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- Monitoraggio Dinamica di attecchimento muscolare nei piccoli animali da In Vivo Fluorescente Imaging
Other Publications (19)
- Ying Yong Sheng Tai Xue Bao = The Journal of Applied Ecology / Zhongguo Sheng Tai Xue Xue Hui, Zhongguo Ke Xue Yuan Shenyang Ying Yong Sheng Tai Yan Jiu Suo Zhu Ban
- IEEE Transactions on Image Processing : a Publication of the IEEE Signal Processing Society
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- European Journal of Cancer (Oxford, England : 1990)
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- The Annals of Thoracic Surgery
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Articles by Xiaoyin Xu in JoVE
Monitoraggio Dinamica di attecchimento muscolare nei piccoli animali da In Vivo Fluorescente Imaging
Zhong Yang1, Qing Zeng2, Zhiyuan Ma1, Yaming Wang1, Xiaoyin Xu2
1Department of Anesthesia, Brigham and Woman's Hospital, 2Department of Radiology, Brigham and Woman's Hospital
Ci descrivono un
Other articles by Xiaoyin Xu on PubMed
[Tolleranza Termica, Diel Variazione Della Temperatura Corporea E Termica Dipendenza Delle Prestazioni Dell'apparato Locomotore Del Cucciolo Soft-sgusciate Tartarughe, Trionyx Sinensis]
Ying Yong Sheng Tai Xue Bao = The Journal of Applied Ecology / Zhongguo Sheng Tai Xue Xue Hui, Zhongguo Ke Xue Yuan Shenyang Ying Yong Sheng Tai Yan Jiu Suo Zhu Ban. Sep, 2002 | Pubmed ID: 12561184
La tolleranza termica, la temperatura corporea e l'influenza della temperatura sulle prestazioni dell'apparato locomotore del cucciolo Soft-sgusciate tartarughe (Trionyx sinensis) sono stati studiati in condizioni di asciutte e bagnate, e la temperatura del corpo selezionato di hatchlings era 28,0 e 30,3 gradi C, rispettivamente. In condizioni di bagnato, il critico termica massima e minima media 40,9 e 7,8 gradi C, rispettivamente. In ambienti senza gradienti termici, diel variazione della temperatura corporea è stata molto coerenza con la variazione delle temperature dell'aria e l'acqua e la temperatura del corpo più direttamente è stata influenzata dalla temperatura dell'acqua che dalla temperatura dell'aria, il che implicava che la termoregolazione fisiologica del cucciolo T. sinensis è stato molto debole. Negli ambienti con gradienti termici, le tartarughe cucciolo potrebbero mantenere temperature relativamente elevata e costante del corpo, principalmente attraverso la termoregolazione comportamentale. Le prestazioni dell'apparato locomotore dei turtles schiusa era altamente dipende dalla loro temperatura corporea. All'interno di un determinato intervallo, le prestazioni dell'apparato locomotore è aumentato con l'aumento della temperatura corporea. Nel nostro studio, la temperatura corporea ottimale per le prestazioni dell'apparato locomotore era 31,5 gradi C, sotto il quale, la massima distanza continua in esecuzione, esecuzione di passi al minuto, e numero di fermate al minuto una media di 1,87 m, 4.92 m-1 e 6,2 times.min-1, rispettivamente. I valori corrispondenti a 33,0 gradi C una media di 1,30 m, 4,28 m-1 e 7,7 times.min-1, rispettivamente, che ha indicato che le prestazioni dell'apparato locomotore dei turtles schiusa erano ridotta a 33,0 gradi C. Pertanto, temperatura corporea estremamente elevata potrebbe avere un effetto negativo sulle prestazioni dell'apparato locomotore dei turtles schiusa.
Filtro Adattivo Ordine Di Rango Due Passaggi Per Rimuovere Il Rumore Di Impulso in Immagini Altamente Corrotti
IEEE Transactions on Image Processing : a Publication of the IEEE Signal Processing Society. Feb, 2004 | Pubmed ID: 15376944
In questo articolo, vi presentiamo un filtro adattivo ordine di rango due passaggi per rimuovere il rumore impulso in immagini altamente corrotti. Quando il rapporto di rumore è alto, filtri di ordine di rango, come ad esempio il filtro mediano possono produrre, ad esempio, risultati insoddisfacenti. Risultati migliori possono essere ottenuti applicando il filtro doppio, che noi chiamiamo due passaggi di filtraggio. Per migliorare ulteriormente le prestazioni, sviluppiamo un filtro adattivo ordine di rango due passaggi. Tra le passate di filtraggio, un processo adattivo è utilizzato per rilevare irregolarità nella distribuzione spaziale del rumore stimato impulso. Il processo adattivo quindi sostituisce selettivamente alcune pixel modificato dalla prima passata di filtraggio con valori osservati pixel originali. Questi pixel sono poi mantenuto invariato durante il filtraggio secondo. In combinazione, il processo adattivo e il secondo filtro eliminare più rumore di impulso e ripristinare alcuni pixel che sono erroneamente modificate filtrando prima. Come risultato finale, l'immagine ricostruita mantiene un elevato grado di fedeltà e ha una minore quantità di rumore. L'idea della trasformazione adattiva two-pass può essere applicato a molti filtri di ordine di rango, come ad esempio un filtro mediano ponderata centrale (CWMF), CWMF adattivo, filtro inferiore-medio-alto e filtro rango-ordine-media soft-decisione. Risultati da simulazioni al computer sono utilizzati per dimostrare le prestazioni di questo tipo di adattamento utilizzando un numero di filtri base ordine di rango.
Forza Repulsiva Basato Su Modello Serpente Del Segmento E Tenere Traccia Di Un Neurone Assoni in Pile Immagine Di Microscopia 3D
NeuroImage. Oct, 2006 | Pubmed ID: 16861006
I modelli di ramificazione di assoni e dendriti sono fondamentali proprietà strutturali che influenzano la connettività sinaptica degli assoni. Sebbene oggi immagini tridimensionali dei processi fluorescente contrassegnati possono essere ottenuti per studiare la ramificazione assonale, non esistono affidabili metodi di tracciatura singoli assoni. Questo documento descrive un modello di serpente forza repulsiva basato per segmentare e tenere traccia dei profili assonale in immagini 3D. Questo nuovo metodo segmenti tutti i profili assonali in un'immagine 2D e poi usi i risultati ottenuti da quell'immagine come informazione preventiva per aiutare segmento adiacente immagine 2D. In questo modo, la segmentazione si connette con successo assonale profili per centinaia di immagini in una pila di immagini 3D. Quindi essere estratti singoli assoni sulla base dei risultati di segmentazione. L'utilità e le prestazioni del metodo sono dimostrati usando 3D assonale immagini ottenute da topi transgenici che esprimono la proteina fluorescente.
Imaging Chimicamente Selettivo Di Strutture Cerebrali Con Microscopia Di Automobili
Optics Express. Sep, 2007 | Pubmed ID: 19547572
Noi di dimostrare l'uso di coerente microscopia anti-Stokes Raman scattering (auto) alla struttura del cervello di immagine e patologia ex vivo. Sebbene non invasiva clinical brain imaging con CT, MRI e PET ha trasformato la diagnosi di malattia neurologica, definitiva distinzione preoperatoria di patologie benigne e neoplastiche rimane sfuggente. La diagnosi definitiva richiede ancora la biopsia del cervello in un numero significativo di casi. Microscopia di automobili, una tecnica non lineare, vibrazionalmente-sensibili, è in grado di chimicamente selettivo imaging tridimensionale ad alta sensibilità senza etichettatura di agenti esogeni. Come MRI, automobili possono essere adattate per fornire una vasta gamma di tessuti possibili contrasti, ma con risoluzione spaziale subcellulare e vicino a tempo reale risoluzione temporale. Questi attributi fare automobili una tecnica ideale per veloce, minimamente invasiva, non distruttiva, molecolarmente specifica intraoperatoria ottica diagnosi di lesioni cerebrali. Questo promette benefici clinici significativi ai pazienti neurochirurgici fornendo diagnosi definitiva di neoplasia prima della biopsia o resezione. AUTOMOBILI di imaging possono aumentare l'accuratezza diagnostica di istopatologia tradizionale sezione congelata nella biopsia dell'ago e definire dinamicamente i margini di resezione del tumore durante l'intervento chirurgico al cervello. Questa relazione dimostra la fattibilità di in vivo istologia vibrazionale automobili come strumento clinico per la diagnosi neuropatologiche dimostrando l'uso della microscopia automobili nell'individuare strutture cerebrali normali e glioma primario nel tessuto cerebrale freschi non fissati e non colorati ex vivo.
Mediante Diffusione Non Lineare E Media Shift Per Rilevare E Connettere Le Sezioni Trasversali Degli Assoni in Immagini Di Microscopia Ottica 3D
Medical Image Analysis. Dec, 2008 | Pubmed ID: 18440853
La morfologia degli assoni neuronali è stato attivamente studiata dai ricercatori per capire le funzionalità delle reti neuronali, per esempio, in neurologia dello sviluppo. Microscopio ottico e tecniche di etichettatura di oggi ci permettono di ottenere immagini ad alta risoluzione su assoni in tre dimensioni (3D), tuttavia, rimane impegnativo per segmentare e ricostruire la morfologia 3D degli assoni. Questi includono differenziando assoni adiacenti e rilevare i rami assone. In questo articolo presentiamo un metodo per tenere traccia di assoni in 3D identificando le sezioni trasversali degli assoni su immagini 2D e le sezioni trasversali di collegamento sopra una serie di immagini 2D per ricostruire la morfologia 3D. Il metodo può separare assoni adiacenti e rilevare gli split e merge degli assoni. Il metodo consiste di tre fasi, diffusione non lineare modificato per rimuovere il rumore e migliorare i bordi in 2D, operazioni morfologiche per rilevare i bordi delle sezioni trasversali degli assoni in 2D e significa MAIUSC per rintracciare le sezioni trasversali degli assoni in 3D. Le prestazioni del metodo sono dimostrata da dati reali acquisiti da laser confocale microscopia a scansione di elaborazione.
Uno Studio Quantitativo Dei Fattori Che Influenzano La Formazione Immagine in Vivo Di Bioluminescenza
Luminescence : the Journal of Biological and Chemical Luminescence. Sep-Oct, 2008 | Pubmed ID: 18452141
Bioluminescenza in vivo imaging (BLI) ha i vantaggi di alta sensibilità e basso fondo. Contando il numero di fotoni emessi da un esemplare, BLI può quantificare eventi biologici come la crescita del tumore, espressione genica e la risposta di droga. L'intensità e la cinetica del segnale BL sono influenzati da molti fattori e possono confondere i risultati quantitativi acquistati da diversi campioni o sessioni consecutive di imaging. Abbiamo utilizzato tre diversi modelli murini di tumori per esaminare se anestetici, crescita tumorale e di posizionamento può influenzare la consistenza del segnale BL. I risultati hanno mostrato che segnale BLI potrebbe essere compromessa da diversi anestetici e posizionamento ripetitivo. Utilizzando la stessa anestesia prodotto momenti di picco coerente, mentre altri fattori sono stati mantenuti costanti. Tuttavia, come i tumori è cresciuto i tempi di picco spostati e il decorso dei segnali BL aveva forme diverse, a seconda del posizionamento dei topi. I dati indicano che un esperimento progettato con cura BLI è necessario per generare risultati ottimali e costanti.
Ricostruzione 3D Robusto E Identificazione Delle Spine Dendritiche Da Imaging Microscopia Ottica
Medical Image Analysis. Feb, 2009 | Pubmed ID: 18819835
In neurobiologia, la ricostruzione 3D dei neuroni seguita dall'identificazione delle spine dendritiche è essenziale per lo studio della morfologia neuronale, funzione e proprietà biofisiche. La maggior parte dei metodi esistenti soffrono di problemi di scarsa affidabilità, scarsa precisione e richiedono molta interazione con l'utente. In questo articolo, vi presentiamo un metodo per ricostruire dendriti utilizzando una rappresentazione superficiale del neurone. Lo scheletro di dendrite è estratta da una procedura basata sulla funzione geodetica mediale che è robusto e topologia preservare, e viene utilizzato per identificare con precisione le spine. La sensibilità dell'algoritmo su vari parametri è esplorata in dettaglio e il metodo è indicato per essere robusto.
L'inibizione Selettiva Di JNK Con Un Inibitore Peptide Attenua Dolore Ipersensibilità E Crescita Tumorale in Un Modello Del Mouse Skin Cancer Pain
Experimental Neurology. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19445931
Dolore da cancro influenza significativamente la qualità dei malati di cancro, e gli attuali trattamenti per questo dolore sono limitati. C-Jun N-terminal chinasi (JNK) è stata implicata nella crescita tumorale e sensibilizzazione di dolore neuropatico. Abbiamo studiato il ruolo di JNK in cancer pain e la crescita tumorale in un modello di dolore del cancro della pelle. Iniezione di melanoma B16-Fluc luciferase transfected le cellule in un hindpaw di topo indotta da tumore robusta crescita, come indicato dall'aumento dell'intensità di fluorescenza e volume zampa. Ipersensibilità di dolore in questo modello si è sviluppato velocemente (< 5 giorni) e ha raggiunto un picco in 2 settimane e fu caratterizzata da iperalgesia meccanica allodinia e calore. Crescita del tumore è stata associata con attivazione JNK nel ganglio di tumore massa radice dorsale (DRG) e del midollo spinale e una neuropatia periferica, ad esempio perdita di fibre nervose della pelle hindpaw e induzione dell'espressione di ATF-3 nei neuroni DRG. Ripetute iniezioni sistemiche di D-JNKI-1 (6 mg/kg, i.p.), un inibitore del peptide cellula permeabile e selettiva di JNK, prodotto un'inibizione accumulativo di iperalgesia meccanica allodinia e calore. Un'iniezione spinale bolo di D-JNKI-1 inibisce anche l'allodinia meccanica. Ulteriormente, inibizione di JNK soppressa la crescita tumorale in vivo e in vitro la proliferazione cellulare melanoma. Al contrario, ripetute iniezioni di morfina (5 mg/kg), un analgesico comunemente usato per il cancro terminale, prodotto analgesico tolleranza dopo 1 giorno e non inibire la crescita tumorale. I nostri dati rivelano una marcata neuropatia periferica in questo modello di cancro della pelle e ruoli importanti del pathway JNK nel cancro dolore lo sviluppo e la crescita tumorale. Inibitori JNK come D-JNKI-1 possono essere usati per trattare il dolore da cancro.
Imaging Di Bioluminescenza Rivela L'inibizione Della Proliferazione Delle Cellule Tumorali Di Proteina Beta Amiloide Morbo Di Alzheimer
Cancer Cell International. 2009 | Pubmed ID: 19480719
Cancro e il morbo di Alzheimer (AD) sono due malattie apparentemente distinte e raramente si verificano simultaneamente nei pazienti. Per esplorare i determinanti molecolari differenziando patogeni rotte verso annuncio o il cancro, si indaga il ruolo della proteina beta amiloide (Abeta) su più linee di cellule tumorali che esprimono stabilmente luciferase (glioblastoma umano U87; umano MDA-MB231; adenocarcinoma della mammella e melanoma B16F il mouse).
Progettazione, Sintesi E Test Di Difluoroboron-derivatizzata Curcumine Come Sonde Vicino Infrarosso Per La Rilevazione in Vivo Di Depositi Di Amiloide-beta
Journal of the American Chemical Society. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19807070
Depositi di beta-amiloide (Abeta) sono stati identificati come attori chiave nella progressione della malattia di Alzheimer (AD). Recenti evidenze indicano che i depositi probabilmente precedono e inducono atrofia neuronale. Pertanto, metodi che consentono il monitoraggio della patologia, prima che i sintomi clinici sono osservati sarebbe utile per la diagnosi precoce di annuncio. Riportiamo la progettazione, sintesi e la sperimentazione di curcumina derivatizzata vicino infrarosso (NIR) sonda, CRANAD-2. All'interazione con aggregati di Abeta, CRANAD-2 subisce una serie di cambiamenti, che includono un 70-fold aumento di intensità di fluorescenza, un 90 nm blue shift (da 805 a 715 nm) e un grande aumento nel rendimento quantico. Inoltre, questa sonda Mostra anche un'elevata affinità per gli aggregati di Abeta (K(d) = 38,0 nM), un valore ragionevole log P (log P = 3), una notevole stabilità nel siero e un'interazione debole con albumina. Dopo iniezione endovenosa di questa sonda, topi Tg2576 19-mese-vecchio esposto segnale relativo significativamente più alta rispetto a quella dei topi di controllo rispetto allo stesso periodo di tempo. In sintesi, CRANAD-2 soddisfa tutti i requisiti per un agente di contrasto NIR per la rilevazione di Abeta targhe sia in vitro che in vivo. I nostri dati punto verso la possibilità di monitorare lo stato di avanzamento della malattia da imaging NIR con CRANAD-2. Inoltre, noi crediamo che la nostra sonda potrebbe essere potenzialmente utilizzato come strumento per lo screening di stupefacenti.
Imaging in Vivo Di Fluorescenza Di Rigenerazione Delle Cellule Muscolari Da Trapiantato Con Etichetta EGFP Myoblasts
Molecular Therapy : the Journal of the American Society of Gene Therapy. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20125125
Fluorescenza in vivo imaging (FLI) consente il monitoraggio della proteina fluorescente (FP)-etichettati in modo non invasivo le cellule e le proteine negli organismi viventi. Qui, abbiamo esaminato se questa modalità potrebbe raggiungere una sensibilità sufficiente a consentire la valutazione del processo di rigenerazione della proteina fluorescente verde migliorato (eGFP)-etichettati precursori muscolari (myoblasts). Utilizzando una stazione base di FLI, siamo stati in grado di rilevare i segnali chiari fluorescenza generate da 40.000 cellule etichette iniettate in un muscolo (TA) di tibiale anteriore del mouse. Abbiamo osservato che il segnale è diminuito di circa il 25% sulle 48 ore dall'iniezione cellulare seguita da una ripresa a partire il secondo giorno e ha raggiunto un picco di circa il 45% del segnale originale entro il settimo giorno, suggerendo che la popolazione è sopravvissuta subì una tiratura limitata di proliferazione prima differenziazione. Per valutare se trapiantato myoblasts potrebbe formare le cellule satellite, abbiamo ferito i muscoli trapiantati ripetutamente con cardiotoxin. Abbiamo osservato una ripresa del segnale di fluorescenza dopo una scomparsa del segnale dopo ogni iniezione di cardiotoxin. Risultati istologici hanno mostrato derivato da donatore cellule situate sotto la membrana basale ed esprimendo Pax7, confermando che la rigenerazione osservata da imaging fu infatti mediata da cellule satellite derivato da donatore. I nostri risultati mostrano che il FLI è un potente strumento che può estendere la nostra capacità di svelare complessi processi biologici come la rigenerazione delle cellule staminali-mediata.
Trattamento Del Cancro Al Seno Triplo-negativi Da Una Combinazione Di Rapamicina E Ciclofosfamide: Una Bioluminescenza in Vivo Imaging Studio
European Journal of Cancer (Oxford, England : 1990). Apr, 2010 | Pubmed ID: 20156674
Rapamicina, un obiettivo mammifero del rapamycin (mTOR) inibitore, ha dimostrato di inibire la crescita del tumore al seno positivo degli estrogeni. Tuttavia, il cancro al seno (TN) triplo-negativo è resistente al trattamento rapamicina in vitro. Mettiamo alla prova un trattamento di combinazione della rapamicina con agente di danno al DNA, ciclofosfamide, in un modello di cancro al seno TN. Associando a e perturbano il DNA cellulare, ciclofosfamide uccide le cellule via interferendo con le loro normali funzioni. Abbiamo valutato le risposte di topi nudi cuscinetto xenotrapianti di tumore delle cellule TN MDA-MB-231 alla combinazione di rapamicina e ciclofosfamide in entrambi ortotopico mammario e metastasi polmonari modelli. Abbiamo monitorato crescita del tumore e metastasi da imaging bioluminescenti esaminato l'espressione di Ki67, CD34 e HIF-1alpha nei tessuti tumorali mediante immunoistochimica e apoptosi indice con saggio TUNEL e trovato che le cellule MDA-MB-231 sono sensibili alla terapia rapamycin ortotopico mammaria, ma non nel polmone con metastasi. Rapamicina quando combinato con ciclofosfamide è trovato per avere un effetto più significativo nel ridurre il volume tumorale e le metastasi con un tasso di sopravvivenza migliorata molto. I nostri dati mostrano anche che la sensibilità dei tumori TN a rapamicina è associata con il microambiente delle cellule del tumore. I dati indicano che in un ambiente relativamente ipossico HIF-1alpha può giocare un ruolo nel mediare l'effetto anti-cancro di rapamicina e ciclofosfamide può impedire l'attivazione di feedback di Akt da rapamicina. Nel complesso i nostri risultati mostrano che rapamicina plus ciclofosfamide può raggiungere un'efficacia migliorata nel sopprimere la crescita tumorale e le metastasi, suggerendo che la terapia di combinazione può essere un promettente opzione di trattamento per il cancro di TN.
Analisi Fenotipica Di Immagini Di Zebrafish Trattati Con Inibitori Della Gamma-secretasi Di Morbo Di Alzheimer
BMC Biotechnology. 2010 | Pubmed ID: 20307292
Diversi inibitori della gamma-secretasi (GSI) sono in studi clinici per il trattamento della malattia di Alzheimer (AD). Questo enzima da intermediario il clivaggio proteolitico della proteina precursore dell'amiloide (APP) per generare la proteina beta amiloide, Abeta, la proteina patogena nell'annuncio. La gamma-secretasi fende anche tacca per generare il dominio intracellulare di Notch (NICD), la molecola di segnalazione che è implicata nella tumorigenesi.
Manifestazione in Vivo Della Tacca Relativi Fenotipi in Zebrafish Trattati Con Amiloide Alzheimer Riducendo Inibitori Della Gamma-secretasi
Journal of Neurochemistry. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20345767
Gamma-secretasi sono responsabile per la definitiva scissione della proteina precursore dell'amiloide a generare la proteina beta-amiloide, la componente principale delle placche nel cervello dei pazienti con malattia di Alzheimer. inibitori della gamma-secretasi (GSI) sono stati esplorati per inibizione terapeutica della generazione della proteina beta amiloide, ma tossicità meccanicistica è stata documentata a causa del suo blocco della gamma-secretasi scissione di diverse decine di substrati, tra cui la tacca. Questo diventa l'ostacolo principale per la maggior parte gli inibitori durante lo sviluppo pre-clinico e la preoccupazione principale per diversi composti in cliniche. Per prevedere i potenziali effetti collaterali legati alla tacca di segnalazione, abbiamo esaminato l'effetto globale di GSIs nello zebrafish animali vertebrati. Abbiamo usato due potenti GSIs (GSI A e GSI 18) con una concentrazione efficace di sub-microM per inibizione di proteina beta amiloide di 50% (EC(50)). Embrioni di zebrafish sono stati trattati con GSI A 18 o un ben caratterizzati GSI N-[N-(3,5-difluorophenacetyl-L-alanyl)]-S-phenylglycine t-butile (DAPT), e gli animali trasparenti sono stati esaminati per fino a 7 giorni. GSI A aveva meno anormale fenotipo in zebrafish, rispetto agli embrioni GSI 18-trattati che visualizzato coda ricurva, una perdita di pigmentazione e ridotto la vescica natatoria e frequenza cardiaca. Per capire l'effetto meccanicistico a livello molecolare, abbiamo esaminato Notch signaling in questi zebrafish GSI-trattati. Fenotipi tacca sono stati osservati negli embrioni trattati con 50 e 10 microM GSI 18, ma non con 10 microM GSI A. Secondo, l'ibridazione in situ con una sonda contro tacca destinazione gene her6 ha mostrato una debole colorazione negli embrioni trattati con 10 microM GSI 18 rispetto a quelli trattati con 10 microM GSI A. In conclusione, profilo fenotipico in tutto animali offre importanti informazioni sulla tacca relativi percorsi e fornisce la previsione di sicuri composti durante le prime fasi di sviluppo di GSIs terapeutico.
Un Metodo Di Analisi Di Alto-rendimento Per Rilevare Le Regioni Di Interesse E Quantificare Immagini Embrione Di Zebrafish
Journal of Biomolecular Screening. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20930217
Zebrafish è ampiamente utilizzato per comprendere lo sviluppo neurale e varie malattie neurodegenerative del modello. Embrioni di zebrafish sono otticamente trasparenti, hanno un periodo di sviluppo brevi e possono essere mantenuti vivi in piastre microtiter per giorni, che li rende suscettibili a microscopici imaging ad alta velocità. A seguito di esperimenti ad alta velocità, un gran numero di immagini può essere generato in un singolo esperimento, presentano una sfida per i ricercatori ad analizzarli in modo efficiente e quantitativamente. In questo lavoro, possiamo sviluppare un'elaborazione immagine incentrata sulla individuazione e quantificazione dei pigmenti in embrioni di zebrafish. L'algoritmo rileva automaticamente una regione di interesse (ROI) che racchiude un'area intorno i pigmenti e quindi i pigmenti per la quantificazione del segmento. In questo processo, l'algoritmo identifica la testa e il torso in un primo momento e poi scopre i limiti corrispondenti alla schiena e addome sfruttando a priori informazioni sull'anatomia degli embrioni di zebrafish. Il metodo è robusto in termini che in grado di rilevare e quantificare i pigmenti anche quando gli embrioni sono diversi orientamenti e curvature. Abbiamo utilizzato i dati reali per dimostrare le prestazioni del metodo per estrarre informazioni fenotipiche da immagini di embrione di zebrafish e confrontato i risultati con analisi manuale per la verifica.
C Terminale Di Clostridium Perfringens Enterotossina Sottoregola CLDN4 E Sensibilizza Le Cellule Di Cancro Ovarico Di Taxolo E Carboplatino
Clinical Cancer Research : an Official Journal of the American Association for Cancer Research. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21123456
Abbiamo precedentemente dimostrato che CLDN4 (codifica claudin-4), una proteina di cella stretta giunzione (TJ), altamente è espressa in umani carcinomi ovarici epiteliali (EOC) ma non rilevabili nelle ovaie normali. CLDN4 è stato identificato come un recettore specifico per C terminale di Clostridium perfringens enterotossina (C-CPE), una molecola non tossico che possa interferire con la funzione di barriera TJ e migliorare l'assorbimento cellulare. Lo scopo di questo studio era di determinare le potenziali applicazioni cliniche di C-CPE e dei suoi effetti sull'espressione di CLDN4 in EDC.
Automatizzato Di Analisi Di Immagini Di Zebrafish Per Cambiamenti Fenotipici Nella Scoperta Della Droga
Journal of Neuroscience Methods. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21767568
Zebrafish è diventata uno dei modelli più popolari e più utili nella biologia cellulare, di sviluppo e di scoperta della droga. Perché l'embrione di zebrafish è trasparente e può essere osservato sotto un microscopio senza fissazione, è sempre più utilizzato in high-throughput screening. Le piccole dimensioni di zebrafish embrioni consente agli utenti di immagine li in una piastra a 96 o 384 pozzetti in varie condizioni, a sua volta, genera una grande quantità di immagini che solo l'analisi automatizzata è fattibile per l'elaborazione e l'analisi. Ci concentriamo sullo sviluppo di un algoritmo di elaborazione immagine per quantificare automaticamente espressione genica su embrioni di zebrafish che sono stati trattati da vari composti. La sfida in questo tipo di applicazione include allineando gli embrioni di diversi orientamenti e creazione automatica di regioni di interesse (ROI) per racchiudere aree specifiche della testa e il busto di embrioni. La pipeline di elaborazione immagine consiste di allineamento, segmentazione, creazione e quantificazione di ROIs. Testiamo l'algoritmo utilizzando immagini high-throughput di zebrafish embrioni ottenuti da un esperimento lo screening di composti che possono influenzare il γ-secretasi nella malattia di Alzheimer e i risultati mostrano che analisi automatizzata possono ottenere prestazioni soddisfacenti in una molto più breve lasso di tempo, con un alto livello di obiettività.
Paclitaxel-caricato Le Nanoparticelle Espansibili in Un Modello Di Trattamento Multimodale Del Mesotelioma Maligno
The Annals of Thoracic Surgery. Dec, 2011 | Pubmed ID: 21963198
Mesotelioma maligno ha una prognosi infausta, anche quando trattata aggressivamente con terapia multimodale. Tumore murino tradizionali modelli possono essere usati per valutare l'efficacia del farmaco e tossicità nel mesotelioma maligno, ma non per valutare l'effetto di un approccio multimodale che include la resezione chirurgica del tumore. Abbiamo quindi sviluppato un modello murino di terapia multimodale in cui abbiamo valutato paclitaxel-caricato espansibili nanoparticelle (Pax-PEV) per la consegna di chemioterapia endocavitaria nel mesotelioma maligno.
Glioblastoma-derivato Di Fattore Di Crescita Epidermico Recettore Delezione Terminale Carbossilico Mutanti Stanno Trasformando E Sono Sensibili Alle Terapie EGFR-diretto
Cancer Research. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22001862
Alterazioni genomiche del gene epidermal growth factor receptor (EGFR) giocano un ruolo cruciale nella patogenesi di glioblastoma multiforme (GBM). Da un'analisi sistematica dei dati genomic GBM, abbiamo identificato e caratterizzato una mutazione di omissione 27 romanzo esone che si verificano all'interno del dominio carbossi-terminale EGFR (CTD), oltre a identificare ulteriori esempi di mutazioni di delezione precedentemente segnalati in questa regione. Mostriamo che i mutanti di delezione derivato da GBM EGFR CTD sono in grado di indurre la trasformazione cellulare in vitro e in vivo in assenza di ligando e recettore autophosphorylation. Il trattamento con l'anticorpo monoclonale mirato di EGFR, cetuximab o l'inibitore di piccola molecola EGFR, erlotinib, alterato in modo efficace tumorigenicity di mutanti di delezione oncogeni EGFR CTD. Cetuximab in particolare prolungato la sopravvivenza dei topi intracranially xenografted con mutanti di delezione oncogeni EGFR CTD, rispetto ai topi di controllo non trattato. Pertanto, noi proponiamo che erlotinib e, soprattutto, cetuximab trattamento può essere una strategia terapeutica promettente in pazienti GBM harboring mutanti di delezione di EGFR CTD.
