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Methyltransferases의 프로 파일링 및 기타 S - adenosyl - L - 호모 시스테인 결합 단백질
1Department of Biochemistry / Analytics, caprotec bioanalytics GmbH, 2Institute of Organic Chemistry, RWTH Aachen University
캡처 화합물 사진 crosslinking 및 정화하여 다음 기능을 가역 작은 분자 - 단백질 상호 작용에 의한 프로테옴의 복잡도를 줄이기 위해 trifunctional 작은 분자 수 있습니다. 여기있는 캡처 컴파 운드를 사용하여
Other articles by Peter Poot on PubMed
S-adenosyl-L-호모 시스테인의 합성 화합물 Methyltransferases의 선택적 Photoinduced 격리에 대 한 캡처
Postgenomic 시대에 주요 관심은 그들의 기판 및 다른 세포질 단백질의 상호 작용을 이해입니다. 이 목적에 대 한 선택적 격리 및 복잡 한 생물 학적 샘플에서 단백질의 식별은 필요 하 고 효소 가족의 타겟된 절연은 어려운 작업. 지난 년 동안 방법 활동 기반 단백질 프로 파일링 (ABPP) 좋아하고 캡처 복합 질량 분석 (CCMS) 단백질 분리에 대 한 물리적 특성의 차이 이용 하는 표준 접근 방식 달리 단백질 기능에 의하여는 프로테옴 복잡성을 줄이기 위해 개발 되었습니다. 분리 하 여 S-adenosyl-L-메티오닌 (SAM 또는 AdoMet)로 구성 된 subproteome 식별-종속 methyltransferases (methylome), 우리 개발 하 고 선택도 기능으로 화학적으로 안정 cofactor 제품 S-adenosyl-L-homocysteine (SAH 또는 AdoHcy)를 포함 하는 trifunctional 캡처 화합물을 합성. SAH analogues N6 또는 c 8 위치에 아미노 링커 함께 합성 되었고 공유 단백질 수정에 대 한 다른 photocrosslinking 그룹 및 선호도 격리 biotin이 포함 된 건설 기계 임대에 연결 된. 선택적 photoinduced 단백질 격리 SAH 캡처 화합물이 유틸리티는 다양 한 methyltransferases (MTases) 병원 성 대장균 세포 lysate 뿐만 아니라 DNA, RNA 및 단백질에 연기에 대 한 시연입니다. 또한, 그들은 분리 상수 MTase cofactor 단지에 대 한 결정을 사용할 수 있습니다.
복합 캡처 질량 분석에 의해 Methyltransferases와 다른 S Adenosyl L 호모 시스테인 바인딩 단백질 프로 파일링합니다
다양 한 기능 작은 분자-단백질 상호 작용에 기초 하 여 프로테옴 복잡성을 줄이는 방법 이다. Trifunctional 작은 분자 프로브 및 대상 단백질 사이의 초기 평형 구동 상호 작용 캡처 컴파운드의 독립적인 사진 activable 반응성 기능과 대상 protein(s)의 표면 사이 사진-가교 시 고정 irreversibly는 캡처 화합물에 따라 일반적인 접근 방식을 설명 합니다. 그 후, 캡처 화합물-단백질 conjugates 캡처 컴파운드의 정렬 기능을 통해 복잡 한 생물 학적 혼합물에서 격리 됩니다. 여기, 우리 trifunctional methyltransferase 제품 억제제 S-Adenosyl-L-호모 시스테인 lysate 대장균 DH5α 세포의 복잡 한에서 methyltransferases의 격리에 대 한 선택도 함수로 전달 컴파운드 캡처 응용 프로그램을 설명 합니다. 사진 활성화 가교 수율 및 실험의 감도 향상 되 고 특이성 테스트할 수 있습니다 즉시에 대 한 무료 S-Adenosyl-L 호모 시스테인의 초과 사용 하 여 경쟁 실험.
