Abstract
PTMScan טכנולוגיה ® מ טכנולוגיה התא איתות (CST) משלב מתודולוגיות קניינית להעשרת נוגדן מבוססי פפטידים עם כרומטוגרפיה נוזלית-טנדם ספקטרומטריית מסה (LC-MS/MS) כדי כמותית פרופיל שלאחר translational שינויים (PTMs) כגון זרחון (PhosphoScan ®) , ubiquitination (UbiScan ®) ו acetylation (AcetylScan ®).
PTMScan ® טכנולוגיה מעסיקה CST ™ נוגדנים מוטיב להפריד בין קבוצות מוגדרות מראש של הפוסט translationally פפטידים שונה מן פפטידים ללא שינוי ב תמציות תא מעוכל. טכניקה זו טיהור immunoaffinity משולב עם LC-MS/MS לזהות ולכמת את השינויים בשפע פפטיד שונה. נוגדנים מוטיב זמינים באופן ספציפי להיקשר phospho (Tyr, סר, thr)-פפטידים, פפטידים acetylated, או פפטידים היוביקוויטין, מתויג, המאפשרת אפיון כמותי של מעמד זירחון, acetylation, או ubiquitination של התא.
MAPK, mTOR ואת המסלולים PI3K/Akt מאותתים מפתח מסלולים מופעל הזרם של קולטן בשעור קינאזות טירוזין (RTKs). כל המסלולים האלה להפעיל המשפחה AGC קינאז חברים, כולל Akt, RSK, p70 ו S6 קינאז, אשר הם חלבונים מצעים פוספורילציה על RxRxxS / מוטיב טי.
במחקר phosphoproteomic האחרונות נכתב על ידי מדענים ב-CST (Sci. Signal (2010) 24; 3 (136). Ra64), מעל 300 מצעים המשוערת עבור אלה קינאזות משפחה AGC זוהו שלוש שורות תאים, שכל אחד מהם מונע על ידי EGFR או, c-Met, או PDGFR. גישה ניסויית המועסקים PhosphoScan טכנולוגיה ® באמצעות RxRxxS / T כמו נוגדנים מוטיב ריאגנט זיקה סלקטיבי immunoprecipitate מצעים פוספורילציה של Akt, RSK, p70 ו S6 קינאז. שימוש של תרופות נגד סרטן ממוקד עם מעכבי ספציפיות PI3K, mTOR, ואת ה-MEK מותר למיפוי של במורד הזרם לרשת האיתות של RTKs אלה. מצעים כלל החלבונים המעורבים תפקודים תאיים רבים, כולל פיגומים, יציבות חלבון, מטבוליזם, הסחר, תנועתיות.
