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1Department of Microbiology, New York University School of Medicine, 2Molecular Neurobiology Program, Skirball Institute for Biomolecular Medicine, New York University School of Medicine, 3Department of Otolaryngology, New York University School of Medicine, 4Department of Cell Biology, New York University School of Medicine, 5Department of Physiology and Neuroscience, New York University School of Medicine, 6Department of Psychiatry, New York University School of Medicine, 7Center for Neural Science, New York University School of Medicine
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Kobayashi, M., Kim, J. Y., Camarena, V., Roehm, P. C., Chao, M. V., Wilson, A. C., et al. A Primary Neuron Culture System for the Study of Herpes Simplex Virus Latency and Reactivation. J. Vis. Exp. (62), e3823, doi:10.3791/3823 (2012).
Herpes simplex virus di tipo 1 (HSV-1) stabilisce una vita lunga infezione latente nei neuroni periferici. Questo serbatoio latente è la fonte di eventi riattivazione ricorrenti che garantiscono la trasmissione e contribuire alla malattia clinica. Antivirali attuali non influenzano il serbatoio latente e non ci sono vaccini. Mentre i dettagli molecolari di replicazione litico sono ben caratterizzati, meccanismi che controllano la latenza nei neuroni rimangono elusivi. La nostra attuale comprensione di latenza è derivato da studi in vivo su modelli animali di piccole dimensioni, che sono stati indispensabili per la definizione dei requisiti dei geni virali e il ruolo delle risposte immunitarie. Tuttavia, è impossibile distinguere effetti specifici sul virus-neurone rapporto da conseguenze più generali di infezione mediati da cellule immunitarie di sostegno o non neuronali in animali vivi. Inoltre, la sperimentazione animale è costosa, richiede tempo, e limitate in termini di opzioni disponibili per la manipolazione di accoglienzaprocessi. Per superare queste limitazioni, un neurone solo sistema è disperatamente necessario che riproduce la vivo nelle caratteristiche di latenza e la riattivazione, ma offre i vantaggi di coltura tissutale in termini di omogeneità e di accessibilità .
Qui vi presentiamo un modello in vitro utilizzando colture di neuroni primari dai gangli simpatici rat cervicale superiore (SCG) (Figura 1) per studiare HSV-1 la latenza e la riattivazione che si adatta maggior parte se non tutti i criteri desiderati. Dopo aver eliminato cellule non neuronali, vicino omogenei TrkA + colture neuronali sono infettati con HSV-1 in presenza di acyclovir (ACV) per sopprimere la replicazione litico. Dopo la rimozione ACV, non produttivi infezioni da HSV-1 che presentano caratteristiche fedelmente accettato di latenza sono stabiliti in modo efficiente. In particolare, mRNA litici, proteine ​​e virus infettivo diventa non rilevabile, anche in assenza di selezione, ma latenza associata trascrizione (LAT) expression persiste in nuclei neuronale. Genomi virali sono mantenuti ad un numero medio di copie 25 per neurone e possono essere indotte a replicare produttivamente interferendo con PI3-chinasi / Akt segnalazione o il ritiro semplice del nerve growth factor 1. A ricombinante HSV-1 EGFP codifica fusa alla proteina virale US11 litico fornisce uno funzionale, in tempo reale marcatore per la replica risultante da riattivazione che è facilmente quantificato. In aggiunta ai trattamenti chimici, metodologie genetiche come la RNA-interferenza o il gene di consegna attraverso vettori lentivirali può essere applicato con successo al sistema di autorizzazione gli studi meccanicistici che sono molto difficili, se non impossibile, negli animali. In sintesi, il SCG-based HSV-1 la latenza / riattivazione sistema fornisce un potente strumento necessario per svelare i meccanismi molecolari che controllano HSV1 latenza e riattivazione nei neuroni, un puzzle di lunga data in virologia, la cui soluzione può offrire nuove intuizioni nello sviluppo di nuove terapie che obiettivo tsi riserva herpesvirus latente.
1. Isolamento e la coltura di neuroni SCG da embrioni di ratto
Per fornire un contesto utile per comprendere questo protocollo, e per una discussione approfondita della letteratura in precedenza che i metodi stabiliti di cultura SCG neurone, compresa la base per la SCG in coltura in vitro, la piastra di rivestimento substrati, ed i componenti del siero senza mezzi di comunicazione, la si rimanda ai riferimenti 2-4.
* Il SCG è trasparente e incolore rispetto alla opaco, giallastro tessuto adiposo che circonda la biforcazione. Provare a rimuovere la maggior quantità di vasi residui del tessuto adiposo e nel sangue, prima di raccogliere i gangli.
Collagenasi * residua interfenuovamente con il substrato collagene necessario per l'adesione delle cellule alla piastra di coltura.
* Fare attenzione a non a un eccesso di triturare, in modo da danneggiare le cellule. Se la tripsina e collagenasi trattamento ha avuto successo, un massimo di quindici su e giù cicli con l'ago 21 G, e tre cicli con l'ago 23 G dovrebbe essere sufficiente.
* E 'importante utilizzare una buona tecnica di coltura di tessuto sterile perché gli antibiotici sono stati omessi dai mezzi di comunicazione di crescita. Inoltre, non ci può essere una significativa variabilità tra collagene provenienti da diversi fornitori. Abbiamo avuto risultati costanti tra i lotti con coda di topo collagene da Millipore.
* Problemi con contaminazioni fungine o batteriche sono di solito evidenti entro le prime 24 ore di cultura. Esaminare con attenzione ogni pozzetto per la crescita microbica prima di sostituire terreni in piastra. Se soltanto un numero limitato di pozzi sono interessate, possono essere trattati con una soluzione diluita di candeggina, lavate con PBS ed essiccato al fine di procedere con l'esperimento. Si consiglia di ripetere qualsiasi esperimento in cui anche un numero limitato di pozzi avevano contaminazione microbica. Se la contaminazione microbica ampio si osserva nel piatto ben 96, l'esperimento deve essere terminato.
2. L'infezione di SCG Cultmisure di protezione contro HSV-1 US11-EGFP e Istituzione di latenza
Per fondo utile sulle tecniche virologici, incluse la propagazione del virus di base, determinando titolo virale, e molteplicità di infezione (MOI), si rimanda il lettore al riferimento 5. Per una discussione di biologia herpesvirus, si rimanda il lettore a fare riferimento 6. Infine, si rimanda ai riferimenti 7-10 per gli esempi precedenti, altri protocolli, e lo sfondo aggiuntive riguardanti la alpha-herpesvirus infezione litica dei neuroni SCG e per il confronto con adattamenti nostro protocollo per studiare la latenza e la riattivazione.
* Si tratta di exceedingly importante ridurre al minimo necessario manipolazione fisica del neurone in ogni momento. Semplicemente la rimozione e la sostituzione dei media o infettare con le scorte di virus deve essere fatto molto delicatamente e lentamente. In caso contrario, lo stress risultante meccanica può avere un impatto negativo sulla redditività dei neuroni.
* MOI è calcolata usando titolo virale determinato mediante saggio di placca su cellule Vero 12 e il numero di cellule vive placcato, seminate per pozzetto in fase 1,14. Questo calcolo è utile solo in senso operativo,come il numero totale di cellule semi contiene neuroni insieme glia contaminanti, e fibroblasti. Poiché queste cellule contaminanti divisione vengono uccisi da un trattamento con agenti anti-mitotici, l'effettiva MOI per i neuroni superstiti è in realtà maggiore. Dalla quantità iniziale di partenza di 5.000 - 6.000 cellule vive, circa 1.000 i neuroni rimangono dopo il trattamento con agenti anti-mitotiche (come valutato dal conteggio delle cellule trypsinizing e diretto). Il MOI ottimale da utilizzare per infettare colture neuronali possono variare leggermente da una preparazione virus magazzino a quella successiva. Con ogni nuovo allestimento del virus, si consiglia di testare una gamma limitata di differenti MOI dal 1 a 2. L'obiettivo qui è quello di individuare quello che ha meno gli effetti sulla vitalità dei neuroni e produce il maggior numero di eventi di riattivazione inducibile (definito nella sezione 3). L'US11-EGFP virus è particolarmente utile in tempi brevi, ottimizzando le condizioni, ma si possono utilizzare anche altre letture, come saggio di placca o di quantisentante PCR. Può essere utile utilizzare virus purificato attraverso un cuscino di saccarosio per rimuovere le impurità che riducono la vitalità cellulare, anche se questo non è essenziale e non eseguita di routine.
* È estremamente importante essere estremamente delicata quando si cambiano i mezzi di infezione. Scopo la punta della pipetta alla parete del pozzo piuttosto che al fondo del pozzo, e permettere ai mezzi di scorrere dolcemente sulle cellule. Anche espulsione rapida supporti dal pipetta può generare una forza sufficiente a staccare i assoni dal substrato e indurre le cellule a distaccherà tipicamente come un foglio di cellule. Se soltanto un numero limitato di neuroni detach (20-30%), le conseguenze sono minime, a condizione che le cellule appaiono sani. I neuroni sono staccate probabile riattaccare nel tempo, tuttavia, gli assoni non sarà più esteso un bend assoni nuovi ricrescere. Mentre non ottimale, l'esperimento può procedere se solo un numero limitato di pozzetti sono interessati. Se vi è il distacco estesa di neuroni (70-80%), si consiglia di non compresi i pozzetti interessati (s) nell'esperimento. Se la maggior parte dei pozzi contengono 70-80% dei neuroni indipendenti, si consiglia di terminare l'esperimento. Mentre i neuroni può ancora rimontare, in genere si formano grumi di grandi dimensioni. Questo complica la corretta valutazione dei singoli neuroni si riattiva. Si consiglia di ripetere qualsiasi esperimento in cui sono stati osservati i pozzi con i neuroni scollegati per garantire che i tassi di riattivazione non sono stati influenzati dal differenziale rispetto dei neuroni ai pozzetti.
Inoltre, è fondamentale per gestire le culture sempre più delicatamente possibile. Sollecitazioni meccaniche da inutili, i movimenti improvvisi (compresi ripetute aperture e chiusura di una porta della camera incubatrice) o forzata Media Application could compromesso la capacità di supportare le culture HSV-1 la latenza, il possibile risultato di tassi eccessivamente elevati di riattivazione spontanea in un dato esperimento.
3. Riattivazione e valutazione
Eventi riattivazione * Più può verificarsi in una cultura, come descritto in 1. Per distinguere un evento primario riattivazione dalla diffusione virale derivanti da reazioni tivation, l'inibitore incapsidamento WAY-150.138 possono essere aggiunti. Bloccando incapsidazione, virus infettivo non è prodotto e diffuso derivante dalla riattivazione non è possibile. In questo modo, il segnale EGFP rilevato in presenza di WAY-150138 riflette il numero di eventi di riattivazione indipendenti all'interno di una cultura ben singe 1,13-15. Si noti che WAY-150.138 è efficace solo contro il ceppo-1 e HSV Patton non disponibili in commercio. In alternativa alla WAY-150.138, è possibile utilizzare uno dei seguenti: i) un virus mutante compromessa la capacità di diffusione di cellule vicine possono essere utilizzati; ii) un virus reporter di cui è espressa EGFP da un promotore IE in presenza continua di ACV, iii) il trattamento con PAA o ACV per impedire l'espressione del gene in ritardo (e la produzione di virus infettante), seguita da immunofluorescenza utilizzando anticorpi diretti contro un prodotto del gene IE.
4. Metodi alternativi per la valutazione riattivazione utilizzando il test
ONTENUTO "> I risultati di un individuo, singolo esperimento dovrebbe essere ottenuto da una singola preparazione del SCG. replicati esperimenti possono essere eseguiti con preparazioni SCG indipendenti più a lungo ogni replica è stata condotta utilizzando una singola partita SCG.5. Risultati rappresentativi
La Figura 2A mostra un esempio dove 1 pM tricostatina A (TSA), un induttore noto di riattivazione 16-18, viene applicato a colture SCG latente infettati con il tipo selvatico HSV1 EGFP-US11 giornalista ceppo. Con la TSA, la riattivazione raggiunge il 50% del massimo entro 2 giorni, e da 5 giorni la riattivazione altopiani intorno al 60% dei pozzi. Linea di base ('spontanea') riattivazione è circa il 10% in questo esperimento e varia tipicamente da 10-20% di utilizzare questo sistema in vitro. Livelli massimi di riattivazione variano a seconda di quale induttore riattivazione viene utilizzato. Induttori riattivazione Molti può essere applicato per la durata dell'esperimento in quanto non interferiscono con produttiva replicazione virale, ma questo deve essere determinato empiricamente. Altri induttori, tra cui un reagente che colpisce la vitalità dei neuroni e impedisce il completamento del ciclo virale vita produttiva, possono richiedere una domanda di impulso transitorio per provocare la riattivazione.
Mentre l'accumulo di EGFP-US11 in ciascun pozzetto dell'esperimento illustrato in Figura 2A è indicativa di riattivazione di latenza, non distingue se l'US11-EGFP segnale in neuroni individuali deriva da un evento riattivazione indipendente, o la diffusione di un virus riattivato attraverso la cultura. Per valutare il numero di neuroni sottoposti eventi riattivazione indipendenti in ciascun pozzetto, le colture sono state pre-trattate con WAY-150.138, un composto che blocca specificamente propagazione virale prevenendo incapsidamento del DNA virale genoma 13-15. Infetti culture dei neuroni simpatici sono stati trattati con WAY-150138 e la riattivazione indotte con TSA. Un numero significativo di EGFP-positivi neuroni sono stati rilevati solo in pozzetti TSA-trattate rispetto a DMSO-trattati con colture di controllo, dimostrando che un certo numero di eventi di riattivazione indipendenti verificano per cultura individuale (Figura 2B).
Nel nostro saggio, il US11-EGFP reporter è espresso dal promotore endogeno US11 11. Dal momento che US11 è un "vero fine" o γ 2 gene virale litico, la replicazione del DNA virale è necessaria per robusto espressivosul. Ciò è illustrato nella figura 3, come EGFP-US11 accumulo è compromessa dalla virale DNA polimerasi di acido fosfonoacetico inibitore (PAA) in colture indotta per riattivare la PI3 chinasi-LY294002 inibitore.

Figura 1. Schema che illustra un tipico protocollo sperimentale con il neurone colta sistema in vitro per studiare HSV-1 la latenza e la riattivazione. 1) Dopo la dissezione superiore gangli cervicali (SCG) da E21 ratti, i neuroni dissociati sono placcati in 96 piatti bene e trattato con anti-mitotico agenti per rimuovere cellule non neuronali. 2) Dopo 6 giorni in vitro (DIV), le colture sono infettati con HSV-1 ricombinante che contiene EGFP fusa al virus codificato US11 gene tardivo (EGFP-HSV-1) in presenza di acyclovir (ACV), un farmaco antivirale che blocchi di replica litico. 3) Di giorno 14 (DIV 14), l'aciclovir viene rimosso e EGFP-espressionenon viene rilevato. Le culture possono essere mantenuta stabilmente in questo modo per 1 mese o più, o una variabile di prova può essere aggiunto per valutare la sua capacità di provocare riattivazione di latenza. La variabile può essere nella forma di un inibitore piccola molecola chimica, un anticorpo contro una neurotrofina solubile o proteina della superficie cellulare, o un lentivirus esprime sia un gene-specifico shRNA o una proteina espressa ectopica. La riattivazione viene poi monitorato segnando EGFP-positivi pozzi in tempo reale.

Figura 2. TSA riattiva HSV-1 in colture SCG. Colture SCG sono stati infettati latente come descritto nella Figura 1. A DIV 14, ACV è stato rimosso e sostituito con mezzi contenente 1 pM tricostatina A (TSA). (A) Le colture sono state visualizzate e valutato con microscopia a fluorescenza ogni giorno dopo il trattamento farmaco per un periodo di 5 giorni. La percentuale di pozzi in fase di reactivatione nel corso dell'esperimento è mostrato rispetto al DMSO controllo trattati culture. Percentuale di riattivazione è stato calcolato il numero di EGFP-positivo pozzetti di 20 pozzetti di una piastra 96 ​​coltura bene. Le barre di errore indicano l'errore standard della media. (B) colture latentemente infette sono stati trattati con TSA e un inibitore di incapsidazione DNA virale, WAY-150.138 (20 pg / ml). Il numero di neuroni EGFP + è stato confrontato con 48 ore dopo il trattamento con i farmaci al controllo trattato con DMSO e WAY-150138. Ciascun punto di dati rappresenta il rapporto di eGFP + neuroni fuori 1000 neuroni in una cultura pure. Barra mostra la percentuale media di EGFP + neuroni in un pozzo.

Figura 3. Detecion EGFP dipende dalla replicazione del DNA virale. Culture SCG sono stati latentemente infettate poi trattati con 10 pM di LY29004, un induttore nota di riattivazione 1. La riattivazione indotta da LY (blu) was rispetto a quelli trattati con inibitore della sintesi del DNA virale, acido phophonoacetic, PAA (300μg/ml, rosso) e le due composti insieme (verde).
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Questa cultura neurone primario e l'infezione del sistema fornisce un metodo semplice ed efficace per esplorare i meccanismi molecolari alla base HSV-1 la latenza e la riattivazione. Il sistema riprende fedelmente le caratteristiche di latenza accettati definiti in entrambe le infezioni umane ed in live-modelli animali. Quando il virus è latente nelle culture SCG, particelle virali infettive e prodotti genici litici non può essere rilevato. L'unico prodotto del gene virale rilevato in neuroni latente-infette è la non-codificante trascrizione LAT, che si accumula all'interno dei nuclei. La riattivazione coincide con l'espressione di geni virali litici e culmina nella produzione di particelle infettive. Inoltre, questo modello di neurone cellula primaria la cultura è sensibile alle induttori riattivazione accettati come il TSA, che induce efficacemente la replicazione virale litica.
Induttori chimici diversi stimolare la riattivazione in varia misura e con caratteristiche cinetiche. Ad esempio, TSA induce riproducibile riattivazione nel 60-70% delle colture in un periodo di osservazione 5 d. Livelli simili di TSA-indotta riattivazione sono stati riportati con latentemente infetti, feocromocitoma di ratto PC12 differenziate le cellule murine 17 o culture di neuroni del trigemino 18. La cinetica di riattivazione osserviamo e l'incapacità di TSA per riattivare il 100% delle colture potrebbe riflettere eterogeneità nella capacità dei genomi latenti da derepresso. Coerentemente con questa proposta, l'efficacia della riattivazione TSA indotta diminuisce riferito in funzione del tempo di coltura 18. In contrasto con TSA, LY29004 induce la riattivazione in 80-90% delle culture entro 2-3 d. Differenze nella creazione latenza o MOI non possono tenere conto delle differenze di riattivazione inducibile tra TSA e LY29004, come le nostre condizioni per stabilire la latenza riproducibile provocare in circa il 20% dei neuroni che esprimono il virus-encoded ass latenzatrascrizione ociated LAT 1. Tuttavia, non abbiamo ancora misurata la frazione del genoma virale cellule positive, aumentando la possibilità che induce LY29004 riattivazione in un maggior numero di neuroni che TSA. Mentre le motivazioni alla base della capacità differenziale di TSA e LY20004 per indurre la riattivazione ancora da stabilire, è chiaro che inducono diversi agenti in grado di promuovere la riattivazione con efficienze caratteristici e cinetica.
Un aspetto forte del sistema è la possibilità di utilizzare ceppi di virus di tipo selvatico o reporter che si comportano in maniera indistinta da un virus wild-type. A differenza dei sistemi di coltura di cellule precedenti per studiare HSV-1 la latenza, che si basava sui mutanti varianti HSV che erano in grado di replicare in modo produttivo 16,18,19, recensione in 20, il nostro sistema modello incorpora un EGFP-reporter ceppo che è indistinguibile da wild-type virus in termini di efficienza replicazione litico in cellule in coltura 11. L'uso di un reporter EGFP vIRU consente una valutazione sensibile e semplice visiva della latenza e la riattivazione. A differenza di altri reporter come β-galattosidasi, che richiede fissazione e la lisi delle cellule per l'analisi, EGFP consente al ricercatore di monitorare lo stato virale durante l'intero corso di un esperimento, fornendo un facile, valutazione in tempo reale di spontanea e indotta riattivazione. Altri metodi, come la PCR quantitativa, può anche essere utilizzato per esaminare i modelli di espressione dei geni virali che precedono EGFP-espressione, poiché EGFP è espressa come un gene "true-ritardo", o per ceppi virali che mancano di un gene reporter. In alternativa, i virus giornalista altre in cui si fonde alla EGFP immediata-precoci (IE) o all'inizio (E) i geni potrebbero essere sviluppate. Un vantaggio di usare il "vero-in ritardo" EGFP-reporter descritto è che EGFP-espressione è severamente dipende la sintesi del DNA virale, che indica che il ciclo di vita del virus si è proceduto alla fase finale di espressione del gene associato con la crescita litica. Indeed, "true-tardiva" espressione di EGFP a livelli rilevabili mediante ispezione visiva si correla bene con la produzione di virus infettante, un indicatore biologico che la riattivazione produttiva si è verificato. Tuttavia, resta da vedere se ogni neurone che comincia riattivazione, come misurata dal ciclo produttivo (litico) l'espressione genica, è in grado di progredire attraverso il programma completo litico per la produzione di virus infettivo. Forse i virus hanno ampie possibilità di interrompere il programma litico e ristabilire la latenza. Così, i virus giornalista che esprimono EGFP fuso IE o proteine ​​E possono portare a letture riattivazione meno affidabili. Da questo punto di vista, confrontare l'efficienza di riattivazione misurata utilizzando EGFP-reporter espresse da IE, E, o promotori in ritardo, o anche un giornalista combinata con diverse proteine ​​reporter fluorescenti fuse in un prodotto del gene per ogni classe cinetica (E vs IE vs ) fine sarebbe utile. Inoltre, il sistema di coltura cellulare neuronale può anche essere utilizzato con diversi HSV-1 stpiogge, indipendentemente dalla loro potenziale neuroinvasive o la capacità di regolare la risposta immunitaria ospite 21-24. Infine, il sistema di coltura in vitro qui descritto può essere applicato ad altri tipi di cellule neuronali e ex vivo culture gangli periferico ottenuti da ordine superiore specie, compreso l'uomo 25-27.
Utilizzando una popolazione pura di neuroni, studi dettagliati delle interazioni tra HSV1 e il suo ospite neuronale a livello molecolare sono ora possibili. Significativamente, questo sistema modello consente di evitare i molti problemi complessi associati con la latenza e la riattivazione studiare negli animali immunocompetenti, in cui sono stratificati livelli aggiuntivi di controllo al di sopra dei fondamentali virus neuroni interazioni. Inoltre, i lavori in questo sistema dimostra chiaramente che esiste effettivamente una relazione stabile tra virus e ospite neurone che può essere stabilito e mantenuto senza l'assistenza di una risposta immunitaria acquisita. Mentre innato e ADAPTIVImmunità e chiaramente giocano un ruolo importante nella biologia di infezioni da HSV latenti, il virus ha la capacità intrinseca i) per stabilire una non-produttiva infezione simile latenza nei neuroni, e ii) per passare ad un litico, programma di replicazione produttiva in risposta alle ambientale segnali neuronali e applicata solo ai neuroni. È importante sottolineare che la base molecolare per questo rapporto unico tra HSV e il neurone può ora essere sezionati mediante cellula biologica, farmacologico, silenziamento del gene, e strumenti di consegna del gene 1. Studi di questo tipo che si concentrano sul neurone e virus presi isolatamente, non sono possibili in modelli animali in cui diversi tipi di cellule occupano il vano dei gangli. Ci auguriamo che utilizzando questo sistema modello, una comprensione globale dei circuiti molecolari che regolano la complessa HSV-1 la latenza nei neuroni può finalmente essere realizzato. Quando possibile, i principi raccolti da questo sistema dei neuroni colto può quindi essere testato in vivo utilizzando stabilito animale models, che illustrano la natura complementare di questi due approcci allo studio generale di HSV-1 la latenza.
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Non ci sono conflitti di interesse dichiarati.
Ringraziamo i revisori per i loro suggerimenti premurosi che hanno contribuito a migliorare questo manoscritto. Questo lavoro è stato supportato da sovvenzioni a favore di MVC (NS21072, HD23315), ACW (GM61139, S10RR017970) e IM (AI073898, GM056927) dal NIH. MK è stata sostenuta in parte da una formazione sovvenzione del NIH (5T32 AI007180).
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 70µm nylon filter( cell strainer) | BD Biosciences | 352350 | |
| 1x Hank’s Balanced Salt Solution (HBSS-/-) | Invitrogen | 14175 | w/o CaCl2 and MgCl2 |
| 1x Minimum Essential Media (MEM) | Invitrogen | 11095-080 | |
| 5-Fluoro-2’-deoxyuridine | Sigma-Aldrich | F0503 | prepare 20 mM stock in 1x MEM; store at -20°C |
| 96-well flat well bottom TC plates | Corning | 3599 | |
| Acyclovir | Calbiochem | 114798 | prepare 31 mM stock in DMSO; store at -20°C |
| Aphidicolin | Calbiochem | 178273 | prepare 10 mM stock in DMSO; store at -20°C |
| B-27 Supplement | Invitrogen | 17504-44 | |
| Collagenase | Sigma-Aldrich | C2674 | prepare 10 mg/ml stock in HBSS-/-; store at -20°C |
| D-(+)-Glucose | Sigma-Aldrich | G6152 | prepare 40% stock in H2O; filter sterilize & store at 4°C |
| L-Glutamine | Invitrogen | 25030-081 | |
| Laminin | Sigma-Aldrich | L2020 | prepare 1 mg/ml stock in H2O; quick-freeze 20 μl aliquats & store at -80°C; dilute to 2 μg/ml working conc. in sterile H2O |
| Leibovit’z L-15 media | Invitrogen | 11415 | |
| Nerve Growth Factor | Harlan Laboratories | BT.5017 | prepare 50 μg/ml stock in HBSS-/-; store at -80°C |
| Neurobasal medium | Invitrogen | 12348 | |
| Phosphonoacetic acid (PAA) | Sigma-Aldrich | P6909 | prepare 75 mg/ml stock in H2O; store at -20°C |
| Poly-D-lysine hydrobromide | Sigma-Aldrich | P0899 | prepare 20 mg/ml stock in H2O; store at -20°C |
| Rat-tail collagen | EMD Millipore | 08-115 | Concentration varies with supply lot; store at 4°C and dilute to 0.66 mg/ml working conc. in sterile H2O |
| Trichostatin A | Sigma-Aldrich | T8552 | prepare 1 mM stock in DMSO; store at -20°C |
| Trypsin 2.5% | Invitrogen | 15090-04 |