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Articles by Nicolas Di Fiori in JoVE
Sistema automatico per le misure di fluorescenza singola molecola di superficie, immobilizzato Biomolecole
Nicolas Di Fiori1, Amit Meller1,2
1Physics Department, Boston University, 2Department of Biomedical Engineering, Boston University
In questo articolo viene descritto come si ottiene FRET tracce di molecole di DNA individuale immobilizzato su una superficie utilizzando un microscopio a scansione automatica confocale.
Other articles by Nicolas Di Fiori on PubMed
Modellazione a Stato Solido Effetti Sulla NMR Chemical Spostamenti Utilizzando Modelli Elettrostatiche
Magnetic Resonance in Chemistry : MRC. Oct, 2004 | Pubmed ID: 15366040
Questo libro presenta un confronto tra il metodo di ioni incorporati (EIM) e la rappresentazione di carica superficiale del elettrostatico incorporamento potenziale (SCREEP) metodo, due metodi che possono essere utilizzati per calcolare a stato solido effetti sugli spostamenti chimici NMR. I risultati in un gruppo selezionato di composti con singolo-cristallo Solid-state NMR dati e neutroni diffrazione strutture note, confermano che questi effetti sono importanti in entrambi C (13) e (15) N spostamenti chimici. Gli effetti a stato solido calcolati da entrambi i metodi sono simili e di uguale qualità statistica quando confrontato con i dati sperimentali.
L'effetto Delle Interazioni Di Tintura Colorante Sulla Risoluzione Spaziale Delle Misurazioni FRET Singola Molecola Negli Acidi Nucleici
Biophysical Journal. May, 2010 | Pubmed ID: 20483335
Studiamo l'effetto di interazioni di tintura colorante in molecole di DNA double-stranded con etichette sull'efficienza Förster resonance energy transfer (FRET) a livello di singola molecola. Un'ampia analisi di molecole di DNA double-stranded marcate internamente alla rinfusa e presso la singola molecola livello rivela che distanze assolute donatore-accettore possono essere attendibilmente estratti fino a circa 3 nm separazione, purché tintura colorante tempra è rappresentato. A queste separazioni brevi, troviamo le fluttuazioni significative fluorescenza longevo tra livelli discreti provenienti da tempra simultanea e sincrona di due coloranti. Confrontando le quattro coppie di colorante diverso donatore-accettore (TMR-ATTO647N, ATTO647N-Cy3, TMR-Cy5 e Cy3-Cy5), troviamo che questo fenomeno dipende dalla natura della coppia colorante usata, con la coppia di cianina Cy3-Cy5 mostrando la minor quantità di fluttuazioni. Il significato di questi risultati è duplice: in primo luogo, esse illustrano quando tintura colorante tempra è contabilizzata, singola molecola FRET può essere utilizzato per misurare con precisione le distanze inter-dye, anche a brevi separazioni. In secondo luogo, questi risultati sono utili per decidere quale colorante coppie da utilizzare per analisi di acidi nucleici mediante FRET.
