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Articles by Nicolas Di Fiori in JoVE
JoVE General
表面固定化生体分子の単一分子蛍光測定のための自動化システム
1Physics Department, Boston University, 2Department of Biomedical Engineering, Boston University
この記事では、我々は、自動走査型共焦点顕微鏡を用いて表面に固定化された個々のDNA分子からのトレースをFRETの取得方法について説明します。
Other articles by Nicolas Di Fiori on PubMed
固体 NMR 化学効果のモデリング静電モデルを使用してシフトします。
埋め込みイオン メソッド （EIM） の比較と表面電荷表現、静電埋め込みポテンシャル (SCREEP) 法、固体 NMR 化学シフトの影響を計算するために使用できる 2 つの方法について述べる。知られている単結晶固体 NMR データと中性子回折構造を持つ化合物の選択したグループで結果を確認するこれらの効果が両方 (13) C で重要であることと (15) N 化学シフト。両方の方法によって計算固体の効果と同様と実験データと比較すると等しい統計的品質のです。
単分子の空間分解能で色素 - 色素の相互作用の効果核酸の測定のFRET
我々は、単一分子レベルでのフェルスター共鳴エネルギー移動（FRET）の効率で標識した二本鎖DNA分子の色素 - 色素の相互作用の影響について検討を行った。バルクと単一分子レベルで内部的に標識した二本鎖DNA分子の広範な分析では、ドナー·アクセプター絶対的な距離は確実に色素 - 色素消光が考慮されていることを提供し、約3 nmの分離にダウンして抽出することができます明らかにする。これらの短い分離では、我々は両方の染料の同時および同期消光に起因する個々のレベルの間に有意な寿命の長い蛍光の変動を見つける。 4つの異なるドナー - アクセプター染料対（TMR-ATTO647N、Cy3でATTO647N、TMR-Cy5で、およびCy3-Cy5を）比較することによって、我々は、シアニンペアCy3でCy5で、この現象は使用する色素ペアの性質に依存していることを見つける変動の最小量を示している。これらの結果の意義は二つある：まず、彼らは色素 - 色素消光が考慮されている場合、単一分子FRETのことを示しても短い分離では、正確に間染料の距離を測定するために使用することができます。染料対は、FRETを用いて核酸の分析に使用するかを決定するとき、2番目に、これらの結果は有用である。
