The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
This translation into Arabic was automatically generated through Google Translate.
English Version | Other Languages
Department of Biochemistry and Cell Biology, State University of New York
This article is a part of JoVE General. If you think this article would be useful for your research, please recommend JoVE to your institution's librarian.
Recommend JoVE to Your LibrarianCurrent Access Through Your IP Address
Current Access Through Your Registered Email Address
Ueki, S., Lacroix, B., Citovsky, V. Protein Membrane Overlay Assay: A Protocol to Test Interaction Between Soluble and Insoluble Proteins in vitro. J. Vis. Exp. (54), e2961, doi:10.3791/2961 (2011).
التحقق من التفاعلات بين البروتينات المختلفة أمر حيوي لتحقيق وظائفها البيولوجية على المستوى الجزيئي. هناك أساليب عدة ، سواء في التجارب المختبرية والحية ، لتقييم ملزمة البروتين ، وينبغي أن تجرى على الأقل طريقتين التي تكمل بعضها البعض أوجه القصور في الحصول على رؤى وثوقية.
لمقايسة في الجسم الحي ، وتكامل ثنائي الجزيء مضان (BiFC) مقايسة يمثل النهج الأكثر شعبية والأقل الغازية التي تمكن للكشف عن البروتين البروتين التفاعل داخل الخلايا الحية ، وكذلك تحديد توطين الخلايا من 1،2 البروتينات المتفاعلة. في هذا الاختبار ، وتنصهر غير الفلورسنت N - C ومحطة GFP - نصفي أو مشتقاته للبروتينات اختبار ، وعندما يتم إحضارها بروتينات اندماج اثنين معا بسبب تفاعلات البروتينات اختبار "، يتم إعادة تشكيل إشارة الفلورسنت 3-6 . بسبب اشارة غير قابلة للكشف بسهولة عن طريق الفحص المجهري أو epifluorescence مبائر ، برز BiFC كأداة قوية من الاختيار بين علماء الأحياء خلية لدراسة عن بروتين تفاعلات البروتين في الخلايا الحية 3. هذا الاختبار ، ومع ذلك ، يمكن ان تنتج في بعض الأحيان إلى نتائج إيجابية كاذبة. على سبيل المثال ، يمكن تشكيل لإشارة الفلورسنت بشظايا GFP two رتبت بقدر 7 نانومتر من بعضها البعض بسبب إغلاق التعبئة والتغليف في المحفظة أ التحت خلوية صغيرة ، وأنه بدلا بسبب تفاعلات معينة 7.
بسبب هذه القيود ، يجب تأكيد النتائج التي تم الحصول عليها من تقنيات التصوير الخلية الحية بنهج مستقل يقوم على مبدأ مختلفة للكشف عن تفاعلات البروتين. شارك في مناعي (المشارك IP) أو الجلوتاثيون ترانسفيراز (GST) المنسدلة المقايسات تمثل هذه الطرق البديلة التي يشيع استخدامها لتحليل التفاعلات بين البروتينات والبروتين في المختبر. ومع ذلك ، IIN هذه المقايسات ، ومع ذلك ، يجب أن تكون قابلة للذوبان البروتينات اختبارها بسهولة في المنطقة العازلة التي supportsused للتفاعل ملزمة. لذا ، لا يمكن أن تنطوي على تفاعلات معينة غير قابلة للذوبان البروتين يتم تقييمها بواسطة هذه التقنيات.
هنا ، نحن لتوضيح بروتوكول للتراكب فحص غشاء بروتين ملزمة ، والتي تلتف على هذه الصعوبة. في هذه التقنية ، يمكن التفاعل بين البروتينات القابلة للذوبان وغير القابلة للذوبان اختبار موثوق لأنه يجمد واحد من البروتينات على مصفوفة الغشاء. هذا الأسلوب ، في تركيبة مع التجارب المجراة في مثل BiFC ، يقدم نهجا موثوق بها للتحقيق في وتوصيف التفاعلات بين البروتينات بإخلاص للذوبان وغير القابلة للذوبان. في هذه المقالة ، الربط بين فيروس موزاييك التبغ (TMV) البروتين حركة (MP) ، التي تمارس وظائف متعددة أثناء النقل الخلية الى خلية الفيروسية 8-14 ، والنباتات التي تم تحديدها مؤخرا interactor الخلوية ، والتبغ ankyrin تكرار المحتوية على البروتين (عنخ ويتجلى) 15 ، وذلك باستخدام هذه التقنية.
1. التعبير واستخراج البروتينات
2. تجميد ProIM وProIMnc على الغشاء
3. إعادة للطي من البروتينات غشاء محدد
4. سبر ProIM بواسطة بروسول
5. تصور البروتين البروتين التفاعل immunoblotting
6. ممثل النتائج :
وقد لوحظ التفاعل من قبل النائب كرانك BiFC في خلايا البشرة التبغ (الشكل 1A). لأن النائب هو بروتين غير قابلة للذوبان للغاية عندما أعرب في البكتيريا أو في النباتات ، واعتمد تراكب غشاء فحص البروتين للتحقق من صحة هذا التفاعل في المختبر (1B الشكل). تم حل مقتطفات من البروتين تحتوي على 1 ميكروغرام من GST - MP (ProIM) أو ضريبة السلع والخدمات غير مدمجة (ProIM NC) بواسطة بولي أكريلاميد - SDS الكهربائي للهلام ، تليها electrotransfer لغشاء النيتروسليلوز. عندما تم بحث هذه ProIMs مع ذوبان كرانك strepII (بروسول) ، GST النائب ، ولكن لا ضريبة السلع والخدمات غير مدمجة ، عرضت ملزمة (1B الشكل ، الممرات 1 ، 2 ، مقارنة الممرات 5 ، 6). وعلاوة على ذلك ، عندما تم بحث نفس مجموعة ProIMs مع ProSOLnc لا علاقة لها ، أي Arabidopsis كيناز NADH هيولي strepII الموسومة (NADH3 - strepII) ، لم يلاحظ أي الملزمة ، مما يدل على مزيد من التحديد للتفاعل كرانك النائب (1B الشكل ، والممرات 3 ، 4).

الشكل 1. عنخ ملزمة محددة من التبغ إلى النائب TMV في الجسم الحي وفي المختبر. (A) كرانك النائب تفاعل الخلايا الحية في الكشف عن التبغ البشرة كما BiFC. أعيد بناؤها قوية YFP عند إشارة النائب وكرانك ، تنصهر فيها إلى C - N - محطة ومحطة نصفي YFP ، على التوالي ، وكانت في البشرة coexpressed التبغ microbombardment التالية من الجينات ترميز الخاصة بهم. هذه الإشارة BiFC المتراكمة في نقاط وعلى هامش الخلية ، والتي هي من التشخيص رابطات هيولية 15. (ب) كرانك النائب التفاعل في المختبر الكشف عن بروتين الغشاء كما مقايسة تراكب. تم حل مقتطفات من البروتين تحتوي على 1 ميكروغرام من GST - MP (ProIM) أو ضريبة السلع والخدمات غير مدمجة (ProIMnc) على جل SDS - بولي أكريلاميد 15 ٪ ، تليها electrotransfer على غشاء النيتروسليلوز. وحضنت ضريبة السلع والخدمات ، وMPProIM GSTProIMnc مع 0.5 ميكروغرام / مل من كرانك strepII (بروسول) ، وكان الكشف عن عنخ ملزمة التحقيق الغشاء مع الأضداد المضادة للأرنب strepII النسائل المتعددة ، تليها المضادة للأرنب مفتش الأضداد M + الثانوية لمترافق HRP (حارات 1 و 2). لا ضريبة السلع والخدمات ، ولا MPProIM GSTProIMnc تفاعلت مع البروتين لا علاقة لها ، Arabidopsis كيناز NADH حشوية ، تنصهر فيها إلى العلامة strepII (ProSOLnc ، الممرات 3 و 4). وتم تأكيد هوية الفرقة التي لوحظت في هذا الاختبار من قبل الذين يحققون في الغشاء المضادة للضريبة السلع والخدمات الأضداد (حارات 5 و 6). عندما كان يعالج في الغشاء مع العازلة تمسخ دون غسلها مع العازلة ألف ، يتم فقدان الملزم للضريبة السلع والخدمات إلى النائب عنخ ، بينما البروتينات مجهولين الواردة في GST النائب ومقتطفات GST البروتين contining تفاعلت مع كرانك strepII ، مما يدل على أهمية من الخطوة 3.1 قبل عملية تمسخ (حارات 7 و 8).
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
هذا النهج هو مناسبة لاختبار البروتين البروتين التفاعلات بين مجموعات من البروتينات ، عندما تم تطبيقها بنجاح واحد على الأقل من البروتينات التي تذوب بسهولة في المخزن ملزمة ، ومجموعة أخرى من البروتينات 17،18. لا يمكن iInteractions بين البروتينات التي هي غير قابلة للذوبان على حد سواء في ظل هذه الظروف يمكن اختباره من قبل هذا البروتوكول.
أيضا ، refolding ProIM الناجح هو أمر حاسم لمقايسة. الشطف في الغشاء TBS بعد electrotransfer هو خطوة رئيسية ، لأن SDS المتبقية يمكن أن يعوق عملية تمسخ / استعادة الطبيعة.
أخيرا ، لتجنب غير محددة وملزمة ، وينبغي تركيز بروسول في المنطقة العازلة ملزم لا يتجاوز 1 ميكروغرام / لتر. قد بروسول التي تتركز أيضا المعرض غير محددة وملزمة لProIM. أيضا ، يمكن لمنع الربط غير محددة من البروتينات إلى غشاء يجمد بروسول ، جيش صرب البوسنة في المنطقة العازلة التي استخدمت خلال التهجين الخطوة 4.2 لتكون بديلا الحليب الخالي من الدسم.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
الإعلان عن أي تضارب في المصالح.
ويدعم العمل في المختبر لدينا من المنح المقدمة من المعاهد الوطنية للصحة ، وزارة الزراعة والمعهد الوطني للأغذية والزراعة ، وجبهة الخلاص الوطني ، بارد ، وزارة الطاقة ، والبنك السعودي الفرنسي لVC
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Protein assay kit | Bio-Rad | 500-0001 | |
| Proteinase inhibitor cocktail | Sigma-Aldrich | S8820 | |
| Mini-PROTEAN system | Bio-Rad | 165-8000 | |
| Semi-dry western blotting SD electrotransfer system | Bio-Rad | 170-3940 | |
| Anti-rabbit IgG antibody conjugated with horse radish peroxidase | GenScript | A00098 | |
| Anti-GST rabbit polyclonal antibody | GenScript | A00097 | |
| Anti-strepII | GenScript | A00626 | |
| BioTrace, NT nitrocellulose transfer membrane | Pall Corporation | 27377-000 | |
| Immobilon western chemiluminescent HRP substrate | EMD Millipore | WBKL S0 050 |
what are the proteins reactions?the reactants and products and tools and the methods od the experiments ?
1
ReplyPosted by: mustafaSeptember 14, 2011, 1:06 PM