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1Department of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of Medicine, University of Calgary, 2Faculty of Kinesiology, University of Calgary
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Hughey, C. C., Hittel, D. S., Johnsen, V. L., Shearer, J. Respirometric Oxidative Phosphorylation Assessment in Saponin-permeabilized Cardiac Fibers. J. Vis. Exp. (48), e2431, doi:10.3791/2431 (2011).
Enquête sur la fonction mitochondriale représente un paramètre important de la physiologie cardiaque que les mitochondries sont impliquées dans le métabolisme énergétique, le stress oxydatif, l'apoptose, le vieillissement, encéphalomyopathies mitochondriale et la toxicité des médicaments. Dans ce contexte, les technologies pour mesurer la fonction mitochondriale cardiaques sont en demande. Une technique qui emploie une approche intégrative pour mesurer la fonction mitochondriale est respirométriques phosphorylation oxydative (OXPHOS) analyse.
Le principe de l'évaluation OXPHOS respirométriques est centrée autour de la mesure de la concentration en oxygène en utilisant une électrode de Clark. Comme le faisceau de fibres perméabilisées consomme l'oxygène concentration en oxygène, dans les baisses de chambre fermée. En utilisant des protocoles de titration sélectionnée substrat-inhibiteur découplant, les électrons sont fournis à des sites spécifiques de la chaîne de transport d'électrons, ce qui permet l'évaluation de la fonction mitochondriale. Avant l'analyse respirométriques de la fonction mitochondriale, mécaniques et chimiques des techniques de préparation sont utilisées pour perméabiliser le sarcolemme des fibres musculaires. Perméabilisation chimique emploie saponine de façon sélective perforer la membrane cellulaire tout en conservant l'architecture cellulaire.
Ce document décrit en détail les étapes impliquées dans la préparation de saponine peau fibres cardiaques pour mesurer la consommation d'oxygène afin d'évaluer OXPHOS mitochondriale. De plus, le dépannage des conseils ainsi que des substrats spécifiques, les inhibiteurs et découpleurs qui peuvent être utilisées pour déterminer la fonction des mitochondries dans des sites spécifiques de la chaîne de transport d'électrons sont fournis. Fait important, le protocole décrit peut être facilement appliquée à des tissus cardiaques et squelettiques de divers modèles animaux et des échantillons humains.
1. Préparation des réactifs
2. Préparation des tissus
A. Cardiac fibres préparation mécanique
B. cardiaque préparation chimique des faisceaux de fibres
C. Lavage faisceau de fibres cardiaques
D. Détermination du poids humide
3. Respirométriques Analyse OXPHOS
A. Équipement respirométriques
B. Qualité Représentant validation Control Protocol / Technique
4. Les résultats représentatifs:
La consommation d'oxygène au bien préparé murin fibres cardiaques est évalué par le protocole de contrôle de la qualité comme le montre la figure 2. Figures 3-5 fournissent des exemples fréquemment rencontrés des mal préparés fibres cardiaques. Le ratio de contrôle respiratoire (RCR), représente un indice important dans respirométrie. Ce paramètre indique le couplage entre la consommation d'oxygène et la phosphorylation oxydative. Dans les préparations de fibres perméabilisées, le RCR est le taux de respiration en état 3 par rapport à l'état 2 ou bien l'état 3 sur l'état 4 (induite par oligomycine et / ou atractyloside, ATR). Par ailleurs, le RCR peut être utilisé comme un marqueur de l'assurance qualité et peuvent identifier les changements dans le couplage résultant des interventions expérimentales ou pathologiques 5. Eh bien couplé perméabilisées murin préparations cardiaques donnent un RCR entre 3-6 en fonction de la solution d'incubation utilisé 1, 8, 9.
Le titrage du cytochrome c est utilisé comme une validation de la préparation des tissus appropriés. Cytochrome c est une protéine située dans l'espace intermembranaire à la membrane mitochondriale interne 10. Lorsque la membrane externe des mitochondries est intacte, le cytochrome c endogènes reste dans l'espace intermembranaire et la titration de la cytochrome c exogènes a un effet négligeable sur la respiration (figure 2). Si la membrane externe des mitochondries est endommagé, le cytochrome c endogènes peut être libéré de l'espace intermembranaire et inhiber la respiration jusqu'à ce exogènes cytochromeOutre C (figure 3). Bonne préparation devrait connaître qu'une légère élévation de flux d'oxygène suivantes cytochrome c plus dans la gamme 5-15% 5. De plus, ce titrage expérimental permet pour l'évaluation de l'influence du stress pathologique ou expérimentale sur la membrane mitochondriale externe intact. Si un effet de cytochrome c est expérimenté, assurer des soins lors de la préparation mécanique du tissu et / ou réduire la concentration de la saponine.
L'ajout de oligomycine et / ou ATR est utilisé pour évaluer des altérations de la respiration de fuite; consommation d'oxygène ne contribuent pas à la phosphorylation de l'ADP 11. De plus, cette étape de titration peut être utilisé comme une validation de la préparation des échantillons appropriés. Fibres de commande ou de type sauvage devraient être sensibles à cet ajout et de l'expérience d'une réduction significative des flux d'oxygène. Un RCR faible et une sensibilité réduite à oligomycine et / ou ATR entraînant un flux d'oxygène relativement élevé indique des dommages à la membrane mitochondriale interne lors de la préparation (figure 4). Les dommages sont vraisemblablement induites lors de la séparation mécanique des fibres cardiaques comme la membrane mitochondriale interne est moins sensible aux insultes par un parent saponine à la membrane mitochondriale externe. Cependant, tant pour la préparation mécanique et chimique peut être ajustée en conséquence pour éviter les mal préparés fibres cardiaques, 5, 12.
Les faisceaux de fibres saponine peau de souris ne devrait pas rester dans la solution RP depuis plus de 6h ou la solution MiR05 pendant plus de 2h. L'absence de réponse au substrat-inhibiteur découplant titrages comme on le voit dans la figure 5 peut être indicatif des périodes d'incubation prolongée. Les efforts ultérieurs devraient minimiser les périodes entre les sacrifices d'animaux et de mesures de consommation d'oxygène.

Figure 1. La préparation mécanique des faisceaux de fibres cardiaques murines. A. Le cœur entier de dissection qui suit immédiatement. B. Un échantillon de 10-25mg du ventricule antérieur gauche. C. cardiaque tissus séparés en 1mm de diamètre et des bandes de longueur 2-4mm. D. final des faisceaux de fibres cardiaques prêt pour perméabilisation chimique avec de la saponine.

Figure 2. Les résultats représentatifs de la préparation des tissus bon d'utiliser les évaluations polarographique. Le flux d'oxygène état 2 est soutenue par le glutamate, je substrats complexes et malate (M / G) et est significativement stimulée après l'addition d'ADP (état 3). Aucun effet stimulateur de la cytochrome c exogènes outre indique la membrane mitochondriale externe est intacte. Sensibilité de la consommation d'oxygène pour oligomycine suggère l'intégrité membrane interne mitochondriale est intacte. La concentration d'oxygène dans une chambre de 2 ml fermé est identifié par la ligne bleue. La consommation d'oxygène de l'échantillon de tissu cardiaque dans une chambre de 2 ml fermé est représenté par la ligne rouge. Malate et du glutamate, M / G; l'adénosine diphosphate, l'ADP; cytochrome C, Cyto c; oligomycine, o.

Figure 3. Cytochrome c test de validation d'effet d'utiliser les évaluations polarographique. Le flux d'oxygène état 2 est soutenue par le glutamate, je substrats complexes et malate (M / G) et est significativement stimulée après l'addition d'ADP (état 3). Effet stimulateur de la cytochrome c exogènes outre indique l'intégrité membrane mitochondriale externe est compromise. La concentration d'oxygène dans une chambre de 2 ml fermé est identifié par la ligne bleue. La consommation d'oxygène de l'échantillon de tissu cardiaque dans une chambre de 2 ml fermé est représenté par la ligne rouge. Malate et du glutamate, M / G; l'adénosine diphosphate, l'ADP; cytochrome C, Cyto c.

Figure 4. Intérieure de test de validation de membrane mitochondriale utilisant l'évaluation de l'intégrité polarographique. Le flux d'oxygène état 2 est soutenue par le glutamate, je substrats complexes et malate (M / G) et une stimulation relativement faible de la consommation d'oxygène après l'addition d'ADP (état 3). Mauvaise sensibilité de la consommation d'oxygène pour oligomycine suggère la membrane mitochondriale interne est endommagée. La concentration d'oxygène dans une chambre de 2 ml fermé est identifié par la ligne bleue. La consommation d'oxygène de l'échantillon de tissu cardiaque dans une chambre de 2 ml fermé est représenté par la ligne rouge. Malate et du glutamate, M / G; l'adénosine diphosphate, ADP oligomycine, o.

Figure 5. Polarographique évaluation après une incubation prolongée dans MiR05. La consommation d'oxygène est insensible à l'addition exogène de glutamate et le malate (M / G) et la consommation d'oxygène après l'addition d'ADP (l'état 3) est réduit. Il n'ya pas d'effet stimulant exogène cytochrome c plus et l'insensibilité de la consommation d'oxygène pour oligomycine est expérimenté. Le manque de réponse à des ajouts à la solution d'incubation extramitochondriale suggère mitochondriale stabilité fonctionnelle est compromise. La concentration d'oxygène dans une chambre de 2 ml fermé est identifié par la ligne bleue. La consommation d'oxygène de l'échantillon de tissu cardiaque dans une chambre de 2 ml fermé est représenté par la ligne rouge. Malate et du glutamate, M / G; l'adénosine diphosphate, l'ADP; cytochrome C, Cyto c.
1. Notes: Préparation des réactifs
Préparation de K 2 Solution EGTA Stock 100 mM
| Nom du réactif | Concentration finale (mM) | g/100 ml H 2 O |
| L'éthylène glycol-bis-(2-aminoethylether) - N, N, N ', N'-tétraacétique (EGTA) | 100 | 3,805 |
| Hydroxyde de potassium (KOH) | 200 | 1,15 |
Note: Ajuster le pH à 7,4 à la température ambiante.
Préparation de Ca 2 Solution EGTA Stock 100 mM
| Nom du réactif | Concentration finale (mM) | g/100 ml H 2 O | Commentaires (optionnel) |
| L'éthylène glycol-bis-(2-aminoethylether) - N, N, N ', N'-tétraacétique (EGTA) | 100 | 3,805 | Chauffer à 80 ° C et remuer légèrement. |
| Carbonate de calcium (CaCO3) | 100 | 1,001 | La concentration en calcium doit être précise que le calcium régule la fonction des divers organites dont les mitochondries. Assurez solubilisation complète de tous les CaCO 3. La solution finale doit être totalement transparente. CaCO 3 est initialement mélangé à l'EGTA et de l'eau pour activer la formation d'acide carbonique et de CO 2 par évaporation. Cette réaction peut être accélérée par chauffage jusqu'à 80 ° C. |
| Hydroxyde de potassium (KOH) | 200 | 1,15 | Neutraliser avec du KOH après évaporation du CO 2 est terminé. |
Note: Ajuster le pH à 7,4 à la température ambiante.
Préparation de la solution de conservation et de relaxation (Solution RP) 1
| Réactifs | Concentration finale (mM) | Par litre | Commentaires |
| K 2 EGTA | 7,23 | 72,3 ml | |
| CaK 2 EGTA | 2,77 | 27,7 ml | |
| Imidazole | 20 | 1.36g | |
| Dithiothréitol | 0.5 | ||
| Taurine | 20 | 2.52g | |
| L'adénosine 5'-triphosphate hydrate de sel disodique (ATP) | 5.7 | 3.14g | |
| Phosphocréatine (PCr) | 14,3 | 4.0g | |
| Le chlorure de magnésium (MgCl 2) | 6,56 | 0.624g | |
| K-MES | 50 | 14.0g |
Note: Ajuster le pH à 7,1 à la température ambiante
Préparation de la solution respirométrie mitochondrial (MiR05 Solution) 2
| Réactifs | Concentration finale (mM) | Par litre | Commentaires (optionnel) |
| L'éthylène glycol-bis-(2-aminoethylether) - N, N, N ', N'-tétraacétique (EGTA) | 0.5 | 0.190g | Utilisé comme un chélateur du calcium |
| Hexahydrate de chlorure de magnésium (MgCl 2 .6 H 2 O) | 3.0 | 0.610g | La qualité de la préparation de fibres ne peut pas être testé sans Mg 2 +. |
| Taurine | 20,0 | 2.502g | La taurine est un stabilisateur de membrane et antioxydant. 20mm est la concentration intracellulaire présente dans le cœur. |
| Phosphate de potassium monobasique (KH 2 PO 4) | 10,0 | 1.361g | |
| 20,0 | 4.77g | ||
| Potassium-lactobionate | 60,0 | 120 ml de 0,5 M K-lactobionate Stock | 0,5 K-lactobionate Stock: Ajouter 35,83 g d'acide lactobionique à 100 mL H 2 O et le pH à 7,0 à la température ambiante. Réglez le volume à 200 ml avec ddH 2 O. Utilisé pour reproduire la haute concentration intracellulaire K +. Auparavant KCl a été utilisé, cependant, la haute-Cl inhibe la fonction mitochondriale de la créatine kinase. |
| Saccharose | 110,0 | 37.65g | Utilisé comme un charognard ROS. |
| Albumine sérique bovine (BSA) | 1g / L | 1g | Utilisé comme une membrane stabilisatrice, antioxydant et chélateur de calcium et des acides gras libres. |
Note: Ajuster le pH à 7,1 à 30 ° C
3. Notes: Analyse respirométriques OXPHOS
B. Substrats Select, découpleurs et les inhibiteurs
Liste des substrats sélectionnés pour l'analyse de respirométrie mitochondriale
| Substrat | [Stock] | Préparation | Volume par 2 ml | [Final] | Commentaires |
| L'adénosine 5'-diphosphate dihydraté sel monopotassique (ADP) | 500mm | 246mg / ml ddH 2 O. Ajuster le pH à 7,1 à la température ambiante. Conserver à -80 ° C dans 250 aliquotes. | 20ul | 5mM | Pour maintenir constante Mg 2 + + lors d'expériences de respirométrie ajouter 0,6 mole de MgCl 2 / mol d'ADP. |
| L'ascorbate | 800mm | 0.1584g / mL ddH 2 O. Conserver à -20 ° C en aliquots de 200 ul. Sensible à la lumière | 5 ul | 2mM | Agit comme substrat lorsqu'il est utilisé en parallèle avec TMPD. Doit corriger pour le flux d'oxygène pour l'auto-oxydation. |
| Cytochrome C | 4 mM | 50mg / ml ddH 2 O. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. | 5 ul | 10um | |
| Carbonyle du cyanure p-(trifluorométhoxy) phénylhydrazone (FCCP) | 0,1 mM | 0.254mg/10 ml de EtOH à 100%. Conserver dans des flacons en verre à -20 ° C en aliquotes de 500 uL. | Étapes de 1 pl | Agit comme un découplant. Détermine la capacité de transport maximale d'électrons et de toute limitation de transport des électrons par le système de phosphorylation. | |
| Le glutamate | 2M | 0.3742g / mL ddH 2 O. Ajuster le pH à 7,1 à la température ambiante. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. | 10ul | 10mM | Agit comme un substrat pour NADH déshydrogénase (complexe I). |
| Malate | 800mm | 0.1073g / mL ddH 2 O. Ajuster le pH à 7,1 à la température ambiante. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. | 5ul | 2mM | Agit comme un substrat pour NADH déshydrogénase (complexe I). Ne peut pas soutenir la respiration seul. |
| Pyruvate | 1M | 11mg/0.1 ml ddH 2 O. Préparer une solution fraîche. | 5 ul | 2,5 mM | Agit comme un substrat pour NADH déshydrogénase (complexe I). |
| Succinate | 1000mm | 1.3505g / 5 ml ddH 2 O. Ajuster le pH à 7,1 à la température ambiante. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. | 20ul | 10mM | Agit comme un substrat pour la succinate déshydrogénase (complexe II). |
| N, N, N ', N'-tétraméthyl- pphenylenediamine Dichlorhydrate (TMPD) | 200 mM | 47.1mg / mL ddH 2 O. Ajouter ascorbate 0,8 M à une concentration finale de 10 mM pour empêcher l'auto-oxydation Conserver à -20 ° C en aliquots de 200 ul. | 5 ul | 0,5 mM | L'auto-oxydation de la solution mère évidente par l'apparition d'une coloration bleue. Agit comme substrat lorsqu'il est utilisé en parallèle avec TMPD. Doit corriger pour le flux d'oxygène pour l'auto-oxydation. |
Liste des inhibiteurs sélectionnés pour l'analyse de respirométrie mitochondriale
| Substrat | [Stock] | Préparation | Volume par 2 ml de chambre | [Final] | Commentaires |
| Antimycine A | 5mM | 27.4mg/10 ml de EtOH à 100%. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. | 1 ul | 2.5μM | Inhibiteur de la coenzyme Q: cytochrome c oxydoréductase (complexe III) </ Td> |
| Atractyloside | 50mM | 40mg / ml ddH 2 O. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. | 30 uL | 0,75 | Inhibiteur de l'ATP synthase. |
| Oligomycine | 4mg / mL | 4mg / ml EtOH à 100%. Conserver à -20 ° C en aliquots de 200 ul. | 1 ul | Inhibiteur de l'ATP synthase. | |
| Le cyanure de potassium | 1M | 65.1mg / mL ddH 2 O. Préparer une solution fraîche. Ajuster le pH à 7,1 à la température ambiante | 1 ul | 1mM | Inhibiteur du cytochrome c oxydase (complexe IV). Utiliser TMPD suivantes et titrage ascorbate d'accéder à l'auto-oxydation. |
| La roténone | 0,1 mM | 0.39mg/10 ml de EtOH à 100%. Conserver à -20 ° C dans 250 aliquotes. Sensible à la lumière. | 1 ul | 0.05μM | Inhibiteur de NADH déshydrogénase (complexe I). Des concentrations plus élevées peuvent être nécessaires, cependant, de réduire la rétention de la roténone dans la chambre commence comme indiqué. |
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La technique de la saponine perméabilisées fibres cardiaques offre un compromis unique entre in vitro et in vivo l'évaluation de la consommation d'oxygène des mitochondries OXPHOS. Avantages de cette technique comprennent une augmentation pertinence physiologique par rapport aux mitochondries isolées de l'architecture cellulaire est préservée. Alors que la membrane plasmique est dégradé, les structures membranaires intracellulaires, y compris 12 des mitochondries, 14, 14 du réticulum sarcoplasmique, myofilaments et le cytosquelette 1, 17 demeurent intactes. Par ailleurs, les interactions entre les mitochondries et du cytosquelette 1, 17 sont également inchangées. Les mitochondries dans les fibres perméabilisées montrent une stabilité accrue. Préparations de fibres rongeurs peuvent être stockées dans les solutions de conservations glacée pour les échantillons de fibre de 6h et humaines montrent une grande stabilité pour un maximum de 18,2 24h. Équilibration expérience Mitochondries rapide avec la solution d'incubation. Cela permet un contrôle direct sur une analyse spécifique de la chaîne de transport des électrons en réponse à des substrats ajoutée, les inhibiteurs et découpleurs 1, 5. De plus, cette technique in situ nécessite seulement quelques milligrammes de tissu.
Limites de la technique de la fibre saponine peau ne peut être ignorée. Mitochondries cardiaques sont hétérogènes, composé de deux sous-populations;. Sarcolemme et interfibrillaires En respirométrie mitochondriale in situ évalue la population totale des mitochondries sans la capacité de distinguer entre les cinq sous-populations. En outre, les différents métabolites cellulaires et des facteurs cytosoliques réguler la fonction mitochondriale. Ces composants cytosoliques des fibres cardiaques sont perdues pendant le processus de perméabilisation résultant de l'impossibilité d'évaluer mitochondriale à l'exacte environnement in vivo 5.
Questions d'information sont une préoccupation importante. Mesures de consommation d'oxygène peuvent être exprimés par rapport au poids humide ou poids sec, cependant, la densité mitochondriale est un facteur majeur dans l'hétérogénéité du flux respiratoire lorsqu'il est exprimé par sept masse de tissu. Il est important de comprendre que l'interprétation des taux respiratoires et les changements sont grandement influencés par le choix d'un état de référence. Pour les comparaisons directes des résultats OXPHOS respirométriques en fibres perméabilisées, les taux doivent être exprimés par rapport à un repère de référence communs tels que l'ADN mitochondrial, l'activité de la citrate synthase, l'activité cytochrome c oxydase, et / ou le contenu cytochrome aa3 19.
En résumé, la préparation des fibres perméabilisées utilisé en conjonction avec l'analyse respirométrie permet l'évaluation de la fonction intégrative des mitochondries cardiaques. Divers états pathologiques et les modèles génétiques ont utilisé cette technique. Il s'agit notamment de l'évaluation de la toxicité médicamenteuse, le vieillissement, le diabète, insuffisance cardiaque congestive, une lésion ischémique et le stress oxydatif sur la physiologie mitochondriale 5, 20. Plusieurs excellentes critiques méthodologiques et des manuscrits de la technique de la fibre saponine perméabilisées et polarographique appréciation consommation d'oxygène ont été précédemment publiés 1, 5, 14, 20 et sont fortement recommandés.
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Aucun conflit d'intérêt déclaré.
Cette étude a été financée par les Instituts canadiens de recherche en santé et Génome Canada. JS détient bourses d'aide salariale de l'Alberta Heritage Foundation for Medical Research, Heart and Stroke Foundation du Canada et l'Association canadienne du diabète. Le laboratoire tient à souligner l'aide technique des instruments Oroboros lors de l'acquisition de la technique des fibres perméabilisées saponine.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 100% Ethanol | Fisher Scientific | HC600 | |
| 70% Ethanol | Fisher Scientific | HC-1000 | |
| Adenosine 5′-diphosphate monopotassium salt dihydrate (ADP) | Sigma-Aldrich | A5285 | |
| Albumin from bovine serum essentially fatty acid–free | Sigma-Aldrich | A-6003 | |
| Antimycin A | Sigma-Aldrich | A8674 | |
| Ascobic acid | Sigma-Aldrich | A4403 | |
| Adenosine 5′-triphosphate disodium salt hydrate (ATP) | Sigma-Aldrich | A2383 | |
| Atractyloside | Sigma-Aldrich | A6882 | |
| Calcium carbonate | Sigma-Aldrich | C4830 | |
| Carbonyl cyanide p-(trifluoromethoxy) phenylhydrazone (FCCP) | Sigma-Aldrich | C2920 | |
| Cytochrome c | Sigma-Aldrich | C7752 | |
| Digitonin | Sigma-Aldrich | D141 | |
| Dithiothreitol | Sigma-Aldrich | D9779 | |
| Ethylene glycol-bis-(2-amin–thylether)-N,N,N′,N′-tetraacetic acid (EGTA) | Sigma-Aldrich | E4378 | |
| Glutamic acid | Sigma-Aldrich | 27647 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H4034 | |
| Imidazole | Sigma-Aldrich | I5513 | |
| Ketamine | Pfizer Pharma GmbH | Ketaset | |
| Lactobionic acid | Sigma-Aldrich | 153516 | |
| Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich | M9272 | |
| Magnesium chloride hexahydrate (MgCl2∙6H2O) | Sigma-Aldrich | M9272 | |
| Malic acid | Sigma-Aldrich | M1000 | |
| MES | Sigma-Aldrich | M3671 | |
| N,N,N’,N’-Tetramethyl- pphenylenediamine Dihydrochloride (TMPD) | Sigma-Aldrich | T3134 | |
| Oligomycin | Sigma-Aldrich | O4876 | |
| Phosphocreatine | Sigma-Aldrich | P7936 | |
| Potassium Chloride | Sigma-Aldrich | P9541 | |
| Potassium Hydroxide | Sigma-Aldrich | P5958 | |
| Potassium cyanide | Fluka | 60178 | |
| Potassium phosphate monobasic | Sigma-Aldrich | P5655 | |
| Rotenone | Sigma-Aldrich | R8875 | |
| Saponin | Sigma-Aldrich | 47036 | |
| Sodium Pentobarbital | Ceva Sante Animale | 1715 138 | Conc. 54.7 mg/ml |
| Sodium pyruvate | Sigma-Aldrich | P2256 | |
| Succinic acid | Sigma-Aldrich | S3674 | |
| Sucrose | Sigma-Aldrich | S7903 | |
| Taurine | Sigma-Aldrich | T8691 | |
| Xylazine | Bayer AG | Rompun | |
| ddH2O | |||
| Ice | |||
| Oroboros Oxygraph-2k | Oroboros Instruments | ||
| Kimwipes | VWR international | 21905-026 | |
| 15ml polypropylene centrifuge tubes | VWR international | 89004-368 | |
| 50ml polypropylene centrifuge tubes | VWR international | 89004-364 | |
| Straight Jewelers Forceps | George Tiemann & Co. | 160-50B | |
| Curved Jewelers Forceps | George Tiemann & Co. | 160-57B | |
| Straight Surgery Scissors | George Tiemann & Co. | 105-402 | |
| Sterile Surgical Blade | VWR international | BD371610 | |
| 0.45-μm Syringe filters | VWR international | CA28145-485 | |
| pH meter | VWR international | CA11388-308 | |
| Glass Petri dishes | VWR international | 89000-300 | |
| 12-well Polystyrene Tissue Culture Plates | VWR international | 82050-926 | |
| Plate Stirrer | VWR international | 97042-594 | |
| Fisherbrand Microbars | Fisher Scientific | 14-511-67 | |
| Weigh Scale | VWR international | CA11278-162 | |
| 10μl Hamilton Micro Syringe | Fisher Scientific | 14-815-1 | |
| 25μl Hamilton Micro Syringe | Fisher Scientific | 14-824-7 | |
| 50μl Hamilton Micro Syringe | Fisher Scientific | 14-824-5 | |
| Nalgene Squeeze Bottles | Wilkem Scientific | LNA2407-1000 | |
| Polystyrene Weighing Dishes | VWR international | 89106-750 | |
| Dissecting Microscope | Olympus Corporation |