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Articles by Pachiappan Arjunan in JoVE
JoVE Neuroscience
망막 신경절 세포의 생존을 공부 시신경의 호감 상해 Murine 모델
1National Eye Institute, NIH, 2Ophthalmology Department, The Second Hospital of Harbin Medical University
이 프로토콜은 망막 신경절 retrogradely 세포, 및 이후 망막 신경절 세포 생존과 apoptosis를 분석하기 위해서는 시신경의 호감 부상을하기 위해 레이블을하는 방법을 보여줍니다. 그것은 녹내장을 포함하여 시신경 신경 장해의 종류에 대한 실험 질병 모델입니다.
JoVE Clinical and Translational Medicine
Angiogenesis 연구에 대한 각막 포켓 분석의 마우스 모델
각막은 혈관 조직이 부족한다는 점에서 고유합니다. 그러나, 강력한 혈관의 성장과 생존은 강력한 angiogenic 요인에 의해 각막에 유도된 수 있습니다. 따라서 각막이 우리와 함께 angiogenic 연구 가치있는 도구를 제공할 수 있습니다. 이 프로토콜은 각막 포켓 분석 방법과이 모델을 사용 angiogenic 요인에 의해 유발 angiogenesis을 평가의 마우스 모델을 수행하는 방법을 보여줍니다.
Other articles by Pachiappan Arjunan on PubMed
1 D 페이지-MALDI/MS/MS 쥐 열 스트레스 모델에 의해 간세포 단백질 프로 파일링합니다
열 합병증 원인 열 충격 중 다양 한 통로의 역할을 하는 단백질의 많은 수에 있는 증가 유발 합니다. 이러한 단백질의 상세한 특성화 일사병에 관여 하는 분자 메커니즘을 이해 하는 데 필수적 이다. 이 보고서에서 쥐 간에 단백질 37도 C (컨트롤)와 코어 온도 (Tc) 1 d 페이지 42도 C (열 스트레스)과 MALDI/MS/MS를 비교 했다. 열 스트레스 후 샘플에서 확인 된 단백질 중에서 dimethyglycine 효소, transketolase, carboxylic 에스테 르 가수분해 효소, pyruvate 니, L 형 pyruvate kinase, arginosuccinate 합성; fumarylacetoacetate 가수분해 효소 및 peptidylpropyl isomerase 1. 이러한 연구 결과 보여 MALDI/MS/MS에 의해 대규모 단백질의 분석 열 충격 연관 분자 메커니즘의 더 나은 이해를 제공 합니다. 1 D 페이지를 검사 하는 단백질의 해상도 2D 페이지와 얻은 것 보다는 더 적은. 좀 더 구체적으로, 2D 페이지 1 D 페이지에서 확인할 수 없는 낮은 분자량 단백질의 더 나은 식별 수 있습니다.
한 활동으로 인간의 분 Phospholipase a 2의 소설 펩타이드 저 해제: 솔루션 구조 및 분자 모델링
분 phospholipase A2 (sPLA2)와 매트릭스 metallopreoteinases (MMPs)는 핵심 효소 류 마티스 관절염 (RA)에 관련 된 그들의 변조는 따라서 잠재적인 치료 옵션을 나타냅니다. 병원 성 대장균 radioassay 기초 합성 펩 티 드는 설계 하 고 sPLA2 저해에 대 한 검사. 선형 펩 티 드, 10 층 (핍-18) 1.19 Microm의 IC50 synovial sPLA2 재조합 인간 활동 저해. 뿐만 아니라 펩 티 드 sPLA2, 기능 방해 했 어 하지만 그것은 또한 Spla2와 IL 1beta 자극 RA synovial 섬유 아 세포 (RASF) 문화 및 그로 인하여 다양 한 Mmps의 mRNA 표정 해당 단백질의 생산을 억제 등장 (> 80% 억제). 핵 자기 공명 (NMR), 모델링 및 연구 도킹 솔루션에서 펩 티 드 잔류물 Trp Asp Gly 발에서 베타 차례 전시 및 가능 하 게 Spla2의 소수 성 채널에 바인딩합니다 나타냅니다. 결과 좋습니다 펩 티 드 10 층의 modulatory 작업 counteracting 라스의 개발에 중요 한 역할을 재생할 수 있습니다.
Transcriptome 신경 모델 셀 PC12 쥐 Pheochromocytoma에서 프로 파일링 합니다
GeneChip microarray 특정 셀 종류와 유전자의 식 패턴을 공부 하는 데 사용 되는 최첨단 기술입니다. 본이 연구에서는 플랫폼 안정적으로 프로 파일링 하는 데 사용한 Affymetrix RAE230A 통로 5, 15에 PC12 세포에서 mRNA 성적 표현. 전체 셀 PC12 transcriptome 공개는 7,531 안정 된 성적 증명서의 총 (P < 0.05), 해당 6,785 유전자 하, 일관 되 게 표현 통로 사이 5와 15 발견 했다. 데이터 분석 PC12 세포에 표현 되는 단백질의 약 65% 되지 않는 특징이 표시 13 가족에 속하는 3080 기능성 단백질을 공개 했다. 우리의 사용자가 설계한 쥐 신경 참조 게놈 데이터베이스를 사용 하 여 우리 약 765 유전자 신경 기능 및 질환에 대 한 책임으로 구성 된 PC12 세포에서 endogenously 표현된 안정적인 신경 성적 매핑됩니다. 이러한 신경 성적 증명서 추가 neurobiologist 생물 학적 기능 및 신 경계에 영향을 미치는 질병에 대 한 관련된 신호 네트워크 기본 복잡 한 세포질이 고 분자 메커니즘을 해명 하는 데 사용 수 유전 청사진을 제공 분석 했다.
VEGF B은 그들의 생존을 위해 중요 하지만 혈관의 성장에 대 한 필수 및 병 적인 혈관 신생 억제 VEGF B를 대상으로 합니다
오래 전에 발견 된 VEGF의 체 VEGF B 하지 항 혈관 신생 치료에 중요 한 목표를 고려 하고있다. 대신, 그것은 현장에서 거의 주목을 받았습니다. 이 연구에서 우리가 VEGF B 혈관의 성장에 필수 불가결 하지만 그것은 그들의 생존을 위해 중요 한 밝혀 다른 동물 모델 및 여러 종류의 혈관 세포를 사용 하 여. 중요 한 것은, VEGF B의 생존 효과 pericytes, 부드러운 근육 세포와 혈관 줄기/뿌리 세포에 뿐만 아니라 혈관 내 피 세포에 뿐만 아니라. Vivo에서 안도 하 고 망막 neovascularization을 저해 VEGF B를 대상으로 합니다. Mechanistically, VEGF B의 혈관 생존 효과 NP-1과 1 VEGFR를 통해 많은 혈관 prosurvival 유전자의 표현 규제에 의해 이루어집니다를 찾았습니다. 우리의 작업 따라서 나타내고 혈관 시스템에서 VEGF B의 함수 역할 "생존"을 "angiogenic" 요소 보다는 VEGF B 저해 신생 질병 치료에 새로운 치료 기회를 제공할 수 있습니다.
인간의 신경 (SH-SY5Y)의 ETS2 조절 신경 퇴행 성 신호 통로 세포 단일 및 반복 노출된 낮은 복용량 시린 (GB)
단일 또는 반복 투여 후 낮은 수준의 시린 유도 neurotoxicity 기계 이해 아직 세포 수준에서 탐험 하고있다. Microarray (Affymetrix GeneChips) 전사 프로 파일링 방법을 사용 하 여, 현재의 연구 단일 (3, 24 h) 또는 시린 가능한 메커니즘의 윤곽을 그리 다 (5 microg/mL)의 반복된 (2 x 24 h) 복용에 노출 인간의 SH SY5Y 세포에서 유전자 발현을 조사 했다. 누구의 식 크게는 2 백 20-4 유전자 (P < 0.01)에 의해 최소한 3-fold 변경 GeneSpringGX 분석에 의해 선정 됐다. 비교 유전자 표현 데이터 transcriptional 변경을 시린의 투여 및 노출 시간에 관련 된 것을 확인 했다. 유전자 전사에 단일 noncytotoxic 시린 복용량의 효과 변수, 반복 투여 48 시간 이상 지속적으로 다운 레 귤 레이트 된 유전자 신경 퇴행 성 메커니즘에 연결 하는 반면. 30 영구적으로 변경 된 유전자 실시간 양적 역 전사 효소 연쇄 반응 (PCR qRT)를 사용 하 여 유효성을 검사 했다. 비슷한 qRT PCR 프로필 시린 취급 SH SY5Y 및 HCN 1A 셀에서 얻은 식 레벨 셀에 관계 없이 변경 확인. 사린을 이용한 neuropathogenesis의 규정에 주로 연루 되는 유전자 (ETS2, APOE, PSEN1, DDC, 및 CD9) 더 서쪽 오 점 및 더블-면역 형광 분석 실험에 의해 확인 되었다. Regulome 통로 시린 증가 ETS2 식으로 실현 하는 새로운 메커니즘을 제안 하 고 다른 유전자가 신경 퇴행 성 통로에 관련된 제어할 수 걸립니다. 전체 데이터 셀의 neuropathology를 공부에 적합 한 체 외 실험 모델을 윤곽을 그리 다 및 치료 적 개입에 대 한 새로운 통찰력을 제공할 수 있습니다.
VEGF B: 생존, 또는 Angiogenic 요소?
초기 검색과 다른 VEGF 가족 구성원에 게 높은 시퀀스 homology 불구 VEGF B의 생물 학적 기능 오랜 시간에 대 한 논쟁의 여지가 남아 및 VEGF B 현장에서 지금까지 거의 관심을 받고 있다. 최근에, 우리와 다른 사람 (1) VEGF B 식 BH3 전용 단백질과 다른 apoptotic/세포 죽음에 관련 된 유전자의 억제를 통해 apoptosis를 억제 함으로써 세포의 종류에 대 한 강력한 생존 요소는 발견 했다. (2) VEGF B는 대부분의 장기에 혈관의 성장 유도에 무시할 수 역할. 대신, 그것은 비판적으로 혈관 생존을 위해 필요입니다. VEGF B를 대상으로 다양 한 동물 모델에서 혈관 생존을 폐지 하 여 병 적인 혈관 신생 저해. (3) 신경 손상 및 신경 퇴행 성 질환 모델, VEGF B 치료의 다른 유형을 사용 하 여 원치 않는 혈관의 성장 또는 침투성 유도 없이 apoptosis에서 멸종 위기에 놓인된 신경 세포 보호. 따라서, VEGF B 부족 한 일반 angiogenic 활동 동안 강력한 생존/안티-apoptotic 효과 VEGF 가족의 첫 번째 멤버 이다. 따라서 우리의 작업 VEGF B의 주요 기능은 "angiogenic" 요소 보다는 "생존"으로 행동 하 고 여러 종류의 혈관 치료에 VEGF B의 치료 가능성을 연루를 옹호 하 고 신경 퇴행 성 질환.
류 마티스 Synovial 섬유 아 세포에서 인터 루 킨 1beta 유도 매트릭스 Metalloproteinase 생산 및 HTNFtg 쥐에서 Antiarthritic의 활동에 분 Phospholipase A2 금지 펩 티 드의 진압 효과
분 phospholipase A2 (sPLA2) 매트릭스 metalloproteinase (MMP) 억제제 염증 치료 잠재력의 유력한 변조기는 하지만 류 마티스 관절염 (RA) 효능을 제한 했다. 이 연구의 목표는 교양된 synovial 게재 (SF)에 파이썬 (PIP)-18 펩 티 드에서 phospholipase 억제제의 억제 메커니즘을 이해 하 고 인간의 종양 괴 사 인자 (hTNF)에서 치료 잠재력 평가-관절염의 유전자 변형 마우스 (Tg197) 모델을 구동.
혈소판 유래 성장 인자-DD를 대상으로 병 적인 신생 Glycogen Synthase 니 3beta 인 산화를 변조 하 여 체포
혈소판 유래 성장 인자-DD (PDGF DD)는 최근에 발견 된 PDGF 가족 위원. 병 적인 신생 및 기본 세포 및 분자 메커니즘에 PDGF DD의 역할이 크게 미개척 남아 있습니다. 이 연구에서 PDGF DD 식 병 적인 신생 동안 위로 했다 고 PDGF DD의 저해 억제 안 및 망막 neovascularization 보여 다른 동물 모델을 사용 하 여. 우리는 또한 증가 된 세포 생존으로 이어지는 PDGF dd. PDGF DD 유도 glycogen synthase 키-3beta (GSK3beta) Ser(9) 인 산화 및 체 외 그리고 vivo에서 Tyr(216) dephosphorylation 기능을 중재 하는 소설 메커니즘 시연. 일관 되 게, GSK3beta 활동 PDGF DD를 대상으로 하는 항 혈관 신생 효과 대 한 필요 했다. 또한, PDGF DD gsk3beta과 신생 및 apoptosis에 대 한 중요 한 다른 많은 유전자의 표현 규제. 따라서, 혈관 및 비 혈관 세포에는 다 면 발현 성 효과 인해 항 혈관 신생 치료에 대 한 중요 한 대상 유전자로 PDGF DD 파악. PDGF DD 저해 신생 질병 치료에 새로운 치료 옵션을 제공할 수 있습니다.
GSK3beta 인 산화를 조절 하 여 신경 세포에서 두뇌와 망막에 있는 Apoptosis 구출 하는 PDGF CC의 생존 효과
혈소판 유래 성장 인자 (PDGF CC) CC PDGF AA와 PDGF BB는 가족의 원래 멤버에 대 한 연구의 이상의 20 년 후 발견 된 PDGF 가족의 세 번째 구성원입니다. PDGF CC의 생물 학적 기능 탐험 크게 남아 있습니다. PDGF CC glycogen synthase 니 3beta를 변조 하 여 작동 하는 강력한 신경 보호 요소입니다 찾는 소설을 보고 (GSK3beta) 활동. 신경 손상, 신경 죽음 axotomy 유도 등의 여러 가지 다른 동물 모델에서 neurotoxin 유도 신경 부상, 6 hydroxydopamine 유발 된 파 킨 슨 dopaminergic 신경 죽음, 그리고 허 혈 유도 선, PDGF CC 단백질 또는 유전자 배달 apoptosis 망막과 뇌에서에서 뉴런의 종류를 보호. 다른 한편으로, 기능 손실 분석 실험 PDGF C null 마우스를 사용 하 여, 중화 항 체, 또는 짧은 헤어핀 RNA는 PDGF CC 결핍/저해 악화 vivo에서 서로 다른 신경 조직에 있는 신경 죽음 보였다. Mechanistically, 우리는 PDGF CC의 신경 보호 효과 GSK3beta 인 산화와 식 규제에 의해 달성 했다 밝혔다. 우리의 데이터 보여 PDGF CC 신경 생존에 대 한 비판적으로 필요한 신경 퇴행 성 질환 치료를 잠재적으로 사용할 수 있습니다. 억제 임상 용도별로 PDGF CC PDGF 수용 체 통로의 정상적인 신경 기능을 보존 하기 위해 주의 실시 한다.
PDGF CC 봉쇄 여러 세포 및 분자 표적 행동에 의해 병 적인 혈관 신생을 억제 한다
병 적인 신생에 VEGF 독립적인 경로 식별의 중요성은 점점 더 안티 VEGF 치료에 신흥 마약 저항 결과로 인식 된다. PDGF CC PDGF AA와 PDGF BB에 대 한 연구의 이상의 20 년 후 발견 된 PDGF 가족의 세 번째 구성원입니다. PDGF 참조 및 기본 세포 및 분자 메커니즘의 생물 학적 기능 크게 미개척 남아 있습니다. 여기, 우리 PDGF CC 저해 중화 항 체, shRNA, 또는 유전 삭제 안 하 고 망막 neovascularization 억제를 보고 다른 동물 모델을 사용 하 여. 중요 한 것은, 우리는 PDGF CC 타겟팅 행동 PDGF BB와 PDGF 수용 체와 같은 다른 중요 한 angiogenic 유전자의 표현에 뿐만 아니라 여러 셀 형식 혈관 벽화 및 내 피 세포, 대 식 세포, 안 섬유 아 세포 및 망막 색소 상피 세포 같은 병 적인 신생에 대 한 중요 한에서 뿐만 아니라 밝혔다. 분자 수준에서 우리는 PDGF CC 규제 glycogen synthase 니 (GSK) 발견-3beta 인 산화 및 생체 외 및 생체 조건 식. Gsk3beta의 활성화 장애가 PDGF CC 유발 신생 및 gsk3beta의 저해 폐지 PDGF CC 봉쇄의 항 혈관 신생 효과. 따라서, 우리가 항 혈관 신생 치료에 대 한 중요 한 후보 대상 유전자 PDGF CC 식별 하 고 신생 질병 치료에 치료 적 가치의 PDGF CC 저해 될 수 있습니다.
