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In JoVE (2)
- Ein Optic Nerve Crush Injury Mausmodell zur retinalen Ganglienzellen Survival Study
- Ein Maus-Modell der Cornea Pocket-Assay für die Angiogenese-Studie
Other Publications (10)
- Frontiers in Bioscience : a Journal and Virtual Library
- Journal of Medicinal Chemistry
- Cellular and Molecular Neurobiology
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
- Chemical Research in Toxicology
- Cell Adhesion & Migration
- Arthritis Research & Therapy
- The Journal of Biological Chemistry
- The Journal of Experimental Medicine
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
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Articles by Pachiappan Arjunan in JoVE
JoVE Neuroscience
Ein Optic Nerve Crush Injury Mausmodell zur retinalen Ganglienzellen Survival Study
1National Eye Institute, NIH, 2Ophthalmology Department, The Second Hospital of Harbin Medical University
Dieses Protokoll zeigt, wie man retrograd Label retinalen Ganglienzellen, und wie man später machen ein Sehnerv Quetschverletzung um retinalen Ganglienzellen Überleben und Apoptose zu analysieren. Es ist eine experimentelle Krankheit Modell für verschiedene Arten von Optikusneuropathie, einschließlich Glaukom.
JoVE Clinical and Translational Medicine
Ein Maus-Modell der Cornea Pocket-Assay für die Angiogenese-Studie
Die Hornhaut ist einzigartig, es fehlt Gefäßgewebe. Allerdings kann robuste Wachstum der Blutgefäße und das Überleben in der Hornhaut durch potente angiogenen Faktoren ausgelöst werden. Daher kann die Hornhaut mit uns ein wertvolles Instrument für die angiogenen Studien. Dieses Protokoll zeigt, wie die Maus-Modell der Hornhaut Tasche Test und wie die Angiogenese durch angiogene Faktoren mit diesem Modell induziert Beurteilung durchzuführen.
Other articles by Pachiappan Arjunan on PubMed
Profilerstellung Für Hepatozelluläre Proteine Durch 1 D Seite-MALDI/MS/MS in Einem Rattenmodell Für Hitze-Stress
Hitze induzierte Komplikationen Ursache eine Zunahme für zahlreiche Proteine, die eine in diversen Bahnen während Hitzeschock Rolle. Eine detaillierte Charakterisierung dieser Proteine ist essentiell für das Verständnis der molekularen Mechanismen Hitzschlag beteiligt. In diesem Bericht wurden die Proteine in Ratte-Leber bei 37 Grad C (Kontrolle) und bei Kerntemperatur (Tc) 42 Grad C (Hitzebelastung) von 1 D Seite und MALDI/MS/MS verglichen. Unter Proteine in der Probe nach Hitzebelastung identifiziert sind Dimethyglycine-Dehydrogenase, Transketolase, carboxylic Ester-Hydrolase, Pyruvatkinase, L-förmige Pyruvatkinase, Argininosuccinat-Synthase; Fumarylacetoacetate Hydrolase und Peptidylpropyl-Isomerase A. Diese Ergebnisse zeigen, dass die Analyse der großen Skala Proteine durch MALDI/MS/MS ermöglicht ein besseres Verständnis der molekularen Mechanismen Hitzeschock zugeordnet. Die Auflösung der Proteine von 1D-Seite geprüft war kleiner als die mit 2D-Seite. Genauer gesagt, ermöglicht 2D-Seite bessere Identifizierung der niedermolekularen Proteine, die durch 1D-Seite nicht aufgelöst werden können.
Neuartiger Peptid-Inhibitoren Der Menschlichen Sekretorischen Phospholipase A2 Mit Entzündungshemmenden Aktivität: Lösungsstruktur Und Molekulare Modellierung
Sekretorischen Phospholipase A2 (sPLA2) Matrix Metallopreoteinases (MMPs) sind wichtige Enzyme, die rheumatoide Arthritis (RA) beteiligt und ihre Modulation stellt somit eine mögliche Therapieoption dar. Auf der Grundlage von Escherichia coli Radioassay wurden synthetische Peptide entworfen und sPLA2 Hemmung abgeschirmt. Die lineare Peptid, 10f (PIP-18), hemmte die rekombinanten menschlichen synovialen sPLA2-Aktivität mit einer IC50 1.19 MicroM. Nicht nur hat das Peptid stören die Funktion des sPLA2, aber es schien auch mRNA Ausdruck sPLA2 und verschiedene MMPs in IL-1beta-stimuliert RA synovialen Fibroblasten (RASF) Kulturen und damit die Produktion der entsprechenden Proteine hemmen (> 80 % Hemmung). Kernspinresonanz (NMR), zufolge modellieren und Andocken Studien in Lösung das Peptid Exponate eine Beta-Wendung auf Rückstände Trp-Asp-Gly-Val und möglicherweise an die hydrophobe Kanal sPLA2 bindet. Die Ergebnisse empfehlen dringend, dass die modulatorische Wirkung von Peptid 10f eine wichtige Rolle spielen bei der Bekämpfung der Entwicklungdes der RA.
Transkriptom Profilerstellung Für Neuronale Modell Zelle PC12 Von Ratte Phäochromozytom
GeneChip Microarray ist eine innovative Technologie, die verwendet wird, um die Ausdrucksmuster Gene mit in einem bestimmten Zelltyp zu studieren. In dieser Studie äußerte der Affymetrix RAE230A Plattform verwendet wurde, um stabil Profil mRNA Transkripte von PC12 Zellen Passage 5 und 15. Die ganze Zellen PC12 Transkriptom ergab, dass insgesamt 7.531 stabile Abschriften (P < 0,05), 6.785 Gene entsprechend, konsequent sein ausgedrückt zwischen Durchgang 5 und 15 gefunden wurden. Die Datenanalyse ergab 3.080 funktionelle Proteine, gehören 13 Familien, die darauf hindeuten, dass etwa 65 % der Proteine in PC12 Zellen ausgedrückt uncharakterisiertes sind. Mithilfe unserer Custom-Built Ratte neuronalen Verweis Genom Datenbank zugeordnet wir endogen exprimierten stabile neuronale Abschriften aus PC12 Zellen bestehend aus ca. 765 Gene verantwortlich für neuronale Funktion und Krankheit. Diese neuronalen Transkriptionen wurden weiter analysiert, um eine genetische Blaupause bereitzustellen, die von Neurobiologe verwendet werden kann, um die komplexen zellulären und molekularen Mechanismen, die zugrunde liegenden biologischen Funktionen und ihre zugeordneten Signalgebung Netzwerke für Krankheiten, die das Nervensystem zu entwirren.
VEGF-B Ist Entbehrlich Für Blutgefäßwachstum Aber Entscheidend Für Ihr Überleben Und VEGF-B Ausrichtung Auf Pathologischen Angiogenese Hemmt
VEGF-B, ein homologes von VEGF eine vor langer Zeit entdeckt wurde nicht als ein wichtiges Ziel in verlängernder. Stattdessen hat es wenig Aufmerksamkeit aus dem Feld erhalten. In dieser Studie ergab mit verschiedenen Tiermodellen und mehrere Arten von vaskulären Zellen, wir, dass obwohl VEGF-B für blutgefäßwachstum entbehrlich ist, es wichtig für ihr Überleben ist. Wichtig ist, ist der überleben-Effekt von VEGF-B nicht nur auf vaskuläre Endothelzellen, aber auch auf Pericytes, glatten Muskelzellen und vaskuläre Vorbau/Vorläuferzellen. In-vivo, VEGF-B gezielt gehemmt sowohl Choroidale und retinale Neovaskularisation. Mechanistisch, fanden wir, dass die vaskuläre überleben-Wirkung der VEGF-B durch die Regulierung des Ausdrucks vieler vaskulärer prosurvival Gene über NP-1 und VEGFR-1 erreicht wird. Unsere Arbeit zeigt damit an, dass die Funktion des VEGF-B im Gefäßsystem zu handeln als ein "Überleben", anstatt ein "Angiogenese"-Faktor und Hemmung von VEGF-B neue therapeutische Möglichkeiten, Neovaskularisation und Krankheiten zu behandeln bieten kann.
ETS2 Regulierende Neurodegenerative Signalweg Des Menschlichen Neuronalen (SH-SY5Y) Zellen Ausgesetzt Sind Einzel- Und Wiederholte Niedrig Dosierte Sarin (GB)
Das mechanistische Verständnis der Low-Level Sarin-induzierte Neurotoxizität nach einmaligen oder wiederholten Dosen noch auf zellulärer Ebene untersucht werden. Verwenden die Profilerstellung Ansatz Microarray (Affymetrix-Augenentwicklung)-Transkription, untersucht die vorliegende Studie Genexpression in SH-SY5Y Humanzellen gemachten an einzelne (3 bis 24 h) oder wiederholte (2 x 24 h) Dosen von Sarin (5 µg/mL), den möglichen Mechanismus abzugrenzen. Zwei hundert vierundzwanzig Gene, deren Expression signifikant war (P < 0,01) geändert, indem mindestens 3-fach von GeneSpringGX Analyse ausgewählt wurden. Die vergleichende Gen-Ausdruck-Daten bestätigt die transkriptionelle Änderungen mit Dosis und Belichtung Zeit von Sarin verwandt. Die Wirkung einer einzigen zytotoxischer Sarin-Dosis auf Gen-Transkription war variabel, während Dosen wiederholt über 48 h anhaltend unten-geregelt Gene mit neurodegenerativen Mechanismen verknüpft. Dreißig dauerhaft veränderten Gene wurden mit Echtzeit-quantitative reverse Transkription-Polymerase-Kettenreaktion (qRT-PCR) überprüft. Ähnliche qRT-PCR-profile erwarb Sarin-behandelten Zellen für SH-SY5Y und HCN-1A bestätigt die Zelle-unabhängige Änderungen in Stufen. Gene (ETS2, APOE, PSEN1, DDC und CD9) hauptsächlich in der Regulierung von Sarin-induzierte Neuropathogenesis verwickelt wurden weiter durch Westernblot und Doppel-Immunofluoreszenz Proben bestätigt. Der Regulome Weg schlägt einen neuen Machbaren Mechanismus durch welche Sarin erhöht ETS2 Ausdruck und übernimmt die Kontrolle über andere Gene beteiligt, die Neurodegenerative-Pathway. Die gesamten Daten ein in-vitro-experimentelles Modell geeignet für die Untersuchung der Neuropathologie Zellen abzugrenzen und können neuartige Einblicke in therapeutische Interventionen.
VEGF-b: Ein Überleben, Oder Ein Angiogenen Faktor?
Trotz seiner frühen Entdeckung und hohe Sequenz-Homologie, die anderen VEGF-Familienmitglieder die biologische Funktion von VEGF-B blieb lange umstritten und VEGF-B erhielt wenig Aufmerksamkeit aus dem Feld bisher. Vor kurzem haben wir u. a. festgestellt, dass (1) VEGF-B ein potenter überleben Faktor für verschiedene Arten von Zellen durch Hemmung der Apoptose über den Ausdruck von BH3-only-Protein und andere Apoptotic/Zelle Tod im Zusammenhang mit Genen zu unterdrücken. (2) VEGF-B hat eine vernachlässigbare Rolle in induzierende blutgefäßwachstum in den meisten Organen. Stattdessen ist es kritisch für das Überleben der Blutgefäße erforderlich. VEGF-B gezielt gehemmt pathologischen Angiogenese durch die Abschaffung von Blutgefäß-Überleben in verschiedenen Tiermodellen. (3) Mit verschiedene Arten von Neuro-Verletzungen und Neurodegenerative Krankheitsmodelle, VEGF-B Behandlung geschützt vom Aussterben bedrohte Neuronen von Apoptosis ohne damit unerwünschte blutgefäßwachstum oder Durchlässigkeit. VEGF-B ist somit das erste Mitglied der VEGF-Familie, die eine potente überleben/Anti-apoptotische Wirkung, beim ermangeln einer allgemeine Angiogenese-Aktivität hat. Unsere Arbeit so plädiert dafür, dass die wichtige Funktion der VEGF-B ist ein "Überleben", sondern als ein Faktor "Angiogenese" handeln und das therapeutisches Potenzial von VEGF-B bringt bei der Behandlung von verschiedene Arten von vaskulären und neurodegenerativen Erkrankungen.
Unterdrückende Wirkung Der Sekretorischen Phospholipase A2 Hemmenden Peptid Auf Produktion Von Interleukin-1beta-induzierte Matrix-Metalloproteasen in Rheumatoide Synovialen Fibroblasten Und Seiner Antiarthritic Tätigkeit Bei HTNFtg Mäusen
Sekretorischen Phospholipase A2 (sPLA2) und Matrix-Metalloproteasen (MMP)-Inhibitoren sind potente Modulatoren der Entzündung mit therapeutischen Potenzials, sondern haben nur begrenzte Wirksamkeit bei rheumatoider Arthritis (RA). Das Ziel dieser Studie war es, den hemmenden Mechanismus Phospholipase-Inhibitor von Python (PIP)-18 Peptid in kultivierten synovialen Fibroblasten (SF) verstehen und ihr therapeutische Potential in einer menschlichen Tumor-Nekrose-Faktor (hTNF) auswerten-getrieben von transgenen Mausmodell (Tg197) von Arthritis.
Platelet Derived Growth Factor-DD Targeting Verhaftungen Pathologischen Angiogenese Durch Modulation Der Glykogen-Synthase Kinase-3beta Phosphorylierung
Platelet derived Growth Factor-DD (PDGF-DD) ist ein vor kurzem entdeckte Mitglied der PDGF-Familie. Die Rolle der PDGF-DD in pathologischen Angiogenese und der zugrunde liegenden zellulären und molekularen Mechanismen bleiben weitgehend unerforscht. In dieser Studie zufolge mit verschiedene Tiermodellen, wir PDGF-DD Ausdruck war oben-geregelt, während pathologischen Angiogenese und Hemmung des PDGF-DD unterdrückt sowohl Choroidale und retinale Neovaskularisation. Wir zeigten auch einen neuen Mechanismus, der die Funktion des PDGF-DD. PDGF-DD induzierte Glykogen-Synthase Kinase-3beta (GSK3beta) Ser(9) Phosphorylierung und Dephosphorylierung von Tyr(216) in vitro und in vivo Vermittlung führt zu erhöhter Zelle überleben. GSK3beta Aktivität war konsequent, für die antiangiogenetische Wirkung von PDGF-DD Ausrichtung erforderlich. Darüber hinaus reguliert PDGF-DD den Ausdruck GSK3beta und viele andere Gene, die wichtig für die Angiogenese und Apoptose. Daher haben wir als ein wichtiges Ziel-gen für verlängernder aufgrund seiner pleiotropen Wirkung auf Kreislauf und nichtvaskuläre Zellen PDGF-DD identifiziert. PDGF-DD-Hemmung kann neue Therapiemöglichkeiten Neovaskularisation und Erkrankungen anbieten.
Überleben Wirkung Von PDGF-CC Rettet Nervenzellen Von Apoptose Im Gehirn Und Der Netzhaut Durch Die Regelung Des GSK3beta Phosphorylierung
Platelet-derived Growth Factor (PDGF-CC) CC ist das dritte Mitglied der PDGF-Familie, die nach mehr als zwei Jahrzehnten Studien über die ursprünglichen Mitglieder der Familie, PDGF-AA und PDGF-BB entdeckt. Die biologische Funktion von PDGF-CC bleibt weitgehend erforscht werden. Wir berichten einen Roman, der Feststellung, dass PDGF-CC ein potenter neuroprotektive-Faktor, die ist durch Modulation der Glykogen-Synthase Kinase 3beta fungiert (GSK3beta)-Aktivität. In mehreren verschiedenen Tiermodellen der neuronalen Verletzung, wie Axotomie induziert neuronalen Tod geschützte Neurotoxin-induzierte neuronale Schädigung, 6-Hydroxydopamine-induzierte Parkinson dopaminerge neuronalen Tod und Ischämie-induzierte Schlaganfall, PDGF-CC Protein oder gen Lieferung verschiedene Arten von Neuronen von Apoptosis in der Netzhaut und Gehirn. Auf der anderen Seite zeigten Loss of Function-Assays mit PDGF-C null Mäuse, neutralisierenden Antikörper oder kurze Haarnadel RNA, PDGF-CC-Mangel/Hemmung neuronalen Tod in verschiedenen neuronalen Geweben in-vivo verschärft. Mechanistisch, zeigten wir, dass die neuroprotektive Wirkung von PDGF-CC für die Regulierung von GSK3beta Phosphorylierung und Ausdruck verwirklicht wurde. Unsere Daten zeigen, dass PDGF-CC kritisch für neuronale überleben erforderlich ist und kann potenziell zur Behandlung von neurodegenerativen Erkrankungen verwendet werden. Hemmung des PDGF-CC-PDGF-Rezeptor-Signalweges für verschiedene klinische Zwecke sollte mit Vorsicht zu normale neuronale Funktionen zu erhalten durchgeführt werden.
PDGF-CC-Blockade Hemmt Pathologischen Angiogenese Durch Einwirkung Auf Mehrere Zelluläre Und Molekulare Ziele
Die Bedeutung der Identifizierung VEGF-unabhängige Wege in pathologischen Angiogenese wird zunehmend als Folge der aufkommenden Resistenzen zu Anti-VEGF Therapien anerkannt. PDGF-CC ist das dritte Mitglied der PDGF-Familie, die nach mehr als zwei Jahrzehnten Studien über PDGF-AA und PDGF-BB entdeckt. Die biologische Funktion von PDGF-CC und die zugrunde liegenden zellulären und molekularen Mechanismen bleiben weitgehend unerforscht. Hier berichten mit verschiedene Tiermodellen, wir, dass PDGF-CC-Hemmung durch neutralisierende Antikörper, ShRNA oder genetische Löschung sowohl Choroidale und retinale Neovaskularisation unterdrückt. Wichtiger ist, zeigten wir, dass PDGF-CC Zielen nicht nur auf mehrere Zelltypen für pathologische Angiogenesis, wie vaskuläre Wandgemälde und Endothelzellen, Makrophagen, choroidale Fibroblasten und Retinales Epithelzellen, wichtig, sondern auch auf dem Ausdruck anderer wichtiger Angiogenese-Gene, wie PDGF-BB und PDGF-Rezeptoren gehandelt. Auf molekularer Ebene, wir fanden, dass PDGF-CC Glykogen-Synthase Kinase (GSK) geregelt-3beta Phosphorylierung und Ausdruck in vitro und in vivo. Aktivierung des GSK3beta beeinträchtigt PDGF-CC-induzierte Angiogenese und Hemmung der GSK3beta abgeschafft und die antiangiogenetische Wirkung von PDGF-CC-Blockade. Daher wir PDGF-CC als ein wichtiger Kandidat vorbei gen für verlängernder identifiziert und PDGF-CC-Hemmung von therapeutischen Wert bei der Behandlung von Neovaskularisation und Krankheiten sein könnten.
