The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
This translation into Dutch was automatically generated through Google Translate.
English Version | Other Languages
1Japan Science and Technology Agency, Core Research for Evolutionary Science and Technology (CREST), 2Division of Systems Medical Science, Institute for Comprehensive Medical Science, Fujita Health University, 3Department of Psychiatry, Graduate School of Medicine, Kyoto University, 4Genetic Engineering and Functional Genomics Group, Horizontal Medical Research Organization, Graduate School of Medicine, Kyoto University, 5Center for Genetic Analysis of Behavior, National Institute for Physiological Sciences, National Institutes of Natural Sciences
Hagihara, H., Toyama, K., Yamasaki, N., Miyakawa, T. Dissection of Hippocampal Dentate Gyrus from Adult Mouse. J. Vis. Exp. (33), e1543, doi:10.3791/1543 (2009).
Dissectie van de hippocampus dentate gyrus
Kwantitatieve real-time PCR
De dentate gyrus werd geïsoleerd met behulp van de hierboven genoemde methode en de resterende hippocampus werd ontleed uit als hoorn van de Ammons monster van wild-type muizen. Real-time PCR van beta-actine, TDO2, DSP, Mrg1b en Tyro3 werden uitgevoerd met de dentate gyrus en de Ammons hoorn monsters zoals eerder is beschreven: 1. Primers 5'-CTGGCGAGATCACGATGACG en 5'-AAGCTACGCTGTTGTCTAACC werden gebruikt voor Mrg1b en GCCTCCAAATTGCCCGTCA en 5'-CCAGCACTGGTACATGAGATCA voor Tyro3.
Microarray analyse
Microarray experimenten werden uitgevoerd met mannelijke wild-type muizen en muizen heterozygoot voor de alfa-isovorm van calcium / calmoduline-afhankelijke proteïne kinase II (alpha-CaMKII + / - muizen) zoals eerder beschreven: 1. In het kort werd RNA geïsoleerd uit de hele hippocampus of de dentate gyrus van de wild-type en mutante muizen gehybridiseerd met een muis Genome 430 2.0 Array (Affymetrix, Santa Clara, CA), en elke GeneChip werd gescand door een Affymetrix GeneChip Scanner 3000 (GCS3000) . GeneChip analyse werd uitgevoerd met Microarray Analysis Suite versie 5.0.
De dentate gyrus neemt ongeveer 25% tot 30% van het volume van de hippocampus formatie 2,3. Het heeft een unieke samenstelling cel en speelt cruciale rol in diverse hersenfuncties. Dan ook, technieken om de dentate gyrus te isoleren zijn nuttig voor het analyseren van de gebeurtenissen die specifiek optreden in deze regio.
Hier hebben we laten zien een procedure om efficiënt ontleden van de dentate gyrus van de volwassen muis hippocampus en bevestigde de precisie van de techniek. De eerste, histologisch onderzoek bleek dat de dentate gyrus werd afgescheiden zonder besmetting door andere regio's (figuur 1), wat aangeeft dat een zuiver dentate gyrus monster kan worden bereid.
Ten tweede hebben we bevestigd dat de ontleedde weefsel dentate gyrus door het uitvoeren van real-time PCR van de dentate gyrus-specifieke genen, TDO2 en DSP, en Ammon de hoorn verrijkt genen, Mrg1b en Tyro3 4 (figuur 2). De mRNA expressie van TDO2 (p = 0,000023; n's = 4 en 4, respectievelijk) en DSP (p = 0,0000030; n's = 4 en 4, respectievelijk) in de dentate gyrus monsters werden gedetecteerd bij duidelijk hogere niveaus, terwijl Mrg1b (p = 0.000080, n's = 4 en 4, respectievelijk) en Tyro3 (p = 0,00017; N = 4 en 4, respectievelijk) waren een lager niveau, dan die in hoorn van de Ammons monsters. Beta-actine expressie niveaus verschilden niet in deze monsters (p = 0,11; N = 4 en 4, respectievelijk). Zo kunnen we controleren of de dentate gyrus juist is ontleed door het uitvoeren van dergelijke eenvoudige real-time PCR experimenten.
Ten derde, het nut van deze dissectie methode te beoordelen, vergeleken we de mRNA expressie niveau van de gehele hippocampus met die van dentate gyrus. Hele hippocampus en dentate gyrus afkomstig van wild-type (n's = 9 en 4, respectievelijk) en alfa-CaMKII + / - muizen (n's = 18 en 4, respectievelijk) werden verwerkt voor microarray analyse, en voor alle genen gescoord, de vouw- verandering werd berekend door de mutant waarde door de wild-type waarde. De resultaten gaven aan dat de veranderingen in mRNA expressie, in het bijzonder van de dentate gyrus-specifieke moleculen zoals DSP en TDO2, werden gedetecteerd met een tot 5-voudige toename van de gevoeligheid van dentate gyrus monsters in vergelijking met heel hippocampus monsters (tabel 1). We hebben eerder aangetoond dat alfa-CaMKII + / - muizen vertonen gedragingen die verband houden met de menselijke psychiatrische stoornissen, zoals werkgeheugen tekorten en een overdreven infradian ritme 1,5. Bovendien, morfologische en de elektrofysiologische eigenschappen van de dentate gyrus neuronen in mutante muizen zijn opvallend vergelijkbaar met die van onvolwassen dentate gyrus neuronen in de normale knaagdieren, wat aangeeft dat de neuronen in deze mutante muizen niet uitgroeien tot volgroeide 1. De onvolwassen dentate gyrus en de down-gereguleerde expressie van DSP en TDO2 mRNA in alpha-CaMKII + / - muizen zijn in overeenstemming met de bevinding dat DSP en TDO2 kan worden gebruikt als markers van volwassen granule cellen in de dentate gyrus (Ohira et al., niet gepubliceerd. gegevens).
Bij elkaar genomen, kan dit gemakkelijke en nauwkeurige dissectie techniek betrouwbaar kunnen worden gebruikt voor onderzoek gericht op de dentate gyrus. Dentate gyrus weefsel verkregen met behulp van deze methode is van toepassing op andere soorten analyses ook, met inbegrip proteomische en celbiologie analyses.

Figuur 1. Verificatie van het geïsoleerde dentate gyrus door histologische studie. Een coronale deel van de hersenen na het isoleren van dentate gyrus was verwerkt voor Nissl vlekken (linker paneel), en een schematisch diagram aangepast van de hersenen van muizen atlas6 vertegenwoordigt de ongeveer hetzelfde niveau van de sectie getoond in het linker paneel (rechter paneel). Pijlen geven de richting van de naald-tip inbrengen. Schaal bar, 1 mm.

Figuur 2. Verificatie van het geïsoleerde dentate gyrus door real-time PCR. De dentate gyrus en de Ammon s hoorn afkomstig van vier wild-type muizen werden verwerkt voor real-time PCR van beta-actine, TDO2, DSP, Mrg1b en Tyro3. De resultaten worden gepresenteerd als gemiddelden ± SEM. Voor statistische analyse, was Student t test s in dienst, en p-waarden worden gevolgd: beta-actine, p = 0,11; TDO2, p = 0,000023 (** 1), DSP, p = 0.0000030 (** 2); Mrg1b, p = 0.000080 (** 3), en Tyro3, p = 0,00017 (** 4).
Tabel 1. . Microarray analyse van de gehele hippocampus en de dentate gyrus genen differentieel tot expressie in de dentate gyrus en hele hippocampus van alfa-CaMKII + / - muizen werden bepaald door het berekenen van de fold-change van die gedetecteerd in wild-type muizen. De gegevens werden geanalyseerd voor statistische significantie met behulp van de Student T-test tussen de wild-type en de alpha-CaMKII + / - muizen. Onder de genen waarvan de expressie tentoongesteld p <0,05 inde dentate gyrus van alfa-CaMKII + / - muizen vergeleken met die van wild-type muizen, zijn de top 50 genen vermeld. Merk op dat de aantallen monsters voor dentate gyrus zijn veel minder zijn dan die voor hele hippocampus. AffyID, Affymetrix sonde identifier, CKII, alpha-CaMKII + / - muizen, WT, wild-type muizen.
| Dentate gyrus (p <0,05) WT: n = 4, CKII + / -: n = 4 | Hele hippocampus WT: n = 9, CKII + / -: n = 18 | |||||||
| Gen titel | Genenbank | AffyID | Voudige verandering | p-waarde | Voudige verandering | p-waarde | ||
| desmoplakin | AV297961 | 1435494_s_at | 0,011018913 | 7.02694E-06 | 0,037021003 | 1.86126E-13 | ||
| desmoplakin | AV297961 | 1435493_at | 0,014369734 | 7.86747E-06 | 0.04232106 | 1.00579E-12 | ||
| tryptofaan 2,3-dioxygenase | AI098840 | 1419093_at | 0,020986484 | 5.23546E-09 | 0,101037776 | 4.14823E-13 | ||
| nephronectin | AA223007 | 1452106_at | 0,075479901 | 1.05191E-08 | 0,234001154 | 1.66301E-15 | ||
| nephronectin | AA223007 | 1452107_s_at | 0,079457767 | 1.40433E-07 | 0,177974715 | 3.9758E-12 | ||
| thyrotropine releasing hormoon receptor | M59811 | 1449571_at | 0,103105815 | 0,003093796 | 0,801412732 | 0,283994361 | ||
| ryanodine receptor 1, skeletspieren | X83932 | 1427306_at | 0,104825517 | 3.38513E-07 | 0,650685017 | 0,000308462 | ||
| agnostisch helix-lus-helix een | NM_010916 | 1419533_at | 9.431896 | 6.7979E-06 | 4,078815314 | 5.27E-11 | ||
| Copine familielid IX | BB274531 | 1454653_at | 9.159157 | 7.99492E-06 | 1,797304153 | 0,000296375 | ||
| doublecortin-like kinase 3 | BB326709 | 1436532_at | 0,109336662 | 1.95278E-07 | 0.56697229 | 2.62633E-08 | ||
| calpaïne 3 | AF127766 | 1426043_a_at | 0,111269769 | 8.07053E-06 | 0,370956608 | 2.04421E-14 | ||
| Volwassen mannelijke corpus striatum cDNA, RIKEN full-length verrijkt bibliotheek, kloon: C030023B07 product: niet te classificeren, vol te voegen volgorde | BB357628 | 1460043_at | 0,118712341 | 6.16926E-07 | 0,682339204 | 2.33001E-06 | ||
| collageen en calcium-bindende EGF domeinen een | AV264768 | 1437385_at | 0,124043978 | 3.65669E-05 | 0,488394112 | 4.05538E-06 | ||
| amyloid beta (A4) precursor eiwit-binding, familie A, lid 2 bindend eiwit | AK013520 | 1431946_a_at | 7.7986307 | 1.2098E-06 | 2,099164713 | 1.67047E-06 | ||
| calbindin-28K | BB177770 | 1456934_at | 0,130255444 | 3.32186E-06 | 0,572605751 | 1.99157E-10 | ||
| Getranscribeerd locus | AV328597 | 1443322_at | 0,133290835 | 5.43583E-06 | 0,562767164 | 7.56544E-06 | ||
| neuropeptide Y-receptor Y2 | NM_008731 | 1417489_at | 0,135319609 | 0,000113407 | 0,781498474 | 0.00394504 | ||
| ras responsief element bindend eiwit een | BE197381 | 1428657_at | 0,138235114 | 7.93691E-07 | 0,651220705 | 2.94209E-05 | ||
| gliale cellijn afgeleide neurotrofe factor familie receptor alpha 2 | BB284482 | 1433716_x_at | 0,139062563 | 2.35371E-06 | 0,669544709 | 0,000214146 | ||
| preproenkephalin een | M13227 | 1427038_at | 6.9850435 | 2.39074E-08 | 1,766018828 | 0,000250501 | ||
| RIKEN cDNA 1810010H24 gen | BI729991 | 1428809_at | 6.8658915 | 1.88516E-05 | 2.77573142 | 6.81865E-09 | ||
| ryanodine receptor 1, skeletspieren | BG793713 | 1457347_at | 0,151364292 | 3.35612E-05 | 0,503144617 | 4.32907E-05 | ||
| protocadherine 21 | NM_130878 | 1418304_at | 0,152671849 | 8.57783E-06 | 0,670714726 | 1.56309E-05 | ||
| cornichon homoloog 3 (Drosophila) | NM_028408 | 1419517_at | 0,153724144 | 8.90755E-06 | 0.95780695 | 0,661055608 | ||
| zelfmoord, BCL2 interagerende proteïne (bevat alleen BH3 domein) | BQ175572 | 1439854_at | 0,154284407 | 2.0118E-05 | 0.56516812 | 4.86925E-09 | ||
| koolhydraten (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferaseactiviteit 9 | AK017407 | 1431897_at | 0,155238951 | 5.37423E-06 | 1.14910007 | 0,215637733 | ||
| calpaïne 3 | AI323605 | 1433681_x_at | 0,160871988 | 1.07655E-05 | 0,477164757 | 1.33753E-11 | ||
| zinkvinger, CCHC domein met 5 | BQ126004 | 1437355_at | 0,161812078 | 3.08262E-06 | 0,421252632 | 0.01152969 | ||
| loricrin | NM_008508 | 1448745_s_at | 0,165129967 | 1.86362E-05 | 0,639733409 | 0,000729772 | ||
| spondin 1, (f-spondin) extracellulaire matrix eiwit | BC020531 | 1451342_at | 0,168035879 | 6.67867E-07 | 0,821042412 | 0,023650765 | ||
| RIKEN cDNA A930035E12 gen | AV348640 | 1429906_at | 5.9086795 | 1.747E-07 | 1,470383201 | 0,104085454 | ||
| BB247294 RIKEN full-length verrijkt, 7 dagen neonaat cerebellum Mus musculus cDNA-kloon A730018G18 3 ', mRNA-sequentie. | BB247294 | 1447907_x_at | 5.9047494 | 1.04931E-05 | 1,968147585 | 0.00010636 | ||
| FERM domein met 3 | BB099015 | 1437075_at | 5.860216 | 0,000345581 | 2,780297178 | 1.83072E-06 | ||
| NM_016789 | 1420720_at | 5.7568517 | 1.34227E-06 | 2,652516957 | 0,000206279 | |||
| Getranscribeerd sequenties | BG076361 | 1460101_at | 5.657735 | 2.5015E-06 | 1,296248831 | 0.22870031 | ||
| spondin 1, (f-spondin) extracellulaire matrix eiwit | BC020531 | 1424415_s_at | 0.17783576 | 1.01658E-06 | 0,836181248 | 0,001380141 | ||
| calbindin-28K | BB246032 | 1448738_at | 0,180317904 | 1.35961E-05 | 0,647334052 | 4.12268E-09 | ||
| Marcks-achtige 1 | AV110584 | 1437226_x_at | 0,186235935 | 1.47067E-06 | 0,499291387 | 2.34984E-08 | ||
| matrilin 2 | BB338441 | 1455978_a_at | 0,187783528 | 6.19122E-05 | 0.8967688 | 0,282337853 | ||
| matrilin 2 | BC005429 | 1419442_at | 0,188195795 | 0,000105295 | 0,915528892 | 0.35282097 | ||
| spondin 1, (f-spondin) extracellulaire matrix eiwit | BQ175871 | 1442613_at | 0,189956563 | 9.41195E-06 | 0,861033222 | 0.1394266 | ||
| arrestine 3, retinale | NM_133205 | 1450329_a_at | 5.2130346 | 2.90599E-05 | 3,944218329 | 1.07437E-07 | ||
| RIKEN cDNA A330050F15 gen | AV325555 | 1457558_at | 0.19186781 | 0,000119342 | 0,660282035 | 2.47342E-05 | ||
| contactin 3 | BB559510 | 1438628_x_at | 0,194404608 | 4.08641E-07 | 0,918742591 | 0,022545297 | ||
| calbindin-28K | BB246032 | 1417504_at | 0,196381321 | 2.24182E-05 | 0,619305124 | 3.6222E-06 | ||
| gastrine releasing peptide | BC024515 | 1424525_at | 4.9436426 | 3.00588E-05 | 2,752845903 | 5.72954E-07 | ||
| sortilin-gerelateerde VPS10 domein-bevattende receptor 3 | AK018111 | 1425111_at | 4.885766 | 1.03645E-05 | 1.29051599 | 0,029733649 | ||
| dopamine receptor D1A | BE957273 | 1455629_at | 4.869493 | 3.77525E-05 | 1,815881979 | 0,000516498 | ||
| proproteïne convertase subtilisine / kexin type 5 | BB241731 | 1437339_s_at | 0,210528027 | 7.83039E-05 | 0,574126078 | 9.15496E-05 | ||
| interleukine-1 receptor, type I | NM_008362 | 1448950_at | 0,210572243 | 9.64524E-06 | 0,241135352 | 2.79816E-08 | ||
Dieren experimenten werden uitgevoerd in overeenstemming met de National Institute of Health Guide voor Zorg en gebruik van proefdieren, en goedgekeurd door het dier zorg en het gebruik comite op Fujita Health University.
Wij danken dr. Yoko Nabeshima aan de Universiteit van Kyoto voor haar instructie over de dissectie techniek en mevrouw Aki Miyakawa aan Fujita Health Universiteit voor haar steun aan film. Dit werk werd ondersteund door het Programma voor de bevordering van de fundamentele Studies in Health Sciences van het Nationaal Instituut voor Biomedische Innovatie, een Grant-in-Steun voor Wetenschappelijk Onderzoek op prioritaire gebieden-Integratieve Brain Research (shien) - van MEXT in Japan, en door een Grant-in-Aid van CREST van de Japan Science and Technology Agency.
1
ReplyPosted by: AnonymousJanuary 27, 2010, 10:39 AM