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Department of Biology, University of Texas at Arlington
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Chaudhuri, J., Parihar, M., Pires-daSilva, A. An Introduction to Worm Lab: from Culturing Worms to Mutagenesis. J. Vis. Exp. (47), e2293, doi:10.3791/2293 (2011).
这个协议描述的程序,以保持线虫在实验室,以及如何mutagenize他们使用两种可供选择的的方法:甲基磺酸乙酯(EMS)和4,5“,8 trimethylpsoralen结合紫外线(TMP /紫外线)。线虫是因为其简单的身体计划和交配系统,这是自我施肥雌雄同体和男性可以产生数以百计的每动物后代组成强大的生物遗传学的研究系统。线虫是保持中含有的细菌草坪的琼脂板,可以很容易地从一个板块转移到另一台使用一挑。 EMS是常用的一种烷化剂诱发点突变和小缺失,而TMP /紫外线主要是诱导删除。根据正在使用的线虫的物种,环境管理体系和TMP的含量进行优化。为了隔离隐性突变线虫Pristionchus pacificus,F2代的动物视觉筛选表型。为了说明这些方法,我们诱变蠕虫和不协调(UNC),矮胖(DPY)和变压器(TRA)突变体。
第1部分:准备线虫的生长介质(NGM)的Petri板
实验线虫, 如线虫和 P. pacificus通常在6厘米的Petri板含有线虫的生长介质(NGM)1实验室培养。蠕虫是保持在20 ° C,但可以根据线虫的物种和实验设计,在一定温度范围内(4 ° C - 25 ° C之间)孵育。为了准备与NGM板,标准的无菌技术已被用来防止真菌和细菌的污染。以下是协议准备NGM板:
第2部分:准备OP50细菌和播种NGM的Petri板
P. pacificus是在实验室培养大肠杆菌 OP50应变喂养。 OP50上NGM板的有限增长,从而形成一个薄的草坪,方便的可视化的蠕虫1。要成长的OP50文化,使用LB -肉汤:
第3部分:一挑
在本节中,我们介绍了如何挑一个蠕虫。挑用于蠕虫从一个位置转移到另一个。挑30计90%的铂金10%铱丝,虽然一些研究人员可能更喜欢稍有不同的金属成分:
第4部分:采摘蠕虫
第5部分:EMS诱变
乙基甲烷磺酸盐(EMS)诱导突变在基因组中的2的广谱。突变体可以识别的缺陷,如产蛋,肌肉缺损S,性别决定的dauer形成,行为,和性腺形成。为EMS诱变的协议是类似的 C描述线虫 1。
第6部分:补骨脂素诱变
在本节中,我们描述了长波长紫外线(UV)一起使用TMP的突变过程。 TMP /紫外线诱变的方法被广泛用于诱导缺失突变在基因组 3 。
第7部分:代表结果
一些在体育pacificus(可以通过EMS或TMP /紫外线)诱变产生的突变表型,如图1所示。每个突变体具有特征性的的表型,野生型动物,很容易分辨。从蠕虫被处理的诱变剂,30 J3/J4从亲代(P0)的幼虫被放置在单独的板块,并让其产卵,这是F1代。从板块表现出健康的F1子代,共1000 F1S被转移到个别板块和F2代表型的筛选。矮胖5,6,不协调6和变压器7表型的动物被发现。

图1。Pristionchus pacificus野生型和突变型的动物。 A. WT雌雄同体B. WT男三DPY突变D。 UNC突变E. TRA突变。前两名面板显示野生型雌雄同体(左)和男(右)的动物,在余下的面板不同的突变体进行比较。
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突变是一个广泛采用的技术,在各种实验模式生物基因研究。通常用于突变实验,以确定一个基因的2的功能。这里所描述的突变程序可以使用,不仅为体育pacificus,但也为C。线虫和其他相关线虫物种。在这里,我们介绍两种方法,环境管理体系和TMP /紫外线诱变。
EMS是一种化学物质,诱导点突变或整个基因组的3,8小缺失。补骨脂突变(TMP / UV)主要诱发原因可能断裂,在紫外线照射下引起的DNA缺失突变。删除片段通常在长度为3 kb的范围为0.10至15。
我们筛选的表型是比较常见的找到。在屏幕使用EMS F2动物每400板块,一个板块一个DPY,UNC或茶。 DPY可确认其异常运动和茶,有一个男的表型和XX染色体核型7 短尺寸7日,联合国军司令部。 TMP /紫外线诱变的产生与环境管理体系 3相比,突变体的频率较低,但它会产生更大的缺失。
线虫,第四阶段后期幼虫或年轻成人是最有效的的发展阶段,因为他们有生殖线核的最大数量进行诱变。因此,它是有用的,开始第四阶段的幼虫许多家长人口与同步的实验。一个简单的方法是同步文化与鸡蛋,而不是成虫新的文化。在下面的一代,大多数蠕虫将大约在同一时代。隐性突变,可以检测到通过检查F1个人,这将产生约百分之二十五个纯合子的后代。
可进一步利用线虫的基因屏幕上的权力,通过修改设计的屏幕9。雌雄同体的生活方式和快速生成时间相结合,使线虫的遗传学研究的理想之选。
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没有利益冲突的声明。
这项工作已经由美国国家科学基金会资助的IOB#0615996。
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ReplyPosted by: Sonu KumarJune 29, 2011, 6:03 AM