La croissance de la Mycobacterium tuberculosis Les biofilms

1. Biofilms plus en plus de M. la tuberculose dans une bouteille de 250 mL vis plafonné

1. La préparation des médias: Dissoudre 0,5 g de KH ₂ PO _4, 0,5 g de MgSO _4, 4 g de L-asparagine, 2g d'acide citrique, 0,05 g de citrate d'ammonium ferrique, 60mL de glycérol dans 900 ml d'eau. Ajuster le pH à 7,0 avec NaOH. Autoclave, frais et juste avant de commencer l'expérience, ajouter stérile ZnSO ₄ à une concentration finale de 0,1% p / v Depuis mc ² 7000 est un auxotrophe pantothénate cette souche nécessite également de l'acide pantothénique à 10μg/mL de concentration finale.

Note: Ceci est une composition standard des médias Sauton utilisés pour M. tuberculosis. Toutefois, si nécessaire d'autres médias spécialisés peuvent également être utilisés pour d'autres espèces de mycobactéries.

2. La préparation des inoculums: Grow M. la tuberculose dans 7H9OADC avec 0,05% de Tween-80 pendant une semaine, ou DO ₆₀₀ de 0,7 à 1,0. Le culture peut être directement utilisée comme inoculum à une dilution de 1:100.
3. Distribuer 25 ml de Sauton médias à une bouteille de 250 ml en polystyrène vis plafonné (Corning). Ajouter 250μl de l'inoculum dans le milieu, bouchon de la bouteille très serré et le placer tranquillement dans un incubateur humidifié 37 ° C pendant 3 semaines. Observez la bouteille une fois par jour pour s'assurer qu'il n'y a pas de contamination.
4. A la fin de la troisième semaine, dévisser le bouchon de la bouteille afin de permettre une nouvelle croissance de M. la tuberculose à l'interface. Si le bouchon n'est pas desserré, à ce stade, puis la concentration en oxygène insuffisante dans le conteneur va retarder la croissance des bactéries encore.

2. La croissance de M. biofilms tuberculose dans des plaques 12 puits

1. Préparer les médias et l'inoculum de mc ² 7000 tel que décrit dans les sections A1 et A2.
2. Mélanger 60 ml de médias avec 600μl d'inoculum. Distribuer 4,5 millions deL du mélange dans chaque puits de la plaque. Recouvrir la plaque avec un couvercle. Envelopper la plaque à plusieurs reprises avec du parafilm. Incuber la plaque tranquillement dans incubateur humidifié à 37 ° C pendant 5 semaines.

3. Détermination de la fréquence des persistants de drogues tolérantes en M. la tuberculose biofilms

1. Grow M. biofilms tuberculose dans un format de 12 puits comme décrit dans la section B. Cela va prendre un total d'environ 5 semaines de.
2. Une fois que les biofilms sont élevés (après 5 semaines d'incubation) d'injecter votre choix de l'antibiotique à une concentration désirée dans les médias sous les biofilms en utilisant une microsonde dans une pipette.

Remarque: Le volume des médias sous les pellicules réduit à environ 3.0mL. Donc, les enquêteurs devraient donc calculer la quantité de médicament.

3. Swirl doucement la plaque de sorte que l'antibiotique est bien diffusé dans le milieu. Pour obtenir des résultats statistiquement significatifs, injecter le antibiotiquesotique dans quatre puits. En parallèle, injecter le même volume de solvant dans lequel l'antibiotique a été dissous dans quatre autres puits, et de laisser les quatre derniers puits de la plaque vierge. Recouvrir la plaque avec un couvercle et de mettre de nouvelles couches de parafilm autour de la plaque. Placez-le revenir dans l'incubateur pour la période désirée.
4. À la fin de l'incubation, ouvrir la plaque et ajouter le Tween-80 à la concentration finale de 0,1% (volume / volume) dans chacun des puits. Swirl toute la plaque en douceur pour la dispersion uniforme du détergent. Incuber la plaque à température ambiante pendant 15 minutes. Mélanger le contenu de chaque puits avec la pipette plusieurs fois afin que le contenu entier peut être uniformément transférés à un tube de 15 ml conique.
5. Centrifuger le contenu du tube à 4000rpm pendant 10 minutes à température ambiante. Reprendre le culot dans 5 ml de tampon de lavage fraîche (PBS avec 10% de glycérol et 0,05% de Tween-80). Répétez les trois temps de lavage. Reprendre le culot dans 5 ml de tampon de lavage. Gardez-le sur la bascule pour overnight à 4 ° C.

Remarque: Bien que basse température a été initialement développé pour M. smegmatis (afin de minimiser sa croissance lors de la dispersion) et utilisé pour M. tuberculosis ainsi, les espèces à croissance lente peut très probablement être secoué à la température ambiante sans aucun impact sur ​​le résultat. Rocking à la température ambiante pourrait être nécessaire si vous travaillez dans BSL-3 installation.

6. Préparer une seringue stérile équipée micropointe (2-200 pl), en coupant son extrémité la plus large à la taille appropriée, en l'adaptant à la seringue et l'envelopper avec du parafilm. Passez l'ensemble du contenu du tube à travers la seringue à embout-équipée et recueillir dans un des tubes de 15 ml frais. Répétez cette étape 5 à 6 fois jusqu'à ce que vous observez une suspension assez homogène.
7. Préparer des dilutions en série de la suspension et la plaque des dilutions sur la plaque 7H11OADC pour déterminer le nombre de colonies viables dans chaque puits. Incuber les boîtes pendant trois semaines à 37 ° C incubateur. Déterminer la fréCY d'objets persistants dans la population biofilm en calculant le rapport du nombre de colonies obtenues dans antibiotique traitée à celles obtenues lors de solvant plaques traitées.

4. Les résultats représentatifs

Lorsqu'elle est cultivée dans une bouteille, la croissance de M. la tuberculose peut être vu à la base de la bouteille à la fin de la première semaine. À la fin de la deuxième semaine, la croissance inégale des bactéries sur l'interface air-support peut être vu, même si la croissance à l'interface air-media est toujours visible à la fin de la troisième semaine (fig. 1A). À ce moment de la fixation des bactéries à la paroi du récipient est également observée. A partir de ce point de la croissance de la culture se fait principalement sur l'interface air-médias. Le liquide sous la surface de la croissance est clair. En règle générale, la structure évolue d'ici la fin de la cinquième semaine (figure 1B). Si l'incubation est prolongée, les structures de va commencer à couler au fond du récipient. Curieusement,serrage du bouchon jusqu'à la fin de la troisième semaine est une étape importante dans le processus, et pour des raisons inconnues une bouteille lâche-capped retarde significativement l'initiation de la croissance sur l'interface ^9.

Dans le format de 12 puits, un biofilm robuste à l'interface air-médiatique est perçue dans chacun des puits à la fin de cinq semaines (figure 2A). Si les plaques ne sont pas enveloppés complètement, puis la croissance du biofilm différentiel est observée. Dans le pire des cas, l'évaporation importante des médias peuvent retarder la croissance des bactéries (figure 2B). Ainsi, l'emballage de la plaque est nécessaire à la fois pour empêcher l'évaporation ainsi que de fournir un environnement pour la formation de biofilm (voir paragraphe précédent).

Le nombre de bacilles viables dans les biofilms déterminés avec cette technique est tout à fait reproductible. Réponse de M. tuberculose biofilms varie avec la nature des antibiotiques. Pour un antibiotique bactéricide tels que la rifampicine, la perte de la viabilité suit une bipha tendance sic ^9. Un déclin rapide de la viabilité au cours des trois à quatre premiers jours, suivie d'une phase persistante dans laquelle un petit pourcentage de la population restent totalement récalcitrant aux antibiotiques, quelle que soit la concentration de l'antibiotique ou le temps d'exposition. La figure 3 montre le nombre de bacilles viables dans les biofilms matures après une exposition de 7 jours à 50μg/mL (50 fois plus élevé que le MIC) de la rifampicine.

Figure 1A. Apparition précoce de M. bacilles de la tuberculose sur l'interface air-media de bactéries après 3 semaines d'incubation.

La figure 1B. Elevage biofilms de M. la tuberculose sur l'interface air-médias après cinq semaines d'incubation.

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Figure 2A. 5-semaine biofilms vieux de M. la tuberculose cultivé dans 12 puits de format.

La figure 2B. Une tentative a échoué à croître M. biofilms tuberculose dans 12 puits de plaque sans parafilm.

Figure 3. Un graphique représentatif sur la fréquence des persistants de drogues tolérantes en M. la tuberculose biofilms cultivés dans 12 puits format et exposées à 50μg/mL de rifampicine pendant sept jours.

La tuberculose (TB), causée par l'infection de Mycobacterium tuberculosis, demeure une menace majeure pour la santé publique mondiale. Près d'un tiers de la population mondiale est estimée à asymptomatique infecté par l'agent pathogène, environ 9 millions de nouveaux cas apparaissent chaque année dans la clinique avec des symptômes de tuberculose évolutive et environ 1,7 million de personnes meurent de l'infection chaque année ^11. Le lourd fardeau de la maladie est principalement contribué par le manque d'un vaccin et une chimiothérapie hautement complexe qui implique un régime multi administré plus de six à neuf mois. La chimiothérapie prolongée est en grande partie attribuable à la tolérance phénotypique d'une petite sous-population de l'agent pathogène qui exigeait une exposition prolongée d'antibiotiques ^12. Bien que le ciblage de ces objets persistants est essentiel pour le traitement à court et efficace de la tuberculose, les mécanismes sous-jacents au développement de ces persistants restent floues.

La plupart microbienne spécies dans leur habitat naturel pousser spontanément dans les auto-assemblés, de surface ci-jointes les communautés multicellulaires appelés biofilms, qui sont très tolérants aux antibiotiques ^3. Récemment, il a été montré que plusieurs espèces de mycobactéries, ont forte propension à cultiver in vitro des biofilms, qui fournissent un microenvironnement qui favorisent le développement de médicaments persistants tolérantes ^9,13-15. Alors que les espèces à croissance rapide de l'environnement tels que M. smegmatis peut facilement former des biofilms dans les détergents sans les médias, la croissance lente espèce pathogène M. la tuberculose nécessitent des conditions spécifiques afin de former des structures multicellulaires ^9. Depuis la culture M. la tuberculose dans les biofilms pourraient donner un aperçu significatif sur les mécanismes de la tolérance au médicament et de la persistance, la diffusion d'un protocole détaillé pour la culture de l'agent pathogène dans les biofilms grâce à un open source sera utile pour recherche sur la tuberculose, en particulier dans un countr ressources limitéesy.

Nous décrivons ici la méthode de culture de M. la tuberculose dans les biofilms en détail. Nous fournissons également un protocole de briser les biofilms et de déterminer le nombre de bacilles viables dans la population. Cette technique peut être utilisée pour déterminer le nombre de médicaments persistants tolérantes dans la culture. Les trois étapes les plus critiques dans les biofilms de culture sont les suivants: 1) le choix d'un mécanisme approprié de détergent sans les médias, un contenant fermé et la culture au cours des trois premières semaines, et ouvrir le récipient pour l'incubation ultérieure. En outre, au maintien du conteneur dans un état humidifié est également essentiel pour éviter l'évaporation des médias au cours de 5 semaines d'incubation. Cela peut entraver de manière significative la reproductibilité des résultats.