Relaciones Filogenéticas De Combretoideae (Combretaceae) Deducido De Plasto, Gene Nuclear Y Secuencias Del Espaciador

Journal of Plant Research. Dec, 2002  |  Pubmed ID: 12579451

Relaciones filogenéticas de la subfamilia Combretoideae (Combretaceae) estudiaron basan en secuencias de ADN de las regiones de espaciador transcrito interno ribosomal nuclear (ITS), el gen de Plasto rbcL y el espaciador intergénico entre los genes PaaS y ycf3 (PY-IGS), incluyendo 16 especies de ocho géneros dentro de dos tribus tradicionales de Combretoideae y dos especies de la subfamilia Strephonematoideae de Combretaceae como grupos externos. Árboles filogenéticos basados en los tres conjuntos de datos (ITS, rbcL y PY-IGS) se obtuvieron mediante máxima parsimonia (MP) y análisis de máxima verosimilitud (ML). Partición de homogeneidad pruebas indicaron que los tres conjuntos de datos y el conjunto combinado de datos son homogéneos. Los árboles filogenéticos combinados, todos los taxones ingroup se dividen en dos clados principales, que corresponden a las dos tribus Laguncularieae y Combreteae. En el clade de Laguncularieae, se muestran dos géneros de mangle, Lumnitzera y Laguncularia, hermana taxa. En la tribu Combreteae, pueden clasificarse dos clados principales: uno incluye tres géneros Quisqualis, Combretumand Calycopteris, dentro del cual la monophyly de la tribu Combreteae sensu Engler y Diels Quisqualis y Combretumis fuertemente apoyado y este monophyly es entonces hermana al género monotípico Calycopteris; otro grupo importante incluye tres géneros Anogeissus, Terminalia y Conocarpus. No hay soporte para el monophyly de Terminaliaas es un polytomy con Anogeissus. Este clado es hermana de Conocarpus.

Una Estrategia Para La Síntesis De Aril Alfa-ketoamides Se Basa En La Acilación De Aniones Derivados De Cyanomethylamines Seguido Por Rotura Oxidativa

Organic Letters. Apr, 2002  |  Pubmed ID: 11922793

[reacción: ver texto] Cyanomethylamines, preparados por alquilación de aminas con chloroacetonitrile, fueron deprotonated en NaHDMS THF, reaccionó con ésteres de heteroaryl o substitutedphenyl y entonces oxidado mediante la adición de Clorox(TM) para poder pagar aril alfa-ketoamides en una sola operación en buenos rendimientos totales.

Un Método General Para La Preparación De 4 - Y 6-azaindoles

The Journal of Organic Chemistry. Apr, 2002  |  Pubmed ID: 11925251

Nitropyridines reaccionó con un exceso de vinilo reactivo de Grignard para producir 4 - o 6-azaindoles. Mejores rendimientos se obtuvieron cuando un átomo de halógeno estuvo presente en el alpha de posición al átomo del nitrógeno en el anillo de piridina.

Composición Del Aceite Volátil De Primula Obconica En China Central

Natural Product Letters. Aug, 2002  |  Pubmed ID: 12168760

Primula obconica fue introducida en Europa de Hubei, China en 1880 y se ha cultivado en todo el mundo como una de las plantas ornamentales populares. El aceite volátil de salvaje p. obconica recogido de su lugar original, Yichang, Hubei primero fue investigado. Se identificaron un total de 43 compuestos constituyendo 93.49% del petróleo mediante el uso de GC y GC-MS. Los principales compuestos fueron benzoato de metilo 2, 4-dihidroxi-5-metil (30.41%), benzoato de metilo 2,6-dihidroxi-4-metil (29,27%) y hypnone (8,92%) etc.. En comparación con los datos publicados de algunos cultivares europeos, el nativo p. obconica parece ser alérgenos debido a la ausencia de primin y miconidin.

Un Procedimiento Eficaz Para La Acilación De Azaindoles En C-3

The Journal of Organic Chemistry. Aug, 2002  |  Pubmed ID: 12182666

Se exploraron las condiciones para la fijación de cloruro de acetilo, cloruro de benzoilo y clorometil oxalato en la posición 3 de 4, 5, 6 o 7-azaindoles. Los mejores resultados se lograron con un exceso de AlCl(3) en CH(2)Cl(2), seguido por la adición de un cloruro de acilo a temperatura ambiente.

Duplicación Y Evolución Adaptativa De Los Genes De Chalcona Sintasa De Dendranthema (Asteraceae)

Molecular Biology and Evolution. Oct, 2002  |  Pubmed ID: 12270901

Chalcona sintetasa (CHS) es una enzima clave en la biosíntesis de los flavonoides, que son importantes para la pigmentación de las flores y actúan como atrayentes para los polinizadores. Genes que codifican CHS constituyen una familia de multigenes en que el número de copia varía entre especies de plantas y divergencia funcional parece haber ocurrido repetidas veces. Plantas del género Dendranthema tienen flores blancas, amarillas y rosadas, exhibiendo una considerable variación en el color de la flor. En este artículo, se secuenciaron 18 genes CHS de seis especies de Dendranthema. Dos de ellos resultaron para ser pseudogenes. Los genes funcionales de Dendranthema CHS forman tres subfamilias bien soportados: SF1, SF2 y SF3. La filogenia inferida de los genes CHS de Dendranthema y Gerbera sugiere que estos genes se originaron a consecuencia de duplicaciones antes de la divergencia de estos dos géneros, y la función de genes Dendranthema CHS se han apartado en una manera similar a los genes de Gerbera CHS; es decir, los genes del código SF1 y SF3 para enzimas CHS típicas expresada durante las diferentes etapas de desarrollo, mientras que los genes de SF2 código para otra enzima que es diferente de la CHS en reacción y especificidad de sustrato. Tasa relativa pruebas revelaron que los genes Dendranthema CHS desviaban significativamente de evolución clocklike en sitios nonsynonymous. Máxima verosimilitud análisis mostró que el nonsynonymous-sinónimo (omega = proporción de la tasa de d(N)/d(S)) para el linaje ancestral de SF2 era mucho mayor que para otros linajes, con algunos sitios con una relación muy por encima de uno. Presión positiva selectiva parece haber conducido la divergencia de SF2 de SF1 y SF3.

Propofol Reduce La Acumulación De Infarto Tamaño Y Estriado Dopamina Tras La Oclusión De La Arteria Cerebral Media Transitoria: Un Estudio De Microdiálisis

European Journal of Pharmacology. Oct, 2002  |  Pubmed ID: 12359271

Isquemia cerebral aguda se asocia a una acumulación creciente de la dopamina extracelular. Atenuación o prevención de la acumulación excesiva de la dopamina alivia el daño isquémico cerebral. Propofol, un anestésico, por vía intravenosa ha sugerido tener propiedades neuroprotectoras. Se desconoce el efecto del propofol en neurotransmisores dopaminérgicos. La técnica de microdiálisis in vivo se utilizó en este estudio para examinar el efecto del propofol en acumulación de infarto tamaño y estriado de dopamina en el modelo de la rata de oclusión de la arteria cerebral media temporal. Dieciséis de las ratas estaban equipadas con una sonda de microdiálisis estriada derecha. Isquemia fue inducida mediante la inserción de una sutura de nylon monofilamento de 4-0 en la arteria cerebral media. Propofol fue infundida por vía intravenosa en ocho ratas durante (60 min) de la isquemia y reperfusión (60 min) en una dosis promedio de 36 mg/kg/ratas de h. Control (n = 8) recibió infusión de vehículo. Se determinó el tamaño del infarto en el final del experimento. Propofol redujo significativamente el tamaño del infarto, el valor de la mediana (rango interquatile) era 6,84% (7,68%), significativamente menor que en el grupo control, que era 28,04% (32,28%) (p < 0.01). La oclusión de la arteria cerebral media aumentó significativamente la acumulación de la dopamina en el estriado. Infusión de propofol atenúa significativamente esta acumulación de dopamina inducida por oclusión de la arteria cerebral media. Los datos demuestran propofol, cuando se administra durante la isquemia y reperfusión, ofrece neuroprotección en nuestra oclusión de la arteria cerebral media en el modelo de la rata. Los datos también sugieren que la acumulación de dopamina atenuada puede ser uno de los factores que contribuyen a la propiedad de neuroprotector de propofol.

Diversidad Genética En Primula Obconica (Primulaceae) De China Central Y Suroeste, Según Lo Revelado Por Marcadores ISSR

Annals of Botany. Feb, 2003  |  Pubmed ID: 12547685

Diversidad genética fue investigado en 60 individuos de Primula obconica de cuatro poblaciones naturales (de Hubei, China central y Sichuan, suroeste de China) y de cultivado material. Secuencia Inter-simple repetir técnicas (ISSR) produjeron 249 bandas polimórficas e identificaron 60 genotipos ISSR. Basado en el índice de Shannon y diversidad genética de Nei, la diversidad genética detectada en todas las poblaciones naturales de P. obconica fue mucho mayor que en las plantas cultivadas, y que en las tres poblaciones de Dalaoling (Hubei) fue mayor que en la población de Wawushan (Sichuan). Análisis de conglomerados UPGMA demostraron que no había ninguna distinta diferenciación genética entre las poblaciones de la Mt Dalaoling Mt Wawushan/área. Este estudio proporciona un perfil genético de la población de p. obconica, que previamente era poco conocido pero que es importante para el cultivo y cría de Primula.

Congruencia Interpoblacional En Chino Primula Ovalifolia Revelada Por Marcadores Moleculares Y Químicos Usando Aceites Esenciales Y ISSRs

Zeitschrift Für Naturforschung. C, Journal of Biosciences. Jan-Feb, 2003  |  Pubmed ID: 12622227

Primero se analizaron la composición química de los aceites esenciales de cinco poblaciones naturales de p. ovalifolia de central y el sudoeste de China y su variabilidad interpoblacional usando GC-MS. veinte - dos se obtuvieron los compuestos de aceites esenciales, en que dieciocho fueron identificados y caracterizados que representan 95% - 96% de la composición del aceite. Tres quemotipos principales, es decir, la metil-acetil-hidroquinona-ricos, ricos en hidroquinona y acetil-hidroquinona-ricos quemotipos, luego fueron distinguidos, correspondientes a los tres grupos obtenidos en el análisis de agrupamiento basado en los porcentajes de composición del aceite esencial. Las variaciones genéticas entre las cinco poblaciones también fueron investigadas usando los marcadores Inter-Simple secuencia se repite (ISSR). Finalmente, la prueba de Mantel mostró que hubo una correlación significativa entre dos matrices de distancia partiendo de los compuestos químicos de aceites esenciales y marcadores ISSR, confirmando la congruencia de relaciones interpoblacional en la p. ovalifolia revelado por los marcadores moleculares y químicos

Composición Química De Los Aceites Esenciales De Dos Especies De Rhodiola Del Tíbet

Zeitschrift Für Naturforschung. C, Journal of Biosciences. Mar-Apr, 2003  |  Pubmed ID: 12710720

Los aceites esenciales de rizoma de Rhodiola crenulata y r. fastigiata en el Tíbet oriental se analizaron mediante el uso de GC-MS. Los componentes principales fueron el geraniol (53.3%), n-octanol (13,4%), 2-methyl-3-buten-2-ol (10,8%), citronellol (5,3%), 3-methyl-2-buten-1-ol (4,0%), myteol (3.0%) y linalool (2,4%) para r. crenulata y geraniol (45,3%), n-octanol (12,3%), 2-methyl-3-buten-2-ol (8,0%), linalool (5,1%), isogeraniol (4,5%), citronellol (4,4%) y cis-sabinenehydrate (3,6%) para r. fastigiata.

Análisis De Microarrays De CDNA De Perfiles De Expresión Génica En Células Humanas Fibroblastos Irradiados Con Luz Roja

The Journal of Investigative Dermatology. May, 2003  |  Pubmed ID: 12713592

En este trabajo se utilizó la técnica de microarrays de cDNA para investigar los perfiles de expresión génica de fibroblastos humanos irradiados por la luz roja de baja intensidad. Análisis de proliferación demostraron que las células de fibroblastos HS27 respondieron con un efecto de curva a diferentes dosis de irradiación de la luz roja de baja intensidad en una longitud de onda de 628 nm. Una dosis óptima de 0,88 J por cm2 fue elegida para experimentos de microarrays de cDNA posterior. Los perfiles de expresión génica revelaron que 111 genes fueron regulados por la irradiación de la luz roja y pueden agruparse en 10 categorías funcionales. La mayoría de estos genes directamente o indirectamente juega papeles en la mejora de la proliferación celular y la supresión de la apoptosis. Dos vías de señalización, la p38-PROTEINA QUINASA mitógeno activada señalización vía y la vía de señalización de factor de crecimiento derivado de plaquetas, resultaron para ser involucrados en la proliferación celular inducida por irradiación de la luz roja de baja intensidad. También se encontraron varios genes relacionados con el metabolismo de energía antioxidación y las mitocondrias para expresar diferencialmente a irradiación. Este estudio proporciona información sobre los mecanismos moleculares asociados a los efectos beneficiosos de la irradiación de la luz roja para acelerar la cicatrización de heridas.

Fanwort En El Este De China: Una Planta Acuática Invasora Y Potenciales Consecuencias Ecológicas

Ambio. Mar, 2003  |  Pubmed ID: 12733803

Efecto De Oligonucleótidos Antisentido De Noggin En Aprendizaje Espacial Y La Memoria De Las Ratas

Acta Pharmacologica Sinica. May, 2003  |  Pubmed ID: 12740172

Investigar el efecto de oligonucleótidos antisentido (ASODN) de noggin en memoria y el aprendizaje espacial de rata.

Urbanización, Uso Del Suelo Y Calidad Del Agua En Shanghai. 1947-1996

Environment International. Aug, 2003  |  Pubmed ID: 12742408

El documento compromete a una investigación preliminar sobre la relación entre la calidad del agua y la urbanización, así como los cambiantes patrones de uso de la tierra en Shanghai. Cambios longitudinales al agua de calidad en diferentes puntos a lo largo del curso del río Huangpu se analizado y comparados con cambios en las tasas de urbanización y usos de la tierra. Los resultados revelan que la rápida urbanización corresponde con la rápida degradación de la calidad del agua. También muestra que los usos del suelo urbano se correlacionaron positivamente con la disminución en la calidad del agua. Un modelo de regresión muestra que cerca del 94% de la variabilidad en agua clasificaciones de la calidad se explica por área de suelo industrial. El trabajo concluye con la necesidad de uso de la tierra completa planificación como una forma de proteger los recursos hídricos valiosa.

Una Filogenia De Especies Del Género Chinas Phrynocephalus (Agamidae) Deducido De Secuencias De ADN Mitocondrial

Molecular Phylogenetics and Evolution. Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12742745

Investigamos las relaciones filogenéticas entre la mayoría de China especies de lagartijas del género Phrynocephalus (118 individuos recogidos de 56 poblaciones de 14 especies bien definidas y varios especímenes no identificados) utilizando cuatro fragmentos del gen mitocondrial (12S rRNA 16S rRNA, citocromo b y ND4-tRNA(LEU)). Las pruebas de partición de homogeneidad indicaron que el conjunto combinado de datos homogéneos y máximo-parsimonia (MP), neighbor-joining (NJ), máxima probabilidad (ML) y análisis bayesiano (BI) fueron realizados en este conjunto de datos combinado (49 haplotipos incluyendo grupos externos para 2058bp en total). El análisis de parsimonia de máximo resultó en 24 árboles igualmente parsimoniosas y su árbol de consenso estricto muestra que existen dos clados principales que representan las especies de Phrynocephalus chino: el grupo vivíparo (Grupo A) y el grupo ovíparo (Grupo B). Los árboles derivan Bayesiano, ML, y los análisis NJ fueron topológicamente idénticos al análisis MP excepto la posición de p. mystaceus. Todos los análisis dejaron los nodos para el grupo ovíparo, el clado más basal en el grupo ovíparo y p. mystaceus sin resolver. Las filogenias más sugieren que la monophyly de las especies vivíparas pudieron haber resultado de vicarianza, mientras que la dispersión reciente puede haber sido importante en la generación del patrón de variación entre las especies ovíparas.

Sitios De Unión Del Receptor HAPN Putativos En SARS_CoV Punto De Proteína

Acta Pharmacologica Sinica. Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12791172

Para obtener la información de la Unión del ligando-receptor entre la proteína S de SARS-CoV y CD13, identificar los dominios de interacción posibles o motivos relacionados con sitios de Unión y proporcionar pistas para el estudio de las funciones de las proteínas SARS y diseño anti-SARS medicamentos y vacunas.

Identificación De La Secuencia De La Señal De Empaquetado Genómica Probable De SARS-CoV Genoma Por Análisis Bioinformáticos

Acta Pharmacologica Sinica. Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12791173

Para predecir la señal de empaquetado genómica probable de SARS-CoV por análisis bioinformáticos. La señal de empaquetado derivada puede utilizarse para diseñar antisentido RNA y RNA interfieran fármacos (ARNi) tratamiento de SARS.

Investigación Preliminar De Un Biomarcador Sensible De Organoestánnicos Contaminación En El Medio Acuático Costero Chino Y Organismos Marinos

Environmental Pollution (Barking, Essex : 1987). 2003  |  Pubmed ID: 12826407

En nueve lotes de bivalvos de mar recogidas de ciudades costeras chinas durante el año de 2000 a 2002, una muestra especial llamada Mya arenaria fue encontrada para tener una capacidad fuerte de acumulación butyltin en comparación con los otros bivalvos muestreados en los lotes correspondientes. Tributilestaño compuesto era el agente contaminador predominante con la tasa de detección alta hasta 100%. Especiales altos niveles de g Sn/g fueron detectados en algunas muestras de Mya arenaria. Los resultados obtenidos mostraron que Mya arenaria era potencialmente un biomarcador para indicar organoestánnicos contaminación en ambientes acuáticos costeros.

Composición Química De Los Aceites Esenciales De Dos Chinos Meconopsis Endemismos

Zeitschrift Für Naturforschung. C, Journal of Biosciences. May-Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12872920

Los aceites esenciales de dos chinos Meconopsis especies endémicas, i. e., M. punicea y M. delavayi, se analizaron mediante el uso de GC-MS por primera vez. Los componentes principales fueron ácido hexadecanoico (16,8%), 1, 2-dimetil naftaleno (11,4%), 1, 4-dimetil naftaleno (6,6%), 1, 3-dimetil-5-etil naftaleno (5,9%) y 3-metil bifenilo (5,6%) M. punicea, ácido hexadecanoico (9,9%), 1, 2-dimetil naftaleno (7,9%), 1, 3-dimetil-5-etil naftaleno (6,2%), tetradecane (5,9%) y hexil cinamaldehído (5,5%) para M. delavayi.

[Diversidad Filogenética De Los Microbios Y Sus Perspectivas En Biología De La Conservación]

Ying Yong Sheng Tai Xue Bao = The Journal of Applied Ecology / Zhongguo Sheng Tai Xue Xue Hui, Zhongguo Ke Xue Yuan Shenyang Ying Yong Sheng Tai Yan Jiu Suo Zhu Ban. Apr, 2003  |  Pubmed ID: 12920914

El análisis filogenético molecular juega un papel muy importante en el estudio de la diversidad microbiana. El análisis comparativo de la secuencia del 16S rRNA microbios tanto cultivados como incultos, habilita la investigación de las relaciones filogenéticas entre microorganismos en una manera que no era posible a través de los tradicionales métodos microbiológicos. Como resultado, hay revisiones drásticas en nuestro entendimiento de la microbiología. La diversidad filogenética basada en el análisis comparativo de la secuencia del 16S rRNA producido nuevas penetraciones en la conservación de la biodiversidad. Proporciona un método para juicio de biodiversidad y una guía para la conservación de la biodiversidad. También, tiene el objetivo de conservación, que debe mantener la información filogenética tanto como sea posible. En esta revisión, se detallan algunos caracteres de diversidad filogenética microbiana y las perspectivas en biología de la conservación.

Diversidad Genética De Hibiscus Tiliaceus (Malvaceae) En China Evaluó Mediante Los Marcadores AFLP

Annals of Botany. Sep, 2003  |  Pubmed ID: 12930729

Marcadores de polimorfismo (AFLP) de longitud de fragmentos amplificados fueron utilizados para investigar las variaciones genéticas dentro y entre poblaciones naturales nueve de Hibiscus tiliaceus en China. ADN de 145 personas se amplificó con ocho pares de cartilla. No polimorfismos fueron encontrados entre las 20 muestras de una población marginal de origen reciente, probablemente debido a un efecto fundador. A través de los demás 125 individuos, 501 de 566 bandas (88,5%) fueron polimórficas, y 125 únicos fenotipos AFLP fueron observados. Estimaciones de la diversidad genética de acuerdo con los rasgos de la historia de la vida de H. tiliaceus y distribución geográfica. AMOVA análisis reveló que más de la diversidad genética residía dentro de poblaciones (84.8%), que correspondió a los reportados para plantas de exogamia. La estimación indirecta de flujo genético basado en phiST fue moderada (Nm = 1,395). Dispersión de larga distancia de semillas flotantes y ambientes locales puede desempeñar un papel importante en la conformación de la diversidad genética de la población y la estructura genética de esta especie.

Patrones Espaciales Y Temporales De Expresión De Noggin Y BMP4 En Hipocampo De Rata Embrionario Y Postnatal

Brain Research. Developmental Brain Research. Dec, 2003  |  Pubmed ID: 14643011

Estudios recientes indican que hueso proteínas morfogenéticas-4 (BMP4) y Noggin no sólo juega un papel importante en el desarrollo temprano del sistema nervioso, pero también puede jugar un papel importante en el desarrollo postnatal del sistema nervioso central (CNS). En este estudio, se analizaron los niveles relativos y localización de Noggin y BMP4 mRNA en el hipocampo de ratas de diferentes etapas de desarrollo con la reacción en cadena de polimerasa-transcriptasa reversa (RT-PCR) e hibridación in situ (ISH). RT-PCR demostró que los cambios temporales en los niveles de expresión de Noggin y BMP4 eran diferentes. El nivel máximo de expresión de mRNA de Noggin se observó en el día embrionario 13 (E13), posteriormente gradualmente disminuido en 1-3 meses (P1 - 3 M) postnatales y fue detectado sólo en un nivel bajo en P18M. En cambio, la expresión del ARNm de BMP4 aumentado gradualmente durante el desarrollo embrionario, alcanzado un nivel máximo en 3 semanas (W) postnatales y disminuyó ligeramente a través de P18M. Hibridación in situ reveló que en etapas embrionarias, Noggin mRNA fue localizado a lo largo de todas las regiones de hipocampales, mientras que en la alta edad postnatal, Noggin mRNA fue localizada principalmente en el subiculum anterior. En las etapas postnatales embrionarias y principios, ninguna expresión de mRNA de BMP4 significativa era perceptible en el hipocampo. En más adelante postnatal envejece, sin embargo, Noggin y observó la expresión del mRNA de BMP4 en patrones similares. A 1-3 meses postnatales, expresión de BMP4 se observó principalmente en la convolución del cerebro y en las capas de células piramidales de CA1-CA3. Se observaron señales de hibridación inferiores en el hilus y subículo. Tomados en conjunto, nuestros resultados demuestran que Noggin y BMP4 se expresan en hipocampo embrionario y postnatal, y que los patrones temporales y espaciales de su expresión al desarrollo están regulados. Estos datos sugieren que Noggin y BMP4 juegan papeles importantes en el desarrollo del hipocampo.

Búsqueda Semántica Entre Bases De Datos Biológicos Heterogéneos Basado En La Ontología Génica

Acta Biochimica Et Biophysica Sinica. May, 2004  |  Pubmed ID: 15156279

Búsqueda semántica es un tema clave en la integración de bases de datos heterogéneas biológicas. En este trabajo, presentamos una metodología para la aplicación de búsqueda semántica en BioDW, un almacén de datos biológicos integrado. Se presentan dos tablas: la tabla de DB2GO para correlacionar Gene Ontology (vaya) anotado las entradas de fuentes de datos BioDW a la cita, y la tabla de similitud semántica puntajes récord semejanza deriva de cualquier par de términos GO. Basado en las dos tablas, se proporcionan múltiples formas de búsqueda semántica y las entradas correspondientes en las bases de datos biológicos heterogéneos en términos semánticos pueden ser conveniente buscadas.

Composición Química De Los Aceites Esenciales De Clausena Lansium De La Isla De Hainan, China

Zeitschrift Für Naturforschung. C, Journal of Biosciences. Mar-Apr, 2004  |  Pubmed ID: 15241914

Los aceites esenciales de salvaje Clausena lansium recogido en la isla de Hainan, China fueron extraídos de semillas, hojas, flores y sarcocarps y luego se analizaron mediante el uso de GC/MS. Los principales componentes de los aceites esenciales fueron: beta-santalol (35,2%), bisabolol (13,7%), santalol metílico (6,9%), ledol (6,5%) y sinensal (5,6%) en las hojas; beta-santalol (50,6%), 9-octadecenamide (17,2%) y sinensal (4.1%) en las flores; beta-santalol (52.0%), alfa-santalol (15,5%), farnesol (5,2%) y sinensal (4,0%) en la sarcocarps; y felandreno (54,8%), limoneno (23,6%) y p-menth-1-en-4-ol (7,5%) en las semillas.

Composición Química De Los Aceites Esenciales De Dos Especies De Alpinia Desde La Isla De Hainan, China

Zeitschrift Für Naturforschung. C, Journal of Biosciences. Mar-Apr, 2004  |  Pubmed ID: 15241915

Los aceites esenciales de dos especies de Alpinia, es decir. Se analizaron mediante el uso de GC-MS hainanensis a. y a. katsumadai, de la isla de Hainan, China. Los componentes principales en el aceite de la hoja de hainanensis a. fueron ocimeno (27,4%), beta-pineno (10,1%), ácido 9-octadecenoico (6,5%), ácido n-hexadecanoico (5,8%), ácido 9, 12-octadecadienoico (5,4%) y terpinen (4,3%). Los componentes de aceite obtenidos de las flores de a. hainanensis fueron ocimeno (39,8%), beta-pineno (17,7%), terpineno (5,5%), p-menth-1-en-ol (4.9%), cariofileno (4.9%) y felandreno (4,4%). En a. katsumadai, los componentes principales en el aceite de la hoja fueron p-menth-1-en-ol (22,0%), terpinen (19.0%), 4-careno (9,1%), 1, 8-cineol (8,3%) y alcanfor (5,6%). Los componentes principales en el aceite de la flor fueron p-menth-1-en-ol (21,3%), 1, 8-cineol (20,2%), terpinen (12,6%), felandreno (7,0%), 4-careno (6,4%) y beta-pineno (5,2%).

Una Filogenia Molecular De Oxya (Orthoptera: Acridoidea) En China, Deducido De Secuencias De Genes Parcial Citocromo B

Molecular Phylogenetics and Evolution. Nov, 2004  |  Pubmed ID: 15336683

Los saltamontes del género Oxya son bien sabido al daño de arroz, caña de azúcar y otros cultivos, pero sus relaciones filogenéticas no han sido examinadas con datos moleculares. En este estudio, se obtuvieron las 432 secuencias de ADN de bp del gen mitocondrial citocromo b de 91 personas de nueve especies de Oxya y dos grupos externos (Gesonula punctifrons y Acrida cinerea). Los análisis filogenéticos para el conjunto de datos molecular luego se llevaron a cabo con la máxima parsimonia y métodos neighbor-joining. Los resultados mostraron que las nueve especies de Oxya forman cuatro clados bien sustentadas, que incluyen (1) intricata o. y o. flavefemura; (2) Japonica o. y o. bicingula; (3) O. agavisa; y chinensis o. (4), o. brachyptera, o. adentata y o. hainanensis, respectivamente. En particular, el monophyly de hainanensis o. y o. agavisa es fuertemente apoyado, respectivamente. Sin embargo, flavefemura o. y o. intricata, o. bicingula y o. japonica forman grupos parafilético, respectivamente, o. chinensis, o. adentata y o. minxianensis forman el grupo polyphylétique, sugiriendo que ellos deberían fusionarse tan sólo tres especies.

Relaciones Filogenéticas Moleculares De Ciprínidos De Asia Oriental (pisces: Cypriniformes) Deducido De Secuencias De Citocromo B

Science in China. Series C, Life Sciences / Chinese Academy of Sciences. Apr, 2004  |  Pubmed ID: 15379245

Completa mitocondrial citocromo b secuencias de 54 especies, incluyendo 18 recién ordenado, se analizaron para inferir las relaciones filogenéticas dentro de la familia de los Cyprinidae en Asia oriental. Árboles filogenéticos fueron generados utilizando diversos métodos de construcción de árboles, incluyendo Neighbor-joining (NJ), máxima parsimonia (MP) y métodos de máxima verosimilitud (ML), con Myxocyprinus asiaticus (familia Catostomidae) como el grupo externo designado. Los resultados de NJ y ML métodos en su mayoría fueron similares, apoyando algunas subfamilias existentes dentro Cyprinidae como monofilético, como Cultrinae, Xenocyprinae y Gobioninae (incluyendo Gobiobotinae). Sin embargo, géneros dentro de la subfamilia "Danioninae" no formaron un grupo monofilético. La subfamilia Leuciscinae se dividió en dos grupos sin relación: el "Leuciscinae" en la formación de Asia oriental como un grupo monofilético junto con Cultrinae y Xenocyprinae, mientras que el Leucisciriae en Europa, Siberia y América del norte como otro grupo monofilético. El monophyly de la subfamilia Cyprininae sensu Howes fue apoyado por árboles de NJ y ML y es básico en el árbol. La posición de Acheilognathinae, un grupo monofilético ampliamente aceptado representado por Rhodeus sericeus, no está resuelto.

S De Alto Rendimiento-SAP Fluorescente PCR Múltiplex Y Electroforesis Capilar En Plantas

Journal of Biotechnology. Oct, 2004  |  Pubmed ID: 15464599

El modo replicativo inherente de transposición dota retrotransposones con considerables ventajas como herramientas genéticas en el análisis del genoma de plantas. Aquí presentamos un método de polimorfismo (S-SAP) de amplificación de secuencia específica de alto rendimiento basado en la copia como retrotransposones para satisfacer el creciente deseo de los grandes números de muestras en las plantas. Enfoque clásico para la digestión, ligadura y pre-amplificación fue combinado con PCR multiplex fluorescente optimizado para fragmentos de S-SAP amplificación selectivas simultáneamente, y posteriormente se detectaron varios S-SAPs por electroforesis capilar utilizando instrumentos capilares ABI PRISM 3700. Comparaciones de los resultados de PCR multiplex con una PCR y electroforesis capilar con losa-electroforesis demostraron que este método es un medio eficiente, económico y preciso para la variación de retrotransposon de Genotipado de alto rendimiento y a gran escala en las plantas.

Variación Genética Molecular En Poblaciones Chinas De Tres Subespecies De Hippophae Rhamnoides

Biochemical Genetics. Aug, 2004  |  Pubmed ID: 15487589

Para proporcionar un perfil genético poblacional de investigación y conservación de la diversidad genética del espino amarillo (Hippophae rhamnoides L.), 300 personas de quince poblaciones naturales de espino cerval de mar en China se analizaron mediante el uso de marcadores ISSR (repeticiones de secuencia inter-simple). En base a índice de Shannon y diversidad genética de Nei, la diversidad genética promedio detectada en las poblaciones naturales de Hippophae rhamnoides SSP. yunnanensis SSP. sinensis y SSP. gyantsensis fue 0.1944, 0.2169 y 0.1372, respectivamente. El coeficiente de diferenciación genética (Gst) de siete poblaciones de yunnanensis SSP. es 0.2790, y la de siete poblaciones de sinensis SSP. es 0.4184. Esto significa que el 28% de la varianza molecular total de siete poblaciones de yunnanensis SSP. existió entre poblaciones y el 42% de siete poblaciones de sinensis SSP., sugiriendo que las subespecies tienen diferentes estructuras genéticas. Se encontró ninguna correlación significativa entre distancias genéticas y geográficas de las poblaciones mediante marcadores ISSR.

[Bombas De Infusión Implantables Intratecal En El Tratamiento Del Dolor Refractario--informe De 3 Casos]

Zhonghua Yi Xue Za Zhi. Oct, 2004  |  Pubmed ID: 15569443

[Estudio Clínico Sobre El Tratamiento De Cáncer De Pulmón No Microcítico Avanzado De Guben Xiaoliu Cápsula]

Zhongguo Zhong Xi Yi Jie He Za Zhi Zhongguo Zhongxiyi Jiehe Zazhi = Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Medicine / Zhongguo Zhong Xi Yi Jie He Xue Hui, Zhongguo Zhong Yi Yan Jiu Yuan Zhu Ban. Nov, 2004  |  Pubmed ID: 15609595

Para observar el efecto terapéutico de Guben Xiaoliu cápsula (GXC) en el tratamiento avanzado cáncer de pulmón no microcítico estadio (NSCLC).

[Introducción a Los Métodos De Construcción De árboles Filogenéticos Con ADN Secuencias]

Yi Chuan = Hereditas / Zhongguo Yi Chuan Xue Hui Bian Ji. Mar, 2004  |  Pubmed ID: 15639989

Construcción de árboles filogenéticos es un medio clave en los estudios evolutivos moleculares. Los métodos de construcción de árboles filogenéticos incluyen los métodos basados en la distancia, parsimonia, máxima verosimilitud y métodos de inferencia bayesiana. Para resolver un problema especial sobre filogenia, son necesarios varios avisos: primero, para seleccionar los datos razonables en menor sesgo posible; segundo, elegir el método adecuado para reconstruir el árbol filogenético; en tercer lugar, para evaluar las conclusiones y explicarlos en el campo de la evolución. El presente artículo ofrece una breve introducción de los principios de selección de datos y métodos de construcción del árbol y discute sobre sus puntos de ventaja y desventaja.

Composición Química Del Aceite Esencial De Elephantopus Scaber Del Sur De China

Zeitschrift Für Naturforschung. C, Journal of Biosciences. May-Jun, 2004  |  Pubmed ID: 18998395

El aceite esencial de Elephantopus scaber, famosa hierba medicinal de Yangjiang Condado del sur de China se analizó por primera vez usando GC-MS. Los componentes principales fueron ácido hexadecanoico (42,3%), isopropyl dimetil tetrahydronaphthalenol (14,1%), beta-sesquifelandreno (8,3%), ácido octadecadienoico (5,5%) y fitol (5,2%).

Asignación De Orthologous Genes Vía Cambio Del Genoma

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics / IEEE, ACM. Oct-Dec, 2005  |  Pubmed ID: 17044168

La asignación de orthologous genes entre un par de genomas es un problema fundamental y desafiante en genómica comparativa. Los métodos existentes que asignan ortólogos basada en la similitud de secuencias de ADN o proteínas pueden hacer asignaciones erróneas cuando la semejanza de la secuencia no delinear claramente la relación evolutiva entre los genes de las mismas familias. En este trabajo presentamos un nuevo enfoque para la asignación de ortólogo que tienen en cuenta la similitud de secuencia tanto eventos evolutivos en un nivel del genoma, donde orthologous genes se supone que corresponden entre sí en el escenario de evolución más parsimonioso bajo cambio del genoma. En primer lugar, el problema se formula como de la informática en la distancia de inversión firmados con duplicados entre los dos genomas de interés. Entonces, el problema se descompone en dos nuevos problemas de optimización, llamadas partición común mínimo y máximo ciclo de descomposición, que reciben eficientes algoritmos heurísticos. Siguiendo este enfoque, hemos implementado un sistema de alto rendimiento para asignar ortólogos en una escala de genoma, llamada SOAR y probado en datos simulados y datos de la secuencia del genoma real. En comparación con un método de asignación ortólogo reciente basado enteramente en la búsqueda de homología (llamada INPARANOID), SOAR muestra un desempeño ligeramente mejor en términos de sensibilidad en el conjunto de datos real porque es capaz de identificar varios pares de orthologous correcto que le falten por INPARANOID. Los resultados de la simulación demuestran que se disparan, en general, funciona mejor que el algoritmo iterativo ejemplar en términos de computación la distancia de inversión y asignación correcta ortólogos.

MPSS: Un Base De Datos Integrada Sistema De Medición De Un Conjunto De Proteínas

Bioinformatics (Oxford, England). May, 2005  |  Pubmed ID: 15699026

Resumen: Diseñamos e implementamos un sistema de base de datos integrada denominado "sistema de encuesta multi-proteína" (MPSS), que proporciona una plataforma para recuperar información sobre muchas proteínas a la vez. Este sistema integra varias bases de datos importantes y ampliamente utilizados como SwissProt, TrEMBL, PDB y InterPro, más referencias útiles como GO y KEGG a otras bases de datos. Los usuarios pueden enviar a un grupo de proteína IDs, nombres de entrada, indicar los números de SwissProt/TrEMBL o GenBank SIG a través de la interfaz de la web de 'MPSS y obtener proteína anotación información de bases de datos públicas y propiedades moleculares meteorológicos rápidamente. MPSS también puede suministrar información completa sobre las proteínas de la consulta, incluyendo estructuras 3D, dominios, camino, ontología génica y presentación visual de la asignación al árbol GO y camino KEGG, para proporcionar una visión actualizada de conocimientos disponibles con respecto a las estructuras y funciones moleculares de proteínas en estudio. DISPONIBILIDAD: MPSS es libremente accesible en http://www.scbit.org/mpss/

Relaciones Filogenéticas De Los Peces Salangid (Osmeridae, Salanginae) Con Comentarios Sobre Colocación Filogenética De La Salangids Basado En Secuencias De ADN Mitocondrial

Molecular Phylogenetics and Evolution. Apr, 2005  |  Pubmed ID: 15737583

Utilizamos secuencias parciales de ADN de los genes mitocondriales del b y 16S del citocromo para determinar la ubicación filogenética de peces salangid y las relaciones genéricas dentro de la salangids. Nuestros datos moleculares apoyan fuertemente la monophyly de salangid de peces, la inclusión de salangids en el Osmeridae, y la hermana grupo relación entre salangids y osmerids. Nuestros análisis sugieren que Plecoglossus pueden ser separados de los otros salangids y osmerids. Mallotus y Hypomesus están agrupadas dentro de Osmerinae, en lugar de aliado con Salanginae. En cuanto a las relaciones dentro de la salangids, nuestros análisis son incongruentes con todas las hipótesis de clasificación anterior. Nuestro apoyo de análisis filogenéticos la hermana grupo relaciones entre Protosalanx y Neosalanx y entre Salanx y Hemisalanx. Más evidencias muestran que Leucosoma está más estrechamente relacionado con el clade de Salanx-Hemisalanx, mientras que Salangichthys forma parte de un polytomy basal sin resolver.

Efecto Del Uso Preoperatorio Del Octreotide Long-acting En Cirugía Pituitaria Del Adenoma Y Transsphenoidal De Secreción De La Hormona De Crecimiento

Chinese Medical Sciences Journal = Chung-kuo I Hsüeh K'o Hsüeh Tsa Chih / Chinese Academy of Medical Sciences. Mar, 2005  |  Pubmed ID: 15844307

Investigar si octreotide análogo de somatostatina de acción prolongada liberación (LAR) reduce a la hormona de crecimiento (GH) que secretaba adenomas y mejora los resultados de la cirugía transsphenoidal posterior.

Expresión Y Caracterización De La Esterasa Carboxilo Rv3487c De Mycobacterium Tuberculosis

Protein Expression and Purification. Jul, 2005  |  Pubmed ID: 15939293

Rv3487c (lipF), un miembro de la familia de la lipasa de Mycobacterium tuberculosis, se relaciona con la virulencia de este patógeno. Análisis de RT-PCR en tiempo real indican que Rv3487c fue inducida a bajo pH en M. tuberculosis cultivadas in vitro. El gen de la Rv3487c fue reproducido y expresado como proteína de fusión en Escherichia coli. Después del retiro del dominio N-terminal de la pareja de fusión por el tratamiento del enterokinase, se caracterizó el efecto del pH, temperatura y detergentes en la actividad de la enzima purificada y estabilidad. Rv3487c eficiente podría hidrolizar los ésteres de cadena corta. La tríada catalítica de Rv3487c consiste en residuos Ser90, Glu189 y His219 según lo demostrado por el alineamiento de secuencias de aminoácidos, modelado tridimensional y mutagénesis sitio-dirigida.

Un Modelo Acoplamiento Molecular De Proteína S1 Del SARS-CoV En Complejo Con Su Receptor, ACE2 Humana

Computational Biology and Chemistry. Jun, 2005  |  Pubmed ID: 15979045

Los residuos exactos dentro de la proteína de síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV) de coronavirus S1 y su receptor, ACE2 humano, involucrado en su interacción siguen siendo en gran medida indeterminadas. Identificación de residuos de aminoácidos exacta que son cruciales para la interacción de S1 con ACE2 podría proporcionar hipótesis de trabajo para estudios experimentales y podría ser útil para el desarrollo de antivirales inhibidores. En este trabajo, se construyó un modelo acoplamiento molecular de proteína S1 del SARS-CoV en complejo con ACE2 humana. También se identificaron los pares de residuo interactúan dentro de este complejo modelo y sus tipos de contactos. Nuestro modelo, apoyado por pruebas bioquímicas significativas, sugirió receptor-obligatorio residuos se concentraron en dos segmentos de proteína S1. En contraste, los residuos interfaciales en ACE2, aunque próximas entre sí en la estructura terciaria, resultaron ampliamente dispersados en la secuencia primaria. En particular, el residuo de S1 ARG453 y ACE2 residuo LYS341 serian los residuos claves en la formación de complejos.

Detectar La Correlación Entre Las Divergencias De Secuencia Y Expresión En Un Análisis Comparativo De Los Genes Humanos Serpinas

Bio Systems. Dec, 2005  |  Pubmed ID: 16112386

Funciones fisiológicas y construcciones características de la superfamilia de gene serpin se han estudiado ampliamente, sin embargo, la evolución de los genes de serpin sigue siendo confusa. Duplicación del gene en esta superfamilia puede arrojar luz sobre este tema. Dos modelos se utilizan para predecir la preservación de genes duplicados: el modelo clásico y el modelo de duplicación-degeneración-complementación (DDC). En este estudio, se analizaron las relaciones filogenéticas de 33 genes humanos serpin y los datos de expresión de algunos miembros de la superfamilia de las serpinas de un microarray de ADN de las células de la leucemia humana U937 con expresión inducible estable del gen AML1-ETO relacionadas con la leucemia. Luego se determinó la utilidad del modelo DDC por serpin Superfamilia expresión datos al árbol filogenético. La correlación entre las divergencias de la secuencia y expresión como es medido por el coeficiente de correlación de Pearson indicó que genes humanos serpin desarrollado bajo el modelo DDC. Nuestro estudio proporciona una nueva estrategia para el análisis comparativo de secuencias de genes y datos de microarrays.

Películas De Múltiples Capas Del Polipéptido

Biomacromolecules. Nov-Dec, 2005  |  Pubmed ID: 16283705

Investigación sobre películas de múltiples capas del polipéptido, revestimientos y microcápsulas se encuentra en la intersección de varias disciplinas: polímero sintético química y física, ciencia de los biomateriales e ingeniería de nanoescala. Los últimos años han sido testigos de un crecimiento considerable en cada una de estas áreas. Territorio inexplorado se ha encontrado en las fronteras, y nuevas posibilidades para el desarrollo tecnológico están tomando forma de avances tecnológicos en la producción del polipéptido, secuenciación del genoma humano y la naturaleza de péptidos propios. La mayoría prevé aplicaciones de multicapas de polipéptido tienen un doblado biomédico. Perspectivas parecen no menos positivas, sin embargo, en campos que van desde la tecnología de los alimentos a la ciencia ambiental. Este informe sobre el estado actual de la investigación de película de múltiples capas de polipéptido abarca puntos clave de polipéptidos como materiales, medio de preparación de producción y de la película de polímero, métodos de caracterización de película, los puntos focales de la actual investigación en ciencia básica y las perspectivas para algunas aplicaciones específicas. Además, se analiza cómo el estudio de películas de múltiples capas de polipéptido podría ayudar a aclarar la base física de la Asamblea y la estabilidad de multicapas de polielectrolito, y se menciona semejanzas a estudios de plegamiento de la proteína.

Detección Transferencia Horizontal Del Gene Con Programas De T-REX Y RHOM

Briefings in Bioinformatics. Dec, 2005  |  Pubmed ID: 16420738

Como el proyecto del genoma humano y otro genoma proyectos experimentan notable éxito y una inundación de datos biológicos se produce por medio de alta-a través de técnicas de secuenciación, detección de transferencia horizontal del gene (HGT) se convierte en un campo prometedor en Bioinformática. Este informe describe dos programas freeware: T-REX para MS Windows y RHOM para Linux. T-REX es un programa de interfaz gráfica de usuario que ofrece funciones para reconstruir la red HGT entre las huestes del donante y del receptor del gen y especies distancia matrices. RHOM es un conjunto de programas conducidos de línea de comandos utilizada para detectar HGT en genomas. Mientras que el T-REX impresiona con una interfaz fácil de usar y dibujo de la red de redes de suministro, la fuerza de RHOM es un amplio marco estadístico del genoma y la visualización gráfica de las probabilidades de posición de la secuencia estimada para el candidato horizontalmente transfieren genes.

Ajuste Fino De Propiedades Físicas De Películas De Múltiples Capas De Polipéptido Diseñado Por Control Del PH

Biotechnology Progress. Jan-Feb, 2006  |  Pubmed ID: 16454502

Ajuste del pH puede alterar el conjunto de estructuras tridimensionales de un polipéptido en solución cambiando la distribución de la carga y las interacciones Coulombic. El papel de pH en capa por capa autoensamblaje (LbL) de los péptidos 32mer diseñados que contiene el aminoácido cisteína ha sido investigada usando una combinación de métodos físicos. Los resultados muestran que el pH puede tener una influencia sustancial en la masa de péptido adsorbida, rugosidad de la superficie y densidad de la película en un rango de 1,5 unidades de pH. Espesor de la película del péptido depende del número de capas, como con polielectrolitos "convencional". Densidad de la película y la morfología, sin embargo, varían más con pH que hace grueso, traducir en un cambio en la densidad del orden de 70% en el rango de pH 7.4-8.9. Resultados de este trabajo proporcionan la penetración en la base física de LbL y sugieren que los péptidos son una prometedora clase de polielectrolitos para la creación de películas delgadas de diseño para aplicaciones en biotecnología y otras áreas.

Androesterilidad Citoplasmática De Arroz Con Citoplasma II De Boro Es Causada Por Un Péptido Citotóxico Y Es Restaurada Por Dos Genes De Adorno PPR Relacionados Mediante Modos Distintos De Silenciamiento Del MRNA

The Plant Cell. Mar, 2006  |  Pubmed ID: 16489123

Androesterilidad citoplasmática (CMS) y la restauración de la fertilidad controlada por núcleo son características reproductivas planta generalizada que proporcionan herramientas útiles para explotar la heterosis en los cultivos. Sin embargo, el mecanismo molecular subyacente a este tipo de interacción citoplásmico nuclear sigue siendo confuso. A continuación, os mostramos en arroz (Oryza sativa) con citoplasma Boro II que un marco de lectura abierto mitocondrial anormal, orf79, es cotranscribed con un atp6 duplicados gene (B-atp6) y codifica un péptido citotóxico. Expresión de orf79 en CMS líneas y plantas de arroz transgénico causó esterilidad masculina uniseriado. Análisis de Immunoblot demostró que la proteína ORF79 se acumula específicamente en microsporas. Se identificaron dos genes del restaurador de la fertilidad, Rf1a y Rf1b, en el lugar geométrico clásico Rf-1 como miembros de un grupo multigénica que codifican proteínas repetición de pentatricopeptide. RF1A y RF1B están dirigidos tanto a las mitocondrias y pueden restaurar la fertilidad masculina bloquean la producción de ORF79 través de endonucleolítica (RF1A) o degradación (RF1B) de dicistronic B-atp6/orf79 mRNA. En presencia de dos Restauradores, RF1A era epistáticas sobre RF1B en el procesamiento de mRNA. También hemos demostrado que RF1A juega un papel adicional en la promoción de la edición de atp6 mRNAs, independiente de su función de escote.

[El Estudio De Las Secuencias De Proteínas Ribosomal L15 CDNA Como Marcador Molecular En El Análisis Filogenético Teleostei]

Yi Chuan = Hereditas / Zhongguo Yi Chuan Xue Hui Bian Ji. Feb, 2006  |  Pubmed ID: 16520312

En este estudio, los cDNAs completos del gene de RPL15 (proteína ribosomal L15) fueron clonados y secuenciados de quince peces de cinco órdenes bajo Teleostei. Se analizaron las secuencias completas de ORF para reconstrucción filogenética por primera vez evaluar el potencial del gen de la RPL15 como un nuevo marcador en la resolución de teleostean relaciones filogenéticas. Los árboles resultantes de NJ, MP y ML con Anguilla japonica como el outgroup eran generalmente resuelto y en gran parte congruente con el árbol basadas en morfología aunque se observaron algunas incongruencias. Luego se analizaron las incongruencias para algunas explicaciones. Los resultados sugirieron que: (1) RPL15 gene fue altamente conservado durante la evolución eucariota; (2) ORF RPL15 podría ser un buen marcador filogenético para resolver las relaciones teleostean. Puede ser especialmente apropiado para las relaciones de alto nivel (como interordinal), y era posiblemente conveniente para las relaciones de nivel inferior así. Lo mismo puede ser válido para otros eucariotas.

Genes De Tolerancia De Sequía En Arroz

Functional & Integrative Genomics. Oct, 2006  |  Pubmed ID: 16552602

Loci de rasgos cuantitativos (QTLs) para tolerancia a la sequía (DT) pueden ser fácilmente identificados en bases de datos disponibles y en este papel, estos QTLs fueron resumidos en forma de un mapa de consenso. Un in silico estrategia entonces se desplegó para mina de genes candidatos asociados al uso de QTLs DT arroz dbEST y bases de datos del genoma del arroz. DT QTLs en los cromosomas 1, 2, 4, 8 y 9 fueron seleccionados para probar el método de arroz. El resultado mostró genes candidatos asociados con el DT podrían identificarse fácilmente.

[Avances Recientes En El Estudio Entre Los Esteroides Y La Función Cerebral]

Sheng Li Ke Xue Jin Zhan [Progress in Physiology]. Jan, 2006  |  Pubmed ID: 16683536

Es vital para las hormonas esteroides sintetizadas en la glándula de la gónada, la glándula suprarrenal y la placenta para el desarrollo y el metabolismo fisiológico del cuerpo. En particular, su efecto regulador sobre las funciones cerebrales ha atraído más atención, como casi todas las hormonas esteroides pueden ser sintetizan de novo en el cerebro. Esto significa esteroides derivados de cerebro y glándula periférica pueden modular la fisiología y patología del cerebro recíprocamente y lo que es importante en muchos aspectos como aprendizaje y memoria, transmisión sináptica, neuroprotección, enfermedades neurodegenerativas (especialmente la enfermedad de Alzheimer), emoción, estrés y trastornos menstruales-ciclo-ligado. En la presente revisión, se resumen algunos nuevos avances.

Reconstrucción Y Análisis De Silico De La MAPK Señalización Vías En La Platija De Sangre Humana, Schistosoma Japonicum

FEBS Letters. Jun, 2006  |  Pubmed ID: 16765950

En la actualidad, poco se conoce sobre los mecanismos de transducción de señal en esquistosomas, que causan la enfermedad de la esquistosomiasis. Las vías de señalización de quinasa (MAPK) de proteínas activadas por mitógenos, evolutivamente se conservan de la levadura a Homo sapiens, un papel clave en múltiples procesos celulares. Aquí, reconstruimos la MAPK hipotética señalización vías en Schistosoma japonicum y en comparación con las vías de esquistosoma con los de la especie de eucariotas de modelo. Se identificaron 60 componentes homólogos en el japonciumMAPK S. vías de señalización. Entre ellos, 27 fueron predichas para ser secuencias integrales. El análisis filogenético de estas proteínas confirmó la conservación evolutiva de la MAPK vías de señalización. Notable, identificamos homólogos de S. japonicum de proteína de unión a GTP beta y alfa-me subunidades en la levadura de apareamiento de la vía, que podría estar implicada en la regulación de diferentes estadios y procesos de maduración sexual femenina, así como en esquistosomas. Además, varios genes de miembros de vía, ERK y JNK, Adventures-DSP, ARM, RAS, se determinaron mediante análisis PCR cuantitativa para expresarse de manera específica de etapa, ERK y JNK y su inhibidor Adventures-DSP con marcado alza en esquistosomas femeninos adultos.

Estructura Del Urm1 Y Sus Implicaciones Para El Origen De Los Modificadores De Proteínas En Solución

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2006  |  Pubmed ID: 16864801

Modificadores de proteína participan en diversos procesos biológicos y regulan la actividad o función de proteínas de destino por covalente conjugando a ellos. Aunque ubiquitina y una serie de modificadores de ubiquitina-proteína (Ubls) en eucariotas han sido identificados, no se ha encontrado modificadores de proteínas en procariotas; por lo tanto, su origen evolutivo sigue siendo un rompecabezas. Para inferir las relaciones evolutivas entre los modificadores de la proteína y proteínas portadoras de sulfuro, resolvimos la solución estructura NMR de la proteína de Urm1 (relacionados con la ubiquitina modificador-1) de Saccharomyces cerevisiae. Comparación estructural tanto el análisis filogenético de la superfamilia de ubiquitina, con énfasis en la familia Urm1, indican que el Urm1 es el único "fósiles moleculares" que tiene el más conservado estructural y características de la secuencia del antepasado común de la superfamilia de todo. Las similitudes de la estructura 3D y funciones de superficie hidrofóbicas y electrostáticos entre Urm1 y MoaD (molybdopterin synthase subunidad pequeña) sugieren que pueden interactuar con los socios de manera similar, y similitudes entre Urm1-Uba4 y MoaD-MoeB establecen un vínculo evolutivo entre verbal de proteína dependiente de ATP en eucariotas y sulfuración de cofactor dependiente de ATP.

Caracterización De La Familia Multigénica De Interferón Alfa Porcino

Gene. Nov, 2006  |  Pubmed ID: 16901658

La disponibilidad de datos en la secuencia del genoma del cerdo nos incitó a caracterizar la familia multigénica porcina de IFN-alfa (alfa-PoIFN). Se detectaron 14 genes funcionales de PoIFN-alfa y dos pseudogenes PoIFN-alfa en el genoma porcino. Alineamiento de secuencias múltiples reveló una canceladura del c-terminal de ocho residuos en seis subtipos. Un árbol filogenético de la familia de genes de IFN-alfa porcino define la relación evolutiva de los diferentes subtipos. Además, el análisis de la tasa evolutiva y el efecto de selección positiva sugieren que la supresión de la terminal C es una estrategia para la conservación en el genoma. Ocho subtipos de PoIFN-alfa se aislaron el genoma porcino de hígado y expresan en la línea de células BHK-21. Detectamos el nivel de transcripción por análisis de RT-PCR cuantitativa en tiempo real. La actividad antiviral de los productos fueron determinada por las células del deseo/Vesicular (VSV) del Virus de la estomatitis y PK 15 células/Pseudorabies Virus (PRV) respectivamente. Encontramos que las actividades antivirales de genes de alfa-PoIFN intactos son aproximadamente 2 - 50 veces superiores a los de los subtipos con eliminaciones de la terminal C en células de deseo y 15 - 55 veces mayor en las células PK 15. No hubo diferencias obvias entre los subtipos con y sin la eliminación de la c-terminal de susceptibilidad de ácido.

Identificación Y Mapeo Genético De Un Nuevo Gen Implicado En El Desarrollo Del Polen En Arabidopsis

Fen Zi Xi Bao Sheng Wu Xue Bao = Journal of Molecular Cell Biology / Zhongguo Xi Bao Sheng Wu Xue Xue Hui Zhu Ban. Apr, 2006  |  Pubmed ID: 16944588

Con el fin de la disección genética del desarrollo de la antera y polen, identificamos una línea de mutante de Arabidopsis nombrada zy1511 por mutagénesis de etil metano sulfonato (EMS). El análisis genético indica que el fenotipo mutante fue controlado por un solo gen recesivo de nuclear zy1511. Estudios citológicos de la antera en diversas etapas del desarrollo indican que el tapetum antera mutante no salió degenerar después microsporas liberados de las tétradas. Parte del tapetum antera mutante todavía existió en las últimas etapas de desarrollo de la antera, indicando que Tapetum mutante degeneró después que el tipo salvaje. Tan las microsporas mutantes no podrían convertirse en normales los granos de polen de la antera. Para el posterior análisis genético y la clonación basada en mapas de gene zy1511, hemos asignado a una región de 134 kb entre marcadores moleculares F25P12 y T8L23 en el cromosoma 1 mediante una estrategia basada en mapas de clonación. Como ningún hombres estériles genes se han divulgado en esta región, creemos que zy1511 es un desconocido gen clave involucrado en el desarrollo del polen.

[Vitrificación De Blastocistos De Ratón Por Método Open Pulled Straw (OPS) En Diversa Temperatura]

Fen Zi Xi Bao Sheng Wu Xue Bao = Journal of Molecular Cell Biology / Zhongguo Xi Bao Sheng Wu Xue Xue Hui Zhu Ban. Jun, 2006  |  Pubmed ID: 16944599

Para examinar la eficacia de la FED y EFS para la criopreservación de blastocisto y proporcionar información para la preparación de medio de vitrificación a diferentes temperaturas, la presente investigación se realizó para establecer un modelo para la vitrificación de blastocistos y blastocistos humanos utilizando blastocistos de ratón como modelo y OPS (open pulled straw) como el contenedor del animal doméstico. Cuando la temperatura ambiente era 25 grados C y temperatura de la placa de calefacción 37 grados C, ratón blastocistos fueron vitrificados utilizando el método de la OPS de 1-paso, después de descongelar, las tarifas de blastocisto expandido (EB) del grupo EDFS40 y EFS40 (92,31%, 92.30%) no fueron difiere del control (97.26%) (P 0.05 >), sin embargo, la tasa de nacidos blastocisto (HB) de EDFS40 grupo (59.62%) fue significativamente menor que la del control (83.56%); Cuando se adoptó el método de dos pasos a la misma temperatura, blastocistos de ratón fue criopreservado con éxito con EDFS30 y EFS40, la post-thawing tasa EB (95.69%, 95.05%) y tasa de HB (80.48%, 78.95%) de los grupos tanto EDFS30 y EFS40 no difirieron de los del testigo (P 0.05 >). Cuando la temperatura ambiente era 25 grados C y placa solar era libre, la tasa EB (85.96%) y HB (75.44%) de embriones vitrificados con EDFS40 con OPS 1 paso método no fueron estadísticamente diferentes de los del testigo (96.05% y 82.89%, respectivamente) (P > 0.05); las tasas EB y HB (92.03-95.31%, 67.19-76.76%) de embriones vitrificación con EDFS30, EDFS40 y EFS40 2-paso OPS método eran similares a las del control (P > 0.05). Según el desarrollo in vitro de embriones vitrificados, el prometedor grupo fue elegido para que la transferencia de embriones examinar el desarrollo in vivo de embriones vitrificados. Cuando se transfirieron blastocistos vitrificados en útero de ratón seudopreñado, la tasa de embarazo de recibos (90.90%) y la tasa de natalidad de madre adoptiva (37.33%) eran similares a las de embriones frescos (91.67% y 42,33%) (P 0.05 >). Todos los datos demostraron que blastocistos de ratón fue criopreservado con éxito con EDFS30, EDFS40 y EFS40 en diferentes temperaturas y con diferentes procedimientos.

Cerca De Variación Homogénea De Potenciales En Los Grandes Sistemas Y La Estructura Electrónica De Puntos Cuánticos Molecular

The Journal of Chemical Physics. Sep, 2006  |  Pubmed ID: 16965100

Se muestra de la teoría de la densidad funcional de Kohn-Sham (KS) que en un sistema molecular grande, el potencial del culombio, potencial electrostático molecular y potencial efectivo KS pueden exhibir una variación aproximadamente homogénea en el espacio, en respuesta a un pequeño cambio de la cantidad de electrones. La variación homogénea de potenciales subyace en el modelo de interacción constante (CI) de puntos cuánticos (QDs) y se relaciona con la deslocalización y la invariación de KS orbitarios, el cambio idéntico niveles de KS y una definición natural de la capacitancia QD. Se presentan los resultados del cálculo de un fullereno C60 y un nanotubo de carbono de pared simple. Aunque la homogeneidad de la variación potencial no es perfecta, parece conducir a una aproximación bastante buena del modelo CI a los espectros de energía además de estos sistemas.

Origen De La Diversidad De ADN Mitocondrial De Yaks Domésticas

BMC Evolutionary Biology. 2006  |  Pubmed ID: 16995938

Antropológicamente, la domesticación de plantas y animales es sumamente importante. Estudios previos han revelado una tendencia general para las poblaciones de especies pecuarias incluir profundamente divergentes linajes maternos, indicando que ellos fueron domesticados en eventos múltiples, independientes de las poblaciones silvestres genéticamente discretas. Sin embargo, en Búfalo del agua, hay sugerencias que una bifurcación profundamente maternal similar pudo haber originado de una sola población. Estas hipótesis raramente han sido rigurosamente probadas por falta de suficientes muestras salvajes. Para investigar el origen del yak doméstico (Poephagus grunnies), analizábamos 637 bp del ADNmt maternal heredada de 13 yaks salvajes (incluyendo ocho yaks salvajes de una pequeña población en el oeste Qinghai) y 250 yaks domesticados de grandes regiones ganaderas.

Estructura Genética De La Variación Y La Población De Langosta Migratoria Oriental, Locusta Migratoria Manilensis, En China Por Aloenzimas, Prosigue-PCR Y Marcadores AFLP

Biochemical Genetics. Oct, 2006  |  Pubmed ID: 17028785

Análisis de aloenzimas, microsatellite primer PCR (SSRP-PCR), y técnicas de polimorfismo (AFLP) de longitud de fragmentos amplificados fueron utilizadas para determinar la estructura genética de la diversidad y población de la China oriental langosta migratoria, Locusta migratoria manilensis. Un total de 299 marcadores PCR (67 SSRPs y 232 AFLPs) fueron detectados en ocho poblaciones, de los cuales 98.7% eran los marcadores polimórficos. La proporción de loci polimórficos (95.5-98.8%) por marcadores SSRP + AFLP indicó diferencias significativas entre las poblaciones y todas las poblaciones expuestas a un nivel similar de variabilidad, resultados de los análisis de aloenzimas demostraron que 19 loci dieron lugar a un menor nivel de polimorfismo (55,6-66.7%). Las distancias genéticas entre las poblaciones fueron relativamente bajas. Índice de Shannon y diversidad de genes de Nei demostraron baja diferenciación entre las poblaciones. Análisis de aloenzimas, sin embargo, reflejan mayor similitud y menor diferenciación entre las poblaciones que se muestra por marcadores prosigue y AFLP. Neighbor-joining dendrogramas derivado tanto del aloenzimas y marcadores SSRP + AFLP demostraron que las distancias genéticas entre las poblaciones de langosta migratoria oriental chino no fueron muy influenciadas por la distancia geográfica y hábitats de cría.

Estructura Genética De La Población Y La Diversidad De Lamiophlomis Rotata (Lamiaceae), Una Especie Endémica De La Meseta De Qinghai-Tíbet

Genetica. Sep-Nov, 2006  |  Pubmed ID: 17028966

Lamiophlomis rotata (Lamiaceae), una planta medicinal perenne, es endémica de la Meseta Qinghai-Tíbet. Un total de 188 personas de ocho poblaciones naturales de L. rotata en la meseta de Qinghai-Tíbet (cuatro de Tíbet, dos de Yunnan y dos de Qinghai) se analizaron mediante repeticiones de la secuencia intersimple (ISSR) y técnicas de ADN (RAPD) polimórfico amplificado al azar. Nuestros resultados revelaron que el nivel de variación genética en L. rotata era relativamente alto (P = 94.85%, I = 0.440 +/-0.220, sistema = 0,289 +/-0.028). Se detectaron tres grupos genéticos correspondientes a las tres regiones geográficas, sugiriendo la estructura geográfica significativa. Nuestros resultados sugieren que el patrón geográfico altamente estructurado en L. rotata podría representar la divergencia evolutivos procesos asociados con la elevación de las meseta de Qinghai-Tíbet y cuaternario oscilaciones climáticas. Estos resultados implican que deben conservarse in situ para la conservación de esta especie como muchas poblaciones como sea posible. Dada su variabilidad genética y la distribución periférica, Qinghai y Yunnan poblaciones deben asignarse prioridad para la conservación. Estrategias de cosecha óptima, domesticación y cultivo de tejidos de L. rotata desarrollarse tan pronto como sea posible para garantizar su uso sostenible.

Secuencias Del Genoma Integral De Dos Coronavirus Del SRAS En Murciélagos De Herradura Y Análisis De La Variación Genética

The Journal of General Virology. Nov, 2006  |  Pubmed ID: 17030870

Murciélagos fueron identificados recientemente como reservorios naturales del coronavirus del SRAS (SL-CoV) o virus del tipo de coronavirus del SRAS. Estos virus, junto con el coronavirus SARS (SARS-CoV) aislado de humanos y civeta de las palmeras, forman un grupo distintivo dentro del coronavirus del grupo 2 del género Coronavirus, llamado tentativamente grupo 2b (G2b). En este estudio, se determinaron las secuencias de dos adicionales grupo 2b coronavirus (G2b-CoVs) de herradura de genoma completo bat Rhinolophus ferrumequinum (G2b-CoV Rf1) y Rhinolophus macrotis (G2b-CoV Rm1). Los aislamientos de murciélago G2b-CoV tienen una organización genoma idéntico y compartan una identidad de secuencia de genoma total del 88-92% entre sí y entre ellos y los humanos/civet aísla. Las regiones más variables se encuentran en los genes que codifican nsp3, ORF3a, proteína de espiga y ORF8 al palo y humanos/civet aísla G2b-CoV se comparan. El análisis genético demostró que una población diversa de G2b-CoV existe en el hábitat de murciélagos y ha evolucionado de un antepasado común del SARS-CoV.

Teorema De Koopmans' Para Grandes Sistemas Moleculares Dentro De La Teoría Funcional De La Densidad

The Journal of Physical Chemistry. A. Nov, 2006  |  Pubmed ID: 17064189

Se muestra que en teoría funcional de la densidad (DFT), Teorema de Koopmans' para un gran sistema molecular puede ser indicado como sigue: la energía de ionización del sistema es igual a la negativa de la más alta energía del orbital molecular ocupado (HOMO) más la energía electrostática culombio de quitar un electrón del sistema, o equivalente, la energía de ionización de un sistema de N electrones es la negativa de la media aritmética de la energía HOMO de este sistema y el menor orbital molecular desocupado (LUMO) energía de la (N - 1)-sistema de electrones. Se discuten las relaciones entre el teorema de 'este Koopmans DFT y sus homólogos existentes en la literatura. Algunos de los resultados anteriores se generalizan y algunos se han simplificado. Se presentan resultados del cálculo de DFT de una molécula de fullereno, un nanotubo de carbono de pared simple finito y un nanotubo de nitruro de boro finito, indicando que el teorema de 'este Koopmans sostiene aproximadamente, aunque la relajación orbital es tomada en consideración.

[Hipoxia Aguda Altura Provoca Activación Glial Marcado En El Cerebro De Ratas Adultas]

Zhongguo Ying Yong Sheng Li Xue Za Zhi = Zhongguo Yingyong Shenglixue Zazhi = Chinese Journal of Applied Physiology. Nov, 2006  |  Pubmed ID: 21155257

Estructura Genética De La Diversidad Y Población De Amarillo Camelia (Camellia Nitidissima) En China, Según Lo Revelado Por Marcadores RAPD Y AFLP

Biochemical Genetics. Oct, 2006  |  Pubmed ID: 17109218

Camelia nitidissima, una planta rara pero un recurso genético útil para el cultivo comercial de Camelias ornamentales, se distribuye en una estrecha región del sur de China y Vietnam del norte. En este estudio, los marcadores RAPD y AFLP fueron utilizados para determinar la estructura genética de la población y la diversidad de seis poblaciones naturales de C. nitidissima de Guangxi en el sur de China. Veinte iniciadores RAPD amplifican 183 bandas, de las cuales 143 bandas fueron polimórficas, y 8 pares de cartilla AFLP produjeron 502 bandas, de las cuales 364 fueron polimórficas. Análisis independientes, así como combinados de los análisis de cluster de los fragmentos RAPD y AFLP demostraron que las seis poblaciones podrían clasificarse en dos grandes grupos genéticos correspondientes a las áreas de Nanning y Fangcheng. La prueba de Mantel reveló una correlación significativa entre las distancias genéticas y geográficas de las poblaciones de C. nitidissima (r = 0.953, p = 0.036). AMOVA análisis permitió la partición de la variación genética entre grupos (36,09%), entre poblaciones dentro de los grupos (25,78%) y dentro de poblaciones (38,14%). Una comprensión de la diversidad genética y la estructura de la población de C. nitidissima en China también pueden proporcionar la penetración en la conservación y manejo de esta especie en peligro de extinción.

[Análisis Funcional Del Gen De Arroz P0491E01 Regula El Desarrollo De La Antera]

Fen Zi Xi Bao Sheng Wu Xue Bao = Journal of Molecular Cell Biology / Zhongguo Xi Bao Sheng Wu Xue Xue Hui Zhu Ban. Oct, 2006  |  Pubmed ID: 17117558

El gen de arroz P0491E01 comparte alta similitud en secuencia de aminoácidos con gen de Arabidopsis AtDAD1 (defectuoso en antera DEHISCENCE1) que desempeña un papel clave en la biosíntesis del ácido jasmónico. En este trabajo, hemos investigado la función de este gen en el desarrollo de anteras de arroz usando la estrategia de interferencia del RNA. Un fragmento del exón de 263bp fue clonado de ADN genómico de P0491E01 para construir ARNi vector pP0491RNAi. Entonces, pP0491RNAi se transformó en o. sativa japonica por transformación mediada por Agrobacterium y obtuvieron diez plantas transgénicas. Coloración de GUS y PCR el análisis confirmó que el T-DNA se integró en el genoma del arroz. Tres de las plantas transgénicas fueron hombre estéril y las otras plantas transgénicas mostraron fertilidad reducida. Citológico observación indica que desarrollo antera en la fase inicial de las plantas transgénicas estériles masculinos era normal, sin embargo, no se desarrollarían las microsporas en granos de polen maduros. Las posteriores investigaciones de la expresión del gen P0491E01 en estas líneas transgénicas por RT-PCR revelaron que su transcripción se redujo significativamente. Los resultados sugieren que el P0491E01 puede jugar un papel importante durante la última etapa de desarrollo de la antera.

PlantQTL-GE: Un Sistema Base De Datos Para La Identificación De Genes Candidatos En Arroz Y Arabidopsis Por QTL Información Y Expresión Génica

Nucleic Acids Research. Jan, 2007  |  Pubmed ID: 17142239

Hemos diseñado e implantado un sistema de bases de datos basadas en la web, llamado PlantQTL-GE, para facilitar la quantitatine rasgos locus (QTL) basado en candidato gene identificación y gene función análisis. Se recogieron un gran número de genes, la información de expresión génica en datos de microarrays y expresó etiquetas de secuencia (ESTs) y marcadores genéticos provenientes de múltiples fuentes de Oryza sativa y Arabidopsis thaliana. El sistema integra estos orígenes de datos diversos y tiene una interfaz uniforme para facilitar el acceso. Soporta consultas QTL especificar intervalos de marcador QTL o loci genómicos y muestra, en arroz o genoma de Arabidopsis, genes, datos de microarrays, ESTs y genes candidatos y genes putativos similares en la otra planta. Genes candidatos en intervalos QTL se anotan más basado en tecnologías ecológicamente racionales, datos de expresión genética de microarrays y cis-elementos en secuencias reguladoras. El sistema está disponible gratuitamente en http://www.scbit.org/qtl2gene/new/.

Simulación Computacional De Interacciones Entre El Coronavirus SARS Spike Mutantes Y Receptores Específicos De Anfitrión

Computational Biology and Chemistry. Apr, 2007  |  Pubmed ID: 17368104

Como un mecanismo adaptativo crítico, sustituciones de aminoácidos en la proteína de espiga de coronavirus (SARS-CoV) de síndrome respiratorio agudo severo podrían alterar la especificidad de unión a receptores de esta glicoproteína de envoltura y su vez conduciría a la aparición o el resurgimiento de esta zoonosis viral. Basado en las estructuras de rayos x del dominio de unión a receptores de spike SARS-CoV (RBD) en complejo con su receptor funcional (enzima convertidora de angiotensina 2, ACE2), realizamos simulaciones computacionales de interacciones entre tres representantes mutantes RBD y cuatro receptores específicos de host. Las comparaciones entre las predicciones computacionales y evidencias experimentales validar nuestros enfoques de la Bioinformática estructural. Y además las predicciones indican que algunos prototipos virales podrían utilizar la rata ACE2 mientras que las ratas podrían servir como un vector o depósito de SARS-CoV.

Caracterización Computacional Y Diseño De Neutralización Del Reconocimiento Y Anticuerpos Del Receptor De Los Coronavirus SARS

Computational Biology and Chemistry. Apr, 2007  |  Pubmed ID: 17374510

La determinación secuencial de las estructuras cristalinas de la SARS coronavirus espiga dominio receptor-obligatorio (RBD) en conjunto con su receptor celular o Anticuerpo neutralizante abrió una puerta para el diseño y desarrollo de antivirales inhibidores competitivos. Partiendo de esas estructuras complejas, llevamos a cabo caracterización computacional y diseño de la neutralización de reconocimiento y anticuerpo receptor mediada por RBD. Las comparaciones entre las predicciones computacionales y evidencias experimentales validar nuestros protocolos de Bioinformática estructural. Y los cálculos predicen una serie de sustituciones solas en RBD, receptor o anticuerpo que podría elevar notablemente las afinidades de unión de los complejos. Es razonable anticipar que nuestras hipótesis basadas en la estructura de derivados de cómputo podrían ser informativos a las futuras pruebas bioquímicas e inmunológicas.

Liberación Estimulada De Moléculas Pequeñas De Polielectrolito Nanorrevestimientos Multicapa

Chemical Communications (Cambridge, England). Apr, 2007  |  Pubmed ID: 17389977

Polielectrolitos que contienen tiol libres sirven simultáneamente como un material para Automontaje de un nanocobertura multicapa y como portador de pequeñas moléculas para el lanzamiento de la capa en respuesta a una señal ambiental.

Bioinformática Identificación Y Análisis De Schistosoma Japonicum Adenina Fosforribosiltransferasa

Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao = Journal of Southern Medical University. Mar, 2007  |  Pubmed ID: 17425969

Para identificar phosphoribosyltransferases de adenina en Schistosoma japonicum y analizar sus características estructurales.

Perfiles De Riesgo Espacial De Schistosoma Japonicum En Elsbett, Provincia De Yunnan, China

Geospatial Health. Nov, 2007  |  Pubmed ID: 18686256

Bayesiano espacial riesgo perfiles tiene promesa para mejorar nuestra comprensión de la epidemiología de enfermedades parasitarias y a las intervenciones del objetivo de una manera rentable. Aquí, presentamos los resultados de un estudio mediante modelos de variograma bayesianos mapa y predecir la seroprevalencia de Schistosoma japonicum en Elsbett, provincia de Yunnan, China, incluyendo análisis de factor de riesgo. Cuestionario y datos serológicos fueron obtenidos a través de un estudio transversal realizado en 35 aldeas seleccionadas aleatoriamente con 3.220 inscritos. Datos ambientales detectadas remotamente se derivan de bases de datos disponibles al público. Bayesiano bivariada y no-espacial se utilizaron modelos de regresión logística múltiple para identificar las asociaciones entre la seroprevalencia local y demográficos (edad y sexo), ambientales (es decir, la ubicación del pueblo, altitud, pendiente, tierra temperatura de la superficie y el índice de vegetación de diferencia normalizada) y factores socio-económicos. En el modelo bayesiano espacialmente explícito, S. japonicum seroprevalencia se asoció significativamente con el sexo, la edad y la situación de la aldea. Los machos, los menores de 10 años y habitantes de pueblos situados en las laderas escarpadas (inclinación = 20 grados) o en laderas menos empinadas de > 5 grados por encima de los 2.150 m corrían menor riesgo de seroconversión que sus contrapartes respectivas. Nuestro modelo de predicción final reveló un elevado riesgo de seroconversión en las llanuras de la región oriental del Condado de Elsbett. En conclusión, el mapa de predicción puede utilizarse para la orientación espacial de las intervenciones de control de la esquistosomiasis en el Condado de Elsbett. Por otra parte, estudios de seroprevalencia S. japonicum pueden ofrecer un medio conveniente para evaluar la presión de infección experimentada por las comunidades locales y mejorar los perfiles de riesgo en áreas donde han llegado las intensidades de prevalencia e infecciones reiteradas rondas siguientes de la administración del praziquantel.

[Efectos De Pretratamiento Espectral En La Predicción De La Cristalinidad De La Celulosa De Madera Usando Cerca De Espectroscopia De Infrarrojo]

Guang Pu Xue Yu Guang Pu Fen Xi = Guang Pu. Mar, 2007  |  Pubmed ID: 17554892

La cristalinidad de madera tiene un efecto importante sobre las propiedades físicas, mecánicas y químicas de las fibras de celulosa. Los objetivos de este estudio fueron investigar la capacidad de cerca de espectroscopia de infrarrojo (cercano NIR) para predecir la cristalinidad de la celulosa de madera y el efecto del tratamiento previo espectral en la predicción de cristalinidad en el uso de celulosa de madera cerca de espectroscopia de infrarrojo (cercano NIR). Cerca de reflectancia en el infrarrojo difuso espectros se colectaron de polvo de madera con una sonda de fibra óptica y la cristalinidad de la madera se determinó por difractómetro de rayos x (DRX) en este experimento. Los resultados mostraron que cerca de la espectroscopia infrarroja, juntada con la Plaza menos parcial (PLS) regresión podría estar correlacionada con la cristalinidad de la madera de plantaciones, y la capacidad de predicción de NIR basada en espectros originales fue mejor que el basado en los primeros segundo o derivados derivados tratados espectros. Hubo una correlación significativa entre espectros NIR y cristalinidad DRX determinado con un Pearson de 0.950 y una baja RMSEP. Cerca de la espectroscopia infrarroja, juntada con datos multivariados anlaysis ha demostrado para ser un método rápido y preciso para predicción rápida de cristalinidad de madera.

Carga Controlada Y Liberación De Un Fármaco De Modelo De Polipéptido Nanofilms Multicapa

Nanomedicine : Nanotechnology, Biology, and Medicine. Jun, 2007  |  Pubmed ID: 17572357

Una preocupación importante de la medicina es hoy la liberación de compuestos terapéuticos. Vectores para tales compuestos deben ser biocompatibles. Idealmente, cargando una droga en el vehículo de entrega será un proceso simple, y propiedades de vehículo permitirá el control sobre el perfil de liberación del fármaco bajo condiciones deseadas. Aquí, polipéptido multicapa nanofilms han sido preparados por capa-por-capa electrostática Automontaje para estudiar la carga post-fabrication y el lanzamiento de un modelo terapéutico, azul de metileno (MB). Liberación y el cargamento de droga se han caracterizado por espectroscopía óptica para diseños de péptidos diferentes con valores de pH diferentes y morfología superficial de la película se ha caracterizado por microscopía de fuerza atómica (AFM). Se encontraron diferencias en la estructura del péptido influir MB carga y liberar bajo otra forma fija condiciones. Lanzamiento también está influenciada por el pH, concentración de sales y número de capas de "tapado". Aunque se necesitarán más investigaciones agotar el potencial de películas de múltiples capas del polipéptido, presentes resultados sugerirían que la tecnología es prometedora considerable para aplicaciones en medicina.

[Discriminación De Deterioro Biológico De Madera Por Suave Modelado Independiente De Reconocimiento De Patrones De Analogía (SIMCA) Clase Basado En El Análisis De Componentes Principales]

Guang Pu Xue Yu Guang Pu Fen Xi = Guang Pu. Apr, 2007  |  Pubmed ID: 17608176

Madera, como materiales de biomasa, tiende a ser atacadas por microorganismos, y su estructura podría ser destruida rápidamente por decaimiento biológico. Por lo tanto, resulta significativo rápidamente y con precisión detectar o identificar decaimiento biológico en madera. Recientemente, una amplia investigación ha demostrado cerca de espectroscopia de infrarrojo (cercano NIR) y suave modelado independiente de la analogía de la clase (SIMCA) puede utilizarse para discriminar o detectar una amplia variedad de alimentos, medicinas y productos agrícolas. El uso de NIR junto con análisis de componentes principales (PCA) y reconocimiento de patrones SIMCA para detectar deterioro biológico de madera fue investigado en el presente documento. Los resultados mostraron que la espectroscopia NIR juntada con el reconocimiento de patrones SIMCA podría utilizarse para detectar rápidamente el decaimiento biológico en madera. La exactitud de la discriminación por el modelo SIMCA basado en el conjunto de entrenamiento para la no-decaimiento, blanco-putrefacción y podredumbre parda del decaimiento muestras fueron 100%, 82. 5% y el 100%, respectivamente; y que para las muestras para la prueba fueron 100%, 85% y 100%, respectivamente. Sin embargo, algunas muestras de decaimiento blanco-putrefacción fueron mis-discriminated como el decaimiento de la podredumbre parda, para que las principales razones podrían ser que el conjunto de la formación no tiene suficientes muestras típicas, y existe una ligera diferencia entre blanco-putrefacción y podredumbre parda decaimiento durante la primera etapa de decaimiento.

Las Infecciones Por Helmintos Y Análisis De Factor De Riesgo Entre Los Habitantes De Elsbett, Provincia De Yunnan, China

Acta Tropica. Oct, 2007  |  Pubmed ID: 17719553

Mientras que las infecciones por helmintos transmitidos por el suelo son comunes en toda China, la importancia de la salud pública de Schistosoma japonicum y helmintiasis transmitidas por los alimentos es más focalizada. Solamente pocos estudios han investigado la epidemiología local de las infecciones por helmintos en la China rural, incluyendo análisis de factor de riesgo. Recogimos muestras de heces y sangre de 3220 individuos, 5-88 años, de 35 pueblos seleccionados al azar de Elsbett, provincia de Yunnan, China. Muestras de heces fueron anestesiadas con la técnica de Kato-Katz y examinadas para huevos de helmintos. Se analizaron muestras de sangre de Trichinella spp., S. japonicum y anticuerpos específicos cisticercos. Se recogieron datos sobre factores de riesgo individuales y a nivel de familia, utilizando cuestionarios. La prevalencia de Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Taenia spp. y anquilostomas fue de 15,4%, 3,5%, 1,7% y 0.3%, respectivamente. La seroprevalencia de Trichinella spp fue de 58,8% y cisticercosis 18,5%. La tasa de positividad de huevo de S. japonicum en las 13 aldeas endémicas conocidas fue de 2,7%, y la correspondiente seroprevalencia fue 49.5%. Observamos una fuerte heterogeneidad espacial en la situación económica de las familias. S. japonicum las infecciones fueron más frecuentes entre los Han que nacionalidad Bai (odds-ratio (OR) = 3.77, intervalo de confianza (IC) del 95% = 1.97-7.23) y los cultivadores de tabaco (OR = 3.66, IC del 95%: = 1.77-7.60) y sólo se encontró a elevaciones por debajo de 2150 metros sobre el nivel del mar. A. lumbricoides y Taenia spp. infecciones fueron más prevalentes en altitudes superiores a 2150 m comparados con ajustes más bajos (o = 1.51, IC del 95% = 1,24-1.84 y o = 5.32, IC 95% = 3.42-8,28, respectivamente). Lo contrario fue encontrado para T. trichiura (OR = 0.31, IC 95% = 0.14-0,70). Nuestros resultados pueden guiar el diseño y la orientación espacial de las intervenciones de control contra las infecciones por helmintos en el Condado de Elsbett.

MSOAR: Un Alto Rendimiento Ortólogo Asignación Sistema Basado En Cambio De Genoma

Journal of Computational Biology : a Journal of Computational Molecular Cell Biology. Nov, 2007  |  Pubmed ID: 17990975

La asignación de orthologous genes entre un par de genomas es un problema fundamental y desafiante en la genómica comparativa, ya que muchos métodos computacionales para resolver diversos problemas biológicos críticamente dependen de la buena fe ortólogos como entrada. Mientras que generalmente se realiza utilizando búsqueda de similitud de secuencia, hemos propuesto recientemente un nuevo enfoque combinatorio que combina la similitud y genoma el cambio de secuencia. Este documento sigue el desarrollo del enfoque y une eventos de cambio de genoma y duplicación (post-speciation) en un marco único bajo el principio de la parsimonia. En este marco, orthologous genes se supone que corresponden entre sí en el escenario evolutivo más parsimonioso reordenamiento del genoma y duplicación del gene (post-speciation). Además de varias contribuciones algorítmicas originales, el método mejorado permite la detección de inparalogs. Siguiendo este enfoque, hemos implementado un sistema de alto rendimiento para ortólogo de asignación en una escala de genoma, llamada MSOAR y aplicado al ser humano y genomas de ratón. Se mostrará el resultado, MSOAR es capaz de encontrar que hicieron 99 ortólogos verdaderas más que el programa INPARANOID. En comparación con el algoritmo iterativo ejemplar en datos simulados, MSOAR realiza favorablemente en cuanto a la exactitud de la asignación. También validamos nuestros pares ortólogo principal prevista entre humanos y de ratón utilizando conjuntos de datos de asignación pública ortólogo, synteny información y clasificación de función del gen. Estos resultados de la prueba indican que nuestro enfoque es muy prometedor para la asignación de ortólogo de genoma. Material suplementario y programa MSOAR están disponibles en http://msoar.cs.ucr.edu.

Un Marco Probabilístico Para El Seguimiento De Tejidos Blandos Deformables En Cirugía Mínimamente Invasiva

Medical Image Computing and Computer-assisted Intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention. 2007  |  Pubmed ID: 18044550

El uso de algoritmos de visión basada en cirugía mínimamente invasiva ha atraído considerable atención en los últimos años debido a su potencial en servicios de recuperación de deformación del tejido 3D in situ para orientación quirúrgico intraoperatorio y navegación robótica. Hasta el momento, un gran número de descriptores de la característica se han propuesto en visión por computador pero dirigir la aplicación de estas técnicas de cirugía mínimamente invasiva ha mostrado problemas significativos debido a la deformación del tejido de forma libre y diversos aspectos visuales de escenas quirúrgicas. Este trabajo evalúa los actual descriptores de la característica del estado-of-the-art en visión por computador y describe sus problemas de funcionamiento respectivo cuando se utiliza para el seguimiento de la deformación. Se presenta un novela marco probabilístico de selección de los descriptores más discriminativos y un método de fusión Bayesiano se utiliza para aumentar la precisión y la persistencia temporal de deformación de tejidos blandos de seguimiento. Se evalúa el desempeño del método propuesto con ambos datos simulados con la verdad de la tierra conocida, así como secuencias de vídeo en vivo, grabadas de robótica asistida con MIS.

Propiedades Termodinámicas Y Estructurales De Las Soluciones De Metanol-agua Utilizando Modelos De Interacción No Aditiva

Journal of Computational Chemistry. May, 2008  |  Pubmed ID: 18074339

Estudiamos a granel propiedades estructurales y termodinámica de soluciones de metanol-agua mediante simulaciones de dinámica molecular usando potenciales de interacción novela basados en el formalismo de equilibrado (carga fluctuante) cargo para tener en cuenta explícitamente la polarización molecular nivel atómico. El estudio utiliza el potencial de TIP4P-FQ para interacciones de agua y la (química en mecánica Molecular de HARvard) basadas en CHARMM carga fluctuante potencial interacciones metanol-metanol y agua metanol. En términos de propiedades de solución a granel, discutimos líquidas densidades, entalpías de mezcla, constantes dieléctricas, constantes de autodifusión, así como propiedades estructurales relacionadas con estructura de vinculación del hidrógeno local en funciones de distribución radial y el análisis de conglomerados. Exploramos más la respuesta electrónica de agua y metanol en los diferentes ambientes locales establecidos por la interacción de cada especie predominante con las moléculas de las otras especies. El actual campo de fuerza para la interacción del alcohol-agua realiza razonablemente bien para la mayoría de las propiedades, con la mayor desviación del experimento observada los exceso entalpías de mezclas, que se predicen que sea demasiado favorable. Esto es cualitativamente consistente con la sobrestimación de la energía de interacción de fase gaseosa de metanol-agua para la energía más baja conformer (metanol como donantes de protones). Energías de hidratación libre de metanol en agua TIP4P-FQ se predicen que -5,6 +/-0,2 kcal/mol, respetable de acuerdo con el valor experimental de 5.1 kcal/mol. Con respecto a la microestructura de la solución, el presente análisis de agrupamiento sugiere que el entorno de microescala para concentraciones donde seleccionadas cantidades termodinámicas alcanzan valores extremal es descrito por una estructura de red de bipercolating.

Cirugía Transsphenoidal En Un Paciente Con Acromegalia Y Síndrome De McCune-Albright: Aplicación De Neuronavegación

Journal of Neurosurgery. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 18173327

El síndrome de McCune-Albright (MAS) se caracteriza por una tríada clínica de displasia fibrosa poliostótica, máculas hiperpigmentadas café-au-lait y endocrinopatías Hipersecretoras. La acromegalia es una manifestación infrecuente de la alteración endocrina asociada a MAS, y el papel de la cirugía en el manejo de estos casos ha sido un tema de debate. Los autores presentan el caso de un hombre de 35 años de edad con MAS que también fue diagnosticada con acromegalia, hiperprolactinemia y macroadenoma pituitario. El paciente tenía una historia de 18 años de la displasia fibrosa con el hueso frontal derecho y costillas, así como múltiples endocrinopatías, pero no cutáneas hiperpigmentadas macules. Una prueba de tolerancia de glucosa oral demostró la supresión parcial de los niveles plasmáticos de la hormona de crecimiento (GH). El paciente experimentó la resección del tumor pituitario, realizada con ayuda de Neuronavegación, transsphenoidal y tolera bien el procedimiento. Después de la cirugía, tanto niveles de GH y prolactina volvieron a la normalidad. Estos resultados sugieren que la cirugía transsphenoidal asistida por Neuronavegación puede quitar los adenomas pituitarios asociados a MAS y tratar con éxito las anormalidades endocrinas subyacentes.

Semillas Del Tíbet Se Almacenarán Como Cambios Climáticos

Nature. Mar, 2008  |  Pubmed ID: 18322501

[Impacto De Todo-trans-retinoico En El Perfil De Expresión Génica De La Línea De Células De Glioblastoma SHG-44]

Ai Zheng = Aizheng = Chinese Journal of Cancer. May, 2008  |  Pubmed ID: 18479597

Astrocitoma tiene la tendencia de la progresión maligna. Terapia de inducción de diferenciación puede inducir la diferenciación del tumor y hacer que las células tumorales se convierten en menos malo o incluso normal. Este estudio fue investigar el impacto de todo-trans-retinoico (ATRA) en el perfil de expresión génica de la línea de células de glioblastoma SHG-44 y proporcionar datos básicos para la investigación adicional en terapia génica de astrocitoma humano.

[Discriminación De Deterioro Biológico De Madera Por NIR Y Parcial Menos Plazas Análisis Discriminante (PLS-DA)]

Guang Pu Xue Yu Guang Pu Fen Xi = Guang Pu. Apr, 2008  |  Pubmed ID: 18619300

Una amplia investigación ha demostrado cerca de espectroscopia de infrarrojo (cercano NIR) y análisis discriminante de cuadrados mínimos parciales (PLS-DA) puede utilizarse para discriminar rápidamente o para detectar una amplia variedad de alimentos, medicinas y productos agrícolas. El uso de NIR junto con PLS-DA para detectar deterioro biológico de madera fue investigado en el presente documento. Los resultados mostraron que la correlación entre la variable categoría prevista de calibración y validación y la variable medida categoría es significativa con un coeficiente de correlación (r) 0.94 y baja de la SEC y SEP (< 0.17); la exactitud del discriminante para el no-decaimiento, muestras de decaimiento blanco-putrefacción y podredumbre parda son 100% (desviación < 0.5) por el modelo PLS-DA basado en el equipo de prueba de muestras; la exactitud del discriminante por Modelo PLS-DA es mejor que el modelo SIMCA. Se sugiere que la espectroscopia NIR juntada con PLS-DA podría utilizarse para detectar rápidamente el deterioro biológico de madera.

Una Distinción Genética Preliminar De Cuatro Peces Coilia (Clupeiformes: Engraulidae) Deducido De Secuencias De ADN Mitocondrial

Genetika. Mar, 2008  |  Pubmed ID: 18664145

Para comprender la genética distinción entre cuatro Coilia fishes,i.e., C. ectenes, C. e. taihuensis, C. mystus y C. grayii, combinado citocromo b (cytb), rRNA 12S y 16S rRNA secuencias genéticas fueron obtenidas y analizadas. Los resultados son los siguientes: 1) vecino-joining (NJ) y árboles de máxima parsimonia (MP) fueron construidos con 1000 repeticiones bootstrap. Apoyaron que Coilia peces consistió en dos clados: C. grayii forman un grupo monofilético, y las muestras de resto forman el otro grupo monofilético; 2) las diferencias topológicas entre el árbol de NJ y el árbol de la MP se verificó Templeton prueba, indicando que sus diferencias son insignificantes (P 0.05 >); y 3) Kimura 2-parámetros distancias entre las muestras de ectenes C., e. C. taihuensis y C. mystus son todos no más grande que el 1,6%, y la mayoría de ellos es entre 0,0% y 0,9%. Ectenes C., e. C. taihuensis y C. mystus están estrechamente relacionados y que pueden ser sus diferencias bajo la subespecie.

PBmice: Un Sistema De Base De Datos Integrada De Mutaciones Insertional PiggyBac (PB) Y Sus Caracterizaciones En Ratones

Nucleic Acids Research. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 17932058

ADN transposón piggyBac (PB) es un mutágeno recién creado para la mutagénesis a gran escala en ratones. Hemos diseñado e implantado un sistema de base de datos integrada denominado PBmice (centro de información de mutagénesis PB) para almacenar, recuperar y Mostrar la información derivan de las inserciones de PB (insertos) en el genoma del ratón. Este sistema se centra en insertos con información incluyendo su localización genómica y que flanquean las secuencias genómicas, los niveles de expresión de los genes de golpe y los patrones de expresión de los genes atrapados si se usó un vector de captura. También archiva los datos de fenotipado de ratón con insertos y permite a los usuarios realizar búsquedas rápidas y avanzadas para genotípica y fenotípica información relevante a un particular o un conjunto de inserciones. Información basada en la secuencia puede ser referencias cruzada con otras bases de datos genómicos como Ensembl, BLAST y GBrowse herramientas utilizadas en PBmice ofrecen búsqueda mejorada y exhibición para información adicional pertinente para insertos. El número total y distribución genómica de PB inserta, así como la disponibilidad de cada línea de insertional PB puede verse también con interfaces fáciles de usar. PBmice está disponible en http://www.idmshanghai.cn/PBmice o http://www.scbit.org/PBmice/.

Inhibición De Todo-trans-retinoico Sobre La Expresión Génica De MDM2 En Línea De Células De Astrocitoma SHG-44

Neuroscience Bulletin. Oct, 2008  |  Pubmed ID: 18839023

Para investigar el impacto de todo-trans-retinoico (ATRA) sobre la expresión génica de MDM2 en línea de células de astrocitoma SHG-44 y para proporcionar datos básicos para investigaciones adicionales sobre el mecanismo de la progresión y la terapia génica de astrocitoma humano.

Diversidad Genética De Plantas En Peligro De Extinción Y Relictus Abies Ziyuanensis (Pinaceae) Había Revelada Por AFLP Y SSR Marcadores

Genetica. May, 2008  |  Pubmed ID: 17661154

Abies ziyuanensis es una especie en peligro de extinción abeto endémica del sur de China. A diferencia de otras especies de Abies en el que se distribuyen en zonas con climas fríos, a. ziyuanensis está restringido a varias localidades aisladas de la isla-como en montañas subtropicales. En este estudio, utilizamos el polimorfismo de la longitud del fragmento amplificado dominante (AFLP) y secuencia simple codominantes repite marcadores (SSR) para inferir la estructura genética de a. ziyuanensis. Siete poblaciones de 139 personas fueron muestreadas en toda su distribución todo. A. ziyuanenesis tiene un relativamente bajo nivel de variación genética, con una diversidad genética promedio por habitantes (él) de 0.136 (AFLP) y 0,337 (SSR), que es más bajo que el de otras especies endémicas divulgados basados en el mismo tipo de marcador. Observamos diferenciación de alta población, con Gst = 0482 (AFLP) y Fst = 0.250 (SSR), entre las siete poblaciones. AMOVA también detectó significativa diferenciación entre poblaciones (Phist (AFLP) = 0.550 y Phist (SSR) = 0,289) y entre regiones (Phict (AFLP) = 0.139 y Phict (SSR) = 0.135) en ambos tipos de marcador. Tanto las fuerzas evolutivas actuales (por ejemplo, deriva genética resultante de tamaño pequeño de la población) y los acontecimientos históricos (por ejemplo, la contracción de la población y la fragmentación durante y después de los ciclos glaciares cuaternarios) puedan haber contribuido a la estructura genética en a. ziyuanensis.

[Construcción E Identificación De La Rata GDNF Gen Recombinante Retroviral Vector Y Gene Transfección a NSC]

Sheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi = Journal of Biomedical Engineering = Shengwu Yixue Gongchengxue Zazhi. Jun, 2008  |  Pubmed ID: 18693448

Por genética técnica recombinante, el cDNA GDNF rata fue recombinated a la pLXSN del vector retroviral. El plásmido recombinante pLXSN-GDNF fue verificado por digestión con endonucleasas de restricción y PCR. Luego las células madre neurales (NSCs) fueron infectadas con pLXSN-GDNF. Inmunocitoquímica, RT-PCR y western-blot se utilizan para detectar el efecto de la transfección. Resultados mostraron que el cDNA GDNF fue clonado en un vector retroviral pLXSN correctamente, y el pLXSN-GDNF puede infectar NSCs eficientemente. Estos resultados proporcionan la posibilidad de trasplante y terapia génica con GDNF de lesiones y enfermedades del sistema nervioso.

MPSQ: Una Herramienta Web Para La Búsqueda De La Proteína-estado

Bioinformatics (Oxford, England). Oct, 2008  |  Pubmed ID: 18697766

MPSQ (multi-protein-Estados consulta) es una herramienta basada en web para el descubrimiento de los Estados de la proteína (interacciones biológicas por ejemplo, modificaciones covalentes, localizaciones celulares). En particular, grandes grupos de genes pueden utilizarse para búsqueda de mapas de la red de transición de estado enriquecido (NMs) y facilitar la interpretación de los experimentos de escala genómica como microarrays de características. Uno NM recoge todos los Estados catalogados de una proteína, así como las transiciones mutuas entre los Estados. Para el NM devuelto, visualización del gráfico se ofrece para fácil comprensión y guiar más análisis.

Catena-Poly[[bis-[2-chloro-6-(1H-1,2,4-triazol-1-yl-κN)pyridine]cadmium(II)]-di-μ-thio-cyanato-κN:S;κS:N]: Un Polímero Unidimensional De La Coordinación

Acta Crystallographica. Section E, Structure Reports Online. 2008  |  Pubmed ID: 21201062

En la estructura cristalina del título complejo, [Cd(NCS)(2)(C(7)H(5)ClN(4))(2)](n), el Cd(II) átomo se encuentra en un centro de inversión cristalográfica y asume una geometría distorsionada octa-hedral. El mol-ecule 2-chloro-6-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)pyridine actúa como un ligando terminal. Los ligandos de thio-cianato funcionan como μ (1,3)-puente unidades adyacentes Cd(II) átomos de conexión con una separación de 5.7525 (11) Å, formando una cadena unidimensional a lo largo de la un eje.

Diaqua-bis[2-(2-pyridylmeth-OXY)pyrazine-κN]bis-(Thio-cyanato-κN)Cobalt(II)

Acta Crystallographica. Section E, Structure Reports Online. 2008  |  Pubmed ID: 21201079

En el complejo, de título [Co(NCS)(2)(C(10)H(9)N(3)O)(2)(H(2)O)(2)], el ion Co(II) está situado en un eje de rotación de doble cristalográficos y está en un ambiente de coordinación ligeramente distorsionada octa-hedral CoN(4)O(2). El Ángulo diedro entre los anillos de piridina y pirazina es 85.86 (10) °. En la estructura cristalina, enlaces de hidrógeno intermolecular O-H⋯N y O-H⋯S enlace complejo mol-ecules en una red tridimensional.

Dichlorido(2,6-dipyrazol-1-ylpyridine)zinc(II)

Acta Crystallographica. Section E, Structure Reports Online. 2008  |  Pubmed ID: 21580830

En el complejo, de título [ZnCl(2)(C(11)H(9)N(5))], el ion Zn(II) asume una geometría de coordinación distorsionada bipiramidal trigonal-ZnN(3)Cl(2) [Zn-N = 2,1397 16-2.2117 (17) Å, Zn-Cl = 2.2470 (6) y 2.2564 (6) Å]. El embalaje de cristal exhibe las interacciones apilamiento π-π entre los ligandos de 2, 6-dipyrazol-1-ylpyridine de vecinos mol-ecules.

Catena-Poly[[[2,6-bis-(pyrazol-1-yl-κN)pyridine-κN](nitrato-κO,O')cadmium(II)]-μ-thio-cyanato-κN:S]

Acta Crystallographica. Section E, Structure Reports Online. 2008  |  Pubmed ID: 21580839

En la estructura cristalina de título, [Cd(NCS)(NO(3))(C(11)H(9)N(5))](n), el único Cd(II) ion es coordinado en un entorno de penta-gonal-bipiramidal distorsionado. Los ligandos axiales thio-cianato actúan en un μ (1,3)-puenteándolos para conectar los iones Cd(II) relacionados con la simetría en cadenas unidimensionales a lo largo de [010]. Además, hay contactos de C-H⋯O intermolecular entre cadenas.

Estructura De La Población Comparativa De Zumaque Chino Pulgón Schlechtendalia Chinensis Y Su Anfitrión Principal-planta Rhus Chinensis

Genetica. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 17503190

La mayor parte de nuestra comprensión actual de la estructura de la población comparativa ha sido provienen de estudios del parásito-hosts, mientras que la comparación genética de nuez de Galla-pulgones y sus plantas hospederas siguen siendo mal documentado. Aquí examinamos la estructura genética de la población del zumaque chino pulgón Schlechtendalia chinensis y su único anfitrión principal-planta Rhus chinensis en una provincia montañosa en el oeste de China usando marcadores (ISSR) repetición de secuencia inter-simple. A pesar de ser muestreado de un rango geográfico montañoso, análisis de varianza molecular (AMOVA) demostraron que la mayoría de la variación genética se produjo entre los individuos dentro de las poblaciones del pulgón y su huésped. Las poblaciones de pulgón fueron encontradas para ser estructurado de manera similar a sus poblaciones de host primario (valores de F (ST) fueron 0.239 para el pulgón y 0.209 para su huésped), sugiriendo que hay patrones similares de flujo genético entre las poblaciones del pulgón y entre las poblaciones de su planta hospedera. Las distancias genéticas (F (ST) / 1 - F (ST)) entre las poblaciones de pulgón y entre su planta hospedera poblaciones fueron correlacionadas, indicando que sitios con poblaciones genéticamente similares de la planta huésped no siempre pueden tener poblaciones genéticamente similares de pulgón. La falta de relaciones entre matrices de distancia genética y geográfica sugirió que el aislamiento por distancia (IBD) desempeñó un papel insignificante en este nivel. Esto se puede atribuir principalmente al efecto fundador, deriva genética y la relativa pequeña escala espacial entre poblaciones.

[Resultados Microsurgical Transsphenoidal De Los Prolactinomas No Invasivos]

Zhonghua Wai Ke Za Zhi [Chinese Journal of Surgery]. Feb, 2008  |  Pubmed ID: 18683769

Analizar los resultados de microsurgical de transsphenoidal de los prolactinomas no invasivos, con el fin de proporcionar referencia para su opción de tratamiento.

Metabolismo Fotosintético De Las Plantas C3 Muestra Altamente Cooperativa Regulación Bajo Entornos Cambiantes: Un Análisis De Los Sistemas Biológicos

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2009  |  Pubmed ID: 19129487

Estudiamos la robustez del metabolismo fotosintético en los cloroplastos de las plantas C(3) bajo estrés hídrico y en altas condiciones de concentración de co (2) utilizando un método llamado minimización de metabólico ajuste dinámico flujo Balance análisis (M_DFBA). Metabolismo fotosintético en los cloroplastos de las plantas C(3) aplica Reglamento altamente cooperativo para reducir al mínimo la fluctuación de los perfiles de concentración del metabolito ante perturbaciones transitorias. Nuestro trabajo sugiere que la regulación altamente cooperativo asegura la robustez del sistema biológico y que existe una cooperación más estrecha en condiciones de perturbación que en condiciones normales. Esto da lugar a minimizar las fluctuaciones en los perfiles de las concentraciones del metabolito, que es la clave para mantener la función de un sistema. Nuestros métodos de ayudar a entender estos fenómenos y los mecanismos de robustez para redes metabólicas complejas en procesos dinámicos.

La Aportación De Elementos Cis-reguladores Al Patrón De Coexpresión De Parejas Gene Cara a Cara

Science in China. Series C, Life Sciences / Chinese Academy of Sciences. Jan, 2009  |  Pubmed ID: 19152086

Regulación de la transcripción es una de las tuberías más críticas en el proceso biológico, en el que elementos cis desempeñan el papel como reguladores de la expresión de genes. Intentamos deducir los principios que inspiran la coexpresión de pares de genes "cara a cara" mediante el análisis de las actividades o comportamientos de los cis-elementos compartidos. Se realizó un análisis de componentes de red para estimar el impacto de cis-elementos de promotores de genes y sus actividades bajo diferentes condiciones. Nuestros descubrimientos revelan cómo biológica sistema utiliza los elementos reguladores para controlar el patrón de expresión de pares de genes "cara a cara" y el sistema de regulación de la transcripción entera.

MapNext: Una Herramienta De Software Para La Detección De SNP De Secuencia Corta Y Alineaciones Empalmadas Y Unspliced Lee

BMC Genomics. 2009  |  Pubmed ID: 19958476

Tecnologías de secuenciación de última generación proporcionan avenidas emocionantes para estudios de genómica transcriptómica y población. Hay una creciente necesidad de realizar alineaciones empalmadas y unspliced de transcripción corto Lee en un genoma y estimación alelo menor frecuencia de referencia de secuencias de las muestras de la población.

Desarrollo De Un Sistema De Base De Datos Para El Mapeo De Insertional Mutaciones En El Genoma De Ratón Con Datos Experimentales a Gran Escala

BMC Genomics. 2009  |  Pubmed ID: 19958505

Mutagénesis insertional es un método eficaz para estudios de genómica funcional en varios organismos. Rápidamente puede generar mutaciones fácilmente manejables. Actualmente está realizando una mutagénesis insertional a gran escala con el transposón piggyBac (PB) en ratones en el Instituto de Biología del desarrollo y la Medicina Molecular (IDM), Universidad de Fudan, en Shanghai, China. Este proyecto se lleva a cabo mediante colaboraciones entre varios grupos de supervisión de medidas experimentales interconectados y genera un gran volumen de datos experimentales continuamente. Por lo tanto, el proyecto se llama para un sistema de base de datos eficiente para la grabación, gestión, análisis estadístico y el intercambio de información.

Expresados Diferencialmente Genes De La Línea De Células De Glioblastoma Que SHG-44 Tratados Con All-trans-retinoico in Vitro

Journal of Clinical Neuroscience : Official Journal of the Neurosurgical Society of Australasia. Feb, 2009  |  Pubmed ID: 19091570

Citometría de flujo, inmunocitoquímica, ensayo de la curva de crecimiento y morfología fueron utilizados para investigar los efectos de todo-trans-retinoico (RA) sobre la proliferación celular, la progresión del ciclo celular y la diferenciación de la línea celular de astrocitoma SHG-44 de glioblastoma multiforme (grado IV de la Organización Mundial de la salud). Los genes expresados diferencialmente de tratados con RA y normal SHG-44 se identificaron mediante microarrays de cDNA después de la línea celular SHG-44 fue tratada con 10muM RA durante 3 días. Validación de algunos genes expresados diferencialmente realizó análisis de Northern Blot. La expresión de la proteína ácida fibrilar glial (GFAP), aumentó notablemente en las células tratadas con RA SHG-44. Otros cambios incluyeron una forma de transporte corto, pequeño núcleo, disminuyeron la proporción de karyoplasm, la formación de procesos citoplásmicos finos crecientes, reducción el crecimiento de la célula y un aumento de 15% en poblaciones de células de Fase G0/G1. Además, se identificaron 42 genes conocidos con expresión alterada de los microarrays de cDNA. Había regulación estable de MDM2 y UGB, así como la sobreexpresión de SOD2, CSTB y G3BP cuando RA tratados SHG-44 se comparó con normal SHG-44. RA simultáneamente suprimió significativamente la proliferación de células de SHG-44 así como inducida por diferenciación y alteración de la expresión génica.

Efectos De La Polarización Electrostática E Hidratación Hidrofóbica En Soluciones De Etanol-agua De Simulaciones De Dinámica Molecular

The Journal of Physical Chemistry. B. Jan, 2009  |  Pubmed ID: 19115819

Campos electrostáticos no aditiva de la fuerza basados en el formalismo de equilibrado de carga junto con escala de tiempo largo simulaciones de dinámica molecular se utilizan para investigar los aspectos estructurales microscópicos de hidratación hidrofóbica en soluciones de etanol-agua. Empleando una combinación de polarizables campos etanol y agua de fuerza (desarrollado de forma independiente), encontramos que la propiedades de la solución se reproducen satisfactoriamente en toda la gama de fracción mol de etanol entre 0.1 y 0.9. Densidades de solución se predicen en 3,6% de mediciones experimentales, mientras que el exceso de entalpías de mezclas se sobrestiman como en estudios anteriores. La energía de solvatación libre de etanol en la dilución infinita se determina mediante la integración de la termodinámica que 5.70 +/-0.23 kcal/mol, sobrestimando la energía libre de solvatación en relación con el experimento (5.01 kcal/mol). A granel solución dieléctrica constantes y constantes de difusión reproducen las tendencias experimentales y están de acuerdo razonable en toda la gama de la concentración de etanol estudiada. Debido a la contabilidad explícito de los efectos de la inducción, etanol y agua exhiben diferentes distribuciones de momento de dipolo molecular con concentración. El modelo de etanol polarizable, que poseen mayor polarizabilidad fase condensada en relación con el modelo de agua TIP4P-FQ (4,54 A(3) versus A(3) 1.1, respectivamente), muestra una gran variación en la perturbación por el campo eléctrico del agua. En cuanto a hidratación hidrofóbica, los campos de fuerza actuales indican positivo hidrógeno exceso de agua en el intervalo de concentraciones de etanol diluido, consistente con estudios previos de teóricos y experimentales de la vinculación. Sorprendentemente, encontramos que hay ambas contribuciones de exceso de hidrógeno positivo y negativo dentro de la primera cáscara de hidratación de ambos el etanol del oxhidrilo oxígeno y etileno átomos de carbono. Las más grandes contribuciones positivas dominan el hidrógeno total vinculación patrones para dar total neto positivos excesos. Por otra parte, no encontramos evidencia de la vinculación del hidrógeno exceso vecinales a los bandos no polares, como se ha sugerido basado en el "iceberg"-como los modelos propuestos por Frank y Evans. Estos resultados sugieren exceso negativo en las regiones que rodean los grupos ALQUILO que vis-à-vis corresponde a una reducción en el momento de dipolo molecular media de las moléculas de agua residente debido a la inducción de dipolo más pequeña en los campos electrostáticos más débiles de los grupos no polares.

Sensibilidad De Expresión Génica Humana Según Metanálisis De Gran Escala

BMC Bioinformatics. 2009  |  Pubmed ID: 19208159

Genes presentan diferentes sensibilidades en la expresión correspondiente a diferentes condiciones biológicas. Estudio sistemático de este concepto se requiere debido a sus implicaciones en el análisis de microarrays, etc.. J.H. Ohn et al primero estudió esta propiedad gene con datos de generación de perfiles transcripcional de levadura.

Evolución Gradual Diferencial De Proteínas Funcionales De SARS Coronavirus En Especie Diferente

BMC Evolutionary Biology. 2009  |  Pubmed ID: 19261195

Coronavirus del SRAS (SARS-CoV) fue identificado como el agente etiológico del SRAS, y las investigaciones extensas indicaron que originaron una fuente animal (probablemente murciélagos) y recientemente fue introducido en la población humana a través de animales silvestres de mercados húmedos en el sur de China. Estudios anteriores revelaron que la proteína de la espiga (S) de SARS había experimentado evolución adaptativa, pero si otras proteínas funcionales de SARS han sufrido adaptativa evolución se desconoce.

Velocidad De Disolución De Caliza Para La Desulfurización Mojado En Presencia De Sulfito

Journal of Hazardous Materials. Sep, 2009  |  Pubmed ID: 19359093

Velocidad de disolución de piedra caliza se midió mediante un método de pH-stat con aspersión de co (2) y disuelto sulfito. La velocidad de disolución de piedra caliza bajo estas condiciones se encontró a ser controlada por transferencia de masa y de la cinética de superficie. Como puede verse en los resultados, en presencia de sulfito, aumenta la velocidad de disolución de piedra caliza con el aumento de la velocidad de agitación, la temperatura de la reacción y la presión parcial de co (2). La cristalinidad de la piedra caliza tiene un gran impacto en la velocidad de disolución: cuanto menor sea el valor de la cristalinidad de la piedra caliza es, mayor es la velocidad de disolución. La presencia de sulfito promueve la velocidad de disolución cuando el valor de pH es inferior a 5.5 pero inhibe al valor de pH está por encima de 5.5.

Evolución Episódica Y Adaptación De Los Genomas De Cloroplasto En Pastos Ancestrales

PloS One. 2009  |  Pubmed ID: 19390686

Se ha sugerido que el genoma del cloroplasto de la familia de las gramíneas, Poaceae, ha experimentado una tasa evolutiva elevada en comparación con la mayoría de otras angiospermas y, sin embargo, los detalles de este fenómeno han permanecido oscuros. Para saber cómo se produjo el cambio de velocidad durante la evolución, es necesario la estimación de la escala de tiempo con calibraciones confiables. El reciente descubrimiento de 65 Ma hierba fitolitos en coprolitos de dinosaurio del Cretácico coloca la diversificación de las gramíneas al período Cretácico y ofrece una calibración confiable en estudiar el tempo y el modo de evolución del cloroplasto de hierba.

Resultados De Tumor Neuroectodérmico Primitivo Periférico Abdominal Proyección De Imagen: Informe De Cuatro Casos Con Correlación Patológica

Clinical Imaging. May-Jun, 2009  |  Pubmed ID: 19411024

Los tumores neuroectodérmicos primitivos periféricos (periféricas PNETs) son raros en el abdomen. Divulgamos los resultados de cuatro PNETs periféricas que se presenta en el abdomen. Tres eran tumores mal-demarcada y uno era un tumor bien delimitado, con extensa invasión local y metástasis ganglionar en dos casos, respectivamente. Los tumores son de atenuación no homogénea y heterogéneo realce tras la administración intravenosa de contraste. Aunque sus manifestaciones de la imagen no distinguen de otros sarcomas, reconocimiento de estas características de la proyección de imagen puede ser útil en sugerir la posibilidad de PNETs periféricas en algunos casos.

Identificación De Una Supuesta Citoquina Helicoidal Invertebrada Similar a La Familia De Factor Inhibitorio De Leucemia Factor Neurotrófico Ciliar Por PSI-explosión-basado

Journal of Interferon & Cytokine Research : the Official Journal of the International Society for Interferon and Cytokine Research. Aug, 2009  |  Pubmed ID: 19514841

La mayoría de nuestros conocimientos de moléculas helicoidales de cytokine-como en invertebrados se basa en ensayos funcionales y semejanzas a nivel físico-químico. Es difícil predecir helicoidal citoquinas en invertebrados basados en secuencias de mamíferos y vertebrados, debido a su divergencia evolutiva durante mucho tiempo. En este artículo, se recogieron 12 clases de peces citoquinas y construcción sus secuencias de consenso respectivos mediante modelos ocultos de Markov; entonces, la región de dominios conservados de cada secuencia consenso más fueron extraídos por el SMART tool y utilizado como la secuencia de consulta para el análisis de la PSI-BLAST en Drosophila melanogaster. Después de dos procesos de filtrado basados en las propiedades de citoquinas helicoidal, obtuvimos una proteína llamada CG14629, que comparte el 25% identities/46% positivos para pescar M17 citoquinas en la mitad de la longitud del N-terminal. Teniendo en cuenta la homología entre M17 y LIF/CNTF (factor neurotrófico ciliar/factor inhibidor de leucemia) y la estrecha relación entre la cúpula, el receptor de la citoquina putativos en células de Drosophila y LIFR/CNTFR (receptor de receptor/CNTF LIF), los resultados sugieren que el CG14629 es un buen candidato para el ortólogo de cytokine helicoidal en D. melanogaster.

Estructura Interfacial, Termodinámica Y Electrostática De Soluciones Acuosas De Metanol Mediante Simulaciones De Dinámica Molecular Usando Modelos De Equilibrado De Carga

The Journal of Physical Chemistry. B. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 19569724

Presentamos los resultados de simulaciones de dinámica molecular de las soluciones de metanol-agua utilizando campos de fuerza de equilibrio de carga para tener en cuenta explícitamente las contribuciones de interacción electrónica no aditiva a la energía potencial. Estudiamos soluciones en toda la gama de concentración de 0.1 a 0.9 fracción molar de metanol. En concentraciones diluidas, densidad de metanol se realza en la interfase líquido-vapor, coherente con la anterior dinámica molecular y estudios experimentales. Grueso interfacial exhibe un incremento monótono con el aumento de la fracción molar de metanol, y tensiones superficiales muestran monótono disminuye con la concentración de metanol, cualitativa de acuerdo con los datos experimentales y anteriores predicciones de dinámica molecular usando polarizables campos de fuerza. En cuanto a estructura interfacial, en consonancia con las predicciones de campos de fuerza tradicionales, hay una única orientación preferencial de moléculas de metanol en la interfaz. Por otra parte, hay una preferencia energética libre de moléculas de metanol en la interfaz según lo evidenciado por el potencial de cálculos de fuerza media. Los cálculos de pmf sugieren un estado interfacial con 0,8 estabilidad kcal/mol en relación con la mayor parte, otra vez cualitativa de acuerdo con la anterior simulación y estudios experimentales. Interfaciales potenciales basan en la integración doble de gama de la densidad de la carga total de-610 a -330 mV sobre el diluir hasta concentrado regímenes, respectivamente. La preponderancia de metanol en la interfaz en todas aquellas fracciones de Topo da lugar a una contribución de metanol dominante a la total interfacial potencial. Curiosamente, hay una transición de la contribución potencial de superficie de agua de negativo a positivo sobre la transición de metanol fracción de 0.1 a 0.2. Las contribuciones de dipolo y cuadrupolo para el componente de agua de la total interfacial potencial son efectivamente de igual magnitud y enfrente el signo, cancelando así unos a otros. Calculamos el componente en el plano de la permitividad dieléctrica a lo largo de la interfaz normal. Observamos un comportamiento son de la permitividad dieléctrica de metanol en el plano que rastrea los perfiles de densidad de metanol en fracciones de mole de metanol baja. En fracciones de mole de metanol superiores, la total permisividad en el plano está dominado por el metanol y muestra una disminución monotónica de bulto al vapor. Finalmente nos sondeo la naturaleza de hidratación de agua en el macizo frente a regiones interfaciales para las fracciones de mole de metanol de 0.1 y 0.2. En la mayor parte, metanol perturba la estructura del agua con el fin de dar lugar a excesos de enlace del hidrógeno del agua. Por otra parte, se observan exceso de hidrógeno negativo en las cercanías del grupo ALQUILO, según lo divulgado por Zhong et para soluciones de etanol-agua a granel utilizando campos de fuerza de equilibrio de carga y exceso positivo en la vinculación del hidrógeno de regiones a moléculas de metanol más cercano vecino. Dentro de la densidad de región, el agua y el metanol interfacial reducción de plomo a deficiencias de enlace del hidrógeno del agua concomitante (exceso de hidrógeno negativo).

Inhibidores Del Virus De Inmunodeficiencia Humana Tipo 1 (VIH-1) Accesorio. 5. Una Evolución Del Indol a Azaindoles Hacia El Descubrimiento De 1-(4-benzoylpiperazin-1-yl)-2-(4,7-dimethoxy-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)ethane-1,2-dione (BMS-488043), Un Candidato Que Demuestra Actividad Antiviral En Temas Infectadas Por VIH-1

Journal of Medicinal Chemistry. Dec, 2009  |  Pubmed ID: 19769332

Azaindole derivados derivados de la iniciativa de proyección 1-(4-benzoylpiperazin-1-yl)-2-(1H-indol-3-yl)ethane-1,2-dione (1) fueron preparados y caracterizados para evaluar su potencial como inhibidores del VIH-1 accesorio. Sustitución sistemática de cada uno de los átomos de carbón cuya en el anillo fenilo de la molécula de indol por un átomo de nitrógeno proporciona cuatro derivados de diferentes azaindole que muestra un claro SAR para actividad antiviral y todas ellas marcan mejoras en propiedades farmacéuticas. Optimización de estos conductores azaindole dio lugar a la identificación de dos compuestos que fueron avanzadas a los estudios clínicos: (R)-1-(4-benzoyl-2-methylpiperazin-1-yl)-2-(4-methoxy-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)ethane-1,2-dione (BMS-377806, 3) y 1-(4-benzoylpiperazin-1-yl)-2-(4,7-dimethoxy-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)ethane-1,2-dione (BMS-488043, 4). En un estudio clínico preliminar, 4 había administrado como monoterapia durante 8 días, redujo la viremia en temas infectadas por VIH-1, proporcionar prueba de concepto para esta clase mecanicista.

Evolución Adaptativa De Los Genomas De Cloroplasto En Pastos Ancestrales

Plant Signaling & Behavior. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 19820316

La familia de las gramíneas, Poaceae, es una de las familias más exitosas entre las angiospermas. Aunque mucho se ha sugerido que el genoma del cloroplasto de Poaceae ha experimentado una tasa evolutiva elevada en comparación con otras angiospermas, poco se sabía sobre los detalles de este fenómeno. Utilizando datos del genoma del cloroplasto de 31 especies de plantas de la semilla, se mostró recientemente que la aceleración de tipo episódico ocurrió en la rama ancestral común del núcleo Poaceae (un clado formado por arroz Oryza sativa, mays de trigo Triticum aestivum, maíz Zea y sus aliados) acompañado por la proporción de la tasa de no-sinónimo/sinónimo elevados, mientras que la tasa y la proporción de la tasa de no-sinónimo/sinónimo revertían el bajo nivel típico de la mayoría de las especies monocotiledóneas en las ramas terminales. Fue más demostrado positivo de selección o evolución adaptiva operado en varias proteínas del cloroplasto durante la evolución de hierbas ancestrales y los sitios de aminoácido que selección positiva supuestamente experimentado han sido identificados. Estos resultados ilustran la importancia de futuros trabajos de investigación biológica estructural de cloroplastos para entender el trasfondo de la evolución del exitoso grupo, Poaceae.

[Aplicación De Un Modelo De Predicción En Cuerpos De Inclusión Refolding]

Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao = Journal of Southern Medical University. Nov, 2009  |  Pubmed ID: 19923054

Establecer un método de predicción para el refolding de cuerpos de inclusión y clasificar tipos de repliegue de diferentes cuerpos de inclusión directamente su estructura primaria para mejorar la eficiencia de alto rendimiento refolding proceso.

Modelado De La Proteína Refolding De Cuerpos De Inclusión

Acta Biochimica Et Biophysica Sinica. Dec, 2009  |  Pubmed ID: 20011979

Sobreexpresión de proteínas extrañas en Escherichia coli a menudo conduce a la formación de cuerpos de inclusión (IBs), que se convierte en el principal cuello de botella en la preparación de proteínas recombinantes y sus aplicaciones. En el presente estudio, 36 proteínas de IBs fueron replegadas un simple método de repliegue. Repliegue rendimientos de estas proteínas se definen como el porcentaje de proteínas solubles dilución siguiente refolding en la cantidad de desnaturaliza las proteínas en las muestras antes de diluir en búfer de repliegue. Además, un modelo matemático fue deducido para evaluar la función de las propiedades bioquímicas de la proteína refolding. Nuestros resultados indican que bajo las condiciones experimentales, punto isoeléctrico de las proteínas podría sobre todo contribuir a la eficacia alta de proteína refolding puesto que el incremento de una unidad resultó en una disminución de 14,83% en el rendimiento de repliegue. Otros mediadores importantes eran componentes de estructura secundaria de proteínas y el peso molecular (r = 0,98, P = 0.000, prueba F). Seis proteínas con baja eficiencia en la proteína refolding poseídos puntos isoeléctricos relativamente bajas. Además, rendimientos repliegue de seis proteínas adicionales de IBs se predijo y más validados por refolding las proteínas en las mismas condiciones. Por lo tanto, el modelo de la proteína refolding desarrollados aquí podría utilizarse para predecir el rendimiento repliegue de proteínas de IBs a través de un método sencillo. Nuestro estudio será sugerente para optimizar los métodos para la proteína refolding de IBs según sus propiedades intrínsecas.

Análisis Filogeográficos Del Papillomavirus Humano 58

Science in China. Series C, Life Sciences / Chinese Academy of Sciences. Dec, 2009  |  Pubmed ID: 20016974

Virus del papiloma humano 58 (HPV58) es un tipo de VPH con alto riesgo de causar cáncer de cuello uterino. Inusualmente alta prevalencia de HPV58 se ha divulgado en Asia, África y algunas otras áreas. Sin embargo, debido a la distribución dispersa de datos globales, además de la falta de datos de algunas regiones, como la China continental y las Naciones de alta incidencia de HPV58 un análisis exhaustivo de la distribución geográfica mundial de HPV58 permanece en blanco hasta ahora. En este estudio, HPV58 del tejido uterino humano fue detectado en China continental, y se obtuvieron 14 nuevas secuencias de genes E6/HPV58-L1. Por otra parte, se ha realizado Análisis filogeográficos que combina las secuencias de HPV58 que se hayan depositado en GenBank desde 1985. El resultado del estudio muestra que las secuencias detectadas las áreas de Shanghai, Jiangsu y Sichuan son homólogas con los que se encuentran en el pasado de Hong Kong y Xian, China, así como Japón y otras zonas del sudeste asiáticos. Además, África occidental se considera ser el origen de la "raíz" de la variante de HPV58, mientras que China continental y el sudeste asiático son "puntos de tránsito" y las nuevas fuentes de HPV58 después de recibir los aislantes de la fuente de la "raíz"; como HPV16 y HPV18, el HPV58 puede ser también uno de los principales tipos HPV asociados con el desarrollo y la diseminación del cáncer cervical.

Efecto De La Evolución Heterogénea Site-specific En Reconstrucción Filogenética: Una Evaluación Simple

Gene. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 18778757

Estudios recientes han demostrado que la evolución heterogénea puede inducir análisis filogenético, que ha sido desatendido durante mucho tiempo. Evaluamos el efecto de la evolución heterogénea en el análisis filogenético, utilizando secuencias de codificación de los 18 mitogenomic de pescado como un ejemplo. La utilización del software DIVERGE identificamos 198 páginas de aminoácido que han experimentado la evolución heterogénea. Después de quitar estos sitios, el resto de sitios se muestran que prácticamente homogéneo en la tasa evolutiva. Hay algunas diferencias entre los árboles filogenéticos construidos con sitios heterogéneos ("antes de"árbol") y sin heterogéneos sitios ("después de árbol"). Nuestro estudio demuestra que para la reconstrucción filogenética, un enfoque eficaz consiste en identificar y eliminar sitios con evolución heterogénea y sugiere que los investigadores pueden utilizar el software DIVERGE para eliminar la influencia de la evolución heterogénea antes de reconstruir árboles filogenéticos.

Completar El Arreglo De Secuencia Y Gene De Nucleótidos Del Genoma Mitocondrial Del Cangrejero Rana Fejervarya Cancrivora E Implicaciones Evolutivas

Gene. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 18848608

La secuencia nucleotídica completa del genoma mitocondrial (TM) de la rana cangrejero, Fejervarya cancrivora Gravenhorst (Amphibia: Anura: Ranidae), se determinó. El genoma de mt es 17.843 bp largo y contiene proteína 13-codificación (ATP6, ATP8, COI-III, ND1-6 y 4 L y Cyt b) y dos genes de ARN ribosomal (12S y 16SrRNA). Aunque mt metazoarios genomas codifican típicamente 22 genes de ARN de transferencia (ARNt), F. cancrivora mtDNA contiene 23 tRNAs debido a la presencia de una copia extra de tRNA(Met). También se encontraron una región de los gran y un espaciador intergénico prominente correspondiente al origen de replicación de región y luz-strand de control. Para confirmar la posición filogenética de F. cancrivora, que en comparación con el arreglo de genes con la de otros anuros y realiza análisis filogenéticos basados en datos genómicos de mt. La organización del genoma de F. cancrivora mtDNA difiere de vertebrados típicos y ranas neobatrachian pero es idéntica a la de F. limnocharis, sugiriendo que el arreglo de gen único ocurrió en el antepasado común del género. Los análisis filogenéticos apoyaron la monophyly de las especies de Fejervarya utilizadas aquí así como del grupo de dicroglossini. Aunque la familia Ranidae previamente reconocido (= Ranidae, Discoglossidae y algunas otras familias natatanuran; sensu Frost et al., 2006) se muestra como un clado en el análisis de máxima parsimonia, máxima verosimilitud y los análisis bayesiano sugieren la parafilético de los Ranidae con respecto a las familias, Mantellidae y Rhacophoridae. Tres-tándem duplicaciones de regiones del gen seguidas posteriores deleciones de genes supernumerarios se propusieron para explicar la evolución de la tRNA(Met) extra y translocación de CD5 desde el pedido original de gen neobatrachian.

Duplicación Y Evolución Adaptativa De Los Genes COR15 Dentro Del Linaje De Draba Altamente Tolerante Al Frío (Brassicaceae)

Gene. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 18640249

Las plantas han desarrollado diversos mecanismos adaptativos que puedan tolerar abiótico, en diferentes grados, y tales tensiones pueden haber influido fuertemente en cambios evolutivos en los niveles que oscilan entre moleculares y morfológicos. Estudios anteriores realizados sobre estos fenómenos se han centrado en la evolución adaptativa de genes relacionados con el estrés orthologous en linajes específicos. Sin embargo, heterogenetic evolución de los genes parálogo siguiendo la duplicación sólo se ha examinado en un número muy limitado de familias de genes de respuesta al estrés. El gen COR15 codifica una proteína de bajo peso molecular que desempeña un papel importante en la protección de las plantas de frías tensiones. Aunque se han encontrado dos copias diferentes de este gen en las especies modelo Arabidopsis thaliana, patrones evolutivos de esta familia de genes pequeño en plantas no han sido previamente explorados. En este estudio, realizamos había clonado COR15-como secuencias y análisis evolutivos de estas secuencias (incluyendo las reportadas previamente) en el linaje de Draba altamente tolerante al frío y relacionados con los linajes de Brassicaceae. Los análisis filogenéticos indican que todas las secuencias COR15-como se agrupan en cuatro clados que correspondieron a los linajes morfológicos. Conversiones de gene fueron encontradas probablemente ocurrieron antes/durante la divergencia de Brassica y Draba. Sin embargo, las duplicaciones repetidas, independientes de este gen se han producido en diversos linajes de Brassicaceae. Las comparaciones más de todas las secuencias indican que ha habido inter-lineage significativas en las tasas de evolución entre los genes duplicados y originales. Se evaluó la posibilidad de que las diferencias entre dos subfamilias de gene bien sustentada que parecen haberse originado de una sola duplicación, COR15a y COR15b, dentro del linaje de Draba han sido expulsados por evolución adaptativa. Comparaciones de sus relaciones de sustitución no-sinónimo/sinónimo y tasas de cambios previstos aminoácido indican que estos grupos de dos genes están evolucionando bajo diferentes presiones selectivas y pueden ser funcionalmente divergentes. Esta divergencia funcional fue confirmada mediante la comparación de site-specific cambios en los índices de evolución de los dos grupos de proteínas predichas. Las pruebas de selección diferencial y posible divergencia funcional sugieren que la duplicación puede ser de significado adaptativo, con posibles implicaciones para la diversificación explosiva del linaje Draba durante las etapas de enfriamiento cuaternarios y la colonización en todo el mundo siguiente de regiones áridas de alpinas y árticos.

Estructura Genética Espacial De Bellas Y Paisaje Escala De Cojín Rockjasmine, Androsace Tapete (Primulaceae), a Través De La Meseta De Qinghai-Tíbet Meridional

Genetica. Apr, 2009  |  Pubmed ID: 18604631

El cojín rockjasmine, Androsace tapete (Primulaceae), está entre las angiospermas con distribución altitudal más alta del mundo. Amortiguador rockjasmine es una prominente especies pioneras en desiertos alpinos y calcárea alpino cuesta hasta 5.300 m en la meseta de Qinghai-Tíbet. En este estudio, utilizamos entre secuencia simple repetición () marcadores ISSR para investigar la estructura genética espacial de tapete a. bellas-escala y escala de paisaje, con énfasis en la prueba de la hipótesis de que el valle de poca altura del río Brahmaputra, va de oeste a este a través de la meseta de Qinghai-Tíbet, tiene efectos significativos en la estructura espacial de la población de a. tapete. Se recolectaron un total de 235 personas de cinco poblaciones disjuntas crestas (es decir, de dos poblaciones ubicadas en el norte y tres en el sur del río Brahmaputra), incluyendo 158 personas que fueron espaciales muestra explícitamente de una parcela de 30 m x 90 m. A escala fina, análisis de autocorrelación espacial indican una estructura genética significativa a una corta distancia (menos de 10 m), que es probablemente debido a la dispersión del gen limitada por polen y semillas. A escala de paisaje, sin embargo, AMOVA sugiere que la mayoría de la variación genética total (85%) es entre individuos dentro de poblaciones; y el río Brahmaputra desempeña un papel débil en la conformación de la estructura espacial de la población de a. tapete. Además, los resultados de asignación de la PCA y estructura muestran asociaciones genéticas significativas entre las poblaciones a través del río Brahmaputra. Los intercambios de gen histórico y lenta deriva genética pueden ser responsables de la falta de diferenciación profundo genética entre poblaciones topográficamente separadas en el tapete a..

[Correlación Entre Activación De Astrocitos De Médula Espinal L5-S2 Y El Efecto De La Sustancia P En El Dolor De La Prostatitis Crónica]

Zhonghua Nan Ke Xue = National Journal of Andrology. Nov, 2009  |  Pubmed ID: 20218316

Observar las expresiones de la sustancia P (SP) mRNA y receptor Neuroquinina-1 (NK-1R) en el cuerno posterior de la L5 - S2 de la médula espinal en el modelo de la rata del dolor de la prostatitis crónica e investigar los cambios en la activación de astrocitos y la influencia de SP en esta activación en los astrocitos de la médula espinal de rata cultivan in vitro.

Un Método Simple Para Phylogenomic Inferencia Utilizando La Información De Contenido Del Gene De Genomas

Gene. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 18675889

Muchos estudios han sido aportados a las inferencias de filogenias. Algunos estudios se basan en un solo gen (familia), y algunos se basan en datos del genoma entero. En este trabajo proponemos un enfoque de distancia del genoma de pérdida total basado en la información de contenido de gene para inferir filogenias. A través de varias simulaciones, que demostrar y evaluar la propuesta. Lo comparamos con algunos otros enfoques basados en contenido de gen gen contenido o extendido. En general, el enfoque propuesto realiza igualmente bien como los otros métodos y es más eficiente que algunos de los métodos. Aplicamos nuestro enfoque a 34 microbianas genomas completos de COG. El árbol reconstruido concuerda con los resultados de otros enfoques y el árbol apoya el concepto de árboles universales.

Músculo Adulto Células ' Madre' Pueda Mantenerse En Cultura Como Myospheres Flotante

Experimental Cell Research. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 20381487

La efectividad del tratamiento basadas en células para tratar la enfermedad muscular ha sido obstaculizada por las dificultades para aislar, el mantenimiento y la propagación de las células que se necesitan para el tratamiento. Aquí divulgamos el aislamiento de células madre procedentes de músculo de ratones jóvenes y adultos y su propagación en largos periodos de tiempo en la cultura como myospheres "flotante". El análisis de estas células formadoras de esfera demostró que expresan células madre antigen-1 (Sca-1), integrina beta1 (CD29), Thy-1 (CD90), y CD34, pero no expresar CD45, CD31 o marcadores miógenos (Pax7, Myf5 y MyoD). Encontramos que las células derivadas de myospheres y luego crecido adherentemente (MDACs) comportaban mioblastos similares a primaria, en que estas células expresan marcadores miógenos y fueron capaces de formar fácilmente miotubos multinucleadas. A diferencia de la myospheres los padres pero análoga a mioblastos primario, MDACs habían expresado Pax7 y Myf5 MyoD, indicando que las células de myosphere padres eran un tipo más primitivo de la célula. En apoyo de esto, hemos demostrado que myospheres también fueron capaces de diferenciarse en células osteogénicos en cultura, así como ser capaces de contribuir al músculo lesionado en vivo y adipogenic. En Resumen, divulgamos ese músculo adulto primitivo células madre pueden ser fácilmente aisladas y sustentadas en la cultura como myospheres.

La Posición De DUI Entre Plantas De La Semilla: Superar Escollos De Cloroplasto Filogenómica

Molecular Biology and Evolution. Dec, 2010  |  Pubmed ID: 20601411

La posición filogenética de DUI es uno de los temas más polémicos en la sistemática de la planta de la semilla. Para aclarar la posición de DUI, una matriz de sustitución de aminoácido mejorada fue estimada en base a genomas de cloroplasto (cp) 64 y se aplicó a los datos del genoma del cp incluyendo todos los tres linajes de DUI en análisis de máxima verosimilitud de proteínas. Aunque el análisis inicial apoya firmemente la hermana relación de DUI con Cryptomeria (coníferas Cupressophyta o no-Pinaceae) (la hipótesis de la "Gnecup"), el apoyo parece ser causado por un artefacto de atracción de la rama larga (LBA). De hecho, mediante la eliminación de más rápida evolución de las proteínas que son probablemente asociados a la LBA, el apoyo drásticamente disminuido. Además, el otro análisis del genoma parcial datos con muestreo de taxonomía densa de coníferas demostraron que, en psbC, rpl2 y proteínas de rps7, hay muchas sustituciones de aminoácidos paralelo entre los linajes principales DUI y Cryptomeria y más excluyendo estos tres genes, la hermana de relación de DUI con Pinaceae (la hipótesis de la "Gnepine") se convirtió en apoyo. En general, nuestros análisis indican que el LBA y sustituciones paralelas causan una inferencia seriamente sesgada de la posición filogenética de DUI con los datos del genoma de cp.

Campos De Fuerza Empíricos No Aditiva Para Alcoholes Lineales De Cadena Corta: Metanol a Butanol. Hidratación Libre Energética Y Análisis De Kirkwood-Buff Utilizando Modelos De Equilibrado De Carga

The Journal of Physical Chemistry. B. Sep, 2010  |  Pubmed ID: 20687517

Basándose en el campo de fuerza electrostático no aditiva para alcoholes basan en el equilibrio de carga CHARMM formalismo (CHEQ), introducimos parámetros específicos de Lennard-Jones (LJ) soluto-solvente átomo-par de campos de fuerza de interacción de alcohol-agua dirigidas a mejorar de acuerdo con energías de hidratación experimental libre de una serie de alcoholes lineales de molécula pequeña así como ab initio geometrías de agua-alcohol y energética. Consideramos alcoholes de cadena corta, lineales de metanol a butanol como son compuestos canónica modelo orgánico de moléculas pequeñas para representar la funcionalidad hidroxilo química oponeros biomolecular campos de fuerza para las proteínas. Discutimos simulaciones de dinámica molecular de soluciones acuosas diluidas de metanol y etanol en agua TIP4P-FQ, con la discusión concreta de densidades de la solución, estructura definida en funciones de distribución radial, propiedades electrostáticas (momento de dipolo distribuciones), patrones de agua, así como un análisis integral de Kirkwood-Buff (KB) de la vinculación del hidrógeno. Cálculo de este último proporciona una evaluación de cuán bien clásicos campos de fuerza parametrizadas a por lo menos semiquantitatively partido experimental hidratación libre energías capturar las estructuras microscópicas de soluciones de alcohol diluído; este último se traduce en propiedades termodinámicas macroscópicas mediante la aplicación de análisis KB. Encontramos que los campos de fuerza de alcohol CHEQ de este trabajo coinciden semiquantitatively con experimentales KB integrales para las fracciones de mole de metanol y etanol de 0.1 y 0.2. La combinación de fuerza de campo cualitativo captura la dependencia de la concentración de los integrales KB alcohol-alcohol y agua, pero debido a insuficiencias en la representación de las estructuras microscópicas en dichos sistemas (que no pueden ser parametrizados en cualquier manera sistemática), a priori descripción cuantitativa de integrales de alcohol-agua KB sigue siendo elusiva.

Nervios Endoscópica Asistida Gestión Micro Invasor De Chiari I Malformación

Chinese Medical Journal. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 20819571

Para hacer la descompresión de la fosa posterior para la gestión de Chiari I malformación sencilla y menos invasiva durante el uso de la visualización directa, un novedoso procedimiento únicamente endoscópico ha sido empleado para la descompresión del tipo de la malformación de Chiari I. El objetivo de este estudio era para laminectomía atlas y descompresión endoscópica neural de la fosa posterior presente de Chiari tipo I pacientes.

Utilizando Nanopartículas De Carbón Activado Para Disminuir La Genotoxicidad Y La Teratogenicidad De Agentes Terapéuticos Contra El Cáncer

Journal of Nanoscience and Nanotechnology. Dec, 2010  |  Pubmed ID: 21121372

Uno de los principales obstáculos contra el éxito en la quimioterapia contra el cáncer es el tóxico y efectos secundarios de los agentes quimioterapéuticos. La evitación de estos tóxicos y efectos secundarios mejorarán en gran medida los efectos terapéuticos de los medicamentos contra el cáncer, mientras que la disminución de los dolores de los pacientes. Aquí mostramos las nanopartículas de carbón activado (ACNP), una de las nanopartículas mesoporosos, puede disminuir la genotoxicidad y teratogenicidad de mitomicina C (MMC). Para estudiar los efectos de la ACNP sobre genotoxicidad y teratogenicidad de MMC, métodos de ensayo de micronúcleos PCE, hámster chino pulmón células cromosoma aberración experimento y rata teratogenicidad se emplearon para observar las diferencias en la genotoxicidad y teratogenicidad entre ACNP-adsorbidos MMC (ACNP-MMC) y MMC gratis. Los resultados demostraron que libre MMC 0.16-5.0 microg/kg aumentó significativamente positiva tasa de micronúcleos PCE, la tasa de Aberración cromosómica y teratogenicidad de rata, pero ACNP-MMC no aumentado estos índices toxicológicos herencia y reproducción en un rango de dosis de 0.625-10.0 microg/kg. De estos resultados, se puede concluir que la ACNP-MMC tenga efectos significativos para disminuir los efectos de genotoxicidad y teratogenicidad de MMC. Estos resultados tendrán un impacto considerable sobre la estrategia de la quimioterapia contra el cáncer.

DbDEMC: Una Base De Datos De MiRNAs Expresados Diferencialmente En Los Cánceres Humanos

BMC Genomics. 2010  |  Pubmed ID: 21143814

MicroRNAs (miRNAs) son pequeños RNAs codifica unos 22 nt largo que regulan negativamente la expresión génica a nivel post-transcripcional. Sus principales efectos en varios procesos biológicos, por ejemplo, el desarrollo embrionario, división celular, diferenciación y apoptosis, son ampliamente reconocidos. La evidencia sugiere que la expresión aberrante de miRNAs puede contribuir a muchos tipos de enfermedades, incluyendo cáncer. Aquí os presentamos una base de datos de miRNAs expresados diferencialmente en cánceres humanos (dbDEMC), para explorar miRNAs aberrantemente expresados entre diferentes tipos de cáncer.

[El Estudio Preliminar Del Uso De Descompresión Occipital De Atlanto Neuro-endoscopio Asistida Para Tratar De Chiari Tipo I Malformación Con Siringomielia]

Zhonghua Wai Ke Za Zhi [Chinese Journal of Surgery]. Oct, 2010  |  Pubmed ID: 21176650

Para explorar y evaluar la metodología de neuro-endoscopio asistida atlanto occipital descompresión en Chiari tipo I malformación con Siringomielia.

Los Marcadores Del Microsatellite Para El Amortiguador Rock Jazmín, Androsace Tapete (Primulaceae), Una Especie Endémica De La Meseta De Qinghai-Tíbet

American Journal of Botany. Oct, 2010  |  Pubmed ID: 21616790

• Premisa del estudio: los marcadores del Microsatellite fueron desarrollados en una planta Alpina endémica de la meseta de Qinghai-Tíbet, Androsace tapete, para investigar su estructura genética espacial, flujo génico y patrones de apareamiento. • Métodos y resultados: usando el método de captura de biotina combinado, 16 microsatélites cartilla conjuntos fueron aislados y caracterizados. Quince de estos marcadores demostró polimorfismo, y el número de alelos por locus varió entre tres y 13 a través de 56 personas de seis poblaciones tibetanas. • CONCLUSIONES: estos marcadores proporcionan una herramienta útil para investigar la estructura genética espacial, flujo génico y sistema de apareamiento de tapete a..

Ninguna Asociación Entre El Riesgo De Cáncer De Polimorfismo Y Mama CYP1B1 Val432Leu: Un Meta-análisis Con 40.303 Sujetos

Breast Cancer Research and Treatment. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 20033481

Cáncer de mama es el cáncer más común en las mujeres. Hasta la fecha, muchas publicaciones han evaluado la asociación entre el citocromo P450 1B1 (CYP1B1) Val432Leu polimorfismo y mama el riesgo de cáncer. Sin embargo, los resultados siguen siendo inconclusos. Con el fin de obtener una estimación más precisa de la Asociación, se realizó un metanálisis en este estudio. Mediante búsquedas en bases de datos Medline, Pubmed y ISI Web of Knowledge, obtuvieron 26 estudios 19.028 casos y 21.275 controles para Val432Leu CYP1B1 polimorfismo. ORs crudos con IC del 95% se utilizaron para evaluar la fuerza de asociación entre el riesgo de cáncer de polimorfismo y mama CYP1B1 Val432Leu. Se realizaron las RUP agrupadas para modelo codominante, modelo dominante y recesiva modelo, respectivamente. En general, no asociaciones significativas entre la susceptibilidad al cáncer polimorfismo y mama Val432Leu CYP1B1 encontradas para Val/Val versus Leu/Leu (o = 0,98; IC del 95%:: 0.90-1.06), Val/Leu versus Leu/Leu (o = 1.01; IC del 95%:: 0.93-1,09), Val/Val + Val/Leu versus Leu/Leu (OR = 1.00; IC del 95%:: 0.93-1.08) y Val/Val versus Val/Leu + Leu/Leu (OR = 0,96; IC del 95%:: 0.91-1.01). En el análisis estratificado por origen étnico, estado menopáusico y fuentes de los controles, asociaciones significativas no todavía se observaron en todos los modelos genéticos. En conclusión, este metanálisis proporciona fuertes evidencias que Val432Leu CYP1B1 polimorfismo no está asociado con el riesgo de cáncer de mama.

Organelos De Objetivos Farmacológicos Y Toxicológicos Y Uso Seguro De Nanotubos De Carbono De Pared Simple Como Portadores De La Droga En El Tratamiento De La Enfermedad De Alzheimer

Nanomedicine : Nanotechnology, Biology, and Medicine. Jun, 2010  |  Pubmed ID: 20056170

Identificación de perfiles farmacológicos y toxicológicos es de importancia crítica para el uso de nanopartículas como portadores de la droga en nanomedicina y para la evaluación de la bioseguridad de las nanopartículas ambientales en Nanotoxicología. Aquí mostramos que los lisosomas son los organelos objetivo farmacológico de nanotubos de carbono de pared simple (SWCNTs) y que las mitocondrias son los orgánulos de destino para su citotoxicidad. Los NTCSPs gastrointestinally absorbidas fueron lysosomotropic sino también introdujo las mitocondrias en grandes dosis. Genes que codifican la proteína de la membrana fosfatidilinositol 3-cinasa y lisosomal asociada 2 participaron en tal una preferencia del organelo. Administración de SWCNT dio lugar a colapso del potencial de membrana mitocondrial, dando lugar a la sobreproducción de especies reactivas de oxígeno, resultando en daños de la mitocondria, que fue seguido por lesión celular y lisosomal. Basado en las diferencias de dosificación en organelos de destino, NTCSPs fueron utilizados con éxito para entregar acetilcolina en el cerebro para el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer inducida experimentalmente con un margen de seguridad moderado controlando precisamente las dosis, asegurando que NTCSPs preferencial entran lisosomas, los organelos de destino y no las mitocondrias, los orgánulos de destino para la citotoxicidad SWCNT. DESDE el EDITOR clínico: Nanotubos de carbono de pared simple (SWCNT) podrían hacer excelentes sistemas específicos para productos farmacéuticos. Dentro de las células, lisosomas son los organelos objetivo farmacológico de SWCNT, pero en grandes dosis las mitocondrias también toman SWCNT y toxicidad mitocondrial se convierte en el motivo de toxicidad general de este enfoque. En este trabajo, SWCNT fueron utilizados con éxito para entregar la acetilcolina en el cerebro de la enfermedad de Alzheimer con la gama de alta seguridad por controlar las dosis para lysosomal pero no mitocondrial dirigidos a.

Gemcitabina Concurrente Y Terapia De Ultrasonido Enfocado De Alta Intensidad En Pacientes Con Cáncer De Páncreas Localmente Avanzado

Anti-cancer Drugs. Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20075714

Este ensayo de fase II se realizó para evaluar la seguridad y eficacia de gemcitabina concurrente y terapia de ultrasonido enfocado de alta intensidad (HIFU) en pacientes con cáncer de páncreas localmente avanzado. Pacientes con adenocarcinoma pancreático irresecable localizada en la cabeza o el cuerpo del páncreas recibieron gemcitabina (1000 mg/m) por vía intravenosa durante 30 minutos en los días 1, 8 y 15 y tratamiento HIFU concurrente en los días 1, 3 y 5. El tratamiento se administró cada 28 días. Treinta y siete (94,9%) de los 39 pacientes fueron evaluables para la respuesta, y se confirmaron dos casos de respuesta completa y 15 casos de respuesta parcial, dando una tasa de respuesta global del 43,6% [95% intervalo de confianza (IC), 28.0-59,2%]. El período de seguimiento medio fue de 16,5 meses (rango: 8.0-28,5 meses). La mediana de tiempo a la progresión y la supervivencia general para todos los pacientes fueron 8.4 (95% CI, 5.4-11,2 meses) y 12,6 meses (IC del 95%: 10.2-15.0 meses), respectivamente. Las estimaciones de supervivencia global a los 12 y 24 meses fueron 50,6% (95% CI, 36.7-64,5%) y el 17,1% (95% CI, 5.9-28,3%), respectivamente. Un total de 16,2% de los pacientes experimentados grado 3/4 neutropenia. Trombocitopenia grado 3 fue documentada en dos pacientes (5,4%). Grado 3 náuseas/vómitos y diarrea fueron observados en tres (8,1%) y dos pacientes (5,4%), respectivamente. Fiebre de grado 1 o 2 se detectó en el 70.3% de los pacientes. Veintiocho pacientes (71,8%) se quejaban de dolor abdominal constante con dolor relacionado con el tumor antes de la terapia HIFU. Dolor fue relevado en 22 pacientes (78,6%). En conclusión, gemcitabina concurrente y HIFU es una modalidad de tratamiento tolerado con actividad prometedor en pacientes con cáncer de páncreas localmente avanzado no tratado anteriormente.

La Asociación Entre El Polimorfismo De TA-repetición En La Región Promotora Del Riesgo De Cáncer UGT1A1 Y Mama: a Meta-analysis

Breast Cancer Research and Treatment. Aug, 2010  |  Pubmed ID: 20087647

Uridina diphospho-glucuronosyltransferase 1A1 (UGT1A1) desempeña un papel importante en el desarrollo de cáncer de mama. Hasta la fecha, muchas publicaciones han evaluado la correlación entre el riesgo de cáncer de polimorfismo y mama UGT1A1 TA-repetición. Sin embargo, los resultados siguen siendo inconclusos. Para resolver este conflicto, se realizó un metanálisis mediante búsquedas en bases de datos Medline, PubMed y ISI Web of Knowledge. Se colectaron siete estudios 5.746 casos y 8.365 controles para polimorfismo UGT1A1 TA-repetición. La fuerza de asociación entre el riesgo de cáncer de polimorfismo y mama UGT1A1 TA repetición se evaluó calculando ORs crudos con IC del 95%. En general, no fueron encontradas asociaciones significativas entre polimorfismo y mama UGT1A1 TA repetición susceptibilidad al cáncer. En el análisis estratificado por origen étnico y la fuente de los controles, asociaciones significativas se observaron sólo por 6/6 y 7/7 (OR = 0,88; IC del 95%: 0,77-0.99; P = 0.425 para heterogeneidad) en caucásicos, pero no en otros modelos genéticos. En conclusión, este metanálisis sugieren que el alelo TAA UGT1A1 A(TA) (7) es un potencial factor de riesgo para el cáncer de mama en personas de raza blanca.

Imágenes in Vivo De Fluorescencia De La Regeneración De La Célula Muscular Por Trasplantadas EGFP-etiquetados Mioblastos

Molecular Therapy : the Journal of the American Society of Gene Therapy. Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20125125

En vivo las imágenes por fluorescencia (FLI) para su monitoreo proteína fluorescente (FP)-etiquetados células y las proteínas en los organismos vivos no invasiva. Aquí, examinamos si esta modalidad podría llegar a una sensibilidad suficiente para permitir la evaluación del proceso de regeneración de aumento de proteína verde fluorescente (EGFP)-etiquetados precursores musculares (mioblastos). El uso de un básico de la estación de FLI, que fueron capaces de detectar claras señales de fluorescencia generada por 40.000 células marcadas se inyectan en un músculo tibial anterior (TA) muscular de ratón. Hemos observado que la señal se redujo a aproximadamente 25% en las 48 horas de la inyección de células seguida por una recuperación de partida en el segundo día y alcanzó un máximo de aproximadamente 45% de la señal original por el séptimo día, lo que sugiere que la población sobrevivió sometió a una edición limitada de la proliferación de antes de la diferenciación. Para evaluar si los mioblastos trasplantados podrían formar las células satélite, que lesionó los músculos trasplantados en varias ocasiones con cardiotoxina. Hemos observado una recuperación de la señal de fluorescencia después de una desaparición de la señal después de cada inyección cardiotoxina. Su estudio anatomopatológico demostró células derivadas del donante ubicados debajo de la membrana basal y expresar Pax7, lo que confirma que la regeneración observada por la imagen estaba mediada por las células de los donantes de hecho derivados de satélite. Nuestros resultados muestran que FLI es una poderosa herramienta que puede ampliar nuestra capacidad para dar a conocer complicados procesos biológicos tales como células madre mediada por la regeneración.

Polimorfismo De TGFB1 509 C/T Y El Riesgo De Cáncer Colorrectal: Un Meta-análisis

Medical Oncology (Northwood, London, England). Dec, 2010  |  Pubmed ID: 20012233

Transforming growth factor β (TGF-β) es una citoquina. La vía de señalización de TGF-β desempeña un papel importante en el control de la proliferación celular y diferenciación en la carcinogénesis colorrectal. En células de mamíferos, TGFB1 es el subtipo más abundante de TGF-β. El polimorfismo de C/T 509 en TGFB1 ha sido implicada en el riesgo de cáncer colorrectal. Sin embargo, datos publicados siguen siendo contradictorias. Para obtener una estimación más precisa de la relación, se realizó un metanálisis de 994 casos y 2.335 controles de cinco estudios de casos y controles publicados. En general, los riesgos de cáncer colorrectal significativamente mayor encontrados para CC y TT (o = 1.62; 95% CI: 1.30-2.02; Pheterogeneity = 0.118), TC + CC versus TT (o = 1,30; 95% CI: 1.08-1,58; Pheterogeneity = 0.259) y CC versus TC + TT (o = 1,48; 95% CI: 1.26-1.75; Pheterogeneity = 0.249). En el análisis de subgrupos por etnia, significativamente mayores riesgos también se encontraron entre los asiáticos de CC y TT (OR = 1.77; 95% CI: 1.40-2.24; Pheterogeneity = 0.519), TC + CC versus TT (o = 1,38; 95% CI: 1.13-1.68; Pheterogeneity = 0.679) y CC versus TC + TT (o = 1,58; 95% CI: 1.31-1.89; Pheterogeneity = 0.340). Sin embargo, no asociaciones significativas encontradas entre los europeos para todos los modelos genéticos. Este metanálisis mostró que el alelo de TGFB1 509 C es un factor de riesgo de desarrollar cáncer colorrectal en asiáticos.

Ninguna Asociación Entre El Riesgo De Cáncer De Polimorfismo Y Mama CYP17 T - 34C: Un Meta-análisis 58.814 Individuos

Breast Cancer Research and Treatment. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 20013047

El cáncer de mama es uno de los tumores malignos más comunes en todo el mundo. Hasta la fecha, muchos artículos han evaluado la asociación entre el citocromo P450c17 (CYP17) T - 34 C polimorfismo y mama el riesgo de cáncer. Sin embargo, los resultados siguen siendo inconclusos. Con el fin de obtener una estimación más precisa de la Asociación, se realizó un metanálisis en este estudio. Mediante búsquedas en bases de datos Medline, ISI Web of Knowledge, Cochrane, ScienceDirect, EBSCO, CNKI y SinoMed, se colectaron 43 estudios 26.008 casos y 32.806 controles para el polimorfismo del CYP17 T - 34C. ORs crudos con IC del 95% se utilizaron para evaluar la fuerza de asociación entre el riesgo de cáncer de polimorfismo y mama CYP17 T - 34C. Se realizaron las RUP agrupadas para modelo codominante, modelo dominante y recesiva modelo, respectivamente. En general, no asociaciones significativas entre la susceptibilidad al cáncer polimorfismo y mama CYP17 T - 34C encontradas para TT contra CC (o = 0,96; IC del 95%:: 0,89-1.05), TC versus CC (OR = 0.97; IC del 95%:: 0,89-1.06), TT + TC versus CC (OR = 0.97; IC del 95%:: 0,89-1.05) y TT versus TC + CC (o = 0,98; IC del 95%:: 0.93-1.03). En el análisis estratificado por origen étnico, estado menopáusico y fuentes de los controles, asociaciones significativas fueron aún no detectadas en todos los modelos genéticos. En conclusión, este metanálisis sugieren fuertemente que polimorfismo CYP17 T - 34C no está asociado con el riesgo de cáncer de mama.

La Asociación Entre El Riesgo De Cáncer De Polimorfismo Y Mama ERCC2 Asp312Asn: Un Meta-análisis 22.766 Individuos

Breast Cancer Research and Treatment. Aug, 2010  |  Pubmed ID: 20127278

Hasta la fecha, muchas publicaciones discuten la correlación entre el riesgo de cáncer de polimorfismo y mama ERCC2 Asp312Asn. Sin embargo, los resultados no fueron unánimes. Con el fin de derivar una conclusión más precisa, se realizó un metanálisis en este estudio mediante búsquedas en bases de datos Medline, PubMed y ISI Web of Knowledge. Finalmente, se obtuvieron 17 estudios 12.019 casos y 10.747 controles para este metanálisis. La fuerza de asociación entre el riesgo de cáncer de polimorfismo y mama ERCC2 Asp312Asn se evaluó calculando ORs crudos con IC del 95%. En general, no fueron encontradas asociaciones significativas entre polimorfismo y mama ERCC2 Asp312Asn susceptibilidad al cáncer. En el análisis estratificado por origen étnico, se observaron asociaciones significativas para Asn/Asn versus Asp/Asp (OR = 0.55; IC 95%: 0,32-0,96) y Asn/Asn versus Asn/Asp + Asp/Asp (OR = 0,53; IC 95%: 0,32-0,90) en asiáticos. En el análisis estratificado por diseño del estudio, se encontraron asociaciones significativas para Asn/Asn versus Asp/Asp (o = 0,79; IC 95%: 0,64-0,98) y Asn/Asn versus Asn/Asp + Asp/Asp (OR = 0.82; 95%: 0,68-0,99) en estudios poblacionales. En conclusión, este metanálisis proporciona una evidencia que ERCC2 312Asn alelo puede tener un efecto protector para el desarrollo de cáncer de mama en los asiáticos.

El Tratamiento Triple Negativo Cáncer De Mama Por Una Combinación De Rapamicina Y Ciclofosfamida: Un Estudio in Vivo Imágenes De Bioluminiscencia

European Journal of Cancer (Oxford, England : 1990). Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20156674

La rapamicina, un objetivo de mamíferos de la rapamicina (mTOR) inhibidor, se ha demostrado que inhibe el crecimiento del cáncer de mama estrógeno positivo. Sin embargo, triple negativo (TN), el cáncer de mama es resistente al tratamiento rapamicina in vitro. Nos pusimos a probar un tratamiento de combinación de rapamicina con el agente de daño del ADN-, la ciclofosfamida, en un modelo de cáncer de mama TN. Al unirse a alterar el ADN celular y, ciclofosfamida mata a las células a través de interferir con sus funciones normales. Se evaluaron las respuestas de los ratones desnudos teniendo xenoinjertos tumorales de TN MDA-MB-231 células a la combinación de rapamicina y ciclofosfamida en ambos modelos ortotópico mamarias y pulmón metástasis. Seguimos el crecimiento del tumor y la metástasis mediante imágenes de bioluminiscencia y examinaron la expresión de Ki67, CD34 y HIF 1 alfa-en los tejidos tumorales mediante técnicas de inmunohistoquímica y el índice de apoptosis con ensayo de TUNEL, y encontraron que la MDA-MB-231 células son sensibles a la terapia con rapamicina en ortotópico mamaria , pero no en el pulmón con metástasis. La rapamicina en combinación con ciclofosfamida se encuentra que tiene un efecto más significativo en la reducción de volumen del tumor y la metástasis con una tasa de supervivencia mejorado mucho. Nuestros datos también muestran que la sensibilidad de los tumores TN para la rapamicina se asocia con el microambiente de las células tumorales. Los datos indican que en un ambiente relativamente hipóxico HIF-1 alfa puede jugar un papel en la mediación de los efectos anti-cáncer de la rapamicina y ciclofosfamida puede prevenir la activación de Akt por las votaciones de la rapamicina. En general nuestros resultados muestran que la rapamicina y ciclofosfamida puede lograr una mayor eficacia en la supresión del crecimiento tumoral y la metástasis, lo que sugiere que la terapia de combinación puede ser una opción de tratamiento prometedora para el cáncer de TN.

Efecto Del PH Sobre La Actuación De La Coagulación De Coagulantes Basadas En Al Y Especiación De Aluminio Residual Durante El Tratamiento De Agua Sintético De Caolín-ácido Húmico

Journal of Hazardous Materials. Jun, 2010  |  Pubmed ID: 20188465

El fraccionamiento y la medición de aluminio residual se llevó a cabo durante el tratamiento de ácidos húmico (ah)-agua sintética de caolín con cloruro de Al(2)(SO(4))(3), AlCl(3) y polyaluminum (PAC) con el fin de investigar el efecto del pH sobre el rendimiento de la coagulación como especiación de aluminio residual. Resultados experimentales sugieren que el rendimiento de eliminación de turbidez varió según el siguiente orden: AlCl(3)>PAC>Al(2)(SO(4))(3). HA rendimiento de eliminación de la PAC fue mejor que la de AlCl(3) en condiciones ácidas. El rango de pH óptimo para AlCl(3) y Al(2)(SO(4))(3) fue entre 6.0 y 7.0, mientras que el PAC mostró estable HA y UV(254) capacidad de remoción con mayor variación del pH (5.0-8.0). Para los tres coagulantes, mayoría de aluminio residual existió en la forma de Al disuelto total (60-80%), que existió en su mayoría en oligómeros o complejos formados entre Al y materia orgánica natural o materiales poliméricos coloidales. PAC exhibe la menor concentración para cada tipo de especies de aluminio residual, así como su porcentaje en aluminio residual total, seguido por AlCl(3) y Al(2)(SO(4))(3) (en orden creciente). Por otra parte, PAC efectivamente podría reducir la concentración de disuelto Al monomérica y su relación de aluminio residual fue el menor entre los tres coagulantes y varió poco en un pH inicial entre 7.0 y 9.0.

La Asociación Entre Dos Polimorfismos Del Riesgo De Cáncer De ENOS Y Mama: a Meta-analysis

Breast Cancer Research and Treatment. Nov, 2010  |  Pubmed ID: 20204503

El cáncer de mama es uno de los tumores malignos más comunes en todo el mundo. Óxido nítrico sintasa endotelial (eNOS) desempeña un papel clave en el desarrollo del cáncer de mama. Las asociaciones entre los dos polimorfismos de eNOS (E298D rs1799983,-786T > C rs2070744) y cáncer de mama no son concluyentes. Se realizó un metanálisis en este estudio. Mediante búsquedas en Medline, ISI Web of Knowledge, ScienceDirect, EBSCO, CNKI y SinoMed base de datos, se recolectaron seis estudios de casos y controles para el eNOS E298D polimorfismo (3.038 casos y 2.508 controles) y tres estudios de casos y controles fueron elegibles para la eNOS-786T > C polimorfismo. ORs crudos con IC del 95% se utilizaron para evaluar la fuerza de asociación entre los dos polimorfismos de eNOS y riesgo de cáncer de mama. Se realizaron las RUP agrupadas para modelo codominante, modelo dominante y recesiva modelo, respectivamente. Significativamente menor riesgo se observó en general, E298D (para EE vs DD: O = 0.74, IC del 95%: = 0,59-0,94; para ED vs DD: O = 0,78, IC del 95%: 0,61-0,98; para el modelo dominante: O = 0.77, IC del 95%: = 0,61-0.96) y - 786T > C (para TT vs CC: O = 0.60, IC del 95%: = 0.42-0,86; para el modelo dominante: O = 0,66, IC del 95%: = 0.47-0.94). En el análisis de subgrupos por etnia, disminución de riesgos encontrados para E298D (para EE vs DD: O = 0.75, IC del 95%: = 0,56-0.99) y - 786T > C (para TT vs CC: O = 0.53, IC 95%: = 0.35-0,81; para el modelo dominante: O = 0,61, IC del 95%: = 0.41-0,91; para modelo recesivo: O = 0.70, IC del 95%: = 0.55-0.91) entre caucásicos; se observaron importantes riesgos de disminución para E298D (para ED vs DD: O = 0,12, IC del 95%: = 0.02-0.96; para el modelo dominante: O = 0,13, IC del 95%: = 0.02-1.00) entre los asiáticos. En conclusión, este metanálisis sugieren que ambos eNOS E298D y - 786T > C polimorfismos están asociados con el riesgo de cáncer de mama reducida.

Genes Bajo Selección Positiva En Mycobacterium Tuberculosis

Computational Biology and Chemistry. Oct, 2011  |  Pubmed ID: 22000803

Se empleó un enfoque de genómica evolutiva para detectar genes bajo selección positiva de linaje específico para las dos estrechamente relacionados con Mycobacterium tuberculosis cepas, la virulenta H37Rv y la insipidez H37Ra, con la clínica aislar CDC1551 como el grupo externo. Encontramos seis H37Rv específicos y seis H37Ra-específico seleccionado positivamente genes, entre los que el primero comprende una flavoproteína, un factor sigma de ARN polimerasa SigM, dos proteínas familiares de EPI, así como dos proteínas hipotéticas, mientras que el último consistió en una deshidrogenasa, una (3R) subunidad de - hidroxiacil - ACP deshidratasa HadA, una proteína de familia del PPE y tres proteínas de familias PE-RCV. Obviamente, las proteínas de la familias de PE/PPE/PE-RCV fueron los principales objetivos de selección positiva. La discusión funcional de nuestros resultados implica que esos genes seleccionados positivamente fueron altamente implicados en las variaciones del antígeno y evasiones inmunes de Mycobacterium tuberculosis.

[Estimación De Las Propiedades Físicas Y Mecánicas De Neosinocalamus Affinins Con Cerca De Espectroscopia De Infrarrojo]

Guang Pu Xue Yu Guang Pu Fen Xi = Guang Pu. Mar, 2011  |  Pubmed ID: 21595210

Cerca de la espectroscopia infrarroja se aplicó para predecir rápidamente densidad, módulo de ruptura y resistencia a la tracción paralela al grano de neosinocalamus affinins. Intervalo al revés partial least squares (BiPLS) se usó para hallar las gamas de espectro más informativas y construir modelos basan en espectros crudos y pretratados espectros, como espectros derivados primeros, segundo espectros derivados, espectros suavizados Savitzky-Golay y espectros estándar variable normalizada. Y también se desarrollaron modelos de cuadrados mínimos parciales (PLS) en la longitud de onda entera gama 350-2500 nm. Los resultados muestran que en comparación con modelos PLS, BiPLS efectivamente podrían encontrar las regiones del espectro óptimo y mejorar la capacidad predictiva de los modelos. Los modelos óptimos de densidad, módulo de ruptura y resistencia a la tracción paralela al grano se obtuvieron a través del método BiPLS que separaba los espectros todo pretratados estándar variable normalizada, derivado de la segunda y primera derivados respectivamente en intervalos de 20, 30 y 20. Y los modelos de predicción de densidad, módulo de ruptura y resistencia a la tracción paralela al grano tenían el coeficiente de correlación (r) 0,85 y 0.88 0.88, así como de raíz media estándar error de predicción (RMSEP) 0.0524, 0.0185 y 0.0292, respectivamente. La relación entre NIR predijo valores y valores reales fue buena en todos los casos. Por lo tanto, los resultados experimentales demostraron que la espectroscopia NIR era prometedor para la predicción de las propiedades físicas y mecánicas de neosinocalamus affinins.

Población Estructura Y Phylogeographical Patrón Genético De Saltamontes De Arroz, Oxya Hyla Intricata, a Través De Asia Sur-Oriental

Genetica. Apr, 2011  |  Pubmed ID: 21505761

El saltamontes de arroz, Oxya hyla intricata, es una plaga del arroz en el sudeste asiático. En este estudio, la diversidad genética de la población y la estructura de este Oxya especies fue examinada usando secuencias de ADN y la tecnología de la AFLP. Se recolectaron las muestras de 12 poblaciones de cuatro países del sudeste asiático, entre las que se analizaron 175 individuos utilizando el ADN mitocondrial secuencias de la subunidad de citocromo c oxidasa I (COI), y 232 personas fueron examinadas usando polimorfismos de longitud de fragmentos amplificados (AFLP) para probar si el patrón de phylogeographical y genética de la población de esta especie están relacionado a los últimos acontecimientos geológicos u oscilaciones climáticas. Ninguna tendencia evidente de la diversidad genética se encontró a lo largo de un gradiente de latitud/longitud entre los diferentes grupos geográficos. Análisis filogenético indica tres clados monofiléticos profundo que corresponden aproximadamente a tres regiones geográficas separadas por altas montañas y un profundo estrecho, TCS análisis también reveló tres redes desconectadas, sugiriendo que espacial y temporales separaciones por vicarianza, que también fueron apoyadas por AMOVA como una fuente de la varianza molecular presentan entre grupos. Análisis de flujo genético demostró que había habido frecuente histórico flujo de genes entre poblaciones locales en diferentes regiones, pero las redes no expuestas haplotipo compartida entre poblaciones. En conclusión, el pasado geológico los eventos y las fluctuaciones climáticas son el factor más importante en la estructura de phylogeographical y patrones genéticos de hyla o. intricata en el sudeste asiático. Hábitat, vegetación y efecto antrópico pueden contribuir también a flujo genético e introgresión de esta especie. Por otra parte, temperatura, precipitaciones abundantes y una diversidad de especies de gramíneas son beneficiosos para la migración de hyla o. intricata. Haplotipo alta diversidad filogenética profunda división, negativa de Fu valores de F (s) y unimodal y formas de distribución multimodal sugieren un patrón complicado expansión demográfica de estas poblaciones de hyla o. intricata, que pudo haber causado por las oscilaciones climáticas durante periodos glaciares en el Cuaternario.

Análisis Del Embrión, Correlaciones Genéticas Citoplásmicas Y Maternales Para Siete Aminoácidos Esenciales En Harina De Colza (Brassica Napus L.)

Journal of Genetics. Apr, 2011  |  Pubmed ID: 21677390

Correlaciones genéticas de rasgos de calidad de nutrientes incluyendo contenido de lisina, metionina, leucina, isoleucina, fenilalanina, valina y treonina en comida de rabina se analizaron mediante el modelo genético para caracteres cuantitativos de plantas diploides con un diseño dialélico de nueve padres de Brassica napus L. Estos resultados indicaron que las correlaciones genéticas de un embrión, citoplasma o contribución diferentes planta materna havemade totales correlaciones genéticas de rasgos más pares de nutrientes de calidad. Las correlaciones genéticas entre los aminoácidos en la comida de rabina simultáneamente fueron controladas por correlaciones genéticas principales y genotipo x correlaciones de interacción del entorno (GE), especialmente para las correlaciones de dominación materna. Mayoría de los componentes de las correlaciones genéticas de principales y correlaciones de interacción de GE para los pares rasgos estudiados fueron significativamente positiva. Algunos de los rasgos pares tenían correlaciones genéticas negativas, especialmente entre valina y otros contenidos del aminoácido. Selección indirecta para mejorar las características de calidad de la harina de colza podría esperarse en la cría de violación según la magnitud y dirección de los componentes de la correlación genética.

[Estudio Sobre La Clasificación De Madera Por Cerca De Espectroscopia De Infrarrojo]

Guang Pu Xue Yu Guang Pu Fen Xi = Guang Pu. Apr, 2011  |  Pubmed ID: 21714241

El presente trabajo discute la clasificación madera según módulo de ruptura (MOR) por cerca de espectroscopia de infrarrojo (cercano NIR). El modelo de calibración se construyó entre MOR de madera y datos NIR en la gama de 1 000-1 400 nm con la regresión cuadrada menos parcial (PLS). El coeficiente de correlación (r) fue de 0.89 y el error estándar de calibración (SEC) 6,30 MPa. El MOR de 35 muestras desconocidas fue predicha utilizando el modelo. Muestras de madera se clasificaron según sus valores predichos y valores verdaderos. La tasa de predicción correcta para el A, B y C 75.0%, 91.3% y 80.0% respectivamente, y la tasa toda de derecha predicción fue 88,6%. El resultado ha demostrado que cerca de la espectroscopia infrarroja es un método rápido para la determinación del grado de madera en las pequeñas muestras claras.

¿Por Qué Come El Panda Gigante Bambú? Un Análisis Comparativo De Los Genes Relacionados Con La Recompensa-apetito Entre Mamíferos

PloS One. 2011  |  Pubmed ID: 21818345

El panda gigante tiene una dieta de bambú interesante a diferencia de las otras especies en el orden Carnivora. El umami gusto gen receptor que T1R1 ha sido identificado como un pseudogene durante su genoma proyecto de secuenciación y confirmada usando una muestra de diferentes panda gigante. El tiempo estimado de la mutación de este gen es aproximadamente 4,2 Myr. Tal mutación coincidió con cambio dietético del panda gigante y había reforzado también su estilo de vida herbívora. Sin embargo, este gen que preserva en herbívoros como la vaca y el caballo, debemos buscar otras razones detrás de interruptor de alimentación de los pandas gigantes.

Desarrollo Y Caracterización De Cartillas De Microsatélites Polimórficos En Soongorica Reaumuria (Tamaricaceae)

American Journal of Botany. Aug, 2011  |  Pubmed ID: 21821585

• Premisa del estudio: marcadores microsatélites polimórficos se desarrollaron en Soongorica Reaumuria, un arbusto desértico que ocurre ampliamente en China occidental, para investigar su estructura genética genética, diversidad y población. • Métodos y resultados: usando la técnica de captura de biotina combinado, 10 sistemas de cartilla de loci polimórficos del microsatellite novela fueron aislados y caracterizados en 90 personas de seis poblaciones de r. Reaumuria. Se identificaron cinco a 14 alelos por locus para estos microsatélites. Heterozygosities observadas y esperadas variaron de 0.132 0.593 y 0.217 a 0.803, respectivamente. • CONCLUSIONES: estos marcadores microsatélites proporcionan una herramienta útil para evaluar la estructura genética de la variación y la población de r. Reaumuria.

Producción Altamente Eficiente De Proteínas Solubles De Cuerpos De Inclusión Insolubles Por Un Método De Two-step-desnaturalizantes Y Repliegue

PloS One. 2011  |  Pubmed ID: 21829569

La producción de proteínas recombinantes en gran escala es importante para los estudios funcionales y estructurales de proteínas, especialmente mediante el uso de sistemas de Escherichia coli sobreexpresión; sin embargo, aproximadamente 70% de proteínas recombinantes están sobreexpresado como cuerpos de inclusión insolubles. Aquí presentamos un método eficiente para la generación de proteínas solubles de cuerpos de inclusión mediante dos pasos de desnaturalización y a un paso de refolding. Primero hemos demostrado las ventajas de este método sobre un procedimiento convencional con un paso de desnaturalización y un repliegue paso usando tres proteínas con diferentes propiedades plegables. Las proteínas replegadas fueron encontradas para ser activo mediante ensayos in vitro y un bioensayo. Entonces probamos la aplicabilidad general de este método mediante el análisis de 88 proteínas de humanos y otros organismos, todos los cuales se expresaron como cuerpos de inclusión. Encontramos que alrededor del 76% de estas proteínas se volver a plegarlo con un promedio de > 75% rendimiento de proteínas solubles. Este método (2dr) "two-step-desnaturalizantes y repliegue" es simple, altamente eficiente y de aplicación general; se puede utilizar para obtener activas proteínas recombinantes para investigación básica y uso industrial.

Mapa De Auto-organización De Redes Reguladoras Del Gen Para Fenotipos Celulares Durante La Reprogramación

Computational Biology and Chemistry. Aug, 2011  |  Pubmed ID: 21864790

Las células pluripotentes inducidas (iPSCs) se derivan de las células somáticas por reprogramación de sus perfiles genéticos. Este proceso requiere la expresión dinámica coordinada de cientos de genes y proteínas. Como elementos tanto determinísticos y estocásticos controlan el proceso de reprogramación, no es fácil tener una forma de reflejar el estado de la red de regulación de gene en ésos reprogramando células. En este estudio, aplicamos mapas de auto-organización (SOMs) en los genes complejos datos de células pluripotentes diferentes, incluyendo las células reprogramadas parcialmente y totalmente reprogramadas pluripotentes inducidas (iPSCs), células embrionarias (CES) y células madre adultas provenían de diferentes tejidos. Demostramos que nuestro SOMs tienen buena correlación con el PluriNet previamente divulgado de células madre y son diagramas pictóricos que pueden reflejar la condición intrínseca de las células.

[Aplicación Preliminar De 3.0 Sistema De Neuronavegación T La Proyección De Imagen De Resonancia Magnética Intraoperatoria En China]

Zhonghua Wai Ke Za Zhi [Chinese Journal of Surgery]. Aug, 2011  |  Pubmed ID: 22168929

Para divulgar la experiencia preliminar de la aplicación clínica de 3.0 sistema de Neuronavegación T la proyección de imagen de resonancia magnética intraoperatoria (iMRI) en China.

Propiedades De Solvatación De N-acetil-β-glucosamina: Dinámica Molecular Estudio Incorporando Polarización Electrostática

Journal of Computational Chemistry. Dec, 2011  |  Pubmed ID: 21898464

N-acetil-β-glucosamina (NAG) es una parte importante de las glicoproteínas y participa en muchas funciones biológicas. Sin embargo, propiedades conformacionales y dinámicas de las moléculas NAG en solución acuosa, el entorno biológico más común, siendo ambiguos debido a las limitaciones de los métodos experimentales. Están cada vez más esfuerzos a investigar las propiedades estructurales de NAG y NAG que contienen macromoléculas, como peptidoglicanos y quitina polimérica, nivel atómico mediante simulaciones de dinámica molecular. En este trabajo, desarrollamos un campo de fuerza de carbohidratos polarizable resultados de simulación de NAG y contraste de diversas propiedades utilizando este nuevo campo de fuerza y un modelo análogo nonpolarizable (cargo fijo). Soluciones acuosas de NAG y sus oligómeros son investigadas; exploramos propiedades conformacionales (geometría de bonos rotativo), propiedades electrostáticas (distribución del momento de dipolo), propiedades dinámicas (coeficiente de autodifusión), Unión de hidrógeno (agua puente estructura y dinámica) y energía libre de hidratación. El campo de fuerza de carga fija carbohidratos exhibe las desviaciones de la energía de rotación relativo de fase de gas de la cadena lateral de exocyclic hidroximetil y de distorsión de anillo de silla/barco. El campo de fuerza polarizable predice propiedades conformacionales de acuerdo con los resultados correspondientes de la primera. Patrón de vinculación del hidrógeno de NAG-agua es estudiado a través de funciones de distribución radial (RDFs) y funciones de correlación. Vinculación entre soluto y solvente del hidrógeno intermolecular se encuentra para estabilizar las estructuras de solución NAG mientras que los enlaces de hidrógeno intramoleculares definir la geometría de un enlace glicosídico de oligómeros NAG. El componente electrostático de energía libre de hidratación es altamente dependiente de campo de fuerza atómica cargas parciales, la que influyen en una energía más favorable de hidratación en el modelo de carga fija en comparación con el modelo polarizable.

Irritación Química De La Próstata Sensibiliza P(2)X(3) Mediada Por Receptor Respuestas En Neuronas De Ganglio De Raíz Dorsal De Rata

Neurourology and Urodynamics. Apr, 2011  |  Pubmed ID: 21254200

P(2)X(3) (ATP-bloqueados los receptores) en las neuronas nociceptivas del ganglio de raíz dorsal (GRD) participar en la transmisión de las señales del dolor desde la periferia a la médula espinal. Sin embargo, el papel de los receptores P(2)X(3) en dolor crónico de próstata y continuo dolor insuperable sigue siendo confuso.

Energética De La Fase De Transferencia De Alcoholes De Moléculas Pequeñas a Través Del Agua-hexano: Simulaciones De Dinámica Molecular Usando Modelos De Equilibrado De Carga

Journal of Molecular Graphics & Modelling. Apr, 2011  |  Pubmed ID: 21414823

Estudiamos la interfaz de agua-hexano usando dinámica molecular (MD) y carga polarizable equilibrado (CHEQ) campos de fuerza. A granel densidades para TIP4P-FQ agua y hexano, 1.0086±0.0002 y 0.6378±0.0001 g/cm(3), demostrar excelente acuerdo con el experimento. Anchura interfacial y la tensión interfacial son consistentes con los valores previamente divulgados. El componente en el plano de la permitividad dieléctrica (ɛ(||)) de agua se muestra para disminuir de 81.7±0.04 a la unidad, longitudinalmente la transición del agua a granel a granel hexano. Ɛ(||) para hexano alcanza un máximo en la interfaz, pero este término representa sólo una pequeña contribución a la constante dieléctrica total (como era de esperarse para una especie no polar). Estructuralmente, orientaciones netas de las moléculas se presentan en la región interfacial que hexano se encuentra ligeramente paralelo a las interfaz y agua reorients para maximizar la vinculación del hidrógeno. Interfaciales potenciales debido a las contribuciones del agua y hexano se calculan - mV 567.9±0.13 y 198.7±0.01, respectivamente, dando lugar a un potencial total de acuerdo con el intervalo de valores registrados de anteriores simulaciones de sistemas similares. Potenciales de fuerza media (PMF) calculado para 1-propanol, etanol y metanol para la transferencia de agua con el hexano indican un mínimo de energía interfacial, correspondiente a la naturaleza anfifílicas de las moléculas. Las magnitudes de transferencia libre energías más caracterizaron de las energías de solvatación libre de alcoholes en agua y hexano mediante integración de termodinámica. Este análisis muestra que solvatación energías libres de alcoholes en hexano son 0,2 a 0,3 kcal/mol demasiado desfavorable, mientras que solvatación de alcoholes en agua es aproximadamente 1 kcal/mol demasiado favorable. Para las simulaciones interfacial hexano-agua pura, observamos una disminución monotónica del momento de dipolo de agua a valores cerca de vacío. Esto sugiere que el componente electrostático de la energía libre de desolvation no es tan grave para los modelos polarizables que para campos de fuerza de carga fija. Las consecuencias de semejante comportamiento pertenecen al modelado de solutos polares y cargados en entornos lipídicas.

Determinación De Asperosaponin VI En Plasma De Perro Por Espectrometría De Masas Tándem Cromatografía Líquida Alto Rendimiento Y Su Aplicación a Un Estudio Farmacocinético Piloto

Biomedical Chromatography : BMC. Jan, 2012  |  Pubmed ID: 21465503

Un método rápido y sensible líquida cromatografía-tándem espectrometría de masas (LC-MS/MS) ha sido desarrollado y validado para la determinación de asperosaponin VI en plasma, perro beagle utilizando ácido glicirrícico como estándar interno (IS). Las muestras de plasma fueron simplemente pretratadas con metanol para desproteinización. Separación cromatográfica se realizó en una columna de Hedera ODS-2 usando una fase móvil de metanol-10 mm amonio acetato tampón que contiene ácido acético 0.05% (71:29, v/v) con un caudal de 0.38 mL/min Asperosaponin VI y el se eluyeron a 2.8 y 1.9 min, respectivamente, ionizado en modo de iones negativos y luego detectados por monitoreo múltiple de la reacción. La detección utiliza las transiciones de las moléculas de deprotonated en m/z 927.5 → 603.4 asperosaponin VI y m/z 821.4 → 645.4 ácido glicirrícico (IS). El ensayo fue lineal en el rango de concentración de 0.15-700 ng/mL y se aplicó con éxito a un piloto estudio farmacocinético en perros beagle.

Mejorar La Capacidad De Crecimiento Intrínseco Promueve La Regeneración De CNS Para Adultos

Journal of the Neurological Sciences. Jan, 2012  |  Pubmed ID: 21924742

En el adulto mamífero sistema nervioso central (CNS), los axones no regenera espontáneamente después de lesión debido al ambiente extrínseco inhibitorio y una disminuida capacidad regenerativa intrínseca. Muchos estudios previos se centran principalmente en la caracterización de las moléculas inhibidoras del crecimiento hostil en el SNC. De hecho, sólo bloquear dichas actividades inhibitorios por enfoques genéticos o farmacológicos permite brotación limitada, y la mayoría de las neuronas adultas capaces de regenerar sus axones incluso proporcionados de sustratos permisivos. En los circuitos neurales establecidos durante el desarrollo, poco a poco se reprime la actividad intrínseca de crecimiento neuronal. Poco se sabe que los mecanismos de transición desde el modo de crecimiento robusto de las neuronas inmaduras a la modalidad de crecimiento deficiente de las neuronas maduras y la forma de reactivar la capacidad intrínseca de crecimiento después de la lesión. Las neuronas sensoriales primarias con cuerpos celulares en el ganglio de raíz dorsal (GRD) proporcionan un modelo útil para desarrollar estrategias para aumentar la capacidad de crecimiento intrínseco de las neuronas. Los axones centralmente proyectando en la médula espinal adulta no regenerar, mientras que las ramas periféricas sólidamente regeneran después de lesión. Regeneración de las ramas centrales puede mejorarse significativamente después de una lesión de la rama periférica previa, que se define como la lesión de acondicionado. Repasamos el modo de reactivar el programa de crecimiento intrínseco de la lesión de condicionamiento. Lo importante, se resumieron los determinantes intrínsecos neuronales para el crecimiento de la neurita como campamento, PTEN/mTOR, APC-Cdh1, KLF4, etc., los mecanismos subyacentes de la disminución de desarrollo dependen de la capacidad de crecimiento de las neuronas de CNS y procedimientos para mejorar el potencial de crecimiento intrínseco.

CTCF Y Cohesina Cooperativamente Median La Interacción Interchromatin Específica De Tipo Célula Entre Loci Bcl11b Y Arhgap6

Molecular and Cellular Biochemistry. Jan, 2012  |  Pubmed ID: 21948239

Factor de Unión CCCTC (CTCF) es un organizador principal de la organización espacial de genoma y desempeña un papel importante en la mediación de las interacciones de la cromatina extensa. Captura de conformación del cromosoma circular (4C) es un enfoque de alto rendimiento que permite la proyección del genoma para socios de interacción potencial desconocido. Utilizando un sitio de unión conservado CTCF como cebo en el locus Bcl11b, socio de interacción en el locus Arhgap6 en un cromosoma diferente fue identificado por 4 C. Experimentos adicionales verificado que la interacción interchromatin entre los loci Bcl11b y Arhgap6 era tipo célula específica, que fue mediado cooperativamente por CTCF y cohesina. Análisis funcional demostró que los socios de la interacción interchromatin estaban reprimiendo elementos reguladores. Estos resultados indican que los bucles de cromatina de interacción regulan la expresión de los genes correspondientes.

El Genoma Mitocondrial Completo De La Mariposa Apatura Metis (Lepidoptera: Nymphalidae)

Molecular Biology Reports. Feb, 2012  |  Pubmed ID: 22311013

Como una plaga importante en el delgado hojas sauce (Salix alba), Apatura metis se llama emperador púrpura de Freyer, y su genoma mitocondrial es 15.236 bp largo. Los genes codificados para 22 genes ARNt, dos genes (rrnL y rrnS) de ARN ribosómico y 13 genes proteína-codificación (una) y una zona de control en las mitocondrias de metis a. son altamente homólogas a otras especies de lepidópteros. El genoma mitocondrial de metis a. está sesgado hacia una alta A + T contenido (A + T = 80,5%). Todos los genes proteína-codificación, excepto el COI comienza con el codón CGA según lo observado en otros lepidópteros, comience con un codón de iniciación típico de ATN. TRNAs todos muestran la estructura clásica de trébol, salvo que la dihydrouridine (DHU) brazo del tRNA (Ser(AGN)) forma un lazo simple. La región de a. metis A + T-ricos contiene algunas estructuras conservadas como una estructura que combina el motivo 'ATAGUI' y 19 tramo de poli (T) de bp, que es similar a las encontradas en otros escarabeidos lepidópteros. Los análisis filogenéticos de lepidópteros en base a secuencias de escarabeidos demuestran que cada una de las seis superfamilias es monofilética, y la relación entre ellos es (((Noctuoidea + (Geometroidea + Bombycoidea)) + Pyraloidea) + Papilionoidea) + Tortricoidea. En grupo Papilionoidea, nuestra conclusión sostiene que ((Lycaenidae + Pieridae) + Nymphalidae) + Papilionidae.