés avant la chloration à la tête de puits. Par RT-PCR (RT-PCR), 24 de 48 échantillons d'eau municipaux ainsi (50%) étaient positifs pour les virus entériques, y compris les entérovirus, rotavirus, l'hépatite A (VHA), et norovirus. Sur les 12 échantillons d'eau, 10 (83%) étaient positifs du virus par RT-PCR. Entérovirus viables n'ont pas été détectés par culture cellulaire dans les échantillons ainsi, bien que trois échantillons ainsi étaient positifs pour le VHA cultivables. Les entérovirus détectées dans le puits par RT-PCR ont été identifiés comme plusieurs sérotypes de échovirus et le groupe A et groupe B coxsackievirus. Aucun des échantillons d'eau de puits a été positive pour les indicateurs de la qualité sanitaire, à savoir les hommes et spécifiques et des coliphages somatiques, le total des bactéries coliformes, Escherichia coli, entérocoques et coliformes. Contrairement aux attentes, les virus ont été trouvés dans tous les puits quel que soit le niveau des contributions des eaux de surface. Ce résultat suggère qu'il y avait d'autres sources non identifiées, en plus de l'eau de surface, responsables de la contamination.
L'utilisation De Promoteurs De Croissance Streptogramine Chez Les Volailles Et D'isolement Des Enterococcus Faecium Résistants Aux Streptogramines Chez Les Humains
Utilisation chez les volailles Virginiamycine sélectionne pour Enterococcus faecium à une résistance croisée à la quinupristine-dalfopristine, un médicament pour résistant à la vancomycine E. faecium chez les humains. Nous avons mené une étude épidémiologique des expositions de volaille comme facteurs de risque pour le transport de l'homme de la quinupristine-dalfopristine E. faecium résistants.
Identification D'un Nouveau Hémolysine Des Maladies Diarrhéiques Isoler SSU D'Aeromonas Hydrophila
Un SSU souche clinique de Aeromonas hydrophila produit une entérotoxine cytotoxique puissant (la Loi) avec des activités cytotoxiques, entérotoxique, et hémolytique. Un nouveau gène, qui code pour une hémolysine de résidus d'acides aminés 439-avec une masse moléculaire de 49 kDa, a été identifié. Cette hémolysine (HlyA) a été détecté sur la base de l'observation que le gène mutant acte, moins de A. hydrophila SSU avait encore une activité résiduelle hémolytique. Le nouveau gène hémolysine (hlyA) a été cloné, séquencé, et surexprimé dans Escherichia coli. Le gène hlyA exposé identité de 96% avec son homologue dans la séquence du génome récemment annoté d'un isolat environnemental, à savoir la souche type ATCC 7966 de A. hydrophila hydrophila sous-espèce. Le gène hlyA ne présentait aucune homologie avec d'autres hémolysines connus et les gènes aérolysine détectée dans les isolats d'Aeromonas. Toutefois, cette hémolysine exposé homologie significative avec des hémolysines des Vibrio vulnificus, ainsi qu'avec la protéine bêta-synthase de domaine cystathionine de oneidensis Shewanella. La protéine a été HlyA activé seulement après le traitement à la trypsine et l'activité hémolytique résultant n'était pas neutralisable avec des anticorps de la loi. La présence du gène dans les isolats d'Aeromonas hlyA cliniques et de l'eau a été étudiée et l'analyse des empreintes digitales d'ADN a été effectuée pour démontrer son rôle possible dans la virulence de Aeromonas.
Développement D'une Méthode Pour La Détection De Voie D'eau Microsporidies
Les microsporidies sont des pathogènes intracellulaires obligatoires capables d'infecter les humains. Il ya des preuves crédibles de suggérer que infection chez peuvent être transmises par la consommation de spores dans l'eau contaminée; toutefois, des méthodes pour détecter ce pathogène n'ont pas été normalisées et des études d'occurrence microsporidies n'ont pas été menées. Concentration des spores par centrifugation à flux continu (CFC), la purification par séparation immunomagnétique (IMS), et la détection par microscopie ou en temps réel la réaction en chaîne par polymérase (PCR) ont été évalués pour la détection des spores de Encephalitozoon intestinalis dans les échantillons d'eau ensemencés. L'efficacité de récupération des CFC en utilisant la détection microscopique variait de 38,7 à 75,5% dans l'eau du robinet filtrée. En utilisant une méthode indirecte d'IMS, de 78,8 à 90,2% de spores ensemencées ont été récupérés dans l'eau ultra-pure (18 M Omega), mais l'absence d'un anticorps monoclonal spécifique et la présence de particules d'autres interféré avec le test IMS dans certains échantillons troubles. Malgré des rendements de récupération faibles et la présence détectable d'inhibiteurs de PCR dans chacun des échantillons, une combinaison de la concentration de CFC, indirecte IMS, et PCR en temps réel produit un résultat positif au test dans six des dix échantillons d'eau naturelle (0,1 à 28,9 turbidité NTU) à un taux d'ensemencement de 50 spores / L.
Les Virus Entériques Humains Dans Les Eaux Souterraines D'un Aquifère Du Substratum Rocheux Clos
Aquifères captifs sont recouverts par une faible perméabilité aquitards qui sont communément admises pour protéger les nappes sous-jacentes de contaminants microbiens. Toutefois, les données empiriques sur la contamination microbienne sous aquitards est limité. Cette étude a déterminé la présence de virus pathogènes pour l'homme dans l'eau de puits à partir d'un aquifère gréseux profonde confinée par un aquitard d'envergure régionale de schiste. Trois publics d'approvisionnement en eau de puits ont été échantillonnés chaque 10 fois sur 15 mois. Les échantillons ont été analysés par réaction en chaîne de transcription inverse-polymérase (RT-PCR) pour les groupes de virus plusieurs et par culture cellulaire pour les entérovirus infectieux. Sept des 30 échantillons étaient positifs par RT-PCR pour les entérovirus, l'un d'eux était positif pour échovirus infectieuses 18. Les échantillons du virus-positives ont été recueillies à partir de deux puits tubé à travers l'aquitard, en indiquant les virus étaient présents dans l'aquifère. Les échantillons provenant des mêmes puits a montré tritium atmosphérique, indiquant l'eau rechargée dans les décennies à pastfew. Conditions hydrogéologiques en charge rapide de transport des milieux poreux de virus par le biais de l'aquifère de grès supérieur au sommet de l'aquitard 61 m sous la surface du sol. Fractures naturelles dans l'aquitard de schiste sont une voie possible le transport du virus par l'intermédiaire du aquitard, mais les fenêtres, cross-connexion des puits de forage, ou les joints de coulis imparfaits long et boîtiers peuvent également être impliqués. Profondes des aquifères captifs peuvent être plus vulnérables à la contamination par les virus humains qu'on ne le croit.
Concentration Des Entérovirus, Les Adénovirus, Et Les Norovirus De L'eau Potable Par L'utilisation De Filtres En Laine De Verre
Méthodes de filtration disponibles pour se concentrer virus d'origine hydrique sont soit trop coûteux pour les études qui nécessitent un grand nombre d'échantillons, limitées à de petits volumes d'échantillons, ou pas très portable pour les applications sur le terrain de routine. Sodocalcique de filtration de laine de verre est une méthode rentable et facile à utiliser pour conserver les virus, mais son efficacité et la fiabilité ne sont pas bien compris. Cette étude d'évaluer la performance de la laine de verre filtre pour concentrer les quatre virus de la liste US Agence de Protection environnementale des contaminants candidat, c.-à-, coxsackievirus, échovirus, norovirus, et l'adénovirus, ainsi que le poliovirus. Total des numéros de virus récupérés ont été mesurées par la transcription inverse-PCR quantitative (qRT-PCR); poliovirus infectieux ont été quantifiées par culture cellulaire intégrée (CPI)-qRT-PCR. Efficacité de la récupération moyenne de 70% pour le poliovirus, 14% pour les virus Coxsackie B5, 19% pour les échovirus 18, 21% pour l'adénovirus 41, et 29% pour les norovirus. Souche du virus et la récupération matrice d'eau touchée, avec une interaction significative entre les deux variables. Récupération optimale a été obtenue à pH 6,5. Aucune preuve n'a été constaté que le volume d'eau, le taux de filtration, et le nombre de virus ensemencés de récupération influencée. La méthode a réussi à détecter les virus autochtones dans les puits municipaux dans le Wisconsin. Filtration à long terme continue conservé virus suffisamment pour leur détection pour un maximum de 16 jours après l'ensemencement pour qRT-PCR et jusqu'à 30 jours pour les CPI-qRT-PCR. De filtration de laine de verre est adapté pour échantillons de grand volume (1000 litres) collectées à des taux de filtration élevés (4 min litres (-1)), et son faible coût rend avantageux pour les études qui nécessitent un grand nombre d'échantillons.
Effet De La Concentration Des Agents Pathogènes Sur L'enlèvement De Cryptosporidium Et Giardia Par Traitement De L'eau Potable Conventionnel
La présence de pathogènes entériques d'origine hydrique dans l'approvisionnement en eau municipaux contribue risque pour la santé publique. Afin d'évaluer l'élimination de ces agents pathogènes dans les processus de traitement d'eau potable, les chercheurs précédents ont connu une flambée des eaux brutes avec un maximum de 10 (6) agents pathogènes et de L, afin de détecter de manière fiable les agents pathogènes dans l'eau traitée. Ces doses sont pointes 6-8 ordres de grandeur plus élevé que les concentrations de pathogènes couramment observées dans la pratique. Dans la présente étude, les expériences ont été menées avec différentes méthodes d'échantillonnage (c.-à-benne par rapport échantillonnage en continu) et des concentrations initiales des agents pathogènes allant de 10 (1) à 10 (6) agents pathogènes / L. Les résultats ont montré que les oocystes de Cryptosporidium et le retrait kyste de Giardia dans le traitement conventionnel étaient tributaires des concentrations initiales des agents pathogènes, avec une baisse déménagements pathogènes observés lorsque la baisse initiale des agents pathogènes doses pointes ont été utilisés. En outre, plus la turbidité de l'eau brute a semblé entraîner la suppression du journal pour plus des oocystes de Cryptosporidium et des kystes de Giardia deux.
Effets De L'agent étiologique Et L'excrétion Des Agents Pathogènes Baigneuse Sur L'interprétation Des Données épidémiologiques Utilisées Pour Fixer Des Normes De Qualité Des Eaux De Loisirs
L'objectif global de l'étude ont rapporté ici était d'utiliser des techniques dans le domaine de l'évaluation des risques (en particulier un modèle de population l'espace d'état dynamique de transmission de la maladie dans les eaux de loisirs) pour explorer l'importance relative de (1) actif effusion de micro-organismes des baigneurs eux-mêmes , et (2) le type et la concentration de l'agent étiologique de l'hétérogénéité observée de l'incidence de la maladie dans les études épidémiologiques qui ont été utilisés pour développer des critères de qualité de l'eau ambiante. L'agent étiologique et de la dose ingérée correspondant lors d'un contact de loisirs a été trouvé à un impact significatif sur l'incidence observée de la maladie dans une étude épidémiologique menée dans l'eau de loisirs. En outre, l'incidence observée de la maladie a été trouvée pour ne pas nécessairement refléter les concentrations de fond de micro-organismes indicateurs, mais plutôt des micro-organismes versé lors d'un contact de loisirs. De futures révisions de l'air ambiant des critères de qualité de l'eau doit répondre à l'agent étiologique, la dose et l'importance de l'excrétion microbienne par rapport aux concentrations de fond de pathogènes et d'organismes indicateurs, en plus de l'incidence de la maladie et la concentration de micro-organismes indicateurs. Sans une évaluation quantitative de ces variables supplémentaires, résultats de l'étude peuvent potentiellement être spécifiques au site et n'est pas représentative des risques pour la santé associés aux concentrations d'indicateurs spécifiques dans toutes les eaux récréatives.
Évaluation De La Contamination De La Source D'égout De Puits D'eau Potable Utilisation De Traceurs Et Virus Entériques Humains
Cette étude a porté sur la source, le transport, et la présence de virus entériques humains dans l'eau de puits municipaux, en se concentrant sur les sources d'égouts sanitaires. Un total de 33 puits à partir de 14 collectivités ont été échantillonnés une fois pour traceurs des eaux usées et les virus. Des eaux usées traceurs ont été détectées dans quatre de ces puits, et cinq puits ont été virus-positive par qRT-PCR. Ces résultats, ainsi que l'exclusion du puits avec des sources d'eau de surface, ont été utilisés pour sélectionner les trois puits pour complément d'enquête. Les virus et les traceurs des eaux usées ont été trouvés dans les eaux souterraines sur tous les sites. Certains traceurs des eaux usées, tels que les détergents ioniques, retardateurs de flamme, et le cholestérol, ont été considérés comme des preuves sans équivoque des eaux usées. L'échantillonnage à un moment donné peut ne pas apparaître le virus et la présence simultanée du traceur, mais, compte tenu de l'échantillonnage suffisante au fil du temps, une relation entre traceurs des eaux usées ainsi que l'apparition du virus a été identifié. Présence de virus infectieux à la tête de puits montre que la capacité de pompage de haute-induite temps de déplacement doivent être suffisamment courts pour le transport de virus infectieux. Par conséquent, puits d'eau potable sont vulnérables aux contaminants qui se déplacent le long des eaux souterraines voies d'écoulement rapide, même si elles contribuent d'une petite quantité de virus chargé de l'eau au puits. Ces résultats suggèrent que les évaluations de vulnérabilité nécessitent la caractérisation de «faible rendement rapide de transport", en plus de traditionnelle "à haut rendement-lent de transport", les voies.
Répartition Des Facteurs De Virulence Et Caractérisation Moléculaire Des Espèces Aeromonas Isolats Provenant D'échantillons D'eau Et Clinique: Signes Suggestifs De L'eau-de-transmission Interhumaine
Un total de 227 isolats d'Aeromonas obtenus à partir de différents emplacements géographiques des États-Unis et les différentes parties du monde, dont 28 souches de référence, ont été analysés pour déterminer la présence de facteurs de virulence différents. Ces isolats ont également été empreintes digitales, avec identification biochimique et l'électrophorèse en champ pulsé (PFGE). Parmi ces 227 isolats, 199 qui ont été recueillis à partir d'eau et des échantillons cliniques appartenaient à trois grands groupes ou complexes, à savoir le groupe A. hydrophila, le A. caviae-A. groupe de médias, et le A. veronii-A. sobria groupe, basé sur les profils biochimiques, et ils ont eu pulsotypes divers. Lorsque les activités des facteurs de virulence ont été examinés, Aeromonas isolats obtenus à partir de sources cliniques étaient plus élevés que les activités cytotoxiques isolats obtenus à partir de sources d'eau pour les trois groupes d'espèces Aeromonas. De même, la production de quorum-sensing molécules de signalisation, tels que la N-acyl homosérine lactone, était plus grande dans les isolats cliniques que dans les isolats de l'eau pour l'A. caviae-A. des médias et des groupes A. hydrophila. Basé sur l'hybridation d'ADN colonie blot, le gène entérotoxine thermolabile cytotonique et l'ADN du gène adénosine méthyltransférase étaient plus fréquents dans les isolats cliniques que dans les isolats de l'eau pour tous les groupes Aeromonas trois. Utilisation de l'hybridation d'ADN colonie blot et ECP, nous avons obtenu trois ensembles de l'eau et des isolats cliniques qui ont eu la même virulence, la signature et a eu des profils électrophorétiques indiscernables. En outre, l'ensemble de ces isolats appartenaient à la A. caviae-A. groupe de médias. Les conclusions de la présente étude fournissent la première preuve suggestive de la colonisation réussie et l'infection par des souches particulières de certaines espèces d'Aeromonas après la transmission de l'eau pour les humains.
Éclosion De Norovirus Causés Par Un Nouveau Système Septique Dans Un Aquifère Dolomite
Les fosses septiques qui sont construits en conformité avec les règlements ne sont généralement pas s'attendre à être la cause d'épidémies de maladies d'origine souterraine, en particulier dans les zones avec des zones vadose épais. Cependant, cette étude de cas démontre qu'une épidémie peut se produire dans un tel contexte et décrit la combinaison de méthodes épidémiologiques, microbiologiques et hydrogéologique utilisés pour confirmer la source de l'éclosion. Au début de Juin 2007, 229 clients et des employés d'un nouveau restaurant dans le nord du Wisconsin ont été touchées par la gastro-entérite aiguë; 6 personnes ont été hospitalisées. Épidémiologique cas-témoin a indiqué que l'analyse de l'eau potable ainsi le restaurant a été associée à la maladie (odds ratio = 3,2, intervalle de confiance à 95% = 0,9 à 11,4, P = 0,06). L'analyse microbiologique (quantitative réaction inverse de la chaîne de transcription-polymerase) mesurée à 50 copies génomiques par litre de norovirus du génogroupe I dans l'eau du puits. Le séquençage des nucléotides a déterminé le génotype comme GI.2 et montré en outre que le virus était présent dans identiques des échantillons de selles des mécènes et dans la fosse septique. Des essais de traçage utilisant des colorants injectés à deux points dans la fosse septique a montré que les effluents se rendait à partir des réservoirs (par le biais d'un raccord qui fuit) et sur le terrain d'infiltration pour le bien de 6 et 15 j, respectivement. Le système de restauration septique et bien (85-m de profondeur, dans un aquifère fracturé la dolomie) à la fois conforme aux codes du bâtiment de l'État. L'arrivée précoce de colorant dans le puits, qui était de 188 m de la fosse septique et situé sous une zone de 35 m d'épaisseur non saturée, démontre que dans les paramètres hydrogéologiques très vulnérables, le respect des règlements ne peut pas fournir une protection adéquate contre les pathogènes fécaux.
La Contamination Du Virus à Partir Des événements D'exploitation Et De Maintenance Dans Les Systèmes De Distribution D'eau Potable Petits
Nous avons testé l'association d'événements communs dans les systèmes de distribution d'eau potable avec la contamination de l'eau du robinet des ménages avec des virus entériques humains. Les virus ont été dénombrés par qPCR dans l'eau du robinet de 14 systèmes municipaux qui utilisent les eaux souterraines non désinfectées. Désinfection par rayonnement ultraviolet a été installé à tous les têtes de puits actifs pour réduire les cotisations de virus à partir des eaux souterraines à des systèmes de distribution. En l'absence de désinfectant résiduel a été ajouté à l'eau, toute augmentation de la concentration du virus mesurée en aval au niveau des robinets des ménages serait indicative d'intrusions de réseaux de distribution. Opérateurs de services publics ont rapporté des événements au moyen de questionnaires écrits. Mesures des résultats de virus ont été liés à des événements du système de distribution en utilisant la régression binomiale et gamma. Concentrations de virus étaient élevés dans le puits, réduits ou éliminés par désinfection par rayonnement ultraviolet, et élevé à nouveau dans les systèmes de distribution, montrant que les virus étaient, en effet, en entrant directement les systèmes. L'installation du tuyau était significativement associée à des niveaux plus élevés de virus, alors que rinçage bouche était significativement associée à des niveaux inférieurs de virus. La faiblesse des associations positives ont été observées pour l'entretien des tours d'eau, la vanne de l'exercice, et le découpage d'une conduite principale. Des bactéries coliformes détections de surveillance de routine n'ont pas été associées à des virus. Comprendre quand les systèmes de distribution sont les plus vulnérables à la contamination par le virus, et en prenant des mesures de précaution, assurera la livraison d'eau potable.
Lachnospiraceae Et Les Autres Indicateurs Fécaux Bacteroidales Reveal Chronique Contamination Des Eaux Usées Humaines Dans Un Port Urbain
La complexité des communautés microbiennes fécales et les chevauchements entre les sources animales de l'homme et d'autres ont rendu difficile d'identifier la source spécifiques bactéries fécales indicatrices. Cependant, l'avènement des technologies de séquençage de nouvelle génération offre désormais plus de puissance de séquençage pour résoudre composition de la communauté microbienne à l'intérieur et entre les environnements. Ces données peuvent être exploitées pour l'information sur la source spécifiques phylotypes et / ou des assemblages de phylotypes (c.-à-signatures microbiennes). On signaler l'apparition d'un nouveau marqueur génétique de contamination fécale humaine identifié par l'analyse de séquence pyrotag microbienne de la région du gène V6 ARNr 16S. L'analyse des séquences de 37 échantillons d'eaux usées et la comparaison avec des séquences de bases de données a révélé une phylotype humaine associée au sein de la famille Lachnospiraceae, qui a été étroitement liée à la Blautia genre. Cette phylotype, appelé Lachno2, était en moyenne de la deuxième plus abondant phylotype bactéries fécales dans des échantillons d'eaux usées influents de Milwaukee, WI. Nous avons développé une PCR quantitative (qPCR) pour détecter les Lachno2 et utilisé avec les tests de PCR en temps réel basés sur de l'homme Bacteroidales (basé sur le marqueur génétique HF183), le total des Bacteroidales spp., Et les entérocoques et les E. coli et des dosages classiques entérocoques numération sur plaque d'examiner la prévalence de la pollution fécale fécales humaines et dans le port de Milwaukee. Tant les indicateurs classiques fécaux et les indicateurs associés aux humains a révélé la pollution fécale chronique dans le port, avec des augmentations significatives suite à des événements de fortes pluies et des débordements d'égouts unitaires. Les deux associés aux humains abondance de marqueurs génétiques ont été étroitement corrélées dans le port, une forte indication qu'ils ciblent la même source (c.-à-épuration de l'homme). Les adénovirus humains ont été détectées dans toutes les conditions dans le port, et la probabilité de leur occurrence a augmenté de 154% pour chaque augmentation de 10 fois dans la concentration de l'indicateur de l'homme. Les deux Bacteroidales Lachno2 et humain a augmenté la spécificité pour détecter des eaux usées par rapport à des indicateurs généraux, et la relation à un groupe pathogène humain suggère que l'utilisation de ces indicateurs alternatifs pour améliorer les évaluations des risques pour la santé humaine dans les eaux urbaines.
