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Articles by Thomas Boulet in JoVE
JoVE Bioengineering
Magnet-Resonanz-Elastographie Methodik für die Beurteilung von Tissue Engineering gewonnenen Konstrukts Wachstum
1Department of Biological Systems Engineering, University of Nebraska-Lincoln, 2Department of Engineering Mechanics, University of Nebraska-Lincoln
Das Verfahren zeigt die Methodik der Magnet-Resonanz-Elastographie zur Überwachung der gentechnisch Ergebnis der Fett-und osteogene Gewebezüchtungen Konstruktionen, die durch nicht-invasive lokale Beurteilung der mechanischen Eigenschaften mit mikroskopischen Magnetresonanz-Elastographie (μMRE).
Other articles by Thomas Boulet on PubMed
Entdeckung Der Polymorphie 62 DNA-Reparatur-Gene Und Haplotype Verbände Mit Risiken Für Lungenkrebs Und Kopf- Und Hals-Tumoren
DNA-Reparatur ist essentiell für die Aufrechterhaltung der genetische Stabilität. Wir unternahmen die Sequenzierung zu ermitteln, gemeinsame genetische Varianten in 70 Genen beteiligt, in drei große Reparatur-Wege (base Excision Repair, Nucleotide Excision Repair und Fehlanpassung Reparatur) und DNA-Synthese und untersucht ihre Beziehung zur Lunge und Kopf und Hals Tumoren (H-N). Der 70 Gene untersucht, 62 wurden erfolgreich gezeigt (Exon Abdeckung > 20 %) durch Sequenzierung der Exons, Teile des Introns und angrenzende Regionen in 32 DNA-Proben von gesunden Personen der kaukasischen. Die verwendete Strategie erlaubt die Erkennung von fast allen Varianten mit einer geringfügigen Allel-Frequenz > oder = 5 % in den Regionen sequenziert. Während Single-Nucleotide Polymorphism (SNP) Entdeckung 772-Sequenzen in Introns wurden erkannt oder Regionen flankierenden gen und 313 fanden sich in Exons (führt zu 113 nicht Synonym Variationen) bei der Ermittlung von Einzel-Nukleotid Polymorphie (SNP). Insgesamt wurden 695 Varianten erfolgreich genotypisierten in 151 Krebserkrankungen der Lunge, 251 H-N-Krebserkrankungen und 172 Krankenhaus-Steuerelemente. Ergebnis Statistik wurden verwendet, um Unterschiede im Haplotype Frequenzen zwischen Fällen und Kontrollen in eine bedingungslose logistischen Regressionsmodell zu testen. Um mehrere Tests berücksichtigen, die wir mit jedem P-Wert einen geschätzten Anteil falscher Entdeckungen. Haplotype Analyse zeigte mögliche Verbände (P < 0,05) zwischen Lungenkrebs und acht Gene (MSH3, MLH3, POLK, LIG1, ERCC5, PMS1, POLG2 und RPA3) und H-N-Krebs und vier Gene (PMS1, POLG2, POLR2B und RPA1) mit false Discovery Proportionen von 25 und 55 %, beziehungsweise. Der DNA-Synthese-Weg zeigte eine Tendenz für mehr differenzielle SNP-Allel-Frequenzen zwischen H-N-Fällen und Kontrollen, als durch Zufall erwartet (P = 0,05). Diese Ergebnisse-Hinweis an ein paar potenzielle Kandidaten für weitere Untersuchungen in größeren Studien.
[Genexpression in Der Krebsforschung Profilerstellung]
Gene Expression profiling wird zunehmend in der Krebsforschung eingesetzt. Für jeden Patienten kann der Ausdruck Tausender Gene in den Tumor auf ein Microarray gleichzeitig gemessen werden. Microarray Studien darauf abzielen, Klassifizierung von Patienten, die auf der Grundlage von zwei Arten von Klassifikationsschemata: unbeaufsichtigt Einstufung, die zum Beispiel zwischen einer Gruppe von Patienten mit schlechten und guten Prognose zur Identifizierung homogener Subtypen einer Krankheit aufgrund ihrer Genexpression oder überwachte Klassifikation, die hauptsächlich auf die Identifizierung der Gene oder Gruppe von Genen, die differenziell ausgedrückt zwischen Tumoren mit unterschiedlichen Merkmalen (molekulare Signatur) abzielt verwendet, Clusterbildung. Die Daten bestehen aus einer kleinen Zahl von Patienten und eine große Anzahl von Variablen, schwerwiegende methodische Probleme auslösen. Wir nutzen veröffentlichten Ergebnisse zu Brustkrebs in Reihenfolge sowohl die Macht der Experimente zu studieren und um die Probleme bei der Auslegung und Gültigkeit ihrer Ergebnisse zu veranschaulichen. Wir empfehlen strengen Bewertung dieser neuen Technologie.
Varianten in DNA-Doppel-Strang Brechen Reparatur Und DNA-Schäden-Antwort-Gene Und Anfälligkeit Für Lungenkrebs Und Kopf- Und Hals-Tumoren
Rauchen ist der Hauptrisikofaktor für Lungenkrebs und zusammen mit Alkohol für Kopf und Hals (H--N) Krebs. Diese Genotoxics erzeugte DNA-Schäden und insbesondere Doppel-Strang Pausen (DSB), die durch verschiedene Reparatur-Wege entfernt werden. Um die Einleitung dieser Krebse zu verstehen, führten wir eine Genotyp-Analyse, um einige Varianten in bestimmten Genen in einer Fall-Kontroll-Studie von Lungen- und H-N korrelieren. Eine Orientierungsphase sequenziert wir DNA-Proben von 32 gesunden Caucasians, genetische Varianten in 30 Genen an der Reparatur von DSB und DNA-Schäden als Reaktion zu beschreiben. 625-Varianten wurden auf 29 aus 30 Gene erfolgreich abgeschirmt von Sequenzierung Exons, Teile des Introns und flankierenden Regionen erkannt. Dazu gehörten 470 nicht exonic Varianten, von denen 33 Einfügungen/Löschungen und 155 exonic-Änderungen, 59 nicht Synonym Polymorphismen entspricht. 223 dieser Varianten wurden bisher nicht beschrieben. Insgesamt wurden 379 Varianten erfolgreich genotypisierten in einer Fall-Kontroll-Studie nur für Raucher 151 Lungenkrebs Fällen 251 H-N-Fällen und 172-Steuerelemente. Um mehrere Tests berücksichtigen, die wir mit jedem p-Wert einen Anteil der falsch-positiven (Q-Wert). Haplotyp-Analyse schlug mögliche Verbände (p < 0,05) zwischen Lungenkrebs und 2 Genen (RECQL4 und RAD52), die mit Q-Wert von 8 % und zwischen H-N-Krebs und 1 Gen (DNA-PK) aber mit Q-Wert von 56 % kam. Die 3 Gene spielen eine Schlüsselrolle für die Regulierung der Effizienz der DSB-Reparatur. Groß angelegte Studien sind notwendig, um aufzuzeigen, ob jeder dieser 3 Varianten ein erhöhtes Risiko für Krebs wirklich zugeordnet sind.
Genetische Polymorphismen in 85 DNA-Reparatur-Gene Und Blase-Krebs-Risiko
Mehrere Abwehrmechanismen wurden entwickelt und während der Entwicklung zum Schutz der menschlicher Zellen vor Schäden aus exogene oder endogene Quellen beibehalten. Wir untersucht die Zusammenhänge zwischen Blasenkrebs und ein Gremium von 652 Polymorphismen von 85 Genen, die in der Pflege der genetische Stabilität [base Excision Repair, Nucleotide Excision Repair, Doppel-Strang Pause Reparatur (DSBR) und Fehlanpassung Reparatur, sowie DNA-Synthese und Zellzyklus-Verordnung-Bahnen] in 201 Vorfall Blase Krebserkrankungen und 326 Krankenhaus-Steuerelementen. Ergebnis Statistik wurden verwendet, um Unterschiede im Haplotype Frequenzen zwischen Fällen und Kontrollen in eine bedingungslose logistischen Regressionsmodell zu testen. Um mehrere Tests berücksichtigen, die wir mit jedem P-Wert den erwarteten Anteil falscher Entdeckungen (Q-Wert). Haplotype Analyse ergab bedeutende Vereinigungen (P < 0,01) zwischen Blasenkrebs und zwei Genen (POLB und FANCA) mit einem dazugehörigen Q-Wert von 24 %. Eine Permutationstest wurde auch verwendet, um festzustellen, ob in jedem Weg analysiert, gibt es weitere Varianten, deren Allele Frequenzen unterscheiden sich zwischen Fällen und Kontrollen im Vergleich zu dem, was man durch Zufall erwarten würde. Für Zellzyklusregulation wurden Unterschiede gefunden (P = 0,02) und in geringerem Maße für DSBR (P = 0,05) Wege. Diese Ergebnisse-Hinweis auf ein paar mögliche Kandidatengene; jedoch unsere Studie wurde durch die geringen Stichprobenumfangs begrenzt und daher geringe statistische macht, Assoziationen zu erkennen. Es wird erwartet, dass Genome-Wide Association Studies neue Perspektiven für die Interpretation der Ergebnisse der umfangreichen Kandidat gen Studien wie die unsrige öffnet.
Interleukin-2 Vor Der Antiretroviralen Therapie Bei Patienten Mit HIV-Infektion: Eine Randomisierte Studie (ANRS 119)
Interleukin (IL)-2 erhöht T CD4-Zellzahlen in Kombination mit einer antiretroviralen Therapie (ART). Ob Il allein CD4 erhöhen kann, zählt der Zelle, ist unbekannt.
CXCR4 Ausdruck Bei Brustkrebs Im Frühstadium Und Gefahr Der Fernen Wiederholung
Chemokin-Rezeptor 4 (CXCR4) ist demonstriert worden, eine entscheidende Rolle in der frühen metastasierendem Prozess zu haben. Ziel dieser Studie war den prognostischen Wert des CXCR4-Ausdrucks in primären Brusttumoren zu bewerten und beschreiben Korrelationen mit dem Auftreten von Metastasen in Organen, die Ausdruck des CXCR4 Ligand stromal Cell-derived Faktors 1 (d.h., Leber, Lunge, Gehirn und Knochen).
Auswirkungen Auf Die Gesundheitsbezogene Lebensqualität Von Einem Wechsel Von Enfuvirtid Zu Raltegravir Bei Multiresistenten HIV-1-infizierten Patienten: Eine Randomisierte Open-Label-Studie (einfacher-ANRS 138)
unter multiresistenten HIV-1-infizierten Patienten Enfuvirtid hat nachhaltige Wirksamkeit gezeigt, aber langfristige Nutzung ist unbequem wegen zweimal täglich subkutane Injektionen, die oft-Injektionsstelle Reaktionen auslösen. Wir wurde untersucht, ob ein Wechsel von Enfuvirtid zu Raltegravir, einem oral verfügbaren HIV-Integrase-Hemmer, gesundheitsbezogene Lebensqualität (HRQoL) verbessern kann.
Aufstrebenden Integrase-Inhibitor Resistenz Mutationen Im Raltegravir Behandelten HIV-1-infizierten Patienten Mit Low-Level Virämie
Die Entstehung der Integrase Strang-Transfer-Inhibitor (INSTI) Widerstand-assoziierten Mutationen wurde nach der Umstellung von Enfuvirtid zu Raltegravir in der ANRS-138-einfacher-Studie bei Patienten mit niedriger Virämie untersucht.
Mikroskopische Magnet-Resonanz-Elastographie Schädel-Hirn-Verletzungen-Modells
Schädel-Hirn-Verletzungen (TBI) ist eine der Hauptursachen für Tod und Invalidität, für den gibt es keine Heilung. Eines der Themen, die Hemmung der klinischen Studie Erfolg ist die mangelnde Ausrichtung auf bestimmte Patientengruppen aufgrund von Inkonsistenzen zwischen klinischen Diagnose-Tools und zugrunde liegende Pathophysiologie. Die Entwicklung von zuverlässigen, nicht-invasive Marker der TBI Schweregrad und Verletzungen Mechanismen kann diese Populationen, und verbessert damit die klinische Studiendesign besser identifizieren. Magnetresonanz-Elastographie (MRE), kann durch die Beurteilung der mechanischen Eigenschaften der Gewebe, potenziell solche Markierung bereitstellen. MRE synchronisiert mechanische Anregungen mit einem Phasenkontrast imaging Pulsfolge Bauteilqualität Scherung Wellenausbreitung, Registrieren von denen lokale Werte der Gewebe viskoelastische Eigenschaften abgeleitet werden können. Die Arbeitshypothese dieser Studie ist, dass TBI eine Kompression des Hirngewebes, die groß genug sind, bringen das Material aus seiner elastischen Bereichs umfasst mechanische Eigenschaften zum Generieren von Kontrast auf MRE-Messungen ausreichend zu verändern. Um diese Hypothese zu testen, haben wir mikroskopische MRE mit Hirngewebe zusammengestellt von Erwachsenen männlichen Ratten ausgesetzt auf kontrollierte kortikale Auswirkungen Verletzungen kombiniert. Die Messungen wurden in verschiedenen Regionen von Interesse (somatosensorischen Kortex, Hippocampus und Thalamus) und zu verschiedenen Zeitpunkten nach die Verletzung (sofort, 24 Stunden, 7 Tage, 28 Tage). Werte der Steifigkeit im somatosensorischen Kortex fanden sich in der Geschädigten Hemisphäre als in der gesunden, 23-32 % niedriger sein, wenn kein signifikanter Unterschied bei Schein Gehirn beobachtet wurde. Ein in-vivo Vorversuch ist auch vorgestellt, sowie Alternativen, die Treue der Steifigkeit Erholung zu verbessern.
