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Articles by Pachiappan Arjunan in JoVE
JoVE Neuroscience
一个视神经挤压伤的小鼠模型，研究视网膜神经节细胞生存
1National Eye Institute, NIH, 2Ophthalmology Department, The Second Hospital of Harbin Medical University
该协议显示了如何逆行标记视网膜神经节细胞，以及如何随后视神经挤压伤，以分析视网膜神经节细胞的存活和凋亡。这是一个为不同类型的视神经病变，包括青光眼的实验性疾病模型。
JoVE Clinical and Translational Medicine
一个小鼠模型角膜血管生成研究掌上含量
角膜是独特的，因为它没有血管组织。然而，强大的血管的生长和生存，可以在角膜上，通过强有力的血管生成因子诱导。因此，角膜可以与我们提供一个有价值的工具，对血管生成的研究。此协议演示了如何执行角膜口袋检测，以及如何评估使用这个模型的血管生成因子诱导的血管生成的小鼠模型。
Other articles by Pachiappan Arjunan on PubMed
1 D 页-进行质谱/质谱/质谱热应激模型大鼠肝细胞蛋白质的分析。
热致并发症原因增加大量的热休克期间在不同途径发挥作用的蛋白质。这些蛋白质详细的表征是了解参与中暑的的分子机制。在此报告中，目前在大鼠肝脏中的蛋白质在 37 摄氏度 （控制） 和核心温度 （Tc） 42 度 C （热应力），由 1 D 页和马尔迪/MS/MS 进行了对比。热应激后，确定样本中的蛋白质是 dimethyglycine 脱氢酶、 转酮酶、 羧酸酯水解酶、 丙酮酸激酶、 L 型丙酮酸激酶、 arginosuccinate 合成酶 ；fumarylacetoacetate 水解酶和 peptidylpropyl 异构酶 A.这些研究结果表明大型蛋白质由马尔迪/MS/MS 分析提供了更好地了解与热休克相关的分子机制。蛋白 1 D 页所审查的决议是小于 2D 页获得。更具体地说，2D 页允许更好地确定低分子量蛋白质，不能通过 1 D 页得到解决。
新型多肽抑制剂具有抗炎活性的人类分泌磷脂 A2： 解决方案结构和分子建模。
分泌的磷脂酶 A2 (sPLA2) 和矩阵 metallopreoteinases (基质金属蛋白酶） 所涉及的类风湿关节炎 (RA) 的关键酶，其调制因此表示潜在的治疗选项。根据大肠埃希氏大肠杆菌放射，合成肽是设计和筛查 sPLA2 抑制作用。线性肽、 10f (PIP-18），抑制的 1.19 microM IC50 重组人类滑膜 sPLA2 活动。不仅做肽干扰功能的 sPLA2，但它似乎也抑制 sPLA2 和各种基质金属蛋白酶在刺激 IL 1beta RA 滑膜成纤维细胞 (RASF) 文化中，从而表达相应蛋白的生产 (> 80%抑制)。核磁共振 (NMR)，建模和对接的研究表明在解决方案中肽展品残留跨国激进党-Asp-甘-Val beta 交可能绑定到 sPLA2 的疏水渠道。结果强烈建议 10f 肽的调节作用可能主要作用的抵制发展辉煌地发芽。
转录组的大鼠嗜铬细胞瘤 PC12 细胞神经元模型分析。
基因芯片基因芯片是最先进的技术，被用来研究中的特定单元格类型与基因的表达模式。在此研究中，平台用于配置文件稳定的好得多 RAE230A 表示从通道 5 和 15 在 PC12 细胞 mRNA 成绩单。全细胞 PC12 转录过程表明，总共有 7,531 稳定誊本 (P < 0.05），对应于 6,785 的基因，发现要始终如一地表示之间通道 5 和 15。数据分析结果表明 3,080 功能的蛋白质，属于 13 个家庭，这表明，约 65%的 PC12 细胞表达的蛋白质是无。通过使用我们定制大鼠神经元参考基因组数据库，我们映射步之遥表示稳定神经元成绩单从 PC12 细胞组成约 765 基因负责神经元功能和疾病。进一步分析这些神经元誊本提供神经可以用于解开复杂基础生物学功能和其关联的信令网络为影响中枢神经系统疾病的细胞和分子机制的遗传蓝图。
VEGF-B 是可有可无的血管增长，但其生存的关键和 VEGF-B 靶向抑制病理性血管形成。
不考虑 VEGF-B，同系物的 VEGF 发现很久以前，在反血管增生疗法中的一项重要指标。相反，它已从外地收到很少的注意。在此研究中，使用不同的动物模型和多种类型的血管细胞，我们发现虽然 VEGF-B 是可有可无的血管生长，它是其生存的关键。重要的是，VEGF-B 的生存影响是不仅对血管内皮细胞周细胞、 平滑肌细胞和血管干/祖细胞。在体内，VEGF-B 靶向抑制脉络膜和视网膜新生血管。机械化，我们发现 VEGF-B 血管生存影响通过许多血管 prosurvival NP-1 和生长因子受体-1 基因的表达调控。因此我们的工作指示 VEGF-B 在血管系统的功能是充当"求生存"，而不是"血管生成"因子和血管 B 抑制可能提供新的治疗机会，以治疗新生血管性疾病。
ETS2 调节神经退行性信号转导通路的人类神经元 (SH-SY5Y) 细胞暴露在单次和重复低剂量沙林 (GB)。
低级的沙林毒气毒性后单或重复剂量的机械理解尚未从细胞水平探讨。使用分析方法的转录基因芯片 （好得多-基因芯片），目前已研究了基因表达的 SH SY5Y 细胞暴露于单 (3 和 24 h) 或反复 (2 x 24 h) 剂量的沙林 (5 microg/mL)，划定的可能机制。百二十四个两个基因的表达是大大 (P < 0.01） 至少 3-fold 通过改变被选定的 GeneSpringGX 分析。比较基因表达数据证实转录的变化与其沙林的剂量和暴露时间相关的。对基因转录的单一 noncytotoxic 沙林剂量影响是变量，而重复的剂量超过 48 h 持续下调基因与神经退行性机制挂钩。三十不断改变的基因进行了验证使用实时定量逆转录-聚合酶链反应 (qRT PCR)。沙林治疗 SH SY5Y 和 HCN-1A 细胞中获得的类似 qRT PCR 配置文件证实细胞独立改建中表达水平。主要是卷入沙林诱发 neuropathogenesis 的规管的基因 (ETS2、 apoe 基因、 PSEN1、 DDC 和 CD9） 进一步证实了免疫印迹和双重免疫荧光检测方法。Regulome 途径由哪些沙林增加 ETS2 表达式表明一种新的可行机制，并采取其他神经退行性途径中所涉及的基因控制。总体数据描述适合学习研究神经病理学的细胞体外实验模型，可能提供新颖见解纳入治疗干预措施。
VEGF-b： 生存或血管生成因子吗？
尽管它的早期发现和高的序列同源性向 VEGF 其他家庭成员，VEGF-B 的生物学功能逗留很长时间，值得商榷，迄今为止 VEGF-B 已收到外地到很少的注意。最近，我们和其他人发现 VEGF-B (1) 通过抑制通过仅 BH3 的蛋白质和其它细胞凋亡/死亡相关基因的表达抑制细胞凋亡是烈性的生存因子为不同类型的单元格。(2) VEGF-B 具有诱导血管生长在大多数机构中的可以忽略不计的作用。相反，它是极其需要血管生存。VEGF-B 靶向抑制病理性血管生成废除血管生存在不同的动物模型。(3) 使用不同类型的神经损伤及神经退行性疾病模型、 VEGF-B 治疗保护濒危的神经元凋亡，无诱使不良的血管生长或渗透。因此，VEGF-B 是有烈性的生存抗凋亡作用，但却缺乏一般血管生成活性的 VEGF 家族的第一个成员。我们的工作因此主张 VEGF-B 的主要功能是充当"生存"，而不是"血管生成"因子和涉及的 VEGF-B 的治疗潜力治疗不同类型的血管和神经退行性疾病。
分泌的磷脂酶 A2 抑制肽对类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞、 白细胞介素-1beta 诱导基质金属蛋白酶生产及其 Antiarthritic HTNFtg 小鼠活性的抑制作用。
分泌的磷脂酶 A2 (sPLA2) 和基质金属蛋白酶 (MMP) 抑制剂烈性调制器的炎症的治疗潜力，但限制了在类风湿关节炎 (RA) 的疗效。这项研究的目的是了解 python （PIP）-18 肽滑膜成纤维细胞 (SF)、 磷脂酶抑制剂的抑制机制，评估其在人肿瘤坏死因子 (hTNF) 的治疗潜力-驱动 (Tg197) 的转基因小鼠模型的关节炎。
血小板衍生的生长因子 DD 针对逮捕病理血管生成通过调节糖原合酶激酶-3beta 磷酸化。
血小板衍生的生长因子 DD (血小板衍生生长因子-DD) 是最近发现血小板衍生生长因子家族的成员。在病理血管生成和底层的细胞和分子机制血小板 DD 的作用仍然很大程度上是蛮荒之地。在此研究中，使用不同的动物模型，我们表明血小板 DD 表达式是在病理血管新生，期间上调抑制血小板 DD 抑制脉络膜和视网膜新生血管。我们还展示了调解的血小板 dd.血小板 DD 致糖原合酶激酶-3beta (GSK3beta) Ser(9) 磷酸化和 Tyr(216) 脱磷体外和体内，功能的新型机制导致增加的细胞存活。始终如一，GSK3beta 活动是需要为血小板 DD 靶血管生成的影响。此外，血小板 DD 规管 GSK3beta 和许多其他重要的血管生成和凋亡的基因的表达。因此，我们发现血小板 DD 作为重要目标基因的反血管增生疗法由于其对血管及非血管细胞的多效性作用。血小板衍生生长因子 DD 抑制可能提供新的治疗选择，以治疗新生血管性疾病。
血小板衍生生长因子-CC 的生存影响通过调节 GSK3beta 磷酸化拯救神经元在大脑和视网膜细胞凋亡。
血小板衍生的生长因子抄送 (血小板衍生生长因子-CC) 是家庭的第三个家庭的成员血小板超过二十年，血小板 AA 和血小板衍生生长因子 BB 的原始成员研究后发现的。血小板衍生生长因子-CC 的生物学功能很大程度上仍有待探讨。我们的报告发现血小板衍生生长因子-CC 通过调节糖原合酶激酶 3beta 行为的一个有力的神经保护作用因素的一种新型 (GSK3beta) 活动。在几个不同动物模型的神经元损伤，如切断诱导的神经元死亡、 神经毒素诱导神经元损伤、-6-羟基诱导帕金森病多巴胺能神经元死亡和缺血引起的中风，血小板衍生生长因子-CC 蛋白或基因传递保护不同类型的神经元在视网膜和大脑中的细胞凋亡。另一方面，损失的函数检测使用 null 小鼠血小板衍生生长因子-C、 中和抗体或短发夹 RNA 表明血小板衍生生长因子-CC 虚/抑制加剧体内不同神经细胞组织中的神经元死亡。机械化，我们发现血小板衍生生长因子-CC 的神经保护作用通过调节 GSK3beta 磷酸化和表达。我们的数据表明血小板衍生生长因子-CC 是急需的神经元存活，有可能用于治疗神经退行性疾病。应谨慎维护正常神经细胞功能进行抑制血小板衍生生长因子-CC-血小板衍生生长因子受体途径不同临床用途。
血小板衍生生长因子-CC 封锁对病理血管生成抑制通过作用于细胞和分子的多个目标。
确定病理血管生成因子独立通路的重要性是日益认识到由于新兴耐药抗 VEGF 的疗法。血小板衍生生长因子-CC 是超过二十年的研究血小板 AA 和血小板衍生生长因子-BB 后发现血小板衍生生长因子家族的第三名成员。血小板衍生生长因子-CC 和底层的细胞和分子机制的生物学功能仍然主要是蛮荒之地。在这里，我们使用不同的动物模型，报告中和抗体、 shRNA 或遗传删除抑制血小板衍生生长因子-CC 对抑制脉络膜和视网膜新生血管。重要的是，我们发现血小板衍生生长因子-CC 针对行事不仅对多个单元格类型重要的病理血管新生，如血管壁画和血管内皮细胞、 巨噬细胞、 脉络膜成纤维细胞和视网膜色素上皮细胞，也对其他重要血管生长的基因，如血小板衍生生长因子-BB 和血小板衍生生长因子受体的表达。在分子层面上，我们发现血小板衍生生长因子-CC 规管糖原合成酶激酶 (GSK)-3beta 磷酸化和体外和体内的表达。GSK3beta 激活受损血小板衍生生长因子-CC 诱导的血管生成和抑制 GSK3beta 废除血小板衍生生长因子-CC 封锁血管生成的影响。因此，我们发现血小板衍生生长因子-CC 作为重要的候选目标基因的反血管增生疗法和抑制血小板衍生生长因子-CC 可能治疗新生血管性疾病的治疗价值。
