Michael Q. Zhang Computational Biology and Bioinformatics Cold Spring Harbor Laboratory Biography Publications Institution JoVE Articles Michael Q. Zhang has not added a biography. If you are Michael Q. Zhang and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Roman Foxo1-abhängige Transkriptionelle Programme Steuern T(reg)-Zelle-Funktion Nature. Nov, 2012 | Pubmed ID: 23135404 Regulatorische Elemente Von Caenorhabditis Elegans Ribosomal Protein Genen BMC Genomics. Aug, 2012 | Pubmed ID: 22928635 Genomweiten Lokalisierung Von Protein-DNA-Bindung Und Histon Änderungen Durch Eine Bayes-Änderung-Punkt-Methode Mit ChIP-Seq-Daten PLoS Computational Biology. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22844240 Chromatin-Zustand Und MicroRNA Bestimmen Verschiedene Gen-Ausdruck Dynamik Reagieren Auf TNF-Stimulation Genomics. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22824656 Bivalent-wie Chromatin Marker Sind Vorausschauende Vertriebsnetz Transkription Start Website Mensch PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22768038 H3K4 Demethylierung Von Jarid1a Und Jarid1b Trägt Zum Retinoblastom-vermittelte Gen-silencing Während Der Zellulären Seneszenz Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jun, 2012 | Pubmed ID: 22615382 Zell-Typ-basierte Analyse Von MicroRNA-Profile in Das Gehirn Der Maus Neuron. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22243745 Eine Sehr Effiziente Und Effektive Motiv Ermittlungsmethode Für ChIP-Seq/ChIP-Chip-Daten Mithilfe Von Positionsinformationen Nucleic Acids Research. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22228832 Neuartige Markov-Modell Der Induzierten Pluripotenz Prognostiziert Gen Ausdruck Änderungen Eine Anpassung BMC Systems Biology. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22784579 Herleiten Von Haplotypen Der Copy Number Variationen Von Hochdurchsatz-Daten Mit Unsicherheit G3 (Bethesda, Md.). Jun, 2011 | Pubmed ID: 22384316 Identifizierung Der Neuartigen Androgen Geregelten Bahnen Und MRNA-Isoformen Durch Genomweiten Exon-spezifischen Profilierung Von LNCaP-Transkriptom PloS One. 2011 | Pubmed ID: 22194994 Identifizierung Der Tumor Suppressors Und Onkogene Von Genomischen Und Epigenetischen Merkmale Bei Eierstockkrebs PloS One. 2011 | Pubmed ID: 22174824 EpiRegNet: Bau Epigenetische Regulatorischen Netzwerk Von Hochdurchsatz-Gen-Ausdruck-Daten Für Den Menschen Epigenetics : Official Journal of the DNA Methylation Society. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22139581 Studie FoxA Pionier-Faktor Bei Leisen Gene Zeigt Rfx Unterdrückten Enhancer Auf Cdx2 Und Ein Möglicher Indikator Für Speiseröhrenkrebs Adenokarzinom Entwicklung PLoS Genetics. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21935353 SpliceTrap: Eine Methode, Alternatives Spleißen Unter Einzelnen Zellulären Bedingungen Zu Quantifizieren Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21896509 Korrelierte Entwicklung Der Transkriptionsfaktoren Und Ihren Bindungsstellen Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21896508 Direkte Klonen Von Doppelsträngige RNA Aus RNase-Schutz-Analyse Zeigt Verarbeitung Verlaufsmuster Der C/D Feld SnoRNAs Und Liefert Beweise Für Weit Verbreitete Antisense-Transkript Ausdruck Nucleic Acids Research. Dec, 2011 | Pubmed ID: 21880592 Funktionelle Mutation SMAC/Diablo, Für Eine Mitochondriale Proapoptotischen Protein Bewirkt, Dass Menschliche Progrediente Schwerhörigkeit DFNA64 American Journal of Human Genetics. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21722859 ChIP-Array: Kombinatorische Analyse Der ChIP-Seq/Chip Und Microarray Gen-Ausdruck-Daten Zur Direkten/indirekten Ziele Der Transkriptionsfaktor Erkennen Nucleic Acids Research. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21586587 Histon-Änderung-Profile Sind Vorausschauende Für Gewebe/Zellen-Typ Spezifischen Ausdruck Der Protein-kodierenden Und MicroRNA Gene BMC Bioinformatics. 2011 | Pubmed ID: 21569556 Vergleich Der Sequenzierung-basierte Methoden Zur Profil-DNA-Methylierung Und Identifizierung Von Monoallelisches Epigenetischen Modifikationen Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852635 Eine Lange Nukleare Beibehalten Non-coding RNA Regelt Synaptogenese Durch Modulation Der Genexpression The EMBO Journal. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20729808 Entwicklung Des Menschlichen Krebs MicroRNA Netzes Silence. 2010 | Pubmed ID: 20226080 Transkriptom Studie Für Frühe Blutbildung--Leistung, Herausforderung Und Neue Chancen Journal of Cellular Physiology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20143329 SFSSClass: Ein Integriertes Konzept Für MiRNA Basierte Tumor-Klassifizierung BMC Bioinformatics. 2010 | Pubmed ID: 20122194 Aktuelles Zu Den RMAP-kurz-lesen-Mapping-Software Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2009 | Pubmed ID: 19736251 High-Definition Profilerstellung Von Säugetier-DNA-Methylierung Von Array-Abscheidung Und Einzelmolekül-Bisulfit-Sequenzierung Genome Research. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19581485 Ein Integrative Genomics-Ansatz Identifiziert Hypoxia Inducible Factor-1 (HIF-1)-Gene, Die Die Kern-Reaktion Auf Hypoxie Bilden Als Ziel Nucleic Acids Research. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19491311 Das Transkriptom Des Menschlichen CD34 + Hämatopoetische Stammzellen-Vorläuferzellen Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2009 | Pubmed ID: 19416867 Bestimmung Der Angereicherten Histon-Modifikationen in Nicht-komedogen Teile Des Menschlichen Genoms BMC Genomics. 2009 | Pubmed ID: 19335899 Gen Satz-basiertes Modul-Entdeckung in Der Brust-Krebs-Transkriptom BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19243633 Der Siebten Asien Pazifik Bioinformatics Konferenz (APBC2009) BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19208108 Mehrstufige Analyse Der Genregulation Ausdruck Und Transkription C57/B6 Maus Leber Entwicklung Genomics. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19015022 Hochauflösende Menschlichen Kern-Projektträger Vorhersage Mit CoreBoost_HM Genome Research. Feb, 2009 | Pubmed ID: 18997002 Integrative Bioinformatics Analyse Transkriptionelle Rechtlichen Programme in Brustkrebszellen BMC Bioinformatics. 2008 | Pubmed ID: 18823535 Definieren Im Regulatorische Netzwerk Der Gewebe-spezifischen Spleißen Faktoren Fox-1 Und Fox-2 Genes & Development. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18794351 ZOOM! Abermillionen Von Oligos Zugeordnet Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2008 | Pubmed ID: 18684737 Verordnung über Die PDK4-Isozym Von Der Rb-E2F1-Komplex The Journal of Biological Chemistry. Oct, 2008 | Pubmed ID: 18667418 Poly-A - Transkripte in HeLa-Zellen Ausgedrückt PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18665230 Histon-Methylierung Marken Spielen Wichtige Rollen Bei Der Vorhersage Der Methylierungstest CpG-Inseln Biochemical and Biophysical Research Communications. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18656446 Kombinatorische Muster Von Histon-Wirkstoff Und Methylierungen Im Menschlichen Genom Nature Genetics. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18552846 Kennung Des Synaptischen Ziele Von Drosophila Pumilio PLoS Computational Biology. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18463699 Netzwerk-basierte Globale Inferenz Menschlicher Erkrankungen Gene Molecular Systems Biology. 2008 | Pubmed ID: 18463613 RNA-Landschaft Der Evolution Für Optimale Exon-Intron-Diskriminierung Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18391195 Cd36-abhängige Regelung Der Muskel-FoxO1 Und PDK4 in Der PPAR-Delta/Beta-vermittelte-Adaption Zu Metabolischen Stress The Journal of Biological Chemistry. May, 2008 | Pubmed ID: 18308721 Qualität Scores Und Länger Liest Verbessert Die Genauigkeit Der Solexa Zuordnung Zu Lesen BMC Bioinformatics. 2008 | Pubmed ID: 18307793 Genome Research. May, 2008 | Pubmed ID: 18292219 Hitze-Schock-Protein-90beta1 Unbedingt Mehrfach Ungesättigte Fettsäure-induzierten Mitochondrialen Ca2 + Efflux The Journal of Biological Chemistry. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18178560 Interferon Regulatorische Faktoren Sind Transkriptionelle Regulatoren Der Estrogenen Cell Metabolism. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18177728 Genomweiten Zuordnung Und Analyse Von Aktiven Projektträgern in Mäuseder Embryonalen Stammzellen Und Erwachsenen Organe Genome Research. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18042645 Identifizierung Von Phylogenetisch Konservierten MicroRNA-Cis-regulatorischen Elementen über 12 Drosophila-Arten Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2008 | Pubmed ID: 18037683 Vermeintliche Zink-Finger-Protein-Bindungsstellen Sind überrepräsentiert in Die Grenzen Der Methylierung-resistenten CpG-Inseln Im Menschlichen Genom PloS One. 2007 | Pubmed ID: 18030324 Vorhersage Der Transkription Beginnen Websites Basierend Auf Featureauswahl AMOSA Verwenden Computational Systems Bioinformatics / Life Sciences Society. Computational Systems Bioinformatics Conference. 2007 | Pubmed ID: 17951823 OSCAR: Eine Klasse SVM Für Genaue Erkennung Von Cis-Elemente Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2007 | Pubmed ID: 17921174 Computational Analysen Der Eukaryotische Promotoren BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17903284 Neuronale Potenzial Einer Stammzell-Population in Den Haarfollikel Cell Cycle (Georgetown, Tex.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17873521 Dual-Spezifität Splice Alternativ Als 5' Und 3'-Splice-Sites Websites-Funktion Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Sep, 2007 | Pubmed ID: 17848517 Evolutionäre Auswirkung Der Begrenzten Spleißen Treue in Säugetier-Gene Trends in Genetics : TIG. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17719121 Ein Stark Konservierten Regulatorischen Element Steuert Hämatopoetischen Ausdruck Von GATA-2 Im Zebrafisch BMC Developmental Biology. 2007 | Pubmed ID: 17708765 Vorhersagemodelle Der Genregulation: Anwendung Von Methoden Der Regression Auf Microarray Daten Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2007 | Pubmed ID: 17634611 Analyse Der Wirbeltiere Isolator Proteins CTCF-Bindungsstellen Im Menschlichen Genom Cell. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17382889 Kritischen Rollen Für Dicer in Der Weiblichen Keimbahn Genes & Development. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17369401 Förderung Mit Stümpfe Zur Vorhersage Der Transkription Start-Seiten Genome Biology. 2007 | Pubmed ID: 17274821 Die Statistische Signifikanz Der Cis-regulatorische Module BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17241466 Datenverarbeitung Genaue P-Werte Für DNA-Motiven Bioinformatics (Oxford, England). Mar, 2007 | Pubmed ID: 17237046 Gewebe-spezifischen Regulatorischen Elementen in Säugetieren Promotoren Molecular Systems Biology. 2007 | Pubmed ID: 17224917 Computational Vorhersage Der Neuartige Komponenten Der Lunge Transkriptionelle Netzwerke Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2007 | Pubmed ID: 17050569 Pan-Genom Isolierung Der Niedrigen Fülle Transkripte Mit Salbei-Tag FEBS Letters. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17113583 Eine Neue Methode Zum Erkennen Von Menschlichen Rekombination Hotspots Und Ihre Anwendungen Auf Die HapMap KODIEREN Daten American Journal of Human Genetics. Oct, 2006 | Pubmed ID: 16960799 Vorhersage Methylierungstest CpG Inseln Im Menschlichen Gehirn Bioinformatics (Oxford, England). Sep, 2006 | Pubmed ID: 16837523 Eine Erhöhte Spezifität-Partitur-Matrix Für Die Vorhersage Von SF2/ASF-spezifische Exonic Spleißen Geschmacksverstärker Human Molecular Genetics. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16825284 Computational Vorhersage Der Methylierungstest in Menschlicher Genomic Reihenfolgen Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16818882 Adaptiv Herleiten Von Menschlichen Transkriptionelle Subnetzwerke Molecular Systems Biology. 2006 | Pubmed ID: 16760900 Charakterisierung Der RNase R-verdaut Zelluläre RNA Quellcode, Der Lasso Und Kreisförmige RNAs Von Pre-mRNA Spleißen Besteht Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16682442 Ein Clustered-Eigenschaft Des Hoch-entarteter Transkription Faktor-Bindungsstellen Im Säugetier-Genom Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16670430 Profilerstellung Alternativ Gespleißten MRNA-Isoformen Für Prostatakrebs Klassifizierung BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 16608523 DNA-Motive in Mensch Und Maus Proximalen Promotoren Vorhersagen Gewebe-spezifischen Ausdruck Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 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Zhang2,3 1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas JoVE 4273 Biology
A Novel Bayesian Change-Punkt Algorithmus für genomweite Analyse Diverse ChIPseq Datentypen Haipeng Xing1, Willey Liao1,2, Yifan Mo1,2, Michael Q. Zhang2,3 1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas JoVE 4273 Biology