Usando a luciferase Infecções bacterianas Imagem em camundongos

1. Infecção pulmonar por entubação endotraqueal

1. Pesar ratos e, opcionalmente, as marcas podem ser feitas nas orelhas para fácil identificação.
2. Anestesiar os ratos com cetamina (100 mg por g de peso do mouse) e xilazina (10 mg por g de peso do rato) por inoculação intraperitoneal.
3. Camundongos lugar em gaiolas até totalmente anestesiado. Aperte as pontas dos seus pés para verificar pedal reflexo. Ratos deve exibir reduzida ou nenhuma reação reflexa.
4. Posicione o mouse sobre o suporte intubação deitado de costas.
5. Fix um elástico para ficar intubação e depois colocá-lo sob os incisivos superiores do mouse. Use fita adesiva para fixar as pernas e os braços no suporte intubação.
6. Suavemente move tougue da boca com a pinça.
7. Inserir espéculo com octoscope dentro da boca e orofaringe até olhar para a abertura da laringe é visível.
8. Fio guia coberto com antecedência cathether em traquéia até cateter hub está no incisivos. Remova o fio guia. Coloque o ar para dentro cathether para observar a expansão torácica e confirmar a intubação correta.
9. Injetar 50 mL de bactérias (nas imagens mostradas usamos bacilo Calmette Guerin (BCG) que expressa clique besouro vermelho luciferase (CBRLuc), construído no nosso laboratório, mas qualquer estirpe bacteriana luminescentes podem ser usados) solução através cathether usando uma seringa de 1 mL.
10. Lugar do mouse em uma gaiola e observá-lo durante a recuperação da anestesia.

2. Anestesiados animais e preparação para o Imaging Bioluminescência

Os ratos são anestesiados com isoflurano usando a XGI-8 Gas Sistema Aneshesia.

1. Antes de operar o XGI-8 sistema de anestesia, pesar cada canister filtro de carvão e escrever o peso ea data nele. Se o peso é 50 gramas mais do peso inicial, substituí-lo por uma lata nova.
2. Verifique o nível de isoflurano no vaporizador e preenchê-lo se necessário.
3. Ligue a bomba de evacuação em frente da XGI-8 sistema de anestesia e definir a 8 lpm (litros por minuite).
4. Ligue o fornecimento de oxigênio a partir do cilindro de alta pressão e defini-la a 55 psig.
5. Ligar o oxigênio de alternância (verde) na parte da frente do sistema de anestesia XGI-8.
6. Ligar o fluxo de gás para a câmara de imagem para definir o nível de fluxo de gás. Ajustado para 0,25 lpm e depois desligar o fluxo de gás.
7. Ligar o fluxo de gás para a câmara de indução da anestesia para definir o nível de fluxo de gás. Ajustado para 1,5 lpm e desligue o fluxo de gás.
8. Ligue o isoflurano com o vaporizador e definido para 2-2,5 por cento. O nível de isoflurano pode ser ajustada dependendo do número de animais a ser utilizado e peso.
9. Coloque os ratos dentro da câmara de indução e feche a tampa. Ligar o fluxo de gás para a câmara de indução. Camundongos lugar na câmara de 5-10 minuites até que sejam anestesiar completamente.
10. Aplicar pomada óptica para os olhos para proteger os olhos do mouse durante o exame e colocar os ratos na câmara de imagem em um dos cones do nariz no colector de anestesia. Use defletor de luz entre os ratos para evitar o reflexo da luz sobre assuntos adjacentes animais.
11. Injetar luciferina (150 mg / grama de peso corporal) por inoculação intraperitoneal.

3. Imagem bioluminescência

1. Inicie o software de imagem Living.
2. Se o sistema não é inicializado, inicializar o sistema de imagem IVIS.
3. Definir os parâmetros para geração de imagens, clicando em configuração seqüência em IVIS painel de controle de aquisição.
   Selecione luminescência e fotografar no modo de imagem. Se a opção de realizar DLIT reconstrução 3D é desejada, selecione fotográfico, luminescentes e estruturais imagens de luz como parte da seqüência de imagens.
   Definir o tempo de exposição de 0,5 seg a 10 minutos.
   Definir Binning e F / stop em função da luminosidade esperada da amostra.
   Conjunto de excitação do filtro para bloquear e emissão de filtro para abrir, a menos que pretende adquirir comprimentos de onda específicos apenas da luz. No caso de DLIT 3D constituição, definir filtros de emissão múltiplos comprimentos de onda diferentes para permitir a localização exata da fonte.
   Set FOV de A a D, dependendo do número de ratos ou região de origem animal a ser trabalhada. Selecione A e B para um mouse, C por 2-3 camundongos e ratos D por 4-5.
4. Clique em adicionar no Assistente de Imagem no Painel de Controle Aquisição de adicionar a configuração da seqüência.
5. Comece seqüência de imagens, clicando em adquirir.
   No caso de DLIT construção 3D, imagens luminescentes serão adquiridos para filtros de emissão múltiplos comprimentos de onda diferentes. Fotográficos e imagens de luz estruturada também será adquirido.
6. Durante a aquisição da imagem e editar painéis níveis imagem será visível. Preencha informações tão pormenorizadas quanto possível para cada experimento na edição de imagem para garantir fácil rastreamento de imagens em momentos posteriores e salvar suas imagens.
7. ReRemove os ratos a partir de imagens IVIS câmara e devolvê-los às suas gaiolas. Observar a recuperação de umanestesia para garantir ratos não foram significativamente afetadas pelo procedimento. Os animais devem ser monitorados constantemente, até que se recuperar totalmente da anestesia (geralmente 1-2 min).

4. Ex vivo de Imagem e Análise de CFU para a quantificação de bactérias nos Pulmões

1. Injetar camundongos com luciferina intraperitoneal da mesma maneira como para geração de imagens, pouco antes da eutanásia.
2. Eutanásia os ratos por injeção intraperitoneal de 100 mg / kg 5 min após a injeção pentobarbitol luciferina.
3. Explante os pulmões de camundongos e coloque em pratos de Petri estéreis usando uma pinça e tesouras estéreis.
4. Coloque placa de Petri contendo órgão explantado em imagens de câmara e adquirir imagens bioluminescência da mesma maneira como para mouse todo.
5. Depois de imagem, remoção de órgãos explantado de petri prato com a pinça estéril e homogeneizar em 1 mL de PBS.
6. Fazer diluições e tecido placa na mídia apropriada seletivo. Tecido homogeneizado pode ser armazenado entre -80 ° C para a re-regulamentação, caso seja necessário. Alternativamente, o tecido homogeneizado pode ser utilizado para extração de DNA ou RNA para quantificar o número de bactérias por qPCR.

5. Análise de imagem Luminescência

1. Start "Software Imaging Living" e procurar os arquivos de imagem.
2. Use "Tool Palette" para ajustar as imagens. Clique na imagem Ajuste para modificar a correção / filtragem configurações e min / max para as escalas de cores individuais.
3. Use ferramentas de ROI na lista suspenso para a quantificação da intensidade da luz. Selecione a forma ROI, número e tamanho. Arraste quadro ROI para região de interesse na imagem. Assegurar que todas as ROI são do mesmo tamanho e forma. Clique ROI de medição e salvar, copiar e / ou exportação de dados quantitativos.
4. No caso de DLIT reconstruções 3D, carregar uma seqüência de imagens, incluindo a imagem de luz estruturada. Clique topografia de superfície na Ferramenta de Platte. Na lista suspensa, clique em Reconstruir guia para gerar a topografia da superfície. Uma confusão de superfície irá aparecer na janela.
5. Selecione DLIT reconstrução 3D na ferramenta de Platte. Na lista de pulldown, clique na guia Propriedades para definir as propriedades dos tecidos e espectro da fonte. Muscular é recomendado na maioria das circunstâncias. Na lista pendente, clique na guia Analisar para selecionar o comprimento de onda para análise. Clique na guia Parâmetros e confirmar os valores padrão ou ajustar os parâmetros DLIT se necessário. Clique Reconstruir guia para começar a análise em 3D.
6. Quando a reconstrução 3D é concluída, a visualização em 3D irá exibir os resultados da reconstrução 3D. Clique na guia para ver os resultados de análise de dados para a densidade de fótons, voxels e parâmetros do algoritmo DLIT.
7. Salvar e / ou exportar os resultados das análises de reconstrução 3D em figuras e arquivos de dados.

6. Resultados representativos:

As imagens bioluminescência de camundongos infectados com bactérias bioluminescentes, juntamente com um controle do mouse não infectados são mostrados na Figura 1. O pulmonares camundongos infectados com bactérias bioluminescentes produzir sinal significativo dos pulmões (Figura 1). Intensidade da luminescência é quantificado como fluxo total dentro de um ROI (região de interesse) (Figura 2). Os dados quantitativos para a intensidade da luz é normalizado para as unidades formadoras de colônia (UFC) de bactérias obtidas de pulmões para confirmar que o sinal é produzido a partir de bactérias bioluminescentes e pode ser comparado ao controle negativo. A localização ea intensidade do sinal pode ser posteriormente analisado por DLIT reconstrução 3D da fonte de luminescência com base na tomografia da superfície do mouse ^11. Essas análises permitem a quantificação e localização do sinal bioluminescente produzido. Os resultados da reconstrução 3D de uma fonte luminescente em camundongos infectados demonstra que a luz é produzida a partir de pulmões do mouse (Figura 3). As imagens ex vivo dos pulmões do rato resultando confirmar que a luminescência é emitido a partir dos pulmões, ao invés de algum outro tecido ou órgão estreitamente justapostas (Figura 2C).

Figura 1. Imagens da luminescência pulmonar camundongos infectados com bactérias bioluminescentes marcados com CBRluc. Rato controle não infectado é do lado esquerdo e dois camundongos infectados estão na direita. Camundongos foram infectados com bactérias expressando CBRluc (n = 2) por via intratraqueal. 10 minutos após a injeção de luciferina, imagens de luminescência foram adquiridas por 10 minutos a 4 posições: dorsal, lateral, ventral esquerdo e lado direito.

Figura 2. A intensidade da luz quantitativa de camundongos infectados com bactérias expressando CBRluc. (A, B) imagens Luminescência de ROI análise e quantificação do fluxo total de luz de ROI em posições dorsal e ventral, respectivamente. Camundongos não infectados estão na esquerda e dois camundongos infectados estão na direita. Luminescência imagens foram adquiridas a partir de pulmões of camundongos não infectados e infectados com CBRlux (n = 2). A intensidade da luz em torno dos pulmões foi quantificada por análise de ROI. C) imagens ex vivo de pulmões de não infectados (em cima) e infectadas (em baixo dois conjuntos de pulmões) camundongos. Luciferina foi injetado 5 miniuts antes da eutanásia e as imagens foram então adquiridos. Os valores quantificados são normalizados para CFU.

Figura 3. A reconstrução 3D da fonte de bioluminescência (s) de um rato pulmonar infectado. O rato foi infectado com bactérias expressando CBRluc por injeção intratraqueal. A seqüência de imagens foi adquirido usando filtros diferentes comprimentos de onda de emissão de série de 540 nm e 700 nm. Uma seqüência de imagens foi utilizada para a reconstituição em 3D para fonte de luminescência em indivíduos animais que continha uma imag estruturado. A) A tomografia para mouse é mostrado em diferentes posições: frente, trás, esquerda e direita. Fontes de luz são mostrados como voxels (caixas vermelhas dentro de mouse 3D) que estão localizados dentro do pulmão, conforme determinado pela reconstrução. B) Photon mapa densiy de dados medidos e simulados. Comparando as curvas de densidade medidos e simulados fóton fornecer as informações de qualidade de reconstrução. Boa qualidade no resultado reconstruções semelhante medidos e simulados densidades de fótons.

Apesar de seguir estes protocolos normalmente irá resultar em imagens de alta qualidade, é importante considerar algumas questões-chave a fim de obter dados precisos e consistentes a partir de estudos de imagem. Luminescência imagens devem ser adquiridas que têm contagens de 600 a 60000 para garantir que o sinal está acima do fundo ea câmera não está saturado. Se o sinal obtido é inferior a 600 as condições de exposição deve ser ajustado para aumentar a contagem. Se o sinal obtido é mais de 60.000 a câmera está saturado em algumas regiões. Quando a câmera está saturado, a quantificação não deve ser tentada em regiões saturadas, embora ainda seja possível e às vezes necessário, em regiões não-saturado. Além disso, a reconstrução 3D não pode ser realizada com precisão quando uma saturada regiões está incluído dentro da região a ser utilizado para a máscara para a reconstrução. O ajuste do tempo de exposição, binning e F / stop para aquisição de imagem, bem como a modificação da região de imagem ou posição animal pode controlar o sinal obtido e permitir uma análise quantitativa de dados. Assim, em muitos experimentos é útil para os animais de forma consistente de imagem em condições de exposição múltiplas para garantir que pelo menos um conjunto de imagens estará dentro dos limites necessários para permitir análise quantitativa.

É importante lembrar que a expressão de qualquer gene repórter pode afetar a virulência, tornando-se necessário a realização de estudos-piloto para avaliar os impactos potenciais sobre a aptidão em recombinantes cepas que devem ser usados ​​para geração de imagens. Esta é uma das limitações da imagem bioluminescentes, uma vez que requer a expressão de genes estranhos nas bactérias. Isso pode muitas vezes ser superados através do uso otimizado de construções que usam o uso de códon apropriado para a espécie bacteriana a ser estudado, a titulação dos níveis de expressão de genes repórter para reduzir o impacto sobre o metabolismo ou o exame de múltiplos sistemas repórter luminescentes que podem ser diferentes no seu impacto em fitness.

Outra variável fundamental para os estudos de imagem com agentes infecciosos é o nível de sinal produzido pelo agente que está sendo fotografada. Uma vez que existem diferenças no limiar de detecção para cada agente em animais, em comparação com in vitro, recomenda-se que estudos-piloto com múltiplas doses infecciosas para otimizar números agente antes da realização de experimentos mais extensos. Os repórteres se bioluminescentes também deve ser otimizado para toxicidade transcrição, tradução e baixos, para garantir que o nível de sinal produzido é tão alto quanto possível. Otimização dos jornalistas pode ser feito na maioria dos casos in vitro, mas o comprimento de onda de emissão de luz também terá impacto a luz produzida pelos repórteres capacidade ideal para penetrar tecidos de mamíferos, tornando-se importante também avaliar diferentes repórteres diretamente em animais. Apesar de cada animal pode ser seguido individualmente, que controla uma grande parte da variabilidade entre os animais, ainda é necessária a inclusão de animais suficiente para permitir a significância estatística entre os grupos a serem determinados. Normalmente, os números de animais deve ser 4-6 por grupo, permitindo que diferenças tão baixo como duas vezes entre os grupos que devem ser observados em muitos casos. Por último, a via de inoculação e precisão de entrega para os tecidos apropriados e de números precisos agente vai ajudar a garantir resultados consistentes, reduzindo variabilidade geral entre os animais.

As propriedades espectrais da bioluminescência produzido também é um fator importante que afeta a capacidade de infecções de imagem in vivo. Em tecidos de mamíferos, a luz de comprimentos de onda inferior a 600 nm são em grande parte absorvida pela hemoglobina, um componente principal de tecidos de mamíferos. A profundidade de penetração de comprimentos de onda bioluminescência aumenta drasticamente para comprimentos de onda de 600 nm mais ^8,12. Ambos CBRluc e FFluc produzir bioluminescência com um comprimento de onda amplo, incluindo mais de 600 nm, tornando estes luciferases repórteres quase ideal para in vivo de imagens, mesmo em tecidos profundos, incluindo os pulmões eo fígado ^7-8.