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Articles by Mathias Munschauer in JoVE
JoVE General
PAR剪辑 - 一个方法来确定全转录组学，RNA结合蛋白的结合位点
1Howard Hughes Medical Institute, Laboratory of RNA Molecular Biology, Rockefeller University, 2Berlin Institute for Medical Systems Biology, Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine, 3Biozentrum der Universität Basel and Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), 4Biozentrum der Universität Basel and Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), 5Genomics Resource Center, Rockefeller University
RNA转录受到广泛的是由众多的反式作用的RNA结合蛋白（限制性商业惯例）介导的转录后调控。在这里，我们提出了一个普及的方法，准确地确定和一个转录大规模RNA结合位点的限制性商业惯例。
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转录过程全由 PAR 剪辑 RNA 结合蛋白和 MicroRNA 目标站点的标识。
RNA 誊本是转录后基因监管涉及数以百计的 RNA 结合蛋白 (限制性商业惯例) 和含有 microRNA 的核糖核蛋白复合物 (miRNPs) 表示单元格类型的依赖方式。我们开发的基于单元格的交联方法来确定在高分辨率和转录组全细胞的限制性商业惯例和 miRNPs 的结合点。交联站点中编写从 immunopurified RNPs 4 thiouridine 治疗细胞扩增胞苷过渡到胸苷所发现。我们几个的密集研究的限制性商业惯例和 miRNPs，包括 PUM2、 QKI、 IGF2BP1 3、 戈/EIF2C1-4 和 TNRC6A C.确定的结合位点和规管的后果我们的研究显示这些因素绑定成千上万的站点包含定义的序列图案为 exonic 与内含子或编码与翻译有不同喜好谈话内容区域。跨转录过程结合位点的精确映射将迅速新兴数据之间的个人和这些变化如何贡献复杂遗传疾病的遗传变异的解释的关键。
