İnsan Kortikal Doku Aβ multimerlerin SDS-PAGE/Immunoblot Algılama Antijen-epitop Alma kullanarak homojenatlarında

Bölüm 1: açıklık doku homojenatlarında Hazırlık

1. Yaklaşık 30 bile havaneli şart vuruş ile (yani ekle 400μl tampon - buz gibi soğuk tampon (artı 2x proteaz inhibitörü kokteyl [Santa Cruz] 0.1M fosfat tamponlu tuzlu [ve Mg + +-serbest Ca + +]) 4 kez hacmi Sabitlenmemiş kortikal doku homojenize Dounce 100 mg doku).
2. 3.000 az 5 dakika Spin homojenatlarında g (4 ° C). Dikkatle -80 açıklık süpernatantlar ve bu özler mağaza alikotları kaldırmak ° C kullanana kadar.
3. Üreticinin talimatlarına (ThermoFisher) göre, bir bicinchoninic asit (BCA) deneyi ile açıklık homojenatlarında total protein konsantrasyonu (mg / ml) belirleyin.

Bölüm 2: SDS-PAGE ile örnek hazırlama

1. Iyi bir 10 ile,% 10-20 Tricine jel (Invitrogen), yanı başına yüklenecek maksimum ses ~ 25μl. Toplam hacmi 2x SDS numune tamponu ve 10x indirgen, yanı başına yüklenecek açıklık Homojenat maksimum ses 10μl. % 20 (w / v) Sade kortikal homojenatlarında 50μg total protein için de izin veren, total protein konsantrasyonu 5 mg / ml 'den büyük olması gerekir. Daha az protein 5mg/ml numuneler başına daha az total protein yüklenmesi gerektirecektir. Ancak, yüksek protein düzeyleri monomerik ve toplu Aβ tespiti için en uygun (50 60μg total protein, optimum).
   Her zaman ortalama toplam protein aynı miktarda yük.
2. Her jel için, SeeBlue Plus2 (Invitrogen) gibi bir moleküler ağırlık marker 10μl ile en az bir yük. Pozitif kontrol olarak, sentetik Aβ40 veya başka bir kuyuda Aβ42 peptid (1xPBS içinde seyreltilmiş) 10-100ng çalıştırın.
3. Taze çözülmüş, açıklık homojenatlarında kullanarak, buz üzerinde reaksiyon karışımları hazırlayın. Vorteks tüpleri, 5-10 saniye için 100 kuru bir banyo ısı ° C, 5 dakika sonra, hızlı bir şekilde kapağı yoğunlaşma kaldırmak için tüm örnekler dönerler.

Bölüm 3: SDS-PAGE Jel elektroforezi

1. Tricine SDS çalışan tampon kullanarak, üreticinin talimatlarına (Invitrogen) göre,% 10-20 Tricine jel üzerine XCell Sure Lock Mini-Cell Gelbox vortekslenmiş numuneleri yükleyin
2. Yaklaşık 90 dakika boyunca sabit bir gerilim 125V jel çalıştırın. 4KDa marker bant jel alttan 1 cm kadar numunelerinin çalışılabilmesi edelim.

Bölüm 4: Jeller gelen Membranlar aktarma Proteinler

1. Dikkatlice plastik kasa (Invitrogen) üreticinin talimatlarına göre, jeller kaldırmak ve XCell II Blot Modülü içinde transfer sandviç montajı. Pre-Tris-Glycine transfer tampon (% 20 metanol) ile pedleri ve 0.2μm nitroselüloz membranlar ıslak kurutma ve blot pabuçları veya filtre kağıdı / membran sandviç herhangi bir kabarcıkları.
2. XCell Gelbox, transfer tamponu ile iç odanın doldurun ve dih ₂ O (metanol maruz zamanla plastik gelbox yıpratmak) dış kamara doldurun.
3. 2-3 saat boyunca sabit bir 25mA amperajda transfer çalıştırın.
4. Transfer tamamlandığında, sandviç yapısızlaÅŸtırabileceÄŸimizi ve dih ₂ O ve membranlar içine jeller kare plastik petri kaplarına 1xPBS (veya baÅŸka uygun bir kap) içine yerleÅŸtirin.
5. Protein transfer verimliliği görselleştirmek için, jeller Sadece Mavi SafeStain (Invitrogen) ile boyanmış olabilir, Ponceau G Kırmızı leke (Sigma Aldrich) membranlar, hem üreticinin talimatlarına göre. Bu boyama immunoblotting engel olmaz. Boyama yetersiz protein transferi ortaya çıkarsa, Adım 3 transfer süresi değiştirin.

Bölüm 5. Antijen-epitop alma ve İmmünoblotting

1. Antijen alma antikor bağlanma membran Aβ epitoplar immunoblotting sırasında ortaya çıkarmada önemli bir adımdır. Herhangi bir vapur, mikrodalga fırın, su banyosu, tutar sabit bir sıcaklık 100 ° C yeterli olacaktır. Bir vapur antijen alımı için, oda sıcaklığında, 1xPBS dolu bir ağır Kapak plastik poşet membran ısı mühür. Sat, önceden ısıtılmış bir vapur düz kese kese genişletmek için ek bir 15 dakika boyunca inkübe başladıktan sonra. Membran aşırı kırışıklıklar önlemek için, poşetten çıkarmadan önce yavaş yavaş soğutmak için izin verin.
2. Oda sıcaklığında, membran dikkatle buharda poşetten çıkarın ve 5 dakika 5 dakika (% 0.05 Tween-20 ile Tuzlu, pH 8.0 Tris-Tamponlanmış TBS-T durulama ardından 1xPBS membran, durulama [Sigma] ), yörüngesel bir çalkalayıcı. Titreme, bir saat süreyle bloke çözüm membranı (% 2,5 yağsız süt TBS-T) inkübe edin. Durulama olmadan, (6E10) 1:1,000 [1μg/ml] 1:5,000 [0.2μg/ml] seyreltme Covance, kaçınarak kabarcık engelleme çözümü seyreltilmiş primer antikor içeren bir tabak veya plastik poşet membran transferis Için oda sıcaklığında bir orbital çalkalayıcı 4 sallayarak ° C (uzun inkübasyon daha iyi bir sinyal verebilir) bir saat sonra 24-48 saat inkübe
3. TBS-T 30 dakika membran durulayın (tek bir hızlı 3 x 10 dakika çalkalama takip durulama).
4. 90 dakika oda sıcaklığında çalkalayıcı engelleme çözümü 1:10,000 seyreltilmiş HRP-konjuge sekonder antikor membran (Amersham ECL koyun anti-fare, GE Healthcare), inkübe edin.
5. TBS-T 30 dakika membran durulayın (tek bir hızlı 3 x 10 dakika çalkalama takip durulama).
6. Shaker, plastik levha koruyucuları arasındaki, havsız filtre kağıdı üzerinde aşırı reaktif kurulayın ve membran bir film kaset yerleştirmek, 5 dakika boyunca taze SuperSignal West Pico Electrochemiluminescence reaktifi (ThermoFisher) membran kuluçkaya yatmaktadır. Tozsuz Kimwipes gerekirse ek SuperSignal reaktif kurutun.
7. 30 dakika 30 saniye aralıklarla Kodak Biomax MR film ortaya çıkarmak ve bir film geliştirici gelişir. 5 dakika sonra, Aβ monomer bantları muhtemelen doymuş olacaktır.
8. Membranlar Geri Yükleme sallayarak Plus oda sıcaklığında 30 dakika boyunca tampon sıyırma ve istenirse ek antikorlar ile reprobed (TBS-T durulandıktan sonra) elimden olabilir.

Bölüm 6: Temsilcisi immüno:

7 insan denekler 50μg total protein içeren Şekil 1a-c. Aydınlatılmış homojenatlarında multimer Aβ ve APP varlığı için incelenir. Antikor 6E10 İmmünoblotting Aβ monomerlerin, dimerleri, trimerler, tetramers ve tüm Alzheimer durumlarda APP (üst bant) yanı sıra 2 AD durumlarda bol miktarda yüksek molekül ağırlığı Aβ multimerleri ortaya koymaktadır. Sentetik Aβ40 düşük molekül ağırlıklı bantları kimliğini onaylar. AD: Alzheimer hastalığı, LCD'de: demansı olmayan insan (a) 30 dakikalık film pozlama, (b) 5 dakikalık bir film maruz kalma, (c) 30 saniyelik film maruz kalma: Lewy Bodies, ND ile Demans .

Alzheimer hastalığı ^1,4,5 patogenezinde Aβ agregasyonunun önemine raÄŸmen, az sayıda çalışma açıklanan veya insan kortikal doku örnekleri ² farklı Aβ multimerlerin sayısal dağılımı var. Yaygın olarak kullanılan immünohistokimyasal teknikler sabit kortikal doku, farklı multimer Aβ türlerin ayrımcılığa izin vermez. SabitlenmemiÅŸ kortikal doku homojenatlarında, Aβ multimerleri ayrılmış ve biyokimyasal jel elektroforezi ve antikor tabanlı algılama yöntemleri kullanılarak deÄŸerlendirildi. Ancak, algılama ve toplu Aβ doÄŸru kantifikasyon önlenmesi hedeflenmektedir Aβ epitoplar toplanmış ve post-translationally peptit yapılarının içinde gizli olabilir. SDS-PAGE ve Aβ ^6,7 N-terminal bölgesi için bir antikor ile immunoblotting ile birlikte ısı kaynaklı antijen-epitop alma kullanarak, ayrı ve doÄŸal olarak oluÅŸan insan beyni izole Aβ multimerleri tespit etmek mümkün . Farklı Aβ multimer nüfus açıklık doku homojenatlarında sonra dansitometrisi tarafından belirlenebilir. Ayrıca, jel veya membran-çıkarma kombinasyonu doÄŸal olarak ortaya çıkan diÄŸer yapısal karakterizasyonu için immunoblotting Aβ saÄŸlayacaktır, post-translationally Aβ multimerleri insan dokusunun deÄŸiÅŸtirilmiÅŸ. Bu insan beyninin Aβ multimerleri SDS dayanıklı, ya da SDS-duyarlıdır ve bu nedenle tanımlanmış koÅŸullar altında SDS denatürasyon küçük agrega ayrılmış olmadığını belirlemek için önemli olacaktır. Insan beyninde toplanan Aβ farklı formları karakterizasyonu, Alzheimer hastalığı için tedavi ve biyobelirteçler için arama kolaylaÅŸtıracaktır.