The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
This translation into Arabic was automatically generated through Google Translate.
English Version | Other Languages
1School of Molecular Bioscience, University of Sydney, 2Department of Surgery, Royal Prince Alfred Hospital, 3Department of Anatomical Pathology, Department of Anatomical Pathology, 4Department of Medicine, Concord Repatriation General Hospital
This article is a part of JoVE Immunology and Infection. If you think this article would be useful for your research, please recommend JoVE to your institution's librarian.
Recommend JoVE to Your LibrarianCurrent Access Through Your IP Address
Current Access Through Your Registered Email Address
Zhou, J., Belov, L., Solomon, M. J., Chan, C., Clarke, S. J., Christopherson, R. I. Colorectal Cancer Cell Surface Protein Profiling Using an Antibody Microarray and Fluorescence Multiplexing. J. Vis. Exp. (55), e3322, doi:10.3791/3322 (2011).

تدفق العمل الرقم 1. لإعداد تعليق الخلايا الحية من عينة جراحية من اتفاقية حقوق الطفل.
1. عينة سريرية التفكيك
وقد تم جمع عينات من كل من مستشفى رويال الامير ألفريد (Camperdown ، نيو ساوث ويلز ، أستراليا) ، ومستشفى كونكورد العودة إلى الوطن (كونكورد الغربية ، نيو ساوث ويلز ، أستراليا) مع الموافقة المسبقة بموجب البروتوكول رقم X08 - 164.
2. إعداد نموذج لالتقاط الخلية
3. القبض على خلية جسم [ميكروأري
4. مضان مضاعفة
5. ممثل النتائج :
وينبغي أن ينتج عن ميكروأري DotScan تظهر أنماط الخلية متسقة الربط بين صفائف مكررة. محاذاة نقطة قوية ملزمة (CD44/CD29) تمكن الشبكة إلى وضعها فوق منطقة الصفيف. ويبين الشكل 2 مثالا على التقاط الخلية الأمثل والمتعدد. ويبين الشكل 3 بعض المشاكل المشتركة التي تواجه أثناء التقاط الخليوي ، والحلول الممكنة.
ويمكن قياس نتائج الخلية ميكروأري ملزمة من خلال قياس كثافة نقطة وأعرب على نطاق وgreyness تتراوح بين 1 إلى 256. ويبين الشكل 4 بيانات رقمية لجنة حقوق الطفل من 58 عينات الجراحية ، ملطخة الضد - 647 EpCAM اليكسا ، بوصفها heatmap مع المجموعات الهرمية. على الرغم من أن عدد العينات غير محدودة ، ومراكز التأهيل المجتمعي للمرحلة نفسها تميل إلى التجمع في نفس المجموعة.

الشكل 2. نمط الخلية السرطانية السريرية الملزمة للسرطان القولون والمستقيم (استراليا عيادة - الباثولوجية التدريج ، ACP المرحلة B1). (أ) مفتاح الضد يظهر DotScan مواقع الأجسام المضادة للنصف الأيسر من ميكروأري مكررة (المذكورة). القسم العلوي يحتوي على الأجسام المضادة الأصلي 82 من ميكروأري DotScan اللوكيميا. العثور على مبلغ إضافي 40 الأضداد ، المطابقة لمستضدات سطح محددة إلى أن يصل التنظيم في الأدب ، كما أضيفت ميكروأري 'الفضائية' إلى لجنة حقوق الطفل. يتكون القسم السفلي من أجسام تحكم isotype (ب) من الخلايا الضوئية صورة ملزما للجنة حقوق الطفل ميكروأري. (ج) صورة مضان CD3 تظهر الخلايا التائية. (د) صورة مضان EpCAM تظهر الخلايا لجنة حقوق الطفل.

الشكل 3. أمثلة للنتائج DotScan الفقراء والحلول الممكنة. (أ) خلية قليلة ملزمة ؛ الحل : تأكد على الأقل 4x106 هي خلايا قابلة للحياة على مجموعة (ب) Isotype خلية مراقبة الملزمة وغير الملزمة محددة ؛ الحل : إضافة للحرارة الإنسان المعطل لعينة مصل AB قبل الحضانة على ميكروأري للحد من isotype السيطرة ملزمة. في بعض الأحيان ، وهو مبلغ صغير من المنظمات غير محددة وملزمة من الخلايا إلى النيتروسليلوز يحدث مع اتفاقية حقوق الطفل وعينات لا يؤثر بشكل كبير على النتائج. (ج) النتروسليلوز تجفيف خلال الحضانة ؛ الحل : تأكد من عينة يغطي القسم النيتروسليلوز كله والمحتضنة ميكروأري على سطح مستو. (د) التحف خلفية عالية ؛ الحل : التأكد منيتم غسلها جيدا ميكروأري حضانة التالية.

الشكل 4. DotScan برمجيات تحليل الرسوم البيانية ولدت شريط يمثل كثافة الخلية ملزم على نطاق greyness تتراوح بين 1 إلى 256. الأرقام على محور الرجوع إلى مستضدات CD. الاختصارات الأخرى TCR ، تي مستقبلات الخلية ؛ κ ، λ ضوء المناعي ، وسلاسل ، سيج ، المناعي السطح ؛ DCC ، حذف البروتين في سرطان القولون والمستقيم ؛ EGFR ، البشرة مستقبلات عامل النمو ؛ FAP ، البروتين الليفية التنشيط ؛ HLA - A ، B ، HLA - C DR ، الكريات البيض البشرية DR مستضدات و A ، B ، C على التوالي ؛ ميكا ، MHC الصف الأول سلسلة متصلة من البروتين A ؛ MMP - 14 ، مصفوفة metallopeptidase 14 ؛ PIGR ، مستقبلات المناعي البوليمرية ؛ TSP - 1 ، thrombospondin - 1 ؛ Mabthera ، البشرية : مكافحة CD20. انقر هنا لعرض صورة أكبر .
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
في هذا الفيديو ، ونظهر كيف يمكن استخدام الأجسام المضادة ميكروأري DotScan بطريقة بسيطة نصف الكمية ، لدراسة ملامح سطح المستضد للسكان خلية من أنسجة لجنة حقوق الطفل.
الحصول على تعليق خلية واحدة قابلة للحياة من الأنسجة أمر حاسم لنجاح التجربة ، لأن الطاقة التي تعتمد على العمليات (مثلا ، متوجا مستضد و / أو تشكيل أقدام كاذبة) ويبدو أن هناك حاجة للربط الثابت من خلايا جسم بأكمله إلى نقطة خلال الحضانة ، بينما يتم غسلها في وقت لاحق خارج الخلايا الميتة. كان يعمل في البداية اكتب 1 كولاجيناز disaggregation8 للأنسجة ، ولكن استعيض عن كولاجيناز (4) التي أقل ضررا لأغشية الخلايا ، كما أنه يحتوي على عدد أقل من الملوثات البروتيني. لم هذا التغيير لن يؤثر على محصول الخلية ، صلاحية أو أنماط ملزمة. انخفاض المخاط من بعض الأورام وعينات الخلايا والسيطرة العائد تدخلت مع التقاط الخلية. تم تصغير هذه الحساسية من المخاط قبل تخزين تعليق خلية موزعة في 10 ٪ DMSO / FCS في -80 درجة مئوية ، ويفترض نظرا للتغيرات في خصائص مخاط بعد تجميد والذوبان 9. في وقت لاحق ، تم تخزين جميع العينات المجمدة في 10 ٪ DMSO / FCS بعد تصنيفها وكانت إذابة بسرعة لإنتاج معلقات خلية قابلة للحياة ، مع أنماط ملزمة متناسقة. حذفت العينات مع بقاء <50 ٪ أو إظهار ملزمة الفقراء على محاذاة / التدبير المنزلي نقاط (CD44/CD29) من التحليل.
وكان علامة بارزة لجنة حقوق الطفل واستنساخ CD15s الضد قليلة أظهرت تقارب عندما خفضت منضمة إلى النيتروسليلوز ربما يرجع ذلك إلى تغيير في التشكل ، على سبيل المثال ، فإن القليل جدا أو لا ملزمة الخلية. ينبغي الاستعاضة عن الأجسام المضادة التي أظهرت نتائج سلبية على الدوام مع الحيوانات المستنسخة ورم هجين مختلفة. وكان سبب آخر ممكن من النشاط لبعض الفقراء إلى تدخل الأجسام المضادة ملزمة ألبومين المصل البقري (BSA). وينبغي استخدام جيش صرب البوسنة خالية من الأجسام المضادة على ميكروأري حيثما أمكن ذلك.
على الرغم من أن هناك حاجة كبيرة للمريض الأفواج التحليل الاحصائي للبيانات ميكروأري ، المجموعات الهرمية للنتائجنا (58 عينات سريرية) كانت مشجعة. وينبغي تطبيع البيانات باستخدام الأساليب التي وصفها يانغ 10 تقديم دلالة إحصائية محسنة.
في حين أن الأجسام المضادة ميكروأري DotScan تمكن من تحديد أنماط جديدة من التعبير عن مستضدات CD المعروفة ، فإنه يكون أكثر فعالية عندما يستخدم جنبا الى جنب مع تقنيات اكتشاف البروتين ، مثل هلام إستشراد 2 الأبعاد وLC - MS - iTRAQ ، لتحديد البروتينات الرواية وفيرة تفاضلي . رواية البروتينات مثل هذه العلامات المحتملة ، ويمكن أن تضاف الأضداد المقابلة للمجموعة ، والتحقق من صحتها مع عينات سريرية لجنة حقوق الطفل.
استخدام الأجسام المضادة fluorescently المسمى لملف الفرعي مجموعات من الخلايا والقبض توفر منصة قوية لتحليل DotScan المختلطة السكان من الخلايا.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
الإعلان عن أي تضارب في المصالح.
نشكر العاملين في مختبرات علم الأمراض التشريحية لألفريد الملكي الأمير المستشفيات والعودة إلى الوطن كونكورد لجمع عينات جديدة من اتفاقية حقوق الطفل والغشاء المخاطي في الأمعاء طبيعية. وقد تم تمويل العمل من قبل معهد السرطان نيو ساوث ويلز برنامج المنح بالحركة.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Hanks’ balanced salt solution | Sigma-Aldrich | H6136-10X1L | Buffered with 25 mM Hepes (Sigma #H3375) |
| Airpure biological safety cabinet class II | Westinghouse | 1687-2340/612 | |
| Surgical blades | Livingstone | 090609 | Pack of 100 |
| RPMI 1640 with 2 mM Hepes | Sigma-Aldrich | R4130-10X1L | |
| Collagenase type 4 | Worthington Biochemical | 4188 | |
| Deoxyribonuclease 1 | Sigma-Aldrich | DN25-1G | |
| Terumo Syringe (10 mL) | Terumo Medical Corp. | SS+10L | Box of 100 |
| Filcon filter (200 m) | BD Biosciences | 340615 | |
| Filcon filter (50 m) | Filcon filter (50 m) | Filcon filter (50 m) Filcon filter (50 m) 340603 | |
| Fetal calf serum | GIBCO, by Life Technologies | 10099-141 | |
| Centrifuge 5810 R | Eppendorf | 7017 | |
| Dimethyl sulphoxide | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| Trypan blue | Sigma-Aldrich | T8154 | |
| Hemocymeter Technocolor Neubar | Hirschmann | not available | |
| Light microscope | Nikon Instruments | Nikon TMS | |
| Cyrovial tubes | Greiner Bio-One | 121278 | |
| Cryo freezing contrainer | Nalge Nunc international | 5100-0001 | |
| DotScan antibody microarray kit | Medsaic | not available | |
| DotScan microarray wash tray | Medsaic | not available | |
| KimWipes | Kimberly-Clark Corporation | 4103 | |
| Formaldehyde 37% | Sigma-Aldrich | F1635-500ML | |
| DotReaderTM | Medsaic | not available | |
| Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | A9418-10G | |
| Heat-inactivated AB serum 2% | Invitrogen | 34005100 | |
| Phycoerythrin-conjugated CD3 | Beckman Coulter Inc. | ET386 | |
| AlexaFluor647-conjugated EpCAM | BioLegend | 324212 | |
| Typhoon FLA 9000 | GE Healthcare | 28-9558-08 | 532 nm laser, 580 BP30 emission filter for PE. 633 nm laser and 670 BP30 emission filter for Alexa647 |
| MultiExperiment Viewer v4.4 | TM4 Microarray Software Suite | Open – source software (Ref 11) |