Michael Q. Zhang Computational Biology and Bioinformatics Cold Spring Harbor Laboratory Biography Publications Institution JoVE Articles Michael Q. Zhang has not added a biography. If you are Michael Q. Zhang and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Nouveaux Programmes De Transcriptionnelles Dépendant Foxo1 Contrôlent La Fonction Des Cellules T(reg) Nature. Nov, 2012 | Pubmed ID: 23135404 Éléments Régulateurs Des Gènes De Protéines Ribosomiques Caenorhabditis Elegans BMC Genomics. Aug, 2012 | Pubmed ID: 22928635 Localisation De Génome-large De Liaison De La Protéine-ADN Et Modification Des Histones Par Une Méthode Bayésienne De Changement-point Avec Des Données De ChIP-seq PLoS Computational Biology. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22844240 MicroARN Et état De La Chromatine Déterminent La Dynamique D'expression De Gène Différent Sensible à La Stimulation De TNF Genomics. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22824656 La Chromatine Bivalent-comme Marqueurs Sont Prédictifs Pour Distribution Sur Le Site Début Transcription Chez Les Humains PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22768038 H3K4 Déméthylation Par Jarid1a Et Jarid1b Contribue Au Rétinoblastome-mediated Gene Silencing Au Cours De La Sénescence Cellulaire Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jun, 2012 | Pubmed ID: 22615382 Cellule-type-based Analysis of MicroRNA Profils Dans Le Cerveau De Souris Neuron. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22243745 Une Méthode De Découverte De Motif Très Efficient Et Efficace Pour Les Données De ChIP-seq/ChIP-chip à L'aide Des Données De Position Nucleic Acids Research. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22228832 Nouveau Modèle De Markov De Pluripotence Induite Prédit Des Modifications De L'expression Génique Dans La Reprogrammation BMC Systems Biology. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22784579 Inférence Des Haplotypes De Variations Numéros De Copie De Données Haut Débit Avec Incertitude G3 (Bethesda, Md.). Jun, 2011 | Pubmed ID: 22384316 Identification De Nouvelles Voies Androgène Réglementés Et Isoformes De L'ARNm Par Génome Exon Spécifique Profiling of Le Transcriptome LNCaP PloS One. 2011 | Pubmed ID: 22194994 Identification Des Suppresseurs De Tumeur Et Oncogènes Des Caractéristiques Génomiques Et épigénétiques Dans Le Cancer Des Ovaires PloS One. 2011 | Pubmed ID: 22174824 EpiRegNet : Construire Le Réseau De Régulation épigénétique De Données à Haut Débit Sur L'expression Génique Pour Les Humains Epigenetics : Official Journal of the DNA Methylation Society. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22139581 L'étude Du Facteur De Pionnier De FoxA à Gènes Silencieuses Révèle Rehausseur De Rfx-réprimée à Cdx2 Et Un Indicateur Potentiel De Développement De L'adénocarcinome Oesophagien PLoS Genetics. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21935353 SpliceTrap : Une Méthode Pour Quantifier L'épissage Alternatif Dans Des Conditions Cellulaires Unique Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21896509 Corrélés D'évolution Des Facteurs De Transcription Et De Leurs Sites De Liaison Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21896508 Clonage Direct D'ARN Double Brin De L'analyse De Protection De RNase Révèle Des Modes De Traitement De C/D Boîte Introniques Et Fournit Des Preuves Pour L'expression De Transcription Antisens Généralisée Nucleic Acids Research. Dec, 2011 | Pubmed ID: 21880592 Mutation Fonctionnelle De SMAC/DIABLO, Codant Pour Une Protéine Pro-apoptotique Mitochondriale, Entraîne Une Perte Auditive Progressive Humaine DFNA64 American Journal of Human Genetics. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21722859 Puce-tableau : Analyse Combinatoire Des Données D'expression Génique ChIP-seq/puce Et « Microarray » Pour Découvrir Des Cibles Directes/indirectes D'un Facteur De Transcription Nucleic Acids Research. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21586587 Profils De Modification Des Histones Sont Prédictifs Pour L'expression Spécifique De Type Cellulaire/tissulaire Des Gènes Codant Pour Des Protéines Et De Micro-ARN BMC Bioinformatics. 2011 | Pubmed ID: 21569556 Comparaison Des Méthodes Basées Sur Le Séquençage De Méthylation De L'ADN Le Profil Et L'identification Des Modifications épigénétiques Monoallelic Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852635 Un ARN De Non-codage Retenu Longtemps Nucléaires Réglemente La Synaptogenèse En Modulant L'expression Des Gènes The EMBO Journal. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20729808 Développement Du Réseau De Micro-ARN De Cancer Chez L'homme Silence. 2010 | Pubmed ID: 20226080 Transcriptome étude Pour Début Hématopoïèse--réalisation, De Défi Et De Nouvelles Possibilités Journal of Cellular Physiology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20143329 SFSSClass : Une Approche Intégrée Pour MiRNA Base De Classification De La Tumeur BMC Bioinformatics. 2010 | Pubmed ID: 20122194 Mises à Jour Du Logiciel De Cartographie Court-lecture PAGD Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2009 | Pubmed ID: 19736251 Haute Définition De Profilage De Méthylation De L'ADN Chez Les Mammifères Par Capture De Tableau Et Séquençage De Bisulfite De Molécules Simples Genome Research. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19581485 Une Approche De Génomique Intégrative Identifie L'hypoxie Inducible Factor-1 (HIF-1)-cibler Des Gènes Qui Forment La Réponse Du Coeur à L'hypoxie Nucleic Acids Research. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19491311 Le Transcriptome De Cellules Souches-cellules Souches Hématopoïétiques Humaines CD34 + Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2009 | Pubmed ID: 19416867 Détermination Des Modifications D'histone Enrichi Dans Les Portions Non Géniques Du Génome Humain BMC Genomics. 2009 | Pubmed ID: 19335899 Découverte Du Gène Module Reposant Sur Un Jeu Dans Le Transcriptome De Cancer Du Sein BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19243633 La Septième Conférence Asie-Pacifique Bioinformatique (APBC2009) BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19208108 Multi-étape D'analyse De L'expression Génique Et Le Règlement De Transcription Dans Le Développement C57/B6 Foie De Souris Genomics. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19015022 Prédiction De Haute Résolution De Base Humaine-promoteur Avec CoreBoost_HM Genome Research. Feb, 2009 | Pubmed ID: 18997002 Analyse Bioinformatique Intégrative De Transcriptional Programmes De Réglementation Dans Les Cellules Cancéreuses Du Sein BMC Bioinformatics. 2008 | Pubmed ID: 18823535 Définir Le Réseau De Régulation Des Facteurs Spécifiques Des Tissus épissage Fox-1 Et Fox-2 Genes & Development. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18794351 ZOOM ! Zillions D'oligos Mappé Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2008 | Pubmed ID: 18684737 Règlement De L'isozyme PDK4 Par Le Rb-E2F1 Complexe The Journal of Biological Chemistry. Oct, 2008 | Pubmed ID: 18667418 Poly A - Transcrits Exprimés Dans Les Cellules HeLa PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18665230 Marques De Méthylation Des Histones Jouent Un Rôle Important Dans La Prédiction De L'état De Méthylation Des îles De CpG Biochemical and Biophysical Research Communications. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18656446 Modes Combinatoires D'investigué Histone Et Méthylations Dans Le Génome Humain Nature Genetics. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18552846 Identification De Cibles Synaptiques De Drosophila Pumilio PLoS Computational Biology. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18463699 Sur Le Réseau Mondial Inférence Des Gènes De Maladies Molecular Systems Biology. 2008 | Pubmed ID: 18463613 Paysage De RNA D'évolution Pour Discrimination Intron Exon Optimale Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18391195 Règlement CD36 Dépendant Du Muscle FoxO1 Et PDK4 Dans L'adaptation De Delta/bêta-mediated PPAR Au Stress Métabolique The Journal of Biological Chemistry. May, 2008 | Pubmed ID: 18308721 À L'aide Des Scores De Qualité Et Des Lectures Plus Améliore La Précision De Solexa Lire Cartographie BMC Bioinformatics. 2008 | Pubmed ID: 18307793 Genome Research. May, 2008 | Pubmed ID: 18292219 90Beta1 De Protéine Pour Le Choc Thermique Est Essentiel Pour Les Polyinsaturés Induite Par L'acide Gras Mitochondrial Efflux De Ca2 + The Journal of Biological Chemistry. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18178560 Facteurs De Régulation De L'interféron Sont Des Régulateurs Transcriptionnels De L'adipogenèse Cell Metabolism. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18177728 Cartographie Du Génome Et L'analyse Des Promoteurs Actifs Dans Les Cellules Souches Embryonnaires De Souris Et Organes Adultes Genome Research. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18042645 Identification Des éléments Cis-régulateurs MicroARN Phylogénétiquement Conservée à Travers Les 12 Espèces De Drosophile Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2008 | Pubmed ID: 18037683 Sites De Liaison Protéine Putative Zinc Doigt Sont Surreprésentées Dans Les Limites Des îles De CpG Résistants à La Méthylation Dans Le Génome Humain PloS One. 2007 | Pubmed ID: 18030324 Prédiction De La Transcription Démarrer Sites Basés Sur La Sélection Des Fonctionnalités à L'aide De AMOSA Computational Systems Bioinformatics / Life Sciences Society. Computational Systems Bioinformatics Conference. 2007 | Pubmed ID: 17951823 OSCAR : Une Classe SVM Pour La Reconnaissance Précise Des éléments Cis Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2007 | Pubmed ID: 17921174 Analyse Computationnelle Des Promoteurs Eucaryotes BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17903284 Neural Potentiel D'une Population De Cellules Souches Dans Le Follicule Pileux Cell Cycle (Georgetown, Tex.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17873521 Double Spécificité Splice Fonction Sites Alternativement Comme Sites D'épissage 5' Et 3' Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Sep, 2007 | Pubmed ID: 17848517 Impact évolutif De Limitée Fidélité épissage Des Gènes Chez Les Mammifères Trends in Genetics : TIG. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17719121 Un élément Hautement Conservé De Régulateur Contrôle L'expression Hématopoïétique De GATA-2 Chez Le Poisson Zèbre BMC Developmental Biology. 2007 | Pubmed ID: 17708765 Des Modèles Prédictifs De La Régulation Génique : Application Des Méthodes De Régression De Données Microarray Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2007 | Pubmed ID: 17634611 Analyse Des Vertébrés Isolateur Protéine Liant Le FCCT Sites Dans Le Génome Humain Cell. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17382889 Rôles Critiques Pour Dicer Dans Le Féminin Dans Les Cellules Germinales Genes & Development. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17369401 Stimuler Avec Des Souches Pour Prédire Les Sites De Début De Transcription Genome Biology. 2007 | Pubmed ID: 17274821 Signification Statistique Des Modules Cis-régulation BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17241466 Calcul Des Valeurs De Probabilité Exactes Pour Les Motifs De L'ADN Bioinformatics (Oxford, England). Mar, 2007 | Pubmed ID: 17237046 Tissu-spécifique Des éléments Régulateurs Dans Les Promoteurs De Mammifères Molecular Systems Biology. 2007 | Pubmed ID: 17224917 Computational Prédiction De Nouvelles Composantes De Réseaux Transcriptionnels De Poumon Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2007 | Pubmed ID: 17050569 Isolement De Pan-génome Des Transcriptions De Faible Abondance En Utilisant La Balise SAGE FEBS Letters. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17113583 Une Nouvelle Méthode Pour Détecter Les Points Chauds De Recombinaison Humain Et Ses Applications Aux Données HapMap Encoder American Journal of Human Genetics. Oct, 2006 | Pubmed ID: 16960799 Prédire L'état De Méthylation Des îles De CpG Dans Le Cerveau Humain Bioinformatics (Oxford, England). Sep, 2006 | Pubmed ID: 16837523 Une Matrice De Score De Spécificité Accrue Pour La Prédiction Des Exhausteurs D'épissage Silenceur SF2/ASF-spécifiques Human Molecular Genetics. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16825284 Computational Prédiction Du Statut De La Méthylation Dans Les Séquences Génomiques Humaines Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16818882 Manière Adaptative Inférence Des Sous-réseaux Transcriptionnelle Humaine Molecular Systems Biology. 2006 | Pubmed ID: 16760900 Characterization of RNase R Digérés Cellulaire Source RNA Consistant En Sautoir Et ARN Circulaire De L'épissage De L'ARN Pré-messager Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16682442 Une Propriété De Clusterisation De Sites De Fixation De Facteur De Transcription Très Dégénéré Dans Le Génome Des Mammifères Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16670430 Profilage Des Isoformes ARNm épissés Alternativement Pour La Classification Du Cancer De La Prostate BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 16608523 Motifs D'ADN Chez Les Humains Et Les Souris Proximale Promoteurs Prédisent L'expression Tissu-spécifique Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16606849 Structure à Grande échelle De Génomique De Méthylation Genome Research. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16365381 Utiliser CorePromoter Pour Trouver Des Promoteurs Du Cœur Humain Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Jul, 2005 | Pubmed ID: 18428749 Régulation De L'expression Des Gènes Par Le Biais De Rétention Nucléaire RNA Cell. Oct, 2005 | Pubmed ID: 16239143 Distribution De SR Protéine Silenceur épissage Enhancer Motifs Dans Les Gènes Codant Pour Des Protéines Humaines Nucleic Acids Research. 2005 | Pubmed ID: 16147989 Genome-wide Promoteur Extraction Et Analyse Chez L'humain, Souris Et Rat Genome Biology. 2005 | Pubmed ID: 16086854 Extraction De Données ChIP-chip Pour Le Facteur De Transcription Et De Sites De Fixation De Cofacteur Bioinformatics (Oxford, England). Jun, 2005 | Pubmed ID: 15961485 Identification Des Sites De Fixation De Facteur De Transcription Sélective Des Tissus Dans Vertébrés Promoteurs Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15668401 De Ver Pour Homme : Approches De Bio-informatique Pour Identifier Des Gènes Cibles FOXO Mechanisms of Ageing and Development. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15610780 TRED : Une Base De Données élément De Régulation Transcriptionnelle Et Une Plateforme En études De Régulation Génique Silico Nucleic Acids Research. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15608156 DWE : Discrimine énumérateur De Mot Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2005 | Pubmed ID: 15333453 Similitude Des Matrices De Fréquence De Position Pour Les Sites De Liaison De Facteurs De Transcription Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2005 | Pubmed ID: 15319260 Le Génome De La Souris : Examen Expérimental Des Prédictions De Gène Et Transcription Démarrer Sites Genome Research. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15574821 Interactions Des Modèles De Régulation Génique Coopérative Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2004 | Pubmed ID: 15534222 Genome-wide Prévision Et Analyse Des Sites De Fixation De Facteur De Transcription Des Fonctions Spécifiques In Silico Biology. 2004 | Pubmed ID: 15506990 Preuve Et Caractéristiques Des Hotspots De Recombinaison Alpha Humain Putatif Human Molecular Genetics. Nov, 2004 | Pubmed ID: 15385449 Règlement Combinatoire De Facteurs De Transcription Et De Motifs De Liaison De L'identification Genome Biology. 2004 | Pubmed ID: 15287978 Transcription Factor Binding élément Détection Utilisant Fonctionnelle De Regroupement Des Données D'expression Mutant Nucleic Acids Research. 2004 | Pubmed ID: 15115798 Identification De Coopérativité Parmi Les Facteurs De Transcription Contrôlent Le Cycle Cellulaire Chez La Levure Nucleic Acids Research. Dec, 2003 | Pubmed ID: 14627835 Logiciels Pour Trouver Des Gènes Dans L'ADN Génomique De Plantes Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2003 | Pubmed ID: 14501060 ESEfinder : Une Ressource Web Pour Identifier Les Enrichisseurs épissage Silenceur Nucleic Acids Research. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12824367 Un Global Rôle Régulateur Transcriptionnel De C-Myc Dans Les Cellules De Lymphome De Burkitt Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12808131 Computational Comparaison Des Deux Génomes De Projet De La Souris Et L'humain Golden Path Genome Biology. 2003 | Pubmed ID: 12537546 La Famille Argonaute : Tentacules Qui Atteignent Dans RNAi, Contrôle Du Développement, L'entretien Des Cellules Souches Et Tumorigenèse Genes & Development. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12414724 Couplage De La Machine De Mort Cycle Cellulaire Et Les Cellules De E2F De Direct Nature Cell Biology. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12389032 Expression Des Gènes Dans Le Développement Humain Hippocampe De Profilage Journal of Neuroscience Research. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12271469 Extraire Des Informations Fonctionnelles Des Puces à ADN : Un Défi Pour La Génomique Fonctionnelle Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12271149 Prédiction Numérique Des Gènes Codant Pour Des Protéines Eucaryotes Nature Reviews. Genetics. Sep, 2002 | Pubmed ID: 12209144 GFScan : Un Outil De Recherche Famille De Gène Au Niveau De L'ADN Génomique Genome Research. Jul, 2002 | Pubmed ID: 12097353 Génomique Fonctionnelle Comme Appliquée à La Cartographie Des Réseaux Régulateurs De Transcription Current Opinion in Microbiology. Jun, 2002 | Pubmed ID: 12057687 A Novel bayésienne changement de point Algorithme pour l'échelle du génome Analyse des données ChIPseq divers types de Haipeng Xing1, Willey Liao1,2, Yifan Mo1,2, Michael Q. Zhang2,3 1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas JoVE 4273 Biology
A Novel bayésienne changement de point Algorithme pour l'échelle du génome Analyse des données ChIPseq divers types de Haipeng Xing1, Willey Liao1,2, Yifan Mo1,2, Michael Q. Zhang2,3 1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas JoVE 4273 Biology