Hierarchische Hochdurchsatz-SNP-Genotypisierung Des Menschlichen Y-Chromosom Mittels MALDI-TOF-Massenspektrometrie

Nucleic Acids Research. Mar, 2002  |  Pubmed ID: 11884646

Ein überwiegend Neolithischen Ursprungs Für Y-chromosomale DNA-Variation in Nordafrika

American Journal of Human Genetics. Aug, 2004  |  Pubmed ID: 15202071

Ein 77-Kilobasen-Region Von Chromosom 6p22.2 Mit Legasthenie in Familien Aus Dem Vereinigten Königreich Und Aus Den Vereinigten Staaten Verbunden

American Journal of Human Genetics. Dec, 2004  |  Pubmed ID: 15514892

Das Chromosom 6 P 22-Haplotyp Zusammenhang Mit Legasthenie Reduziert Den Ausdruck Des KIAA0319, Einem Neuartigen Gen Der Neuronalen Migration Beteiligt

Human Molecular Genetics. May, 2006  |  Pubmed ID: 16600991

Legasthenie ist eine der am weitesten verbreitete Kindheit kognitive Störungen, ca. 5 % der Schulkinder betroffen. Wir haben vor kurzem identifiziert ein Risiko Haplotype Zusammenhang mit Legasthenie auf Chromosom 6p22.2 die die TTRAP-gen und Teile von vereinfachen2 und KIAA0319 erstreckt. Hier zeigen wir, dass in Anwesenheit der Risiko Haplotype, der Ausdruck des KIAA0319-Gens wird reduziert, aber der Ausdruck der anderen zwei Gene unberührt bleibt. Mit in-situ-Hybridisierung, erkennen wir ein sehr ausgeprägten Ausdrucksmuster des KIAA0319-Gens in entwickelnden zerebralen Neocortex Maus und menschlichen Föten. Außerdem führt die Interferenzen mit Ratte Kiaa0319 Ausdruck in der Gebärmutter zu Beeinträchtigung der neuronalen Migration in Entwicklungsländern zerebrale Neocortex. Diese Daten legen nahe, eine direkte Verbindung zwischen einer bestimmten genetischen Hintergrund und einen biologischen Mechanismus zur Entwicklung der Legasthenie: das Risiko Haplotype auf Chromosom 6p22.2 Down-reguliert das KIAA0319-gen, das für neuronale Migration bei der Bildung des zerebralen Neocortex erforderlich ist.

Haplotyp-spezifischen Ausdruck Des Exon 10 Bei Der Menschlichen MAPT-Locus

Human Molecular Genetics. Dec, 2006  |  Pubmed ID: 17085483

Neurofibrillären Kabelgewirr bestehend aus Exon 10 + Microtubule associated Protein Tau (MAPT) Einlagen sind das charakteristische Merkmal der neurodegenerativen Krankheiten progressive supranukleäre Blickparese (PSP) und kortikobasale Degeneration (CBD). PSP, CBD und vor kurzem von Alzheimer und Parkinson, die MAPT H1-Haplotyp zugeordnet sind, aber die Beziehung zwischen Genotyp und Krankheit bleibt unklar. Hier untersuchen wir die Hypothese, dass H1 mehr Exon 10 + MAPT mRNA im Vergleich zu den anderen Haplotype, H2 drückt, führt zu eine größere Anfälligkeit für Neurodegeneration in H1-Trägern. Wir spielten Allel-spezifische Genexpression auf zwei H1/H2 heterozygote menschliche neuronale Zellformen und 14 H1/H2 heterozygote Kontrolle einzelner Post-Mortem Hirngewebe aus zwei Hirnregionen. In Gewebekultur und Post-Mortem Hirngewebe, wir zeigen, dass die MAPT H1-Haplotyp deutlich mehr Exon 10 + drückt MAPT mRNA als H2. In Post-Mortem Hirngewebe, zeigen wir, dass der Gesamthöhe MAPT Ausdrucks von H1 und H2 nicht signifikant verschieden ist, aber das H1-Chromosom bis zu 1.43-fold mehr Exon 10 + MAPT mRNA als H2 im Globus Pallidus, einer Hirnregion, die stark betroffen Tauopathie drückt (maximale Exon 10 + MAPT H1:H2 Abschrift Verhältnis = 1.425, SD = 0.205, P < 0.0001), und bis zu 1.29-fold mehr Exon 10 + MAPT mRNA als H2 im frontalen Kortex (maximale Exon 10 + MAPT H1:H2 Abschrift Verhältnis = 1.291, SD = 0,315, P = 0,006). Diese Daten können erklären die erhöhte Anfälligkeit der H1-Carrier Neurodegeneration und schlagen einen möglichen Mechanismus zwischen MAPT genetische Variabilität und die Pathogenese der Neurodegenerative Krankheit.

Das Genetische Lexikon Der Legasthenie

Annual Review of Genomics and Human Genetics. 2007  |  Pubmed ID: 17444811

Lesung Fähigkeiten werden nur durch spezifische Lehre und Ausbildung erworben. Ein Großteil der Kinder nicht diese Fähigkeiten trotz normalen intellektuellen Fähigkeiten und eine geeignete Gelegenheit zu lernen zu erreichen. Schwierigkeiten beim Lernen zu lesen ist auf bestimmte Funktionsstörungen des Gehirns, die bisher weitgehend unverstanden bleiben zurückzuführen. Jedoch wird es erkannt, dass die neurologische Grundlage für Legasthenie oder Lesen einer Behinderung, im großen Teil durch genetische Faktoren verursacht wird. Gestänge-Studien haben erfolgreich mehrere Regionen des menschlichen Genoms identifiziert, die wahrscheinlich zum Hafen veränderten Gene für Legasthenie. In der Vergangenheit einige Jahre stattgefunden haben spannende Fortschritte mit der Identifizierung von vier Kandidatengenen befindet sich innerhalb von drei dieser Chromosom Regionen verbunden: DYX1C1 auf Chromosom 15, ROBO1 auf Chromosom 3, und KIAA0319 und DCDC2 auf Chromosom 6. Funktionsstudien dieser Gene bieten neue Erkenntnisse über die biologischen Mechanismen der Entwicklung der Legasthenie und, im Allgemeinen der Kognition.

Alternatives Spleißen Im Legasthenie-assoziierte Gen KIAA0319

Mammalian Genome : Official Journal of the International Mammalian Genome Society. Sep, 2007  |  Pubmed ID: 17846832

Das KIAA0319-gen im Chromosom 6 p 22 wurde entwicklungsbedingte Dyslexie stark zugeordnet. In diesem Artikel zeigen wir ein breites Ausdrucksmuster dieses Gens im erwachsenen Gehirn Nordfleck Analyse. Wir spielten auch RT-PCR-Analyse um alternative Spleißen Varianten im menschlichen Gehirn zu erkennen. Die meisten der gefundenen Varianten beinhalten alternatives Spleißen des Exons an der 5' und 3'-enden. Zwei Hauptformen unterscheiden in der Länge 5' UTR auf ungefähr der gleichen Geschwindigkeit erkannt. Zwei Varianten (B und C) fehlende Exon 19, die kodiert das Transmembranegebiet, sind die wichtigsten alternativen Formen bei Menschen voraussichtlich Protein kodieren festgestellt. Diese beiden Varianten konnte abgesondert werden und eventuell Signalisierung Funktionen beteiligt. Eine ähnliche RT-PCR-Analyse durchgeführt in Maus und Ratte Erwachsenen Gehirne, die zeigte, dass nur einige der alternativen Spleißen Varianten gefunden in das menschliche Gen gleichwertig sind.

Des Y-Chromosoms Einblicke in Die Genetischen Auswirkungen Das Kastensystem in Indien

Human Genetics. Mar, 2007  |  Pubmed ID: 17075717

Das Kastensystem hat in der indisch-hinduistischen Gesellschaft rund 3.500 Jahren beibehalten. Wie das y-Chromosom Kaste ist definiert, bei der Geburt, und Männer können ihre Kaste nicht ändern. Um die genetischen Folgen dieses Systems untersuchen, analysieren wir haben Männchen-Übertragungslinie Variation in einer Probe von 227 indische Männer bekannte Kaste, 141 aus der Jaunpur in Uttar Pradesh und 86 vom Rest Indiens. Wir eingegeben 131 des Y-Chromosoms binäre Marker und 16 Mikrosatelliten. Wir finden auffällige Beweis für männliche Unterbau: insbesondere Brahmins und ksatrias (aber nicht anderen Kasten) aus Jaunpur jedes zeigen geringe Vielfalt und die Dominanz der einen einzelnen unterschiedliche Cluster Haplotypen. Diese Ergebnisse bestätigen die genetische Isolierung und Drift im oberen Kasten Jaunpur, die wahrscheinlich aus der Gründer-Effekte und soziale Faktoren ergeben. In den anderen Kasten möglicherweise entweder größere effektive Bevölkerung Größen weniger strikte Isolierung oder beides.

Das Legasthenie-assoziierte Gen KIAA0319 Codiert Hoch N Und O-HbA1c Plasmamembran Und Sezernierte Isoformen

Human Molecular Genetics. Mar, 2008  |  Pubmed ID: 18063668

Das KIAA0319-gen gezeigt, dass der neuronalen Migration beteiligt und entwicklungsbedingte Dyslexie vor kurzem zugeordnet wurde. Das hergeleiteten KIAA0319 Protein enthält mehrere polycystic Kidney Disease (PKD) Domains die Interaktion zwischen Nervenzellen und Gliazellen Fasern während der neuronalen Migration vermitteln können. Wir die Anwesenheit von mehreren Alternativen Spleißen Varianten zuvor berichtet haben, von denen einige voraussichtlich hergeleiteten Proteins beeinflussen. In dieser Studie over-expressed wir Konstrukte, die mit dem Hauptformular (A) und zwei alternative Varianten (B und C) von KIAA0319. Wir zeigen, dass die in KIAA0319 (A) ein Typ ich Plasmamembran-Protein, eine Topologie, die konsistent mit der vorgeschlagenen in der neuronalen Migration. Status der Oligomere KIAA0319 wird vor allem Dimere, und diese Bedingung hängt Cystein-reiche Regionen des Proteins, vor allem die Transmembranegebiet (TM) und die umliegenden Sequenz. KIAA0319 ist sehr stark glykosyliert in verschiedenen Säugetier-Zellformen. Die zentrale Region, einschließlich der PKD-Domänen ist N-glykosyliert. Darüber hinaus enthält ein kurzes Fragment N-Terminal an der PKD-Domänen Mucin-Typ O-Glykosylierung. Die zwei Alternativen Isoformen sind lösliche Proteine fehlen die TM-Domain und interessanterweise nur Isoform B abgesondert wird. KIAA0319-Löschung Proteine fehlen die TM-Domain wurden auch abgesondert. Diese Ergebnisse legen nahe, dass KIAA0319 nicht nur in Zell-Zell-Interaktionen, sondern auch in der Signalgebung beteiligt sein könnten.

Verband Der KIAA0319 Legasthenie Anfälligkeit Gen Mit Lese-Fähigkeiten in Der Allgemeinbevölkerung

The American Journal of Psychiatry. Dec, 2008  |  Pubmed ID: 18829873

Die Autoren identifizierten zuvor ein Haplotype auf Chromosom 6 p 22 durch drei Einzel-Nukleotid-Polymorphismen (SNPs) definiert, die mit Legasthenie (Lesung Behinderung) in zwei unabhängige Stichproben der Familien verbunden war, die mindestens ein Geschwister mit schweren Lesung Wertminderung enthalten. Die Autoren zeigten auch, dass dieses Haplotype einen Rückgang der Expression des Gens KIAA0319 zugeordnet ist. Darüber hinaus entdeckt eine völlig unabhängige Studie eine Assoziation zwischen KIAA0319 Marker und Lesung Behinderung. In der aktuellen Studie getestet die Autoren, ob das KIAA0319-gen Lesekompetenz in der Allgemeinbevölkerung, anstatt einen Effekt auf die Lektüre einer Behinderung eingeschränkt beeinflusst.

Eine Gemeinsame Variante Mit Legasthenie Verbunden Reduziert Die Expression Des KIAA0319-Gens

PLoS Genetics. Mar, 2009  |  Pubmed ID: 19325871

Zahlreiche genetische Assoziation Studien haben das KIAA0319-gen auf dem menschlichen Chromosom 6 p 22 Legasthenie Anfälligkeit verwickelt. Die ursächliche Variante(n)/ ist unbekannt, aber Genexpression, modulieren kann, angesichts der Tatsache, dass (1) ein Legasthenie-assoziierte Haplotyp in den reduzierten Ausdruck der KIAA0319 verwickelt wurde hat, und (2) der stärkste Verein für die Region von Exon 1 der KIAA0319 gefunden wurde. Hier testen wir die Hypothese, dass Variante(n)/ für reduzierte KIAA0319 Ausdruck auf das Risiko Haplotype in der Nähe der Gen-Transkription befindet Website zu starten. Wir identifizierten sieben Einzel-Nukleotid-Polymorphismen auf die Risiko Haplotype unmittelbar oberhalb der KIAA0319 und entschlossen, dass drei davon mit mehreren lesen-bezogene Merkmale stark verbunden sind. Konstrukte Luciferase-Ausdrücken mit die KIAA0319-Region stromaufwärts, charakterisiert wir die minimale Projektträger und weitere vermeintliche transkriptionelle Regler Regionen. Dies ergab, dass die kleinere Allel des rs9461045, die die stärkste Assoziation mit Legasthenie in unserem Beispiel zeigt (max p-Wert = 0,0001), in beiden neuronalen und nicht-neuronale Zellformen reduzierte Luciferase Ausdruck verleiht. Darüber hinaus fanden wir, dass das Vorhandensein dieses rs9461045 Legasthenie-assoziierte Allel eine Atomanlage von Protein-Bindung, wahrscheinlich für die transkriptionelle Endschalldämpfer Okt-1 schafft. Okt-1-Ausdruck in die neuronale Zelllinie SHSY5Y mithilfe einer SiRNA umzuwerfen wiederhergestellt KIAA0319 Ausdruck aus dem Risiko Haplotype fast, die aus der nicht-Risiko Haplotype gesehen. Unsere Studie so identifiziert eine gemeinsame Variante als die Funktion eines Legasthenie Kandidat Gens zu verändern und bietet ein illustrativen Beispiel der strategische Ansatz erforderlich, um die molekulare Grundlage der komplexen genetischen Merkmale zu sezieren.

CMIP Und ATP2C2 Modulieren Phonologischen Kurzzeitgedächtnis in Sprachstörungen

American Journal of Human Genetics. Aug, 2009  |  Pubmed ID: 19646677

Bestimmten Sprachstörungen (SLI) ist eine häufige Entwicklungsstörung zeichnet sich durch Schwierigkeiten im Spracherwerb trotz ansonsten normalen Entwicklung und ohne jede offensichtlichen Erklärungsfaktoren. Wir spielten einen High-Density Bildschirm von SLI1, einer Region des Chromosoms 16q, distale, die sehr deutliche und konsequente Verknüpfung der Nonword Wiederholung, ein gewisses Maß an phonologischen Kurzzeitgedächtnis zeigt, die häufig im SLI beeinträchtigt wird. Verwenden zwei unabhängige Sprache eingeschränkt Stichproben eine familienbasierte (211) und Familien einen anderen aus einer Kohorte Bevölkerung aufgrund der extremen Sprache Maßnahmen (490 Fälle) ausgewählt, wir Vereinigung zu zwei Gene in der SLI1-Region erkannt: Diese Codierung c-Maf-induzierende Protein (CMIP, MinP = 5,5 x 10(-7) bei rs6564903) und die Codierung, Kalzium-transportierende ATPase, type2C, member2 (ATP2C2, MinP = 2,0 x 10(-5) bei rs11860694). Regression Modellierung ergab, dass jede dieser Loci einen unabhängigen Effekt von Nonword Wiederholung Fähigkeit übt. Trotz die konsistente Ergebnisse in Sprache-beeinträchtigt Proben, deaktiviert die Untersuchung in einer großen Kohorte (n = 3612) Verband nicht erkennen konnte. Wir schlagen deshalb vor, dass Varianten im CMIP und ATP2C2 handeln, um die phonologischen Kurzzeitgedächtnis in erster Linie im Zusammenhang mit Sprachstörungen zu modulieren. So unterstützt dieser Untersuchung die Hypothese, dass einige Ursachen von Sprachstörungen von Faktoren sind, die normale Sprache Variation zu beeinflussen. Diese Arbeit daher steht in Verbindung mit CMIP und ATP2C2 in der Ätiologie von SLI und liefert Molekulare Beweise für die Bedeutung der phonologischen Kurzzeitgedächtnis im Spracherwerb.

Charakterisierung Einer Familie Mit Seltenen Löschungen in CNTNAP5 Und DOCK4 Schlägt Roman Risiko Loci Für Autismus Und Legasthenie

Biological Psychiatry. Aug, 2010  |  Pubmed ID: 20346443

Autismus-Spektrum-Störungen (ASD) zeichnen sich durch soziale, Kommunikation, und Verhaltens Defizite und komplexe genetische Ätiologie. Eine aktuelle Studie von 517 ASD Familien verwickelt DOCK4 von single Nucleotide Polymorphism (SNP) Verband und eine Mikrodeletion in einem betroffenen Geschwister-Paar.

Identifizierung Von Kandidatengenen Für Legasthenie Anfälligkeit Auf Chromosom 18

PloS One. 2010  |  Pubmed ID: 21060895

Sechs unabhängige Studien haben auf Chromosom 18 für entwicklungsbedingte Dyslexie oder allgemeine Lesefähigkeit identifiziert. Bis jetzt wurden keine Kandidatengene identifiziert, um diese Verbindung zu erklären. Hier machten wir uns um die Übertragung der Anfälligkeit von zweistufigen Strategie der Verbindung und Vereinigung Analyse gehäuft zu identifizieren.

DCDC2, KIAA0319 Und CMIP Sind Lesung-bezogene Eigenschaften Zugeordnet

Biological Psychiatry. Aug, 2011  |  Pubmed ID: 21457949

Mehrere veränderten Gene wurden vorgeschlagen für Legasthenie (Lesung Behinderung; RD) und bestimmten Sprachstörungen (SLI). RD und SLI zeigen Komorbidität, aber es ist unklar, ob eine gemeinsame genetische Komponente freigegeben ist.

Präparation Der Genetische Assoziationen Mit Sprachlicher Merkmale in Populationsbasierten Kohorten

Journal of Neurodevelopmental Disorders. Dec, 2011  |  Pubmed ID: 21894572

Jüngste Fortschritte im Bereich der Sprache-Erkrankungen führten zur Identifikation von Kandidatengenen für bestimmte Sprachstörungen (SLI) und Legasthenie. Replikation Studien wurden durchgeführt, in unabhängige Stichproben einschließlich populationsbasierten Kohorten, die für eine große Anzahl von relevanten kognitiven Maßnahmen gekennzeichnet werden können. Die Verfügbarkeit einer breiten Palette von Phänotypen ermöglicht uns nicht nur die am besten geeigneten Züge für die Replikation der genetische Assoziation zu identifizieren, sondern auch das damit verbundenen kognitive Merkmal zu verfeinern. Darüber hinaus ist es möglich, für pleiotropen Effekte auf mehrere Phänotypen zu testen, die die umfangreichen Komorbidität beobachtet über SLI, Legasthenie und andere Erkrankungen des Nervensystems erklären könnte. Die Datenverfügbarkeit für diese Kohorten genomweiten Genotyp wird eine solche Analyse erleichtern aber wichtige Themen, wie mehrere Test-Korrekturen, müssen berücksichtigt werden, dass geringe Wirkung Größen dürften solche Vereinigungen zugrunde liegen.

PCSK6 Ist Mit Händigkeit Bei Personen Mit Legasthenie Verbunden

Human Molecular Genetics. Feb, 2011  |  Pubmed ID: 21051773

Etwa 90 % der Menschen sind Rechtshänder. Händigkeit ist eine vererbbare Eigenschaft, aber die genetische Basis ist nicht gut verstanden. Hier berichten wir eine genomweiten Verband-Studie für ein quantitatives Maß der relativen Hand Geschicklichkeit bei Personen mit Legasthenie [Lesung Behinderung (RD)]. Die am höchsten assoziierten Marker, rs11855415 (P = 4,7 × 10(-7)), befindet sich in PCSK6. Zwei unabhängige Kohorten mit RD zeigen den gleichen Trend mit der Moll-Allel größere relative rechten Fähigkeiten verleihen. Meta-Analyse aller drei RD-Proben wird genomweiten erhebliche (n = 744, P = 2,0 × 10(-8)). Umgekehrt in der Allgemeinbevölkerung (n = 2666), beobachten wir einen Trend zu reduzierten Lateralitäts Hand Geschick für die kleinere Allel (P = 0.0020). Diese Ergebnisse liefern Molekulare Beweise, daß zerebrale Asymmetrie und Legasthenie verbunden sind. PCSK6 ist eine Protease, die die Links-Rechts-Achse, die Bestimmung von Protein NODAL spaltet. Funktionelle Studien der PCSK6 Versprechen Einsichten in die Mechanismen, die zugrunde liegenden zerebralen Lateralisations und Legasthenie.