Rückstände in Der Konservierten Seine Domäne Der Fruchtfliege TRNase Z, Dass Funktion in Der Katalyse Sind Nicht Im Substrat Anerkennung Oder Bindung Beteiligt

Journal of Molecular Biology. Jul, 2005  |  Pubmed ID: 15935379

Natürlich Können Auftretende Mutationen Im Menschlichen Mitochondrischen Pre-tRNASer(UCN) Die Übertragung Ribonuklease Z Spaltung Website, Verarbeitung Kinetik Und Substrat Sekundärstruktur Beeinflussen

The Journal of Biological Chemistry. Feb, 2006  |  Pubmed ID: 16361254

tRNAs sind als Vorläufer mit einer 5'-Ende-Führer und ein 3'-Ende-Trailer transkribiert. Der 5'-Ende-Führer wird von RNase P verarbeitet und in den meisten Organismen in alle drei Reiche können Transfer Ribonuklease (tRNase) Z Endonucleolytically Entfernen der 3'-Ende-Trailer. Long ((L)) und Kurzformen ((S)) im tRNase Z-gen sind im menschlichen Genom vorhanden. tRNase Z(L) verarbeitet ein nuklear-codierte Pre-tRNA etwa 1600-fold effizienter als tRNase Z (S) und wird voraussichtlich eine starke mitochondriale Transport-Signal haben. tRNase Z(L) konnte, also beide nukleare verarbeiten- und mitochondrially Pre-tRNAs codiert. Mehr als 150 Pathogenese-assoziierten Mutationen es wurden im mitochondrialen Genom, die meisten davon in den 22 mitochondrially codierten tRNAs gefunden. Alle Mutationen, die in menschlichen mitochondrischen tRNA(Ser(UCN)) untersucht Verarbeitungseffizienz, einige berühren und die Spaltung Website und Sekundärstruktur. Diese Änderungen könnten tRNase Z Verarbeitung von mutant Pre-tRNAs, vielleicht zur Mitochondriopathie betreffen.

Rückstände in Zwei Homologie-Blöcken Amino Seitlich Von Der TRNase Z Seiner Domain Tragen Unerwartet Zu Pre-tRNA 3' End-Verarbeitung

RNA (New York, N.Y.). Jun, 2006  |  Pubmed ID: 16618969

tRNase Z, welche Dose Endonucleolytically entfernen pre-tRNA 3'-Ende-Anhänger, besitzt der Signatur seine Domäne (HxHxDH; Motiv II) aus der Familie der Beta-Lactamase von Metall-abhängige-HYDROLASEN. Motiv II kombiniert mit Motiven III-V auf seiner Carboxy-Seite um zwei bivalente Metallionen, Konstituierung den katalytischen Kern zu koordinieren. Die PxKxRN Schleife und Motiv ich amino auf der Motiv II vorgeschlagen wurden, um tRNase Z-Aktivität, einschließlich der anti-determinant Wirkung des CCA in Reife tRNA zu modulieren. Ala Spaziergänge durch diese zwei Homologie-Blöcke zeigen Rückstände, in denen die Ersetzungen unerwartet katalytische Effizienz verringert. Während Substitutionen Motiv II können ohne k(M) k(cat) drastisch beeinflussen sind fünf und 15 8-fach in k(M) Anstiege mit Ersetzungen mehrere konservierte Rückstände in der PxKxRN Schleife und Motiv ich. Diese Erhöhungen der k(M) schlagen ein Modell für Substrat Bindung. Ausdrückliche tRNase Z verarbeitet Reifen tRNA mit CCA am 3'-Ende ca. 80 mal weniger effizient als eine Pre-tRNA besitzen natürliche Folge von den 3'-Ende-Anhänger, aufgrund der reduzierten k(cat) keine Auswirkungen auf k(M), zeigen die CCA anti-determinant ein Charakteristikum dieses Enzyms zu sein.