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Articles by Seth T. Gammon in JoVE
利用X射线计算机断层扫描在小鼠肥胖模型的FAT卷的分割和测量
Todd A. Sasser1, Sarah E. Chapman2, Shengting Li1, Caroline Hudson2, Sean P. Orton1, Justin M. Diener3, Seth T. Gammon1, Carlos Correcher4, W. Matthew Leevy2
1Carestream Molecular Imaging, 2Department of Chemistry and Biochemistry, University of Notre Dame, 3Freimann Life Science Center, University of Notre Dame, 4Research and Development, Oncovision, GEM-Imaging S.A.
脂肪含量的分析,定期进行在利用小鼠肥胖模型的研究。新兴的小动物CT成像和分析的方法为纵向细节丰富的脂肪含量分析。在这里,我们表演小动物CT成像,分析和可视化的步骤的详细步骤。
Other articles by Seth T. Gammon on PubMed
标记与锝-99 米的渗透多肽复合物的定量分析: 净细胞吸收手性和特定序列的影响。
Bioconjugate Chemistry. Mar-Apr, 2003 | Pubmed ID: 12643747
这项研究调查了达基本域和残留手、 长度和修改的侧链重点相关的渗透肽的特定序列的细胞吸收特性。对域中定义的基本序列 42 不同来源肽的库内的细胞渗透的影响进行了评估使用运输放射性标记多肽的进人 Jurkat 白血病细胞。所有其他因素相等,当手性的多肽序列从 l 改为 d、 吸收值增加达 13-fold。控制实验表明吸收的定量差异不能归咎到增加分解的 l-d 肽与蜂窝或血清蛋白酶。此外,长度、 序列,螯合域类型影响和肽吸收到单元格中。最高水平的吸收被发现与下列多肽: (23) d-达-生于 [Ac-rkkrr-orn-rrr-AHA-kgc-amide] 和 [交流-rrrrrrrrr-AHA-kgc-酰胺] (33) d-poly-Arg(9)。最好的这些肽序列可以在体内成像和药物传递代理使用,以衬底转移到单元格中。
显示与萤火虫荧光素酶互补在细胞成像和活牲畜的受规管的蛋白质-蛋白质相互作用的动力学研究。
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2004 | Pubmed ID: 15284440
规管增殖、 分化和凋亡的信号传导通路通常是通过蛋白质-蛋白质相互作用以及可逆磷酸化蛋白介导的。为便利的受规管的蛋白质-蛋白质相互作用在细胞和动物研究,我们通过筛选 N 和 C 端片段的荧光素酶的增量截断库优化萤火虫荧光素酶蛋白片段互补。优化的 FRB N 端荧光素酶分别融合到雷帕霉素绑定域 (FRB) 的激酶靶雷帕霉素与 FK506 结合蛋白 (FKBP) 12、 片段 (NLuc) / 荧光素酶 C 末端片段 (克卢克)-FKBP 荧光素酶互补成像 (狮子) 对重组后的雷帕霉素 FK506 竞争方式单站点绑定细胞荧光素酶活性。国际狮子会三个独立的应用程序中使用。在小鼠植入的细胞表达 FRB-NLuc/克卢克-FKBP 狮子一对,剂量和时间的荧光素酶活性允许特定于目标的药效分析雷帕霉素诱导蛋白质-蛋白质相互作用的体内。在单元格表示的国际狮子会 Cdc25C-NLuc/克卢克-14-3-3epsilon 双、 药物介导的细胞周期的中断调节的蛋白质-蛋白质相互作用与蛋白激酶抑制剂 UCN 01 丝氨酸相关的方式中得到体现。当应用于依赖的 γ-干扰素激活 Janus 激酶/信号转导子和转录激活子 1 (STAT1),结果表明,在配体诱导的磷酸化,缺乏国际狮子会 STAT1 蛋白存在的预制二聚体作为活细胞。因此,优化国际狮子会提供实时检测与表征的受规管和小分子诱导蛋白质-蛋白质相互作用完整细胞和动物生活在附近的一个平台,并使药物发现、 化学遗传学和蛋白质组学研究的新型应用范围广。
构效关系、 动力学、 选择性和细菌和哺乳动物细胞合成 Hydraphile 通道的机理研究。
Organic & Biomolecular Chemistry. Oct, 2005 | Pubmed ID: 16172693
Hydraphile 化合物显示为革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌、 酵母、 哺乳动物细胞的细胞毒。其细胞毒性媲美其他合成的三脚架和天然抗生素的效价的竞争对手。描述对毒性的结构变化的影响。这些变化的影响也与以前的研究脂质体离子输运的关联。全细胞修补程序与哺乳动物细胞夹紧证实在暗示这个家庭可能包括小说和灵活的药理代理商的活细胞的通道机制。
异类生物源排放的五彩发光的光谱解译。
Analytical Chemistry. Mar, 2006 | Pubmed ID: 16503603
各种各样的发光的荧光素酶蛋白均可在转录或生化记者检测中使用。然而,光谱重叠通常阻止他们同时被监视。要解决此问题,编写 Java 插件为 ImageJ deconvolute 发光图像组成的多个 luciferases 的信号。方法是通过测试这两个模拟和真实的荧光素酶图像与程序进行验证。发光图像获得使用配有光学滤光片、 CCD 相机和图像 deconvoluted 使用插件 ImageJ。 HeLa 细胞被染点击甲虫红色荧光素酶 (CBR)、 单击甲虫绿色荧光素酶 (CBG99) 或海肾荧光素酶 (Rluc) 和混合的裂解就成像 96 井板生化验证方法中的比例各不相同。后谱反卷积,预测、 纯荧光信号可恢复出现错误相声最大的 + /-1.5%。此外,表示 CBR、 CBG99、 和 Rluc 的活细胞同时被映像和 deconvoluted 在 96 井板展示高吞吐量的应用程序应用这种方法的可行性。最后,多色的转录和翻译后修饰记者被同时成像和显示,deconvolute 在纵向化验的归一化的 IkappaBeta 激酶活性。因此,我们的软件提供快速、 简单和准确的方法,同时测量多个发光记者在活细胞中。
渗透肽共轭体内分子成像应用程序。
Molecular Imaging. Jan-Mar, 2006 | Pubmed ID: 16779965
快速高效传递的成像探测器使用渗透肽细胞内部已启用新型分子影像学的应用程序。基于艾滋病毒 1 达域的基本序列,GRKKRRQRRR,用荧光和光学成像或用适当的基于多肽的图案或大环以螯合金属,例如为核放射性核素显像锝和钆的磁共振成像、 荧光蛋白标记的膜 permeant 肽已被合成。此外,已被氧化铁配合官能达基本域肽磁共振成像应用程序。此处我们检讨渗透肽分子成像和影响渗透肽内在因素在当前应用程序。这些诊断代理显示集中细胞积累和快速反应动力学并显示在人体细胞中的游离和焦核积累。相结合的方法,纳入眼底马来酰亚胺和螯合的锝双标记渗透肽让细胞摄取的定性和定量的分析。小鼠后静脉给药的原型诊断渗透肽成像研究显示允许各种分子成像应用程序的快速全身分布。战略发展成分子成像探测器的渗透肽已包括纳入的靶向分子信标或启用选择性保留、 荧光激活或有针对性的转导的蛋白酶章域等图案。这些新型渗透肽复合物进入细胞内的隔间跨细胞膜保持快速移位和分子成像和组合治疗中有针对性的体内应用的潜力。
蜂窝通信、 能源利用率和转移性神经内分泌肿瘤的扩散之间的联系。
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16895983
若要标识代谢功能,支持人类神经内分泌 (NE) 癌症的侵略行为,我们审查了 NE 的转移性前列腺肿瘤和派生的前列腺 NE (PNEC) 癌细胞从转基因小鼠模型中观察到代谢产物的转化的硅预测使用幻角旋转核磁共振光谱学的组合可能会经历,生化测试的这些预测和电生理/钙成像的研究。NE 恶性细胞接受励磁和增加的扩散时刺激其 GABA(A)、 味精、 和/或甘氨酸受体的、 为基板用于 NADH 合成谷氨酸和 GABA 和生产丙烯乙二醇,来自循环通过额外的 NE 细胞影响游离脂肪酸水平上升的甘氨酸丙酮酸的前体。包含 (i) 阿米洛利、 利尿剂,抑制 Abp1,与预测无效应浓度肿瘤异种移植的裸鼠的治疗酶参与 NE 细胞 GABA 代谢,(ii) 卡比多巴,哪些函数上游 Abp1,再加上 (三) 西尼,绑定到 GABA(A) 受体,苯二氮卓类拮抗剂导致肿瘤生长显著减少多巴脱羧酶抑制剂。这些研究结果可能普遍适用: 从 471 人类肿瘤基因芯片数据集显示组件的 GABA 代谢途径,包括 ABP1,表现出其表达式中 NE 和非 NE 癌症统计数据明显增加。
在近红外荧光分子探针的生活小鼠细菌性感染的光学成像。
Journal of the American Chemical Society. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17177377
光学成像探测器是由附加到包含两个 zinc(II) dipicolylamine (锌政治部) 单位亲和组的近红外菁荧光合成的。探头表面的细菌,强大和有选择性的相似性,它习惯于革兰阳性金黄色葡萄球菌和革兰阴性杆菌 E.大肠杆菌细菌生活裸小鼠的形象感染。静脉滴注后探头有选择性地积累本地化细菌感染的老鼠的大腿肌肉的工地。
方酸轮烷: 上级替代品的 Cy-5 的分子探针的近红外荧光细胞成像。
Angewandte Chemie (International Ed. in English). 2007 | Pubmed ID: 17585399
中核因子活化信号转导配体诱导瞬态难治性期限确定。
The Journal of Biological Chemistry. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18203717
针对各种各样的胞外配体,核因子 kappaB (NF-活化) 信号调控炎症、 细胞增殖和凋亡。很可能的单元格不连续暴露刺激配体体内但相当经验瞬间脉冲。研究时空调节 NF 活化和其主要监管机构,抑制剂 NF-kappaBalpha (IkappaBalpha),在真正的时间,我们利用一种新型的介导耦合的 IkappaBalpha 萤火虫荧光素酶融合记者和特点的动态和 IkappaBalpha 处理后的肿瘤坏死因子 α (TNFalpha) 的短 30-s 脉冲或 TNFalpha 后 30-s 预处理脉冲持续不断的挑战响应能力。引人注目的是,TNFalpha 30-s 脉冲强劲激活抑制因子 NF 活化激酶 (IKK),导致 IkappaBalpha 退化、 NF 活化核易位和强转录调控的 IkappaBalpha。此外,我们确定瞬态难治性期 (持续达 120 分钟) 以下预处理,在单元格未能够充分降低后的第二个 TNFalpha IkappaBalpha 期间挑战。活动 IKK 激酶检测发现调节 IKK 活性的相关部分,这个瞬变难治性时期。相比之下,实验涉及连续暴露于 TNFalpha 和白细胞介素-1beta 表示受体动力学不能解释这种现象。利用井接受 NF 活化动力学计算模型,我们进一步确定附加层的监管,下游的 IKK,可控制细胞的应对第二次的炎性侮辱时态能力。总体而言,数据表明核出口的 NF kappaB.IkappaBalpha 配合物代表可能会影响此难治性期间,从而提供额外的规管机制的另一个速率限制的一步。
无创光学成像的金黄色葡萄球菌细菌感染小鼠生活,使用 Bis-dipicolylamine-Zinc(II) 亲和组共轭对近红外荧光。
Bioconjugate Chemistry. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18260609
光学成像的动物生活在细菌感染通常进行遗传记者发光酶或荧光蛋白等。然而,有许多在的情况下遗传的记者并不适用,有需要可以有选择地针对细菌的外源合成探测器。这项研究的重点是荧光成像探测器由的共轭对近红外染料的细菌亲和团体组成的。亲和团体是一个目标阴离子表面的细菌细胞的合成锌 (II) 协调复杂。探头允许检测的金黄色葡萄球菌感染 (5 × 10 (7) 细胞) 使用整个动物近红外荧光成像的鼠标腿部感染模型中。区域利益分析表明感染到未受感染的腿腿的信号比达到 + /-0.5 21 h postinjection 的探测器在 3.9。扩增的器官成像产生 8 感染未感染到腿部的信号比。免疫组织化学分析证实了探讨针对细菌细胞中的受感染的组织。影像筛选器的优化设置降低荧光背景信号,并大大改善成像对比度。这项研究显示近红外分子探针适于本地化 S.金黄色感染的无创性光学成像。
评估的沙门氏菌入侵动力学的稳定综合的 LuxCDABE。
Molecular Imaging. Sep-Oct, 2008 | Pubmed ID: 19123992
鼠伤寒沙门氏菌是人体肠胃炎的常见原因,也本地化到肿瘤性肿瘤的动物。特定的真核细胞的入侵是沙门菌与宿主组织相互作用的关键机制。胃肠道细胞入侵的早期阶段被介导沙门氏菌类型三、 分泌系统,由腺苷三磷酸酶 invC 供电。这项工作的目的是进入传统上用作肠上皮细胞或肿瘤模型的不同真核细胞的入侵动力学 invC 依赖性的特点。因此,使用 lux + 胎儿染色体包含的沙门氏菌的真核细胞入侵动力学综合 luxCDABE 基因的报告制定了无损的实时检测。基于生物发光的入侵检测方法使用 lux + 沙门氏菌展出接种剂量-反应关系、 尊敬的入侵主管从入侵无能沙门氏菌和歧视相对沙门氏菌侵袭诱使入侵基因表达的环境条件。从 lux + 沙门菌生物发光与恢复的集落形成相关标准庆大霉素保护检测,在单位内部细菌和可能的生物发光镜可视化。此外,这种测定方法区分开来独立的庆大霉素治疗实时入侵无能细菌入侵主管。生物发光报告不同真核细胞系,包括恶性黑色素瘤、 结肠腺癌和胶质瘤细胞恶性肿瘤的动物模型中使用的沙门氏菌入侵。在每种情况下,沙门氏菌入侵的真核细胞是 invC 依赖。
生物发光成像的髓过氧化物酶活性的影响。
Nature Medicine. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19305414
髓过氧化物酶 (MPO) 系统的激活吞噬细胞是正常宿主防御机制,向中央和 MPO 有助于炎性疾病的发病机制的水平及国家从癌症到的动脉粥样硬化。在这里我们显示系统性的行政当局,小分子鲁米诺使无创生物发光成像 (BLI) 的 MPO 活性的影响。鲁米诺 BLI 允许定量纵向监测的 MPO 活性的急性皮炎,混合过敏性接触过敏反应、 焦关节炎和自发性大颗粒淋巴细胞肿瘤的动物模型。生物发光与炎症的组织学网站 colocalized 和小鼠基因删除 Mpo(-/-),尽管大规模组织渗透的嗜中性粒细胞完全废除了与激活嗜酸性粒细胞,指示该嗜酸性粒细胞的过氧化物酶不会助长鲁米诺-BLI 体内。因此,鲁米诺 BLI 提供体内的巨噬细胞介导 MPO 活性的无创性的、 具体的和高度敏感的光学读出,并可启用新诊断应用程序中广泛的急性和慢性炎症条件。
小说红移的布雷特 · 配对的合理设计: 实时单链蛋白酶生物传感器的平台。
Biotechnology Progress. Mar-Apr, 2009 | Pubmed ID: 19330851
生物发光共振能量转移 (BRET) 系统到目前为止一直由蓝绿海肾荧光素酶 (Rluc) 作为能源捐助者使用。虽然在许多情况下是有效的费用和基板 (phenylcoelenterazine) 的不利生化特性限制基于 Rluc 的布雷特 · 系统的实用程序。此处我们报告了一系列新型布雷特 · 对基于利用 D-荧光素,造成红移的光子产出、 有利的生化特性和增加的疗效的 luciferases。我们制定修改的 Förster 方程预测最优布雷特 · 荧光素酶捐助荧光成对,并确定 tdTomato 作为最佳的红色荧光承兑以单击甲虫绿色荧光素酶 (CBRE)。典型的单链蛋白酶生物传感器,能够对刽子手半胱氨酸蛋白酶活性在活细胞内和实时报告、 是通过插入 DEVD CBG 和 tdTomato 之间的链接器生成和验证与重组半胱氨酸蛋白酶和 cellulo 与细胞凋亡敏感和耐药细胞系体外。高信号的信噪比 (大约 33) 和 Z' 因素 (0.85) 升幅的活细胞的纵向研究,足够的高通量筛选。因此,我们说明新的布雷特 · 系统的合理设计的一般方法,并提供新颖的单链布雷特 · 长寿、 红移,并利用 D-荧光素酶生物传感器。
有针对性地的化疗药物抗肿瘤、 无创成像的癌症,在 P 糖蛋白介导的功能运输和新兴的 Pgp 在神经退行性疾病中的作用。
Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 19949924
P-糖蛋白 (Pgp) 的表达介导的多药耐药性 (MDR) 是最佳特色转运蛋白介导障碍之一成功化疗的癌症病人,也在阿尔茨海默氏症和帕金森病等神经退行性疾病的研究进展快速崛起的目标。因此,战略能够提供化疗药物耐药的肿瘤和有针对性的放射性药物作为可以预计超灵敏探针检测功能 Pgp 在体内表达的分子成像系统生物学作为个性化的医学势头在二十一世纪中发挥重要作用。靶向的治疗可以预计到所需的目标提供最佳剂量的化疗药物,而审讯的 Pgp 介导的运输活动在体内通过无创成像技术 (SPECT 和 PET) 将在分层的患者群体可能会受益于给定的治疗,从而协助管理耐药癌症和治疗神经退行性疾病有益。这两个战略可以在个性化治疗癌症和神经退行性疾病中的地位中发挥着至关重要的作用。通过本教程中,作者尝试做中概述了这些战略,并讨论他们的长处和弱点。
在急性细胞死亡体内光学成像使用近红外荧光锌 Dipicolylamine 探针。
Molecular Pharmaceutics. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21323375
细胞死亡是一个基本的生物过程,目前在许多疾病的病理。为各种各样的研究应用程序从显微镜活体成像到制定了检测细胞死亡的荧光探针。我们在这里介绍的锌 (II) 合成近红外 (NIR) 共轭-dipicolylamine (Zn² +-DPA) 体内成像的细胞死亡。使用 ionphore、 乙醇、 或氯胺酮毒素作为建立化学诱导体内模型肌病。Zn² +-DPA 荧光探针或相应的控件随后被注入,和整个动物荧光成像表明探头摄取遗址的肌肉损伤前体内和组织学分析, 所证实。进一步,用近红外荧光共轭膜联蛋白 V 的比较研究表明膀胱遗址的肌肉损伤和高积累不少强烈吸收。结果表明,荧光 Zn² +-DPA 共轭是体内细胞死亡检测有效探针和在某些情况下可能是荧光钙磷脂结合 V 复合物适当的替代方法。
合成离子通道介导的体内细胞死亡。
Chemical Communications (Cambridge, England). Jul, 2011 | Pubmed ID: 21681307
合成离子通道 hydraphiles,已知渗透膜和扰乱离子稳态平衡,作为直接注射毒素作为潜在 schlerotic 代理活小鼠中进行了测试。这项研究使用近红外染料图像和评价方法的成功。
