The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
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Department of Microbiology and Immunology, University of British Columbia - UBC
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Walsh, D. A., Zaikova, E., Hallam, S. J. Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples. J. Vis. Exp. (28), e1163, doi:10.3791/1163 (2009).
Risultati Rappresentante: Unità 1 campione di acqua L produce uno Sterivix filtro, che contiene biomassa superiore a 0,22 micron. Questo è memorizzato in tampone di lisi per l'estrazione del DNA e analisi successive. Il risultato finale è costituito da un filtro Sterivix per ogni bottiglia da 1 litro memorizzate nel buffer di lisi e pronto per l'estrazione del DNA. Il filtro contiene biomassa superiore a 0,22 micron. I filtri possono essere conservati a -80 ° C prima dell'estrazione Edna.
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E 'indispensabile per pulire panche e pompe con un panno umido dopo l'uso per rimuovere ogni traccia persistente di acqua salata che altrimenti corrodere attrezzature. Anche se la procedura è semplice, il requisito di tempo può essere esteso a seconda della concentrazione di biomassa o detriti nel campione essere filtrato.
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Vorremmo ringraziare la Fondazione canadese per l'innovazione, la British Columbia Fondo di conoscenza per lo sviluppo e la Nazionale di Scienze e Ingegneria Research Council (NSERC) del Canada per sostenere gli studi in corso sulle regioni di scarsità di ossigeno delle acque costiere oceaniche e aperto. DAW è stata sostenuta da borse di studio da NSERC, Killam e la fondazione TULA Centro finanziato per la diversità microbica e Evolution.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Peristaltic pump | Masterflex (Cole Palmer) | 77913-20, 77200-62, 77200-04 | |
| Tygon LFL tubing | Masterflex (Cole Palmer) | 06429-24 | For filtration apparatus |
| Hose clamps | Cole-Parmer | 0683204 | For filtration apparatus |
| 1/4” x 3/16” pipe adaptors | Cole-Parmer | 31702-20 | For filtration apparatus |
| Polypropylene prefilter housing | ADVANTEC | 501200 | For filtration apparatus |
| Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock) | Cole-Parmer | 31507-27 | For filtration apparatus |
| 2“ Magnets | For filtration apparatus | ||
| 3 port carboy caps | For filtration apparatus | ||
| GV 0.22 μm STERIVIX filters | EMD Millipore | SVGV01R5 | |
| 47 mm diameter 2.7 μm GF/D filters | Whatman, GE Healthcare | 1823047 | |
| Lysis buffer | 0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3) | ||
| 0.1 % HCl | For post-filtration rinse | ||
| Autoclaved water | For post-filtration rinse |
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ReplyPosted by: StephenJuly 11, 2011, 10:23 PM